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贵州省2011年急性胃肠炎诺如病毒的哨点监测及其基因特征分析 被引量：1
1
作者 阎岩 吴悦 +2 位作者 郭军 田克诚 王定明 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期51-55,共5页
为了解贵州省2011年诺如病毒的基因型,监测了2011年5月至12月于贵州省人民医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)初步鉴定,并对阳性株的VP1基因区克隆及测序。检测标本70份,GⅠ型... 为了解贵州省2011年诺如病毒的基因型,监测了2011年5月至12月于贵州省人民医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)初步鉴定,并对阳性株的VP1基因区克隆及测序。检测标本70份,GⅠ型诺如病毒阳性1株,阳性率1.43%,GⅡ型诺如病毒阳性34株,阳性率48.57%,获得7份GⅡ型诺如病毒VP1基因序列,3株为GⅡ.4亚型,为新型变异株(GⅡ4 2011),与GⅡ4 2006b变异株的亲缘关系最近,有1个氨基酸位发生了回复突变;4株为GⅡ.3亚型,分为2个基因簇,1簇与2008～2009年韩国株(HM635118)及上海株(GU991355)的亲缘关系最近,1簇与2010年日本株(AB629943)及2007年印度株(EU921389)等的亲缘关系最近,有4个氨基酸位点易发生回复突变。 展开更多
关键词 诺如病毒 GⅡ4型 GⅡ3型 VP1基因 贵州
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贵阳地区急性胃肠炎病例中首次检出GⅠ型诺如病毒的基因特征分析
2
作者 阎岩 郭军 +3 位作者 蒋维佳 田克诚 李世军 王定明 《贵州医药》 CAS 2012年第8期695-697,共3页
目的了解贵阳地区GⅠ型诺如病毒的基因特征。方法监测2010年6-11月于贵阳地区哨点医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(real-time RT-PCR)初步鉴定,用一步法RT-PCR对其VP1基因区克隆及测序,获得1株... 目的了解贵阳地区GⅠ型诺如病毒的基因特征。方法监测2010年6-11月于贵阳地区哨点医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(real-time RT-PCR)初步鉴定,用一步法RT-PCR对其VP1基因区克隆及测序,获得1株GⅠ型诺如病毒基因序列,经与国内外流行的GⅠ型诺如病毒的各亚型序列进行系统进化及氨基酸位点的突变分析。结果检测标本426份,7份标本为GⅠ型诺如病毒阳性,测序获得的诺如病毒为GⅠ.4型,核苷酸序列和2007年韩国株及2003年日本株同源型最近,未发生氨基酸独立位点的突变。结论贵阳地区2010年夏秋季急性胃肠炎中存在GⅠ.4型诺如病毒的流行。 展开更多
关键词 诺如病毒 GⅠ 4基因型 VP1基因 贵阳
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