木薯NHX基因家族鉴定及特征分析

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作者 杨仕梅 谢恩俊 +3 位作者 罗春芳 饶萍 欧珍贵 杨龙 《贵州农业科学》 CAS 2024年第8期19-26,共8页

【目的】鉴定木薯NHX基因家族成员并分析特征,为研究木薯耐盐新种质和挖掘木薯抗逆特性基因具有重要意义。【方法】基于全基因组水平上对木薯NHX基因家族进行鉴定,对其系统进化树、蛋白理化性质、保守结构、保守基序、共线性、蛋白互作... 【目的】鉴定木薯NHX基因家族成员并分析特征,为研究木薯耐盐新种质和挖掘木薯抗逆特性基因具有重要意义。【方法】基于全基因组水平上对木薯NHX基因家族进行鉴定,对其系统进化树、蛋白理化性质、保守结构、保守基序、共线性、蛋白互作等进行分析。【结果】在木薯中共鉴定到9条MeNHX基因(MeNHX1~MeNHX9),分为3个亚族,且不均匀地分布在7条染色体上,其中,染色体Chr03和Chr15中均包含2条MeNHX基因,染色体Chr01、Chr08、Chr09、Chr10和Chr17均只有1条MeNHX基因。MeNHX蛋白有520~1 157个氨基酸,其相对分子质量为58.09~128.21 kDa,理论等电点为5.63~9.11;为两性蛋白,不稳定系数为34.60~41.34;为疏水性蛋白,其GRAVY为0.094~0.595。9条MeNHX基因均含有典型的Na^(+)/H^(+)保守结构域,木薯NHX存在多个共线性区块,进化压力Ka/Ks值均小于1,主要受纯化选择作用;含有光响应、生物胁迫及非生物胁迫作用相关元件MeNHX基因同多条离子通道基因存在蛋白互作关系。【结论】MeNHX基因在木薯受到光、生物胁迫和非生物胁迫时参与生长发育过程,以适应其环境变化。 展开更多

关键词 木薯 nhx家族 系统进化 保守结构 蛋白互作 基因鉴定

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菠菜NHX家族基因鉴定及其响应盐胁迫的表达分析 被引量：3

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作者 李茹霞 顾寅钰 +6 位作者 李萌 陈传杰 梁晓艳 李俊林 邢延富 张海洋 付娆 《山东农业科学》 北大核心 2021年第9期1-7,共7页

Na^(+)/H^(+)逆向转运蛋白(NHX)在植物响应盐胁迫和生长发育过程中发挥着重要的调控作用。本研究对菠菜NHX家族基因进行全基因组鉴定和生物信息学分析,并利用qRT-PCR技术检测NHX基因在盐胁迫下的表达。结果显示,从菠菜基因组中共鉴定出6... Na^(+)/H^(+)逆向转运蛋白(NHX)在植物响应盐胁迫和生长发育过程中发挥着重要的调控作用。本研究对菠菜NHX家族基因进行全基因组鉴定和生物信息学分析,并利用qRT-PCR技术检测NHX基因在盐胁迫下的表达。结果显示,从菠菜基因组中共鉴定出6个SpoNHXs基因,系统进化树分析发现其分属3个亚家族——Vac、Endo和PM;这6个SpoNHXs均具有跨膜结构域,与拟南芥NHX家族成员在不同亚家族中的保守基序高度一致,表明其具有相似的生物学功能;这6个SpoNHXs受盐胁迫上调表达,其中SpoNHX1与SpoNHX6显著上调。本研究结果可为后续SpoNHXs基因克隆和耐盐功能分析提供理论支持。 展开更多

关键词 菠菜 nhx家族基因 生物信息学分析 盐胁迫

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葡萄NHX基因家族的鉴定和表达分析 被引量：10

3

作者 卢世雄 许春苗 +4 位作者 何红红 梁国平 王萍 陈佰鸿 毛娟 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期266-276,共11页

【目的】探究葡萄NHX基因家族生物信息学特性及在非生物胁迫下的表达情况,以期筛选出与非生物胁迫相关的家族成员,从而为葡萄抗逆性研究提供理论依据。【方法】以拟南芥、水稻及胡扬NHX基因序列为基础,对葡萄NHX基因进行同源克隆、染色... 【目的】探究葡萄NHX基因家族生物信息学特性及在非生物胁迫下的表达情况,以期筛选出与非生物胁迫相关的家族成员,从而为葡萄抗逆性研究提供理论依据。【方法】以拟南芥、水稻及胡扬NHX基因序列为基础,对葡萄NHX基因进行同源克隆、染色体定位、氨基酸组成成分、理化性质、motif、蛋白质二级结构以及基因芯片表达等分析,同时利用qRT-PCR技术分析葡萄NHX基因家族表达情况。【结果】葡萄NHXs可分为2个亚族,主要分布在第1、5、7、14、15、19号染色体上,其外显子数为12～23个;VvNHX06的氨基酸数最少,有291个,VvNHX07的氨基酸数最多,有1141个。Motif分析发现,N端含有典型的锌指结构,蛋白质二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。亚细胞定位预测发现,葡萄NHX基因主要分布在细胞膜、内质网、线粒体、液泡和细胞质中。基因芯片表达显示,使用NaCl、ABA和PEG处理后,葡萄叶片中VvNHX02和VvNHX06基因表达量均呈上升趋势。qRT-PCR分析结果表明,在200 mmol·L^(-1)NaCl、100 mmol·L^(-1)ABA处理后的葡萄叶片中,VvNHX06表达量显著增加,分别是对照的30倍和60倍。用10%PEG处理实验材料6 h后,VvNHX05的表达量明显增加,是对照的5倍。【结论】VvNHX05和VvNHX06基因与植物耐盐和抗旱性有密切关系,可为葡萄的逆境胁迫机制研究提供参考。 展开更多

关键词 葡萄 nhx基因家族 胁迫 QRT-PCR

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香蕉NHX基因家族的鉴定及表达分析 被引量：9

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作者 徐亚 滕梦鑫 +2 位作者 何岳东 乔飞 李新国 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期681-691,共11页

NHX是Na+(K+)/H+的逆向转运蛋白,具有Na+/H+exchange (PF00999)蛋白结构域,广泛存在于多种生物中,主要参与植物响应盐胁迫过程中离子平衡的重建。本研究从香蕉(Musa spp.)基因组数据库中鉴定了NHX基因家族,并进行生物信息学分析及盐胁... NHX是Na+(K+)/H+的逆向转运蛋白,具有Na+/H+exchange (PF00999)蛋白结构域,广泛存在于多种生物中,主要参与植物响应盐胁迫过程中离子平衡的重建。本研究从香蕉(Musa spp.)基因组数据库中鉴定了NHX基因家族,并进行生物信息学分析及盐胁迫下香蕉NHX基因的表达分析。结果表明,鉴定到香蕉11个NHX家族基因,分别分布在7条染色体上;大部分MaNHXs基因外显子(14~22)为14个, MaNHX6含有22个外显子;理化性质分析发现大部分MaNHXs蛋白等电点大于8,蛋白质分子质量为57~62 kDa;亚细胞定位预测表明MaNHXs均定位在液泡;与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)的NHX蛋白一起构建的系统发育树分为2个聚类组。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明, MaNHX5蛋白定位于液泡膜。qRT-PCR结果表明香蕉幼苗在200 mmol·L^(-1) NaCl胁迫下, MaNHXs在根、假茎和叶片中均有表达且在不同时间表达差异显著。 展开更多

关键词 香蕉 nhx基因家族 盐胁迫 亚细胞定位 QRT-PCR

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大白菜NHX基因家族的鉴定与表达分析 被引量：2

5

作者 王雪花 韩佳 +5 位作者 马济中 杨曦婷 满华丽 乔亚丽 高雪琴 胡琳莉 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期552-565,共14页

Na+/H+逆向转运蛋白(Na+/H+antiporter,NHX)基因家族在植物响应盐胁迫中发挥重要作用。本研究鉴定了大白菜NHX基因家族成员,并分析了大白菜NHX基因(Brassica rapa ssp.Pekinensis NHX,BrNHXs)响应高温、低温、干旱和盐胁迫等非生物逆境... Na+/H+逆向转运蛋白(Na+/H+antiporter,NHX)基因家族在植物响应盐胁迫中发挥重要作用。本研究鉴定了大白菜NHX基因家族成员,并分析了大白菜NHX基因(Brassica rapa ssp.Pekinensis NHX,BrNHXs)响应高温、低温、干旱和盐胁迫等非生物逆境的表达模式。结果表明,在大白菜中共鉴定到9个NHX基因家族成员,分布在大白菜的6条染色体上,其氨基酸数目在513–1154 aa之间,相对分子量集中在56804.22–127856.66 kDa,等电点位于5.35–7.68之间。该基因家族成员主要存在于液泡中,基因结构完整,外显子的数目介于11–22之间。大白菜NHX基因家族编码的蛋白质二级结构都具有α-螺旋、β-转角和不规则卷曲结构,其中α-螺旋发生频率较高。实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析显示,该基因家族成员在高温、低温、干旱和盐胁迫下均有不同程度地响应,且在不同时间表达差异显著。以BrNHX02和BrNHX09对这4种胁迫的响应最为显著,表达量在处理72 h时均显著上调,可作为候选基因进一步验证其功能。 展开更多

关键词 nhx基因家族 亚细胞定位 荧光定量 胁迫 大白菜

原文传递

辣椒NHX基因家族的鉴定和表达分析 被引量：6

6

作者 罗建 许春苗 +1 位作者 张国斌 郁继华 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2021年第3期15-24,共10页

为了解辣椒中NHX基因家族生物信息学功能,探究其在非生物胁迫下基因表达特性,进而为辣椒CaNHX基因的功能开发以及辣椒耐盐抗旱育种基因提供基础。通过生物信息学方法对辣椒NHX基因家族进行鉴定,并对基因结构、结构域、系统进化关系、基... 为了解辣椒中NHX基因家族生物信息学功能,探究其在非生物胁迫下基因表达特性,进而为辣椒CaNHX基因的功能开发以及辣椒耐盐抗旱育种基因提供基础。通过生物信息学方法对辣椒NHX基因家族进行鉴定,并对基因结构、结构域、系统进化关系、基因表达模式和非生物胁迫表达情况进行分析。结果表明,在辣椒中有7个GME家族成员,可分为3个亚组,同时均包含Na^(+)/H^(+)exchange保守结构域;主要分布在5条染色体上,其基因大小之间差异明显,氨基酸数目维持在198~952个,外显子含量在7~21个。除CaNHX5外其余蛋白均不具有信号肽,为疏水性蛋白,定位在液泡的可能性最高,都属于跨膜蛋白;Motif分析发现,N端含有CXC24XC的锌指结构,C端含有Trp(W)-24和TrKA-N,在序列中高度保守,二级结构主要以不规则卷曲和α-螺旋为主。进化树分析表明,该基因编码的氨基酸序列与番茄亲缘关系最近。qRT-PCR分析结果表明,在渗透和盐胁迫下,CaNHX6的基因表达量显著增加,分别是0 h时的13.5,13.6倍;在茉莉酸甲酯和赤霉素处理后,CaNHX5和CaNHX6在辣椒叶片中表达量均呈显著上调趋势,其余则相反。不同的表达情况表明其在非生物胁迫中发挥作用。 展开更多

关键词 辣椒 nhx基因家族 表达分析 胁迫

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海马齿NHX基因家族的鉴定及表达分析 被引量：1

7

作者 李雨欣 王鹏 +1 位作者 刘雯 周扬 《广东农业科学》 CAS 2023年第10期85-96,共12页

【目的】海马齿(SesuviumportulacastrumL.)是典型的海岸植物和红树林伴生植物,能够固沙护岸,在海水中可以正常生长,具有极强的耐盐性。Na+/H+逆向转运蛋白(Na+/H+exchange,NHX)在植物耐盐和生长发育中起关键作用,为了解NHX在海马齿耐... 【目的】海马齿(SesuviumportulacastrumL.)是典型的海岸植物和红树林伴生植物,能够固沙护岸,在海水中可以正常生长,具有极强的耐盐性。Na+/H+逆向转运蛋白(Na+/H+exchange,NHX)在植物耐盐和生长发育中起关键作用,为了解NHX在海马齿耐盐过程中的作用,对海马齿NHX基因家族进行鉴定和分析。【方法】采用生物信息学方法从海马齿全长转录组数据中鉴定NHXs成员,对其蛋白理化性质、保守基序和进化关系进行分析,并利用荧光定量PCR技术研究盐胁迫下NHXs成员的表达模式。【结果】从海马齿中共鉴定出12个SpNHX基因,命名为SpNHX1~SpNHX12。SpNHXs基因编码的氨基酸长度为276~554 aa,分子量为31.22~61.21 kD,等电点为5.55~8.64,不稳定指数为32.14~50.54,均为疏水性蛋白。系统发育分析表明,SpNHX蛋白可分为2个亚组,同一亚组具有相似的保守基序。多序列比对结果发现,SpNHX均具有Na+/H+exchange保守结构域。转录组数据和荧光定量PCR结果显示,SpNHXs基因在盐胁迫下均受到不同程度的诱导,其中SpNHX1、SpNHX9、SpNHX10、SpNHX11和SpNHX12在盐胁迫下显著上调表达。【结论】本研究明确了海马齿NHX基因家族在高盐胁迫下的表达模式,表明SpNHX1、SpNHX9、SpNHX10、SpNHX11和SpNHX12可能参与海马齿盐胁迫响应,为进一步研究NHX在海马齿耐盐过程中的作用提供理论基础。 展开更多

关键词 海马齿 盐胁迫 nhx基因家族 基因鉴定 生物信息学分析 基因表达

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木麻黄NHX基因家族的鉴定及盐胁迫下的表达分析 被引量：1

8

作者 艾迪 魏永成 +3 位作者 孟景祥 张捷 仲崇禄 张勇 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期750-760,共11页

Na^(+)/H^(+)转运蛋白在植物的耐盐性和生长发育中起关键作用。该研究采用生物信息学方法对木麻黄(Casuarina equisetifolia L.)NHX基因家族成员进行全基因组鉴定和分析,并利用qRT-PCR技术检测NHX基因在盐胁迫下的表达,以探讨木麻黄NHX... Na^(+)/H^(+)转运蛋白在植物的耐盐性和生长发育中起关键作用。该研究采用生物信息学方法对木麻黄(Casuarina equisetifolia L.)NHX基因家族成员进行全基因组鉴定和分析,并利用qRT-PCR技术检测NHX基因在盐胁迫下的表达,以探讨木麻黄NHX家族基因的生物学功能,为进一步研究盐胁迫机制以及挖掘其抗逆基因奠定理论基础。结果显示:(1)鉴定获得8个木麻黄NHX基因家族成员(CeqNHX1-8),系统进化树分析发现其可分为Endo、Vac和PM共3个亚家族,分别包含1、5和2个基因;编码氨基酸数为324~546个,分子量为34.87~60.27 kD,等电点在6.29~9.08之间,均为疏水蛋白。(2)基因结构和Motif分析发现,所有CeqNHXs基因的外显子数为2~17不等,且均具有保守的Na^(+)/H^(+)交换结构域;CeqNHX基因的蛋白质二级结构主要以α-螺旋和不规则卷曲为主。(3)木麻黄CeqNHX基因的启动子区含有大量非生物胁迫和激素响应元件,其中CeqNHX5启动子共含有13种共38个元件。(4)qRT-PCR分析表明,CeqNHX基因家族成员在木麻黄根、茎、枝和雄花序中均有不同程度的表达,且多数主要在小枝上表达;在200 mmol/L NaCl处理下,8个木麻黄CeqNHXs基因的表达量均有一定程度的上调。研究表明,木麻黄CeqNHXs基因家族可能参与多种激素和应激反应的调节,且CeqNHXs基因的表达对盐胁迫有显著的响应,推测CeqNHXs基因与木麻黄的耐盐性相关。 展开更多

关键词 木麻黄 nhx基因家族 生物信息学分析 盐胁迫

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藜麦NHX基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析 被引量：4

9

作者 张业猛 朱丽丽 陈志国 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期184-193,共10页

探讨藜麦NHX基因家族生物学特性及盐胁迫下的表达模式,以期为藜麦抗盐品种选择提供理论依据。以藜麦含有Na+/H+exchange结构域的蛋白质序列为基础,对其基因结构、蛋白质motif、理化性质以及盐胁迫下转录表达进行分析。结果表明,藜麦基... 探讨藜麦NHX基因家族生物学特性及盐胁迫下的表达模式,以期为藜麦抗盐品种选择提供理论依据。以藜麦含有Na+/H+exchange结构域的蛋白质序列为基础,对其基因结构、蛋白质motif、理化性质以及盐胁迫下转录表达进行分析。结果表明,藜麦基因组中含有46个NHXs基因家族成员,氨基酸长度为109-1 820 aa,分子质量为11 472.74-204 381.38 Da,等电点为5.00-9.27,亲水性为-0.226-1.112,不稳定指数为21.71-50.73。进化树分析可以将其分为5个亚组,在进化树中位置相近的NHXs基因具有相近的结构。同一亚组的NHXs蛋白具有相似motif结构,与拟南芥、小麦和玉米为直系同源蛋白,且多数定位在细胞膜和液泡中。通过盐胁迫下藜麦转录组数据分析发现,随盐胁迫时间增加,其中有26个NHXs基因的转录水平提升,9个下降,11个无明显变化。此外,35个受到盐胁迫诱导表达的NHXs基因,通过GO注释发现,主要参与离子、细胞稳态和离子跨膜运输过程。NHXs基因结构和蛋白质motif的多样性,推测不同亚组NHXs在盐胁迫中参与不同的响应过程,其盐胁迫下不同的表达模式也表明在盐胁迫响应过程中发挥重要作用。 展开更多

关键词 藜麦 nhx基因家族 基因结构 MOTIF 理化性质 盐胁迫 表达模式

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杜梨NHX基因家族的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析 被引量：5

10

作者 王影 李慧 +3 位作者 蔺经 杨青松 张绍铃 常有宏 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期825-836,共12页

[目的]NHX基因亚家族为钠氢逆转运体,具有Na^+/H^+ exchange(PF00999)蛋白结构域,广泛存在于多种物种中,主要参与植物响应盐胁迫过程离子平衡的重建。分析鉴定杜梨中NHX基因及其耐盐机制有助于实际生产中更为有效地利用这一砧木资源。[... [目的]NHX基因亚家族为钠氢逆转运体,具有Na^+/H^+ exchange(PF00999)蛋白结构域,广泛存在于多种物种中,主要参与植物响应盐胁迫过程离子平衡的重建。分析鉴定杜梨中NHX基因及其耐盐机制有助于实际生产中更为有效地利用这一砧木资源。[方法]结合已公布的梨基因组数据以及拟南芥相关数据,通过生物信息学手段,鉴定杜梨NHX基因家族成员;通过MEGA7.0软件进行序列比对以及进化分析;通过在线工具Pfam、SMART以及GSDS进行基因结构分析;通过定量PCR技术分析非生物胁迫下基因在不同组织中的表达特征;应用火焰石墨炉原子吸收光谱仪测定NaCl胁迫下杜梨不同组织中Na^+与K^+含量。[结果]成功鉴定出16个候选基因,其中有4个基因属于NHX亚家族,4个基因属于CHX亚家族,8个基因属于KEA亚家族。预测的候选基因均含有Na^+/H^+ exchange功能域;NaCl胁迫下,预测的16个基因在叶片中的表达差异大,但在8h以后均为负调控;在茎中,PEG6000处理下,PbNHX1的表达量显著增高,且高于同一时期NaCl胁迫下的表达水平,仅在48h时低于同一时期NaCl胁迫下的表达水平;在根中,基因PbN-HX12、PbNHX13、PbNHX14和PbNHX15在NaCl胁迫和PEG6000处理下在任何时间段均为负调控。[结论]在盐胁迫过程中,与拟南芥NHX基因进化关系最近的PbNHX1和PbNHX11呈现出负调控模式,与拟南芥KEA基因进化关系相近的PbNHX10和PbNHX7可能参与K^+的运输。 展开更多

关键词 杜梨 nhx基因家族 非生物胁迫 实时定量PCR

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藜麦CqNHX基因家族鉴定及表达模式分析 被引量：4

11

作者 王宇 贾冰晨 +5 位作者 吴筱林 张东亮 褚晶 田晓芹 陈世华 郭善利 《烟台大学学报（自然科学与工程版）》 CAS 2020年第3期270-275,共6页

NHX基因亚家族在植物响应盐胁迫的过程中起到重要作用.本研究对藜麦CqNHX基因家族进行系统分析,结果表明:藜麦基因组中存在10个CqNHX基因家族成员,基于系统发育进化树被分为3组,每组的基因结构及功能相似;部分CqNHX基因的表达具有明显... NHX基因亚家族在植物响应盐胁迫的过程中起到重要作用.本研究对藜麦CqNHX基因家族进行系统分析,结果表明:藜麦基因组中存在10个CqNHX基因家族成员,基于系统发育进化树被分为3组,每组的基因结构及功能相似;部分CqNHX基因的表达具有明显的组织特异性,且部分基因受到干旱和高温胁迫的调控. 展开更多

关键词 藜麦 nhx基因家族 非生物胁迫

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甜橙NHX基因家族的鉴定及功能分析 被引量：3

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作者 杨杰 陈蓉 +4 位作者 胡文娟 吴巧玲 佟晓楠 李兴涛 陈健美 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第7期35-42,共8页

Na^(+)/H^(+)逆向转运(Na^(+)/H^(+)exchange or antiporter, NHX)蛋白家族的氨基酸序列具有Na^(+)/H^(+)exchange蛋白结构域,在植物生长发育和非生物胁迫应答中发挥重要作用。为探究甜橙(Citrus sinensis)NHX基因家族的生物学特性,本... Na^(+)/H^(+)逆向转运(Na^(+)/H^(+)exchange or antiporter, NHX)蛋白家族的氨基酸序列具有Na^(+)/H^(+)exchange蛋白结构域,在植物生长发育和非生物胁迫应答中发挥重要作用。为探究甜橙(Citrus sinensis)NHX基因家族的生物学特性,本研究从甜橙基因组中鉴定出6个NHX基因家族成员,并对其理化性质、基序组成、进化关系、表达谱等进行分析。结果显示,CsNHXs编码蛋白的长度为407~543个氨基酸,分子量为44.71~59.97 ku;所有CsNHXs非均匀地分布在5条染色体上,均具有保守的Na^(+)/H^(+)exchange结构域;蛋白质二级结构分析结果表明,甜橙NHX蛋白主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)的NHX蛋白一起构建的系统进化树聚类为3个亚群,甜橙NHX蛋白分布在Endo和Vac亚群中。顺式作用元件预测分析结果表明,CsNHXs启动子区域包含多个植物的生长发育响应元件、激素响应元件和逆境响应元件。转录组数据分析结果表明,CsNHXs在甜橙不同组织中的表达存在差异性,总体上分为特异性表达和普遍性表达。本研究系统分析了甜橙NHX基因家族,为进一步阐明甜橙NHX基因家族的功能提供了理论依据。 展开更多

关键词 甜橙 nhx基因家族 生物信息学 基因表达 顺式作用元件

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利用RNAi技术抑制拟南芥NHX1基因家族的表达 被引量：3

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作者 原江锋 杨建雄 +2 位作者 俞嘉宁 王丽娟 张志琪 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1735-1741,共7页

采用RNAi抑制NHX1基因家族的表达,并观察其对拟南芥耐盐性和耐旱性的影响.根据从拟南芥(Ara-bidopsis thaliana)cDNA中扩增出编码Na+/H+反向转运蛋白基因AtNHX1长度为210 bp高度保守序列作为RNAi的靶标区,并正反2个方向插入载体pHANNIBA... 采用RNAi抑制NHX1基因家族的表达,并观察其对拟南芥耐盐性和耐旱性的影响.根据从拟南芥(Ara-bidopsis thaliana)cDNA中扩增出编码Na+/H+反向转运蛋白基因AtNHX1长度为210 bp高度保守序列作为RNAi的靶标区,并正反2个方向插入载体pHANNIBAL中,2个片段用intron连接;将RNAi表达框连入具有NPTⅡ筛选标记基因的表达载体pART27中,构建以拟南芥NHX1基因家族为靶标的RNAi载体.采用农杆菌介导的真空渗透法转化拟南芥,得到T0代转基因拟南芥种子.对转基因阳性植株进行RT-PCR检测以及耐盐性和耐旱性分析.结果表明,利用本实验构建的NHX1基因家族RNAi载体,拟南芥NHX1基因家族表达被成功地抑制;耐盐和耐旱分析表明RNAi技术对基因表达沉默是有效的. 展开更多

关键词 Na^+/H^+反向转运蛋白 nhx1基因家族 RNAI 拟南芥

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桃NHX基因家族的全基因组鉴定与表达分析 被引量：1

14

作者 李淼 李桂祥 +3 位作者 刘伟 高晓兰 王孝友 张安宁 《山东农业科学》 北大核心 2021年第12期8-16,共9页

本研究利用生物信息学方法从桃全基因组数据库筛选出7个NHX反向转运体,并对其序列特征、基因结构、进化关系、亚细胞定位、组织表达谱和盐胁迫响应性进行综合分析。结果表明,7个桃NHX具有清晰的亲缘远近关系;5个桃NHX(NHX1,NHX4~NHX7)... 本研究利用生物信息学方法从桃全基因组数据库筛选出7个NHX反向转运体,并对其序列特征、基因结构、进化关系、亚细胞定位、组织表达谱和盐胁迫响应性进行综合分析。结果表明,7个桃NHX具有清晰的亲缘远近关系;5个桃NHX(NHX1,NHX4~NHX7)基因在结构等方面具有相似性,亲缘关系较近,而与NHX2和NHX3亲缘关系较远。7个桃NHX蛋白在N端具有明显的跨膜结构区域。顺式元件分析表明,桃NHX基因家族上游启动子区域包含与光信号、激素、逆境胁迫及分生组织表达相关的顺式作用元件。qRTPCR分析结果显示,大多数桃NHX家族成员在茎中表达较多;所有桃NHX成员对外源盐处理具有响应性。 展开更多

关键词 桃 nhx基因家族 全基因组 基因表达

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