利用HPLC构建黑桑指纹图谱并分析黑桑的主要活性成分,结合网络药理学和分子对接技术研究黑桑治疗阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的作用分子机制。HPLC法建立12批黑桑的指纹图谱并对共有峰进行指认识别,进一步采用相似度评价、...利用HPLC构建黑桑指纹图谱并分析黑桑的主要活性成分,结合网络药理学和分子对接技术研究黑桑治疗阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的作用分子机制。HPLC法建立12批黑桑的指纹图谱并对共有峰进行指认识别,进一步采用相似度评价、聚类分析、主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)和理想解相似性排序法(technique for order preference by similarity to ideal solution,TOPSIS)对12批黑桑样品进行评价;通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和Swiss Target Prediction平台获得黑桑的活性成分与靶点信息。使用Gene Cards数据库和AD专属数据库(Chemogenomics Database For Alzheimer’s Disease)获得AD的疾病靶点信息,得到黑桑治疗AD的潜在作用靶点。通过String(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,String)和Cytoscape3.7.2构建PPI网络图并进行拓扑分析。利用R软件对核心靶点进行GO和KEGG富集分析。通过Auto Dock软件进行模拟分子对接。黑桑HPLC指纹图谱的相似度均>0.96,并指认出3个色谱峰,通过聚类分析将12批样品聚为3类,主成分分析结果与聚类分析结果一致。网络药理学筛选后最终得到12个核心靶点,并对核心靶点进行富集分析得到1480个GO条目和104个KEGG通路。黑桑可能通过核心靶点调节PI3K-Akt信号通路、中性粒细胞外陷等信号通路,进而调控炎症等反应,多靶点-多通路-多途径达到治疗和预防AD的效果。展开更多
文摘利用HPLC构建黑桑指纹图谱并分析黑桑的主要活性成分,结合网络药理学和分子对接技术研究黑桑治疗阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的作用分子机制。HPLC法建立12批黑桑的指纹图谱并对共有峰进行指认识别,进一步采用相似度评价、聚类分析、主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)和理想解相似性排序法(technique for order preference by similarity to ideal solution,TOPSIS)对12批黑桑样品进行评价;通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和Swiss Target Prediction平台获得黑桑的活性成分与靶点信息。使用Gene Cards数据库和AD专属数据库(Chemogenomics Database For Alzheimer’s Disease)获得AD的疾病靶点信息,得到黑桑治疗AD的潜在作用靶点。通过String(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,String)和Cytoscape3.7.2构建PPI网络图并进行拓扑分析。利用R软件对核心靶点进行GO和KEGG富集分析。通过Auto Dock软件进行模拟分子对接。黑桑HPLC指纹图谱的相似度均>0.96,并指认出3个色谱峰,通过聚类分析将12批样品聚为3类,主成分分析结果与聚类分析结果一致。网络药理学筛选后最终得到12个核心靶点,并对核心靶点进行富集分析得到1480个GO条目和104个KEGG通路。黑桑可能通过核心靶点调节PI3K-Akt信号通路、中性粒细胞外陷等信号通路,进而调控炎症等反应,多靶点-多通路-多途径达到治疗和预防AD的效果。
