民猪是我国一个著名的地方猪种,属于脂肪型猪种。而大白猪起源于欧洲,是瘦肉型猪种。通过比较这2个不同猪种间肠道微生物菌群的差异,分析它们在消化吸收上的异同点。首先针对16S r DNA V4区设计引物,对来自于5头大白猪和5头民猪的粪便...民猪是我国一个著名的地方猪种,属于脂肪型猪种。而大白猪起源于欧洲,是瘦肉型猪种。通过比较这2个不同猪种间肠道微生物菌群的差异,分析它们在消化吸收上的异同点。首先针对16S r DNA V4区设计引物,对来自于5头大白猪和5头民猪的粪便基因组进行PCR扩增,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行测序,数据经优化整理后,进行OTU聚类分析,并在门、纲、目、科和属共计5个水平上进行分类学统计。结果表明：共获得421~460 bp序列298 768条,占总数的99.98%。2组间共有OTU 885个,大白猪特有OTU 69个,民猪特有OTU 221个。共检测到25个门,其中拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、螺旋菌门（Spirochaetae）和变形菌门（Proteobacteria）占优势,民猪和大白猪之间具有大致相同的门水平分布。在检测到的207个属中,普氏菌属（Prevotella）和密螺旋体属（Treponema）的相对丰度值在2个猪种内均较高。而大白猪的厌氧弧菌属（Anaerovibrio）和梭菌属（Clostridium）分别比民猪猪高出4.5倍和3.4倍,民猪的纤维杆菌属（Fibrobacter）、螺旋体属（Spirochaeta）和密螺旋体属（Treponema）比大白猪分别高出3.7倍、1.6倍和1.7倍。由此推测,民猪肠道内纤维杆菌属的高表达可能与其易消化粗纤维饲料有关。展开更多
文摘民猪是我国一个著名的地方猪种,属于脂肪型猪种。而大白猪起源于欧洲,是瘦肉型猪种。通过比较这2个不同猪种间肠道微生物菌群的差异,分析它们在消化吸收上的异同点。首先针对16S r DNA V4区设计引物,对来自于5头大白猪和5头民猪的粪便基因组进行PCR扩增,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行测序,数据经优化整理后,进行OTU聚类分析,并在门、纲、目、科和属共计5个水平上进行分类学统计。结果表明：共获得421~460 bp序列298 768条,占总数的99.98%。2组间共有OTU 885个,大白猪特有OTU 69个,民猪特有OTU 221个。共检测到25个门,其中拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、螺旋菌门（Spirochaetae）和变形菌门（Proteobacteria）占优势,民猪和大白猪之间具有大致相同的门水平分布。在检测到的207个属中,普氏菌属（Prevotella）和密螺旋体属（Treponema）的相对丰度值在2个猪种内均较高。而大白猪的厌氧弧菌属（Anaerovibrio）和梭菌属（Clostridium）分别比民猪猪高出4.5倍和3.4倍,民猪的纤维杆菌属（Fibrobacter）、螺旋体属（Spirochaeta）和密螺旋体属（Treponema）比大白猪分别高出3.7倍、1.6倍和1.7倍。由此推测,民猪肠道内纤维杆菌属的高表达可能与其易消化粗纤维饲料有关。
