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非编码RNA调控蛋白翻译与疾病发生 被引量:3
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作者 王文涛 陈月琴 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2023年第11期1527-1545,共19页
蛋白翻译是细胞生命活动最重要的事件之一.蛋白翻译控制使细胞能够迅速和动态地适应各种刺激,其功能的紊乱将导致疾病的发生.因此,解析蛋白翻译机器及其与疾病发生的联系,是生命科学领域的重要课题.非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)的... 蛋白翻译是细胞生命活动最重要的事件之一.蛋白翻译控制使细胞能够迅速和动态地适应各种刺激,其功能的紊乱将导致疾病的发生.因此,解析蛋白翻译机器及其与疾病发生的联系,是生命科学领域的重要课题.非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)的发现被认为是近年来生物学的一个重大突破,其广泛参与细胞生命活动调控,为深入解析蛋白翻译机器及其与疾病发生的紧密联系带来了机遇.本文系统综述了ncRNA调控蛋白翻译与疾病发生的最新进展.分别从rRNA生成加工与核糖体组装、蛋白翻译起始与延伸、非经典翻译调控等蛋白的全景过程,重点回顾了近年来,新型ncRNA调控蛋白翻译在疾病发生发展中的功能,以及作为基于蛋白翻译的新型靶点和治疗策略.从一个新的维度探讨ncRNA参与蛋白翻译机器精密过程,为基于蛋白翻译控制过程治疗疾病提供新的视角和思路. 展开更多
关键词 非编码RNA 蛋白翻译 微肽 疾病发生
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长链非编码RNA编码的微肽研究进展
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作者 张雪 李臣诚 王颖 《药学进展》 CAS 2024年第11期823-837,共15页
长链非编码RNA(lncRNA)是由超过200个核苷酸构成的RNA分子,展现出相对较低的序列保守性,长期以来在生物学领域内被视为“转录噪声”,即无功能性的RNA分子。然而,近年来,随着研究的不断深入,科学家们揭示出在lncRNA中潜藏着许多小开放阅... 长链非编码RNA(lncRNA)是由超过200个核苷酸构成的RNA分子,展现出相对较低的序列保守性,长期以来在生物学领域内被视为“转录噪声”,即无功能性的RNA分子。然而,近年来,随着研究的不断深入,科学家们揭示出在lncRNA中潜藏着许多小开放阅读框,其中部分能够编码微肽。这些微肽已被证实可参与多种细胞进程及基因表达调控网络,并扮演着至关重要的角色。这一发现为生命活动的进一步探索以及疾病的临床诊断与治疗开辟了新的研究方向。对lncRNA编码的微肽在病理与生理过程中的作用、微肽的亚细胞定位与功能机制,以及微肽研究方法的进展进行综述,旨在为新型微肽诊疗一体化药物的开发提供思路与参考。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 小开放阅读框 微肽 肿瘤
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Distribution of micropeptide-coding sORFs in transcripts 被引量:1
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作者 Xinqiang Yin Jialiang Hu Hanmei Xu 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2018年第7期1029-1032,共4页
Small open reading frames(sORFs) are distributed over a wide variety of transcripts. sORFs encoding functional peptides have been identified in various configurations within apparently long noncoding RNAs. Many transl... Small open reading frames(sORFs) are distributed over a wide variety of transcripts. sORFs encoding functional peptides have been identified in various configurations within apparently long noncoding RNAs. Many translated sORFs have been identified across mRNAs, including 5’-upstream, coding domain, and 3’-downstream. sORFs have also been found in circular RNAs, pri-miRNAs, and ribosomal RNAs. Here, we present an overview of the wide distribution of the sORFs in transcripts and their functional roles in organisms. 展开更多
关键词 micropeptide sORFs uORFs NCRNA circRNAs Pri-miRNAs
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长链非编码RNA编码小肽的生物医学意义及研究策略 被引量:1
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作者 王心怡 张祯 +3 位作者 石成瑜 王颖 周天华 林爱福 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期397-405,共9页
长链非编码RNA(lncRNA)通常认为不具有蛋白质编码能力,广泛参与细胞增殖、信号转导等生命过程。但近年来研究表明,部分lncRNA的短开放阅读框(sORF)可编码具有生物活性的短于100个氨基酸的小肽,在钙离子稳态、胚胎发育等生命活动及恶性... 长链非编码RNA(lncRNA)通常认为不具有蛋白质编码能力,广泛参与细胞增殖、信号转导等生命过程。但近年来研究表明,部分lncRNA的短开放阅读框(sORF)可编码具有生物活性的短于100个氨基酸的小肽,在钙离子稳态、胚胎发育等生命活动及恶性肿瘤的发生发展中发挥作用,是潜在的药物靶点和癌症生物标志物。目前大多采用生物信息学工具预测可编码的sORF、核糖体图谱筛选潜在编码的lncRNA、体外翻译初步检测lncRNA的编码能力、质谱鉴定潜在翻译的小肽、特异性抗体及表位标签验证小肽的内源性表达等。本文介绍了近年来鉴定的lncRNA编码小肽的生理功能、病理作用以及预测lncRNA编码潜力的研究策略。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 短开放阅读框 小肽 核糖体图谱 质谱 综述
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非编码RNA来源的小肽:“微不足道”却“功能强大” 被引量:1
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作者 陈晓彤 赵文龙 +2 位作者 孙林玉 王文涛 陈月琴 《中山大学学报(自然科学版)(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期1-13,共13页
非编码RNA(ncRNA,non-coding RNA)长久以来被认为不具有编码能力。近年来随着研究技术和生物信息学工具的迅速发展,研究发现在基因组的非编码区域上存在大量小开放阅读框(sORFs,small/short open reading frames),其翻译产物被称作小OR... 非编码RNA(ncRNA,non-coding RNA)长久以来被认为不具有编码能力。近年来随着研究技术和生物信息学工具的迅速发展,研究发现在基因组的非编码区域上存在大量小开放阅读框(sORFs,small/short open reading frames),其翻译产物被称作小ORF编码肽(SEPs,sORF encoded peptides)或小肽(micropeptides)。部分小肽被证实在细胞内稳定存在并独立于其来源RNA发挥重要作用。本文系统总结了非编码RNA来源小肽的鉴定方法、可编码小肽的RNA类型以及其研究困难和瓶颈,并重点回顾了疾病和植物中发现的功能小肽,以期对小肽的筛选鉴定提供思考,对小肽作为药物研发或者农作物增产的关键靶点提供新的思路和方向。 展开更多
关键词 非编码RNA 小肽 非经典翻译 鉴定方法 调控机制
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国内6种市售酸奶中的ACE抑制肽研究 被引量:2
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作者 崔磊 张少辉 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2012年第6期30-32,42,共4页
选取了不同品牌的6种市售酸奶,通过离心、超滤、凝胶层析分离纯化低分子量(≤1.4 ku)小肽,分析了各酸奶样品中小肽质量浓度及所占比例,并通过ACE抑制实验测定了各小肽收集样的体外抗高血压活性。结果表明,不同市售酸奶的评价指标结果间... 选取了不同品牌的6种市售酸奶,通过离心、超滤、凝胶层析分离纯化低分子量(≤1.4 ku)小肽,分析了各酸奶样品中小肽质量浓度及所占比例,并通过ACE抑制实验测定了各小肽收集样的体外抗高血压活性。结果表明,不同市售酸奶的评价指标结果间存在显著性差异(P<0.05),其ACE抑制率依次为样品5(73.0%±2.59%)>样品2(67.3%±3.05%)>样品6(64.2%±3.75%)>样品3(61.9%±2.65%)>样品1(61.7%±2.38%)>样品4(52.4%±3.15%),综合评价样品5为最优。 展开更多
关键词 市售酸奶 小肽 抑制ACE活性
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非编码RNA编码微肽/蛋白与肿瘤代谢的研究进展
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作者 江戎琦 邓杰 +1 位作者 孟恩清 吴昊 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1690-1696,共7页
肿瘤无限增殖的能力依赖于它独特的代谢方式。现已证实非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)具有编码微肽/蛋白的能力,其中有一小部分微肽/蛋白能够参与肿瘤能量代谢的调控,在肿瘤的发生发展中起着关键作用。本文对目前关于ncRNA编码的微肽/... 肿瘤无限增殖的能力依赖于它独特的代谢方式。现已证实非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)具有编码微肽/蛋白的能力,其中有一小部分微肽/蛋白能够参与肿瘤能量代谢的调控,在肿瘤的发生发展中起着关键作用。本文对目前关于ncRNA编码的微肽/蛋白与癌症代谢之间的研究作一综述,并讨论了这些功能性微肽/蛋白在肿瘤发生发展中的作用机制及其临床意义。深入了解肿瘤代谢重编程中ncRNA编码的微肽/蛋白介导的调控机制,必将在癌症诊疗和预后研究方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 肿瘤代谢 糖代谢 脂质代谢 非编码RNA 微肽 蛋白
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LncRNA在骨骼肌分化及其疾病中的研究进展
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作者 沈浩 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期4877-4881,共5页
LncRNA是一种长度大于200个核苷酸的非编码RNA,它通过与染色质、蛋白质和其他RNA的相互作用参与x染色体沉默、基因组印迹、染色质修饰、转录等过程。最新研究表明LncRNA具有短的开放阅读框能编码微肽,参与调控骨骼肌分化及骨骼肌疾病的... LncRNA是一种长度大于200个核苷酸的非编码RNA,它通过与染色质、蛋白质和其他RNA的相互作用参与x染色体沉默、基因组印迹、染色质修饰、转录等过程。最新研究表明LncRNA具有短的开放阅读框能编码微肽,参与调控骨骼肌分化及骨骼肌疾病的相关过程。本综述总结了LncRNA调控骨骼肌分化的几种不同方式,包括与染色质、蛋白质相互作用、作为miRNA的海绵与各种RNA分子的相互作用、编码微肽对骨骼肌分化和疾病的调控作用。上述LncRNA调控骨骼肌疾病的分子机制可作为相关疾病潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 LncRNA 骨骼肌疾病 微肽
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微肽大用:种子脱水调控新机制
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作者 李红菊 杨维才 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期869-872,共4页
种子脱水是其成熟过程中的一个关键生理过程,直接影响种子休眠程度以及收获后种子的含水量、储存能力和品质。在农业生产中,籽粒脱水速率是决定种子收获时籽粒含水量的主要因素之一,也是决定机械化收获质量的关键。近年的研究表明,种子... 种子脱水是其成熟过程中的一个关键生理过程,直接影响种子休眠程度以及收获后种子的含水量、储存能力和品质。在农业生产中,籽粒脱水速率是决定种子收获时籽粒含水量的主要因素之一,也是决定机械化收获质量的关键。近年的研究表明,种子脱水过程中转录组和激素水平发生了明显变化,但相关分子机制研究进展非常缓慢。近期的一项研究发现了1个位于非编码区调控玉米(Zeamays)种子成熟期脱水速率的数量性状遗传位点(QTL)qKDR1,通过招募转录因子ZmMYBST1和ZmMYBR43抑制qKDR1上游微肽编码基因RPG的转录,导致RPG的表达量降低。研究揭示了RPG编码的微肽microRPG1通过调控乙烯信号途径影响种子脱水速率的分子机制,并阐明了其在作物育种和农业生产中的应用潜力。该研究拓展了人们对种子脱水调控机制的理解,为开发脱水速率更快和耐储性更强的作物品种提供了重要理论依据。 展开更多
关键词 种子脱水 机械化收获 微肽 乙烯
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小开放阅读框编码微肽的研究进展 被引量:3
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作者 陈相颖 李梦玮 +2 位作者 王颖 陈权 徐寒梅 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期737-746,共10页
已有的研究表明,生命体中存在着大量的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),先前被错误注释为ncRNA的分子序列中实际上包含小的开放阅读框(short open reading frame,sORF),部分sORF可转录并翻译成进化保守的微肽(micropeptide),这些sORF... 已有的研究表明,生命体中存在着大量的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),先前被错误注释为ncRNA的分子序列中实际上包含小的开放阅读框(short open reading frame,sORF),部分sORF可转录并翻译成进化保守的微肽(micropeptide),这些sORF由于序列较短和研究技术手段的限制而被忽略。迄今为止,已在生命体中发现一些sORF编码的功能各异的微肽,它们对生命活动的调控起着重要作用。本文对近年来发现的功能性微肽进行综述,介绍了本课题组发现新型微肽MIAC(micropeptide inhibiting actin cytoskeleton)的过程,同时总结了研究潜在微肽的相关技术,以期为研究人员利用相关技术发现新微肽提供借鉴和参考。 展开更多
关键词 非编码RNA 小开放阅读框 微肽
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Micropeptides: origins, identification, and potential role in metabolism-related diseases
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作者 Yirui LU Yutong RAN +5 位作者 Hong LI Jiao WEN Xiaodong CUI Xiaoyun ZHANG Xiumei GUAN Min CHENG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2023年第12期1106-1122,共17页
With the development of modern sequencing techniques and bioinformatics, genomes that were once thought to be noncoding have been found to encode abundant functional micropeptides(miPs), a kind of small polypeptides. ... With the development of modern sequencing techniques and bioinformatics, genomes that were once thought to be noncoding have been found to encode abundant functional micropeptides(miPs), a kind of small polypeptides. Although miPs are difficult to analyze and identify, a number of studies have begun to focus on them. More and more miPs have been revealed as essential for energy metabolism homeostasis, immune regulation, and tumor growth and development. Many reports have shown that miPs are especially essential for regulating glucose and lipid metabolism and regulating mitochondrial function.MiPs are also involved in the progression of related diseases. This paper reviews the sources and identification of miPs, as well as the functional significance of miPs for metabolism-related diseases, with the aim of revealing their potential clinical applications. 展开更多
关键词 Energy metabolism micropeptides MITOCHONDRIA Noncoding RNA(ncRNA) Small open reading frame(sORF)
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双功能RNA作用机制及其功能研究进展
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作者 罗锦堂 赵一苹 +7 位作者 夏晓霞 王馨艺 胡德宝 张林林 郭益文 丁向彬 郭宏 李新 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第9期23-27,共5页
编码和非编码RNA(cncRNA)又被称为双功能RNA,是一种同时具有非编码调控功能与蛋白质编码功能的新型RNA分子,其既可以通过非编码RNA作用机制发挥基因调控功能,如作为分子诱饵或通过直接结合的方式发挥调控作用、作为支架结构阻断分子和... 编码和非编码RNA(cncRNA)又被称为双功能RNA,是一种同时具有非编码调控功能与蛋白质编码功能的新型RNA分子,其既可以通过非编码RNA作用机制发挥基因调控功能,如作为分子诱饵或通过直接结合的方式发挥调控作用、作为支架结构阻断分子和转运核蛋白复合物、作为信号传感器感受代谢物变化,从而调控蛋白质表达;也可以通过小开放阅读框(sORF)结构编码功能性微肽产物参与机体生命活动。文章概述了当前cncRNA的主要功能和分子作用机制,展望了cncRNA研究存在的问题及其应用前景,以期为今后对cncRNA的研究提供一定参考。 展开更多
关键词 编码或非编码RNA 双功能RNA 长链非编码RNA 微肽 分子机制
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功能性微肽通量发现和功能验证的研究进展
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作者 吕雪 李帮洁 徐寒梅 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期478-490,共13页
随着计算生物学和深度测序技术的飞速发展,愈来愈多的研究表明大量之前未被注释、隐藏在非编码RNA中的非经典开放阅读框(open reading frame,ORF)具有编码功能性微肽(micropeptide)的能力。本文对微肽的基因来源、生物性质、预测方法和... 随着计算生物学和深度测序技术的飞速发展,愈来愈多的研究表明大量之前未被注释、隐藏在非编码RNA中的非经典开放阅读框(open reading frame,ORF)具有编码功能性微肽(micropeptide)的能力。本文对微肽的基因来源、生物性质、预测方法和功能验证的研究现状和技术策略展开综述,以期为后续开展微肽发现、研究调控机制以及新靶点、生物标志物的开发等提供理论基础和参考依据。 展开更多
关键词 非编码RNA sORFs 功能性微肽
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