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题名茄科植物甲基腐胺氧化酶基因进化路径分析
被引量:2
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作者
王鹏
罗朝鹏
盖江涛
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机构
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室
中国烟草总公司郑州烟草研究院
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期47-53,共7页
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基金
中央级科研单位基本科研业务费(1630032014013
1630032013009)资助
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文摘
甲基腐胺氧化酶(MPO)是茄科植物中腐胺衍生的生物碱合成途径中重要基因。前人研究表明,MPO基因由DAO基因进化而来,然而其在植物中的完整进化图景未见报道。本研究在全基因组水平上全面鉴定MPO基因所属的CuAO基因的基础上,通过进化分析,构建了植物的MPO基因进化路径。首先,从已报道的MPO、CuAO及DAO基因中均鉴定得到了三个保守结构域;在此基础上,结合BLAST和HMMER,从6个植物基因组中鉴定得到了35个CuAO家族基因。系统发育分析表明,该家族基因分为4个亚家族。亚家族Ⅰ和Ⅱ均为AO基因;亚家族Ⅲ基因功能还未获鉴定,该亚家族基因在烟草属植物中不存在;亚家族Ⅳ基因仅在菊亚纲中发现,其在茄科中进一步分化成DAO基因和MPO基因。本研究表明,MPO基因的起源最早可追溯到AO基因,而其最近的祖先出现于菊亚纲,最终在茄科植物起源后进化得到具有MPO活性的基因,从而整合入尼古丁等腐胺衍生的生物碱生物合成途径。
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关键词
腐胺甲基氧化酶
含铜氨基氧化酶
基因挖掘
进化
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Keywords
methylputrescine oxidase
Copper-containing amine oxidase
Gene mining
Evolution
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分类号
Q943.2
[生物学—植物学]
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