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魔芋葡甘聚糖羧甲基化方法改进研究 被引量:24
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作者 汪超 李斌 +1 位作者 谢笔钧 陈君仙 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第5期140-144,共5页
针对魔芋葡甘聚糖(KGM)分子结构特性进行羧甲基化方法的改进,在乙醇介质中先混合醚化试剂,再进行碱化催化反应制备羧甲基魔芋葡甘聚糖(CMK)。通过单因素和正交试验,对其改性反应条件进行优化,以取代度(DS)和表观黏度(η)为评价指标,综... 针对魔芋葡甘聚糖(KGM)分子结构特性进行羧甲基化方法的改进,在乙醇介质中先混合醚化试剂,再进行碱化催化反应制备羧甲基魔芋葡甘聚糖(CMK)。通过单因素和正交试验,对其改性反应条件进行优化,以取代度(DS)和表观黏度(η)为评价指标,综合二者确定羧甲基化的最佳条件为:55℃、pH12反应3.0h。产物DS可高达0.5278,最大η为15.57Pa·s。同时,运用红外光谱分析对KGM羧甲基化反应历程进行了探讨,所得CMK溶胀速率快,水溶胶透光率高。 展开更多
关键词 魔芋葡甘聚糖 羧甲基化 红外光谱 溶胀速率 透光率
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癌组织中SEPT9基因甲基化水平对Ⅱ~Ⅲ期可切除直肠癌术后无进展生存期的影响
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作者 李曰平 韩博 +1 位作者 张汝梦 鞠倩 《医学临床研究》 CAS 2024年第3期375-378,共4页
【目的】探讨癌组织中SEPT9基因甲基化水平对Ⅱ~Ⅲ期可切除直肠癌患者术后无进展生存期的影响。【方法】129例均行R0全直肠系膜切除术治疗的Ⅱ~Ⅲ期可切除直肠癌患者,术后随访5年。检测并比较患者癌组织、癌旁组织中SEPT9基因甲基化阳... 【目的】探讨癌组织中SEPT9基因甲基化水平对Ⅱ~Ⅲ期可切除直肠癌患者术后无进展生存期的影响。【方法】129例均行R0全直肠系膜切除术治疗的Ⅱ~Ⅲ期可切除直肠癌患者,术后随访5年。检测并比较患者癌组织、癌旁组织中SEPT9基因甲基化阳性表达情况,分析患者癌组织中SEPT9基因甲基化水平与临床病理参数的关系,分析影响直肠癌术后复发或转移的因素,探讨癌组织中SEPT9基因甲基化阳性表达与患者术后无进展生存的关系。【结果】癌组织中SEPT9基因甲基化阳性表达率高于癌旁组织(P<0.05)。低分化、N_(2)期、Ⅲ期、肿瘤浸润脉管的可切除直肠癌患者癌组织中SEPT9基因甲基化阳性表达率分别高于中、高分化及N_(0)~N_(1)期、Ⅱ期、肿瘤未浸润脉管者(P<0.05)。Cox回归分析显示:术前癌胚抗原水平、病理分期、分化程度、SEPT9基因甲基化阳性是影响患者术后复发或转移的独立因素(P<0.05)。SEPT9基因甲基化阳性表达患者的无进展生存率低于阴性表达患者(P<0.05)。【结论】Ⅱ~Ⅲ期可切除直肠癌患者癌组织中SEPT9基因甲基化水平与临床病理参数及预后有关,SEPT9基因甲基化阳性表达患者术后复发、转移风险更高。 展开更多
关键词 直肠肿瘤/外科学 DNA甲基化 存活率
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胃癌患者血浆PAX5和RNF180基因甲基化情况及其临床意义 被引量:5
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作者 谭智军 赵玉国 肖晓艳 《中华实用诊断与治疗杂志》 2021年第6期584-587,共4页
目的观察胃癌患者血浆配对盒蛋白5(paired box protein 5,PAX5)与环指蛋白180(ring finger protein 180,RNF180)基因甲基化情况,探讨其与临床病理特征及预后的关系。方法110例胃癌患者为胃癌组,同期体检健康者50例为对照组,采用甲基化... 目的观察胃癌患者血浆配对盒蛋白5(paired box protein 5,PAX5)与环指蛋白180(ring finger protein 180,RNF180)基因甲基化情况,探讨其与临床病理特征及预后的关系。方法110例胃癌患者为胃癌组,同期体检健康者50例为对照组,采用甲基化特异性PCR法检测血浆PAX5与RNF180基因甲基化状态,分析其与胃癌患者临床病理特征的关系。随访3年,采用Kaplan-Meier生存曲线分析PAX5、RNF180甲基化与患者预后的关系。结果胃癌患者血浆PAX5、RNF180基因启动子区甲基化发生率(70.00%、62.73%)高于对照组(32.00%、30.00%)(P<0.05),胃癌组TNM分期Ⅰ~Ⅱ期患者血浆PAX5、RNF180基因甲基化发生率(65.17%、57.30%)低于TNM分期Ⅲ~Ⅳ期患者(90.48%、85.71%)(P<0.05),胃癌组男性与女性、年龄<55岁与≥55岁、肿瘤直径<2.5 cm与≥2.5 cm、细胞低-中分化与高分化及有无淋巴结转移患者血浆PAX5、RNF180基因甲基化发生率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。发生PAX5基因甲基化的胃癌患者3年生存率(68.83%)低于未发生甲基化患者(84.85%)(P<0.05),发生RNF180基因甲基化的胃癌患者3年总体生存率(73.91%)与未发生甲基化胃癌患者(73.17%)比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论胃癌患者血浆PAX5与RNF180基因甲基化发生率增高,与肿瘤TNM分期有关,发生PAX5基因甲基化的患者3年总生存率低。 展开更多
关键词 胃癌 PAX5基因 RNF180基因 DNA甲基化 生存率
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基于低氧-免疫DNA甲基化标记在肺癌中的开发 被引量:1
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作者 熊曙光 周晴 +3 位作者 熊沿 高英杰 屈小敏 彭确昆 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期144-158,共15页
为了探究缺氧和免疫联合分析DNA甲基化位点在肺癌预后中的作用,提高肺癌免疫治疗的有效性,本研究基于甲基化和转录组二维数据,构建了一个用于预后评估的风险评分模型.从TCGA数据库中下载了247个与缺氧、免疫状态相关的去冗余肺癌样本作... 为了探究缺氧和免疫联合分析DNA甲基化位点在肺癌预后中的作用,提高肺癌免疫治疗的有效性,本研究基于甲基化和转录组二维数据,构建了一个用于预后评估的风险评分模型.从TCGA数据库中下载了247个与缺氧、免疫状态相关的去冗余肺癌样本作为训练集.然后对低缺氧-强免疫状态的样本、高缺氧-弱免疫状态的样本进行了差异基因表达、甲基化位点和临床生存率分析.生存曲线分析显示,低缺氧状态-强免疫状态组中的肺腺癌患者的1、3、5年生存率均优于高缺氧状态-弱免疫状态组(log-rank检验,P<0.05、P<0.001、P<0.001).使用LASSO回归构建的多基因预后模型包含9个甲基化位点,在肺腺癌测试数据集和验证数据集中均显示出良好的预后预测能力(AUC=0.83,0.80,0.82).这9个甲基化位点分别分布在PEBP4、FLI1、HLA-DMB、MYO1F、ABCC2、AKNA、ETS1、CCR7和TXNRD1基因上.此外,我们从5年生存曲线中发现,在低缺氧-强免疫状态组中高表达的PEBP4、CCR7、FLI1、AKNA、HLA-DMB、MYO1F和低表达的ABCC2基因也可作为预后因子(P<0.05).结果表明这9个新筛选的生物标记物可以作为肺腺癌免疫治疗的潜在靶点. 展开更多
关键词 肺腺癌 低氧 免疫 DNA甲基化 生存率
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Evaluation of mercury methylation in fresh and pre dried sediments using ^(203)Hg radioisotope 被引量:2
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作者 J.R.Ikingura 1, H.Akagi 2, J.R.D.Guimaraes 3 (1. University of Dar es Salaam, P.O.Box 35052, Dar es Salaam, Tanzania 2. Nat. Inst. for Minamata Disease, 4058 Hama, Minamata, 867 Kumamoto, Japan 3. Lab. de Radioisotopos, Universidade Federal Do Rio 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2000年第S1期66-75,共10页
Mercury methylation rates in fresh and pre dried river sediments were determined in sediment water systems spiked with 203 HgCl 2 at a level of 0.75—0.95 ppm as Hg. At the end of the incubation period (21... Mercury methylation rates in fresh and pre dried river sediments were determined in sediment water systems spiked with 203 HgCl 2 at a level of 0.75—0.95 ppm as Hg. At the end of the incubation period (21—38 days), methylmercury production in the fresh sediments was in the order of 3.0% to 13.75%, whereas in the pre dried sediments the methylation was much lower, at 0.6% to 3.9%. The highest methylation levels were generally recorded in the uppermost, 1 cm layer of the sediment column. Total mercury concentration in water in equilibrium with the 203 Hg spiked fresh sediments was in the range of 44.7 to 634 ng/L, whereas in equilibrium with the pre dried sediments the concentration was in the range of 19.5 to 34.5 ng/L. The proportion of methylmercury to total mercury in the water varied from 9.4% to 66.6% over the fresh sediments, and from 7.1% to 10.8% over the pre dried sediments. In the system consisting of water, sediment and sediment inverterbrates the concentrations of methylmercury were 8.61 to 15.69 ng/g in the sediment, 0.011 ng/ml in the water, and 9.22 to 40.69 ng/g in the inverterbrates. Methylmercury bioaccumualtion factors (BAFs) were in the order of 274 to 8087 relative to the water, and 0.25 to 7.31 relative to the sediment. These results provide further evidence for the tendency of methylmercury to accumulate in high concentrations in aquatic organisms, even at very low total mercury concentration in water. 展开更多
关键词 mercury methylation rate methylMERCURY partitioning tropical river sediment
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B3型胸腺瘤和胸腺癌中MGMT蛋白表达缺失的意义及预后分析 被引量:2
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作者 李飞 宋媛 +3 位作者 申远 何明 徐新建 岳泓旭 《解放军医药杂志》 CAS 2018年第11期24-27,共4页
目的探讨B3型胸腺瘤和胸腺癌的O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)蛋白表达缺失的意义以及对预后的影响。方法选取河北医科大学附属第四医院2008年1月—2015年1月行根治性手术切除的胸腺上皮肿瘤标本蜡块60例,按照WHO组织学分型分为B3... 目的探讨B3型胸腺瘤和胸腺癌的O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)蛋白表达缺失的意义以及对预后的影响。方法选取河北医科大学附属第四医院2008年1月—2015年1月行根治性手术切除的胸腺上皮肿瘤标本蜡块60例,按照WHO组织学分型分为B3型胸腺瘤组(20例)、胸腺癌组(28例)、瘤旁组织组(12例);按照Masaoka临床分期分为Ⅰ/Ⅱ组和Ⅲ/Ⅳ组。术后随访截止日期2018年4月。比较B3型胸腺瘤和胸腺癌中MGMT蛋白表达缺失的情况。结果胸腺癌组MGMT蛋白表达缺失高于B3型胸腺瘤组和瘤旁组织组(P <0. 05),B3型胸腺瘤组MGMT蛋白缺失高于瘤旁组织组(P <0. 05)。Ⅲ/Ⅳ期B3型胸腺瘤和胸腺癌发生蛋白表达缺失的比例高于Ⅰ/Ⅱ期(P <0. 05)。MGMT蛋白表达缺失病例5年生存率低于表达正常病例(P <0. 05)。Ⅲ/Ⅳ5年生存率低于Ⅰ/Ⅱ(P <0. 05)。结论 MGMT蛋白表达缺失提示B3型胸腺瘤和胸腺癌恶性程度高,预后差。 展开更多
关键词 胸腺肿瘤 O(6)-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶 甲基化 生存率
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人肝细胞中FⅧ基因5'端CpG岛甲基化状态的研究 被引量:2
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作者 何玉霞 周云飞 +2 位作者 王娟 代晓璐 张军 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1600-1605,共6页
本实验通过建立稳定的重亚硫酸盐测序(bisulfite-sequencing PCR,BSP)检测平台,研究人类永生化肝细胞LO2与人肝组织细胞中凝血因子Ⅷ(coagulation factorⅧ,FⅧ)基因5'端Cp G岛的甲基化状态及该Cp G岛的甲基化在FⅧ表达调节中的作... 本实验通过建立稳定的重亚硫酸盐测序(bisulfite-sequencing PCR,BSP)检测平台,研究人类永生化肝细胞LO2与人肝组织细胞中凝血因子Ⅷ(coagulation factorⅧ,FⅧ)基因5'端Cp G岛的甲基化状态及该Cp G岛的甲基化在FⅧ表达调节中的作用。运用RT-PCR、Western-blot检测FⅧ在LO2细胞与人肝组织中的转录及表达,Methprimer软件预测FⅧ基因5'端Cp G岛并设计BSP引物,BSP联合TA克隆及质粒PCR各验证十个阳性单克隆送测序,QUMA软件对测序结果进行甲基化位点分析,以(甲基化CG位点个数)/(甲基化CG位点个数+非甲基化位点个数)计算甲基化率。结果显示,新鲜分离的人肝组织细胞能够稳定表达FⅧ,LO2细胞不能表达;FⅧ基因5'端存在一个278 bp的Cp G岛,LO2细胞中该Cp G岛的甲基化率为93.48%,正常人肝组织中该Cp G岛的甲基化率为93.91%。本实验成功建立稳定的BSP检测平台,并发现在LO2细胞与人肝组织中,FⅧ基因5'端均存在一个被高度甲基化的Cp G岛,人肝组织中FⅧ基因5'端Cp G岛的甲基化可能参与维持体内FⅧ的低水平表达。 展开更多
关键词 FⅧ基因 甲基化率 BSP CPG岛
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蒙古羊后腿肌肉组织中MYF6和MEF2A基因的甲基化分析 被引量:1
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作者 罗建兴 刘国强 +2 位作者 张宏博 海小 郭梁 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第3期22-26,共5页
为了分析生肌决定因子(MYF6)和肌细胞增强因子(MEF2A)基因在蒙古羊肌肉组织中的甲基化状态,试验以蒙古羊后腿的8种不同肌肉组织臀中肌、胫骨前肌、股四头肌、趾深屈肌、阔筋膜张肌、腓肠肌、腓骨长肌、半膜肌为材料,采用凝胶电泳技术检... 为了分析生肌决定因子(MYF6)和肌细胞增强因子(MEF2A)基因在蒙古羊肌肉组织中的甲基化状态,试验以蒙古羊后腿的8种不同肌肉组织臀中肌、胫骨前肌、股四头肌、趾深屈肌、阔筋膜张肌、腓肠肌、腓骨长肌、半膜肌为材料,采用凝胶电泳技术检验样品DNA的质量,然后用亚硫酸氢盐修饰基因组DNA并对其进行PCR扩增,通过甲基化分析软件对PCR扩增产物的测序结果进行分析以评价各肌肉组织中MYF6和MEF2A基因的甲基化模式。结果表明:不同肌肉组织中MYF6基因均未发生甲基化,而MEF2A基因均发生DNA甲基化,甲基化率均达到100%。说明MYF6和MEF2A基因的甲基化模式在不同肌肉组织之间具有一致性,且根据MYF6基因全部未甲基化、MEF2A基因完全甲基化的结果推测MYF6和MEF2A基因的甲基化并不会对蒙古羊肌肉的形成和分化产生显著影响。 展开更多
关键词 MYF6基因 MEF2A基因 蒙古羊 肌肉组织 甲基化率 甲基化分析
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Nell-1基因启动子区甲基化与胃癌围手术期相关因素的研究 被引量:1
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作者 高长路 孔德阳 +2 位作者 孙凌宇 徐力善 高旭 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 2018年第3期242-247,共6页
目的探讨Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌围手术期有关联的各种因素之间的相关性,研究胃癌患者术后体重减轻对于胃癌患者5年生存期的影响。方法收集2012年哈尔滨医科大学附属第四医院肿瘤外科25例接受胃癌根治术的病人资料,运... 目的探讨Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌围手术期有关联的各种因素之间的相关性,研究胃癌患者术后体重减轻对于胃癌患者5年生存期的影响。方法收集2012年哈尔滨医科大学附属第四医院肿瘤外科25例接受胃癌根治术的病人资料,运用配对t检验及简单回归分析统计方法,分析Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌患者围手术期各种因素之间的相关性,运用Log-rank检验比较不同体重减轻组胃癌患者5年无病生存期及总生存期。结果 Nell-1基因启动子区不同甲基化位点的胃癌组织组和胃正常组织组甲基化率之间的差别有统计学意义(1、11、22号位点),简单回归分析结果显示第1号位点随着患者术后体重减轻百分比的数值逐渐减小,胃癌组织组和胃正常组织组甲基化率之间的差值会逐渐增大(负相关);第11号位点随着D-二聚体的数值逐渐增大,胃癌组织组和胃正常组织组甲基化率之间的差值会逐渐增大(正相关),第22号位点随着患者血小板计数的数值逐渐减小,胃癌组织组和胃正常组织组甲基化率之间的差值会逐渐增大(负相关)。体重减轻<12%的胃癌患者5年无病生存期明显优于体重减轻> 12%的胃癌患者,体重减轻<12%的胃癌患者5年总生存期明显优于体重减轻> 12%的胃癌患者。结论胃癌的发生、发展及预后受诸多因素的影响,不同甲基化位点其甲基化率不同,其与胃癌患者围手术期相关因素之间存在一定关联性,不同体重减轻组胃癌患者无病生存期及总生存期均存在差异。 展开更多
关键词 围手术期 胃癌 Nell-1基因 甲基化率 生存期
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氢醌对K562细胞着色性干皮病基因D甲基化的影响 被引量:1
10
作者 万秀方 肖芸 +4 位作者 郑丹 张越时 龚俊杰 张亚莉 杨国珍 《贵阳医学院学报》 CAS 2015年第6期552-555,共4页
目的:了解不同剂量苯代谢物氢醌(HQ)对人白血病细胞株K562细胞着色性干皮病基因D(XPD)甲基化水平的影响。方法:分别以终浓度为0、15、30和60μmol/L HQ溶液重复处理K562细胞48 h,采用MTT比色法检测K562细胞增殖能力,采用亚硫酸氢盐处理... 目的:了解不同剂量苯代谢物氢醌(HQ)对人白血病细胞株K562细胞着色性干皮病基因D(XPD)甲基化水平的影响。方法:分别以终浓度为0、15、30和60μmol/L HQ溶液重复处理K562细胞48 h,采用MTT比色法检测K562细胞增殖能力,采用亚硫酸氢盐处理后测序法检测XPD甲基化水平;观察各组细胞存活率及甲基化率。结果:HQ 0、15、30、60μmol/L处理后,K562细胞存活率分别为(100.00±0.00)%、(85.46±0.60)%、(63.46±7.02)%和(51.20±6.49)%,15μmol/L组与0μmol/L组比较,差异无统计学意义(P>0.05),30μmol/L和60μmol/L组与0μmol/L组比较,差异有统计学意义(P<0.05);XPD基因甲基化水平分别依次为1.03%(3/290)、0.34%(1/290)、0.34%(1/290)和0.70%(2/290),15、30、60μmol/L组与0μmol/L组比较,差异无统计学意义(χ2=1.531,P>0.05)。结论:HQ对K562细胞生长有明显的抑制作用,但对细胞中XPD基因甲基化水平无影响。 展开更多
关键词 氢醌 干皮病 着色性 DNA甲基化 K562细胞 存活率
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DNA甲基化分析中重亚硫酸盐处理DNA转化效率的评估方法 被引量:1
11
作者 刘洋洋 崔恒宓 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期939-944,共6页
为建立一种评估重亚硫酸盐处理DNA样本后胞嘧啶转化效率的有效方法,以两组不同的Taq Man q PCR检测梯度稀释的重亚硫酸盐处理和未处理的DNA标准品,建立转化与未转化的DNA Ct值以及对应的DNA拷贝数的标准曲线。使用相同的探针定量检测重... 为建立一种评估重亚硫酸盐处理DNA样本后胞嘧啶转化效率的有效方法,以两组不同的Taq Man q PCR检测梯度稀释的重亚硫酸盐处理和未处理的DNA标准品,建立转化与未转化的DNA Ct值以及对应的DNA拷贝数的标准曲线。使用相同的探针定量检测重亚硫酸盐处理后的DNA样本评估转化效率。结果显示该方法应用两组探针,根据相应的标准曲线,精确评估样本经重亚硫酸盐处理的转化效率。使用已知转化和未转化拷贝数的混合DNA作为模板,证实了该方法的可靠性。同时也对不同重亚硫酸盐试剂盒处理DNA的转化效率进行了评估,结果显示,该方法能够有效地评估DNA样品重亚硫酸盐的转化效率,为DNA甲基化准确分析提供了可靠快捷的方法。 展开更多
关键词 DNA甲基化 重亚硫酸盐 TAQMAN qPCR 转化率
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两种喹诺酮类抗生素对Geobacter sulphurreducens PCA菌的影响研究
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作者 陶虎春 马骉 +2 位作者 丁凌云 吴青青 高月 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第5期1039-1045,共7页
以一种典型的汞甲基化细菌铁还原菌Geobacter sulphurreducens PCA为研究菌种,选取两种喹诺酮类抗生素氧氟沙星和环丙沙星,研究复合污染体系下抗生素对PCA菌生长和产甲基汞能力的影响。研究结果表明,低浓度抗生素对PCA菌的生长有促进作... 以一种典型的汞甲基化细菌铁还原菌Geobacter sulphurreducens PCA为研究菌种,选取两种喹诺酮类抗生素氧氟沙星和环丙沙星,研究复合污染体系下抗生素对PCA菌生长和产甲基汞能力的影响。研究结果表明,低浓度抗生素对PCA菌的生长有促进作用。通过抗生素浓度的检测以及ESI scan扫描图得出,Geobacter sulphurreducens PCA可以代谢氧氟沙星,环丙沙星不能被Geobacter sulphurreducens PCA降解。两种抗生素的存在会促进汞甲基化发生,氧氟沙星对于Geobacter sulphurreducens PCA甲基汞转化率的提升是对照组的4.21倍,环丙沙星对甲基汞转化率的提升是对照组的2.27倍。添加两种抗生素的混合溶液对Geobacter sulphurreducens PCA菌甲基汞转化率的提升也达到对照组的2倍以上,但没有显示出两种抗生素对甲基汞转化具有协同促进作用。 展开更多
关键词 汞甲基化微生物 抗生素 代谢产物 甲基化速率
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结肠癌患者BCL6B基因启动子区域甲基化检测结果分析
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作者 白雪 杜井峰 《中外医疗》 2021年第22期185-187,198,共4页
目的探讨结肠癌患者BCL6B基因启动子区域甲基化情况。方法方便选取2018年6月—2020年6月该院收治的56例结肠癌患者,取其癌组织与癌旁组织,另取同期同数量在该院做健康检查正常人的肠镜活检组织。比较其BCL6B基因启动子区域甲基化率,并... 目的探讨结肠癌患者BCL6B基因启动子区域甲基化情况。方法方便选取2018年6月—2020年6月该院收治的56例结肠癌患者,取其癌组织与癌旁组织,另取同期同数量在该院做健康检查正常人的肠镜活检组织。比较其BCL6B基因启动子区域甲基化率,并分析影响因素;再比较3种组织的BCL6B基因启动子区域甲基化状况。结果Ⅰ、Ⅱ期患者甲基化率(50.00%)明显低于Ⅲ、Ⅳ期(81.25%)患者,差异有统计学意义(χ^(2)=6.140,P<0.05);高分化患者甲基化率(44.44%)明显低于中、低分化(78.95%)患者,差异有统计学意义(χ^(2)=6.667,P<0.05);而有淋巴转移患者甲基化率(84.85%)明显高于无转移(43.48%)患者,差异有统计学意义(χ^(2)=10.635,P<0.05);Logistic分析显示,TNM分期、分化程度以及有无转移均为BCL6B基因启动子区域甲基化率的独立影响因素(P<0.05)。正常结肠组织中未发现甲基化情况;结肠癌细胞系中RKO、HT29完全甲基化;56例患者中甲基化率达67.86%。结论BCL6B基因在结肠癌呈高甲基化,与TNM分期、分化程度以及有无淋巴转移密切相关,经去甲基化药物处理后BCL6B表达上升,结肠癌的发病机制与BCL6B基因启动子区域甲基化相关。 展开更多
关键词 结肠癌 BCL6B基因 基因启动子区域甲基化 聚合酶链式反应 甲基化率
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Nell-1基因启动子区甲基化与胃癌预后因素的关联研究
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作者 高长路 吴迪 +5 位作者 沈伟东 李萌 杨冬冬 郑宏群 孙凌宇 张岂凡 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 2016年第5期437-439,共3页
目的探讨Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌预后有关联的各种因素之间的相关性。方法收集2012年哈尔滨医科大学附属第四医院肿瘤外科25例接受胃癌根治术的患者资料,运用混合效应线性模型分析Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与... 目的探讨Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌预后有关联的各种因素之间的相关性。方法收集2012年哈尔滨医科大学附属第四医院肿瘤外科25例接受胃癌根治术的患者资料,运用混合效应线性模型分析Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌预后有关的各种因素之间的相关性。结果 Nell-1基因启动子区第26号甲基化位点的胃癌组织组甲基化率与胃正常组织组甲基化率之间的差别有统计学意义,混合效应线性模型分析显示胃癌预后有关的因素(癌胚抗原、糖蛋白抗原199)对Nell-1基因启动子区第26号甲基化位点的甲基化率有影响,相同影响因素下该位点胃癌组织组甲基化率受到的影响程度高于胃正常组织组。结论不同甲基化位点其甲基化率不同,其与胃癌患者肿瘤标记物之间存在一定相关性。 展开更多
关键词 肿瘤标记物 胃癌 Nell-1基因 甲基化率
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脑源性神经营养因子启动子区甲基化与孤独症谱系障碍关系初探
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作者 周家秀 丁明 +8 位作者 崔冬 张琳琳 周甄会 秦尚够 廖汝琴 王艳 何福生 杨峰 王明帮 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期98-102,共5页
目的通过比较孤独症谱系障碍(autism spectrum disorders,ASD)患者和正常对照脑源性神经营养因子(brain derived neurotrophic factor,BDNF)基因启动子Ⅰ区和Ⅳ区各CpG单元甲基化率,探讨ASD可能的发病机制。方法选取ASD患者12例及正常对... 目的通过比较孤独症谱系障碍(autism spectrum disorders,ASD)患者和正常对照脑源性神经营养因子(brain derived neurotrophic factor,BDNF)基因启动子Ⅰ区和Ⅳ区各CpG单元甲基化率,探讨ASD可能的发病机制。方法选取ASD患者12例及正常对照12名,利用飞行时间质谱法检测全血中BDNF基因启动子Ⅰ和Ⅳ区各CpG单元甲基化率,并分析其相关性距离、进化关系,比较两组各单元甲基化率。结果在BDNF启动子Ⅰ区和Ⅳ区分别检测到17个和8个CpG单元的甲基化率。ASD患者组BDNF启动子Ⅰ区中CpG单元4、7、10、35,以及BDNF启动子Ⅳ区CpG单元11.12、14相关性距离较近,聚类成比较小的分支。ASD患者BDNF启动子Ⅰ区CpG单元5.6甲基化率低于对照组(P<0.05),Ⅳ区CpG单元3和15甲基化率高于对照组(P<0.05)。结论 ASD患者BDNF启动子Ⅰ区CpG单元5.6和Ⅳ区CpG单元3和15甲基化率在ASD患者组和对照组差异显著,提示BDNF启动子甲基化可作为ASD潜在的生物标志物深入研究。 展开更多
关键词 孤独症谱系障碍脑源性神经营养因子启动子 甲基化
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Nell-1基因启动子区甲基化在胃癌中的研究
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作者 高长路 沈伟东 +4 位作者 吴迪 李萌 杨冬冬 孙凌宇 张岂凡 《现代生物医学进展》 CAS 2016年第22期4274-4279,共6页
目的:探讨Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌患者术后病理分期及淋巴结转移度之间相关性。方法:收集2012年4月至2012年9月在哈尔滨医科大学附属第四临床医院肿瘤外科25例接受胃癌根治术的病人资料,运用配对t检验及线性回归统计方... 目的:探讨Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌患者术后病理分期及淋巴结转移度之间相关性。方法:收集2012年4月至2012年9月在哈尔滨医科大学附属第四临床医院肿瘤外科25例接受胃癌根治术的病人资料,运用配对t检验及线性回归统计方法,分析Nell-1基因启动子区不同甲基化位点与胃癌患者临床病理资料之间的相关因素。结果:Nell-1基因启动子区不同甲基化位点的胃癌组织组和胃正常组织组甲基化率之间的差别有统计学意义(第1号位点及第38号位点),简单线性回归结果分析显示在第1号位点随着患者术后病理分期逐渐降低,胃癌组织组和胃正常组织组甲基化率之间的差值会逐渐增大(负相关);而在第38号位点随着淋巴结转移度的逐渐增大,胃癌组织组和胃正常组织组甲基化率之间的差值会逐渐增大(正相关)。结论:胃癌的发生受诸多因素的影响,不同甲基化位点其甲基化率不同,其与胃癌患者临床病理资料之间存在一定相关性。 展开更多
关键词 甲基化率 胃癌 N E L L-1基因
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菊花组织培养继代过程中的DNA甲基化变化 被引量:8
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作者 聂丽娟 王子成 何艳霞 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1689-1694,共6页
采用MSAP(甲基敏感扩增多态性)方法对菊花(Dendranthema×grandiflorum)组织培养继代过程中的DNA甲基化情况进行了分析。结果发现,3个单芽系的组培苗较田间材料均有DNA甲基化增加和减少现象,采用7对引物,共扩增出929条带,各单芽系DN... 采用MSAP(甲基敏感扩增多态性)方法对菊花(Dendranthema×grandiflorum)组织培养继代过程中的DNA甲基化情况进行了分析。结果发现,3个单芽系的组培苗较田间材料均有DNA甲基化增加和减少现象,采用7对引物,共扩增出929条带,各单芽系DNA甲基化变异率分别为8.929%、8.902%和8.986%。继代材料较母体均有甲基化变异发生,且变异类型中DNA甲基化减少的比例高于甲基化增加的比例,随着继代次数的增加,两种变异间的差异逐渐减小,比例相近。同时在同一单芽系内的不同次继代个体间有DNA甲基化变化现象,对5次继代的180个个体研究发现,带型变化中18.38%的带型不一致,2.99%为一个或两个个体发生了变化,仅有1.72%在发生变化后趋于稳定,另外10.68%的带型呈现不稳定的随机变化。 展开更多
关键词 菊花 继代培养 MSAP方法 DNA甲基化变化 变异率
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砷对HOXD10基因表达的影响 被引量:3
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作者 尚莉 平妮娜 +3 位作者 张若冰 史丽霞 罗神利 何越峰 《中国职业医学》 CAS 北大核心 2017年第5期542-546,共5页
目的探讨砷对周围血淋巴细胞中及人肺腺癌细胞系A549细胞中同源异型盒D10(HOXD10)基因表达的影响。方法 (1)采用判断抽样方法,抽取某砒霜厂职业性接触砷的59名工人为接触组,以无职业性接触砷的17名当地居民为对照组。采用氢化物发生-冷... 目的探讨砷对周围血淋巴细胞中及人肺腺癌细胞系A549细胞中同源异型盒D10(HOXD10)基因表达的影响。方法 (1)采用判断抽样方法,抽取某砒霜厂职业性接触砷的59名工人为接触组,以无职业性接触砷的17名当地居民为对照组。采用氢化物发生-冷肼捕集-原子吸收法检测2组人群尿中形态砷水平,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)法检测周围血淋巴细胞中HOXD10的表达。(2)以浓度为0.0、0.1、0.5、1.0、2.0μmol/L的三氧化二砷(As_2O_3)处理A549细胞,采用比色法检测细胞存活率,采用qRT-PCR法检测HOXD10的表达。结果 (1)接触组人群尿中无机砷、一甲基砷酸、二甲基砷酸、总砷水平和周围血淋巴细胞中HOXD10 mRNA相对表达水平均高于对照组(P<0.05)。(2)As_2O_3可导致A549细胞存活率呈现剂量依赖性下降(P<0.01),HOXD10mRNA相对表达水平呈现剂量依赖性上调(P<0.01)。A549细胞存活率和HOXD10 mRNA相对表达水平呈负相关,相关系数为-0.777(P<0.01)。结论砷可导致职业接触人群周围血中HOXD10表达上调。As_2O_3可抑制A549细胞增殖,可能与上调HOXD10表达有关。 展开更多
关键词 三氧化二砷 HOXD10 甲基化 细胞存活率
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氟斑牙患儿ERα启动子区甲基化率与血钙和尿氟的相关性 被引量:2
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作者 陈敬天 《西南国防医药》 CAS 2016年第7期790-792,共3页
目的探讨氟斑牙患儿ERα启动子区甲基化水平与病情及血清钙和尿氟水平的相关性。方法选择本地区饮水型地方性氟中毒流行区2个调查点的儿童作为研究对象,根据氟斑牙病情分为正常组、轻度组和中重度组,对3组ERa启动子区甲基化水平以及血... 目的探讨氟斑牙患儿ERα启动子区甲基化水平与病情及血清钙和尿氟水平的相关性。方法选择本地区饮水型地方性氟中毒流行区2个调查点的儿童作为研究对象,根据氟斑牙病情分为正常组、轻度组和中重度组,对3组ERa启动子区甲基化水平以及血清钙水平和尿氟含量进行分析。结果中重度组女患者比例较其他组高(P<0.05),中重度组男童ERα启动子区甲基化率显著高于女童(P<0.05);中重度组和轻度组ERα基因启动子区甲基化率均显著高于正常组(P<0.05),中重度组与轻度组的甲基化率差异不显著(P>0.05);轻度组血清钙水平较正常组显著偏低(P<0.05),重度组与轻度组比较差异不显著(P>0.05);轻度组和中重度组尿氟含量均显著高于正常组(P<0.05),重度组尿氟含量显著高于轻度组(P<0.05)。氟斑牙患儿的ERα启动子区甲基化率与血清钙水平呈显著负相关(r=-0.183,P<0.05),与尿氟水平呈显著正相关(r=0.331,P<0.05)。结论氟斑牙患儿ERα启动子区甲基化率与患儿血清钙水平呈显著负相关,与尿氟水平呈显著正相关,而与病情的关系需要进一步的研究证实。 展开更多
关键词 氟斑牙 ERa启动子区甲基化水平 病情 血清钙
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介入放射诊疗工作人员机体DNA甲基化状态与职业暴露的关系 被引量:1
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作者 章群 闫鹏 +3 位作者 肖国兵 李小平 王爱红 王永 《环境与职业医学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期629-633,共5页
[目的]探讨介入放射诊疗工作人员职业暴露对机体DNA甲基化状态、甲基化相关酶类及甲基化次生产物的影响。[方法]暴露组为120名放射工龄3年以上的介入放射诊疗工作人员,对照组为性别相同、年龄±3岁的120名非放射诊疗医技人员。采集... [目的]探讨介入放射诊疗工作人员职业暴露对机体DNA甲基化状态、甲基化相关酶类及甲基化次生产物的影响。[方法]暴露组为120名放射工龄3年以上的介入放射诊疗工作人员,对照组为性别相同、年龄±3岁的120名非放射诊疗医技人员。采集空腹静脉血,前处理后通过高效液相色谱法和酶标法依次检测DNA总甲基化率、DNA甲基化转移酶(DNAmethyltransferase,Dnmt)和同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)的表达水平并比较两组差异。采用偏相关和协方差分析暴露组人群DNA甲基化指标与年有效剂量监测值和介入工龄的关系。采用多元线性回归分析个人剂量监测值、介入工龄、年龄等因素对机体甲基化状态的影响。[结果]暴露组Dnmt为(0.064±0.043)×10~3U/L,Hcy为(10.37±3.92)μmol/L,均高于对照组[(0.047±0.035)×10~3U/L和(9.32±3.90)μmol/L](P<0.05),但DNA总甲基化率[暴露组(8.10±1.53)%,对照组(8.47±1.41)%]组间差异无统计学意义(P>0.05)。暴露组年有效剂量值与Dnmt呈正相关(r=0.671,P=0.00),未发现其他指标与年累积个人剂量值存在相关性。多因素分析显示,年龄和介入工龄(标准化回归系数分别为-0.182和-0.298,均P<0.01)是影响介入工作者机体甲基化状态的重要因素。[结论]介入放射诊疗工作者职业暴露对机体DNA甲基化过程中的相关酶类及代谢产物的表达存在一定影响,但未见对DNA甲基化状态的影响。 展开更多
关键词 介入放射诊疗工作者 DNA总甲基化率 DNA甲基化转移酶 同型半胱氨酸
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