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胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析 被引量：6
1
作者 姚远 李胜昔 《解剖科学进展》 2019年第5期525-527,531,共4页
目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采... 目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采用GEO在线分析工具GEO2R分析数据,选取TOP250,输出差异表达基因,并通过在线生物信息学绘制韦恩图,获得共有差异基因;通过KM plotter数据库的应用分析COL1A2、FN1、 COL6A3与预后的关系。结果通过分析GSE2685、GSE19826、GSE79973芯片数据,共获得6个共表达基因,利用差异倍数作图,选取差异倍数在2倍以上的基因COL1A2、FN1、COL6A3进行分析,KM plotter数据库的分析显示COL1A2、FN1、COL6A3与胃癌的总生存期成负相关。结论 COL1A2、FN1、COL6A3在胃癌组织中表达高于癌旁组织,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 预后 km plotter数据库 COL1A2 FN1 COL6A3
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FN1在胃癌组织和细胞中的表达及意义 被引量：6
2
作者 姚远 李胜昔 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第16期2831-2835,共5页
目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin-1,FN1)在胃癌组织和细胞中的表达,探讨其与预后的关系。方法:利用Oncomine数据库挖掘FN1在胃癌组织中的表达;实时荧光定量聚合酶链反应检测FN1在人胃癌细胞系中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析... 目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin-1,FN1)在胃癌组织和细胞中的表达,探讨其与预后的关系。方法:利用Oncomine数据库挖掘FN1在胃癌组织中的表达;实时荧光定量聚合酶链反应检测FN1在人胃癌细胞系中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析FN1表达水平与胃癌预后的关系。结果:Oncomine数据库分析FN1在多种肿瘤组织中表达增加,与胃正常组织相比,FN1在胃癌组织中表达增加,并具有统计学差异(P=1.41E-5)。FN1 mRNA在人胃癌细胞系SGC7901中表达水平增高,在胃癌组织中FN1蛋白表达增加。KM Plotter数据库分析结果显示FN1表达量与胃癌患者总体生存率存在相关性,即高表达FN1的患者总体生存率较差。结论:FN1在胃癌组织和细胞中的表达高于正常组织和细胞,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 Oncomine数据库 kmplotter数据库 纤维连接蛋白1 预后
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ELF5在乳腺癌的表达及意义 被引量：3
3
作者 齐佳瑞 肖琼 +1 位作者 杨坤 张红艳 《解剖科学进展》 2019年第2期190-192,共3页
目的研究E74-like factor 5 (ELF5)在乳腺癌的表达,探讨ELF5的表达与不同分型乳腺癌预后的关系。方法利用Oncomine数据库挖掘ELF5在乳腺癌组织中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析ELF5表达水平与雌激素受体阳性/阴性表达乳腺癌生存... 目的研究E74-like factor 5 (ELF5)在乳腺癌的表达,探讨ELF5的表达与不同分型乳腺癌预后的关系。方法利用Oncomine数据库挖掘ELF5在乳腺癌组织中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析ELF5表达水平与雌激素受体阳性/阴性表达乳腺癌生存的关系。结果 Oncomine数据库分析ELF5在乳腺癌中表达降低(P=8.29e^(-10));KM plotter数据库分析结果显示ELF5表达量与雌激素受体阳性表达的乳腺癌无复发生存(RFS)呈正相关,即高表达ELF5的患者无复发生存较高(P=0.008)。结论 ELF5在乳腺癌组织中表达低于癌旁正常组织,其表达水平越高预后越好。 展开更多
关键词 乳腺癌 ELF5 Oncomine数据库 km plotter数据库 预后
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GPX3在胃癌中的表达及临床意义 被引量：2
4
作者 张海平 李蜀豫 《世界华人消化杂志》 CAS 2019年第24期1483-1489,共7页
背景谷胱甘肽过氧化物酶3(glutathione peroxidase 3,GPX3)在胃癌(gastric cancer,GC)中低表达,但其表达与GC患者预后联系尚不明确.目的分析GPX3基因在GC中的表达模式及预后价值.方法首选,利用Oncomine数据库分析GPX3基因在GC及正常胃... 背景谷胱甘肽过氧化物酶3(glutathione peroxidase 3,GPX3)在胃癌(gastric cancer,GC)中低表达,但其表达与GC患者预后联系尚不明确.目的分析GPX3基因在GC中的表达模式及预后价值.方法首选,利用Oncomine数据库分析GPX3基因在GC及正常胃黏膜组织中的表达情况;利用KM Plotter数据库分析GPX3的表达对GC患者的预后进行分析.其次,运用TCGA数据集对GPX3的表达模式和预后价值进行验证.最后,通过免疫组织化学法检测含有90例胃腺癌及其癌旁组织的组织芯片对上述结果进一步验证.结果利用Oncomine数据库分析,发现GPX3基因在GC组中表达显著低于正常胃黏膜组织(P<0.05).利用KM Plotter数据库分析,发现GC组织中GPX3低表达与患者总体生存率显著相关(P<0.05).利用TCGA数据集对GPX3的表达模式和预后价值进行验证,提示GPX3低表达与患者GC患者总体生存率显著相关(P<0.05).通过对90例GC及其癌旁组织的组织芯片研究分析发现,GPX3在癌组织中显著低表达(P=0.037),GPX3低表达与患者的年龄、性别、肿瘤临床分期无关,但与GC患者总体生存率显著相关(HR=0.48,95%CI:0.28-0.85,P=0.019).结论GPX3在GC中呈低表达,且与预后显著相关. 展开更多
关键词 胃癌 GPX3 Oncomine数据库 km plotter数据库 TCGA数据库 组织芯片 预后
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ATAD2在卵巢癌中表达及意义的现状分析 被引量：2
5
作者 韩迎燕 王志 +3 位作者 孙书娟 吴娟子 吴鹏 刘佳 《中国妇幼保健》 CAS 2017年第19期4887-4889,共3页
目的研究ATAD2在卵巢癌中的表达及预后评判价值。方法首先,通过Oncomine数据库探索ATAD2在卵巢癌中的表达变化;其次,应用在线数据库及分析工具"the KaplanM eier plotter"(KM plotter)数据库探索ATAD2在卵巢癌中的预后评判价... 目的研究ATAD2在卵巢癌中的表达及预后评判价值。方法首先,通过Oncomine数据库探索ATAD2在卵巢癌中的表达变化;其次,应用在线数据库及分析工具"the KaplanM eier plotter"(KM plotter)数据库探索ATAD2在卵巢癌中的预后评判价值。结果 Oncomine数据库中共有391个涉及不同种类类型肿瘤的研究结果。其中有75个研究结果关于ATAD2表达差异有统计学意义(P<0.05),70个研究结果显示ATAD2的表达增高,5个研究结果显示ATAD2的表达降低。共有两个研究涉及ATAD2在卵巢癌和正常组织中的表达,共647个样本,显示ATAD2在卵巢癌中的表达较正常组织明显增高。另外,KM plotter数据库的分析显示ATAD2mRNA水平与卵巢癌患者的总生存期以及无进展生存期成负相关。结论 ATAD2 mRNA水平在卵巢癌组织中明显增高,并且是卵巢癌的危险因素,其水平越高预后越差。 展开更多
关键词 卵巢癌 预后 Oncomine数据库 km plotter数据库 ATAD2
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