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深圳地区急性上吸呼道感染住院患儿人偏肺病毒感染现状及基因分析
被引量:
10
1
作者
刘爱玲
刘淑燕
+2 位作者
朱彩云
郭龙华
刘军
《临床输血与检验》
CAS
2018年第2期150-153,共4页
目的了解深圳地区急性上呼吸道感染(acute upper respiratory tract infection,AURTI)住院患儿人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)的感染现状及hMPV优势亚型的流行情况。方法收集2015年6月~2016年6月在深圳市龙华区人民医院和福...
目的了解深圳地区急性上呼吸道感染(acute upper respiratory tract infection,AURTI)住院患儿人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)的感染现状及hMPV优势亚型的流行情况。方法收集2015年6月~2016年6月在深圳市龙华区人民医院和福田人民医院因ALRTI住院的患儿鼻咽吸取物或咽拭子标本1720份,同时收集同期健康儿童呼吸道标本6 0份,采用Qiagen One-step RT-PCR法对标本中的hMPV进行筛检,并随机选取6例hMPV阳性标本采用CEQ8800测序仪对扩增产物进行正反测序,采用BLAST软件将测序所得的基因序列与GenBank中的代表株进行序列比对分析。结果 1 720例AURTI住院患儿的鼻咽吸取物或咽拭子标本共检出hMPV阳性标本362例,阳性率为21.05%(362/1720),其中男童阳性率为10.06%(173/1720),女童阳性率为10.99%(189/1720),不同性别患儿阳性率的差异无统计学意义(χ~2=0.917,P>0.05),而健康儿童hMPV全为阴性;<1岁组AURTI住院患儿hMPV感染阳性率为3 1.4 6%,明显高于其他组,差异有统计学意义(χ~2=6.105~11.97 3,P(0.05~0.01);1~3月AURTI住院患儿感染hMPV阳性率最高为4 9.7 4%,明显高于其他月份,差异有统计学意义(χ~2=7.927~1 5.038,P<0.05~0.01);6株hMPV阳性毒株的病毒核苷酸与代表株同源性为91.0%~100.0%;6株hMPV阳性毒株分别属于A2b和B1及B2亚型。结论 hMPV是引起深圳地区AURTI住院患儿感染的主要病原之一,好发于冬春季节和1岁以下儿童,且同时存在A和B两个基因型流行。
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关键词
急性上呼吸道感染
患儿
人偏肺病毒
现状
基因分析
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职称材料
深圳宝安区急性下吸呼道感染门诊患儿人偏肺病毒感染率及基因分析
被引量:
2
2
作者
高丹
刘典浪
+2 位作者
黎国
陈裕萍
彭娟丽
《中国优生与遗传杂志》
2018年第7期133-135,共3页
目的了解深圳宝安区急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infection,ALRTI)门诊患儿人偏肺病毒(human metapneumovirus,h MPV)感染率及其优势亚型分析。方法收集2015年1月~2016年12月来深圳宝安区福永人民医院就诊的ALRTI...
目的了解深圳宝安区急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infection,ALRTI)门诊患儿人偏肺病毒(human metapneumovirus,h MPV)感染率及其优势亚型分析。方法收集2015年1月~2016年12月来深圳宝安区福永人民医院就诊的ALRTI门诊患儿760例,同期健康儿童120例,分别采用One-step RT-PCR法检测咽拭子标本中的h MPV,从h MPV阳性患儿中随机选取8例,对其扩增产物进行正反测序,并将所得基因序列与Gen Bank中的代表株进行比对分析。结果 760例ALRTI门诊患儿咽试子标本中检出h MPV 153例,阳性率为20.13%(153/760),其中男患儿为10.66%(81/760),女患儿为9.47%(72/760),男患儿略高于女患儿,但差异无统计学意义(χ2=1.072,P>0.05),而120例健康儿童咽拭子标本均未检测h MPV。1岁以下ALRTI门诊患儿h MPV阳性率为30.81%(61/198),明显高于其它年龄段,差异均有统计学意义(χ2=6.506,P<0.05;χ2=9.023,P<0.05;χ2=12.067,P<0.01)。1~3月份ALRTI门诊患儿h MPV阳性率为48.76%(138/283),明显高于其它月份,差异均有统计学意义(χ2=13.197,P<0.01;χ2=14.385,P<0.01;χ2=8.207,P<0.05)。8株h MPV阳性毒株的病毒核苷酸与代表株的同源性为92.0%~99.6%,8株h MPV毒株之间核苷酸同源性为91.2%~98.0%。h MPV感染同时存在A和B两种基因,且A2b,B1和B2为本区优势亚株。结论 h MPV是引起2015年~2016年深圳宝安区ALRTI门诊患儿感染的主要病原体之一,多发于冬春季节和1岁以下儿童,且A2b,B1和B2为本区优势亚株,应引起临床高度重视。
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关键词
急性下呼吸道感染
门诊患儿
人偏肺病毒
感染率
基因分析
原文传递
人偏肺病毒基因芯片检测方法的建立及初步应用
3
作者
刘爱玲
刘淑燕
+3 位作者
刘爱胜
刘军
朱彩云
郭龙华
《现代检验医学杂志》
CAS
2017年第6期19-22,共4页
目的建立深圳地区人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)核苷酸的快速、特异和敏感的基因芯片检测方法,为hMPV检测和诊断提供有效的诊疗手段。方法针对hMPV病毒高度保守区域基因序列,应用引物设计软件Primer5设计hMPV的荧光PCR引物;...
目的建立深圳地区人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)核苷酸的快速、特异和敏感的基因芯片检测方法,为hMPV检测和诊断提供有效的诊疗手段。方法针对hMPV病毒高度保守区域基因序列,应用引物设计软件Primer5设计hMPV的荧光PCR引物;应用探针设计软件Array Designer4.20设计hMPV的寡核苷酸检测探针,将寡核苷酸探针点样至醛基玻片上制备hMPV基因芯片,并与常规反转录酶-聚合酶链锁反应(RT-PCR)平行比较,对其灵敏度、特异度和重复性,以及用于临床样本的适用性等进行评价。结果 hMPV基因芯片法检测hMPV的特异度为96.23%(230/239),灵敏度可达2.0×10~1个/μl,线性范围为2.0×101~2.0×10~7个/μl,且重复性好;初步检测深圳地区300份临床鼻咽拭子标本,基因芯片法检出率为20.3%(61/300),明显高于常规RT-PCR法的9.7%(29/300),两方法检测的灵敏度之间差异有统计学意义(χ~2=39.205,P<0.05);两种方法检测结果一致性一般(kappa=0.360 7)。结论建立了hMPV基因芯片检测法,基因芯片法检测hMPV具有很高的特异度和灵敏度,且检测线性范围广,为实验室开展hMPV的流行监测和早期诊断提供了新的检测技术。
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关键词
人偏肺病毒
基因芯片
常规反转录酶-聚合酶链锁反应
建立
应用
下载PDF
职称材料
题名
深圳地区急性上吸呼道感染住院患儿人偏肺病毒感染现状及基因分析
被引量:
10
1
作者
刘爱玲
刘淑燕
朱彩云
郭龙华
刘军
机构
广东省深圳市龙华区人民医院检验科
广东医科大学病原生物学实验室
出处
《临床输血与检验》
CAS
2018年第2期150-153,共4页
基金
广东医科大学校院联合科研基金(No.L2016008)资助
文摘
目的了解深圳地区急性上呼吸道感染(acute upper respiratory tract infection,AURTI)住院患儿人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)的感染现状及hMPV优势亚型的流行情况。方法收集2015年6月~2016年6月在深圳市龙华区人民医院和福田人民医院因ALRTI住院的患儿鼻咽吸取物或咽拭子标本1720份,同时收集同期健康儿童呼吸道标本6 0份,采用Qiagen One-step RT-PCR法对标本中的hMPV进行筛检,并随机选取6例hMPV阳性标本采用CEQ8800测序仪对扩增产物进行正反测序,采用BLAST软件将测序所得的基因序列与GenBank中的代表株进行序列比对分析。结果 1 720例AURTI住院患儿的鼻咽吸取物或咽拭子标本共检出hMPV阳性标本362例,阳性率为21.05%(362/1720),其中男童阳性率为10.06%(173/1720),女童阳性率为10.99%(189/1720),不同性别患儿阳性率的差异无统计学意义(χ~2=0.917,P>0.05),而健康儿童hMPV全为阴性;<1岁组AURTI住院患儿hMPV感染阳性率为3 1.4 6%,明显高于其他组,差异有统计学意义(χ~2=6.105~11.97 3,P(0.05~0.01);1~3月AURTI住院患儿感染hMPV阳性率最高为4 9.7 4%,明显高于其他月份,差异有统计学意义(χ~2=7.927~1 5.038,P<0.05~0.01);6株hMPV阳性毒株的病毒核苷酸与代表株同源性为91.0%~100.0%;6株hMPV阳性毒株分别属于A2b和B1及B2亚型。结论 hMPV是引起深圳地区AURTI住院患儿感染的主要病原之一,好发于冬春季节和1岁以下儿童,且同时存在A和B两个基因型流行。
关键词
急性上呼吸道感染
患儿
人偏肺病毒
现状
基因分析
Keywords
Acute
upper
respiratory
tract
infection
Children
human
pneumovirus
Status
Genetic
analysis
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
R392.11 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
深圳宝安区急性下吸呼道感染门诊患儿人偏肺病毒感染率及基因分析
被引量:
2
2
作者
高丹
刘典浪
黎国
陈裕萍
彭娟丽
机构
深圳市宝安区福永人民医院检验科
深圳市宝安区福永人民医院儿科
深圳市宝安区福永人民医院妇产科
出处
《中国优生与遗传杂志》
2018年第7期133-135,共3页
文摘
目的了解深圳宝安区急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infection,ALRTI)门诊患儿人偏肺病毒(human metapneumovirus,h MPV)感染率及其优势亚型分析。方法收集2015年1月~2016年12月来深圳宝安区福永人民医院就诊的ALRTI门诊患儿760例,同期健康儿童120例,分别采用One-step RT-PCR法检测咽拭子标本中的h MPV,从h MPV阳性患儿中随机选取8例,对其扩增产物进行正反测序,并将所得基因序列与Gen Bank中的代表株进行比对分析。结果 760例ALRTI门诊患儿咽试子标本中检出h MPV 153例,阳性率为20.13%(153/760),其中男患儿为10.66%(81/760),女患儿为9.47%(72/760),男患儿略高于女患儿,但差异无统计学意义(χ2=1.072,P>0.05),而120例健康儿童咽拭子标本均未检测h MPV。1岁以下ALRTI门诊患儿h MPV阳性率为30.81%(61/198),明显高于其它年龄段,差异均有统计学意义(χ2=6.506,P<0.05;χ2=9.023,P<0.05;χ2=12.067,P<0.01)。1~3月份ALRTI门诊患儿h MPV阳性率为48.76%(138/283),明显高于其它月份,差异均有统计学意义(χ2=13.197,P<0.01;χ2=14.385,P<0.01;χ2=8.207,P<0.05)。8株h MPV阳性毒株的病毒核苷酸与代表株的同源性为92.0%~99.6%,8株h MPV毒株之间核苷酸同源性为91.2%~98.0%。h MPV感染同时存在A和B两种基因,且A2b,B1和B2为本区优势亚株。结论 h MPV是引起2015年~2016年深圳宝安区ALRTI门诊患儿感染的主要病原体之一,多发于冬春季节和1岁以下儿童,且A2b,B1和B2为本区优势亚株,应引起临床高度重视。
关键词
急性下呼吸道感染
门诊患儿
人偏肺病毒
感染率
基因分析
Keywords
Acute
lower
respiratory
tract
infection
Outpatient
service
of
children
human
pneumovirus
Infection
rates
Genetic
analysis
分类号
R725 [医药卫生—儿科]
原文传递
题名
人偏肺病毒基因芯片检测方法的建立及初步应用
3
作者
刘爱玲
刘淑燕
刘爱胜
刘军
朱彩云
郭龙华
机构
深圳市龙华区人民医院检验科
广东医科大学病原生物学实验室
出处
《现代检验医学杂志》
CAS
2017年第6期19-22,共4页
基金
广东医科大学校院联合科研基金立项项目(编号:L2016008)
文摘
目的建立深圳地区人偏肺病毒(human metapneumovirus,hMPV)核苷酸的快速、特异和敏感的基因芯片检测方法,为hMPV检测和诊断提供有效的诊疗手段。方法针对hMPV病毒高度保守区域基因序列,应用引物设计软件Primer5设计hMPV的荧光PCR引物;应用探针设计软件Array Designer4.20设计hMPV的寡核苷酸检测探针,将寡核苷酸探针点样至醛基玻片上制备hMPV基因芯片,并与常规反转录酶-聚合酶链锁反应(RT-PCR)平行比较,对其灵敏度、特异度和重复性,以及用于临床样本的适用性等进行评价。结果 hMPV基因芯片法检测hMPV的特异度为96.23%(230/239),灵敏度可达2.0×10~1个/μl,线性范围为2.0×101~2.0×10~7个/μl,且重复性好;初步检测深圳地区300份临床鼻咽拭子标本,基因芯片法检出率为20.3%(61/300),明显高于常规RT-PCR法的9.7%(29/300),两方法检测的灵敏度之间差异有统计学意义(χ~2=39.205,P<0.05);两种方法检测结果一致性一般(kappa=0.360 7)。结论建立了hMPV基因芯片检测法,基因芯片法检测hMPV具有很高的特异度和灵敏度,且检测线性范围广,为实验室开展hMPV的流行监测和早期诊断提供了新的检测技术。
关键词
人偏肺病毒
基因芯片
常规反转录酶-聚合酶链锁反应
建立
应用
Keywords
human
pneumovirus
gene
chip
conventional
reverse
transcriptase
polymerase
chain
reaction
set
up
application
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
深圳地区急性上吸呼道感染住院患儿人偏肺病毒感染现状及基因分析
刘爱玲
刘淑燕
朱彩云
郭龙华
刘军
《临床输血与检验》
CAS
2018
10
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职称材料
2
深圳宝安区急性下吸呼道感染门诊患儿人偏肺病毒感染率及基因分析
高丹
刘典浪
黎国
陈裕萍
彭娟丽
《中国优生与遗传杂志》
2018
2
原文传递
3
人偏肺病毒基因芯片检测方法的建立及初步应用
刘爱玲
刘淑燕
刘爱胜
刘军
朱彩云
郭龙华
《现代检验医学杂志》
CAS
2017
0
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