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青海省海西州鼠疫自然疫源地分离鼠疫菌株CRISPR基因分型研究
1
作者
张琪
代瑞霞
+7 位作者
何建
靳娟
李胜
王兴斌
施昊旻
艾丽孜热·艾尼瓦尔
廖星豪
张雪飞
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期665-669,共5页
目的利用DNA规律聚集簇间隔短回文重复序列(Clustered regularlyinter-spaced short palindromic repeats CRISPR)分型方法,全面探索海西地区分离鼠疫菌株是否存在新的基因型,为鼠疫菌溯源鉴定及流行病学分析提供理论依据。方法分离培...
目的利用DNA规律聚集簇间隔短回文重复序列(Clustered regularlyinter-spaced short palindromic repeats CRISPR)分型方法,全面探索海西地区分离鼠疫菌株是否存在新的基因型,为鼠疫菌溯源鉴定及流行病学分析提供理论依据。方法分离培养海西地区1961-2009年间取自鼠疫患者、媒介昆虫及中间宿主的50株鼠疫菌后提取其DNA,利用PCR技术,对鼠疫菌CRISPR分型中的YPa、YPb、YPc 3个位点进行扩增,测定其扩增产物核酸序列并进行分析,将测得CRISPR序列与文献最新报道的CRISPR Dictionary和NCBI数据库进行比对,找出新的CRISPR spacer阵列,基因型别,分析其进化关系,最终确定青海省海西州喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫菌株的CRISPR基因库。结果50株鼠疫菌在3个CRISPR位点上共有24种spacer,其中YPa位点上有13种、YPb位点8种、YPc位点3种,b51是新发现的spacer。50株鼠疫菌可被分为16个基因型,共归为6大CRISPR类群。Ca35′是该地区主要流行类群;Ca7是流行最为广泛的类群;Cb4和Cb4′仅存在于格尔木唐古拉地区。结论青海省海西州地区鼠疫菌种群结构复杂,Ca35′、Ca7、Cb4′是流行最普遍的种群,G26-a1′型、G22型、G9型、G26-a1′a4-为主要基因型,呈现显著的地区分布特征,今后可以利用CRISPR基因分型技术加强该地区鼠疫溯源检测和防控工作。
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关键词
规律聚集簇间隔短回文重复序列
鼠疫菌
基因分型
青海省海西州
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职称材料
地震地理信息系统的设计与实现——以青海省海西州为例
2
作者
黄彦丽
蔡佳作
郅惠
《青海大学学报（自然科学版）》
2017年第5期95-100,共6页
文中基于青海省海西州的地震特征,采用甘青地区地震烈度影响衰减模型算法,结合地震直接经济损失计算方法以及地震人员伤亡模型,引入地震灾害中各类重大专题地理数据,运用地理信息系统及计算机技术,探讨了GIS在地震灾害中的设计与实现,...
文中基于青海省海西州的地震特征,采用甘青地区地震烈度影响衰减模型算法,结合地震直接经济损失计算方法以及地震人员伤亡模型,引入地震灾害中各类重大专题地理数据,运用地理信息系统及计算机技术,探讨了GIS在地震灾害中的设计与实现,并据此构建了一套较完整的地震地理信息系统,能在地震发生时快速盲估出所造成的直接经济损失、人员伤亡及水库、管线、危险源等各类重点部位受影响情况,可为应急救援提供重要的辅助决策信息。
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关键词
地理信息系统
地震分析
地震地理信息系统
青海省海西州
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职称材料
青海海西州茫崖镇地区早石炭纪地层特征与沉积环境分析
被引量：
1
3
作者
冯丹
杨德方
苏桂芬
《华北科技学院学报》
2019年第3期88-94,共7页
青藏高原北部的沉积岩是在特定的地质条件下演化的阶段产物,其中青海海西州茫崖镇地区晚古生代早石炭纪地层发育良好,化石丰富,独具特色。本文讨论了该地区下向上石拐子组和大干沟组地层组剖面岩石组合特征,以薄片显微图像说明典型岩石...
青藏高原北部的沉积岩是在特定的地质条件下演化的阶段产物,其中青海海西州茫崖镇地区晚古生代早石炭纪地层发育良好,化石丰富,独具特色。本文讨论了该地区下向上石拐子组和大干沟组地层组剖面岩石组合特征,以薄片显微图像说明典型岩石组构、矿物组合等为特色,探讨了各岩性组地层的沉积环境,得出石拐子组上下两段沉积环境分别为浅海砂岩相和浅海-陆棚碳酸盐相,大干沟组沉积环境属于浅海碳酸岩相和浅海-陆棚碳酸岩相。为该地区开展基础地质研究、层序地层分析等工作提供基础资料。
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关键词
青海海西州茫崖镇
早石炭纪地层
岩石特征
沉积环境
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职称材料
题名
青海省海西州鼠疫自然疫源地分离鼠疫菌株CRISPR基因分型研究
1
作者
张琪
代瑞霞
何建
靳娟
李胜
王兴斌
施昊旻
艾丽孜热·艾尼瓦尔
廖星豪
张雪飞
机构
青海大学医学部公共卫生系
青海省地方病预防控制所鼠疫菌专业实验室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期665-669,共5页
基金
国家自然科学基金(No.81660349)
国家重点研发计划(No.2021YFC1200204)联合资助。
文摘
目的利用DNA规律聚集簇间隔短回文重复序列(Clustered regularlyinter-spaced short palindromic repeats CRISPR)分型方法,全面探索海西地区分离鼠疫菌株是否存在新的基因型,为鼠疫菌溯源鉴定及流行病学分析提供理论依据。方法分离培养海西地区1961-2009年间取自鼠疫患者、媒介昆虫及中间宿主的50株鼠疫菌后提取其DNA,利用PCR技术,对鼠疫菌CRISPR分型中的YPa、YPb、YPc 3个位点进行扩增,测定其扩增产物核酸序列并进行分析,将测得CRISPR序列与文献最新报道的CRISPR Dictionary和NCBI数据库进行比对,找出新的CRISPR spacer阵列,基因型别,分析其进化关系,最终确定青海省海西州喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫菌株的CRISPR基因库。结果50株鼠疫菌在3个CRISPR位点上共有24种spacer,其中YPa位点上有13种、YPb位点8种、YPc位点3种,b51是新发现的spacer。50株鼠疫菌可被分为16个基因型,共归为6大CRISPR类群。Ca35′是该地区主要流行类群;Ca7是流行最为广泛的类群;Cb4和Cb4′仅存在于格尔木唐古拉地区。结论青海省海西州地区鼠疫菌种群结构复杂,Ca35′、Ca7、Cb4′是流行最普遍的种群,G26-a1′型、G22型、G9型、G26-a1′a4-为主要基因型,呈现显著的地区分布特征,今后可以利用CRISPR基因分型技术加强该地区鼠疫溯源检测和防控工作。
关键词
规律聚集簇间隔短回文重复序列
鼠疫菌
基因分型
青海省海西州
Keywords
clustered
regularly
interspaced
short
palindromic
repeat
Yersinia
pestis
genetic
typing
haixi
qinghai
province
分类号
R378.6 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
地震地理信息系统的设计与实现——以青海省海西州为例
2
作者
黄彦丽
蔡佳作
郅惠
机构
青海省基础地理信息中心青海省地理空间信息技术与应用重点实验室
出处
《青海大学学报（自然科学版）》
2017年第5期95-100,共6页
文摘
文中基于青海省海西州的地震特征,采用甘青地区地震烈度影响衰减模型算法,结合地震直接经济损失计算方法以及地震人员伤亡模型,引入地震灾害中各类重大专题地理数据,运用地理信息系统及计算机技术,探讨了GIS在地震灾害中的设计与实现,并据此构建了一套较完整的地震地理信息系统,能在地震发生时快速盲估出所造成的直接经济损失、人员伤亡及水库、管线、危险源等各类重点部位受影响情况,可为应急救援提供重要的辅助决策信息。
关键词
地理信息系统
地震分析
地震地理信息系统
青海省海西州
Keywords
GIS
seismic
analysis
Earthquake
Geographic
Information
System
haixi
prefecture
of
qinghai
province
分类号
P315.31 [天文地球—地震学]
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职称材料
题名
青海海西州茫崖镇地区早石炭纪地层特征与沉积环境分析
被引量：
1
3
作者
冯丹
杨德方
苏桂芬
机构
中国矿业大学(北京)地球科学与测绘工程学院
华北科技学院安全工程学院
自然资源实物地质资料中心
出处
《华北科技学院学报》
2019年第3期88-94,共7页
文摘
青藏高原北部的沉积岩是在特定的地质条件下演化的阶段产物,其中青海海西州茫崖镇地区晚古生代早石炭纪地层发育良好,化石丰富,独具特色。本文讨论了该地区下向上石拐子组和大干沟组地层组剖面岩石组合特征,以薄片显微图像说明典型岩石组构、矿物组合等为特色,探讨了各岩性组地层的沉积环境,得出石拐子组上下两段沉积环境分别为浅海砂岩相和浅海-陆棚碳酸盐相,大干沟组沉积环境属于浅海碳酸岩相和浅海-陆棚碳酸岩相。为该地区开展基础地质研究、层序地层分析等工作提供基础资料。
关键词
青海海西州茫崖镇
早石炭纪地层
岩石特征
沉积环境
Keywords
Mangya
Town
haixi
Prefecture
qinghai
province
Early
Carboniferous
strata
rock
characteristics
sedimentary
environment
分类号
P534.45 [天文地球—古生物学与地层学]
P531 [天文地球—地质学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
青海省海西州鼠疫自然疫源地分离鼠疫菌株CRISPR基因分型研究
张琪
代瑞霞
何建
靳娟
李胜
王兴斌
施昊旻
艾丽孜热·艾尼瓦尔
廖星豪
张雪飞
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
地震地理信息系统的设计与实现——以青海省海西州为例
黄彦丽
蔡佳作
郅惠
《青海大学学报（自然科学版）》
2017
0
下载PDF
职称材料
3
青海海西州茫崖镇地区早石炭纪地层特征与沉积环境分析
冯丹
杨德方
苏桂芬
《华北科技学院学报》
2019
1
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职称材料
已选择
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