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基于UHPLC-Q-Orbitrap HRMS的PD-1抑制剂治疗的晚期肺腺癌患者血清代谢组学研究 被引量:5
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作者 李林 杨双宁 +3 位作者 秦国慧 亓妍文 赵坤宇 王丽萍 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2022年第5期631-634,共4页
目的:探索晚期肺腺癌患者化疗联合免疫治疗前后的差异代谢物及代谢通路,为评估预后寻找生物指标。方法:利用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱(UHPLC-Q-Orbitrap HRMS)技术,对14例晚期肺腺癌患者在第1次使用化疗联合PD-1抑制剂治... 目的:探索晚期肺腺癌患者化疗联合免疫治疗前后的差异代谢物及代谢通路,为评估预后寻找生物指标。方法:利用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱(UHPLC-Q-Orbitrap HRMS)技术,对14例晚期肺腺癌患者在第1次使用化疗联合PD-1抑制剂治疗前3 d的血清以及治疗2周期后的血清进行代谢组学分析。通过对采集得到的图谱进行峰识别和匹配等相关处理,应用主成分和正交偏最小二乘法-判别分析对代谢组学的数据进行分析,筛选出重要变量性投影>1和P<0.05的差异代谢物,并筛选代谢通路。结果:治疗前后血清代谢物质有明显差异,治疗后患者血清代谢物中谷氨酰丝氨酸、脯氨酸、犬尿氨酸、脱氢抗坏血酸、N-硬脂酰鞘磷脂、5-羟基吲哚乙酸水平升高;色氨酸、亮氨酰脯氨酸、柠檬酸、硬脂酸、吲哚丙烯酸、丙酰肉碱、吲哚、3-甲基吲哚水平降低。色氨酸代谢通路是治疗前后的差异代谢通路。结论:犬尿氨酸/色氨酸比值可能作为评估PD-1抑制剂治疗的晚期肺腺癌患者预后的生物指标。 展开更多
关键词 晚期肺腺癌 免疫治疗 血清代谢组学 UHPLC-Q-Orbitrap hrms技术
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基于超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱对西藏不同产地甘青青兰的差异性成分分析 被引量:3
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作者 段婷引 达娃卓玛 +4 位作者 兰钧 李雪敏 张梦姣 周燕 邓放 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1265-1271,共7页
采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q/Orbitrap HRMS)技术对西藏3个地区的41批甘青青兰样本进行分析,通过Compound Discoverer 3.2软件对化学成分进行鉴定,并利用多元统计学分析筛选出不同地区样本之间的差异性... 采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q/Orbitrap HRMS)技术对西藏3个地区的41批甘青青兰样本进行分析,通过Compound Discoverer 3.2软件对化学成分进行鉴定,并利用多元统计学分析筛选出不同地区样本之间的差异性成分。在甘青青兰样本中共鉴定73种化合物,包括41种黄酮类、15种有机酸类、8种氨基酸类以及9种其他类化合物。经多元统计学分析,山南市样本(SN)与拉萨市样本(LS)之间有11种差异化合物,山南市样本(SN)与昌都市样本(CD)之间有18种差异化合物,拉萨市样本(LS)与昌都市样本(CD)之间有21种差异化合物(VIP>1,P<0.05)。大多数差异化合物为黄酮类及有机酸类化合物。绿原酸在3组样本间的含量差异最大,在CD组含量最高(约为11.85 mg/g),LS组次之(约为7.85 mg/g),SN组最低(约为5.30 mg/g),这与甘青青兰样本的叶子数量和粉末颜色有一定的相关性。结合各地区地势及气候推测光照日长及日温差对甘青青兰化学成分有影响。综上所述,推测地理环境的差异对甘青青兰的性状和化学成分具有影响。研究结果为甘青青兰质量控制及后续开发利用提供了理论基础。 展开更多
关键词 UHPLC-Q/Orbitrap hrms技术 甘青青兰 多元统计学 差异性成分
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基于UHPLC-Q-Orbitrap HRMS整合网络药理学探讨三仁汤治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制
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作者 邓丹萍 谢天喜 +9 位作者 刘向儒 孙志 薛连平 周胜楠 何平 曾祥嵩 唐晓涛 方艳琳 陈路军 彭小飞 《陕西中医药大学学报》 2023年第5期39-47,共9页
目的通过UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术明确经典名方三仁汤中的主要化学成分,并通过网络药理学进一步探讨其治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制。方法根据UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术得到的二级质谱裂解碎片信息,对三仁汤进行分析鉴定。在PubC... 目的通过UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术明确经典名方三仁汤中的主要化学成分,并通过网络药理学进一步探讨其治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制。方法根据UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术得到的二级质谱裂解碎片信息,对三仁汤进行分析鉴定。在PubChem数据库中下载质谱定性分析出的化合物的2D结构,导入Swiss ADME平台进行初步筛选,并借助Swiss Target Prediction数据库寻找三仁汤潜在作用靶点。通过Gene Cards数据库检索与新型冠状病毒肺炎(Corona virus disease 2019,COVID-19)相关的疾病靶点。使用Draw Venn Diagram网站,获取三仁汤和COVID-19共同作用的靶点。使用STRING数据库构建共同靶点互作网络(PPI),Cytoscape 3.7.2软件构建三仁汤“中药-活性成分-靶点-疾病”网络图。最后通过Metascape平台对三仁汤治疗COVID-19相关靶点进行KEGG和GO富集分析。结果通过质谱法从三仁汤8味中药中鉴定了37种化学成分。进一步筛选出22个活性成分,将三仁汤的533个潜在作用靶点与COVID-19的482个COVID-19靶点基因的靶点进行交集,得到了58个共同靶点,其中出现频次较高的有AVEGFA、EGFR、IL-6、AKT1、JUN、ICAM1等。通过GO富集分析得到了551条(P<0.05)信号通路,KEGG富集分析得到了118条(P<0.05)信号通路,其基因数目在与炎症反应及肺损伤保护相关的多条通路上富集较多,与冠状病毒、SARS-CoV-2、人巨细胞病毒、甲型流感、乙型肝炎病毒感染相关。结论本研究基于UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术对三仁汤的成分进行系统分析,能够充分表征三仁汤的药效物质;三仁汤可通过多靶点、多通路达到对新型冠状病毒肺炎的治疗作用。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎(COVID-19) 三仁汤 UHPLC-Q-Orbitrap hrms技术 网络药理学
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