贵州白山羊的体尺与体重及其相关性 被引量：18

1

作者 康建兵 蔡惠芬 +7 位作者 罗卫星 王锋 曾浩 苏娜芬 黄兰 钱成 刘彬 孙岩岩 《贵州农业科学》 CAS 2015年第8期171-173,共3页

为贵州白山羊的品种选择和育种提供理论依据,对选自贵州省沿河县新景乡贵州白山羊保种区(贵州白山羊中心产区)的415只贵州白山羊,其中,育成羊194只(公羊59只、母羊100只和羯羊35只),成年羊221只(公羊13只、母羊122只和羯羊86只),测定其... 为贵州白山羊的品种选择和育种提供理论依据,对选自贵州省沿河县新景乡贵州白山羊保种区(贵州白山羊中心产区)的415只贵州白山羊,其中,育成羊194只(公羊59只、母羊100只和羯羊35只),成年羊221只(公羊13只、母羊122只和羯羊86只),测定其体重(y)、体高(x1)、体斜长(x2)、胸围(x3)和管围(x4),进行相关性分析和通径分析,并建立最优回归方程。结果表明:胸围是影响贵州白山羊体重最主要的体尺指标,胸围对体重的直接作用较大,通径系数为0.593;体高、体斜长和管围对贵州白山羊体重的直接作用较小;体高对体重的间接作用最大,通径系数为0.656。贵州白山羊体尺-体重的最优回归方程为y=-55.358+0.127x1+0.429x2+0.651x3+0.644x4,R2=0.831。 展开更多

关键词 贵州白山羊 体尺 体重 相关性

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贵州白山羊GOLA-DQA1基因多态性及其与血液免疫指标的关联性 被引量：10

2

作者 刘彬 蔡惠芬 +5 位作者 康建兵 钱成 黄兰 孙岩岩 陈祥 罗卫星 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期962-966,共5页

为了解贵州白山羊GOLA-DQA1基因SNPs与血液免疫指标的相关性,本研究采用PCR直接测序技术对122只贵州白山羊周岁羊群体GOLA-DQA1基因Exon1及部分内含子进行多态性的检测,进一步将各突变位点与血液免疫指标进行关联性分析。结果:在试验群... 为了解贵州白山羊GOLA-DQA1基因SNPs与血液免疫指标的相关性,本研究采用PCR直接测序技术对122只贵州白山羊周岁羊群体GOLA-DQA1基因Exon1及部分内含子进行多态性的检测,进一步将各突变位点与血液免疫指标进行关联性分析。结果:在试验群体中共发现7个SNPs位点,其中C+36G、C+48T、A+49G、T+65G位于外显子上;A+122G、T+125C、A+129G位点位于内含子上,属于中度多态性(0.5<PIC<0.25)。存在连锁不平衡现象且各位点均偏离了Hardy-Weinberg平衡,分析发现C+48T、A+49G位点与中间细胞比率具有显著的相关性,其中CT基因型个体的中间细胞比率显著高于CC基因型(p<0.05);AG基因型个体中间细胞比率值显著高于AA基因型。由此推断GOLA-DQA1基因C+48T、A+49G位点与贵州白山羊血液免疫指标具有一定的相关性,为山羊抗病育种的辅助选择标记的选择提供一定的参考。 展开更多

关键词 贵州白山羊 GOLA-DQA1基因 单核苷酸多态性 血液免疫指标

原文传递

贵州白山羊GFI1B基因多态性与生长性状的相关性 被引量：9

3

作者 陈志 罗卫星 +3 位作者 刘若余 蔡惠芬 张依裕 宋桃伟 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期159-164,共6页

本试验旨在研究贵州白山羊GFI1B基因第八外显子的多态性,及其与生长性状的相关性。通过PCR-RFLP技术对贵州白山羊外显子SNPs位点进行检测,利用一般线形模型分析其与生长性状的关联性。结果显示,供试群体中在外显子上检测到2个SNPs位点,... 本试验旨在研究贵州白山羊GFI1B基因第八外显子的多态性,及其与生长性状的相关性。通过PCR-RFLP技术对贵州白山羊外显子SNPs位点进行检测,利用一般线形模型分析其与生长性状的关联性。结果显示,供试群体中在外显子上检测到2个SNPs位点,即第八外显子263(G/T)和340(G/A)。最小二乘法分析表明,G340A位点,CC型和DD型的体重、体长、胸深和胸宽对CD型达到差异及显著水平(p<0.01)。本研究检测到的GFI1B基因第八外显子340(G/A)多态性位点可作为贵州白山羊生长性状的候选分子标记。 展开更多

关键词 GFI1B基因 贵州白山羊 PCR-RFLP 生长性状

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山羊GHRL基因多态性及其与体重、体尺性状的关系研究 被引量：6

4

作者 罗开鹏 宋桃伟 +4 位作者 孙岩岩 刘彬 罗卫星 黄安志 张许 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期162-165,共4页

采用PCR-SSCP技术对贵州黑山羊和贵州白山羊GHRL基因进行单核苷酸多态性检测,并分析其多态与体重、体尺性状间的关联性。结果发现,在GHRL基因外显子4处存在1个同义突变位点(C345T),表现为2种基因型,分别命名为CC和CT。基因型与体重、体... 采用PCR-SSCP技术对贵州黑山羊和贵州白山羊GHRL基因进行单核苷酸多态性检测,并分析其多态与体重、体尺性状间的关联性。结果发现,在GHRL基因外显子4处存在1个同义突变位点(C345T),表现为2种基因型,分别命名为CC和CT。基因型与体重、体尺性状关联分析结果显示,在贵州黑山羊(麦坪)群体中,CT基因型个体的体重、体高和胸围均显著高于CC基因型个体,而在贵州黑山羊(纳雍)和贵州白山羊群体中差异不显著。研究结果揭示,GHRL基因突变位点(C345T)影响贵州黑山羊生长性状可能性较大,该位点有望作为山羊生长性状的一个标记辅助选择位点。 展开更多

关键词 贵州黑山羊 贵州白山羊 GHRL基因 体重、体尺性状

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贵州白山羊遗传结构的RAPD分析 被引量：4

5

作者 陈祥 廖正录 +3 位作者 李国红 张芸 简承松 魏泓 《四川畜牧兽医》 2004年第8期20-21,共2页

用27条多态性引物对15份贵州白山羊个体基因组进行RAPD分析。结果共扩增出268条带,其中多态带为112条,多态频率在0～72.73%之间,平均多态频率为41.79%。单个引物获得的扩增带数在4～16条之间,平均每条引物扩增出9.92条带,扩增带分子量... 用27条多态性引物对15份贵州白山羊个体基因组进行RAPD分析。结果共扩增出268条带,其中多态带为112条,多态频率在0～72.73%之间,平均多态频率为41.79%。单个引物获得的扩增带数在4～16条之间,平均每条引物扩增出9.92条带,扩增带分子量范围在230～2800bp。Nei氏公式计算品种内个体间遗传相似指数平均为0.9156。结果表明:贵州白山羊个体间遗传变异较小,具有较高的遗传稳定性。 展开更多

关键词 贵州白山羊 遗传结构 RAPD 遗传相似指数 遗传稳定性

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波尔山羊、南江黄羊与土种山羊杂交效果比较 被引量：2

6

作者 徐恢仲 赵永聚 +2 位作者 李天云 田原 张桥 《畜牧兽医杂志》 2003年第1期1-3,共3页

在贵州石阡县将波本 F1、南本 F1和本地羊分为三组 ,测定初生、2月龄、4月龄、6月龄、8月龄五阶段的体高、体长、胸围、管围和体质量。试验结果为 :波尔山羊、南江黄羊杂交能显著提高贵州石阡当地山羊的产肉性能。其中波本 F1初生重公... 在贵州石阡县将波本 F1、南本 F1和本地羊分为三组 ,测定初生、2月龄、4月龄、6月龄、8月龄五阶段的体高、体长、胸围、管围和体质量。试验结果为 :波尔山羊、南江黄羊杂交能显著提高贵州石阡当地山羊的产肉性能。其中波本 F1初生重公羊提高 67.5 7% ,母羊提高 67.65 %。南本 F1初生重公羊提高 8.1 1 % ,母羊提高 1 1 .76%。6月龄波本 F1公羊体质量提高 2 5 .1 9% ,母羊提高 2 6.1 9%。南本F1公羊和母羊体质量分别提高 1 2 .5 9%和 1 6.67%。比较波本 F1和南本 F1各阶段体质量发现 ,除了 2月龄和 8月龄母羊的体质量波本 F1比南本 F1小外 ,其余波本 F1都大于南本 F1。尤其是初生重波本 F1公羊比南本 F1大 1 .1 kg,增加了 5 5 .0 0 % ,母羊大 0 .95 kg,增加了 5 0 .0 0 %。并建议加强杂种羊的饲养管理。 展开更多

关键词 波尔山羊 南江黄羊 贵州白山羊 杂交改良 产肉性能

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基于转录组挖掘不同性别贵州白山羊肌肉生长发育的关键基因及PI3K/ATK信号通路分析 被引量：5

7

作者 安清明 王星 +3 位作者 吴震洋 孟金柱 赵园园 宋兴超 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期213-222,共10页

胴体生长发育是影响山羊养殖效益的重要评价指标,旨在通过RNA-Seq技术挖掘不同性别贵州白山羊生长发育的关键候选基因,为贵州白山羊生长发育研究提供理论依据,以同等饲养水平条件下贵州白山羊为研究对象,测定2周龄不同性别贵州白山羊的... 胴体生长发育是影响山羊养殖效益的重要评价指标,旨在通过RNA-Seq技术挖掘不同性别贵州白山羊生长发育的关键候选基因,为贵州白山羊生长发育研究提供理论依据,以同等饲养水平条件下贵州白山羊为研究对象,测定2周龄不同性别贵州白山羊的屠宰性能指标,通过背最长肌转录组分析,筛选差异表达基因,分析相关基因的信号通路,最后通过RT-qPCR对筛选的基因进行验证。结果表明,测序得到的Raw reads进行过滤后,6个样本共得到78.99 Gb Clean Data,单个样本获得Clean reads在83030104~95739024条,各样本与参考基因组的比对效率在93.75%~94.79%,共获得25089个表达基因,筛选差异表达基因共获得1077个差异基因,其中194个为新发现转录本基因,发现的差异基因中563个在公羊背最长肌中表达显著上调,514个表达显著下调。对获得的1077个差异基因进行GO功能富集分析,其中587个为显著富集(Q-value≥0.05),主要分为三大类35个亚类。KEGG信号通路分析发现,这些差异基因共参与243条信号通路,其中参与PI3K/AKT信号通路相关的基因最为富集,共注释到32个基因,其中17个注释基因显著上调,1个显著下调,且在该通路中COL4A1和COL4A2基因编码蛋白共表达估值最高,ITGAV基因编码蛋白互作最为丰富。筛选出6个与贵州白山羊背最长肌生长发育相关的差异表达基因进行验证,其中FHL3、WFIKKN2、SOX6基因在公羊背最长肌中为上调基因,QSOX2、MYH2、LAP基因为下调基因,RT-qPCR结果显示,这6个候选基因的mRNA表达趋势与转录组测序结果一致,且差异均较为显著(P<0.05),表明测序结果可靠。基于RNA-Seq技术筛选出不同性别贵州白山羊背最长肌的差异表达基因1077个,其中194个为新发掘转录本基因,筛选的差异表达基因及PI3K/AKT信号通路与贵州白山羊背最长肌生长发育相关。 展开更多

关键词 贵州白山羊 RNA-Seq技术 不同性别 生长发育 差异表达基因

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贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析

8

作者 宋兴超 孟金柱 +2 位作者 赵园园 吴震洋 安清明 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期926-935,共10页

【目的】克隆贵州白山羊肌细胞生成素(myogenin)基因并对其结构特性进行生物信息学分析,为进一步探索该基因调控山羊肌肉发育的分子机制提供重要参考依据。【方法】以贵州白山羊血液基因组DNA为模板,设计4对特异性引物,运用PCR扩增、San... 【目的】克隆贵州白山羊肌细胞生成素(myogenin)基因并对其结构特性进行生物信息学分析,为进一步探索该基因调控山羊肌肉发育的分子机制提供重要参考依据。【方法】以贵州白山羊血液基因组DNA为模板,设计4对特异性引物,运用PCR扩增、Sanger直接测序及序列拼接方法获得贵州白山羊myogenin基因完整编码区核苷酸序列,应用BioEdit 7.0、NetPhos 3.1、Conserved Domains Search、SMART、Motif Scan等生物信息学软件分别分析该基因核苷酸与氨基酸序列的组成、编码蛋白磷酸化位点、关键结构域和功能模体等结构特性,通过DNAStar Lasergene、DNAMAN 8.0和Mega 5.0软件分别进行15个偶蹄目物种myogenin基因编码氨基酸序列相似性比对及系统进化树构建。【结果】贵州白山羊myogenin基因序列全长2424 bp(获得GenBank登录号:HZ53289),由3个外显子、2个内含子、部分5′-UTR和3′-UTR构成,长度分别为471、82、122、765、589、135和260 bp,编码区长度为675 bp,共编码224个氨基酸。贵州白山羊myogenin蛋白第1—86位氨基酸为生肌决定因子(myogenic determining factors,MyoD)家族特有碱性结构域(Basic domain),第81—139位氨基酸为螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix,H-L-H)结构域,第160—170位氨基酸为低复杂度结构域,存在21个磷酸化位点和核定位信号蛋白等功能模体结构。氨基酸序列比对表明,6个半胱氨酸残基、1个核定位信号和1个低复杂度结构域在15个偶蹄目物种完全保守。myogenin基因编码氨基酸序列相似性与系统进化分析均显示,贵州白山羊与波尔山羊、湖羊和马可波罗盘羊的亲缘关系最近。【结论】本研究成功克隆得到贵州白山羊myogenin基因全长序列,大小为2424 bp,编码224个氨基酸,myogenin蛋白包含Basic domain和H-L-H结构域。该结果可为myogenin基因调控山羊肌肉发育的分子机制研究提供理论参考。 展开更多

关键词 贵州白山羊 myogenin基因 克隆 分子系统进化 生物信息学

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贵州白山羊L-FABP基因遗传变异对生长性状的影响 被引量：6

9

作者 田应志 崔真华 +4 位作者 牟慧蓉 钱成 黄兰 封竣淇 罗卫星 《山地农业生物学报》 2017年第2期6-12,共7页

本研究旨在探讨肝脏型脂肪酸结合蛋白(L-FABP)基因遗传变异与贵州白山羊生长性状的关联性,以期得到能够影响贵州白山羊各群体生长性状显著效应的分子遗传标记。试验采用DNA池、PCR-SSCP法结合PCR产物直接测序对贵州白山羊L-FABP基因4个... 本研究旨在探讨肝脏型脂肪酸结合蛋白(L-FABP)基因遗传变异与贵州白山羊生长性状的关联性,以期得到能够影响贵州白山羊各群体生长性状显著效应的分子遗传标记。试验采用DNA池、PCR-SSCP法结合PCR产物直接测序对贵州白山羊L-FABP基因4个外显子进行SNPs筛选,并利用SPSS 18.0统计软件分析H-FABP基因遗传变异与生长性状间的相关性。多态位点检测表明,贵州白山羊L-FABP基因内含子两处存在C4557T和A4575G两个多态基因座;遗传效应分析表明,L-FABP基因C4557T和A4575G位点多态座位有利于提高贵州白山羊体重、体高、体斜长和管围,其中基因型CCGG有利于提高贵州白山羊成年母羊的体高和体斜长;TTGG有利于提高贵州白山羊周岁母羊的体重和管围。研究结果初步推测L-FABP基因可能影响贵州白山羊部分生长性状的主效基因或与主效基因连锁,其多态座位可能作为山羊生长性状选择的有效遗传标记。 展开更多

关键词 贵州白山羊 L-FABP基因 遗传变异 生长性状

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贵州白山羊的屠宰与肉质性状及脏器系数测定 被引量：6

10

作者 钱成 罗卫星 +3 位作者 苏娜芬 王锋 曾浩 蔡惠芬 《贵州农业科学》 CAS 2015年第7期121-123,128,共4页

为探明贵州白山羊的种质特性及其生长发育规律,对42只贵州白山羊进行屠宰性状、肉质性状及脏器发育程度测定,并对屠宰性状、肉质性状进行相关性分析。结果表明:成年羯羊的屠宰性状指标多数高于成年母羊,成年羊屠宰性状多数指标间呈显著... 为探明贵州白山羊的种质特性及其生长发育规律,对42只贵州白山羊进行屠宰性状、肉质性状及脏器发育程度测定,并对屠宰性状、肉质性状进行相关性分析。结果表明:成年羯羊的屠宰性状指标多数高于成年母羊,成年羊屠宰性状多数指标间呈显著或极显著相关;周岁羊的屠宰性状指标普遍低于成年羊,周岁羊屠宰性状部分指标间呈显著或极显著相关。成年贵州白山母羊与羯羊的肉质性状指标间无显著差异;周岁贵州白山羊公羊的肌肉失水率(36.07%)显著高于周岁母羊,其余指标间无显著差异。成年羊的脏器重比周岁羊高约1倍,周岁羊的脏器系数与成羊间无显著差异。 展开更多

关键词 贵州白山羊 屠宰性状 肉质性状 脏器系数

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贵州白山羊MyoG基因启动子区序列克隆及生物信息学分析 被引量：1

11

作者 宋兴超 孟金柱 +2 位作者 赵园园 吴震洋 安清明 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期893-903,共11页

【目的】本研究旨在解析肌细胞生成素(MyoG)基因启动子区序列的结构特性及其转录调控机制。【方法】以贵州白山羊血液基因组DNA为模板,设计2对引物,采用PCR扩增、Sanger测序技术获得MyoG基因启动子区序列,通过DNAStar和Mega 5.0软件分... 【目的】本研究旨在解析肌细胞生成素(MyoG)基因启动子区序列的结构特性及其转录调控机制。【方法】以贵州白山羊血液基因组DNA为模板,设计2对引物,采用PCR扩增、Sanger测序技术获得MyoG基因启动子区序列,通过DNAStar和Mega 5.0软件分别进行不同物种MyoG基因启动子区序列相似性比对及系统进化树构建,利用生物信息学软件预测分析该序列核心启动子区、转录因子结合位点、顺式作用元件、CpG岛等结构特征。【结果】贵州白山羊MyoG基因启动子区序列长2334 bp,包括2092 bp的5′-侧翼序列和242 bp的外显子1,GC含量略低于AT含量。通过不同物种比对分析,贵州白山羊MyoG基因启动子区序列与绵羊、牛、猪、人、小鼠和鸡同源序列相似性分别为98.34%、96.15%、77.76%、74.15%、57.63%和43.04%。系统进化树结果表明,贵州白山羊与绵羊和牛的亲缘关系较近,与鸡的亲缘关系最远。生物信息学结构预测发现,贵州白山羊MyoG基因转录起始位点位于翻译起始密码子ATG上游50 bp,5′-侧翼区存在1个潜在的启动子区域和1个CpG岛,含有1个TATA-box(TTTAAATG)、1个GC-box(CCGCCC)、2个CAAT-box(CCAAT)、17个E-box(CANNTG)和1个富含A/T碱基的元件结构(TATATTTAT)。AliBaba 2.1、PROMO、Patch 1.0、JASPAR 2022和AnimalTFDB 3.0在线软件综合预测发现,贵州白山羊MyoG基因启动子区存在Sp1、NF-1、MEF2、MyoD、USF、GATA-1、GATA-3、SRF、C/EBP和c-Myb等多种转录因子潜在结合位点。【结论】本研究成功克隆获得贵州白山羊MyoG基因启动子区序列,为深入解析该基因调控山羊肌肉发育的分子机制提供理论依据。 展开更多

关键词 贵州白山羊 MYOG基因 启动子区 转录因子 生物信息学

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贵州白山羊ADIPOQ基因生物信息及组织表达特异性分析 被引量：5

12

作者 安清明 王星 +4 位作者 黄永震 孟金柱 赵园园 田秀珍 吴震洋 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第8期84-90,共7页

为明确贵州白山羊ADIPOQ基因及其编码蛋白的结构及功能,本实验通过PCR技术拼接白山羊外显子序列,分析其生物信息学特征及在公母羊不同组织中的表达特点。结果表明:白山羊ADIPOQ基因CDS区长720 bp、编码239个氨基酸,编码蛋白为水溶性蛋白... 为明确贵州白山羊ADIPOQ基因及其编码蛋白的结构及功能,本实验通过PCR技术拼接白山羊外显子序列,分析其生物信息学特征及在公母羊不同组织中的表达特点。结果表明:白山羊ADIPOQ基因CDS区长720 bp、编码239个氨基酸,编码蛋白为水溶性蛋白,相对分子量为25 955.14 ku,理论等电点为5.96,且存在17个氨基酸的信号肽区,不属于跨膜蛋白,但属于分泌蛋白,含有16个磷酸化位点,具有1个C1Q保守结构域,主要与ADIPOR1、ADIPOR2、CDH13及LEP蛋白进行信息互作,系统进化分析结果与亲缘关系远近一致。实时荧光定量检测表明,ADIPOQ基因在白山羊各组织中均有表达,其中ADIPOQ基因在肺的表达量最高,其次是脾、心和肝,在肾中表达量较低,且这种表达存在性别差异,ADIPOQ基因在母羊脾脏、肺脏和心脏组织中的表达量较高,而在公羊的肝脏和肾脏中表达量较高。本研究通过对贵州白山羊ADIPOQ基因、编码蛋白的生物信息学及不同组织表达分析,预测了ADIPOQ蛋白分子作用及功能,为进一步分析ADIPOQ基因在白山羊脂肪累积过程中的功能奠定了理论基础。 展开更多

关键词 贵州白山羊 ADIPOQ基因 生物信息 性别差异 组织表达

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贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因生物信息学预测与系统进化分析

13

作者 宋兴超 孟金柱 +2 位作者 赵园园 吴震洋 安清明 《特产研究》 2023年第5期16-21,共6页

本研究旨在解析贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因的结构特性,为该基因功能探究提供理论依据。基于生物信息学及比较基因组学方法,对NCBI数据库中已登录的贵州白山羊MSTN基因完整编码区序列(CDS)核苷酸组成特性及编码蛋白的相关结构... 本研究旨在解析贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因的结构特性,为该基因功能探究提供理论依据。基于生物信息学及比较基因组学方法,对NCBI数据库中已登录的贵州白山羊MSTN基因完整编码区序列(CDS)核苷酸组成特性及编码蛋白的相关结构开展预测及分析,构建了15个物种MSTN基因系统进化树。结果表明,贵州白山羊MSTN基因CDS长度为1128bp,共编码375个氨基酸,由3个外显子和2个内含子构成,其AT含量均高于GC。贵州白山羊MSTN蛋白属混合型二级结构,存在无规则卷曲、延伸链和α-螺旋,为弱碱不稳定亲水蛋白质;包括1个18个氨基酸的潜在信号肽,无跨膜区,形成5对二硫键,含有16个磷酸化位点;278~375位氨基酸为转化生长因子-β样结构域。贵州白山羊MSTN基因与绵羊、牛等牛科动物的亲缘关系较近,与鸡形目原鸡和绿头野鸭的亲缘关系较远。本研究可为贵州白山羊MSTN基因分子遗传学及其表达调控研究奠定理论基础。 展开更多

关键词 贵州白山羊 肌肉生长抑制素基因 编码蛋白 比较基因组学 肌肉发育

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贵州白山羊LEPR基因多态性 被引量：3

14

作者 康建兵 罗卫星 +4 位作者 王锋 曾浩 苏娜芬 黄兰 钱成 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1870-1874,共5页

为探究LEPR基因多态性的遗传特性,本研究以贵州白山羊为试验材料,运用DNA池结合直接测序方法进行LEPR基因的SNPs位点的筛选,继而对LEPR基因RNA的二级结构以及其所编码蛋白质的二级结构和三级结构进行生物信息分析。结果表明,在试验群体L... 为探究LEPR基因多态性的遗传特性,本研究以贵州白山羊为试验材料,运用DNA池结合直接测序方法进行LEPR基因的SNPs位点的筛选,继而对LEPR基因RNA的二级结构以及其所编码蛋白质的二级结构和三级结构进行生物信息分析。结果表明,在试验群体LEPR基因中共发现4个SNPs,分别为exon4-G246A(Asp-Asn)、exon8-C39T(同义突变)、intron8-G59A(内含子突变)和exon18-C94T(Ser-Leu)。经生物信息学软件分析表明,exon4-G246A(Asp-Asn)和exon18-C94T(Ser-Leu)位点突变前后的等位基因频率、LEPR m RNA的二级结构、LEPR蛋白质二级结构和三级结构均有改变。 展开更多

关键词 LEPR SNPS 贵州白山羊 生物信息学

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贵州白山羊GDF9基因编码区1007位点的多态性 被引量：3

15

作者 周泽晓 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第12期74-77,共4页

生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)基因是卵母细胞分泌的生长因子,调节卵泡的早期生长和分化。对贵州白山羊GDF9基因的研究结果显示,编码区1007位碱基与已知山羊不同。为了研究1007位点对贵州白山羊繁殖力的影响,采... 生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)基因是卵母细胞分泌的生长因子,调节卵泡的早期生长和分化。对贵州白山羊GDF9基因的研究结果显示,编码区1007位碱基与已知山羊不同。为了研究1007位点对贵州白山羊繁殖力的影响,采用锚定PCR对GDF9基因外显子2第18位氨基酸密码子所在区域进行了扩增、克隆测序和基因型分析,结果表明,GDF9基因编码区1007位点表现出C/T多态性,使成熟肽第18位氨基酸为丙氨酸/缬氨酸替换;低产母羊均为杂合基因型,高产母羊中90%为杂合基因型,高产羊群与低产羊群之间基因型频率差异不显著(P>0.05),表明GDF9基因1007位点的多态性与贵州白山羊产羔数之间没有直接的相关性。 展开更多

关键词 贵州白山羊 GDF9基因 PCR 高繁殖率 SNP位点

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贵州本地山羊JAK2基因5'调控区SNP生物信息学分析 被引量：1

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作者 谢海强 孙岩岩 +3 位作者 杨永强 龚俞 焦仁刚 刘若余 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2014年第15期1-5,共5页

本实验旨在从贵州本地山羊JAK2基因启动子区查找SNP,并分析其在启动子区中的作用。以贵州当地优良品种贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊3种山羊构建不同DNA池,双向测序筛选SNP位点,降低测序误差。结果表明:JAK2基因5'调控区存在5个... 本实验旨在从贵州本地山羊JAK2基因启动子区查找SNP,并分析其在启动子区中的作用。以贵州当地优良品种贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊3种山羊构建不同DNA池,双向测序筛选SNP位点,降低测序误差。结果表明:JAK2基因5'调控区存在5个SNPs位点,分别为G-278C、G-275C、C-265G、A-193G和G-43T;各生物信息学在线软件预测获得JAK2基因核心启动子范围及CpG岛位置,单核苷酸多态性位点导致附近大量转录因子新位点产生和原来结合位点消失,但并不改变CpG岛大小。结果提示,JAK2基因5'调控区存在5个对启动子功能元件有较大影响的SNP位点,该结果为进一步了解JAK2基因启动子区功能元件奠定基础。 展开更多

关键词 JAK2 SNP 启动子 贵州白山羊 贵州黑山羊 黔北麻羊

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贵州黑山羊、贵州白山羊TFB1M基因第7外显子SNP研究 被引量：1

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作者 孙岩岩 蔡惠芬 +4 位作者 罗卫星 刘若余 谢海强 宋桃伟 刘彬 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期31-36,共6页

目的:研究TFB1M基因编码区多态性,筛选出对山羊肉质有显著影响的SNPs位点,以期为山羊品种选种选育提供科学依据。方法:采用DNA池结合PCR直接测序技术分析TFB1M基因在贵州本地山羊的多态性,估算等位基因频率,利用在线软件分析TFB1M基因RN... 目的:研究TFB1M基因编码区多态性,筛选出对山羊肉质有显著影响的SNPs位点,以期为山羊品种选种选育提供科学依据。方法:采用DNA池结合PCR直接测序技术分析TFB1M基因在贵州本地山羊的多态性,估算等位基因频率,利用在线软件分析TFB1M基因RNA二级结构及其蛋白二级、三级结构。结果:在TFB1M基因中筛选到2个SNPs:A76G和T221G,其中A76G为同义突变;T221G错义突变,导致编码的半胱氨酸(Cys)变为甘氨酸(Gly)。RNA二级结构最小自由能改变,贵州黑山羊RNA二级结构稳定性增强。贵州黑山羊β折叠链增加1%,α螺旋增加4%,混乱度也上升1%。β转角减少4,α螺旋增加6,自由卷曲减少3,延伸链增加1。结论:SNPs位点对TFB1M基因RNA二级结构及其蛋白结构均有影响。 展开更多

关键词 TFB1M SNPS 外显子 贵州黑山羊 贵州白山羊

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贵州白山羊DRA和DRB1基因的表达差异分析 被引量：2

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作者 黄兰 徐伟 +5 位作者 封竣淇 刘彬 康建兵 钱成 蔡惠芬 罗卫星 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1931-1934,共4页

本研究旨在利用实时荧光定量PCR技术检测贵州白山羊DRA和DRB1基因在心、肝、肾以及免疫组织共9种动物组织中的相对表达差异。分析数据得到,贵州白山羊DRA、DRB1基因在9种组织中均有表达,在脾组织中两个基因的表达量均明显高于其他组织,... 本研究旨在利用实时荧光定量PCR技术检测贵州白山羊DRA和DRB1基因在心、肝、肾以及免疫组织共9种动物组织中的相对表达差异。分析数据得到,贵州白山羊DRA、DRB1基因在9种组织中均有表达,在脾组织中两个基因的表达量均明显高于其他组织,在心、肝、肾和颌下腺四中组织中DRA和DRB1基因的表达量均明显低于其他组织,其中在心和肝两种组织中表达量最低。结果表明,在5种免疫组织中除颌下腺外,DRA和DRB1基因的表达量都较高且都在脾脏组织中高表达。 展开更多

关键词 贵州白山羊 荧光定量PCR DRA DRB1

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LEPR基因在贵州白山羊组织中的表达 被引量：2

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作者 肖旭东 杜典策 +4 位作者 王峰 康建兵 黄兰 徐伟 罗卫星 《山地农业生物学报》 2017年第1期36-39,共4页

为探究瘦素受体基因(LEPR)在贵州白山羊组织中的表达规律,利用实时荧光定量PCR技术检测LEPR基因在贵州白山羊心、肝、脾、肺、肾、肠、背肌、腿肌和皮下脂肪9个组织的表达量。结果表明:目的基因LEPR和内参基因GAPDH的熔解曲线均呈单一峰... 为探究瘦素受体基因(LEPR)在贵州白山羊组织中的表达规律,利用实时荧光定量PCR技术检测LEPR基因在贵州白山羊心、肝、脾、肺、肾、肠、背肌、腿肌和皮下脂肪9个组织的表达量。结果表明:目的基因LEPR和内参基因GAPDH的熔解曲线均呈单一峰形,说明所选条件可准确定量LEPR基因在贵州白山羊各组织中的相对表达量。具体表达量为脂肪>脾>肺>背肌>肠>肝>肾>心>腿肌。 展开更多

关键词 LEPR基因 贵州白山羊 实时荧光定量PCR

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贵州白山羊ALK6基因6个外显子的多态性分析

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作者 覃成 杜智勇 +2 位作者 林尖兵 王嘉福 冉雪琴 《贵州农业科学》 CAS 2008年第1期118-120,共3页

活化素受体样激酶(Activin receptor-like kinases 6,ALK6)是转移生长因子β超家族成员的受体,具有介导细胞发育和分化等重要功能。以人的ALK6蛋白结构域分析为依据,设计了6对特异性引物,再以贵州白山羊血液基因组DNA为模板,扩增出ALK6... 活化素受体样激酶(Activin receptor-like kinases 6,ALK6)是转移生长因子β超家族成员的受体,具有介导细胞发育和分化等重要功能。以人的ALK6蛋白结构域分析为依据,设计了6对特异性引物,再以贵州白山羊血液基因组DNA为模板,扩增出ALK6基因外显子5至外显子10相应的DNA片段。对6个外显子进行SSCP和RFLP分析,结果表明:ALK6基因外显子5至外显子10中没有发现单碱基突变,说明在绵羊、人等ALK6基因中发现的碱基突变在贵州白山羊中的自然发生率极低,该基因在贵州白山羊群体中很保守,其保守性对山羊的发育调控具有重要的意义。 展开更多

关键词 ALK6基因 贵州白山羊 PCR—RFLP SSCP

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