DNA芯片技术研究进展 被引量：61

1

作者 李凌 马文丽 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 2000年第2期151-155,共5页

DNA芯片技术是近年来发展迅速的生物高技术 .其基本过程是采用寡核苷酸原位合成或显微打印手段 ,将大量探针片段有序地固化于支持物如硅芯片的表面 ,然后与扩增、标记的生物样品杂交 ,通过对杂交信号的检测分析 ,即可得出样品的遗传信... DNA芯片技术是近年来发展迅速的生物高技术 .其基本过程是采用寡核苷酸原位合成或显微打印手段 ,将大量探针片段有序地固化于支持物如硅芯片的表面 ,然后与扩增、标记的生物样品杂交 ,通过对杂交信号的检测分析 ,即可得出样品的遗传信息 .该技术不仅可以对遗传信息进行定性、定量分析 ,而且扩展到基因组研究和基因诊断等方面的应用 .尽管目前在硬件和软件上还面临一些困难 ,但其发展和应用的前景广阔 . 展开更多

关键词 DNA芯片 基因诊断 基因组研究 技术原理 制备

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基因芯片技术研究进展 被引量：18

2

作者 王洪水 侯相山 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第8期2241-2243,2245,共4页

主要就基因芯片的概念、技术原理、分类、主要技术流程、应用及其存在的问题和应用前景作了综述。

关键词 基因芯片 基因组研究 基因诊断 技术流程

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基因芯片技术及其应用 被引量：13

3

作者 霍金龙 苗永旺 曾养志 《生物技术通讯》 CAS 2007年第2期329-332,共4页

基因芯片是近年来产生的一项生物高技术。它是利用原位合成或合成后交联法,将大量的核酸片段有规则地固定在固相支持物如载玻片、金属片、尼龙膜上,制成芯片,然后将要检测的样品用荧光素或同位素标记,再与做成的芯片充分杂交,通过对杂... 基因芯片是近年来产生的一项生物高技术。它是利用原位合成或合成后交联法,将大量的核酸片段有规则地固定在固相支持物如载玻片、金属片、尼龙膜上,制成芯片,然后将要检测的样品用荧光素或同位素标记,再与做成的芯片充分杂交,通过对杂交信号的检测来分析样品中的信息。基因芯片技术已在基因表达水平的检测、基因点突变及多态性检测、DNA序列测定、寻找可能的致病基因和疾病相关基因、蛋白质作图、基因组文库作图等方面显示出了广阔的应用前景。 展开更多

关键词 基因芯片 DNA芯片 DNA微阵列 基因组研究

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SSR标记技术在植物基因组研究上的应用 被引量：8

4

作者 陆丹 牛楠 李玥莹 《沈阳师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2010年第1期83-85,共3页

SSR也称作微卫星DNA,是一种广泛应用的分子标记技术。SSR具有丰富的多态性,基于这种多态性,可以对植物基因组进行分析筛选;SSR的检测方法快速、技术简便。目前,这项技术已用于多种植物的基因组研究,如基因定位及遗传图谱的建立、数量性... SSR也称作微卫星DNA,是一种广泛应用的分子标记技术。SSR具有丰富的多态性,基于这种多态性,可以对植物基因组进行分析筛选;SSR的检测方法快速、技术简便。目前,这项技术已用于多种植物的基因组研究,如基因定位及遗传图谱的建立、数量性状标记、杂种优势的利用等。在一些重要的农作物中,已定为了丰富的SSR位点。随着技术的发展,基于SSR技术的新的标记方法不断出现,如:ISSR、RAMP、REMAP。概述了SSR标记技术的原理和特点;介绍了与实验相关的技术和方法;着重整理了近年来在SSR技术上发展起来的新的标记方法;探讨了SSR在植物基因组研究中的应用。 展开更多

关键词 SSR 基因组研究 植物

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全基因组SNP分型技术在畜禽遗传育种研究中的应用 被引量：8

5

作者 刘继强 郝晓东 +6 位作者 武丽娜 廖诗莹 冯羿方 弥世荣 刘燊 刘建 张龙超 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期4123-4137,共15页

随着畜禽资源分子鉴定、物种进化、全基因组育种等热点领域的逐渐兴起,准确的全基因组SNP分型成为了畜禽基因组研究的关键。基因芯片、重测序、简化基因组测序及靶向捕获测序等全基因组SNP分型技术已广泛应用于畜禽基因组研究中。本文... 随着畜禽资源分子鉴定、物种进化、全基因组育种等热点领域的逐渐兴起,准确的全基因组SNP分型成为了畜禽基因组研究的关键。基因芯片、重测序、简化基因组测序及靶向捕获测序等全基因组SNP分型技术已广泛应用于畜禽基因组研究中。本文概述了全基因组SNP分型技术的原理及其在全基因组关联分析、选择信号分析和畜禽遗传资源背景分析等方面的应用,以期为畜禽基因组研究和育种应用提供借鉴和参考。 展开更多

关键词 基因分型 基因组研究 基因芯片 二代测序

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DNA芯片技术研究进展 被引量：5

6

作者 胡建宏 于永生 +1 位作者 江中良 李青旺 《湖北农学院学报》 2002年第1期92-96,共5页

DNA芯片技术是近年来发展迅猛的生物高新技术 ,它是利用光刻合成、高速打印或电定位等技术 ,在支持物硅、玻璃或尼龙膜上按照特定的排列方式有序地固化大量的基因探针 ,形成DNA微阵列。生物样品DNA/RNA通过PCR/RT—PCR扩增和荧光标记后... DNA芯片技术是近年来发展迅猛的生物高新技术 ,它是利用光刻合成、高速打印或电定位等技术 ,在支持物硅、玻璃或尼龙膜上按照特定的排列方式有序地固化大量的基因探针 ,形成DNA微阵列。生物样品DNA/RNA通过PCR/RT—PCR扩增和荧光标记后与DNA微阵列杂交 ,通过荧光扫描器及计算机分析 。 展开更多

关键词 DNA芯片 DNA微阵列 DNA测序 基因诊断 基因组研究

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一株金黄色葡萄球菌噬菌体的裂解谱特异性和分子分类研究 被引量：7

7

作者 张志宏 杨娇 +2 位作者 张海鹏 钟佑宏 王鹏 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2043-2052,共10页

【目的】从医院污水中分离金黄色葡萄球菌噬菌体,观察其形态,确证裂解谱特征并研究生物学和基因学特性,为噬菌体的临床应用奠定实验基础。【方法】将金黄色葡萄球菌ATCC25923作为宿主菌,采用双层琼脂平板法从医院污水中分离纯化噬菌体,... 【目的】从医院污水中分离金黄色葡萄球菌噬菌体,观察其形态,确证裂解谱特征并研究生物学和基因学特性,为噬菌体的临床应用奠定实验基础。【方法】将金黄色葡萄球菌ATCC25923作为宿主菌,采用双层琼脂平板法从医院污水中分离纯化噬菌体,电镜下观察形态并测定其最佳感染复数、一步生长曲线及裂解谱;全基因组测序并进行基因结构分析和功能注释。【结果】从4份医院污水中共分离到1株金黄色葡萄球菌噬菌体(命名为vB_SauH_SAP1),仅裂解10株临床分离的葡萄球菌属受试菌(共计37株),其余74株其他种属菌株不能被裂解;透射电镜观察具有正20面体头部和收缩性尾部,属于肌尾噬菌体;其最佳感染复数为0.1,潜伏期10 min,裂解期为20 min。vB_SauH_SAP1基因组全长143375 bp,G+C含量为30.2%,编码226个开放阅读框(ORF),未发现已知的毒力相关基因和抗生素抗性基因,基因组与Kayvirus属葡萄球菌噬菌体有较高的同源性。【结论】分离到1株新的Kayvirus属金黄色葡萄球菌噬菌体,根据生物学特性和基因组研究,具有一定的潜在应用价值。 展开更多

关键词 肌尾噬菌体 金黄色葡萄球菌 生物学特性 全基因组测序 基因组研究

原文传递

植物基因组研究与利用的新型工具——异源单体附加系 被引量：6

8

作者 谭光轩 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期35-45,共11页

在高等植物中,以种间杂交和回交把有益基因从一个物种转移到另一个物种为目的育种项目中,单个外源染色体常常被附加到含有受体细胞完整一套染色体中,形成异源单体附加系。这种异源单体附加系是阐明基因组结构和转移基因的有效工具。它... 在高等植物中,以种间杂交和回交把有益基因从一个物种转移到另一个物种为目的育种项目中,单个外源染色体常常被附加到含有受体细胞完整一套染色体中,形成异源单体附加系。这种异源单体附加系是阐明基因组结构和转移基因的有效工具。它可以通过回交形成覆盖整个基因组的渗入系重叠群,用于建立以受体物种基因组为载体的外源物种基因组文库。另外,一套完整的异源单体附加系也可看作是一个拥有分散供体基因组成为单个染色体单位的文库,便于精确高通量地将标记分配到单个供体染色体上,从而可以比较供体染色体和各自的直向同源受体染色体之间的标记位置和同线性关系。同时,也便于研究同源染色体的渗入机制和配对状态。文中介绍了异源单体附加系的培育和特性,并着重阐明了它在遗传育种和基础研究中的应用。 展开更多

关键词 植物杂交 异源单体附加系 基因组研究 有益基因渗入

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鲍曼不动杆菌碳青霉烯耐药流行克隆株的毒力及基因差异分析

9

作者 黄心林 宁年智 +1 位作者 李伯安 王慧 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期649-655,共7页

目的对碳青霉烯耐药的鲍曼不动杆菌ST191、ST195和ST208的毒力水平进行分析,探究流行克隆株之间的毒力因子差异。方法对2011—2019年中国人民解放军总医院第五医学中心(北院区)分离的ST191、ST195和ST208共计233株鲍曼不动杆菌进行基因... 目的对碳青霉烯耐药的鲍曼不动杆菌ST191、ST195和ST208的毒力水平进行分析,探究流行克隆株之间的毒力因子差异。方法对2011—2019年中国人民解放军总医院第五医学中心(北院区)分离的ST191、ST195和ST208共计233株鲍曼不动杆菌进行基因组二代测序,将基因组数据与细菌毒力因子数据库(VFDB)比对,探究菌株的毒力基因存在情况,同时采用大蜡螟感染生存模型评估菌株的毒力水平,采用Kendall′s tau-b等级相关分析菌株毒力水平与毒力基因的相关性。结果共收集鲍曼不动杆菌ST191克隆38株,ST195克隆104株,ST208克隆91株。大蜡螟感染生存试验中ST191平均致死率为23.0%,高毒力菌株有3株(7.9%);ST195平均致死率为53.0%,高毒力菌株有34株(32.7%);ST208平均致死率为47.0%,高毒力菌株有20株(21.9%),ST191与ST195(χ^(2)=13.9,P<0.001)和ST208(χ^(2)=15.2,P<0.001)的大蜡螟致死率有显著差异。经比对数据库中7类共120个鲍曼不动杆菌毒力基因,发现克隆株携带的毒力基因具有显著差异,其中Ⅵ型分泌系统相关基因(clpV/tssH、hcp/tssD、tagX、tssA、tssB、tssC、tssE、tssF、tssG、tssK、tssL、tssM)和糖转移酶基因ACICU_RS00475在ST191菌株中普遍缺失(0),相反ST195(99.0%)和ST208(>82.0%)菌株普遍携带此类基因。克隆株的大蜡螟致死率与其携带毒力基因相关(clpV/tssHP<0.001、hcp/tssDP=0.001、tagXP<0.001、tssAP<0.001、tssBP=0.001、tssCP=0.001、tssE P=0.001、tssF P=0.001、tssGP<0.001、tssKP<0.001、tssLP<0.001、tssMP=0.001,ACICU_RS00475 P=0.001)。结论碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌流行株中,ST191的大蜡螟致死率较ST195和ST208低,可能与其Ⅵ型分泌系统和糖转移酶基因的缺失有关。 展开更多

关键词 鲍曼不动杆菌 毒力 基因组研究 Ⅵ型分泌系统 糖转移酶

原文传递

松乳菇的研究进展

10

作者 彭君 朱德彬 +1 位作者 王小凤 李湘球 《长江蔬菜》 2021年第24期41-44,共4页

我国市场上常见的松乳菇为野生菌,其肉质鲜美、鲜食可口,营养丰富,食药两用,市场潜力大。简述了野生松乳菇的资源分布、营养价值、基因组序列研究以及人工栽培情况,以期进一步为松乳菇的驯化栽培提供理论基础。

关键词 松乳菇 基因组研究 驯化 人工栽培

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外显子捕捉法快速分离新基因的原理和方法

11

作者 朱冠山 缪为民 焦炳华 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1997年第3期207-211,共5页

从大片段基因组DNA中快速分离转录序列是疾病基因定位克隆 (positionalcloning)中的关键步骤 .外显子捕捉法是一种较为成功的方法 .文章对该法的基本原理。

关键词 基因 分离方法 外显子捕捉法

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人类基因组图谱研究能给我们带来什么 被引量：17

12

作者 方福德 《医学与哲学》 2000年第11期16-20,共5页

人类基因组研究在过去 10年中取得了重要成果 ,推动了生命科学的迅猛发展。人类基因组研究给我们带来了什么 ?首先是带来了新的观念 ,促使人们从整体综合的认识论高度去认识生命现象的发生原理 ,其次 ,在方法论上 ,开创了以高通量、大... 人类基因组研究在过去 10年中取得了重要成果 ,推动了生命科学的迅猛发展。人类基因组研究给我们带来了什么 ?首先是带来了新的观念 ,促使人们从整体综合的认识论高度去认识生命现象的发生原理 ,其次 ,在方法论上 ,开创了以高通量、大规模为特点的研究方式。人类基因组研究将成为 2 展开更多

关键词 人类基因组研究 认识论 方法论 人类基础组图谱

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Fiber-FISH技术及其在植物基因组研究中的应用 被引量：2

13

作者 李宗芸 宋运淳 李立家 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2002年第3期359-364,共6页

Fiber_FISH(fiberbasedfluorescentinsituhybridizationDNA纤维荧光原位杂交 )是近年来发展起来的一项直接在DNA纤维上进行荧光原位杂交的技术 ,其分辨率和灵敏度可分别达到 1～ 2kb和 2 0 0bp。描述了Fiber_FISH的技术要点 ,念珠状信... Fiber_FISH(fiberbasedfluorescentinsituhybridizationDNA纤维荧光原位杂交 )是近年来发展起来的一项直接在DNA纤维上进行荧光原位杂交的技术 ,其分辨率和灵敏度可分别达到 1～ 2kb和 2 0 0bp。描述了Fiber_FISH的技术要点 ,念珠状信号形成的可能原因 。 展开更多

关键词 Fiber-FISH技术 植物基因组 应用 念珠状信号

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荧光标记的染色体原位杂交及其在人类基因组研究中的应用 被引量：1

14

作者 吴学军 柴建华 《生物化学与生物物理进展》 CSCD 北大核心 1995年第2期122-126,共5页

ＦＩＳＨ技术是８０年代开始发展起来的一种新的定位技术。在人类基因组研究中得到了广泛的应用。通过中期染色体的ＦＩＳＨ可以进行ＳＣＰ，Ｃｏｓｍｉｄ和ＹＡＣ的染色体定位，嵌合克隆的鉴别；通过间期核的ＦＩＳＨ可以在５０ｋｂ的... ＦＩＳＨ技术是８０年代开始发展起来的一种新的定位技术。在人类基因组研究中得到了广泛的应用。通过中期染色体的ＦＩＳＨ可以进行ＳＣＰ，Ｃｏｓｍｉｄ和ＹＡＣ的染色体定位，嵌合克隆的鉴别；通过间期核的ＦＩＳＨ可以在５０ｋｂ的分辨率下进行基因作图；最新的研究进展已可以进行伸展的染色质丝（ｃｈｒｏｍａｔｉｎｆｉｂｒｅ）的ＦＩＳＨ，直接测量基因的长度，从而达到高精度基因作图的目的。总之，随着ＦＩＳＨ技术本身的发展，它将在人类基因组研究中发挥更大的作用。 展开更多

关键词 FISH 人类 基因组 染色体定位 基因作图

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基因组研究进展

15

作者 吴友芝 项一宁 《贵州科学》 1995年第4期49-52,64,共5页

基因组结构和遗传语言的研究是现代生物学的前沿和竞争的焦点,对未来生物学、医学、农学和生物技术的发展有十分重要的意义。分子生物学技术的进步为基因组的研究提供了有用的工具。本文对非细胞生物体、原核生物、真核生物的基因组结... 基因组结构和遗传语言的研究是现代生物学的前沿和竞争的焦点,对未来生物学、医学、农学和生物技术的发展有十分重要的意义。分子生物学技术的进步为基因组的研究提供了有用的工具。本文对非细胞生物体、原核生物、真核生物的基因组结构研究现状,特别是人类基因组计划的进展和前景进行了综述。 展开更多

关键词 基因组 遗传信息 无性系 分子生物学

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美国国家科学基金会资助植物基因组研究现状及展望 被引量：1

16

作者 程汉 王君晖 +1 位作者 闫章才 冯锋 《生命科学》 CSCD 2002年第2期112-114,共3页

简要回顾了美国国家科学基金会资助植物基因组研究的情况；包括研究方向和进展、资助项目特点和存在的问题等，并对2002年度的资助计划进行了展望。

关键词 美国国家科学基金会 研究方向 资助计划 植物基因组

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2017-2019年四川地区猪A群轮状病毒的分子流行病学调查 被引量：19

17

作者 周群 陈小飞 +4 位作者 阚蕊慈 李玉 曹慧 彭艳伶 张斌 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1063-1072,共10页

【目的】通过对四川地区规模化猪场A群轮状病毒(RVA)的分子检测,从而了解RVA流行情况及分子特征,为猪RVA疫苗研制提供理论基础。【方法】2017—2019年从四川省14个地区40个猪场采集303份仔猪腹泻样本,用荧光定量RT-PCR方法调查RVA的分... 【目的】通过对四川地区规模化猪场A群轮状病毒(RVA)的分子检测,从而了解RVA流行情况及分子特征,为猪RVA疫苗研制提供理论基础。【方法】2017—2019年从四川省14个地区40个猪场采集303份仔猪腹泻样本,用荧光定量RT-PCR方法调查RVA的分子流行率,用RT-PCR方法对RVA阳性样本进行分型和VP4和VP7全基因组的扩增,用Rota C2.0软件确定相应毒株的基因型,用MegAlign软件进行同源性分析,通过MEGA 7.0软件用邻近法构建系统进化树,用SimPlot和RDP4软件进行重组分析。【结果】303份仔猪腹泻样本检出RVA阳性样本98份,阳性率为32.34%(98/303,95%CI=27.1%—37.9%)。从98份RVA阳性样本中扩增出39个VP7片段,G9为优势基因型(41%),G4、G5、G26和G3各占23%、28.2%、5.1%和2.7%。扩增出的59个P型中以P[13]型为主,占40.7%,其次为P[6]、P[23]和P[1]型,分别占30.5%、23.7%和5.1%。30株毒株成功鉴定出G/P基因型,G9P[23](23.3%)为优势组合基因型。其他基因型为G4P[6](16.7%)、G9P[13](13.3%)、G5P[23](10%)、G5P[13](10%)、G9P[6](6.7%)、G26P[13](6.7%)、G4P[13](6.7%)、G4P[23](3.3%)和G3P[13](3.3%)。基因型G5P[23]、G4P[13]、G9P[6]、G26P[13]和G4P[23]为国内首次鉴定。此外,重组分析表明4株毒株在VP7或VP4基因上存在重组现象。【结论】四川地区腹泻仔猪粪便中RVA的流行率高且基因型复杂,优势组合基因型为G9P[23]。该结果丰富了四川地区RVA的流行病学资料,对四川地区猪RVA的防控提供了重要参考。 展开更多

关键词 猪A群轮状病毒 分子流行病学 基因组研究 重组

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术后恶心呕吐的研究进展

18

作者 张岩丽 郑周鹏 《中国口腔医学继续教育杂志》 2023年第6期438-441,453,共5页

术后恶心呕吐是常见的术后并发症之一,严重影响患者舒适度及满意度,尽管已经有很多相关研究,但对于其机制及预防和治疗并没有统一定论。为此本文就术后恶心呕吐可能机制、相关风险因素、预防与治疗进行综述,为临床工作提供参考。

关键词 术后恶心呕吐 口腔科手术 基因组学研究 人工智能预测 种族差异

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CRISPR/Cas系统在斑马鱼中的研究进展

19

作者 王阿利 刘江东 《生物技术进展》 2023年第4期485-491,共7页

斑马鱼是生物学中十分重要的模式生物,可作为基因功能分析、人类疾病病理学研究和新药研发的有利工具。它具有易于控制操作、与人类进化关系相近的优势,目前已经开发了多种斑马鱼模型用于研究人类相关疾病。聚集的有规则间隔的短回文重... 斑马鱼是生物学中十分重要的模式生物,可作为基因功能分析、人类疾病病理学研究和新药研发的有利工具。它具有易于控制操作、与人类进化关系相近的优势,目前已经开发了多种斑马鱼模型用于研究人类相关疾病。聚集的有规则间隔的短回文重复序列及其关联蛋白(the clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPRassociated proteins,CRISPR/Cas)技术的出现,大大降低了斑马鱼基因编辑的复杂性。主要描述了CRISPR/Cas系统的基本原理、技术革新,总结了CRISPR/Cas系统在斑马鱼基因敲除或敲入、活细胞成像、转录调控、多重靶向、建立疾病模型中的重要作用,以期为探究CRISPR/Cas系统在斑马鱼基因组学研究中的应用提供一定思路。 展开更多

关键词 CRISPR/Cas 斑马鱼 基因编辑 基因组学研究 疾病模型

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高山植物黄管秦艽cDNA文库构建与表达序列标签(EST)分析(英文) 被引量：2

20

作者 尹红菊 王留阳 +3 位作者 高茜 高大海 张东远 刘建全 《云南植物研究》 CSCD 北大核心 2009年第2期146-152,共7页

黄管秦艽(Gentiana officinalis)是一种重要的藏药高山植物,本研究构建了该物种开花期的cDNA文库。经检测达到中等cDNA文库水平,文库滴度为1.2×107pfu/ml,重组率95.9%,插入片段平均长度大于500bp。对343个随机挑选的重组克隆进行... 黄管秦艽(Gentiana officinalis)是一种重要的藏药高山植物,本研究构建了该物种开花期的cDNA文库。经检测达到中等cDNA文库水平,文库滴度为1.2×107pfu/ml,重组率95.9%,插入片段平均长度大于500bp。对343个随机挑选的重组克隆进行部分测序,获得的ESTs经编辑后共有181条有效序列。经生物信息学方法分析181条表达序列标签(EST)代表144个单克隆序列,其中55个与已鉴定的基因同源,35个序列与未鉴定的EST匹配,54个未找到同源序列;后两者共有89个EST序列未发现功能相似的蛋白。对已鉴定的EST进行功能分析发现,相关基因主要编码以下蛋白:与蛋白表达相关的占35%;光合作用相关的占22%;新陈代谢相关的占18%;抗性相关的占11%;质膜运输和细胞分裂相关的分别占5%;染色体变化和细胞信号转导的分别占2%。根据有效EST序列设计引物,通过RT-PCR进一验证了所得EST的准确性。这些研究结果为将来研究黄管秦艽的功能基因以及该物种与相关物种的群体遗传学、进化生物学等方面提供了基础。 展开更多

关键词 黄管秦艽 基因组学 CDNA文库 表达序列标签 龙胆属

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