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基于GPGPU的Lattice-Boltzmann数值模拟算法
被引量：
11
1
作者
周季夫
钟诚文
+2 位作者
尹世群
解建飞
张勇
《计算机辅助设计与图形学学报》
EI
CSCD
北大核心
2008年第7期912-918,共7页
对Lattice Boltzmann方法(LBM)在GPGPU下的建模和算法进行了一系列研究,使得该方法在GPU下的计算加速比提升,大大缩短计算过程的时间消耗.重新设计了GPU的计算流程,在舍弃pixel buffer离屏渲染的同时,采用最新的帧缓存对象,多重纹理、...
对Lattice Boltzmann方法(LBM)在GPGPU下的建模和算法进行了一系列研究,使得该方法在GPU下的计算加速比提升,大大缩短计算过程的时间消耗.重新设计了GPU的计算流程,在舍弃pixel buffer离屏渲染的同时,采用最新的帧缓存对象,多重纹理、多通道渲染和乒乓技术来设计一套基于方腔的LBM数值模拟程序,最终使GPU的计算时间缩短到CPU计算时间的六分之一.
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关键词
基于图形处理器的通用计算
帧缓存扩展
多重渲染目标
Lattice-Boltzmann方法
反弹边界
乒乓技术
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职称材料
基于GPGPU的生物序列快速比对
被引量：
5
2
作者
马海晨
韦刚
吴百峰
《计算机工程》
CAS
CSCD
2012年第4期241-244,共4页
在CPU-GPU异构平台下,提出一种高效的生物序列比对方案。该方案利用GPU的并行处理能力,通过对读延迟、写延迟、重组函数及数据传输进行优化,在OpenCL框架下重构Smith-Waterman算法,加快生物序列比对速度。实验结果证明,与CPU上传统的串...
在CPU-GPU异构平台下,提出一种高效的生物序列比对方案。该方案利用GPU的并行处理能力,通过对读延迟、写延迟、重组函数及数据传输进行优化,在OpenCL框架下重构Smith-Waterman算法,加快生物序列比对速度。实验结果证明,与CPU上传统的串行算法相比,该算法最高可获得约100倍的性能提升。
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关键词
生物信息学
序列比对
通用图形处理器
SMITH-WATERMAN算法
OpenCL框架
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职称材料
并行时空处理模型下的快速N-body算法
被引量：
3
3
作者
王伟
曾栩鸿
+2 位作者
王福焕
傅丽丽
曾国荪
《计算机科学与探索》
CSCD
2011年第11期1006-1013,共8页
图形处理器(graphic processing unit,GPU)的最新发展已经能够以低廉的成本提供高性能的通用计算。基于GPU的CUDA(compute unified device architecture)和OpenCL(open computing language)编程模型为程序员提供了充足的类似于C语言的...
图形处理器(graphic processing unit,GPU)的最新发展已经能够以低廉的成本提供高性能的通用计算。基于GPU的CUDA(compute unified device architecture)和OpenCL(open computing language)编程模型为程序员提供了充足的类似于C语言的应用程序接口(application programming interface,API),便于程序员发挥GPU的并行计算能力。采用图形硬件进行加速计算,通过一种新的GPU处理模型——并行时间空间模型,对现有GPU上的N-body实现进行了分析,从而提出了一种新的GPU上快速仿真N-body问题的算法,并在AMD的HD Radeon 5850上进行了实现。实验结果表明,相对于CPU上的实现,获得了400倍左右的加速;相对于已有GPU上的实现,也获得了2至5倍的加速。
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关键词
N-BODY
并行计算
通用图形处理器(
gpgpu
)
时间空间模型
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职称材料
面向CPU-GPU架构的源到源自动映射方法
被引量：
2
4
作者
朱正东
刘袁
+3 位作者
魏洪昌
颜康
王寅峰
董小社
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2015年第21期41-47,共7页
针对GPU上应用开发移植困难的问题,提出了一种串行计算源程序到并行计算源程序的映射方法。该方法从串行源程序中获得可并行化循环的层次信息,建立循环体结构与GPU线程的对应关系,生成GPU端核心函数代码;根据变量引用读写属性生成CPU端...
针对GPU上应用开发移植困难的问题,提出了一种串行计算源程序到并行计算源程序的映射方法。该方法从串行源程序中获得可并行化循环的层次信息,建立循环体结构与GPU线程的对应关系,生成GPU端核心函数代码;根据变量引用读写属性生成CPU端控制代码。基于该方法实现了一个编译原型系统,完成了C语言源程序到CUDA源程序的自动生成。对原型系统在功能和性能方面的测试结果表明,该系统生成的CUDA源程序与C语言源程序在功能上一致,其性能有显著提高,在一定程度上解决了计算密集型应用向CPU-GPU异构多核系统移植困难的问题。
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关键词
通用计算图形处理器(
gpgpu
)
统一计算架构(CUDA)
自动映射
源到源编译
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职称材料
题名
基于GPGPU的Lattice-Boltzmann数值模拟算法
被引量：
11
1
作者
周季夫
钟诚文
尹世群
解建飞
张勇
机构
西北工业大学高性能计算研究与发展中心
西南大学计算机与信息科学学院
西北工业大学翼型
中国人民解放军
出处
《计算机辅助设计与图形学学报》
EI
CSCD
北大核心
2008年第7期912-918,共7页
基金
航空科学基金(20061453020)
西北工业大学基础科学研究基金重点项目
文摘
对Lattice Boltzmann方法(LBM)在GPGPU下的建模和算法进行了一系列研究,使得该方法在GPU下的计算加速比提升,大大缩短计算过程的时间消耗.重新设计了GPU的计算流程,在舍弃pixel buffer离屏渲染的同时,采用最新的帧缓存对象,多重纹理、多通道渲染和乒乓技术来设计一套基于方腔的LBM数值模拟程序,最终使GPU的计算时间缩短到CPU计算时间的六分之一.
关键词
基于图形处理器的通用计算
帧缓存扩展
多重渲染目标
Lattice-Boltzmann方法
反弹边界
乒乓技术
Keywords
general
purpose
graphic
processing unit
（
gpgpu
）
frame
buffer
object
multiple
render
target
Lattice-Boltzmann
method
rebound
boundary
ping-pang
technique
分类号
TP391.9 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
基于GPGPU的生物序列快速比对
被引量：
5
2
作者
马海晨
韦刚
吴百峰
机构
复旦大学计算机科学技术学院
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
2012年第4期241-244,共4页
文摘
在CPU-GPU异构平台下,提出一种高效的生物序列比对方案。该方案利用GPU的并行处理能力,通过对读延迟、写延迟、重组函数及数据传输进行优化,在OpenCL框架下重构Smith-Waterman算法,加快生物序列比对速度。实验结果证明,与CPU上传统的串行算法相比,该算法最高可获得约100倍的性能提升。
关键词
生物信息学
序列比对
通用图形处理器
SMITH-WATERMAN算法
OpenCL框架
Keywords
bioinformatics
sequence
alignment
general
purpose
graphic
processing unit
（
gpgpu
）
Smith-Waterman（SW）
algorithm
OpenCL
framework
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
并行时空处理模型下的快速N-body算法
被引量：
3
3
作者
王伟
曾栩鸿
王福焕
傅丽丽
曾国荪
机构
同济大学计算机科学与技术系
国家高性能计算机工程技术中心同济分中心
同济大学嵌入式系统与服务计算教育部重点实验室
出处
《计算机科学与探索》
CSCD
2011年第11期1006-1013,共8页
基金
国家自然科学基金No.61103068
61174158
+5 种基金
NSFC-微软亚洲研究院联合资助项目No.60970155
教育部博士点基金No.20090072110035
上海市优秀学科带头人计划项目No.10XD1404400
高效能服务器和存储技术国家重点实验室开放基金No.2009HSSA06
同济大学青年基金No.0800219105
2009KJ030~~
文摘
图形处理器(graphic processing unit,GPU)的最新发展已经能够以低廉的成本提供高性能的通用计算。基于GPU的CUDA(compute unified device architecture)和OpenCL(open computing language)编程模型为程序员提供了充足的类似于C语言的应用程序接口(application programming interface,API),便于程序员发挥GPU的并行计算能力。采用图形硬件进行加速计算,通过一种新的GPU处理模型——并行时间空间模型,对现有GPU上的N-body实现进行了分析,从而提出了一种新的GPU上快速仿真N-body问题的算法,并在AMD的HD Radeon 5850上进行了实现。实验结果表明,相对于CPU上的实现,获得了400倍左右的加速;相对于已有GPU上的实现,也获得了2至5倍的加速。
关键词
N-BODY
并行计算
通用图形处理器(
gpgpu
)
时间空间模型
Keywords
N-body
parallel
computing
general
purpose
graphic
processing unit
（
gpgpu
）
time-space
model
分类号
TP301 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
下载PDF
职称材料
题名
面向CPU-GPU架构的源到源自动映射方法
被引量：
2
4
作者
朱正东
刘袁
魏洪昌
颜康
王寅峰
董小社
机构
西安交通大学电子与信息工程学院
深圳信息职业技术学院
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2015年第21期41-47,共7页
基金
国家自然科学基金(No.61173039)
青年基金项目(No.61202041)
+2 种基金
国家高技术研究发展计划(863)(No.2012AA010904
No.2012AA01A306)
深圳市科技计划(No.JCYJ20120615101127404)
文摘
针对GPU上应用开发移植困难的问题,提出了一种串行计算源程序到并行计算源程序的映射方法。该方法从串行源程序中获得可并行化循环的层次信息,建立循环体结构与GPU线程的对应关系,生成GPU端核心函数代码;根据变量引用读写属性生成CPU端控制代码。基于该方法实现了一个编译原型系统,完成了C语言源程序到CUDA源程序的自动生成。对原型系统在功能和性能方面的测试结果表明,该系统生成的CUDA源程序与C语言源程序在功能上一致,其性能有显著提高,在一定程度上解决了计算密集型应用向CPU-GPU异构多核系统移植困难的问题。
关键词
通用计算图形处理器(
gpgpu
)
统一计算架构(CUDA)
自动映射
源到源编译
Keywords
general
purpose
graphic
processing unit
（
gpgpu
）
Compute
Unified
Device
Architecture
（CUDA）
auto-matic
mapping
source
to
source
compile
分类号
TP303 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于GPGPU的Lattice-Boltzmann数值模拟算法
周季夫
钟诚文
尹世群
解建飞
张勇
《计算机辅助设计与图形学学报》
EI
CSCD
北大核心
2008
11
下载PDF
职称材料
2
基于GPGPU的生物序列快速比对
马海晨
韦刚
吴百峰
《计算机工程》
CAS
CSCD
2012
5
下载PDF
职称材料
3
并行时空处理模型下的快速N-body算法
王伟
曾栩鸿
王福焕
傅丽丽
曾国荪
《计算机科学与探索》
CSCD
2011
3
下载PDF
职称材料
4
面向CPU-GPU架构的源到源自动映射方法
朱正东
刘袁
魏洪昌
颜康
王寅峰
董小社
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2015
2
下载PDF
职称材料
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