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基于ISSR标记的麻花艽遗传多样性分析 被引量：19
1
作者 王笠 赵志礼 +2 位作者 倪梁红 嘎务 米玛 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第15期3168-3174,共7页
目的探讨秦艽基原植物之一麻花艽Gentiana straminea的遗传多样性,并构建DNA指纹谱。方法在其自然分布区广泛取样,共涉及西藏、青海、甘肃及四川等地28个居群83份样本,应用ISSR分子标记技术,POPGEN软件分析遗传信息参数,NTSYS软件构建... 目的探讨秦艽基原植物之一麻花艽Gentiana straminea的遗传多样性,并构建DNA指纹谱。方法在其自然分布区广泛取样,共涉及西藏、青海、甘肃及四川等地28个居群83份样本,应用ISSR分子标记技术,POPGEN软件分析遗传信息参数,NTSYS软件构建亲缘关系UPGMA聚类图。结果从100条引物中筛出7条多态性好、条带清晰的引物用于ISSR分析。共检测到95个条带,其中多态性条带88个,多态性条带百分率(PPL)为92.63%;麻花艽居群间的期望杂合度(H_e)为0.288 2,多样性信息指数(I_m)为0.437 1,种群间基因分化系数(G_(st))为0.678 3,基因流(N_m)为0.237 1,遗传距离为0.074 3~0.490 0。UPGMA树将麻花艽居群主要分为2大支。结论麻花艽种群遗传多样性水平较高,居群间遗传多样性水平高于居群内;其遗传变异主要存在于居群间;遗传特性与地理分布具有一定相关性。该工作可为麻花艽品种鉴定、物种就地保护、探讨环境等因素对于遗传分化的影响及药材道地性研究提供基础资料。 展开更多
关键词 麻花艽 ISSR 遗传多样性 dna指纹谱 多态性条带百分率
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藏药解吉那保基原植物粗茎秦艽品种鉴定及种内遗传多样性分析 被引量：8
2
作者 宗粉粉 赵志礼 +2 位作者 倪梁红 嘎务 刘铜华 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1941-1950,共10页
藏药"解吉那保"(居群163株个体),结合模式标本查阅与形态学比较,将其主流品种之一鉴定为龙胆科龙胆属Gentiana粗茎秦艽Gentiana crassicaulis。粗茎秦艽,我国特有物种,仅在西藏、云南、四川、贵州、青海及甘肃等省区有分布,... 藏药"解吉那保"(居群163株个体),结合模式标本查阅与形态学比较,将其主流品种之一鉴定为龙胆科龙胆属Gentiana粗茎秦艽Gentiana crassicaulis。粗茎秦艽,我国特有物种,仅在西藏、云南、四川、贵州、青海及甘肃等省区有分布,多见于海拔2100~4500 m的高山草甸、林下及林缘。应用AFLP技术,以龙胆科花锚属椭圆叶花锚Halenia elliptica及龙胆属近缘种麻花艽G.straminea为外类群,构建DNA指纹谱。从64对引物组合中筛选出12对,共扩增出315个条带,其中多态性条带254条,占比为80.63%。粗茎秦艽种内遗传多样性丰富,遗传变异主要存在于居群间(87%),居群内部遗传变异较小(13%)。非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)聚类树物种间拓扑结构与经典分类学观点相一致;物种内分为两大支:支I由西藏、甘肃、青海及四川各居群组成,支II由贵州及云南各居群组成。PCA分析及Mantel检验等均表明粗茎秦艽居群间遗传距离与空间地理距离具有显著的正相关关系。同时,结合SSR与SNP标记,探讨了四川康定县居群S1的分化问题。本工作可为藏药"解吉那保"种质资源保护、药材生药学鉴定及道地性探究等提供基础资料。 展开更多
关键词 藏药 解吉那保 粗茎秦艽 扩增片段长度多态性 dna指纹谱
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大仓鼠DNA指纹谱探针的筛选 被引量：2
3
作者 宋铭晶 徐来祥 张知彬 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期287-292,共6页
采用一种简便提取高质量DNA的方法,从大仓鼠肝脏组织中提取其总DNA,分别以人工合成的微卫星核心序列(GTG)5和(CA)8做单一引物,进行特异引物PCR反应。电泳检测后回收15条特异性片段。与被标记过的大仓鼠基因组DNA反向杂交结果表明,15个... 采用一种简便提取高质量DNA的方法,从大仓鼠肝脏组织中提取其总DNA,分别以人工合成的微卫星核心序列(GTG)5和(CA)8做单一引物,进行特异引物PCR反应。电泳检测后回收15条特异性片段。与被标记过的大仓鼠基因组DNA反向杂交结果表明,15个片段中(GTG)5-8、(CA)8-1b和(CA)8-5b产生了较强的阳性信号。我们依据3个片段的测序结果设计适合DIG标记的探针,该探针得到的大仓鼠不同地理种群个体的指纹图谱有较高的个体特异性和种群多态性,而且与传统的来源于其它生物重复序列的探针如33.6和33.15形成的指纹图谱相比得到的变异适中,便于统计。 展开更多
关键词 大仓鼠 dna指纹谱 探针 微卫星 反向杂交
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伏翼DNA指纹谱探针的筛选
4
作者 李修善 徐来祥 +1 位作者 王磊 田雨成 《曲阜师范大学学报（自然科学版）》 CAS 1999年第3期89-92,共4页
以人工合成的微卫星序列（ＧＴＧ）５、（ＧＴ）８、（ＣＡＣ）５和人源小卫星３３．１５做引物，首次随机扩增了伏翼的基因组ＤＮＡ，从多态性ＤＮＡ片段中回收８条特异性片段，即（ＧＴＧ）５ａ、（ＧＴＧ）５ｂ、（ＧＴ）８ａ、（Ｇ... 以人工合成的微卫星序列（ＧＴＧ）５、（ＧＴ）８、（ＣＡＣ）５和人源小卫星３３．１５做引物，首次随机扩增了伏翼的基因组ＤＮＡ，从多态性ＤＮＡ片段中回收８条特异性片段，即（ＧＴＧ）５ａ、（ＧＴＧ）５ｂ、（ＧＴ）８ａ、（ＧＴ）８ｂ、（ＣＡＣ）５ａ、（ＣＡＣ）５ｂ、３３．１５ａ和３３．１５ｂ．与被标记过的基因组ＤＮＡ做探针斑点杂交结果表明，８个片段中（ＧＴＧ）５ａ、（ＣＡＣ）５ａ和３３．１５ａ产生了阳性信号，因此，这三个片段被标记后做探针可用于伏翼ＤＮＡ指纹谱的制备． 展开更多
关键词 伏翼 dna指纹谱 探针 筛选
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用DNA指纹谱区分火鸡多杀巴氏杆菌疫苗株和野毒株
5
作者 C.J.Kim 《国外兽医学（畜禽传染病）》 1991年第4期26-27,共2页
关键词 dna指纹谱 火鸡 多杀巴氏杆菌 鉴定 疫苗株 野毒蛛
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中国莲子种质资源遗传多样性的RAPD分析 被引量：5
6
作者 郑宝东 郑金贵 曾绍校 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 2006年第1期138-143,共6页
利用RAPD标记对收集自全国不同地区的22个莲子(NympheaceaeNelumboAdans)栽培品种及野生品种的遗传多样性进行了分析。结果表明:筛选出的14个随机引物扩增出109条DNA指纹谱带,其中83条为多态性片断,为总数的76.1%。应用PhylTools统计数... 利用RAPD标记对收集自全国不同地区的22个莲子(NympheaceaeNelumboAdans)栽培品种及野生品种的遗传多样性进行了分析。结果表明:筛选出的14个随机引物扩增出109条DNA指纹谱带,其中83条为多态性片断,为总数的76.1%。应用PhylTools统计数据软件进行差异条带的遗传距离系数分析,构建遗传距离系数矩阵,然后用PHYLIP软件包(版本3.573c)非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类分析并绘制聚类树状图,供试品种可以划分为五大类,其中江苏水选1号、建宁莲3号、建瓯莲分别单独为一类,其它19种聚为二类。从中可看出品种间的遗传距离与收集地区没有直接的关联,该研究为莲子育种提供重要的信息。 展开更多
关键词 RAPD 聚类分析 dna指纹谱带 遗传距离
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基于SSR标记的太湖稻区常规粳稻DNA指纹图谱构建及遗传相似性分析 被引量：10
7
作者 罗兵 孙海燕 +3 位作者 杨志刚 沈宗根 汤俊 端木银熙 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期9-14,共6页
【目的】构建太湖稻区粳稻（Oryza sativa L.Subsp.Japonica）DNA指纹图谱,分析粳稻品种间的遗传相似性,为其育种和种子纯度鉴定提供参考。【方法】以19份太湖地区优质常规粳稻品种为材料,利用分布于水稻12条染色体上的24对SSR引物构建... 【目的】构建太湖稻区粳稻（Oryza sativa L.Subsp.Japonica）DNA指纹图谱,分析粳稻品种间的遗传相似性,为其育种和种子纯度鉴定提供参考。【方法】以19份太湖地区优质常规粳稻品种为材料,利用分布于水稻12条染色体上的24对SSR引物构建其DNA指纹图谱,并分析其遗传相似性。【结果】24对引物在19份粳稻品种中共检测到99个等位基因,每对SSR引物检测到等位基因1~7个,平均为4.1个。筛选获得能完全区分19份粳稻材料的4对核心引物（RM190、RM18、RM297、RM5414）,其在19份粳稻中可扩增获得22个多态性片段;以RM190和RM18区分鉴别粳稻材料的能力最强,可以区别鉴定6个粳稻品种,RM297和RM5414仅能鉴别2个粳稻品种,RM297能鉴别常农粳5号和宁9103,RM5414能区分南粳47和常粳10-9。19份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.408~0.857,平均为0.605,遗传相似系数在0.500~0.700的材料占81.87%。UPGMA聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.550处,19份粳稻材料可聚为两大类群;在遗传相似系数0.620和0.570处,两大类群均可分为两个亚群。【结论】太湖地区常规粳稻品种遗传背景相似度高,遗传多样性不够丰富,有待进一步加强引进和利用新的基因资源,创新水稻育种材料。 展开更多
关键词 常规粳稻 dna指纹构图谱 遗传相似性 太湖地区
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