清肺排毒汤干预新冠肺炎细胞因子风暴机制的网络药理学研究 被引量：22

1

作者 周梦琪 杨璐平 +5 位作者 马浩洁 程翠翠 张宇昕 张锦坤 盖聪 孙红梅 《海南医学院学报》 CAS 2020年第10期721-729,共9页

目的:通过网络药理学从细胞因子风暴角度探讨清肺排毒汤治疗新型冠状病毒肺炎的可能机制。方法:利用TCMSP、SymMap数据库筛选出清肺排毒汤的活性成分及靶标;通过GeneCards数据库筛选新冠肺炎的预测靶点;将两者靶点进行映射;利用STRING... 目的:通过网络药理学从细胞因子风暴角度探讨清肺排毒汤治疗新型冠状病毒肺炎的可能机制。方法:利用TCMSP、SymMap数据库筛选出清肺排毒汤的活性成分及靶标;通过GeneCards数据库筛选新冠肺炎的预测靶点;将两者靶点进行映射;利用STRING数据库和Cytoscape3.7.2软件构建药物-活性成分-靶点网络图并筛选出核心成分及靶点;再通过OmicShare云平台、David分别进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果:共获得52个清肺排毒汤治疗新冠肺炎的潜在靶点,17个与炎症相关的核心靶点,主要包含有IL、IFN、TNF等细胞因子和趋化因子,和26个核心成分,包括槲皮素、木犀草素、山奈酚、柚皮素和汉黄芩素等;GO富集结果中与炎症相关的生物过程224条,分子功能15条,细胞组成33条;KEGG富集结果中与炎症相关的信号通路5条,包括TNF信号通路、NOD样受体信号通路、Toll样受体信号通路、MAPK信号通路和细胞因子受体相互作用。结论:清肺排毒汤通过多成分作用于多靶点、多通路,达到抑制细胞因子风暴,从而治疗新冠肺炎的作用。 展开更多

关键词 清肺排毒汤 新冠肺炎 细胞因子风暴 网络药理学 核心靶点

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生态保护地空间重叠与发展冲突问题研究 被引量：17

2

作者 张丽荣 孟锐 +2 位作者 潘哲 郑姚闽 曾维华 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期1351-1360,共10页

不同类型生态保护地的空间用地冲突问题已成为国家生态保护地体系管理面临的共性问题,是国家公园体制建设必须面对的核心问题之一。分析了我国主要类型生态保护地的发展、功能分类及空间用地冲突现状,结合案例地区对承载不同功能的生态... 不同类型生态保护地的空间用地冲突问题已成为国家生态保护地体系管理面临的共性问题,是国家公园体制建设必须面对的核心问题之一。分析了我国主要类型生态保护地的发展、功能分类及空间用地冲突现状,结合案例地区对承载不同功能的生态保护地空间发展冲突分析,提出以"核心目标协同管理"为基础框架的多类型生态保护地精细管控体系和管理对策建议,为科学开展全国自然保护区"绿盾行动"专项执法检查、完善国家公园管理体制建设提供参考。 展开更多

关键词 生态保护地 空间 土地利用 冲突 核心目标 对策

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基于UPLC-Q-TOF-MS/MS技术的经典名方黄连汤化学成分鉴定及网络药理学研究 被引量：10

3

作者 王晓丽 彭梅梅 +6 位作者 陈琪 梅茜 何天雨 候金才 郭勇 陆兔林 毛春芹 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1249-1263,共15页

基于UPLC-Q-TOF-MS/MS技术鉴定经典名方黄连汤中的化学成分。采用Agilent ZORBAX Extend-C_(18)色谱柱(2.1 mm×100 mm,1.8μm),以0.1%甲酸水溶液(A)-乙腈(B)为流动相进行梯度洗脱,流速0.3 mL·min^(-1),柱温35℃,质谱采用电喷... 基于UPLC-Q-TOF-MS/MS技术鉴定经典名方黄连汤中的化学成分。采用Agilent ZORBAX Extend-C_(18)色谱柱(2.1 mm×100 mm,1.8μm),以0.1%甲酸水溶液(A)-乙腈(B)为流动相进行梯度洗脱,流速0.3 mL·min^(-1),柱温35℃,质谱采用电喷离子源(ESI)正、负离子模式,扫描范围m/z 100~1500条件下采集多级质谱碎片信息。通过高分辨质谱数据分析,结合参考文献数据以及对照品确认,共鉴别出134个化学成分,包括生物碱类12个、黄酮类23个、萜类及其皂苷类22个、酚类12个、香豆素类7个、氨基酸类12个、有机酸类23个及其他类化合物23个,并对化合物的药材来源进行了归属。基于前期已有的研究,选取7个成分作为指标性成分,结合网络药理学研究分析方法,通过STRING 11.0数据库,获得交集靶点蛋白与蛋白互作(PPI)的网络信息,并筛选药效作用的20个核心靶点。该研究成功采用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术对经典名方黄连汤化学成分进行全面分析鉴定,并结合网络药理学探讨其发挥药效的核心靶点,为阐明黄连汤药效物质基础和质量控制奠定基础。 展开更多

关键词 经典名方 黄连汤 UPLC-Q-TOF-MS/MS 网络药理学 化学成分 基准样品 核心靶点

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基于网络药理学及体外实验验证研究茯苓-白术药对治疗胃癌的作用机制 被引量：10

4

作者 宋思源 舒鹏 《世界中医药》 CAS 2022年第20期2836-2841,共6页

目的:基于网络药理学及实验验证,探讨茯苓-白术药对治疗胃癌的作用机制。方法:根据口服生物利用度和类药性,在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选茯苓-白术药对活性成分,借助Swiss Target Prediction数据库,预测茯苓-白术药对... 目的:基于网络药理学及实验验证,探讨茯苓-白术药对治疗胃癌的作用机制。方法:根据口服生物利用度和类药性,在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选茯苓-白术药对活性成分,借助Swiss Target Prediction数据库,预测茯苓-白术药对活性成分的潜在靶点。在疾病相关基因数据库(DisGeNET)检索胃癌相关靶点,将2个靶点集导入Cytoscape软件做交集,通过筛选拓扑特征值获取茯苓-白术药对治疗胃癌的核心靶点集,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。并进行基因本体(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后,通过体外实验对有效靶点及通路进行验证。结果:茯苓-白术药对含有36个有效活性成分,PPI网络关键靶点主要为MAPK3、PTGS2、EGFR、MAPK8、MAPK14、PPARG、ESR1等。预测茯苓-白术药对活性成分通过“Viral carcinogenesis”“PI3K-AKT signaling pathway”“Proteoglycans in cancer”等信号通路发挥作用。结论:茯苓-白术药对通过多成分、多靶点、多途径治疗胃癌,可通过靶向于PI3K-AKT信号通路及促分裂原活化的蛋白激酶3蛋白表达参与细胞增殖、侵袭,为进一步研究茯苓-白术药对治疗胃癌奠定了坚实基础。 展开更多

关键词 茯苓 白术 网络药理学 胃癌 富集分析 作用机制 核心靶点

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基于网络药理学和分子对接探讨人参-红景天治疗心肌缺血/再灌注损伤的作用机制 被引量：7

5

作者 赵倩琳 赖颖蓉 姜丽红 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期970-978,共9页

目的采用网络药理学方法、分子对接技术及实验研究,探究人参-红景天治疗心肌缺血/再灌注损伤(myocardial ischemia-reperfusion injury,MIRI)的作用靶点及机制。方法通过TCMSP数据库及文献补充筛选人参-红景天的有效活性成分及靶点,检索... 目的采用网络药理学方法、分子对接技术及实验研究,探究人参-红景天治疗心肌缺血/再灌注损伤(myocardial ischemia-reperfusion injury,MIRI)的作用靶点及机制。方法通过TCMSP数据库及文献补充筛选人参-红景天的有效活性成分及靶点,检索GENECARDS、DISGENET、DRUGBANK数据库得到MIRI靶点,使用STRING数据库构造功能蛋白相互作用网络(PPI),筛出核心靶点;并选择DAVID数据库进行基因本体功能分析(GO)和KEGG信号通路富集分析;最后借助分子对接技术及实验研究进行初步验证。结果获得人参-红景天有效活性成分43种,潜在靶点348个,并发现IL-6、TNF-α、VEGFA等靶点与MIRI密切相关,主要涉及TNF、PI3K-Akt、HIF-1等信号通路。分子对接结果显示,豆甾醇、人参皂苷rh2及红景天苷与IL-6、TNF-α、Caspase-3等靶点均有较好的结合作用且匹配度高,其中结合性最好的是Caspase-3与人参皂苷rh2,实验研究结果显示,人参-红景天可改善MIRI后心肌组织坏死,减轻心肌细胞水肿及血管充血情况,并降低MIRI大鼠中TNF-α及IL-6的表达水平。结论人参-红景天可能通过豆甾醇、人参皂苷rh2及红景天苷来调控IL-6、TNF-α、Caspase-3等多个靶点,抑制炎症及氧化应激反应,减轻心肌细胞损伤,发挥对MIRI的治疗作用。 展开更多

关键词 人参-红景天 心肌缺血/再灌注损伤 网络药理学 分子对接 核心靶点 信号通路

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《中医方剂大辞典》中消渴病方剂“核心药物-作用靶点”关联性挖掘研究 被引量：10

6

作者 王波 周荣荣 唐仕欢 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第19期3919-3926,共8页

基于《中医方剂大辞典》数据库,应用中医传承辅助平台挖掘消渴病方高频药物,通过关联规则和聚类分析挖掘其核心药物及其组合;基于整合药理学平台挖掘药物-疾病关系,构建"药物-化合物-靶点"网络并富集分析关键靶点的基因功能... 基于《中医方剂大辞典》数据库,应用中医传承辅助平台挖掘消渴病方高频药物,通过关联规则和聚类分析挖掘其核心药物及其组合;基于整合药理学平台挖掘药物-疾病关系,构建"药物-化合物-靶点"网络并富集分析关键靶点的基因功能、代谢通路,对其"核心药物-作用靶点"关联性进行挖掘分析,从而探讨其防治消渴病的分子机制。收集、整理并挖掘《中医方剂大辞典》中341首消渴病方剂,药物频次统计甘草最常用,其次是麦冬、茯苓、人参、黄连等,药性偏于寒、温、平,药味偏于辛、苦、酸,归肺、胃、脾等经;其中17味药关联密切,人参、麦冬、茯苓、甘草为核心中药,麦冬是黄连、天花粉与核心中药联系的关键节点;应用整合药理学平台分析获得"人参、茯苓、甘草、麦冬"核心药物组合防治消渴病的10个关键核心靶点,包括已知疾病靶点(PLCD1,PIK3R1,ENPP1)、潜在药物靶点(GNB1,ADCY1,AKT1,RAC1,PRKAA1,RHOA)、共同靶点(GCK)。与"麦冬、黄连、天花粉"药物组合存在7个相同靶点(PLCD1,PIK3R1,ENPP1,ADCY1,AKT1,PRKAA1,GCK)。这些靶点基因功能主要定位于胞质液、质膜等,参与三磷酸腺苷结合、蛋白质结合、血小板活化等;主要参与内分泌系统、信号转导、趋化因子信号通路、癌症通路等代谢通路,推测这些基因与消渴病(糖尿病)有潜在的关联关系。该研究应用中医传承辅助平台与整合药理学平台分析消渴病方剂的组方规律,挖掘获得其"核心药物-作用靶点"的关联性,为中医方剂防治消渴病的方剂筛选及其开发提供了依据和借鉴。 展开更多

关键词 中医方剂大辞典 消渴病 中医传承辅助平台 整合药理学 核心药物 作用靶点

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中国BIM分期目标与标准体系 被引量：8

7

作者 黄强 《时代建筑》 2013年第2期22-25,共4页

文章通过分析美国、英国及澳大利亚等国家推动与应用BIM技术的现状,总结了BIM技术包含的六大核心内容;并针对目前BIM技术发展亟需解决的共同问题,结合中国国情,提出了中国BIM分期目标及标准体系。

关键词 BIM 核心技术 分期目标 标准体系

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基于网络药理学研究蒲地蓝消炎口服液的药理作用分子机制及与疾病的关系 被引量：6

8

作者 张伟 潘梦瑾 +3 位作者 郎靖 时艳平 郭劲松 张胜安 《新中医》 CAS 2022年第8期1-9,共9页

目的:基于网络药理学研究蒲地蓝消炎口服液的药理作用分子机制及与疾病的关系。方法:通过已发表的文献查找蒲地蓝消炎口服液的化学成分,利用SwissADEM网站对有效成分进行筛选,在Swiss Target Prediction网站中找出概率>0的全部预测靶... 目的:基于网络药理学研究蒲地蓝消炎口服液的药理作用分子机制及与疾病的关系。方法:通过已发表的文献查找蒲地蓝消炎口服液的化学成分,利用SwissADEM网站对有效成分进行筛选,在Swiss Target Prediction网站中找出概率>0的全部预测靶点,在String网站中构建全部靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络,应用Cytoscape 3.8.0软件构建PPI可视化网络,通过CytoNCA APP进行集中性综合评价,筛选出蒲地蓝消炎口服液的核心靶点。对全部作用靶点进行富集分析,并对作用靶点进行疾病相关可视化分析。结果:筛选出42种活性成分,624个作用靶点,核心靶点包括:丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、白蛋白(ALB)、胱天蛋白酶3(CASP3),原癌基因、非受体酪氨酸激酶(SRC),表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、肿瘤坏死因子(TNF)。富集分析结果显示这些靶点主要参与的生物过程包括对氮化物的反应、对毒性物质的反应、跨突触信号传导、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联调控等。疾病相关可视化分析结果表明这些靶点主要富集于实验室糖尿病、神经系统疾病、肿瘤性疾病。结论:通过网络药理学筛选出蒲地蓝消炎口服液的核心靶点,发现该药可通过核心靶点,在抗炎、促进组织细胞分化、抗肿瘤等方面起到药理作用,对神经系统、肿瘤疾病等存在潜在的治疗作用。 展开更多

关键词 蒲地蓝消炎口服液 网络药理学 药理作用 核心靶点 疾病 可视化分析

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麻子仁丸治疗术后肠梗阻的网络药理研究 被引量：6

9

作者 钱嘉惠 周春宇 +4 位作者 杨成城 张少辉 张栋 张涛 马亦湘 《世界中医药》 CAS 2022年第7期935-940,共6页

目的:通过网络药理学预测麻子仁丸治疗术后肠梗阻(POI)作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集麻子仁丸中药化学成分,经口服生物利用度(OB)、类药性(DL)筛选得到药物... 目的:通过网络药理学预测麻子仁丸治疗术后肠梗阻(POI)作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集麻子仁丸中药化学成分,经口服生物利用度(OB)、类药性(DL)筛选得到药物的有效成分,并进行有效成分靶点预测;同时从GeneCards、OMIM、DisGeNet数据库检索POI相关靶点;取交集靶点后,使用Cytoscape 3.7.2软件构建成分-靶点互作网络;利用String数据库绘制靶点蛋白-靶点蛋白相互作用网络;并对核心靶点和核心成分分子对接;最后利用Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:本研究共收集到POI相关靶点405个,麻子仁丸活性成分140个,涉及治疗POI靶点75个;GO生物过程分析显示,涉及对无机物的反应、对有害物质的反应、药物细胞应答、细胞因子介导的信号传导途径、对脂多糖的反应、对氧化应激的反应、对细菌源分子的反应、激酶活性的正调控、转移酶活性的正调控等。KEGG分析结果显示,涉及PI3K-AKT信号通路、TNF通路、HIF-1通路、IL-17通路、ErbB通路等信号通路。结论:麻子仁丸可通过潜在的多途径、多靶点、多通路改善术后肠梗阻炎症反应、调节肠黏膜免疫及肠道微循环等。 展开更多

关键词 麻子仁丸 术后肠梗阻 网络药理学 分子对接 作用机制 核心靶点 通路分析 中药

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基于网络药理学探讨中药逍遥丸治疗失眠的药理机制

10

作者 王丹 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2024年第2期169-177,共9页

本文旨在基于网络药理学探讨逍遥丸(XYP)治疗失眠症的作用机制。通过TCMSP数据库对XYP的活性成分和靶点进行预测筛选,GeneCards数据库检索失眠的潜在靶点,分析了活性成分靶点与失眠相关靶点之间的重叠基因。我们利用Cytoscape软件和STR... 本文旨在基于网络药理学探讨逍遥丸(XYP)治疗失眠症的作用机制。通过TCMSP数据库对XYP的活性成分和靶点进行预测筛选,GeneCards数据库检索失眠的潜在靶点,分析了活性成分靶点与失眠相关靶点之间的重叠基因。我们利用Cytoscape软件和STRING构建了XYP的活性组分-靶点、靶点通路网络,在DAVID中进行GO和KEGG富集分析。从XYP中筛选出161个活性成分,并筛选出与活性成分相关的76个潜在的靶点,活性成分与失眠的重叠基因36个。网络药理学分析显示XYP组方中柴胡、当归和甘草可能对失眠有重要作用,机制可能涉及10个核心靶点(TNF、IL1B、CASP3、TP53、HSP90AA1、PPARG、SLC6A4、ESR1、GSK3B、AChE);主要涉及7个GO富集项和6个相关通路,包括神经活性配体受体相互作用通路、肿瘤通路、钙信号通路等。 展开更多

关键词 逍遥丸 失眠 网络药理学 核心靶点

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基于网络药理学方法、分子对接技术及动物实验验证探讨通塞颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重期的作用机制

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作者 付子坚 李建生 +3 位作者 田燕歌 赵鹏 燕苗苗 芦晓帆 《新中医》 CAS 2024年第6期170-185,共16页

目的:基于网络药理学方法、分子对接技术和动物实验验证探讨通塞颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)的作用机制。方法:(1)预测分析。通过中药系统药理学分析平台筛选通塞颗粒的活性成分及其对应靶点;利用人类基因(Genecards)... 目的:基于网络药理学方法、分子对接技术和动物实验验证探讨通塞颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)的作用机制。方法:(1)预测分析。通过中药系统药理学分析平台筛选通塞颗粒的活性成分及其对应靶点;利用人类基因(Genecards)、在线人类孟德尔遗传数据系统(OMIM)等数据库检索AECOPD疾病基因;绘制韦恩图并获取药物-疾病共同靶点;构建通塞颗粒活性成分-靶点网络图和蛋白质相互作用网络图,根据网络关系筛选核心靶点;借助R语言软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用AutoDockTool 1.5.6软件对通塞颗粒关键活性成分和核心靶点进行分子对接。(2)实验验证。随机将50只SD大鼠分为对照组、模型组、中药组、西药组、联合组各10只。除对照组外,其余各组均构建AECOPD大鼠模型,并于急性加重前2 d及其后4 d予药物灌胃治疗。治疗结束后检测各组大鼠的肺功能指标[0.3 s用力呼气容积(FEV_(0.3))、用力肺活量(FVC)、0.3 s用力呼气容积与用力肺活量的比值(FEV_(0.3)/FVC)、呼气流量峰值(PEF)],检测血清肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-17含量,通过苏木精-伊红染色法(HE)观察气道与肺组织的病理改变,采用免疫印迹法和酶联免疫吸附测定法初步验证网络药理学的预测结果。结果:通塞颗粒治疗AECOPD的关键活性成分为槲皮素、芹黄素、木犀草素、山奈酚、β-谷甾醇,主要作用于肿瘤抑制蛋白53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)等核心靶点。GO富集分析和KEGG通路富集分析结果表明,通塞颗粒治疗AECOPD与TNF、IL-17等信号通路干预氧化应激、减少细胞凋亡、抑制炎症反应有关。分子对接结果显示,通塞颗粒的关键活性成分与治疗AECOPD的核心靶点均有较好的结合活性。动物实验研究结果显示,模型组FVC、FEV_(0.3)、FEV_(0.3)/FVC、PEF值均较 展开更多

关键词 慢性阻塞性肺疾病急性加重期 通塞颗粒 网络药理学 分子对接技术 核心靶点 信号通路

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清胰汤治疗胰腺炎的网络药理学研究 被引量：4

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作者 沈丽 闵琼 +1 位作者 卞艳芳 王静 《中国医药导刊》 2022年第1期68-75,共8页

目的:基于网络药理学的方法探讨清胰汤治疗胰腺炎(pancreatitis)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)及中药整合药理学研究平台(TCMIP)检索相关文献,获取清胰汤所含中药的主要化学成分,收集其相对应的靶点;结合Cytoscape ... 目的:基于网络药理学的方法探讨清胰汤治疗胰腺炎(pancreatitis)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)及中药整合药理学研究平台(TCMIP)检索相关文献,获取清胰汤所含中药的主要化学成分,收集其相对应的靶点;结合Cytoscape 3.8.0构建有效成分-核心靶点网络,靶标蛋白相互作用(PPI)网络。利用Bioconductor中的R包对核心靶标进行GO富集和KEGG通路分析。结果:共获得清胰汤药物化学成分105个,靶点250个;获得疾病靶点289个,其中核心靶标25个;核心蛋白涉及EGFR、AKT1、IL6等,通路主要为PI3K-Akt、AGE-RAGE、HIF-1等炎症通路和肿瘤蛋白多糖、结直肠癌、膀胱癌等癌症通路;处方中关键的药物是延胡索、大黄、白芍、柴胡与黄芩,与靶点关系最紧密的成分为槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、汉黄芩素、金合欢素、黄芩素和芦荟大黄素。结论:本研究初步展示了清胰汤治疗胰腺炎的多成分、多靶点、多通路的作用机制,为后期药物分离纯化及药理研究提供了基础,筛选出的作用靶点和通路对于诊断和治疗胰腺炎有一定的参考价值。同时提示对癌症的治疗可以借鉴清胰汤的治疗思路。 展开更多

关键词 清胰汤 胰腺炎 网络药理学 核心靶点

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基于整合药理学技术探讨养血安胎方改善复发性流产血栓前状态的分子作用机制 被引量：5

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作者 贡磊磊 唐红波 +7 位作者 姚伟洁 李心蕾 马小磊 袁偲偲 高宏杰 赵静霞 冯欣 许海玉 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第24期23-29,共7页

目的:基于中医药整合药理学研究平台V2.0(TCMIP V2.0)探讨养血安胎方治疗复发性流产血栓前状态(RSAPTS)的分子机制。方法:通过TCMIP V2.0收集养血安胎方中药物化学成分及药物靶标,利用TCMIP V2.0收集RSA-PTS疾病靶标信息,并借助在线人... 目的:基于中医药整合药理学研究平台V2.0(TCMIP V2.0)探讨养血安胎方治疗复发性流产血栓前状态(RSAPTS)的分子机制。方法:通过TCMIP V2.0收集养血安胎方中药物化学成分及药物靶标,利用TCMIP V2.0收集RSA-PTS疾病靶标信息,并借助在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库补充和完善疾病靶标信息。构建药物与疾病核心靶标网络,并对核心靶标进行生物过程分析和通路富集分析,构建"中药-成分-靶标-通路"多维网络,对网络中主要化学成分进行了吸收、分配、代谢、排泄和毒性(ADMET)水平分析。结果:共收集养血安胎方中8味中药的310个化学成分和975个靶标信息,并获得了143个疾病靶标,药物和疾病靶标互作关系分析获得243个核心靶标,对前100位核心靶标分析结果显示,这些靶标主要作用于血液凝固、血小板活化、血管形成正调控、血小板聚集的调节和血管形成等与血栓形成相关的生物过程。通路分析显示这些靶标主要富集于补体与凝血级联反应、雌激素信号通路、血小板活化和甲状腺激素信号通路等通路。多维网络分析结合ADMET水平显示,养血安胎方中的益母草碱、儿茶酚、香草醛等14个成分可能通过影响凝血因子Ⅱ(F2),纤维蛋白溶酶原(PLG)和雌激素受体1(ESR1)来参与补体与凝血级联反应、血小板活化、甲状腺激素信号通路等,进而发挥对RSA-PTS的治疗作用。结论:养血安胎方中主要化学成分可能通过调节补体与凝血级联反应、血液凝固和血小板活化等生物过程来改善RSA-PTS。 展开更多

关键词 养血安胎方 整合药理学 复发性流产(RSA) 血栓前状态(PTS) 分子机制 核心靶标 多维网络

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基于网络药理学、分子对接探讨强心汤治疗慢性心力衰竭的潜在作用机制

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作者 毛美玲 卢健棋 +7 位作者 谢丽钰 庞延 张鼎 石炜琦 刘水花 蔡宗余 张诗雨 黄敏 《中医杂志》 CSCD 北大核心 2023年第20期2132-2137,共6页

目的基于网络药理学、分子对接的方式揭示强心汤治疗慢性心力衰竭的作用靶点和分子机制。方法从TCMSP数据库检索强心汤的活性成分,应用GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank数据库筛选慢性心力衰竭靶点,取交集获得强心汤治疗慢性... 目的基于网络药理学、分子对接的方式揭示强心汤治疗慢性心力衰竭的作用靶点和分子机制。方法从TCMSP数据库检索强心汤的活性成分,应用GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank数据库筛选慢性心力衰竭靶点,取交集获得强心汤治疗慢性心力衰竭的交集靶点。采用STRING平台构建蛋白互作网络(PPI),Cytoscape 3.8.0软件网络拓扑计算筛选核心靶点,R 4.2.3进行GO富集分析及KEGG通路富集分析,构建“活性成分-靶点”网络。采用AutoDock 1.5.7进行分子对接预测活性成分和核心靶点的结合性能。结果筛选出强心汤治疗慢性心力衰竭的交集靶点75个,其中核心靶点为雌激素受体1(ESR1,度值=7)、核受体辅激活因子1(NCOA1,度值=8)、糖皮质激素受体(NR3C1,度值=7)、核受体辅激活因子2(NCOA2,度值=7)。GO富集分析结果显示,分子功能中P值最小的前3项有G蛋白偶联胺受体活性、突触后神经递质受体活性、神经递质受体活性(P<0.01);生物过程中P值最小的前3项有腺苷酸环化酶激活肾上腺素受体信号通路、肾上腺素受体信号通路、腺苷酸环化酶调节G蛋白偶联受体信号通路(P<0.01);细胞组成中P值最小的前3项为突触后膜、突触膜、突触前膜的组成部分(P<0.01)。KEGG富集分析显示,关键信号通路前5位的为神经活性配体-受体的相互作用、钙信号通路、多巴胺能突触、可卡因成瘾、环状磷酸鸟苷-蛋白激酶G(cGMP-PKG)信号通路。分子对接结果显示,木犀草素、异黄酮与4个核心靶点(ESR1、NCOA1、NR3C1、NCOA2)的结合能更低,结构更稳定。结论强心汤治疗慢性心力衰竭与神经活性配体-受体的相互作用、钙信号通路、多巴胺能突触、化学致癌-受体激活、cGMP-PKG信号通路、脂质和动脉粥样硬化、cAMP信号通路等通路相关,木犀草素、异黄酮可能是其治疗慢性心力衰竭的核心活性化合物。 展开更多

关键词 慢性心力衰竭 强心汤 网络药理学 分子对接 核心靶点

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基于TCGA数据库的扶正消积进展方抑制结直肠癌肝转移机制网络药理学研究

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作者 李琼 陈敬贤 +9 位作者 武渊 吕玲玲 应海峰 朱文华 徐佳悦 阮铭 郭元彪 朱伟荣 殷世鹏 郑岚 《甘肃中医药大学学报》 2023年第3期1-11,共11页

目的基于癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库,采用网络药理学的方法探究扶正消积进展方抑制结直肠癌肝转移的作用机制,为扶正消积进展方进一步的临床应用及转化提供依据。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中草药数据库(TCM... 目的基于癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库,采用网络药理学的方法探究扶正消积进展方抑制结直肠癌肝转移的作用机制,为扶正消积进展方进一步的临床应用及转化提供依据。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中草药数据库(TCMID)筛选药物的有效成分,采用BATMAN数据库预测有效成分的目标靶点,利用TCGA数据库及R语言Mfuzz包预测、筛选结直肠癌肝转移的疾病靶点,药物有效成分的目标靶点与疾病靶点相交获得交集靶点;对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过STRING10.0数据库、Cytoscape3.7.2软件对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建,进而筛选出核心靶点;采用Cytoscape3.7.2的“Merge”功能构建“药物-有效成分-靶点-作用通路”网络图。结果共筛选获得扶正消积进展方有效成分282个,交集靶标152个;涉及13类生物功能,139个分子功能,80个细胞功能;通过PPI网络发掘出OXTR、GNA15、F2、COX5A、COX5B、ATP5B、COX4I1、COX7C、COX7B、ATP5A1等10个核心靶点,KEGG信号通路主要富集在多种神经退行性变的途径、神经活性配体受体相互作用、钙信号通路等方面。结论扶正消积进展方可通过多种有效成分,多途径、多靶点抑制结直肠癌肝转移。 展开更多

关键词 扶正消积进展方 结直肠癌肝转移 网络药理学 癌症基因组图谱计划数据库 有效成分 核心靶点 信号通路

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基于网络药理学的积雪草酸治疗IA1期宫颈癌治疗机制的研究

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作者 张军丹 秦海霞 +1 位作者 张运峰 李华伟 《唐山师范学院学报》 2023年第6期60-64,共5页

通过网络药理学方法筛选获得积雪草酸与IA1期宫颈癌的交集靶点,分析GO功能和信号通路,经拓扑学筛选核心靶点,进行分子对接验证。结果表明,积雪草酸与IA1期宫颈癌有60个交集靶点,涉及101项GO功能和30条KEGG信号通路,确定了4个核心靶点(I... 通过网络药理学方法筛选获得积雪草酸与IA1期宫颈癌的交集靶点,分析GO功能和信号通路,经拓扑学筛选核心靶点,进行分子对接验证。结果表明,积雪草酸与IA1期宫颈癌有60个交集靶点,涉及101项GO功能和30条KEGG信号通路,确定了4个核心靶点(IL1B、CXCL8、CCL2和TLR4),分子对接验证结果显示积雪草酸与核心靶点结合稳定。 展开更多

关键词 积雪草酸 宫颈癌 网络药理学 核心靶点

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创伤后应激障碍物理治疗潜在脑区靶点的研究进展

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作者 刘斌 陈晨 +4 位作者 宋磊 马续龙 高幸 李西萍 杨群 《空军军医大学学报》 CAS 2023年第11期1118-1122,1127,共6页

创伤后应激障碍(PTSD)是一种严重威胁个体健康和生存的精神疾病,大量研究发现特定大脑区域的状态异常是导致PTSD核心症状的重要原因。这些状态异常的脑区中,既包括功能状态异常的脑区如杏仁核,也包括连接状态异常的脑区如腹内侧前额叶... 创伤后应激障碍(PTSD)是一种严重威胁个体健康和生存的精神疾病,大量研究发现特定大脑区域的状态异常是导致PTSD核心症状的重要原因。这些状态异常的脑区中,既包括功能状态异常的脑区如杏仁核,也包括连接状态异常的脑区如腹内侧前额叶皮质。由于物理治疗可以作用于特定大脑区域并引起其功能状态或连接状态改变,因此可将PTSD患者状态异常的脑区作为物理治疗PTSD核心症状的潜在脑区靶点。目前,一些脑区靶点已被应用到PTSD的物理治疗如背外侧前额叶皮质,一些仍然处于理论研究阶段如岛叶皮质。本文旨在总结与PTSD核心症状相关的功能异常或连接异常的脑区,为后续物理治疗PTSD提供可针对的脑区靶点。 展开更多

关键词 创伤后应激障碍 物理治疗 核心症状 靶点

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基于网络药理学探析大黄-附子药对治疗慢性肾衰竭的作用机制 被引量：3

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作者 林路洁 刘绍瑒 +4 位作者 彭希 杨珏 郝莉 刘思雨 刘芳 《中药与临床》 2021年第4期40-46,共7页

目的:运用网络药理学并结合分子对接技术研究大黄-附子药对(DF)治疗慢性肾衰竭(CRF)的作用机制,旨在为其作用机制研究及临床应用提供依据。方法:利用TCMSP检索大黄、附子活性成分,多个数据库预测并筛选成分靶点和疾病靶点;利用二者交集... 目的:运用网络药理学并结合分子对接技术研究大黄-附子药对(DF)治疗慢性肾衰竭(CRF)的作用机制,旨在为其作用机制研究及临床应用提供依据。方法:利用TCMSP检索大黄、附子活性成分,多个数据库预测并筛选成分靶点和疾病靶点;利用二者交集靶点输入STRING、Cytoscape v3.7.1中处理获得核心靶点及其蛋白互作网络;在Metascape、KOBAS、David中获取GO和富集通路;运用Autodock4.2.6将预测成分及大黄附子中已知活性成分与Degree值排名前4核心靶点(PIK3CA、TP53、PIK3R1、MAPK)进行分子对接。结果:经筛选后,得到9个预测成分、27个核心靶点,20条GO富集条目和1条富集通路。核心靶点主要富集在与Hepatits B相关的PI3K-AKT、MAPK、P53等信号通路上。与其他3组数据相比,靶点TP53与有效成分结合均较良好。结论:有效成分与核心靶点结合均较为良好,体现了中药多成分、共作用的特性。DF可能通过抑制P53、MAPKs、活化PI3K-AKT,参与NF-κB等多条信号通路共同发挥药效,主要与抗氧化应激、抗炎及减少肾小管细胞凋亡有关。 展开更多

关键词 大黄—附子药对 慢性肾衰竭 核心靶点 数据库 分子对接 作用机制 开放科学(资源服务)标识码(OSID)

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基于网络药理学和分子对接的高根二醇抗溃疡性结肠炎的作用机制研究 被引量：1

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作者 古亮 兰媛 欧阳婷 《广东化工》 CAS 2022年第4期79-81,62,共4页

运用网络药理学研究方法,对高根二醇作用潜在靶点与机制进行整合与分析,探究高根二醇抗溃疡性结肠炎(UC)作用机制。利用PharmMapper、uniprot对筛选出高根二醇的224个作用靶点,利用OMIM、Genecards数据库检索并筛选出608个疾病作用靶点... 运用网络药理学研究方法,对高根二醇作用潜在靶点与机制进行整合与分析,探究高根二醇抗溃疡性结肠炎(UC)作用机制。利用PharmMapper、uniprot对筛选出高根二醇的224个作用靶点,利用OMIM、Genecards数据库检索并筛选出608个疾病作用靶点,整合筛选出高根二醇和溃疡性结肠炎的共同靶点48个。使用Cytoscape 3.7.2软件,构建"成分-靶点-疾病"网络图,再利用STRING、Cytoscape构建PPI网络,筛选出核心靶点,并进行关键靶基因GO与KEGG功能富集分析。根据网络药理学预测的靶点,选择EFGR、IGF1及IL2进行分子对接。本实验初步揭示出高根二醇可能通过抑制炎症反应、调节免疫功能的途径治疗UC。 展开更多

关键词 高根二醇 网络药理学 分子对接 成分-靶点-疾病网络 核心靶点

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基于网络药理学探讨复方茵丹汤治疗淤胆型肝炎的作用机制 被引量：2

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作者 徐萌 孙凤霞 李晓玲 《世界中医药》 CAS 2021年第15期2266-2274,共9页

目的:通过中药复方网络药理学对复方茵丹汤治疗淤胆型肝炎的作用机制进行系统分析。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)筛选复方茵丹汤中有效活性成分及其作用靶点;运用OMIM数据库以及GeneCards... 目的:通过中药复方网络药理学对复方茵丹汤治疗淤胆型肝炎的作用机制进行系统分析。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)筛选复方茵丹汤中有效活性成分及其作用靶点;运用OMIM数据库以及GeneCards数据库获取淤胆型肝炎疾病相关靶点;将药物与疾病靶点取交集,获得潜在靶点;通过DisGenet数据库分析潜在靶点的蛋白类型;运用Cytoscape软件构建中药复方调控网络;通过STRING数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并带入Cytoscape软件进行拓扑分析;采用R软件进行潜在靶点的基因本体(GO)富集分析以及富京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:复方茵丹汤中有效活性成分所对应的靶点与淤胆型肝炎靶点取交集,共获得了83个潜在靶点;通过复方调控网络构建,预测茵陈、大黄、栀子等药物可能通过NOS2、ESR1、DPP4等靶点对淤胆型肝炎的治疗起到一定作用;通过PPI网络及拓扑分析,获得白细胞介素6、蛋白激酶、血管内皮生长因子A等11个核心靶点,可能在复方茵丹汤治疗淤胆型肝炎中起主要作用;通过GO富集分析结果,预测潜在靶点在淤胆型肝炎的肝脏损伤、炎症反应、细胞代谢功能以及免疫功能中发挥作用;通过KEGG富集分析结果,预测Thl7细胞分化通路、HIF-1信号通路可调节机体的代谢应激,抑制炎症介质。结论:复方茵丹汤对淤胆型肝炎的作用机制可能与其109个有效活性成分、11个核心靶点以及Thl7细胞分化、HIF-1等信号通路有关。 展开更多

关键词 网络药理学 复方茵丹汤 淤胆型肝炎 作用机制 有效成分 核心靶点 信号通路

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