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高pH胁迫下拟南芥根转录组学与网络应答 被引量:6
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作者 穆阳杰 詹玉洁 +1 位作者 许卫锋 夏天雨 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期691-701,共11页
土壤碱化是影响作物产量的重要因素。为进一步了解植物应答土壤碱化的转录调控机制,利用转录组测序技术对正常pH(pH 6.0)和高pH(pH 8.0)条件下生长的拟南芥根进行全基因表达谱分析,共筛选出1129个差异表达基因。基因本体论GO(Gene Ontol... 土壤碱化是影响作物产量的重要因素。为进一步了解植物应答土壤碱化的转录调控机制,利用转录组测序技术对正常pH(pH 6.0)和高pH(pH 8.0)条件下生长的拟南芥根进行全基因表达谱分析,共筛选出1129个差异表达基因。基因本体论GO(Gene Ontology)功能注释显示,差异表达基因主要与胁迫应答、转录、细胞组织发生、运输、蛋白质代谢和信号转导等生物学过程相关。其中,参与离子运输、细胞壁合成、钙离子信号和植物激素等过程的基因表达量发生了显著性变化,暗示这些基因参与植物对高pH胁迫的响应。转录调控网络预测分析表明,花卉同源蛋白质2/乙烯反应元件结合蛋白AP2-EREBP(APETALA2/Ethylene-responsive element binding proteins)、髓母细胞瘤病毒致癌基因同源物MYB(Myeloblastosis viral oncogene homolog)、具有高度保守结构域的转录调控因子WRKY和无顶端分生组织,拟南芥转录激活因子NAC(No apical meristem,Arabidopsis transcription activation factor and Cup-shaped cotyledon)家族转录因子与高pH胁迫响应基因存在密切的转录调控关系。本研究为植物耐碱分子机理的解析和耐碱品种的培育提供了方向和依据。 展开更多
关键词 高pH胁迫 转录组 调控网络 离子运输 细胞壁合成 信号传导
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基于转录组测序分析扭果花旗杆抗旱的主要代谢途径 被引量:4
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作者 马薇 邹丽媛 +1 位作者 赵惠新 葛风伟 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第11期3548-3561,共14页
扭果花旗杆(Dontostemon elegans Maxim)是新疆达坂城荒漠地区广泛分布的旱生植物,在维持荒漠植被的稳定性中发挥重大作用。为了揭示干旱胁迫下扭果花旗杆整个基因组水平的表达特性,对25%PEG胁迫处理12 h、72 h的扭果花旗杆幼苗进行了... 扭果花旗杆(Dontostemon elegans Maxim)是新疆达坂城荒漠地区广泛分布的旱生植物,在维持荒漠植被的稳定性中发挥重大作用。为了揭示干旱胁迫下扭果花旗杆整个基因组水平的表达特性,对25%PEG胁迫处理12 h、72 h的扭果花旗杆幼苗进行了转录组测序分析。经拼接组装共获得64672 Unigene,平均长度为753 bp,N50长度为1527 bp。与七大数据库进行注释,共有48046条Unigene获得了基因注释,占总Unigene的74.29%。其中有29633条Unigene获得了GO注释。通过差异表达基因GO分析显示,608个差异基因主要涉及植物型细胞壁组织或生物发生、细胞壁组织结构成分等功能。KEGG pathway富集分析共有16742 Unigene参与了131个代谢通路,差异基因主要富集到了苯丙素生物合成,类胡萝卜素的生物合成,蜡质、角质的生物合成及二苯乙烯、二芳基庚烷和姜酚生物合成等代谢途径。从扭果花旗杆转录组筛选出来的上调基因多为植物细胞壁组成成分中木质素、纤维素、蜡质、角质、脱落酸等物质的生物合成相关基因。研究表明扭果花旗杆能够通过促进生物合成代谢途经和细胞壁构建途径提高干旱胁迫适应能力,本研究结果有助于揭示扭果花旗杆对干旱的应答机理,为下一步筛选和挖掘抗旱功能基因提供数据支持。 展开更多
关键词 扭果花旗杆 干旱胁迫 转录组 细胞壁合成
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水稻脆秆突变体bc16的鉴定和基因精细定位 被引量:5
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作者 舒亚洲 曾冬冬 +3 位作者 秦冉 金晓丽 郑希 石春海 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期345-355,共11页
脆秆突变体是一类研究植物机械强度的重要材料。利用EMS(甲基磺酸乙酯)诱变粳稻品种日本晴,筛选获得一个脆秆突变体,命名为bc16(brittle culm16)。与野生型植株相比,bc16茎秆、叶片和根明显变脆,而株高、穗粒数降低,穗长和主根长变短。... 脆秆突变体是一类研究植物机械强度的重要材料。利用EMS(甲基磺酸乙酯)诱变粳稻品种日本晴,筛选获得一个脆秆突变体,命名为bc16(brittle culm16)。与野生型植株相比,bc16茎秆、叶片和根明显变脆,而株高、穗粒数降低,穗长和主根长变短。茎秆细胞壁成分分析表明,bc16纤维素含量显著低于野生型植株,半纤维素含量则显著增加,而木质素含量差异不显著。突变体bc16薄壁细胞形状无规则、排列紊乱,表皮层下厚壁细胞次生壁和薄壁细胞壁变薄。遗传分析表明bc16突变体由隐性单基因控制,位于水稻第2染色体长臂端InDel标记2-F和2-H间66.6kb的区间内。该区间共有7个候选基因,其中Os02g0738900是bc3脆秆基因的等位基因。测序结果表明,bc16突变体中的Os02g0738900基因从ATG开始第5113位,在第13内含子近末端发生了T→A的置换,导致转录过程中该内含子末端6个核苷酸被剪切到mRNA中,最终导致翻译提前终止。实时荧光定量PCR结果表明Os02g0738900基因在bc16脆秆突变体根、茎、叶中的表达量降低。bc16基因可能通过调控厚壁组织次生细胞壁和薄壁细胞初生壁的合成来影响水稻茎秆机械强度。 展开更多
关键词 水稻 脆秆 基因定位 细胞壁合成
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Disruption of Cortical Microtubules by Overexpression of Green Fluorescent Protein-Tagged a-Tubulin 6 Causes a Marked Reduction in Cell Wall Synthesis 被引量:2
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作者 David H. Burk Ruiqin Zhong +1 位作者 W. Herbert Morrison III Zheng-Hua Ye 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2006年第1期85-98,共14页
It has been known that the transverse orientation of cortical microtubules (MTs) along the elongation axis is essential for normal cell morphogenesis, but whether cortical MTs are essential for normal cell wall synt... It has been known that the transverse orientation of cortical microtubules (MTs) along the elongation axis is essential for normal cell morphogenesis, but whether cortical MTs are essential for normal cell wall synthesis is still not clear. In the present study, we have investigated whether cortical MTs affect cell wall synthesis by direct alteration of the cortical MT organization in Arabidopsis thaliana. Disruption of the cortical MT organization by expression of an excess amount of green fluorescent protein-tagged a-tubulin 6 (GFP-TUA6) in transgenic Arabidopsis plants was found to cause a marked reduction in cell wall thickness and a de- crease in the cell wall sugars glucose and xylose. Concomitantly, the stem strength of the GFP-TUA6 overexpressors was markedly reduced compared with the wild type. In addition, expression of excess GFP- TUA6 results in an alteration in cell morphogenesis and a severe effect on plant growth and development. Together, these results suggest that the proper organization of cortical MTs is essential for the normal synthesis of plant cell walls. 展开更多
关键词 Arabidopsis thaliana cell elongation cell wall synthesis cortical microtubules microtubule organization.
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新型杀菌剂氟吗啉对黄瓜疫霉病菌细胞壁主要组分合成及分布的影响 被引量:3
5
作者 朱书生 刘西莉 +3 位作者 刘鹏飞 李健强 司乃国 王慧敏 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2007年第4期658-662,共5页
应用同位素示踪和组织特异性荧光染色等生物化学方法研究了新型杀菌剂氟吗啉对黄瓜疫霉病菌细胞壁主要组分合成及分布的影响.结果表明,氟吗啉对细胞壁的主要组成物质纤维素和非纤维素葡聚糖的合成没有抑制作用,但破坏细胞壁物质在菌丝... 应用同位素示踪和组织特异性荧光染色等生物化学方法研究了新型杀菌剂氟吗啉对黄瓜疫霉病菌细胞壁主要组分合成及分布的影响.结果表明,氟吗啉对细胞壁的主要组成物质纤维素和非纤维素葡聚糖的合成没有抑制作用,但破坏细胞壁物质在菌丝正确位置的形成和分布,扰乱菌丝的极性生长. 展开更多
关键词 氟吗啉 细胞壁合成 细胞极性 同位素示踪 荧光增白剂
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fv-gs6:一个与金针菇菌柄伸长相关的葡聚糖合酶基因 被引量:1
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作者 龙莹 严俊杰 +5 位作者 仝宗军 刘媛媛 苗娟 陶永新 江玉姬 谢宝贵 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2018年第6期698-704,共7页
根据金针菇(Flammulina velutipes)基因组及转录组数据,筛选得到1个β-1,6-葡聚糖合酶(β-1,6-glucan synthase)编码基因,命名为fv-gs6.该基因全长1 439 bp,含有9个外显子,8个内含子,编码339个氨基酸.多序列比对及系统进化分析结果表明:... 根据金针菇(Flammulina velutipes)基因组及转录组数据,筛选得到1个β-1,6-葡聚糖合酶(β-1,6-glucan synthase)编码基因,命名为fv-gs6.该基因全长1 439 bp,含有9个外显子,8个内含子,编码339个氨基酸.多序列比对及系统进化分析结果表明:fv-gs6编码蛋白(Fv-GS6)具有β-1,6-葡聚糖合酶的保守motif,且与担子菌的β-1,6-葡聚糖合酶聚在同一个分支.生物信息学分析表明:该蛋白具备信号肽、亚细胞定位于细胞外,属于分泌蛋白;推测Fv-GS6蛋白可能直接在细胞外催化β-1,6-葡聚糖的合成.通过qRT-PCR方法检测该基因在子实体不同发育时期的表达量,结果显示:fv-gs6在菌柄上高表达,且在伸长期菌柄表达量最高;其中,菌柄的伸长区段表达量是不伸长区段的5.42倍.根据β-1,6-葡聚糖合酶在真菌细胞壁合成中的功能,推测fv-gs6的高表达可能促进细胞壁合成,参与金针菇菌柄的伸长过程. 展开更多
关键词 金针菇 β-1 6-葡聚糖合酶 基因结构 细胞壁合成 菌柄伸长 差异表达
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金黄色葡萄球菌耐药机制及治疗药物
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作者 罗丹 马世伟 王哲 《国外医药(抗生素分册)》 CAS 2024年第1期1-11,共11页
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是引起局部化脓和心内膜炎等多种感染的重要人兽共患革兰阳性病原菌。其传播速度快,致病力强,且耐药性日益严重,给全球公共卫生安全和动物养殖业造成了巨大威胁。这对深入了解金黄色葡萄球菌耐药... 金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是引起局部化脓和心内膜炎等多种感染的重要人兽共患革兰阳性病原菌。其传播速度快,致病力强,且耐药性日益严重,给全球公共卫生安全和动物养殖业造成了巨大威胁。这对深入了解金黄色葡萄球菌耐药机制以及药物新靶点的开发提出了迫切需求。因此,本文对当前临床使用的抗生素的作用机制和耐药机理进行了综述,并特别关注了相关领域的最新研究进展,以期望为临床防治细菌耐药和新药研制提供新的视角和参考。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 耐药机制 蛋白质合成抑制剂 核酸合成抑制剂 细胞壁合成抑制剂
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高表达GFP-PBP1b融合蛋白的猪链球菌菌株的构建及PBP1b蛋白细胞定位的研究 被引量:1
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作者 武柳君 卫东 +3 位作者 高广娟 陈平 刘思国 张跃灵 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1101-1107,共7页
为鉴定猪链球菌(Streptococcus suis)A型青霉素结合蛋白PBP1b在S.suis中的细胞定位,本研究经PCR扩增S.suis pbp1b基因融合位点上下游序列UP和DN、强启动子Peno基因片段及绿色荧光蛋白(GFP)gfp基因片段,再通过重叠延伸PCR扩增构建融合片... 为鉴定猪链球菌(Streptococcus suis)A型青霉素结合蛋白PBP1b在S.suis中的细胞定位,本研究经PCR扩增S.suis pbp1b基因融合位点上下游序列UP和DN、强启动子Peno基因片段及绿色荧光蛋白(GFP)gfp基因片段,再通过重叠延伸PCR扩增构建融合片段UP-Peno-GFP-DN。利用同源重组的方法将UP-Peno-GFP-DN转化含反向筛选标记的PSS-pbp1b中间菌株,经含7%蔗糖的TSAS平板筛选,挑单菌落进行PCR及测序鉴定。PCR及测序鉴定结果显示,获得的重组菌株中Peno-gfp片段替换了PSS-pbp1b中的PSS片段,表明融合强启动子Peno、GFP及PBP1b(GFP-PBP1b)的重组菌株P-GFP-pbp1b正确构建。以S.suis 05ZYH33株和本实验室前期构建的GFP-pbp1b为对照,培养P-GFP-pbp1b菌株并测定OD600nm值,绘制各菌株的生长曲线;采用western blot检测P-GFP-pbp1b菌株中GFP-PBP1b融合蛋白的表达水平,并与GFP-pbp1b菌株进行比较;利用Alexa Fluor 633-WGA染色,经超高分辨显微镜观察GFP-pbp1b和P-GFP-pbp1b菌株形态及GFP-PBP1b融合蛋白在S.suis细胞中的定位。生长曲线结果显示,S.suis融合菌株GFP-pbp1b和P-GFP-pbp1b均正常生长;western blot结果显示,GFP-pbp1b和P-GFP-pbp1b菌株均能够表达GFP-PBP1b融合蛋白,但强启动子驱动的P-GFP-pbp1b菌株中GFP-PBP1b蛋白表达量较GFP-pbp1b菌株提高了6倍(P<0.01);超高分辨显微镜观察结果显示,GFP-pbp1b和P-GFP-pbp1b菌株形态均正常,GFP-pbp1b菌株中GFP荧光较弱,难以定位GFP-PBP1b,而P-GFP-pbp1b菌株中GFP荧光较强,能够明显观察到融合蛋白GFP-PBP1b定位在S.suis的细胞横隔和两极。本研究通过构建高表达GFP-PBP1b融合蛋白的P-GFP-pbp1b菌株首次观察到PBP1b在S.suis中的细胞定位,为进一步研究PBP1b在S.suis细胞壁肽聚糖合成中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 猪链球菌 荧光蛋白融合菌株 A型青霉素结合蛋白 PBP1b 细胞壁肽聚糖合成
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RNA干扰Fus3基因对二态性真菌马尔尼菲青霉菌的孢子形成和细胞壁组分合成功能的影响 被引量:1
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作者 王峰 董辉 +3 位作者 钱震 陶菊红 游松 任双喜 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期415-421,共7页
马尔尼菲青霉菌Penicillium marneffei是一种重要的条件致病真菌,可致艾滋病患者产生严重的系统性霉菌病并发症。基因组学的研究和RNA干扰技术,为马尔尼菲青霉菌致病基因和致病机制的深入探讨提供了可能。我们研究马尔尼菲青霉菌的一个... 马尔尼菲青霉菌Penicillium marneffei是一种重要的条件致病真菌,可致艾滋病患者产生严重的系统性霉菌病并发症。基因组学的研究和RNA干扰技术,为马尔尼菲青霉菌致病基因和致病机制的深入探讨提供了可能。我们研究马尔尼菲青霉菌的一个新基因Fus3,它是丝氨酸/苏氨酸-特异性激酶丝裂原活化蛋白激酶家族的成员。为了研究Fus3的功能,我们利用根癌农杆菌介导的双链RNA干扰技术构建了Fus3 RNA干扰菌株(Fus3-i)。RNA干扰的活性是由木糖诱导的启动子xylP控制的。Fus3基因活性下降后影响了马尔尼菲青霉菌生长,包括孢子的生成,细胞壁组分的合成。实验表明,Fus3基因对于马尔尼菲青霉菌细胞生长发育起着重要的调控作用,为研究真菌疾病提供了帮助。 展开更多
关键词 丝裂原活化蛋白激酶 双链RNA干扰 孢子生成 细胞壁合成 真菌疾病
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