期刊文献+
共找到24篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
棉花咖啡酸-O-甲基转移酶基因的克隆及特征分析 被引量:16
1
作者 倪志勇 吕萌 +3 位作者 李波 王娟 白岩 范玲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1117-1126,共10页
【目的】克隆棉花木质素合成关键酶基因GhCOMT1、GhCOMT2和GhCOMT3全长cDNA序列,分析其在不同组织部位的表达情况并进行原核表达研究。【方法】根据棉花纤维特异表达cDNA文库分析得到的EST序列设计引物,采用RT-PCR技术克隆基因,用生物... 【目的】克隆棉花木质素合成关键酶基因GhCOMT1、GhCOMT2和GhCOMT3全长cDNA序列,分析其在不同组织部位的表达情况并进行原核表达研究。【方法】根据棉花纤维特异表达cDNA文库分析得到的EST序列设计引物,采用RT-PCR技术克隆基因,用生物信息学方法对获得的cDNA序列及推定的氨基酸序列进行分析。采用半定量RT-PCR方法研究GhCOMT1、GhCOMT2和GhCOMT3在不同组织中的表达。构建了基因的原核表达载体,经酶切鉴定后转化到大肠杆菌BL21(DE3)中并诱导表达。【结果】从发育的棉花纤维中克隆了3个COMT基因cDNAs,GhCOMT1(GenBank登录号为FJ479708)、GhCOMT2(GenBank登录号为FJ479709)和GhCOMT3(GenBank登录号为FJ848869)分别具有1101bp、1098bp、1071bp的开放阅读框,各自编码366、365和356个氨基酸。GhCOMT1、GhCOMT2和GhCOMT3在棉花各个组织中都有表达,GhCOMT1和GhCOMT2在根部的表达量最高,GhCOMT3在茎中表达量最高。SDS-PAGE电泳分析表明,3个蛋白的最佳诱导表达条件均为0.2mmol·L-1IPTG在37℃下诱导6h。【结论】从棉花中克隆了3个木质素合成关键酶基因GhCOMT1、GhCOMT2和GhCOMT3,为进一步的生物学功能研究及其应用奠定了基础。 展开更多
关键词 棉花 咖啡酸-o-甲基转移酶基因 基因克隆 表达分析 原核表达
下载PDF
丹参咖啡酸-O-甲基转移酶基因(SmCOMT1)的克隆及其分析 被引量:10
2
作者 宋银 王东浩 +3 位作者 吴锦斌 周露 王国栋 王喆之 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期437-443,共7页
依据丹参转录组数据库得到的咖啡酸-O-甲基转移酶基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法从丹参分离得到一个新的COMT基因,命名为SmCOMT1(GenBank注册号为JF693491)。该基因cDNA全长1 158 bp,包含一个长为1 095 bp的开放阅读框,编码364... 依据丹参转录组数据库得到的咖啡酸-O-甲基转移酶基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法从丹参分离得到一个新的COMT基因,命名为SmCOMT1(GenBank注册号为JF693491)。该基因cDNA全长1 158 bp,包含一个长为1 095 bp的开放阅读框,编码364个氨基酸。SmCOMT1 gDNA序列长2 275 bp,包含4个外显子和3个内含子。序列分析结果表明,SmCOMT1编码的多肽具有COMT的序列保守元件,与同科植物罗勒COMT编码的多肽高度同源,同源性达到89%。系统进化树分析表明,SmCOMT1与双子叶植物的COMT亲缘关系较近。qRT-PCR结果表明,SmCOMT1基因在丹参不同组织器官中差异表达,其中茎中的表达量最高,并且其表达受茉莉酸甲酯和病原菌的诱导,显示SmCOMT1基因可能在植物防御反应中发挥作用。 展开更多
关键词 丹参 咖啡酸-o-甲基转移酶 基因克隆 qRT—PCR
下载PDF
当归咖啡酸-O-甲基转移酶基因克隆和序列分析 被引量:9
3
作者 雒军 王引权 +3 位作者 温随超 夏琦 荔淑楠 王振恒 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1180-1186,共7页
目的克隆当归Angelica sinensis咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferases,COMT)编码基因全长c DNA,并对序列进行生物信息学分析。方法提取当归叶片总RNA为c DNA合成模板,利用同源克隆结合c DNA末端快速扩增(RACE)技术克... 目的克隆当归Angelica sinensis咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferases,COMT)编码基因全长c DNA,并对序列进行生物信息学分析。方法提取当归叶片总RNA为c DNA合成模板,利用同源克隆结合c DNA末端快速扩增(RACE)技术克隆当归COMT全长c DNA,并利用NCBI、Ex PASy网站上的Blast N、Blast P、ORF Finder、Compute PI/Mw、Prot Scale、PROSITE、SWISS-MODEL等序列在线分析工具和MEGA、DNAMAN生物信息学软件对序列进行分析。结果获得COMT全长c DNA序列,并在Gen Bank注册(登录号KP188587)。序列分析表明,克隆的c DNA全长为1 436 bp,其中包括5’-UTR(76 bp)和3’-UTR(362 bp),含有1个1 098 bp的完整开放阅读框(opening reading frame,ORF),编码365个氨基酸的多肽链;预测蛋白质相对分子质量为40 230,理论等电点(p I)为5.43;无信号肽,具有典型的II型氧甲基转移酶结构域SAM_OMT_II。结论首次克隆当归COMT基因全长c DNA,为当归COMT基因功能研究和当归阿魏酸生物合成与调控的机制研究奠定基础。 展开更多
关键词 当归 咖啡酸-o-甲基转移酶 基因克隆 生物信息学分析 信号肽
原文传递
当归咖啡酸-O-甲基转移酶基因的克隆与表达分析 被引量:5
4
作者 张培 侯云龙 +5 位作者 苏敏 孙利 徐登封 宋涛 周璐恒 赵韶华 《中国野生植物资源》 CSCD 2021年第1期20-28,共9页
目的:为了研究当归阿魏酸生物合成途径的功能基因,从当归中克隆了一条当归咖啡酸-O-甲基转移酶基因(AsCOMT),进行生物信息学分析、基因表达模式分析及原核表达。方法:首先依据当归COMT基因的序列(GenBank注册号KP188587),利用PCR的方法... 目的:为了研究当归阿魏酸生物合成途径的功能基因,从当归中克隆了一条当归咖啡酸-O-甲基转移酶基因(AsCOMT),进行生物信息学分析、基因表达模式分析及原核表达。方法:首先依据当归COMT基因的序列(GenBank注册号KP188587),利用PCR的方法克隆该基因的cDNA全长。对AsCOMT基因进行实时荧光定量PCR分析。采用无缝克隆技术构建AsCOMT基因的原核表达载体,通过热击法转化大肠杆菌BL21(DE3)。进一步利用异丙基-β-D-硫代半乳糖(IPTG)诱导大肠杆菌表达重组蛋白,并筛选出最佳IPTG诱导表达条件。结果:AsCOMT基因的开放阅读框为1098 bp,编码365个氨基酸,蛋白分子量约为40.230 kDa,等电点为5.43。AsCOMT蛋白含有1个S-腺苷-L-甲硫氨酸结合位点,属于COMT蛋白家族成员。通过实时荧光定量表达分析表明,AsCOMT基因在当归的不同组织均有表达,根中表达量最高,其次是叶片,叶柄中表达量最低。原核表达载体pGEX-4T-3-AsCOMT在E.coli BL21(DE3)中大量表达当归AsCOMT蛋白,且经SDS-PAGE分析显示其相对分子质量约为40.23 kDa,其最优表达条件为25℃、1.0 mmol/L IPTG终浓度、诱导8 h,得到的当归AsCOMT蛋白主要以可溶性形式存在。结论:本研究成功克隆了AsCOMT基因,且该基因的表达具有组织特异性。构建的AsCOMT原核表达菌株在最适IPTG诱导表达条件下能大量表达当归COMT蛋白,为研究COMT基因在当归阿魏酸生物合成途径中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 当归 CoMT 荧光定量PCR 原核表达 最佳表达条件
下载PDF
刺葡萄愈伤组织褪黑素生物合成基因SNAT2、COMT3的克隆及其对光质的响应
5
作者 贺丽媛 赖恭梯 +5 位作者 李思雨 许恒 林俊璇 郭奥琳 赖钟雄 赖呈纯 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期569-578,共10页
5-羟色胺-N-乙酰基转移酶(serotonin N-acetyltransferase,SNAT)和咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)是植物褪黑素合成途径的关键酶,对褪黑素的生物合成有重要的调控作用.以刺葡萄愈伤组织为材料,分别克隆获... 5-羟色胺-N-乙酰基转移酶(serotonin N-acetyltransferase,SNAT)和咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)是植物褪黑素合成途径的关键酶,对褪黑素的生物合成有重要的调控作用.以刺葡萄愈伤组织为材料,分别克隆获得了VdSNAT2和VdCOMT3,对其生物信息学及启动子顺式作用元件进行预测,结合实时荧光定量PCR技术,分析不同光质处理下刺葡萄愈伤组织中褪黑素含量与VdSNAT2和VdCOMT3基因表达的相关性.结果表明,VdSNAT2和VdCOMT3基因ORF分别为549 bp和1158 bp,分别编码182和385个氨基酸,其编码蛋白前者为亲水蛋白,后者为疏水蛋白,亚细胞均定位于叶绿体;蛋白保守基序和进化树分析表明,刺葡萄VdSNAT2和VdCOMT3蛋白与葡萄的SNAT2和COMT3具有相同的保守基序,且两者进化相似、亲缘关系近.启动子顺式作用元件预测发现,VdSNAT2和VdCOMT3启动子序列中均有大量光响应等多种生物/非生物响应元件.qRT-PCR分析表明,光质显著影响VdSNAT2和VdCOMT3基因的表达,其中红光对刺葡萄愈伤组织中VdSNAT2和VdCOMT3基因表达的促进作用最为显著,与褪黑素含量具有正相关性,同时VdSNAT2和VdCOMT3基因对褪黑素的生物合成调控具有协同作用.本研究表明光质可以影响VdSNAT2和VdCOMT3基因的表达,从而定向调控刺葡萄愈伤组织褪黑素的生物合成.(图9表1参41) 展开更多
关键词 刺葡萄 愈伤组织 褪黑素 光质 5-羟色胺-N-乙酰基转移酶 咖啡酸-o-甲基转移酶
原文传递
葡萄COMT基因家族的鉴定与表达分析 被引量:2
6
作者 许雯雯 高换超 +3 位作者 韩菲菲 李凯薇 贾山毅 李桂荣 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期2061-2075,共15页
【目的】咖啡酸O-甲基转移酶(COMTs)是木质素合成过程中一种多功能酶,参与多种初生代谢和次生代谢途径,在植物木质素次生物质合成及植物抗逆胁迫反应中起着重要作用。旨在鉴定葡萄COMT基因家族成员,探究其对葡萄真菌病害胁迫的响应,为... 【目的】咖啡酸O-甲基转移酶(COMTs)是木质素合成过程中一种多功能酶,参与多种初生代谢和次生代谢途径,在植物木质素次生物质合成及植物抗逆胁迫反应中起着重要作用。旨在鉴定葡萄COMT基因家族成员,探究其对葡萄真菌病害胁迫的响应,为葡萄抗病育种提供基因资源。【方法】基于拟南芥COMT基因搜索葡萄COMT基因家族,运用生物信息学方法研究葡萄COMT蛋白质理化性质、基因染色体定位、motif分析和启动子顺式作用元件等;利用荧光定量PCR法分析COMT基因在抗病品种摩尔多瓦和感病品种夏黑葡萄上接种霜霉病的表达模式。【结果】从葡萄中鉴定出26个COMT基因,主要位于第10、12和15号染色体上;蛋白质分子质量差异较大,属于不稳定的两性蛋白;亚细胞定位显示其蛋白主要位于细胞质和细胞外。从构建的系统进化树中发现,该家族分为Ⅰ和Ⅱ2个亚组,在进化过程中比较保守,与拟南芥和水稻亲缘关系较近。启动子分析表明,葡萄COMT基因启动子包含丰富的植物激素响应和胁迫响应的顺式元件,接种葡萄霜霉病后,在抗病品种摩尔多瓦中,除COMT2基因外其余25条COMT基因在接种24 h后均显著上调,而在感病品种夏黑中只有63%的COMT基因出现显著上调,且抗病品种的表达量显著高于感病品种,其中以VvCOMT1、5、6、7、8、9和19上调最为显著。【结论】共鉴定了26个葡萄COMT基因家族成员,同时发现COMT基因在葡萄抗病品种中受霜霉病的强烈诱导,表明木质素在葡萄抗病中起重要作用,可为后期研究葡萄抗霜霉病分子机制提供候选基因。 展开更多
关键词 葡萄霜霉病 咖啡酸-o-甲基转移酶 生物学分析 功能分析
下载PDF
芍药等8种植物COMT基因的生物信息学分析 被引量:3
7
作者 许聪 石文波 +3 位作者 高天祥 胡蕴钰 陶俊 赵大球 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期2468-2474,共7页
植物咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因对木质素的合成具有重要的调控作用。本研究采用生物信息学方法对芍药等8种植物COMT基因编码的氨基酸序列进行比对,进而对其蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构域、磷... 植物咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因对木质素的合成具有重要的调控作用。本研究采用生物信息学方法对芍药等8种植物COMT基因编码的氨基酸序列进行比对,进而对其蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构与三级结构进行了预测与分析。结果表明,芍药等8种植物COMT基因编码氨基酸的一致性可达65.91%,平均相对分子量为39437.79 Da,带有酸性等电点,含量最丰富的氨基酸为亮氨酸(Leu)和丙氨酸(Ala),无信号肽,无跨膜结构域,磷酸化位点数量最多的为丝氨酸和苏氨酸,定位于细胞骨架和细胞质中可能性最大,二级结构则以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维结构具有一定的相似性。这一结果为今后深入开展植物COMT基因功能研究提供了科学依据。 展开更多
关键词 芍药 咖啡酸-o- 甲基转移酶 生物信息学 木质素
原文传递
植物咖啡酸-O-甲基转移酶的研究进展 被引量:3
8
作者 李元玉 陈万生 肖莹 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期2187-2200,共14页
单木质素醇(H型、G型和S型)是构成植物木质素和木脂素的基本单元,其组成的不同直接决定木质素和木脂素的化学多样性和生物活性差异。咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase, COMT)可催化苯丙素类化合物羟基上氧原子的... 单木质素醇(H型、G型和S型)是构成植物木质素和木脂素的基本单元,其组成的不同直接决定木质素和木脂素的化学多样性和生物活性差异。咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase, COMT)可催化苯丙素类化合物羟基上氧原子的甲基化,在不同类型单木质素醇的构成中起决定作用,是木质素和木脂素生物合成途径的关键酶。2010年的相关综述主要对COMT的基因特征和在木质素生物合成中的调控作用作了介绍,文中聚焦了近十多年来COMT的最新研究进展,从基因特征、表达特征、结构特征和调控作用几个方面进行全面综述,并对COMT的研究和应用前景进行展望。 展开更多
关键词 咖啡酸-o-甲基转移酶 木质素 木脂素 单木质素醇
原文传递
Functional characterization of caffeic acid O-methyltransferase in internode lignification of switchgrass(Panicum virgatum) 被引量:1
9
作者 Fengyan WU Zhenying WU +3 位作者 Aiguo YANG Shanshan JIANG Zeng-Yu WANG Chunxiang FU 《Frontiers of Agricultural Science and Engineering》 2018年第1期98-107,共10页
Caffeic acid O-methyltransferase(COMT) is a crucial enzyme that mainly methylates phenylpropanoid meta-hydroxyl of C5 in the biosynthesis of syringyl lignin in angiosperms. A putative COMT, named as PvCOMT1,was isolat... Caffeic acid O-methyltransferase(COMT) is a crucial enzyme that mainly methylates phenylpropanoid meta-hydroxyl of C5 in the biosynthesis of syringyl lignin in angiosperms. A putative COMT, named as PvCOMT1,was isolated from switchgrass(Panicum virgatum), a C4 warm-season dual-purpose forage and bioenergy crop. Our results showed that recombinant PvCOMT1 enzyme protein catalyzed the methylation of 5-OH coniferyl alcohol, 5-OH coniferaldehyde(CAld5H) and 5-OH ferulic acid. Further in vitro studies indicate that CAld5H can dominate COMT-mediated reactions by inhibiting the methylation of the other substrates. Transgenic switchgrass plants generated by an RNAi approach were further employed to study the function of COMT in internode lignification. A dramatic decrease in syringyl lignin units coupled with an obvious incorporation in 5-OH guaiacyl lignin units were observed in the COMT-RNAi transgenic plants. However, the constitutive suppression of COMT in switchgrass plants altered neither the pattern of lignin deposition along the stem nor the anatomical structure of internodes. Consistent with the biochemical characterization of PvCOMT1, a significant decrease in sinapaldehyde was found in the COMT-RNAi transgenic switchgrass plants, suggesting that CAld5H could be the optimal intermediate in the biosynthesis syringyl lignin. 展开更多
关键词 biofuel crop caffeic acid o-methyltransferase FoRAGE lignin Panicum virgatum SWITCHGRASS transgenic plant
原文传递
日本落叶松咖啡酸-O-甲基转移酶基因LkCOMT的克隆及单核苷酸多态性分析 被引量:2
10
作者 易敏 张守攻 +1 位作者 谢允慧 孙晓梅 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2013年第F10期52-59,共8页
依据日本落叶松转录组数据库检测到的咖啡酸-O-甲基转移酶(COMT)基因ESTs序列设计引物,分离得到一个编码该酶的新基因。其cDNA克隆全长为1350bp,包含长度为1092bp的开放阅读框,可编码364个氨基酸残基。序列分析显示,所推导的蛋白... 依据日本落叶松转录组数据库检测到的咖啡酸-O-甲基转移酶(COMT)基因ESTs序列设计引物,分离得到一个编码该酶的新基因。其cDNA克隆全长为1350bp,包含长度为1092bp的开放阅读框,可编码364个氨基酸残基。序列分析显示,所推导的蛋白质氨基酸序列包含COMT基因5个所特有的保守元件,与海岸松PpCOMT的蛋白质氨基酸序列同源性达94%。在此基础上,利用DnaSP5.0软件对日本落叶松加株基因型个体的LkCOMT序列进行了单核苷酸多样性SNPs分析,共检测到92个SNP位点,SNP发生频率为1/17bp,多样性指数1T,为0.00780。在这些SNPs中,65个属于转换,27个属于颠换。在外显子区域,共检测到58个SNP位点,其中37个为错义突变,21个为同义突变。研究结果为Et本落叶松基因标记辅助育种提供了理论基础。 展开更多
关键词 日本落叶松 咖啡酸-o-甲基转移酶基因 基因克隆 单核苷酸多态性
下载PDF
玉米咖啡酸O-甲基转移酶的全基因组鉴定与功能分析
11
作者 张璐 赵月强 +5 位作者 付家锋 张权 马春业 李英壮 张兰 王改革 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1259-1266,共8页
【目的】咖啡酸O-甲基转移酶(Caffeic acid O-methyltransferase,COMT)是褪黑素生物合成中的关键酶,在植物的生长、发育和抵御胁迫中发挥着重要的作用。本研究旨在探究COMT在玉米全基因组中的分布与盐胁迫响应情况,鉴定玉米咖啡酸O-甲... 【目的】咖啡酸O-甲基转移酶(Caffeic acid O-methyltransferase,COMT)是褪黑素生物合成中的关键酶,在植物的生长、发育和抵御胁迫中发挥着重要的作用。本研究旨在探究COMT在玉米全基因组中的分布与盐胁迫响应情况,鉴定玉米咖啡酸O-甲基转移酶(COMT)基因。【方法】通过分析玉米COMT基因家族成员的结构特征、系统发育关系、基因结构、表达模式等,对ZmCOMTs基因进行系统分析,并通过过表达ZmCOMT12拟南芥对ZmCOMT的功能进行初步验证。【结果】在玉米全基因组中共鉴定出了28个COMT基因,根据系统发育分析分为2个分支(分支Ⅰ~Ⅱ),大部分的COMT成员具有相似的motif组成和基因结构特征。利用玉米数据库分析ZmCOMTs的表达模式发现部分基因存在组织特异性,实时荧光定量PCR发现ZmCOMTs被盐胁迫诱导表达,说明ZmCOMTs成员参与了盐胁迫的调控,过表达ZmCOMT12拟南芥提高了褪黑素的含量和耐盐性。【结论】通过序列比对、亲缘关系、蛋白结构分析得到了假定的褪黑素合成基因ZmCOMT12,过表达拟南芥发现该基因与褪黑素的合成和耐盐性相关。 展开更多
关键词 玉米 咖啡酸o-甲基转移酶 褪黑素 非生物胁迫 成员鉴定
下载PDF
菘蓝中咖啡酸氧甲基转移酶IiCOMT的克隆与表达分析 被引量:1
12
作者 张国宁 李元玉 +3 位作者 马雪祺 李姝诺 陈万生 肖莹 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期214-221,共8页
目的克隆菘蓝Isatis indigotica中咖啡酸氧甲基转移酶(I. indigotica fortune caffeic acid O-methyltransferase,IiCOMT)编码基因,并进行生物信息学及表达分析。方法采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆菘蓝IiCOMT的全长cDNA,进而通过... 目的克隆菘蓝Isatis indigotica中咖啡酸氧甲基转移酶(I. indigotica fortune caffeic acid O-methyltransferase,IiCOMT)编码基因,并进行生物信息学及表达分析。方法采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆菘蓝IiCOMT的全长cDNA,进而通过PCR获得其基因组DNA序列。通过qRT-PCR检测IiCOMT在四倍体菘蓝和二倍体菘蓝各器官以及不同胁迫条件下的表达情况。结果 IiCOMT全长cDNA为1376 bp(GenBank登录号DQ115905),包含1个1092 bp的开放阅读框(open readingframe,ORF),编码363个氨基酸残基,其对应的DNA序列含有3个内含子,4个外显子。IiCOMT基因在2种倍性菘蓝的根茎叶均有表达,且四倍体菘蓝中的表达均高于二倍体。胁迫因素盐处理(NaCl)、冷处理(4℃)、水杨酸(salicylicacid,SA)、茉莉酸甲脂(methyl jasmonate,MeJA)、赤霉素(gibberellic acid,GA3)和脱落酸(abscisic acid,ABA)均能诱导IiCOMT表达水平上调。结论 IiCOMT的克隆及表达分析,为进一步阐明与咖啡酸氧甲基转移酶相关的四倍体菘蓝优良性状形成的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 菘蓝 咖啡酸氧甲基转移酶 基因克隆 生物信息学 表达分析
原文传递
茶树咖啡酸氧甲基转移酶基因的克隆及原核表达 被引量:7
13
作者 李小霞 余有本 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期139-143,共5页
以从茶树叶子中提取的总RNA为模板,结合RT-PCR利用RACE技术,得到咖啡酸氧甲基转移酶(caffeic acid o-methyltransferase,COMT)基因全长1 381bp,其开放阅读框为1 092bp,编码393个氨基酸,推测的蛋白分子量约为39.661 9ku,理论等电点为5.66... 以从茶树叶子中提取的总RNA为模板,结合RT-PCR利用RACE技术,得到咖啡酸氧甲基转移酶(caffeic acid o-methyltransferase,COMT)基因全长1 381bp,其开放阅读框为1 092bp,编码393个氨基酸,推测的蛋白分子量约为39.661 9ku,理论等电点为5.66,在GenBank的登录号为HM204933。其核苷酸序列与欧洲白桦、苎麻、中果咖啡和毛果杨的COMT基因相似性分别为80%、78%、77%、77%,氨基酸序列与毛果杨的COMT基因达100%。将该基因重组到表达载体pET-32a(+)中进行原核表达,经IPTG诱导,SDS-PAGE检测结果表明茶树COMT基因能在大肠杆菌BL21(DE3)中表达,电泳检测到一条大约60ku的外源蛋白,与预测的融合蛋白分子量相符。 展开更多
关键词 茶树 咖啡酸氧甲基转移酶 RACE 原核表达
下载PDF
长叶红砂咖啡酸-O-甲基转移酶(RtCOMT)基因的克隆及蛋白纯化 被引量:1
14
作者 张慧荣 冯杰 +1 位作者 赵萍萍 王迎春 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1529-1535,共7页
长叶红砂(Reaumuria trigyna)是内蒙古东阿拉善-西鄂尔多斯地区特有双子叶盐生小灌木,有极强的耐盐抗旱性,入药可以治疗湿疹、皮炎等疾病,具有一定的药用价值。咖啡酸-O-甲基转移酶(RtCOMT)是一个重要的甲基化酶,主要调控木质素合成过... 长叶红砂(Reaumuria trigyna)是内蒙古东阿拉善-西鄂尔多斯地区特有双子叶盐生小灌木,有极强的耐盐抗旱性,入药可以治疗湿疹、皮炎等疾病,具有一定的药用价值。咖啡酸-O-甲基转移酶(RtCOMT)是一个重要的甲基化酶,主要调控木质素合成过程中中间产物及木质素的变化。基于高通量测序结果,利用RT-PCR技术克隆获得长叶红砂COMT(RtCOMT)基因,构建RtCOMT原核表达载pET32a-RtCOMT,并将其转化大肠杆菌,重组阳性菌经IPTG诱导和SDS-PAGE电泳检测。结果表明:RtCOMT基因开放阅读框长1 023bp,编码340个氨基酸,推测蛋白分子质量37.24ku,理论等电点(pI)6.71,发现该基因在大肠杆菌中正常表达得到与预期大小一致的融合蛋白。采用Ni-IDA His-Bind亲和层析方法对RtCOMT重组蛋白进行纯化,体外获得目的蛋白。 展开更多
关键词 长叶红砂 CoMT基因 原核表达 蛋白纯化
下载PDF
川芎咖啡酸-O-甲基转移酶基因密码子偏好性与进化分析 被引量:13
15
作者 严子成 蒋瑞平 +3 位作者 梁浩伟 陈渏 周嘉裕 廖海 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期894-901,共8页
咖啡酸-O-甲基转移酶(COMT)是苯丙烷类代谢途径中的一个关键酶,研究其密码子偏好性对开展该基因的异源表达与分子调控研究有重要指导意义.利用Codon W、EMBOSS、SPSS与Origin等在线服务器及软件,首先分析川芎等不同植物来源COMT基因的... 咖啡酸-O-甲基转移酶(COMT)是苯丙烷类代谢途径中的一个关键酶,研究其密码子偏好性对开展该基因的异源表达与分子调控研究有重要指导意义.利用Codon W、EMBOSS、SPSS与Origin等在线服务器及软件,首先分析川芎等不同植物来源COMT基因的密码子偏好性,随后以川芎COMT为重点,比较其与大肠杆菌、酵母、拟南芥与烟草等模式生物的密码子使用频率.结果表明,单子叶植物COMT基因的密码子偏好性较强,而低等植物与双子叶植物COMT基因的密码子偏好性较弱.分析COMT基因密码子偏好性与核酸序列,发现亲缘关系较近的物种不仅具有较高的核酸序列相似度,并且具有相似的密码子偏好性,推测这种现象是由于密码子偏好性的形成主要受到自然选择的影响.COMT作为一个起源古老的基因,分析其密码子偏好性对了解植物进化关系有一定作用.川芎COMT体现出与其他双子叶植物相近的密码子偏好性,其GC含量与GC3s均小于50%,偏好以A/T编码,偏好性极强(RSCU>2)的密码子有7个,ENc为51.38,整体密码子偏好性较弱.与大肠杆菌相比较,酵母可能是其更好的外源表达系统.较之拟南芥,烟草更合适作为川芎COMT的遗传转化受体.本研究表明拟南芥、烟草都可作为Lc COMT遗传转化受体系统的候选;并且烟草COMT与Lc COMT在进化树上显示出较近的亲源关系,所以烟草可能是LCCOMT相对更好的遗传转化受体;结果可为COMT基因的遗传进化研究、川芎COMT的功能验证及转基因植物培育等奠定理论基础.(图4表2参33) 展开更多
关键词 川芎 咖啡酸-o-甲基转移酶 密码子偏好性 进化分析 外源宿主
原文传递
棉花甲基化酶基因COMT和CCoAOMT的组织特异性表达分析 被引量:11
16
作者 吕萌 倪志勇 +3 位作者 王娟 李波 罗淑萍 范玲 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期713-719,共7页
本研究利用半定量RT-PCR分析方法探索了陆地棉(Gossypium hirsutum L.)木质素合成途径中甲基化酶基因家族COMT和CCoAOMT在不同组织和不同发育时期纤维中的表达情况。结果表明COMT1,COMT2,COMT3和CCoAOMT1,CCoAOMT2在棉花的7个组织器官(... 本研究利用半定量RT-PCR分析方法探索了陆地棉(Gossypium hirsutum L.)木质素合成途径中甲基化酶基因家族COMT和CCoAOMT在不同组织和不同发育时期纤维中的表达情况。结果表明COMT1,COMT2,COMT3和CCoAOMT1,CCoAOMT2在棉花的7个组织器官(根、茎、叶、子叶、花瓣、雄蕊、胚珠)中都有表达,其中COMT1和CCoAOMT1在各组织中的表达趋势类似,COMT2,COMT3和CCoAOMT2表达趋势各异。在5~25d的棉纤维发育过程中,COMT1和COMT3表达稳定,COMT2表达量逐渐增加。而CCoAOMT基因家族的2个基因的表达量变化相对明显,CCoAOMT1在25d出现表达高峰,CCoAOMT2则在10d和15d呈现高表达量。本研究表明甲基化酶基因家族COMT和CCoAOMT在棉花的根,茎等维管组织中具有相对一致的高表达量,而在其他组织和发育纤维中则呈现出明显的组织特异性和纤维发育时期特异性。 展开更多
关键词 陆地棉 咖啡酸-o-甲基转移酶(CoMT) 咖啡酰辅酶A-o-甲基转移酶(CCoAoMT) 反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR) 组织特异性表达
下载PDF
马尾松PmCOMT基因的克隆及实时定量表达分析 被引量:7
17
作者 吴晓刚 陈佩珍 +2 位作者 韦蔷 武星 季孔庶 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期789-795,共7页
在木质素生物合成里,咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid-O-methyltransferase, COMT)起重要作用。本论文以马尾松幼苗作为材料,并通过PCR技术以及RACE技术从马尾松材料中克隆出Pm COMT基因的cDNA全长。该cDNA全长为1660bp,其中预测完整... 在木质素生物合成里,咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid-O-methyltransferase, COMT)起重要作用。本论文以马尾松幼苗作为材料,并通过PCR技术以及RACE技术从马尾松材料中克隆出Pm COMT基因的cDNA全长。该cDNA全长为1660bp,其中预测完整ORF全长为1125bp,可编码374个氨基酸的蛋白。蛋白相对分子质量为41.81 kD;等电点(pI)为5.03,总平均亲水性为-0.311。通过生物信息学的方法对其进行分析表明,Pm COMT基因具有典型的甲基转移酶的保守结构域。通过实时荧光定量表达分析表明,COMT基因在马尾松的不同组织均有表达,其中在新梢中的表达量最高,树皮中表达量最低。 展开更多
关键词 马尾松 咖啡酸-o-甲基转移酶 基因克隆 实时荧光定量表达分析
原文传递
板栗咖啡酸氧甲基转移酶基因CmCOMT的克隆及原核表达 被引量:6
18
作者 刘裕峰 朱天辉 +4 位作者 刘应高 李姝江 龙旭梅 余鹏举 韩珊 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2332-2341,共10页
该研究根据板栗(Castanea mollissima Bl.)cDNA文库分析得到EST序列,采用RT-PCR技术,克隆板栗咖啡酸氧甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因全长cDNA(CmCOMT),分析其编码蛋白的相关信息并进行原核表达研究,为板栗木... 该研究根据板栗(Castanea mollissima Bl.)cDNA文库分析得到EST序列,采用RT-PCR技术,克隆板栗咖啡酸氧甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因全长cDNA(CmCOMT),分析其编码蛋白的相关信息并进行原核表达研究,为板栗木质素合成关键酶基因CmCOMT的生物学功能研究与应用奠定基础。结果表明:(1)CmCOMT基因(GenBank登录号为KU365322)具有一个1 098bp开放阅读框(ORF),共编码365个氨基酸,推测蛋白分子质量为39.684 9kD,理论等电点为5.83,具有植物SAM依赖甲基转移酶的典型特征。(2)CmCOMT核苷酸序列及其编码氨基酸序列与垂枝桦(Betula pendula)和白桦(Betula platyphylla)的相应序列一致性均在90%以上;同源建模表明,CmCOMT的3D模型与苜蓿(Medicago sativa)MsCOMT的蛋白结构相似,推测其可能与MsCOMT具有相似的功能;系统发育树分析显示,CmCOMT与其他植物COMTs具有相同的进化祖先,与桦木科植物物种亲缘关系最近。(3)SDS-PAGE电泳分析表明,CmCOMT蛋白最佳诱导表达条件为0.3mmol/L IPTG在25℃下诱导6h,蛋白分子量约为44kD,其主要以可溶性蛋白的形式存在。 展开更多
关键词 板栗 咖啡酸氧甲基转移酶 基因克隆 原核表达
下载PDF
蒙古冰草咖啡酸氧甲基转移酶基因AmCOMT1的鉴定及功能分析 被引量:1
19
作者 杜锦瑜 孙震 +6 位作者 苏彦龙 王贺萍 刘亚玲 吴振映 何峰 赵彦 付春祥 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期383-396,共14页
蒙古冰草(即沙芦草(Agropyron mongolicum))是我国北方代表性的多年生牧草之一,具有较强的耐寒和耐旱能力。在植物中,咖啡酸氧甲基转移酶基因(COMT)是参与木质素和褪黑素生物合成的关键基因,在调节植物生长、品质和抗逆性中发挥重要作... 蒙古冰草(即沙芦草(Agropyron mongolicum))是我国北方代表性的多年生牧草之一,具有较强的耐寒和耐旱能力。在植物中,咖啡酸氧甲基转移酶基因(COMT)是参与木质素和褪黑素生物合成的关键基因,在调节植物生长、品质和抗逆性中发挥重要作用。通过分析蒙古冰草全长转录组数据,从蒙古冰草中克隆了COMT候选基因AmCOMT1。该基因在茎秆和根等木质素含量高的组织中高表达,且其表达受多种非生物胁迫诱导。在拟南芥(Arabidopsis thaliana)野生型(Col-0)和突变体(omt1-2)中过表达AmCOMT1,显著促进了转基因拟南芥的木质素合成,使突变体的木质素单体和组分恢复至野生型水平,同时Col-0/35S:AmCOMT1中木质素总量提高11%。此外, AmCOMT1过表达显著提高了Col-0/35S:AmCOMT1转基因拟南芥的褪黑素含量。在盐胁迫条件下,该株系平均根长相比野生型拟南芥提高20.3%,表现出更强的抗逆性。综上,蒙古冰草AmCOMT1基因在木质素和褪黑素合成中发挥关键作用,可提高转基因拟南芥的抗逆性,在蒙古冰草等单子叶牧草遗传改良方面具有重要应用潜力。 展开更多
关键词 蒙古冰草 咖啡酸氧甲基转移酶 木质素 褪黑素 盐胁迫
原文传递
当归咖啡酸-O-甲基转移酶在大肠杆菌中的表达及组织表达分析 被引量:4
20
作者 杨彩霞 王引权 +1 位作者 雒军 张亚丽 《甘肃中医药大学学报》 2019年第6期1-6,共6页
目的研究当归咖啡酸-O-甲基转移酶(AsCOMT)在大肠杆菌(E.coli)BL21(DE3)中的表达,以及AsCOMT基因在当归抽苔植株和紫外线(UV)-B辐射胁迫下不同组织中的表达。方法基于前期克隆的AsCOMT基因全长cDNA序列,利用双酶切技术构建pGEX-4T-3-AsC... 目的研究当归咖啡酸-O-甲基转移酶(AsCOMT)在大肠杆菌(E.coli)BL21(DE3)中的表达,以及AsCOMT基因在当归抽苔植株和紫外线(UV)-B辐射胁迫下不同组织中的表达。方法基于前期克隆的AsCOMT基因全长cDNA序列,利用双酶切技术构建pGEX-4T-3-AsCOMT原核表达载体,将其转化至E.coli BL21(DE3)中,优化重组蛋白诱导表达条件,通过聚丙烯酰胺凝胶制备试剂盒(SDS-PAGE)电泳检测;并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析AsCOMT在当归抽苔植株和UV-B辐射胁迫下不同组织中的表达模式。结果异源表达得到重组蛋白分子量为40 KDa,大小与预测分子量一致,AsCOMT蛋白主要以包涵体形式存在。qRT-PCR分析显示,抽苔当归茎中COMT的表达量显著高于其他组织(P<0.05);UV-B辐射胁迫下,茎和叶中AsCOMT基因的表达水平差异有统计学意义(P<0.05),即随UV-B辐射增强,AsCOMT基因的表达量在茎和叶中呈先增加后减少的趋势,而在根中无明显变化。结论AsCOMT在不同组织和处理下表达水平存在差异,且在E.coli中成功表达,为后期深入研究当归阿魏酸生物合成调控研究奠定了基础。 展开更多
关键词 当归 咖啡酸-o-甲基转移酶 异源表达 组织表达
原文传递
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部