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水产品腐败希瓦氏菌CsrA蛋白序列特征及应激响应的基因表达分析
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作者 李秋莹 周文萱 +3 位作者 崔方超 檀茜倩 孙彤 励建荣 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第8期50-59,共10页
目的:探究水产品腐败希瓦氏菌中重要转录后调控蛋白CsrA的序列特征及基因表达模式。方法:克隆腐败希瓦氏菌csrA基因,采用生物信息学手段分析CsrA结构及蛋白互作网络等,利用实时荧光定量PCR技术分析csrA对冷热、高盐、饥饿、乙醇和群体... 目的:探究水产品腐败希瓦氏菌中重要转录后调控蛋白CsrA的序列特征及基因表达模式。方法:克隆腐败希瓦氏菌csrA基因,采用生物信息学手段分析CsrA结构及蛋白互作网络等,利用实时荧光定量PCR技术分析csrA对冷热、高盐、饥饿、乙醇和群体感应信号分子的应激响应表达特性。结果:CsrA为高度保守的亲水蛋白,含9个磷酸化位点,含1个α-螺旋和5个β-折叠,活性结构以二聚体形式存在,预测其互作蛋白涉及参与蛋白合成、鞭毛组装与运动、生物膜形成及群体感应调控等。4℃培养5 h显著诱导csrA基因的表达,而45℃培养1 h会立即诱导csrA基因的表达;高盐浓度能显著诱导csrA基因的表达;csrA基因在营养缺失培养基中的表达均呈逐渐升高趋势,5 h时显著高于对照组;5%乙醇处理组csrA基因表达量持续上调而10%乙醇会使csrA表达水平下降;群体感应信号分子可诱导csrA基因表达上调。结论:CsrA与腐败希瓦氏菌致腐密切相关,在其应对不同环境条件时发挥重要作用,研究结果可为进一步解析CsrA的生物学功能提供参考。 展开更多
关键词 腐败希瓦氏菌 csra 基因表达 互作蛋白 应激
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人工sRNAs沉默csrA基因以优化大肠杆菌生产L-酪氨酸 被引量:3
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作者 姚元锋 赵莹 赵广荣 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期60-65,共6页
sRNAs作为一种强有力的基因表达调控工具,在真核生物中得到了广泛的应用。随着微生物中sRNAs的不断发现以及其调控机制的逐渐明确,新近开发的人工sRNA工程在微生物代谢工程的改造上也展现了巨大的优势。通过对大肠杆菌负调控L-酪氨酸生... sRNAs作为一种强有力的基因表达调控工具,在真核生物中得到了广泛的应用。随着微生物中sRNAs的不断发现以及其调控机制的逐渐明确,新近开发的人工sRNA工程在微生物代谢工程的改造上也展现了巨大的优势。通过对大肠杆菌负调控L-酪氨酸生物合成途径的碳贮藏调控因子(csrA)基因的sRNAs进行了人工设计和筛选,分析了对L-酪氨酸合成的影响。结果表明,所设计的sRNA能有效提高L-酪氨酸的合成,较高拷贝数的短anti-csrA sRNA2比较长的sRNA1更有效,使L-酪氨酸产量提高了1.2倍。sRNA工程技术是一种有效的负调控全局代谢途径的策略,其在合成生物学以及微生物细胞工厂构建上必将有着更广泛的应用。 展开更多
关键词 人工sRNAs 基因沉默 csra L-酪氨酸
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基于改进TResNet的下水道缺陷识别算法
3
作者 晏润冰 李明辉 +3 位作者 李煜博 张梦圆 李金彪 张奇 《西安理工大学学报》 北大核心 2023年第4期567-575,共9页
同一张下水道图像可能同时反映多种类型的下水道缺陷,所以应对下水道图像进行多标签缺陷预测。为了进一步解决城市下水道复杂场景中缺陷的多标签自动分类问题,本文提出了一种两阶段的下水道缺陷类型识别方法。第一阶段,使用二分类卷积... 同一张下水道图像可能同时反映多种类型的下水道缺陷,所以应对下水道图像进行多标签缺陷预测。为了进一步解决城市下水道复杂场景中缺陷的多标签自动分类问题,本文提出了一种两阶段的下水道缺陷类型识别方法。第一阶段,使用二分类卷积神经网络(CNN)模型检测下水道图像是否存在缺陷;第二阶段,使用改进TResNet模型对下水道图像具体缺陷类型进行多标签分类,该模型在TResNet基础上引入了捕获空间相关类别信息的特定类别残差注意力(CSRA)模块,从而提升了网络的多标签识别能力。考虑到不同类型缺陷造成的经济影响程度不同,使用加权缺陷类别经济影响指数的F 2-CIW指标以及标准F 1分数指标来评价模型的性能。实验结果表明,在下水道数据集Sewer-ML Dataset上,本文方法的F 1-Normal和F 2-CIW指标取得了90.41%和53.57%的测试得分,相比其它方法具有更好的缺陷识别性能。 展开更多
关键词 下水道缺陷识别 多标签分类 TResNet 特定类别的残差注意力模块
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细菌RNA分子伴侣Hfq的研究进展
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作者 王巍 战嵛华 +2 位作者 杨智敏 侯明生 燕永亮 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期78-86,共9页
RNA分子伴侣蛋白Hfq广泛存在于细菌中,最早在大肠杆菌Qβ噬菌体的RNA复制过程中作为必需的宿主因子而被发现。hfq基因的缺失会造成细菌多种表型的变化,对Hfq的全局性调控作用的研究,是当前微生物代谢调控研究中的热点之一。近年来,大量... RNA分子伴侣蛋白Hfq广泛存在于细菌中,最早在大肠杆菌Qβ噬菌体的RNA复制过程中作为必需的宿主因子而被发现。hfq基因的缺失会造成细菌多种表型的变化,对Hfq的全局性调控作用的研究,是当前微生物代谢调控研究中的热点之一。近年来,大量的研究表明Hfq能够通过参与非编码RNA与其靶标mRNAs的互作过程,从而影响mRNAs的稳定性,进而发挥其调控作用。介绍了Hfq蛋白的结构、hfq突变产生的典型表型,并阐述了Hfq参与代谢调控的分子机制以及自身的活性调控,对全面深入了解微生物中Hfq蛋白的功能多样性及调控机制具有指导意义。 展开更多
关键词 HFQ RPOS MRNA 翻译激活 csra CRC
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大肠杆菌整体代谢网络调控基因(csrA)的敲除及其对苯丙氨酸生物合成的影响
5
作者 黄钦耿 吴伟斌 +2 位作者 翁雪清 施巧琴 吴松刚 《氨基酸和生物资源》 CAS 2012年第2期1-4,共4页
csrA基因产物是大肠杆菌芳香族氨基酸生物合成途径中碳中心代谢有关的一种全局性调控蛋白质。采用Red敲除系统介导的同源重组的方法定位缺失大肠杆菌染色体csrA基因,经PCR、DNA测序等多种方法证实了基因重组缺失的可靠性。csrA基因缺失... csrA基因产物是大肠杆菌芳香族氨基酸生物合成途径中碳中心代谢有关的一种全局性调控蛋白质。采用Red敲除系统介导的同源重组的方法定位缺失大肠杆菌染色体csrA基因,经PCR、DNA测序等多种方法证实了基因重组缺失的可靠性。csrA基因缺失后,缺失菌株较对照菌株,糖酸转化率有所提高,发酵生产苯丙氨酸的能力也得到一定的提高,产酸提高约13%。 展开更多
关键词 csra 基因敲除 苯丙氨酸生物合成 代谢调控
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大肠杆菌全局调控蛋白CsrA中抑制十字花科黑腐病菌胞外蛋白酶活性所必需的氨基酸残基的鉴定
6
作者 唐东阶 钟婉莹 +2 位作者 秦春铃 唐纪良 晁耐霞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期440-448,共9页
CsrA/RsmA蛋白家族是细菌中一类重要的转录后全局调控因子,它们调控细菌的碳代谢、次生代谢、运动、生物被膜形成以及致病等过程。CsrA/RsmA蛋白家族通常由60~72个氨基酸基组成,其中第1至第52位氨基酸高度保守,而第53位以后的氨... CsrA/RsmA蛋白家族是细菌中一类重要的转录后全局调控因子,它们调控细菌的碳代谢、次生代谢、运动、生物被膜形成以及致病等过程。CsrA/RsmA蛋白家族通常由60~72个氨基酸基组成,其中第1至第52位氨基酸高度保守,而第53位以后的氨基酸则高度可变。目前人们认为其氨基酸高度保守性是不同种属细菌CsrA/RsmA功能和作用机理相似的基础,但是其高度可变区与不同种属CsrA/RsmA蛋白功能差异的关系尚不清楚。我们之前的研究显示,大肠杆菌(Escherichiacoli)的CsrA(CsrAE删)蛋白的高度可变区(第53至第61位氨基酸残基)具有强烈的抑制十字花科黑腐病菌(XanthomonztscampeStr/spathovarcampestris,简称‰c)胞外蛋白酶活性的能力。本研究中,我们采用丙氨酸置换方法,确定了CsrA。蒯可变区中抑制xcc胞外蛋白酶活性必需的氨基酸残基。结果显示,CsrAE枷蛋白的第54位赖氨酸(K54)、第60位丝氨酸(S60)和第61位酪氨酸(Y61)置换成丙氨酸后,csrA‰。蛋白丧失了抑制Xcc胞外蛋白酶活性的能力;而其它位点的丙氨酸置换不影响其抑制Xcc胞外蛋白酶活性的能力。这个结果证明K54、S60和Y61是CsrAE.coli抑制Xcc胞外蛋白酶活性所必需的,为揭示大肠杆菌的CsrA。融蛋白抑制Xcc胞外蛋白酶活性的分子机理奠定基础。 展开更多
关键词 十字花科黒腐病菌 胞外蛋白酶 大肠杆菌 csra 丙氨酸置换
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苯丙氨酸生物合成的整体代谢网络调控基因的敲除
7
作者 黄钦耿 吴伟斌 +1 位作者 施巧琴 吴松刚 《发酵科技通讯》 CAS 2012年第4期13-15,共3页
csrA基因产物是大肠杆菌芳香族氨基酸生物合成途径中碳中心代谢有关的一种全局性调控蛋白质。采用Red敲除系统介导的同源重组的方法定位缺失大肠杆菌染色体csrA基因,经PCR、DNA测序等多种方法证实了基因剔除的可靠性。csrA基因剔除后,... csrA基因产物是大肠杆菌芳香族氨基酸生物合成途径中碳中心代谢有关的一种全局性调控蛋白质。采用Red敲除系统介导的同源重组的方法定位缺失大肠杆菌染色体csrA基因,经PCR、DNA测序等多种方法证实了基因剔除的可靠性。csrA基因剔除后,大肠杆菌芳香族氨基酸生物合成中受csrA表达产物负调控的关键酶的酶活力有所提高,而正调控的关键酶基因活性降低,突变菌株发酵生产苯丙氨酸的能力提高近13%。 展开更多
关键词 csra 基因敲除 苯丙氨酸生物合成 代谢调控
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半导体行业风险评价分级算法的研究
8
作者 雷莹 侯宏波 +1 位作者 刘鹏刚 张颖 《机电安全》 2019年第10期7-12,共6页
在迅猛发展的社会背景下,为有效遏制半导体行业重特大事故的发生,文章对韩国半导体行业安全评价技术KOSHA GUIDE中4M评价工具进行了研究,并结合国内有关法律法规等标准要求,对半导体行业关注的事故性灾害、化学物质灾害等风险建立不同... 在迅猛发展的社会背景下,为有效遏制半导体行业重特大事故的发生,文章对韩国半导体行业安全评价技术KOSHA GUIDE中4M评价工具进行了研究,并结合国内有关法律法规等标准要求,对半导体行业关注的事故性灾害、化学物质灾害等风险建立不同数学评价模型,即CSRA模型,从方法论、评价模型、分级模型、措施原则等方面进行了研究,此评价方法一旦评价基准及模型数据建立完成,更适合于企业内部自行组织执行并实施风险管理,在可操作性及日常课题管理方面更有利于企业对自我安全管理技术及风险把控,对我国半导体行业风险评价分级及提升安全技术管理水平具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 csra 事故性灾害 4M法 筋骨骼系负担
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国外企业社会责任审计研究述评与启示 被引量:37
9
作者 姜虹 《审计研究》 CSSCI 北大核心 2009年第3期33-37,共5页
企业的利益相关者对企业履行社会责任情况信息披露的要求日益提高,企业社会责任审计活动也越来越得到理论界和实务界的重视。本文采用文献研究法从企业社会责任审计需求、审计主体、审计内容、审计标准、与财务绩效的相关性等方面对国... 企业的利益相关者对企业履行社会责任情况信息披露的要求日益提高,企业社会责任审计活动也越来越得到理论界和实务界的重视。本文采用文献研究法从企业社会责任审计需求、审计主体、审计内容、审计标准、与财务绩效的相关性等方面对国外学者的主要研究进行了综述和评价,积极肯定了企业社会责任审计活动的内在价值,并提出了在我国需科学确定企业社会责任审计理论的研究框架,逐步确立推行企业社会责任审计实务的方法和策略,增强企业公共政策的制定意识,强化对企业社会责任审计的内在需求等启示和建议。 展开更多
关键词 社会责任 社会责任审计 审计需求 企业公共政策
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单体分子放射性碳同位素分析在海洋科学及环境科学研究中的应用 被引量:6
10
作者 赵美训 于蒙 +1 位作者 张海龙 陶舒琴 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期1-10,共10页
单体分子放射性碳同位素分析(CSRA)是近十几年来发展起来的一项新兴的分析手段,将所需的单体分子(生物标志物)从复杂的环境样品基质中分离并富集,再进行加速质谱仪(AMS)的放射性碳(14C)测定。这种分子水平的放射性碳同位素测定技术能够... 单体分子放射性碳同位素分析(CSRA)是近十几年来发展起来的一项新兴的分析手段,将所需的单体分子(生物标志物)从复杂的环境样品基质中分离并富集,再进行加速质谱仪(AMS)的放射性碳(14C)测定。这种分子水平的放射性碳同位素测定技术能够揭示出总有机质同位素组成的异质性,为解释有机碳的来源、迁移和转化等提供了新型的手段。在海洋科学研究中,单体分子放射性碳同位素分析已应用于计算碳在全球各储库的逗留时间并揭示和定量估算化石源有机碳的输入、指示沉积物的搬运过程、示踪微生物的代谢途径、改进沉积物年代学等;在环境科学研究中,单体分子放射性碳同位素分析可用于有毒物质(如多环芳烃)的源解析,示踪有机污染环境中微生物的代谢途径等。伴随着单体分子分离技术的改进及AMS灵敏度的提高,CSRA技术的应用会更加广泛。 展开更多
关键词 单体分子放射性碳同位素分析 ^14C 生物标志物 海洋科学 环境科学
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大肠杆菌转录后调控蛋白CsrA的C末端具有抑制十字花科黑腐病菌胞外蛋白酶活性的功能 被引量:3
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作者 黄明慧 陈承晓 +3 位作者 覃振萍 唐纪良 唐东阶 晁耐霞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期341-348,共8页
CsrA(在有些细菌例如十字花科黒腐病菌中也称为RsmA,统称CsrA/RsmA)是一类在细菌中广泛分布而且氨基酸序列非常保守的RNA结合蛋白。研究表明,CsrA/RsmA作为转录后全局调控因子参与了包括细胞碳代谢、次生代谢、运动性、生物被膜形成以... CsrA(在有些细菌例如十字花科黒腐病菌中也称为RsmA,统称CsrA/RsmA)是一类在细菌中广泛分布而且氨基酸序列非常保守的RNA结合蛋白。研究表明,CsrA/RsmA作为转录后全局调控因子参与了包括细胞碳代谢、次生代谢、运动性、生物被膜形成以及动植物病原菌的致病过程等许多细胞过程的调控。CsrA/RsmA在不同的细菌中的生物学功能各有异同。在大肠杆菌中,CsrA的主要功能是控制细胞的碳代谢、运动性和生物被膜形成;而在十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc)中,CsrA的同源蛋白RsmA的主要功能除了控制碳代谢、运动性和生物被膜形成外,还控制致病性和胞外酶的产生。大肠杆菌的CsrA(CsrAE.coli)是否具有XccRsmA(RsmAXcc)的功能?为了回答这个问题,我们用大肠杆菌的csrA基因(csrAE.coli)互补Xcc的rsmA基因(rsmAXcc)的缺失突变体DM2506。结果显示,csrAE.coli能够互补DM2506的所有表型,说明CsrAE.coli具有RsmAXcc的全部功能。更重要的是,我们发现,无论是rsmAXcc突变体还是野生型菌株,导入表达CsrAE.coli的质粒后均导致其致胞外蛋白酶活性的严重下降,证明CsrAE.coli具有抑制Xcc胞外蛋白酶活性的作用。进一步的实验证实,CsrAE.coli的C末端第53~61位氨基酸残基具有抑制Xcc胞外蛋白酶活性的功能。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌Xcc 大肠杆菌 转录后调控蛋白csra 胞外蛋白酶
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不同环境中嗜肺军团菌FlaA和CsrA基因表达水平初步研究 被引量:2
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作者 刘凡 张宝莹 +1 位作者 陈晓东 陈逊 《环境与健康杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期404-406,F0003,共4页
目的初步探讨多种环境介质中嗜肺军团菌FlaA和CsrA基因表达水平的差异。方法于2010年8月和9月随机选取南京市四家公共场所采集集中空调系统的冷却水、冷却塔旁土壤、风管内壁积尘和室内送风口气溶胶,喷泉水、喷泉旁土壤,宾馆淋浴水样品... 目的初步探讨多种环境介质中嗜肺军团菌FlaA和CsrA基因表达水平的差异。方法于2010年8月和9月随机选取南京市四家公共场所采集集中空调系统的冷却水、冷却塔旁土壤、风管内壁积尘和室内送风口气溶胶,喷泉水、喷泉旁土壤,宾馆淋浴水样品。采用实时荧光定量PCR方法检测环境样本中嗜肺军团菌FlaA和CsrA基因的表达水平。结果不同环境样本中嗜肺军团菌FlaA和CsrA基因均有表达,淋浴水中FlaA基因的相对表达量上调6.798 4倍,CsrA基因相对表达量上调1.483 7倍。结论不同环境介质中嗜肺军团菌FlaA和CsrA基因的表达水平有变化,FlaA基因的总体表达水平稍高于CsrA基因。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 FlaA基因 csra基因 表达差异
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细菌全局性调控因子CsrA功能及其作用机制研究进展 被引量:1
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作者 尚立国 战嵛华 +1 位作者 弓湃 燕永亮 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期79-86,共8页
CsrA最初在研究碳储存调节系统(carbon storage regulation system)时被发现并被命名,是一个在肠杆菌、假单胞菌及芽孢杆菌等微生物中广泛存在的转录后调节因子,它可通过与靶标基因mRNA结合进而影响其稳定性或者抑制mRNA的翻译最终影响... CsrA最初在研究碳储存调节系统(carbon storage regulation system)时被发现并被命名,是一个在肠杆菌、假单胞菌及芽孢杆菌等微生物中广泛存在的转录后调节因子,它可通过与靶标基因mRNA结合进而影响其稳定性或者抑制mRNA的翻译最终影响靶基因的表达。研究表明,CsrA属全局调控因子,不仅参与细菌的中心碳代谢、运动、生物膜形成、群体感应、致病性等多种生命活动,而且也参与了细菌多种次级代谢物的合成,具有重要的生物学意义。最近的研究表明,CsrA功能的实现与两个非编码调控RNA具有重要关联,它们组成了复杂而精细的调控单元。综述了不同微生物中CsrA功能的多样性,并阐述了CsrA参与分子调控的机制,对于深入认识碳储存系统的调控机制以及针对性的改造和利用该系统具有重要的理论意义。 展开更多
关键词 碳储存调控系统 csra基因 非编码RNA 群体感应 生物膜
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生物标志物单体放射性碳同位素分析技术的发展 被引量:5
14
作者 张海龙 陶舒琴 +1 位作者 于蒙 赵美训 《地球科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1193-1203,共11页
自Eglinton等(1996)首次将单体放射性碳同位素分析技术(CSRA)应用于海洋沉积物中生物标志物14C研究以来,该技术发展迅速,广泛应用于海洋科学、生物地球化学和古气候学等领域。但是,自然环境样品中生物标志物大多含量低、干扰基质复杂而... 自Eglinton等(1996)首次将单体放射性碳同位素分析技术(CSRA)应用于海洋沉积物中生物标志物14C研究以来,该技术发展迅速,广泛应用于海洋科学、生物地球化学和古气候学等领域。但是,自然环境样品中生物标志物大多含量低、干扰基质复杂而且难以分离。因此,如何从基质组成复杂的样品中分离富集高纯度的目标化合物已经成为限制CSRA技术发展和应用的瓶颈。近些年来,不断改进的色谱分离富集技术不仅提高了目标化合物分离的纯度和回收效率,同时也扩展了生物标志物的碳同位素示踪应用。综合介绍了自然环境研究中单体化合物放射性碳同位素分析技术中常见生物标志物单体分离纯化的技术方法以及发展现状。 展开更多
关键词 单体放射性碳同位素 生物标志物 制备气相色谱 制备液相色谱
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Computation of PoA for Selfish Node Detection and Resource Allocation Using Game Theory
15
作者 S.Kanmani M.Murali 《Computer Systems Science & Engineering》 SCIE EI 2023年第11期2583-2598,共16页
The introduction of new technologies has increased communication network coverage and the number of associating nodes in dynamic communication networks(DCN).As the network has the characteristics like decentralized an... The introduction of new technologies has increased communication network coverage and the number of associating nodes in dynamic communication networks(DCN).As the network has the characteristics like decentralized and dynamic,few nodes in the network may not associate with other nodes.These uncooperative nodes also known as selfish nodes corrupt the performance of the cooperative nodes.Namely,the nodes cause congestion,high delay,security concerns,and resource depletion.This study presents an effective selfish node detection method to address these problems.The Price of Anarchy(PoA)and the Price of Stability(PoS)in Game Theory with the Presence of Nash Equilibrium(NE)are discussed for the Selfish Node Detection.This is a novel experiment to detect selfish nodes in a network using PoA.Moreover,the least response dynamic-based Capacitated Selfish Resource Allocation(CSRA)game is introduced to improve resource usage among the nodes.The suggested strategy is simulated using the Solar Winds simulator,and the simulation results show that,when compared to earlier methods,the new scheme offers promising performance in terms of delivery rate,delay,and throughput. 展开更多
关键词 Dynamic communication network(DCN) price of anarchy(PoA) nash equilibrium(NE) capacitated selfish resource allocation(csra)game game theory price of stability(PoS)
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Feature Selection, Deep Neural Network and Trend Prediction 被引量:2
16
作者 FANG Yan 《Journal of Shanghai Jiaotong university(Science)》 EI 2018年第2期297-307,共11页
The literature generally agrees that longer-horizon(over a month) predictions make more sense than short-horizon ones. However, it's an especially challenging task due to the lack of data(in unit of long horizon)a... The literature generally agrees that longer-horizon(over a month) predictions make more sense than short-horizon ones. However, it's an especially challenging task due to the lack of data(in unit of long horizon)and economic data have a low S/N ratio. We hypothesize that the stock trend is largely dictated by driving factors which are filtered by psychological factors and work on behavioral factors: representative indicators from these three aspects would be adequate in trend prediction. We then extend the Stepwise Regression Analysis(SRA)algorithm to constrained SRA(c SRA) to carry out a further feature selection and lag optimization. During modeling stage, we introduce the Deep Neural Network(DNN) model in stock prediction under the suspicion that economic interactions are too complex for shallow networks to capture. Our experiments indeed show that deep structures generally perform better than shallow ones. Instead of comparing to a kitchen sink model, where over-fitting can easily happen with a shortage of data, we turn around and use a model ensemble approach which indirectly demonstrates our proposed method is adequate. 展开更多
关键词 feature selection trend prediction constrained Stepwise Regression Analysis(c SRA) Deep Neural Network(DNN)
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细菌全局性调控蛋白CsrA的结构与功能 被引量:1
17
作者 郑丽平 赵振芳 冯永君 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期711-718,共8页
碳存储调控因子A(carbon storage regulator,CsrA)是一种RNA结合蛋白,在细菌的碳代谢、生物被膜形成、运动性、病原菌毒力、群体感应、环二鸟苷酸信号合成、应激感应等多种生理过程中具有重要调节功能,是全局性调控蛋白.它通过与靶标mRN... 碳存储调控因子A(carbon storage regulator,CsrA)是一种RNA结合蛋白,在细菌的碳代谢、生物被膜形成、运动性、病原菌毒力、群体感应、环二鸟苷酸信号合成、应激感应等多种生理过程中具有重要调节功能,是全局性调控蛋白.它通过与靶标mRNA的特异结合,抑制其翻译或增强其稳定性来调控下游基因的表达,属于转录后调控因子的范畴.CsrA蛋白的表达与活性受碳存储调控(Csr)系统本身多个自主调节回路的精密控制:一些小的非编码RNA(snmRNAs,如CsrB/C)作为拮抗因子与CsrA二聚体结合并抑制其活性;而这些snmRNAs在体内又可在CsrD的辅助下被核糖核酸内切酶E和多核苷酸磷酸化酶降解,释放CsrA的活性.当前,对于Csr系统的调节作用、调控通路与机制的研究是细菌学研究的热点,本文综述了该蛋白及Csr系统的结构、功能和作用机制的最新研究进展. 展开更多
关键词 碳存储调控因子A 全局性调控因子 非编码小RNA 转录后调节
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长链烯酮单体碳-14同位素分析技术进展与研究意义
18
作者 肖睿 包锐 邢磊 《地球科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1258-1271,共14页
生物标志物是研究古环境重建和物质循环理论的重要载体。针对海洋生物标志物的同位素研究是研究古海洋学与海洋元素循环理论的重要手段,应用国际先进的单体分子天然放射性碳同位素(碳-14)技术开展海洋环境演变和碳循环相关研究有着重要... 生物标志物是研究古环境重建和物质循环理论的重要载体。针对海洋生物标志物的同位素研究是研究古海洋学与海洋元素循环理论的重要手段,应用国际先进的单体分子天然放射性碳同位素(碳-14)技术开展海洋环境演变和碳循环相关研究有着重要的科学意义。其中,长链烯酮单体分子碳-14年龄分析能够反映海洋搬运作用对有机质沉积过程的影响,对生物标志物重建古环境等应用提出了新认识,并为建立利用有机质进行沉积物定年的方法奠定基础,也为建立海洋环境变迁和海洋碳循环模型提供进一步的年龄约束。因此,有必要对长链烯酮单体分子碳-14年龄的测定与研究意义进行系统归纳总结。在此基础上,综合介绍了2种关键的长链烯酮单体的分离提纯技术、1种重要的烯酮单体分离技术和长链烯酮单体分子碳-14分析及计算方法,以及长链烯酮单体分离提纯的过程空白评估方法;并总结了长链烯酮单体分子碳-14分析技术在海洋学中的指示意义:①间接地指示海洋搬运作用;②示踪海洋碳库;③具有改进沉积物年代学和古环境指标的潜力。最后,提出了应用长链烯酮单体分子碳-14解决海洋碳循环的几点核心科学问题。系统地总结长链烯酮单体分子碳-14技术特点与典型范例,对未来在中国近海开展相关研究具有重要启示意义。 展开更多
关键词 长链烯酮 单体放射性碳同位素分析技术 放射性碳同位素 碳-14 生物标志物
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