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奶牛乳腺炎无乳链球菌菌毛岛屿PI-2a骨架蛋白BP基因的克隆及其抗原性预测 被引量:7
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作者 白文丽 王金良 +6 位作者 锡林高娃 吴金花 董林 孙立杰 王华 朝洛蒙 布日额 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第4期294-297,共4页
目的克隆奶牛乳腺炎无乳链球菌菌毛岛屿BP基因片段并进行序列分析。方法根据GenBank已公布牛源无乳链球菌菌毛岛屿PI-2a的BP基因序列,采用Primer 5.0软件设计1对特异性引物,以内蒙古通辽地区分离的乳源性无乳链球菌临床菌株总DNA为模板... 目的克隆奶牛乳腺炎无乳链球菌菌毛岛屿BP基因片段并进行序列分析。方法根据GenBank已公布牛源无乳链球菌菌毛岛屿PI-2a的BP基因序列,采用Primer 5.0软件设计1对特异性引物,以内蒙古通辽地区分离的乳源性无乳链球菌临床菌株总DNA为模板PCR扩增BP基因片段,并进行生物信息学分析。结果克隆的BP基因序列大小为609bp,编码203个氨基酸残基,其基因序列与GenBank上公布的牛源无乳链球菌菌毛岛屿PI-2a的BP基因(EU930008)相似性为100%。菌毛岛屿骨架蛋白BP二级结构的α螺旋在N端分布较多;β折叠较丰富,且分布于C端较多;无规则卷曲分布较均匀。菌毛岛屿骨架蛋白BP的亲水区分布较广,遍布于整个多肽区,属于亲水性蛋白。BP蛋白分子表面可及性较高,区域占比达57.0%,且抗原性较好。结论奶牛乳腺炎无乳链球菌菌毛骨架蛋白BP基因具有高度保守性,其编码蛋白具有良好的抗原性,可作为防治无乳链球菌性乳腺炎的候选抗原序列。 展开更多
关键词 无乳链球菌 菌毛岛屿 bp基因 克隆 序列分析
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奶牛乳腺炎无乳链球菌菌毛岛屿PI-2a骨架蛋白BP基因的克隆及其序列分析 被引量:6
2
作者 白文丽 吴金花 +2 位作者 锡林高娃 布日额 王华 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第6期505-508,共4页
目的获得通辽地区奶牛乳腺炎致病菌无乳链球菌相关菌毛岛屿BP基因序列并进行比对分析。方法根据DNAMAN分析基因库中牛源无乳链球菌菌毛岛屿PI-2a的BP基因序列设计1对特异性引物,以无乳链球菌通辽分离株总DNA为模板,PCR扩增BP基因片段并... 目的获得通辽地区奶牛乳腺炎致病菌无乳链球菌相关菌毛岛屿BP基因序列并进行比对分析。方法根据DNAMAN分析基因库中牛源无乳链球菌菌毛岛屿PI-2a的BP基因序列设计1对特异性引物,以无乳链球菌通辽分离株总DNA为模板,PCR扩增BP基因片段并进行序列比对分析。结果获得了菌毛岛屿PI-2a的BP基因序列,目的基因为609bp,编码203个氨基酸,其基因序列与GenBank上公布的牛源无乳链球菌菌毛岛屿PI-2a的BP基因(EU930008)同源性为100%。BP蛋白二级结构的α螺旋在N端分布较多,β折叠较丰富且分布C端较多,无规则卷曲分布较均匀。BP蛋白的亲水区分布较广,遍布于整个蛋白区,属于亲水性蛋白。BP蛋白分子表面可及性较高,区域占比达57.0%,且具有抗原性。结论获得了奶牛乳腺炎无乳链球菌通辽分离株菌毛岛屿PI-2a骨架蛋白BP基因序列,该基因序列具有高度保守性,其编码蛋白具有抗原表位,可作为奶牛无乳链球菌重组基因工程疫苗候选亚单位抗原。 展开更多
关键词 无乳链球菌 菌毛岛屿 bp基因 克隆 序列分析
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牛乳腺炎无乳链球菌PI-2a菌毛岛屿BP亚基单克隆抗体胶体金标记试纸条制备 被引量:2
3
作者 布日额 吴金花 +2 位作者 锡林高娃 陈金龙 王金良 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期45-49,共5页
目的本研究通过优化牛乳腺炎无乳链球菌PI-2a菌毛岛屿BP亚单位单克隆抗体的性能,制备胶体金标记检测牛乳腺炎无乳链球菌的试纸条。方法利用pET30a(+)-BP重组质粒表达蛋白纯化物免疫小鼠,无菌取脾细胞与sp2/0骨髓瘤细胞融合,筛选杂交瘤细... 目的本研究通过优化牛乳腺炎无乳链球菌PI-2a菌毛岛屿BP亚单位单克隆抗体的性能,制备胶体金标记检测牛乳腺炎无乳链球菌的试纸条。方法利用pET30a(+)-BP重组质粒表达蛋白纯化物免疫小鼠,无菌取脾细胞与sp2/0骨髓瘤细胞融合,筛选杂交瘤细胞,制备单克隆抗体,对单克隆抗体进行胶体金标记后制备检测试剂盒,并确定其灵敏度、特异性等技术指标。结果经数轮筛选,获得1株阳性杂交瘤细胞株,抗体效价达到1∶25600。胶体金标记试纸条灵敏度量达到10~6 CFU/mL。特异性测试结果表明,胶体金标记试纸条与金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌、副结核杆菌、化脓性链球菌培养物人工污染的牛乳样均无阳性反应,只与无乳链球菌乳样出现阳性结果。结论该胶体金标记免疫层析试纸条,具有实际应用价值,将为牛乳腺炎的筛查检测提供新型、便捷的技术产品。 展开更多
关键词 无乳链球菌 bp基因 单克隆抗体 胶体金
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应用差异显示从高低转移癌系克隆出基因G3BP 被引量:4
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作者 刘宇欣 郑杰 +2 位作者 方伟岗 由江峰 吴秉铨 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期267-271,共5页
目的 以 m R N A 差异显示技术对比研究具有不同转移潜能的癌系,克隆与肿瘤转移相关的基因。方法 以肺巨细胞癌细胞系 P G 具有不同转移潜能的亚系( B E1, L H7)为研究对象,应用 m R N A 差异显示技术克隆差... 目的 以 m R N A 差异显示技术对比研究具有不同转移潜能的癌系,克隆与肿瘤转移相关的基因。方法 以肺巨细胞癌细胞系 P G 具有不同转移潜能的亚系( B E1, L H7)为研究对象,应用 m R N A 差异显示技术克隆差异片段,经 Northern 杂交验证后测序,进入 Gen Bank 数据库检验同源性。结果 m R N A 差异显示技术对比高低转移癌系m R N A,分别建立了高低转移相关基因资源库。其中一个849 bp 片段在高转移亚系( B E1)低表达,而在不转移亚系( L H7)高表达,两者差异显著,经 Gen Bank Blastn 检索,与 G3 B P( Ras G T Pase Activating protein S H3 dom ain bindingprotein)同源性高达 99% 。结论 在高低转移癌系中 G3 B P的表达具有显著差异,提示 G3 B P与肿瘤的转移表型有一定相关性,为 G3 B P功能的研究提供了新的线索。 展开更多
关键词 肺肿瘤 肿瘤转移 G3bp基因 肿瘤细胞
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HLA-G 14bp基因多态性及HLA-G mRNA表达水平与原因不明复发性流产的关系 被引量:9
5
作者 邵剑春 胡大春 +2 位作者 陈俊 刘云东 王中弥 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期698-701,共4页
目的:探讨人类白细胞抗原G 14bp(HLA-G 14bp)基因缺失或插入多态性与原因不明复发性流产(URSA)的相关性,了解HLA-G mRNA在URSA患者中的表达水平和意义。方法:选择URSA患者39例(URSA组)和有1次以上正常分娩史并行人工流产的妇女52例(正... 目的:探讨人类白细胞抗原G 14bp(HLA-G 14bp)基因缺失或插入多态性与原因不明复发性流产(URSA)的相关性,了解HLA-G mRNA在URSA患者中的表达水平和意义。方法:选择URSA患者39例(URSA组)和有1次以上正常分娩史并行人工流产的妇女52例(正常对照组)为研究对象,采用聚合酶链反应(PCR)检测14bp基因多态性和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测两组人群绒毛组织中HLA-G mRNA的相对表达量,并进行分析。结果:URSA组14bp基因杂合子(-14bp/+14bp)的基因频率(64.1%)明显高于正常对照组(42.3%)(χ2=6.511,P=0.039);而插入纯合子(+14bp/+14bp)的基因频率(7.7%)低于正常对照组(26.9%)(χ2=5.425,P=0.020);缺失纯合子(-14bp/-14bp)的基因频率(28.2%)与正常对照组(30.8%)比较,差异无统计学意义(χ2=0.070,P=0.791)。URSA组HLA-G mRNA表达水平(-3.018±1.005)明显低于正常对照组(-1.072±0.436)(t=9.681,P=0.000)。结论:14bp基因为-14bp/+14bp杂合子时增加了发病的机会,早期绒毛中HLA-G mRNA低水平表达与URSA发生密切相关。 展开更多
关键词 原因不明复发性流产 人类白细胞抗原G 14bp基因 基因多态性
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miR-4660对肝癌细胞迁移和侵袭的影响及其机制 被引量:3
6
作者 刘翠华 邓林林 +7 位作者 赵方新 红梅 武建强 温琪 赵旭 郝咪咪 石韵隽 张烜 《山西医科大学学报》 CAS 2023年第1期1-8,共8页
目的探讨miR-4660对肝癌细胞SK-HEP-1侵袭和迁移的影响及其作用机制。方法利用癌症数据在线分析网站UALCAN分析肿瘤基因组图谱数据库TCGA中肝细胞癌组织中半乳糖凝集素3结合蛋白(LGALS3BP)基因表达,miRNA靶基因预测网站Targetscan在线预... 目的探讨miR-4660对肝癌细胞SK-HEP-1侵袭和迁移的影响及其作用机制。方法利用癌症数据在线分析网站UALCAN分析肿瘤基因组图谱数据库TCGA中肝细胞癌组织中半乳糖凝集素3结合蛋白(LGALS3BP)基因表达,miRNA靶基因预测网站Targetscan在线预测miR-4660与LGALS3BP基因3′非翻译区(3′UTR)的结合关系。利用双荧光素酶报告基因实验验证miR-4660与LGALS3BP基因之间的调控关系。分别将miR-4660模拟物(mimics)、抑制剂(inhibitor)及其阴性对照(miR-NC)转染至人SK-HEP-1细胞,实时定量PCR(qRT-PCR)及Western blot检测LGALS3BP基因及PI3K/Akt信号通路蛋白p-PI3K、PI3K、p-Akt、Akt的表达水平。细胞划痕及Transwell实验检测细胞的迁移及侵袭能力。结果UALCAN分析显示,相对于正常组织,在肝细胞癌组织中LGALS3BP显著高表达(P<0.05)。Targetscan预测到,miR-4660在LGALS3BP 3′UTR区有两个结合位点。双荧光报告基因实验显示,miR-4660 mimic组野生型重组载体pGL3-LGAL-W-3′UTR、位点1或位点2单独突变的重组载体(pGL3-LGAL-M1-3′UTR和pGL3-LGAL-M2-3′UTR)的相对荧光素酶活性均低于miR-NC组(P<0.05)。qRT-PCR及Western blot结果显示,miR-4660 mimic组LGALS3BP基因在mRNA及蛋白水平的表达,p-PI3K、p-Akt蛋白的表达均低于未转染组及miR-NC组(P<0.05),miR-4660 inhibitor组上述指标均高于miR-NC组(P<0.05)。细胞划痕及Transwell实验发现,过表达miR-4660后SK-HEP-1细胞的迁移及侵袭能力明显下降(P<0.05)。结论miR-4660通过下调靶基因LGALS3BP的表达进而降低PI3K/Akt信号通路活性,抑制肝癌SK-HEP-1细胞的迁移及侵袭。 展开更多
关键词 肝癌 miR-4660 LGALS3bp基因 迁移 侵袭
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HLA-G14bp基因多态性与原因不明复发性流产的相关性 被引量:3
7
作者 王丽萍 孙燕 《临床合理用药杂志》 2013年第11期3-5,共3页
目的探讨人类白细胞抗原G(HLA-G)14bp插入/缺失多态性及HLA-G蛋白在绒毛滋养层细胞的表达与原因不明复发性流产(URSA)的关系。方法应用聚合酶链反应(PCR)法检测42例URSA患者(URSA组)和56例正常早孕妇女(对照组)的绒毛组织HLA-G14bp插入... 目的探讨人类白细胞抗原G(HLA-G)14bp插入/缺失多态性及HLA-G蛋白在绒毛滋养层细胞的表达与原因不明复发性流产(URSA)的关系。方法应用聚合酶链反应(PCR)法检测42例URSA患者(URSA组)和56例正常早孕妇女(对照组)的绒毛组织HLA-G14bp插入/缺失基因型,另从2组中各随机选取23例应用免疫组化法(SP)检测HLA-G蛋白在绒毛滋养层细胞的表达情况。结果 URSA组14bp插入的等位基因频率较对照组高(P<0.05);HLA-G蛋白在对照组绒毛外滋养层细胞呈强表达,在URSA组绒毛组织则呈弱表达(P<0.05)。结论 HLA-G14bp插入/缺失多态性影响绒毛组织HLA-G的表达,与URSA的发生有关。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原G 原因不明复发性流产 14bp基因 多态性
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海南地区汉、黎族重度子痫前期与HLA-G 14bp基因多态性的对比分析 被引量:3
8
作者 郑林媚 唐荣 +4 位作者 王莉 陈小菊 施蕾 陈文忱 周忠义 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期280-284,共5页
目的:探讨人类白细胞抗原(HLA)-G第8外显子14bp基因多态性在海南汉、黎族重度子痫前期(sPE)中的意义。方法:收集2016年1月至2017年7月在海南省人民医院产科分娩的正常妊娠妇女128例(汉族68例和黎族60例)及sPE患者102例(汉族55例和黎族47... 目的:探讨人类白细胞抗原(HLA)-G第8外显子14bp基因多态性在海南汉、黎族重度子痫前期(sPE)中的意义。方法:收集2016年1月至2017年7月在海南省人民医院产科分娩的正常妊娠妇女128例(汉族68例和黎族60例)及sPE患者102例(汉族55例和黎族47例)的血标本,应用PCR及直接测序法对HLA-G的14bp位点的等位基因及基因型进行分型,比较两个民族组间该位点的等位基因及基因型频率分布是否存在差异。结果:各组14bp位点可检测出3种基因型:即+14bp/+14bp型、+14bp/-14bp型和-14bp/-14bp型。不同民族间比较:汉族正常对照组与黎族正常对照组,汉族sPE组和黎族sPE组的HLA-G 14bp等位基因和基因型频率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。相同民族间比较:汉族sPE组HLA-G 14bp等位基因和3种基因型频率与汉族正常对照组比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。黎族sPE组-14bp等位基因频率低于黎族正常对照组(54.4%vs 64.3%,P<0.05)。黎族sPE组HLA-G-14bp/-14bp基因型频率低于黎族正常对照组(22.2%vs 42.9%,P<0.05),而-14bp/+14bp基因型频率高于黎族正常对照组(64.4%vs 42.9%,P<0.05),两组+14bp/+14bp基因型频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:HLA-G基因第8外显子14bp缺失多态性的存在可能有利于降低孕妇PE的发生发展,可能与种族差异有关。 展开更多
关键词 重度子痫前期 人类白细胞抗原-G 14bp基因多态性 种族
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Cochlear mitochondrial DNA3867bp deletion in aged mice
9
作者 张欣欣 韩东一 +4 位作者 丁大连 戴朴 杨伟炎 姜泗长 Richard J.Salvi 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2002年第9期1390-1393,155,共4页
OBJECTIVES: To study the status of cochlear mitochondrial DNA (mtDNA) and to determine the location of mtDNA deletion in aged mice. METHODS: We detected cochlear mtDNA in 2, 7 - 10 and 17 - 19 month old mice by nested... OBJECTIVES: To study the status of cochlear mitochondrial DNA (mtDNA) and to determine the location of mtDNA deletion in aged mice. METHODS: We detected cochlear mtDNA in 2, 7 - 10 and 17 - 19 month old mice by nested polymerase chain reaction (PCR) and DNA sequencing. RESULTS: mtDNA3867bp deletions were found in the cochleae of aged mice. The deletion occurred within nt9103-nt12970 and were flanked by 15 base pair direct repeats. Comparing the incidence of mtDNA3867bp deletions, 17 - 19 month old mice (7/8) were significantly higher than 7 - 10 month old mice (4/16). The deletion was not observed in 2 month old mice (0/7). The ratio of deleted mtDNA/total mtDNA in 17 - 19 month old mice was higher than in 7 - 10 month old mice (P 展开更多
关键词 Sequence Deletion Aging Animals Base Sequence COCHLEA DNA Mitochondrial Mice Molecular Sequence Data Oxidative Phosphorylation PRESBYCUSIS Research Support Non-U.S. Gov't
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土壤中弓形虫半套式PCR检测方法的建立 被引量:2
10
作者 孟鹏 叶强 +2 位作者 王萌 张德林 赵晋军 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期19-23,31,共6页
根据NCBI上公布的弓形虫RH株的529bp基因序列(登录号:AF146527)用Primer Premier 5.0设计3条特异性引物TX1、TX2和TX3,建立土壤中弓形虫的半套式PCR检测方法,并将引物TX1与TX3扩增产物克隆到pMD18-T载体上进行测序.结果表明:该方法能扩... 根据NCBI上公布的弓形虫RH株的529bp基因序列(登录号:AF146527)用Primer Premier 5.0设计3条特异性引物TX1、TX2和TX3,建立土壤中弓形虫的半套式PCR检测方法,并将引物TX1与TX3扩增产物克隆到pMD18-T载体上进行测序.结果表明:该方法能扩增出约350bp的片段,TX1与TX3扩增片段约520bp,克隆到pMD18-T载体上的521bp片段与所选取的弓形虫RH株的目的基因序列相似性100%.该检测方法特异性强,以犬新孢子虫、牛微小隐孢子虫、牛巴贝斯虫、环形泰勒虫、牛链球菌、猪链球菌、蒙氏肠球菌基因组为模板均未扩增出条带;灵敏性高,检测极限为20fg弓形虫DNA;在22份土壤样品中检出3份阳性样品. 展开更多
关键词 土壤 弓形虫 529 bp基因序列 半套式PCR
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基于生物信息学分析IGF2BP基因家族在肝癌中的预后价值及中药靶向治疗的研究 被引量:1
11
作者 周金爱 陈源红 杨建波 《蛇志》 2023年第2期185-190,205,共7页
目的 研究胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白(IGF2BP)家族在人类肝癌中的表达和预后价值。方法 通过ULCAN数据库分析IGF2BP基因家族在肝癌中的表达水平。采用Kaplan-Meier plotter数据库评估IGF2BP基因家族的表达与肝癌患者预后的相关性,... 目的 研究胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白(IGF2BP)家族在人类肝癌中的表达和预后价值。方法 通过ULCAN数据库分析IGF2BP基因家族在肝癌中的表达水平。采用Kaplan-Meier plotter数据库评估IGF2BP基因家族的表达与肝癌患者预后的相关性,使用LinkedOmics数据库探索IGF2BP家族在TCGA肝癌患者组织中共表达基因情况,通过DAVID数据库对差异基因进行KEGG通路富集分析,通过cBioPortal数据库分析IGF2BP家族的表达与甲基化相关性,并基于TIMER数据库分析IGF2BP基因家族与各种肿瘤浸润免疫细胞的相关性。结果 IGF2BP基因家族在肝癌组织中呈高表达。IGF2BP1、IGF2BP2和IGF2BP3的高表达与肝癌患者总生存率显著相关。与IGF2BP1和IGF2BP2表达存在互作的差异性基因有ARID3A、SALL2、C2orf29、SALL2、SALL4,与IGF2BP3表达关联紧密的基因有MYBL2、KIF2C、DEPDC1B、TTK、KIAA1524、BLM等。它们主要富集在代谢途径、视黄醇新陈代谢、咖啡因代谢、药物代谢-细胞色素P450、细胞周期、化学致癌作用、DNA复制等通路。在肝癌中IGF2BP家族的高表达与甲基化相关,IGF2BP基因家族的表达与6种肿瘤免疫细胞变化相关。结论 IGF2BP家族的表达与预后、甲基化密切相关,其可能通过影响免疫细胞的浸润相关通路调控肝癌的发生与发展,有望作为肝癌的潜在治疗靶标。 展开更多
关键词 肝癌 IGF2bp基因家族 预后 生物信息学 中药
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HLA-G 14bp缺失多态性与原因不明习惯性流产相关性研究 被引量:2
12
作者 李彩球 章霞 +2 位作者 包卫光 林爱芬 颜卫华 《浙江实用医学》 2009年第6期449-450,共2页
目的探讨HLA-G基因14bp缺失多态性与原因不明习惯性流产(RSA)的关系。方法利用聚合酶链反应(PCR)和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法对79例RSA患者和109例正常妊娠妇女HLA-G 14bp缺失多态性进行比较分析。结果RSA患者组HLA-G 14bp插入(+14bp... 目的探讨HLA-G基因14bp缺失多态性与原因不明习惯性流产(RSA)的关系。方法利用聚合酶链反应(PCR)和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法对79例RSA患者和109例正常妊娠妇女HLA-G 14bp缺失多态性进行比较分析。结果RSA患者组HLA-G 14bp插入(+14bp)等位基因频率明显高于正常对照组(χ2=4.92,P=0.026)。结论HLA-G 14bp缺失多态性可能是RSA遗传易感性的危险因素。 展开更多
关键词 习惯性流产 不明原因 HLA—G 14bp基因多态性
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马耳它布氏杆菌bp26基因缺失株的构建及鉴定 被引量:16
13
作者 胡森 郑孝辉 +8 位作者 王加兰 张倩 刘文兴 王喜军 乔祖建 刘林涛 高红霞 王君伟 步志高 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期583-586,共4页
为了建立马耳他布氏杆菌M5-90株弱毒疫苗株与野生株的鉴别诊断,本研究以bp26基因作为重组靶位点,以M5-90为亲本,利用bp26基因ORF外侧序列作为同源序列,将卡那霉素抗性基因(Kanr)整合到细菌基因组中,双交叉重组阳性菌株,经SDS-PAGE和west... 为了建立马耳他布氏杆菌M5-90株弱毒疫苗株与野生株的鉴别诊断,本研究以bp26基因作为重组靶位点,以M5-90为亲本,利用bp26基因ORF外侧序列作为同源序列,将卡那霉素抗性基因(Kanr)整合到细菌基因组中,双交叉重组阳性菌株,经SDS-PAGE和western blot试验表明迁移率约为29ku的BP26蛋白在亲本菌中表达并可被鼠抗BP26高免血清识别,而突变株M5-90-26反应结果为阴性,表明BP26蛋白在突变疫苗株M5-90-26中未表达。M5-90-26具备从血清学角度区分M5-90-26免疫与野生型布氏杆菌感染,对布氏杆菌病防制、监测及净化具有重要的意义。 展开更多
关键词 重组布氏杆菌 M5—90 bp26基因 突变株
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布鲁氏菌bp26基因缺失株的构建 被引量:17
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作者 潘文 王佳莹 +5 位作者 赵明秋 琚春梅 易琳 常艳 虞红娇 陈金顶 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期280-286,共7页
选择含有反向筛选基因sacB标记的pRE112质粒为自杀载体,利用等位基因交换的方法成功敲除了布鲁氏菌弱毒疫苗S19株、S2株、M5株的bp26基因,构建了具有非抗性基因标记的缺失株S19-Δbp26、S2-Δbp26、M5-Δbp26。将构建的重组自杀质粒pRE-... 选择含有反向筛选基因sacB标记的pRE112质粒为自杀载体,利用等位基因交换的方法成功敲除了布鲁氏菌弱毒疫苗S19株、S2株、M5株的bp26基因,构建了具有非抗性基因标记的缺失株S19-Δbp26、S2-Δbp26、M5-Δbp26。将构建的重组自杀质粒pRE-Δbp26(缺失了bp26基因的681个碱基)电转化入布鲁氏菌后,经过5μg/mL氯霉素筛选单交换子和70g/L蔗糖筛选同源重组双交换子,用菌落PCR及DNA测序的方法进行验证。结果表明,bp26基因的缺失改造成功,连续传20代后菌落PCR及DNA测序的结果显示突变株具有遗传稳定性。以pRE112自杀质粒为基础构建无抗性基因标记的布鲁氏菌缺失株为布鲁氏菌的基因功能研究奠定了基础,同时Δbp26缺失株的构建可为新型布鲁氏菌疫苗的研制奠定基础。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 bp26基因 自杀质粒 基因缺失株
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同源异型盒基因BP1在乳腺癌组织中的表达及其临床意义 被引量:9
15
作者 于满 杨毅 +4 位作者 牛瑞芳 史玉荣 魏熙胤 张霖 王德发 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第7期855-859,共5页
背景与目的BP1(beta-protein1)基因是新近发现的转录因子,定位于染色体17q21-22,属同源异型盒基因DLX家族,在急性髓系白血病和急性T淋巴细胞白血病中均呈过度表达。本研究通过观察BP1mRNA在乳腺癌中的表达情况,分析并探讨其与乳腺癌临... 背景与目的BP1(beta-protein1)基因是新近发现的转录因子,定位于染色体17q21-22,属同源异型盒基因DLX家族,在急性髓系白血病和急性T淋巴细胞白血病中均呈过度表达。本研究通过观察BP1mRNA在乳腺癌中的表达情况,分析并探讨其与乳腺癌临床病理特征的关系。方法以β-actin基因作为参照,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术,检测82例乳腺肿瘤组织、12例近端肿瘤旁组织和10例远端癌旁组织中BP1mRNA的表达。结果82例肿瘤组织中有53例BP1阳性(64.63%),而在近端癌旁组和远端癌旁组中则表达很弱(16.67%)或不表达(0%),差异具有统计学意义(P<0.05)。BP1基因的过表达与组织学分级有关(P<0.05),而与肿瘤大小、有无淋巴结转移、病理类型、肿瘤家族史、初潮年龄、初产年龄、怀孕次数、绝经状况、雌激素受体及孕酮受体状态无关。结论BP1基因在部分乳腺癌中上调,其表达与肿瘤组织学分级有关。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 bp1基因 同源异型盒 基因表达 逆转录聚合酶链反应 诊断
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流产布鲁氏菌bp26和omp10基因的同源性分析 被引量:5
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作者 王军 王瑞 +1 位作者 申之义 杨莲茹 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期25-30,共6页
利用布鲁氏菌外膜蛋白bp26基因和omp10基因,对分离的布鲁氏菌和参考布鲁氏菌菌株进行克隆和序列分析,以明确分离的布鲁氏菌和参考布鲁氏菌菌株与基因库中的布鲁氏菌外膜蛋白bp26基因和omp10基因间的同源性。根据GenBank中的布鲁氏菌bp2... 利用布鲁氏菌外膜蛋白bp26基因和omp10基因,对分离的布鲁氏菌和参考布鲁氏菌菌株进行克隆和序列分析,以明确分离的布鲁氏菌和参考布鲁氏菌菌株与基因库中的布鲁氏菌外膜蛋白bp26基因和omp10基因间的同源性。根据GenBank中的布鲁氏菌bp26基因和omp10基因,分别设计合成了1对特异性引物,以提取的分离株布鲁氏菌和2株参考布鲁氏菌的总DNA为模板,通过PCR技术扩增得到了bp26基因和omp10基因,回收纯化后将这2个基因分别连接到pMD18-T载体上,热激发转化受体菌大肠杆菌DH5α,并进行质粒提取、PCR鉴定和测序。结果表明,bp26基因全长为995bp,包含1个由753bp的核苷酸组成的完整开放阅读框,分离菌株的同源性为100%,与参考菌株M5、S2的同源性分别为100%和99.9%,与参考序列S19、870的同源性分别为99.9%和100%;omp10基因全长531bp,包含1个由396bp的核苷酸组成的完整开放阅读框,分离菌株的同源性为100%,与参考菌株M5、S2的同源性均为100%,与参考序列544的同源性为99.7%。证实bp26基因和omp10基因在各种型间的同源性都在99%以上,表明这2个基因在布鲁氏菌属的细菌中是高度保守的。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 bp26基因 omp10基因 同源性 分析
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BP1基因在成人急性白血病中的表达 被引量:3
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作者 李慧 徐开林 +2 位作者 潘秀英 汪海岩 李振宇 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期38-40,共3页
目的 研究 β蛋白 1(BP1)基因在成人急性白血病中的表达并分析与急性白血病的关系。方法 用RT PCR方法分别检测 70例急性白血病患者、10名健康对照者及HEL细胞系中BP1基因的表达。结果 在正常人外周血、骨髓和完全缓解的患者骨髓中... 目的 研究 β蛋白 1(BP1)基因在成人急性白血病中的表达并分析与急性白血病的关系。方法 用RT PCR方法分别检测 70例急性白血病患者、10名健康对照者及HEL细胞系中BP1基因的表达。结果 在正常人外周血、骨髓和完全缓解的患者骨髓中均没有检测到BP1基因的表达 ;在急性髓系白血病 (AML)中BP1表达阳性率为 5 7% (35例中 2 0例 ) ,在AML M5中阳性率高达 80 % (10例中 8例 ) ;在急性淋巴细胞白血病中无表达。结论 BP1与AML有一定的相关性 ,可作为AML的一种分子标志。 展开更多
关键词 bp1基因 成人 急性白血病 RT-PCR法 原癌基因
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原位杂交法检测BP1基因在乳腺癌组织中表达 被引量:4
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作者 王洋 郑唯强 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期269-272,共4页
目的探讨BP1同源盒基因在乳腺癌中的表达及其与临床病理指标的关系。方法收集165例乳腺癌临床和病理资料,采用原位杂交法检测BP1的表达,同时用二步法进行ER、p53、PCNA、bcl2、cerbB2免疫组化染色。结果BP1基因表达率为67.88%,免疫组化:... 目的探讨BP1同源盒基因在乳腺癌中的表达及其与临床病理指标的关系。方法收集165例乳腺癌临床和病理资料,采用原位杂交法检测BP1的表达,同时用二步法进行ER、p53、PCNA、bcl2、cerbB2免疫组化染色。结果BP1基因表达率为67.88%,免疫组化:ER70.30%、p5349.09%、PCNA74.55%、bcl253.33%、cerbB275.52%。BP1与bcl2具有相关性(P<0.01),且均与ER相关(P<0.05),与p53呈负相关(P<0.05)。BP1与PCNA、cerbB2、患者年龄、组织学类型、淋巴结转移等无相关性。结论BP1可能通过某种非依赖p53基因调控机制,与bcl2、ER协同抑制肿瘤细胞的凋亡而参与乳腺癌的发生。 展开更多
关键词 bp1基因 原位杂交法 乳腺癌组织 检测 c-erbB-2 bcl-2 临床病理指标 免疫组化染色 基因调控机制 抑制肿瘤细胞 PCNA 同源盒基因 组织学类型 淋巴结转移 p53 病理资料 患者年龄 相关性 ER 表达及 二步法 表达率 负相关
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弥漫性大B细胞淋巴瘤组织中NF-κB p65、P-gp、CYP3A4表达变化及意义 被引量:6
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作者 朱斌 潘韶英 +1 位作者 赵红 丁志勇 《山东医药》 CAS 2014年第28期68-70,共3页
目的观察弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织中核转录因子κB(NF-κB)p65、P-糖蛋白(P-gp)及细胞色素P450 3A4(CYP3A4)的表达变化,并探讨其临床意义。方法采用免疫组化法检测86例DLBCL、30例反应增生性淋巴结组织中的NF-κB p65、P-gp及CYP... 目的观察弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织中核转录因子κB(NF-κB)p65、P-糖蛋白(P-gp)及细胞色素P450 3A4(CYP3A4)的表达变化,并探讨其临床意义。方法采用免疫组化法检测86例DLBCL、30例反应增生性淋巴结组织中的NF-κB p65、P-gp及CYP3A4。结果 DLBCL组织中NF-κB/p65、P-gp、CYP3A4阳性表达率分别为62.8%、57.0%、33.7%,淋巴增生组织中分别为23.3%、20.0%、13.3%,P均<0.05。DLBCL组织中NF-κB p65表达与淋巴瘤国际预后指数(IPI)、临床分期有关(P均<0.05),P-gp表达与结外病灶数、临床分期有关(P均<0.05),CYP3A4表达与IPI、临床分期有关(P均<0.05)。DLBCL组织中NF-κB p65与P-gp、CYP3A4表达呈正相关(r=0.593、0.452,P均<0.05),P-gp、CYP3A4表达无关。NF-κB p65、P-gp、CYP3A4阳性表达者2年总生存率,25.0%、36.7%、31.0%均显著低于阴性表达者68.8%、64.9%、68.4%,P均<0.05。结论 DLBCL组织中NF-κB p65、P-gp、CYP3A4高表达,有助于判定患者预后。 展开更多
关键词 淋巴肿瘤 弥漫性大B淋巴瘤 核转录因子κbp65基因 P-糖蛋白 细胞色素P450
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猪源G3BP1基因的稳定敲低PK-15细胞系构建及生物信息学分析 被引量:1
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作者 林馨倩 郭紫晶 +6 位作者 张瑞 向晗一 林含睿 黄雄挺 陈劲松 张志东 李彦敏 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期970-984,共15页
【背景】Ras-GTP酶活化蛋白SH3结构域结合蛋白1(Ras-GTPase-activating protein SH3 domain binding protein 1,G3BP1)是应激颗粒(stress granule,SG)的重要组成部分和标志性蛋白,在宿主抵抗病原体入侵过程中发挥重要作用。【目的】构建... 【背景】Ras-GTP酶活化蛋白SH3结构域结合蛋白1(Ras-GTPase-activating protein SH3 domain binding protein 1,G3BP1)是应激颗粒(stress granule,SG)的重要组成部分和标志性蛋白,在宿主抵抗病原体入侵过程中发挥重要作用。【目的】构建G3BP1稳定敲低的PK-15细胞系,探究敲低G3BP1基因对水泡性口炎病毒(vesicular stomatitis virus,VSV)、塞内卡病毒(seneca virus,SVV)和痘苗病毒(vaccinia virus,VACV)复制的影响和对肿瘤坏死因子-α(tumour necrosis factorα,TNF-α)、白细胞介素6(interleukin 6,IL-6)、抗黏病毒蛋白1(myxovirus resistance protein 1,Mx1)、干扰素刺激基因54(IFN-stimulated gene 54,ISG54)和干扰素β(interferonβ,IFN-β)表达的影响,并对该基因进行生物信息学分析。【方法】利用慢病毒载体构建稳定敲低G3BP1基因的PK-15细胞系,利用逆转录实时定量PCR(reverse transcription quantitative real-time PCR,RT-qPCR)和实时定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)分析敲低G3BP1基因对VSV、SVV和VACV复制的影响,利用RT-qPCR分析感染VSV、SVV和VACV后敲低G3BP1基因对TNF-α、IL-6、Mx1、ISG54和IFN-β的影响,通过在线工具对G3BP1基因进行生物信息学分析。【结果】RT-qPCR和免疫印迹(Western blotting,WB)结果显示成功构建稳定敲低G3BP1的PK-15细胞系;RT-qPCR和qPCR结果显示敲低G3BP1基因可极显著促进VSV和SVV的复制(P<0.0001),但对VACV的复制无显著影响(P>0.05);RT-qPCR结果显示VSV和SVV感染可显著或极显著促进TNF-α、IL-6、Mx1、ISG54和IFN-β的mRNA表达水平(P<0.05,P<0.0001),敲低G3BP1基因可极显著抑制上述细胞因子的mRNA表达(P<0.01,P<0.0001),RT-qPCR结果显示VACV感染可以极显著抑制上述细胞因子的mRNA表达(P<0.01,P<0.0001),敲低G3BP1基因对VACV抑制的细胞因子mRNA表达无显著影响(P>0.05);理化性质预测结果显示,猪源G3BP1蛋白存在30个磷酸化位点,具有不稳定性和亲水性,属于非跨膜和非分泌蛋白;蛋白质高级结构预测� 展开更多
关键词 PK-15细胞 G3bp1基因 细胞因子 生物信息学
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