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一种简单、有效的适于PCR操作的放线菌DNA提取方法 被引量:57
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作者 姜淑梅 张龙 +1 位作者 戴世鲲 李翔 《生物技术》 CAS CSCD 2007年第1期39-41,共3页
目的:利用改良酶法发展了一种从微量(几百微升)发酵液中快速安全的提取放线菌基因组DNA的方法。方法:利用溶菌酶破壁,蛋白酶K和SDS除蛋白,成功提取较高质量的放线菌基因组DNA,所得的DNA可作为PCR反应的模板进行16SrRNA等基因有效扩增。... 目的:利用改良酶法发展了一种从微量(几百微升)发酵液中快速安全的提取放线菌基因组DNA的方法。方法:利用溶菌酶破壁,蛋白酶K和SDS除蛋白,成功提取较高质量的放线菌基因组DNA,所得的DNA可作为PCR反应的模板进行16SrRNA等基因有效扩增。结果:能从海绵和土壤分离的放线菌中成功提取基因组DNA。结论:该方法操作简单、费用低廉、不使用酚、氯仿等有毒害作用有机试剂,非常适于长期从事放线菌操作的研究人员。为大量放线菌菌株的快速鉴别、高通量筛选和系统分类研究创造了条件。 展开更多
关键词 放线菌 基因组DNA提取 PCR 16S DNA
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我国放线菌系统学研究历史、现状及未来发展趋势 被引量:32
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作者 李文均 职晓阳 唐蜀昆 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1860-1873,共14页
放线菌系统学是以实现对放线菌进行分类、鉴定、命名为目标的基础学科,因此它是放线菌资源研究和开发利用的重要理论基础。自20世纪50年代起,我国放线菌系统学的奠基人阎逊初院士及同事们就开创了我国放线菌系统学的研究,经过近六十年... 放线菌系统学是以实现对放线菌进行分类、鉴定、命名为目标的基础学科,因此它是放线菌资源研究和开发利用的重要理论基础。自20世纪50年代起,我国放线菌系统学的奠基人阎逊初院士及同事们就开创了我国放线菌系统学的研究,经过近六十年、几代人的艰苦努力,我国放线菌系统学工作者在国际微生物系统学权威杂志(International Journal of Systematics and Evolutionary of Microbiology,IJSEM)发表的有关放线菌新分类单元的论文数量连续十年排名稳居前列,部分学者在国际上发表的某些改良的分类技术和新修订的分类系统等为国际同行所广泛采用,这些均标志着我国放线菌系统学研究在国际上已成为微生物系统学界的一支重要力量。本文全面介绍了我国放线菌系统学研究的发展历程,同时对其发展现状给予理性分析,并就未来发展方向进行了展望。 展开更多
关键词 放线菌 多样性 分类系统 系统学
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PCR法快速识别Actinobacteria的五种模板制备方法的比较 被引量:24
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作者 张玉琴 李文均 +2 位作者 陈国忠 杨颖 田新朋 《生物技术》 CAS CSCD 2004年第5期37-39,共3页
放线细菌的 2 3SrRNA基因序列具有较好的保守性和相对的可变性 ,被认为是快速筛选放线细菌的合适部位。能否快速有效地扩增特异性区间 ,聚合酶链反应 (PCR)扩增前的模板制备质量是关键 ,故比较了基因组DNA作为PCR模板的 5种制备方法。... 放线细菌的 2 3SrRNA基因序列具有较好的保守性和相对的可变性 ,被认为是快速筛选放线细菌的合适部位。能否快速有效地扩增特异性区间 ,聚合酶链反应 (PCR)扩增前的模板制备质量是关键 ,故比较了基因组DNA作为PCR模板的 5种制备方法。旨在寻找准确、快速、简便、经济的放线细菌筛选技术 ,为普通和极端环境放线细菌资源的研究和开发利用创造条件。 展开更多
关键词 放线细菌 Chelex-100法 基因组DNA提取
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“伯杰氏系统细菌学手册(第二版)”第5卷与我国的放线菌系统学研究 被引量:26
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作者 阮继生 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期521-530,共10页
"伯杰氏系统细菌学手册"(下文简称"伯杰氏手册"),是世界各国分类学家普遍接受的学术观点的汇总,集科学性、统一性和实用性于一身。2012年5月,随着"伯杰氏手册"第二版第5卷(放线菌专刊)分A、B两册出版,这... "伯杰氏系统细菌学手册"(下文简称"伯杰氏手册"),是世界各国分类学家普遍接受的学术观点的汇总,集科学性、统一性和实用性于一身。2012年5月,随着"伯杰氏手册"第二版第5卷(放线菌专刊)分A、B两册出版,这部经典巨著在Michael Goodfellow等的领导下精心组织并顺利完成。"伯杰氏手册"第5卷对放线菌分类系统做出了重大调整,正式建立了放线菌门,包括6个纲、23个目(含一个未确定目)、53个科、222个属、近3000个种,其分类阶元为细菌域、放线菌门,在门下为纲、目、科、属和种。"伯杰氏手册"收录了我国放线菌分类学研究的大量成果,这是我国四代放线菌分类学家们共同努力的结果。但需要指出的是,由于"伯杰氏手册"过于严谨、保守的著书宗旨与漫长的出版周期,对DNA基因多位点序列分析(MLSA)技术、基因芯片技术和基因组技术等在分类学领域中所做出的新研究成果采纳不足,而这部分内容或许在不久的将来会使原核生物分类学发生深刻的改变。 展开更多
关键词 “伯杰氏手册” 放线菌门 分类系统
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乳酸菌的系统分类概况 被引量:24
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作者 王阶平 刘波 +1 位作者 刘欣 刘芸 《生物资源》 CAS 2019年第6期471-485,共15页
乳酸菌是重要的益生菌资源,在食品、农业、化工业、医学等领域具有广阔的应用前景。目前,人们熟知的乳酸菌主要集中在乳杆菌属、双歧杆菌属、链球菌属、肠球菌属、乳球菌属、片球菌属和明串珠菌属等少数属种。为了拓宽人们对乳酸菌的认... 乳酸菌是重要的益生菌资源,在食品、农业、化工业、医学等领域具有广阔的应用前景。目前,人们熟知的乳酸菌主要集中在乳杆菌属、双歧杆菌属、链球菌属、肠球菌属、乳球菌属、片球菌属和明串珠菌属等少数属种。为了拓宽人们对乳酸菌的认知,本文就乳酸菌的系统分类学进行阐述。在系统分类学上,乳酸菌分别隶属于厚壁菌门4纲7目18科39属653种和放线菌门2纲2目3科12属88种。最后,对乳酸菌的益生作用、安全性与有效来源、益生潜能的体外评价指标等进行简要的讨论。 展开更多
关键词 乳酸菌 分类学 益生菌 厚壁菌门 放线菌门
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基于16S rRNA基因测序的黄连对2型糖尿病大鼠肠道微生物多样性影响研究 被引量:23
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作者 顾宁宁 张兴德 +4 位作者 郁红礼 谢辉 朱潇潇 李莹 郑兴忠 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第19期3998-4004,共7页
目的探索黄连提取物对2型糖尿病模型大鼠肠道微生物多样性的影响,探讨黄连治疗消渴证的机制。方法随机选取10只SD大鼠为对照组,其余大鼠采用特殊膳食诱导与ip链脲佐菌素(STZ)联合制备2型糖尿病模型,造模成功大鼠随机分为3组:模型组、黄... 目的探索黄连提取物对2型糖尿病模型大鼠肠道微生物多样性的影响,探讨黄连治疗消渴证的机制。方法随机选取10只SD大鼠为对照组,其余大鼠采用特殊膳食诱导与ip链脲佐菌素(STZ)联合制备2型糖尿病模型,造模成功大鼠随机分为3组:模型组、黄连提取物(4.36 g/kg)组、二甲双胍(0.097 g/kg)组,每组10只;各组均ig给药,对照组与模型组ig等体积的0.5%羟甲基纤维素钠(CMC-Na),每周监测体质量、血糖值各1次,给药4周后测定口服糖耐量以及胰岛素水平,给药4周后取其结肠内容物,进行16S rRNA基因测序。结果黄连提取物对2型糖尿病大鼠症状均有改善作用,16S rRNA基因得到了951个OTU,15个门、25个纲、43个目、69个科、182个属、357个种;门水平,模型组放线菌门(Actinobacteria)细菌的量明显高于对照组与黄连提取物组(P<0.05);脱铁杆菌门(Deferribacteres)只在模型组中检出;厚壁菌门(Firmicutes)、螺旋体门(Spirochaetae)、柔膜菌门(Tenericutes)、迷踪菌门(Elusimicrobia)在模型组中的量均高于对照组,而给予黄连提取物后,丰度有所降低;同时黄连提取物组中变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)的丰度略高于对照组与模型组。结论经膳食联合STZ诱导的2型糖尿病大鼠中放线菌门与脱铁杆菌门可能是潜在的标志菌;给予黄连提取物后,肠道菌群多样性发生改变,提示黄连提取物可以改善2型糖尿病大鼠肠道菌群紊乱。 展开更多
关键词 黄连 16S rRNA基因测序 肠道菌群 2型糖尿病 放线菌门 脱铁杆菌门
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茅尾海红树林土壤可培养放线菌多样性及其抗尖孢镰刀菌活性分析 被引量:22
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作者 吴家法 吴思婷 +7 位作者 李智鸣 肖尚荣 吴霜 张政 杨立芳 龙寒 禤金彩 姜明国 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期294-301,共8页
目的研究茅尾海红树林植物根际土壤放线菌多样性并进行抗菌活性筛选,为发现放线菌新物种以及新农用生防菌奠定基础。方法采用传统涂布分离方法和复合营养成分培养基,从25份红树林土壤样品中分离放线菌;通过PCR扩增菌株16S r RNA基因序列... 目的研究茅尾海红树林植物根际土壤放线菌多样性并进行抗菌活性筛选,为发现放线菌新物种以及新农用生防菌奠定基础。方法采用传统涂布分离方法和复合营养成分培养基,从25份红树林土壤样品中分离放线菌;通过PCR扩增菌株16S r RNA基因序列,并通过构建系统发育树研究放线菌多样性;采用纸片扩散法分析放线菌发酵液和乙酸乙酯萃取浓缩液对2种尖孢镰刀菌菌体拮抗和孢子萌发抑制活性。结果通过排重获得117株放线菌,16S r RNA基因序列比对分析表明117株放线菌分布于6个亚目10个科19个属,除优势菌属链霉菌属外,还发现纤维微球菌属,戈登菌属,栖白蚁菌属,拟诺卡菌属和植物放线孢菌属等稀有放线菌属;尖孢镰刀菌拮抗活性试验表面,共有23株放线菌在至少1个抗菌活性检测中显示为阳性,总阳性率为19.66%。结论广西北部湾茅尾海红树林根际土壤中存在丰富的放线菌资源,具有从中发现新物种和新型农用生防菌的潜力。 展开更多
关键词 红树林 放线菌 多样性 抗菌活性
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黄连解毒汤对健康大鼠肠道菌群结构影响的研究 被引量:21
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作者 周俊怡 周严严 +5 位作者 赵海誉 王宏洁 王彦礼 司南 杨健 边宝林 《浙江中医药大学学报》 CAS 2018年第10期804-809,共6页
[目的]研究黄连解毒汤对健康大鼠肠道菌群结构的影响。[方法]雄性Wistar大鼠20只依据体重分为空白对照组和黄连解毒汤组,每组各10只。黄连解毒汤组按照700mg/kg的剂量给予黄连解毒汤提取物溶液灌胃,空白对照组大鼠给予相同体积的0.9%氯... [目的]研究黄连解毒汤对健康大鼠肠道菌群结构的影响。[方法]雄性Wistar大鼠20只依据体重分为空白对照组和黄连解毒汤组,每组各10只。黄连解毒汤组按照700mg/kg的剂量给予黄连解毒汤提取物溶液灌胃,空白对照组大鼠给予相同体积的0.9%氯化钠溶液灌胃,两组均连续给药7d。7d后采用Illumina高通量测序技术检测两组大鼠的肠道菌群,寻找其中的差异菌群并对其进行生物学分析。[结果]在门水平菌群变化中,与空白对照组比较,服用黄连解毒汤临床剂量7d可以显著降低健康大鼠肠道中放线菌门和厚壁菌门细菌所占总菌的比例,两组差异具有统计学意义(P<0.05)。在属水平上,可以显著性降低健康大鼠肠道中Adlercreutzia菌、消化链球菌和克里斯滕森菌所占的比例,两组差异具有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。[结论]通过肠道菌群实验发现,黄连解毒汤临床剂量服用7d后可对健康大鼠的肠道菌群产生一定的调节作用。 展开更多
关键词 黄连解毒汤 肠道菌群 16S RRNA 放线菌门 厚壁菌门
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新疆青海极端环境发现大量未知放线菌(英文) 被引量:14
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作者 徐丽华 李文均 +7 位作者 崔晓龙 李铭刚 张利平 徐平 毛培宏 文孟良 李一青 姜成林 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2003年第3期283-292,共10页
从新疆、青海的重盐碱地区、盐湖采集样品 ,分离其中的嗜盐、嗜碱及低温放线菌 .研究了它们在几种盐的不同浓度 ,不同 pH条件下的生长情况 .利用多相分类程序进行鉴定 ,发现嗜盐放线菌、放线细菌的新科 1个 (Yaniaceae) ,新属 2个 (Yani... 从新疆、青海的重盐碱地区、盐湖采集样品 ,分离其中的嗜盐、嗜碱及低温放线菌 .研究了它们在几种盐的不同浓度 ,不同 pH条件下的生长情况 .利用多相分类程序进行鉴定 ,发现嗜盐放线菌、放线细菌的新科 1个 (Yaniaceae) ,新属 2个 (YaniaandStreptomonospora) ,新种 8个 ,嗜碱放线菌新种 4个 ,低温放线菌新种 1个 .对其中部分新种、新属做了描述 .认为新疆、青海的重盐碱地区蕴藏着大量的未知放线菌资源 ;新菌种必然有新基因 ,新产物 ,新活性和新用途 ,是药物开发的重要来源 . 展开更多
关键词 新疆 青海 放线菌 重盐碱地区 盐湖 生长情况 多相分类程序 基因 活性 药物开发
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浓香型白酒窖泥放线菌的群落结构及其多样性 被引量:17
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作者 刘茂柯 唐玉明 +3 位作者 赵珂 任道群 姚万春 田新惠 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期858-864,共7页
以泸州老窖1、50、100和400年窖泥为研究对象,采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)研究浓香型白酒窖泥放线菌的群落结构及其多样性。DGGE图谱显示,除1年样品外,其余窖底泥多样性指数(H)均低于同窖龄窖壁泥,但均匀度指数(EH)较高。不同窖池相同... 以泸州老窖1、50、100和400年窖泥为研究对象,采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)研究浓香型白酒窖泥放线菌的群落结构及其多样性。DGGE图谱显示,除1年样品外,其余窖底泥多样性指数(H)均低于同窖龄窖壁泥,但均匀度指数(EH)较高。不同窖池相同部位窖泥的群落结构变化趋势为:随窖龄的延长,窖壁泥H值逐渐上升,为1.74—2.28;窖底泥下降,为1.73—2.07。EH值均为波动下降,分别在0.986—0.991和0.971—0.994之间。窖底泥相似性系数(SC)逐渐上升,为0.46—0.82;窖壁泥为0.31—0.62。DGGE条带测序结果显示,窖泥放线菌归于Olsenella、Atopobium、Streptomyces和Corynebacterium 4个属。Olsenella和Atopobium属为共有的优势属,且在窖壁泥中的优势度(di)均随窖龄延长而降低,在窖底泥中升高。实验结果表明,浓香型白酒窖泥蕴藏着丰富的放线菌资源,群落结构和多样性存在差异,菌群演替呈现一定规律性。 展开更多
关键词 窖泥 放线菌 群落结构 演替 变性梯度凝胶电泳
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新型Actinobacteria荧光原位杂交(FISH)探针的设计和应用 被引量:8
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作者 余利岩 徐平 姚天爵 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期401-406,共6页
Actinobacteria是形态上变化各异的 ,具有超过 5 0 % G+ C的 DNA碱基组成的 ,革兰氏染色呈阳性的微生物 ,放线菌是 Actinobacteria的一个组成部分 ,它们可产生丰富的次级代谢产物。目前 ,临床上使用的抗生素中有三分之二来自于放线菌。... Actinobacteria是形态上变化各异的 ,具有超过 5 0 % G+ C的 DNA碱基组成的 ,革兰氏染色呈阳性的微生物 ,放线菌是 Actinobacteria的一个组成部分 ,它们可产生丰富的次级代谢产物。目前 ,临床上使用的抗生素中有三分之二来自于放线菌。具有普通细菌形态的 Actinobacteria由于和放线菌具有相近的共同祖先 ,可能会具有一些其它的共性 ,是目前药物筛选中一个新的研究对象 ,但很难用形态观察的方法将之和其它细菌加以区分。本论文利用此类微生物 16 Sr RNA基因同源性 ,设计了两个探针 PA- 1、PA- 2并运用荧光原位杂交方法进行 Actinobacteria的鉴定 ,G+ C含量测定结果表明 ,这两个探针联合使用可直观、正确地鉴定 Acti-nobacteria。 展开更多
关键词 actinobacteria 荧光原位杂交 核苷酸探针
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广东湛江红树林植物内生放线菌资源勘探及生物活性研究 被引量:15
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作者 许敏 李静 +11 位作者 戴素娟 高春燕 刘佳萌 庹利 王飞飞 李小俊 刘少伟 蒋忠科 罗辉 张海涛 江黎明 孙承航 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期26-34,共9页
目的勘探广东湛江红树林植物内生放线菌多样性,为发现放线菌新物种和新抗生素奠定基础。方法样品经表面消毒后粉碎,10种不同培养基分离放线菌;通过PCR扩增、测定并比对16S r RNA基因序列,开展放线菌多样性分析;经发酵,离心,乙酸乙酯萃... 目的勘探广东湛江红树林植物内生放线菌多样性,为发现放线菌新物种和新抗生素奠定基础。方法样品经表面消毒后粉碎,10种不同培养基分离放线菌;通过PCR扩增、测定并比对16S r RNA基因序列,开展放线菌多样性分析;经发酵,离心,乙酸乙酯萃取上清液,旋转蒸发获得浓缩物,甲醇溶解制成样品;采用纸片扩散法对样品进行抗菌活性筛选;采用96孔板法,以秀丽隐杆线虫为对象,对样品进行杀线虫活性筛选;基于PCR的基因筛选技术初步探测活性菌株NRPS、PKS I、PKS II抗生素生物合成基因簇。结果经形态特征排重,从11份植物样品中共得到放线菌159株,16S r RNA基因序列比对分析表明,它们分布于8个目12个科19个属,其中链霉菌属为优势菌属,菌株IP4SC6为海藻球菌属潜在新种;发酵88株放线菌,发酵液乙酸乙酯萃取浓缩物测活结果表明,至少对一株检定菌表现为阳性的菌株有46株,总阳性率为52.27%,其中36株菌可能存在抗生素生物合成基因簇,8株可能同时具有3种抗生素生物合成基因簇;对秀丽隐杆线虫有较强杀虫活性的放线菌有3株,LC50值分别为83.2,132.0和138.0mg/m L。结论广东湛江红树林植物中存在多样性丰富的药用放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种及新抗生素的潜力。 展开更多
关键词 红树林 放线菌 耐药菌 秀丽隐杆线虫 生物多样性
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类诺卡氏属放线菌的研究进展 被引量:15
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作者 杜慧竟 余利岩 张玉琴 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期671-678,共8页
Prauser H.最初于1976年从土壤中分离到17株诺卡氏形态放线菌,综合形态、生理生化特性和部分化学分类特征的研究结果,提议建立了一个新属——类诺卡氏属(Nocardioides),并以新种白色类诺卡氏菌(N.albus)为典型种。之后,随着分离、纯培... Prauser H.最初于1976年从土壤中分离到17株诺卡氏形态放线菌,综合形态、生理生化特性和部分化学分类特征的研究结果,提议建立了一个新属——类诺卡氏属(Nocardioides),并以新种白色类诺卡氏菌(N.albus)为典型种。之后,随着分离、纯培养和分类方法的发展,越来越多的新成员从各种不同环境中分离得到。尽管这些菌来源广泛,形态和生理生化等特征各异,但他们拥有共同的属的特征。过去的50年中,随着放线菌研究的发展,该属中部分成员历经了分类地位的变迁和修订。到目前为止,该属共收纳了56个有效描述种。类诺卡氏属(Nocardioides)放线菌在农业、工业、化工业等方面也曾有应用研究报道。本文就类诺卡氏属放线菌的建立依据,属的特征,属内种的分布和变更以及它们在工农业上的应用研究前景及进展进行了综述。 展开更多
关键词 类诺卡氏 放线菌 分类
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河北九莲城淖尔可培养放线菌多样性及抗菌活性筛选 被引量:15
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作者 李小俊 吴越 +5 位作者 张伟铭 李静 刘少伟 蒋忠科 黄大林 孙承航 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1473-1484,共12页
【目的】勘探干涸的九莲城淖尔土壤放线菌多样性并进行活性筛选,以期发现药用微生物资源,为新抗生素的发现奠定基础。【方法】采用15种分离培养基,以稀释涂布法分离放线菌;根据分离菌株的16S rRNA基因序列同源性分析放线菌多样性;发酵... 【目的】勘探干涸的九莲城淖尔土壤放线菌多样性并进行活性筛选,以期发现药用微生物资源,为新抗生素的发现奠定基础。【方法】采用15种分离培养基,以稀释涂布法分离放线菌;根据分离菌株的16S rRNA基因序列同源性分析放线菌多样性;发酵液经乙酸乙酯萃取,菌丝体经丙酮浸提,获得提取浓缩物样品;样品通过纸片扩散法进行抗菌活性初筛;抗菌阳性菌株采用PCR技术进行Ⅰ型聚酮合酶(PKS I)KS域、Ⅱ型聚酮合酶(PKS II)KS域和非核糖体多肽合成酶(NRPS)A结构域抗生素生物合成基因的检测。【结果】从11份盐湖土壤样品中分离纯化到251株放线菌,其分布于放线菌纲的10个目15个科31个属,其中优势菌属为链霉菌属和拟诺卡氏菌属;251株放线菌中包括57株耐(嗜)盐放线菌,其优势菌属为拟诺卡氏菌属(22株)和涅斯捷连科氏菌属(15株)。基于16S r RNA基因序列的系统发育分析显示,菌株J11Y309为糖霉菌科潜在新属,菌株J12GA03为分枝杆菌科潜在新种。96株放线菌活性检测结果显示,56株至少对1株检定菌具有抗菌活性,阳性率为58.3%;56株有活性的放线菌中,47株至少含有1种抗生素生物合成基因,其中17株同时具有3种抗生素生物合成基因。【结论】干涸的九莲城淖尔土壤中含有较为丰富的药用放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种和新抗生素的潜力。 展开更多
关键词 盐湖 放线菌 多样性 抗菌活性 耐药菌
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传统白酒固态发酵过程放线菌的研究进展 被引量:13
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作者 张建敏 黄永光 +2 位作者 周文美 程兰香 赵辰路 《酿酒科技》 北大核心 2013年第10期73-79,共7页
以固态发酵过程中放线菌的研究历史为主线,综述了固态发酵过程放线菌研究的发展历程,固态发酵过程放线菌数量、多样性、次生代谢产物以及基因组研究等方面,最后展望了我国固态发酵过程中放线菌研究存在的问题及未来发展的前景。
关键词 白酒 固态发酵 放线菌 分离 次生代谢产物 多样性
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新疆高盐环境土壤放线菌分离培养基比较 被引量:13
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作者 关统伟 赵珂 +3 位作者 夏占峰 吕玲玲 张小平 张利莉 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期429-431,共3页
根据采样点及其样品相关信息结合近几年对高盐环境放线菌的分离经验,设计出一种含有10%~30%复合盐的CMKA培养基,同时以补充10%~30%复合盐的高氏一号琼脂培养基(GA)、ISP4培养基、淀粉酪素琼脂培养基(SCK)和HV培养基为对照,对采集于新... 根据采样点及其样品相关信息结合近几年对高盐环境放线菌的分离经验,设计出一种含有10%~30%复合盐的CMKA培养基,同时以补充10%~30%复合盐的高氏一号琼脂培养基(GA)、ISP4培养基、淀粉酪素琼脂培养基(SCK)和HV培养基为对照,对采集于新疆阿克陶盐山、罗布泊洼地和阿克苏盐碱地的3份土壤样品利用上述5种培养基进行了分离.结果表明,CMKA培养基分离效果最好,共分离到7个属的放线菌(Actinopolyspora、Streptomonospora、Nocardiopsis、Saccharomonospora、Brevibacterium、Streptomyces和Amycolatopsis),并且获得1个放线菌新种(TRM F103).ISP4、GA、HV和SCK培养基分离效果较差,获得的属级分类单元少.同时,CMKA培养基的出菌率也是最高的,说明比较适合分离高盐环境土壤放线菌,而用于分离普通环境中放线菌的ISP4、GA、HV和SCK培养基则不适于高盐环境放线菌的分离.此外,新疆的高盐环境土壤中存在着丰富的放线菌资源,包括一些新类群的存在. 展开更多
关键词 高盐环境 放线菌 分离培养基
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Actinobacteria的分离与鉴别 被引量:3
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作者 余利岩 姚天爵 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期36-41,共6页
Actinobacteriaclassisnov .一般包括具有超过 5 0 %G +C的DNA碱基组成的微生物。实验中在分土培养基中 ,添加了Nalidixicacid及Aztreonam和Benlate ,从 4份土壤样品中 ,共分离得到 64株细菌 ,革兰氏阳性细菌共计 5 6株 ,占所分离菌株的... Actinobacteriaclassisnov .一般包括具有超过 5 0 %G +C的DNA碱基组成的微生物。实验中在分土培养基中 ,添加了Nalidixicacid及Aztreonam和Benlate ,从 4份土壤样品中 ,共分离得到 64株细菌 ,革兰氏阳性细菌共计 5 6株 ,占所分离菌株的 87 5 %。任意挑选其中的革兰氏阳性细菌 ,选用以高G +C含量革兰氏阳性细菌为靶点的PHGC探针及PNHGC对照探针 ,并联合使用我们自行设计的适用于Actonobacteria的PA 1和PA 2探针进行初筛菌株的鉴别。综合 4种探针的FISH的结果 ,我们可以判定在 31株分离株中 ,有 2 2株Acti nobacteria,6株低G +C含量革兰氏阳性细菌 ,其它 3株则不易判定。DNAG +C含量的测定结果表明 ,所建立的FISH方法可作为鉴别Actinobacteria的一种手段 ,它具有完整。 展开更多
关键词 actinobacteria 革兰氏阳性高G+C含量细菌 荧光原位杂交 FISH 放线菌
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PCR快速鉴定actinobacteria三种模板制备方法的比较 被引量:8
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作者 徐平 李文均 +1 位作者 徐丽华 姜成林 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第7期388-390,396,共4页
目的 本研究旨在建立准确、简便、快速的放线细菌鉴定技术 ,为普通和极端环境放线细菌资源的调查和开发利用创造条件。方法 从放线细菌固体培养基上挑取少量菌体 ,用微波炉法快速制备基因组DNA作为PCR模板 ,与液体培养法得到的菌体以... 目的 本研究旨在建立准确、简便、快速的放线细菌鉴定技术 ,为普通和极端环境放线细菌资源的调查和开发利用创造条件。方法 从放线细菌固体培养基上挑取少量菌体 ,用微波炉法快速制备基因组DNA作为PCR模板 ,与液体培养法得到的菌体以超声波法或冻融法制备的模板进行了PCR扩增效果的比较研究。结果 PCR检测结果表明微波炉法制备的模板可进行有效的体外扩增 ,目的条带特异 ,而超声波法或冻融法并不对所有菌株有效 ,并有非特异扩增产物产生。结论 组合微波炉法快速制备放线细菌基因组DNA技术和 2 3SrRNA特异插入序列PCR扩增技术建立了准确、简便、快速的actinobacteria鉴别体系。 展开更多
关键词 actinobacteria 微波炉法 超声波法 冻融法 基因组DNA提取 放线细菌 鉴定技术
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广西沿海地区红树林根系土壤中放线菌的分离与鉴定 被引量:12
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作者 骆耐香 陈森洲 +2 位作者 袁桂峰 徐雅娟 陈建宏 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期310-313,共4页
本研究通过分离纯培养,从广西北海及防城港红树林根系土壤中分离出放线菌并提取其总DNA,用放线菌通用引物对获得菌株的16S rDNA进行PCR扩增,对获得的扩增产物进行DNA序列测定及菌株鉴定。研究结果表明,从红树林根系土壤样品中分离出15... 本研究通过分离纯培养,从广西北海及防城港红树林根系土壤中分离出放线菌并提取其总DNA,用放线菌通用引物对获得菌株的16S rDNA进行PCR扩增,对获得的扩增产物进行DNA序列测定及菌株鉴定。研究结果表明,从红树林根系土壤样品中分离出15株典型放线菌菌株。16S rDNA测序比对鉴定结果显示,15株典型放线菌菌株中有12株属于链霉菌属(Streptomyces),是常见菌属;3株属于拟诺卡氏菌属(No-cardiopsis),为稀有放线菌。本研究分离纯化获得15株典型放线菌,初步揭示了广西沿海地区红树林土壤中放线菌的多样性。 展开更多
关键词 放线菌 红树林 土壤 分离 鉴定
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河南黄河湿地放线菌多样性及植物病害生防放线菌的筛选 被引量:12
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作者 习慧君 臧睿 +2 位作者 刘闯 赵莹 文才艺 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期642-656,共15页
【目的】探究河南黄河湿地放线菌多样性,筛选对植物病原菌有拮抗活性的放线菌菌株。【方法】基于Illumina HiSeq技术的高通量测序分析了河南黄河湿地放线菌物种多样性及其分布特点;利用8种分离培养基对采集自三门峡黄河湿地、郑州黄河... 【目的】探究河南黄河湿地放线菌多样性,筛选对植物病原菌有拮抗活性的放线菌菌株。【方法】基于Illumina HiSeq技术的高通量测序分析了河南黄河湿地放线菌物种多样性及其分布特点;利用8种分离培养基对采集自三门峡黄河湿地、郑州黄河湿地和开封黄河湿地21份土壤样品中的放线菌进行了分离纯化,通过16S rRNA基因序列分析对分离株进行了初步的分类鉴定和系统学研究;以7种植物病原菌为靶标筛选有拮抗活性的分离株,并对活性菌株进行了聚酮合酶、非核糖体多肽合成酶和安莎类化合物等基因筛查。【结果】高通量测序结果表明,河南黄河湿地放线菌物种多样性丰富,且不同湿地区域以及同一湿地不同生境间放线菌多样性存在显著差异,放线菌优势属物种依次为Nocardioides、Streptomyces、CL500-29 marine group、Fodinicola、Mycobacterium和Micromonospora,此外,还具有大量的未知类群;通过分离培养共获得了261株纯培养菌株,分布于放线菌门中的7个目9个科9个属,包含97个可能的已知物种和8个潜在新物种,对植物病原菌有拮抗活性的放线菌86株,其中74株中至少含有一种活性代谢物质合成相关基因。【结论】河南黄河湿地放线菌物种多样性丰富,具有发掘新物种和新型植物病害生防资源的潜力。 展开更多
关键词 黄河湿地 放线菌 多样性 生物活性
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