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基于高通量数据分析DNA甲基化和拷贝数畸变对C1orf26基因表达的影响
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作者 赵小芳 杜欣娜 《吉林医学》 CAS 2020年第6期1289-1291,共3页
目的:揭示乳腺癌中1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)DNA甲基化和拷贝数畸变对表达的影响。方法:利用癌症多组学和临床数据库LinkedOmics分析DNA甲基化和拷贝数畸变对乳腺癌组织中C1orf26基因表达的... 目的:揭示乳腺癌中1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)DNA甲基化和拷贝数畸变对表达的影响。方法:利用癌症多组学和临床数据库LinkedOmics分析DNA甲基化和拷贝数畸变对乳腺癌组织中C1orf26基因表达的影响。结果:C1orf26 mRNA水平与其基因拷贝数变化拷贝数畸变正相关(P<0.01),而与其DNA甲基化水平负相关(P<0.01);且LinkedOmics分析结果显示乳腺癌中C1orf26 mRNA水平分别受到组织学类型、肿瘤纯度和患者种族影响(P<0.05、P<0.01、P<0.01)。结论:C1orf26基因拷贝数畸变和DNA甲基化水平影响其表达,C1orf26可作为乳腺癌预后的潜在标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 1号染色体开放阅读框26 基因变化 预后
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基于TCGA分析乳腺癌中C1orf26基因的表达变化
2
作者 赵小芳 张金波 +1 位作者 杜欣娜 张虎 《黑龙江医药科学》 2020年第2期6-7,共2页
目的:揭示1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)在乳腺癌中的表达及其临床意义。方法:利用TCGA数据库门户网站cBioPortal、癌症芯片数据库Oncomine分析乳腺癌组织中C1orf26基因表达变化,C1orf26表达变化... 目的:揭示1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)在乳腺癌中的表达及其临床意义。方法:利用TCGA数据库门户网站cBioPortal、癌症芯片数据库Oncomine分析乳腺癌组织中C1orf26基因表达变化,C1orf26表达变化与患者预后关系。结果:cBioPortal网站分析结果显示963例乳腺癌患者中有223例患者C1orf26基因发生包括突变、拷贝数畸变和mRNA水平上调等变化,其中mRNA水平上调超过默认阈值(EXP>=2)的占比例为15%,且C1orf26高表达不利于患者预后(P<0.05);Oncomine分析结果显示浸润性乳腺癌中C1orf26 mRNA水平显著高于癌旁组织(P<0.01)。结论:乳腺癌中C1orf26基因表达上调,且不利于预后,C1orf26可作为乳腺癌预后的潜在标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 1号染色体开放阅读框26 预后
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