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丙型肝炎病毒非结构蛋白3人源单链抗体的筛选与鉴定 被引量:43
1
作者 钟彦伟 成军 +3 位作者 刘妍 董菁 杨继珍 张玲霞 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期84-87,共4页
目的 筛选、鉴定抗丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白 (NS) 3的人单链抗体 (ScFv) ,以解决鼠单抗的免疫原性问题 ,为HCV的基因治疗研究开辟新途径。方法 采用噬菌体表面展示技术 ,以重组的HCVNS3为包被抗原 ,从噬菌体单链可变区抗体库中经... 目的 筛选、鉴定抗丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白 (NS) 3的人单链抗体 (ScFv) ,以解决鼠单抗的免疫原性问题 ,为HCV的基因治疗研究开辟新途径。方法 采用噬菌体表面展示技术 ,以重组的HCVNS3为包被抗原 ,从噬菌体单链可变区抗体库中经过 5轮“吸附 洗脱 扩增”筛选过程 ,获得抗原结合活性较强的HCVNS3人单链抗体 (ScFv片段 )阳性克隆 ,并对其进行免疫及序列测定。结果 筛选出来的ScFv片段具有抗NS3的特异性。结论 利用噬菌体抗体库技术 。 展开更多
关键词 HCV 丙型肝炎 结构蛋白3 单链噬菌体抗体
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应用抑制性消减杂交技术克隆丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3反式激活的相关基因 被引量:20
2
作者 牟劲松 刘妍 +6 位作者 王刚 成军 段惠娟 李克 陆荫英 王琳 王惠芬 《世界华人消化杂志》 CAS 2003年第4期399-403,共5页
目的:应用抑制性消减杂交技术(SSH)构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活的相关基因cDNA消减文库,克隆HCV NS3反式激活相关基因。方法:以HCV NS3表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后... 目的:应用抑制性消减杂交技术(SSH)构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活的相关基因cDNA消减文库,克隆HCV NS3反式激活相关基因。方法:以HCV NS3表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,提取mRNA并逆转录为cDNA,经RsaI酶切后,将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析。结果:文库扩增后得到70个白色克隆,经菌落PCR分析,得到56个200-1000 b插入片段。对所得片段测序,并进行同源性分析,获得6个差异表达的未知序列,可能是NS3反式激活的新的靶基因。结论:成功构建HCV NS3反式激活的相关基因cDNA消减文库,为今后进一步分析、研究病毒蛋白的致病机制奠定基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 抑制性消减杂交技术 结构蛋白3 克隆 细胞裂解液 病毒蛋白 NS3 反式激活 基因
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基因表达谱芯片技术筛选丙型肝炎病毒非结构蛋白3反式调节靶基因 被引量:15
3
作者 成军 刘妍 +2 位作者 洪源 王建军 杨倩 《世界华人消化杂志》 CAS 2003年第7期930-934,共5页
目的:丙型肝炎病毒(HCV)的非结构蛋白3(non-structural protein 3,NS3)是由HCV基因组编码的具有多种功能的蛋白质.NS3蛋白的表达对于HCV感染肝细胞的基因表达谱具有显著影响.为了研究NS3蛋白反式调节的靶基因,我们应用基因芯片技术对于p... 目的:丙型肝炎病毒(HCV)的非结构蛋白3(non-structural protein 3,NS3)是由HCV基因组编码的具有多种功能的蛋白质.NS3蛋白的表达对于HCV感染肝细胞的基因表达谱具有显著影响.为了研究NS3蛋白反式调节的靶基因,我们应用基因芯片技术对于pcDNA3.1(-)和pcDNA3.1(-)-NS3分别转染的HepG2细胞的基因表达谱进行分析.方法:以含有HCV-H全基因组cDNA的质粒pBRTM3011作为模板,应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增NS3蛋白编码基因片段,以常规的分子生物学技术构建表达载体pcDNA3.1(-)-NS3.以脂质体技术转染肝母细胞瘤细胞系HepG2,提取总mRNA,逆转录为cDNA,与转染空白表达载体pcDNA3.1(-)的HepG2细胞进行DNA芯片分析并比较.结果:构建的表达载体经过限制性内切酶分析和DNA序列测定,证实准确无误.以单链可变区抗体的Western blot杂交技术证实构建的表达载体转染hepG2细胞之后有NS3蛋白的表达,提取高质量的总mRNA并进行逆转录成为cDNA,进行DNA芯片技术分析.在1 152个基因表达谱的筛选中,发现有34个基因表达水平显著上调,37个基因表达水平显著下调.结论:HCV的NS3蛋白是一种反式激活因子.NS3基因的表达对于肝细胞基因表达谱有显著影响.DNA芯片技术是分析反式激活靶基因的有效技术途径. 展开更多
关键词 基因表达谱 基因芯片技术 筛选 丙型肝炎病毒 结构蛋白3 反式调节 靶基因
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HCVNS3基因片段酵母展示文库的构建和鉴定 被引量:8
4
作者 贾帅争 孙红琰 +4 位作者 刘晓达 杜芝燕 杜勇 王全立 章扬培 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期56-60,共5页
HCV NS3特异的 CD4+T细胞反应与 HCV感染的良性转归相关 .为了筛选其 CD4+T细胞表位 ,构建了 HCV NS3基因片段酵母展示文库 .首先 DNase 不完全酶切 HCV NS3基因产生长度为 1 0 0~ 30 0 bp的随机片段 ,然后在它们两端加上含限制性内切... HCV NS3特异的 CD4+T细胞反应与 HCV感染的良性转归相关 .为了筛选其 CD4+T细胞表位 ,构建了 HCV NS3基因片段酵母展示文库 .首先 DNase 不完全酶切 HCV NS3基因产生长度为 1 0 0~ 30 0 bp的随机片段 ,然后在它们两端加上含限制性内切酶 Bam H 作用位点的接头 ,再以接头序列作引物进行 PCR扩增 .最后扩增产物用 Bam H 酶切后与 Bam H 线性化的穿梭载体 p YD1连接 ,转化大肠杆菌 (E.coli) DH5α,共得到 2× 1 0 6个转化子 .转化菌落的 PCR扩增结果表明 ,约 50 %转化子含插入片段 .随机选择 5个插入片段测序 ,然后与 DNA序列数据库中的序列比较 .结果显示它们分别与 HCV NS3序列有 96%~ 99%的同源性 .用从转化菌落中提取的质粒转化酵母 (S.cerevisiae)菌株 EBY1 0 0 ,得到含 2× 1 0 5个插入片段的 HCV NS3基因片段酵母展示文库 .半乳糖诱导的酵母细胞通过和 FITC标记的抗体结合 ,用 FACS可以在 2 0 %的细胞表面检测到融合蛋白的表达 . 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 结构蛋白3 酵母展示 基因片段随机文库
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HCV NS3/4A基因外来表达对Huh7细胞凋亡及DNA损伤应答的影响 被引量:8
5
作者 任来峰 唐子执 +4 位作者 吴惠文 许宁 刘刚 曾鸣 郭莲娣 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1110-1115,共6页
NS3/4A是丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)编码的丝氨酸蛋白酶复合体,是病毒完成自身复制周期的必要成分。该研究为调查NS3/4A对细胞凋亡及DNA损伤应答(DNA-damage response,DDR)的影响,在Huh7细胞中表达了外来NS3/4A基因。通过DAP... NS3/4A是丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)编码的丝氨酸蛋白酶复合体,是病毒完成自身复制周期的必要成分。该研究为调查NS3/4A对细胞凋亡及DNA损伤应答(DNA-damage response,DDR)的影响,在Huh7细胞中表达了外来NS3/4A基因。通过DAPI染色和MTT分析显示,外来表达NS3/4A显著诱导细胞的凋亡和增殖活力的下降。免疫荧光检测结果表明,NS3/4A可明显增加细胞内源性DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)损伤(γH2AX灶点升高);而进一步用X-ray诱导细胞外源性DSBs损伤后,外来表达NS3/4A的细胞显示出明显的DSBs损伤修复缺陷(减缓的γH2AX灶点消退)。免疫印迹法检测结果显示,NS3/4A可抑制喜树碱(Camptothecin,CPT)诱导的ATM第1 981位丝氨酸的磷酸化(pATM1 981)。以上结果提示,NS3/4A基因外来表达可引起细胞DNA损伤,抑制ATM介导的DSBs损伤修复信号,诱导细胞凋亡通路的活化。 展开更多
关键词 DNA损伤 丙型肝炎病毒 DNA双链断裂 结构蛋白3 4A
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口蹄疫病毒非结构蛋白3D单克隆抗体的制备及鉴定 被引量:6
6
作者 田美娜 李永亮 +4 位作者 卢曾军 付元芳 袁明 刘湘涛 刘在新 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期625-627,共3页
目的:制备并鉴定口蹄疫病毒(FMDV)非结构蛋白3D的单克隆抗体(mAb)。方法:以纯化的原核表达3D蛋白免疫BALB/c小鼠,取其脾细胞与小鼠骨髓瘤细胞融合,杂交瘤细胞经间接ELISA法筛选,有限稀释法克隆,直至所克隆的细胞能够100%的分泌抗体,用We... 目的:制备并鉴定口蹄疫病毒(FMDV)非结构蛋白3D的单克隆抗体(mAb)。方法:以纯化的原核表达3D蛋白免疫BALB/c小鼠,取其脾细胞与小鼠骨髓瘤细胞融合,杂交瘤细胞经间接ELISA法筛选,有限稀释法克隆,直至所克隆的细胞能够100%的分泌抗体,用Western blot以及间接免疫荧光法对mAbs的特异性等进行鉴定。结果:免疫的BALB/c小鼠经过多次融合筛选,共获得5株抗pET28a-3D的mAb,其亚类鉴定3株为IgG1,2株为IgG2b,初步判定所得5株mAb识别2个不同表位。Western blot显示这些mAbs与重组3D蛋白和FMDVO/China99感染的BHK-21细胞中的3D抗原均特异性结合,免疫荧光结果显示这5株mAb能够特异结合FMDV感染细胞中的3D蛋白。结论:成功获得了能识别自然3D蛋白的特异性mAb,为进一步研究3D蛋白的结构和功能以及诊断方法奠定基础。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 结构蛋白3D 单克隆抗体 原核表达
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口蹄疫O/China/99毒株在不同宿主系传代的3A和VP1基因变异研究 被引量:3
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作者 张永光 吕建亮 +7 位作者 王永录 方玉珍 蒋守田 张维德 刘湘涛 潘丽 刘力宽 裴仉福 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期338-346,共9页
利用RT-PCR法扩增了经不同宿主系(乳鼠、BHK21细胞、PK15细胞)连传不同代次的口蹄疫O/China/99毒株的3A和VP1基因,并进行了核苷酸和氨基酸序列分析。结果表明,该毒株经不同宿主系传至90代后,VP1基因未发生大的变异,主要抗原位点也较稳定... 利用RT-PCR法扩增了经不同宿主系(乳鼠、BHK21细胞、PK15细胞)连传不同代次的口蹄疫O/China/99毒株的3A和VP1基因,并进行了核苷酸和氨基酸序列分析。结果表明,该毒株经不同宿主系传至90代后,VP1基因未发生大的变异,主要抗原位点也较稳定;而非结构蛋白3A基因却在不同宿主和代次发生突变缺失;经BHK21细胞传代后未发生缺失;经PK15细胞传代,在70~90代之间在第254~313位出现缺失;经乳鼠传代,在60~70代之间在第265~300位发生缺失,并在以后的90代毒中仍在此位缺失。这与代表性猪源流行毒O/YUN/TAW/97和O/HKN/21/70的3A基因在第276~305位发生缺失有相同之处。 展开更多
关键词 宿主 细胞 乳鼠 VP1基因 毒株 PK 结构蛋白3 传代 代次 口蹄疫
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猫冠状病毒非结构蛋白3的多克隆抗体制备及亚细胞定位
8
作者 王子仪 金子安 +5 位作者 卢辰赫 乔治 王圣文 颜焰 周继勇 郑肖娟 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期744-754,共11页
冠状病毒的非结构蛋白3(non-structural protein 3,Nsp3)是复制/转录复合体的组成部分,也是重要的潜在抗病毒靶标之一。本研究在对Nsp3进行跨膜区、信号肽和抗原表位预测的基础上,通过聚合酶链反应扩增Ⅱ型猫冠状病毒(feline coronaviru... 冠状病毒的非结构蛋白3(non-structural protein 3,Nsp3)是复制/转录复合体的组成部分,也是重要的潜在抗病毒靶标之一。本研究在对Nsp3进行跨膜区、信号肽和抗原表位预测的基础上,通过聚合酶链反应扩增Ⅱ型猫冠状病毒(feline coronavirus,FCoV)代表毒株(WSU 79-1683)Nsp3蛋白中抗原性较好的区段(第50—550位氨基酸),随后将其亚克隆到pCOLD-TF原核表达载体上。在低温条件下,经异丙基硫代-β-D-半乳糖苷诱导,成功表达分子量约为130 kDa的His-Nsp3重组融合蛋白。在非变性条件下,采用镍柱亲和层析获得了纯度较高的目的重组蛋白。以纯化的重组蛋白为抗原免疫BALB/c小鼠,制备Nsp3多克隆抗血清(多抗血清),蛋白质印迹法(Western blotting,WB)和间接免疫荧光试验(indirect immunofluorescence assay,IFA)结果显示,Nsp3多抗血清能特异性识别FCoV感染细胞中的Nsp3蛋白。采用免疫荧光双标法结合激光共聚焦显微镜对FCoV感染细胞中Nsp3蛋白的亚细胞定位进行分析,结果发现,FCoV感染细胞中Nsp3发生聚集现象,并与内质网存在共定位现象。Nsp3蛋白的特异性抗体制备以及亚细胞定位研究为进一步开展Nsp3蛋白的生物学功能分析奠定了基础。 展开更多
关键词 猫冠状病毒 结构蛋白3 原核表达 多克隆抗体 亚细胞定位
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口蹄疫病毒O/Laos/00株非结构蛋白3A基因特征分析 被引量:2
9
作者 信爱国 朱建波 +2 位作者 赵文华 李乐 张念祖 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期283-286,共4页
经反转录聚合酶链式反应(RT_PCR)技术扩增得到口蹄疫病毒O/Laos/00株的非结构蛋白3A基因核苷酸序列,与其他8株代表性参考毒株的3A基因进行比较,分析口蹄疫病毒3A基因的特征。结果表明:O/Laos/00株3A基因含有429核苷酸,编码143氨基酸残基... 经反转录聚合酶链式反应(RT_PCR)技术扩增得到口蹄疫病毒O/Laos/00株的非结构蛋白3A基因核苷酸序列,与其他8株代表性参考毒株的3A基因进行比较,分析口蹄疫病毒3A基因的特征。结果表明:O/Laos/00株3A基因含有429核苷酸,编码143氨基酸残基。9株病毒3A氨基酸序列相比较,可分成3种不同的类型:一类是具有全长3A的毒株,一类是具有133~143位氨基酸缺失的毒株,这两类毒株均来源于牛体,核苷酸差异小(<15%);另一类是具有93~102位氨基酸缺失的毒株,毒株相互之间核苷酸差异较大(7.25%~22.2%)。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 结构蛋白3A 序列分析 宿主
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表达丙型肝炎病毒(HCV)截短型NS3与core融合抗原的重组腺病毒疫苗在小鼠中的免疫原性与保护效果分析 被引量:3
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作者 管洁 邓瑶 +3 位作者 陈红 杨扬 文波 谭文杰 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期7-13,共7页
为研发安全广谱有效的丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)T细胞疫苗,本研究构建了表达HCV截短型非结构蛋白3(Nonstructural protein 3,NS3)与核心蛋白(core)融合抗原的重组腺病毒疫苗。体外免疫荧光及蛋白印迹实验表明该融合抗原可有... 为研发安全广谱有效的丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)T细胞疫苗,本研究构建了表达HCV截短型非结构蛋白3(Nonstructural protein 3,NS3)与核心蛋白(core)融合抗原的重组腺病毒疫苗。体外免疫荧光及蛋白印迹实验表明该融合抗原可有效表达;小鼠免疫结果表明该重组腺病毒疫苗除了激发抗原特异的抗体反应外,还可激发较强的针对NS3抗原特异的T细胞免疫应答。该T细胞免疫应答主要表现为IFN-γ+与TNF-α+CD4+T细胞亚群。采用异型(JFH1,2a型)HCV重组痘病毒接种小鼠进行保护效果分析,与对照组相比,表达截短型NS3与core融合抗原的重组腺病毒疫苗2针免疫后可产生明显的交叉免疫保护。本研究为进一步研究HCV免疫保护机制及新型疫苗研制提供了参考。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 疫苗 重组腺病毒 结构蛋白3 T细胞应答 小鼠
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携带丙型肝炎病毒非结构蛋白3基因的重组腺病毒构建研究 被引量:2
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作者 周陶友 陈敏 +4 位作者 李卫华 赵连三 何芳 刘丽 唐红 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期973-976,共4页
目的构建表达丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)的复制缺陷型重组腺病毒,为防治HCV感染的基因免疫和基因治疗提供实验基础。方法将HCV NS3基因定向克隆到穿梭质粒pAdTrack-CMV上,经与腺病毒骨架质粒pAdEasy-1在大肠埃希菌BJ5183内同源... 目的构建表达丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)的复制缺陷型重组腺病毒,为防治HCV感染的基因免疫和基因治疗提供实验基础。方法将HCV NS3基因定向克隆到穿梭质粒pAdTrack-CMV上,经与腺病毒骨架质粒pAdEasy-1在大肠埃希菌BJ5183内同源重组后,转染293细胞进行包装,并反复感染293细胞进行扩增。结果通过PCR扩增、酶切、核酸测序及Western杂交法检测鉴定,均证实插入穿梭质粒中的片段为HCV NS3基因(基因型1b);所包装出的复制缺陷型重组腺病毒AdEasy-GFP-NS3具有良好的感染能力,并可在293细胞中表达HCV NS3蛋白。结论AdEasy-GFP-NS3携带有HCV NS3基因,能有效地感染293细胞并高效表达,从而为丙型肝炎基因疫苗的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 结构蛋白3 重组腺病毒疫苗 基因治疗
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新型冠状病毒非结构蛋白3结构和功能的生物信息学分析 被引量:1
12
作者 丁一 宋峰 +3 位作者 刘烁 江亚娟 王小羽 焦伯延 《智慧健康》 2022年第32期34-37,54,共5页
目的利用生物信息学方法分析新型冠状病毒非结构蛋白3(NSP3)的生物学特征。方法在NCBI数据库获得NSP 3氨基酸序列,利用软件分析其分子式、等电点、亲水性、跨膜结构域、蛋白翻译后修饰、二级结构、抗原表位等特点,并构建其三级结构。结... 目的利用生物信息学方法分析新型冠状病毒非结构蛋白3(NSP3)的生物学特征。方法在NCBI数据库获得NSP 3氨基酸序列,利用软件分析其分子式、等电点、亲水性、跨膜结构域、蛋白翻译后修饰、二级结构、抗原表位等特点,并构建其三级结构。结果NSP3由1945个氨基酸组成,分子式为C_(9722)H_(15175)N_(2489)O_(2969)S_(88),是一种含有4个跨膜结构域的稳定亲水蛋白质。二级结构以无规卷曲为主(占45.1%),含有丰富的磷酸化位点、糖基化位点、泛素化位点、SUMO化位点、甲基化位点、乙酰化位点、琥珀酰化位点和棕榈酰化位点。NSP3含有15个二硫键,具有7个保守蛋白结构域,存在丰富的抗原表位,主要分布于内质网。并以同源建模法构建其三级结构模型。结论利用生物信息学方法分析NSP3的性质、结构、功能特征和抗原表位,为新冠肺炎的防控和药物研发提供参考依据。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 结构蛋白3 生物信息学
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猪传染性胃肠炎病毒非结构蛋白3a和3b融合表达及对细胞周期的影响 被引量:1
13
作者 梁亚冰 张琪 +2 位作者 常嵘 童德文 许信刚 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期352-361,共10页
【目的】克隆及真核表达猪传染性胃肠炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TGEV)陕西分离株的3a和3b基因,研究表达蛋白在细胞中的分布及其对细胞周期的影响。【方法】利用软件Primer 5.0参照Genbank公布的序列设计两对分别针对T... 【目的】克隆及真核表达猪传染性胃肠炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TGEV)陕西分离株的3a和3b基因,研究表达蛋白在细胞中的分布及其对细胞周期的影响。【方法】利用软件Primer 5.0参照Genbank公布的序列设计两对分别针对TGEV非结构蛋白基因3a和3b的特异性引物。采用RT-PCR方法从TGEV陕西分离株克隆3a和3b基因,再将其与真核表达载体p EGFP-N1连接,构建真核表达质粒p3a-EGFP-N1和p3b-EGFP-N1。利用脂质体转染法将重组质粒转染猪小肠黏膜上皮细胞(intestinal epithelial cells,IEC),采用激光共聚焦显微镜检测转染细胞内融合蛋白的表达分布情况。通过RT-PCR检测细胞中目的基因的转录情况,Western blotting检测细胞中融合蛋白的表达情况。利用流式细胞仪检测表达蛋白对细胞周期的影响,采用实时荧光定量PCR检测融合蛋白的表达对内质网应激蛋白标志性分子GRP78和细胞周期蛋白Cyclin A的表达的影响,通过Western blotting试验检测细胞中蛋白表达后GRP78、Cyclin A和Cyclin B1表达量的变化情况。【结果】成功克隆出完整的TGEV陕西分离株的3a及3b基因,经过测序鉴定,3a基因的大小为213bp,3b基因的大小为732bp;经过与不同来源的TGEV毒株进行对比分析,3a基因的核苷酸序列与其他毒株同源性为97.4%—100%,氨基酸同源性为98.6%—100%;3b基因的核苷酸序列与其他毒株同源性为98.3%—99.9%,氨基酸同源性为100%。重组表达载体转染IEC细胞后,经Western blotting分析IEC分别表达出分子质量约为35k D的3a-GFP和54k D的3b-GFP的融合蛋白,与预期结果相一致。激光共聚焦显微镜观察到融合蛋白3a-GFP和3b-GFP在IEC细胞的细胞核和细胞质中均有表达,流式细胞仪分析TGEV非结构蛋白3b的表达能够使G2/M期的细胞增多,实时荧光定量PCR分析显示细胞周期蛋白Cyclin A的m RNA水平高于对照组细胞(IEC和IEC-GFP),同时Western blotting分析结果显示表� 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 结构蛋白3a 结构蛋白3b 真核表达 细胞周期
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生物信息学解读丙型肝炎病毒结构与免疫病理学改变的关联性 被引量:1
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作者 于颖彦 计骏 孔晓飞 《内科理论与实践》 2007年第4期252-255,共4页
目的:分析丙型肝炎病毒(HCV)基因组编码序列结构特征及蛋白同源性,预测HCV非结构蛋白(NS)3序列的抗原表位。方法:以Envision免疫组织化学两步法检测肝移植受体肝组织内HCV抗原。从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中获取HCV编码序... 目的:分析丙型肝炎病毒(HCV)基因组编码序列结构特征及蛋白同源性,预测HCV非结构蛋白(NS)3序列的抗原表位。方法:以Envision免疫组织化学两步法检测肝移植受体肝组织内HCV抗原。从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中获取HCV编码序列,利用RPS-BLAST蛋白同源性比对软件进行序列分析;ProPred-Ⅰ软件预测NS3编码区段的T细胞抗原表位。结果:37%的受检病例肝细胞核对Tordji-22单克隆抗体起反应,33.3%的受检病例肝细胞核或细胞质对NS3抗体起反应。HCV编码产物HCV糖蛋白(gp)1的NS3区为保守区,与多种人类解旋酶具有同源性;其余各编码区未检测到与人类同源性。NS3区显示有CD4+和CD8+T细胞表位。结论:HCV NS3区含有与人类解旋酶同源的保守序列。解旋酶在细胞核参与核酸复制与DNA修复,故针对HCV NS3的抗原检测有可能与人类解旋酶起交叉反应。NS3的抗原表位特征可能是机体抗病毒同时破坏自身肝脏结构的分子基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 编码蛋白 生物信息学 抗原表位 结构蛋白3
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丙型肝炎病毒非结构蛋白3在致病中的作用 被引量:1
15
作者 张树忠 周庆文 《国外医学(微生物学分册)》 1998年第5期1-4,共4页
本文就近几年有关丙型肝炎病毒非结构蛋白3基因(HCV ns3)的研究进展分别从该基因的结构功能特点、编码产物(NS3)的免疫原性等方面作了综述,其中重点介绍了NS3蛋白与肝细胞癌(HCC)发生的相关性研究,对目前有关HCV研究体系、临床治疗中存... 本文就近几年有关丙型肝炎病毒非结构蛋白3基因(HCV ns3)的研究进展分别从该基因的结构功能特点、编码产物(NS3)的免疫原性等方面作了综述,其中重点介绍了NS3蛋白与肝细胞癌(HCC)发生的相关性研究,对目前有关HCV研究体系、临床治疗中存在的问题、新进展也作了简要介绍。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 结构蛋白3 分子生物学 ns3基因
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酵母双杂交技术筛选人胰腺细胞中HCV 1b NS3结合蛋白基因 被引量:1
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作者 胡传翠 张锦前 +3 位作者 王琦 李国力 成军 李朝品 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2009年第5期454-458,共5页
目的:应用酵母双杂交技术筛选人胰腺cDNA文库中与HCV1b亚型非结构蛋白NS3相互作用的结合蛋白的编码基因,为进一步研究HCV影响糖、脂代谢机制奠定实验基础.方法:扩增人胰腺cDNA文库并纯化鉴定,纯化后的文库质粒转化酵母菌Y187;构建诱饵质... 目的:应用酵母双杂交技术筛选人胰腺cDNA文库中与HCV1b亚型非结构蛋白NS3相互作用的结合蛋白的编码基因,为进一步研究HCV影响糖、脂代谢机制奠定实验基础.方法:扩增人胰腺cDNA文库并纯化鉴定,纯化后的文库质粒转化酵母菌Y187;构建诱饵质粒PGBKT7-NS3并转化酵母菌AH109,在色氨酸缺陷型培养基(SD/-Trp)上筛选阳性菌落.应用酵母双杂交系统3将阳性重组AH109菌株与重组酵母菌株Y187进行配合,在四缺培养基(SD/-Trp/-Leu/-His/-Ade)和铺有X-α-gal的四缺培养基上进行筛选,提取蓝色酵母菌落质粒,电转化大肠埃希菌DH5α后提取质粒测序,对测序结果进行序列比对和分析.结果:成功构建人胰腺cDNA文库和pGBKT7-NS3重组质粒;将pGBKT7-NS3质粒转化AH109酵母菌株后,并从人胰腺cDNA文库中筛选出11种与HCVNS3蛋白相结合的蛋白基因.结论:筛选出的与HCVNS3蛋白结合的胰腺蛋白基因中,部分与2型糖尿病、肝脏脂肪变性密切相关. 展开更多
关键词 结构蛋白3 丙型肝炎病毒 人胰腺 CDNA文库 酵母双杂交
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香菇多糖联合丙肝核酸疫苗诱导抗原特异性免疫应答研究 被引量:1
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作者 邹镇 彭佳蓓 +1 位作者 谢潜红 向明 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期348-351,共4页
目的:探讨香菇多糖(Lentinan,LNT)联合丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS3核酸疫苗诱导NS3抗原特异性免疫作用。方法:将不同剂量香菇多糖与等量HCVNS3质粒(100μg/只),采用初次加强免疫法联合免疫BALB/c小鼠。第二次免疫10天后取小鼠脾脏,... 目的:探讨香菇多糖(Lentinan,LNT)联合丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS3核酸疫苗诱导NS3抗原特异性免疫作用。方法:将不同剂量香菇多糖与等量HCVNS3质粒(100μg/只),采用初次加强免疫法联合免疫BALB/c小鼠。第二次免疫10天后取小鼠脾脏,制备脾细胞悬液,与NS3抗原多肽共育作为效应细胞。另培养NS3抗原致敏的P815细胞作为靶细胞。采用MTT法分别检测NS3抗原特异性T细胞增殖反应和细胞毒T细胞特异性杀伤反应(CTL)。同时采用ELISA方法检测血清中细胞因子IL-4和IFN-γ分泌水平。结果:研究发现高剂量及中剂量香菇多糖与NS3质粒联合在效靶细胞比为50:1时,可明显加强NS3抗原特异性CTL反应,与单用NS3质粒相比有显著差异(P<0.01和P<0.05);中剂量和低剂量香菇多糖与NS3质粒联用明显增强NS3抗原特异性T细胞增殖反应(均为P<0.01);细胞因子分析显示中剂量和低剂量香菇多糖与NS3质粒联用使IFN-γ分泌增加(均为P<0.01)。结论:采用初次加强免疫法将中剂量香菇多糖(0.1ml/10g)与HCVNS3质粒联合免疫BALB/c小鼠,可激发明显增强的抗原特异性T细胞增殖和CTL反应,并伴有大量的IFN-γ分泌,提示香菇多糖可作为丙肝病毒NS3核酸疫苗的免疫佐剂,加强抗原特异性免疫应答效应。 展开更多
关键词 丙型肝炎 结构蛋白3 香菇多糖 核酸疫苗
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2株新型冠状病毒全基因测序及插入和终止突变分析
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作者 韩淑琪 《预防医学论坛》 2022年第5期330-334,共5页
目的 分析2株新型冠状病毒基因进化变异情况及分子特征。方法 利用二代测序技术,对2份新型冠状病毒核酸检测阳性样本进行全基因组测序。利用生物信息学软件对基因序列进行分析。结果 获得长度分别为29 826 bp和29 837 bp的两条新型冠状... 目的 分析2株新型冠状病毒基因进化变异情况及分子特征。方法 利用二代测序技术,对2份新型冠状病毒核酸检测阳性样本进行全基因组测序。利用生物信息学软件对基因序列进行分析。结果 获得长度分别为29 826 bp和29 837 bp的两条新型冠状病毒全基因序列,与Wuhan-Hu-1株基因序列同源性分别为99.96%和99.97%。两条序列的N蛋白均发生S194L变异,N蛋白S194磷酸化位点和N192潜在糖基化位点消失。其中序列1的3 647~3 648 bp之间插入了CCCAC序列,导致非结构蛋白3(NSP3)发生移码突变,即编码一种新的无跨膜结构、含有完整泛素样结构域的NSP3Δ蛋白。序列2发生了C27978T突变,导致开放读码框8(ORF8)发生终止突变,即编码1个新的仅含28个氨基酸的截短型ORF8蛋白。结论 新型冠状病毒进化变异方式复杂多样,插入突变和终止突变可能改变相关蛋白的结构和性质,应加大新型冠状病毒的病原学监测力度。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 全基因组测序 突变 结构蛋白3 开放读码框8
原文传递
HCV非结构蛋白3反式激活基因6转染肝癌细胞的基因表达谱芯片分析 被引量:1
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作者 邵清 成军 +2 位作者 王琳 张健 卢成哲 《第四军医大学学报》 北大核心 2005年第21期1942-1944,共3页
目的:为了研究NS3TP6可能的分子生物学功能,我们应用基因芯片技术,检测丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活基因NS3TP6的表达对肝母细胞瘤细胞HepG2基因表达谱的影响.方法:以分子生物学技术构建NS3TP6的真核表达载体pcDNA3.1(-)-... 目的:为了研究NS3TP6可能的分子生物学功能,我们应用基因芯片技术,检测丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活基因NS3TP6的表达对肝母细胞瘤细胞HepG2基因表达谱的影响.方法:以分子生物学技术构建NS3TP6的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS3TP6,以表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3TP6转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为平行对照,制备转染后的细胞裂解液,提取mRNA.应用基因表达谱芯片技术对差异表达mRNA进行检测和分析.结果:HepG2细胞经转染NS3TP6后,有7条基因表达增强,38条基因表达降低.结论:应用基因表达谱芯片成功筛选了NS3TP6的反式调节基因,为进一步阐明NS3TP6的反式激活作用及免疫调节机制提供了新的依据. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 结构蛋白3 基因芯片
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肝炎病毒病原学研究进展
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作者 朱东 《浙江预防医学》 1995年第6期1-3,共3页
近年来,随着分子生物学的发展及聚合酶链反应技术的应用,对各型肝炎病毒病原学的研究更趋深入,现分述如下: 一、甲型肝炎病毒(HAV) HAV属于微小RNA病毒科,目前认为它不归属肠道病毒,而把它归于肝炎病毒属。HAV直径为27~28nm,无囊... 近年来,随着分子生物学的发展及聚合酶链反应技术的应用,对各型肝炎病毒病原学的研究更趋深入,现分述如下: 一、甲型肝炎病毒(HAV) HAV属于微小RNA病毒科,目前认为它不归属肠道病毒,而把它归于肝炎病毒属。HAV直径为27~28nm,无囊膜正二十面体颗粒,内含一条单股正链RNA基因组,沉降系数为156~160s,在氯化铯中的浮密度为1.33~1.34g/ml;只有一种血清型。 HAV的基因组由约7500个核苷酸组成,包括(1)5'非编码区,位于基因组前段,由734个核苷酸组成;(2)编码区即开放读码框区(ORF),长度为6681个核苷酸;(3)3'非编码区,长度为63个核苷酸。 ORF编码产物是2227个氨基酸组成的多聚蛋白。该多聚蛋白分P<sub>1</sub>区、P<sub>2</sub>区和P<sub>3</sub>区。P<sub>1</sub>区包括4种衣壳蛋白VP<sub>1</sub>、VP<sub>2</sub>、VP<sub>3</sub>和VP<sub>4</sub>。P<sub>2</sub>区包括非结构蛋白2A、2B和2C。P<sub>3</sub>区包括非结构蛋白3A、3B和3D。病毒转录及基因调控位于P<sub>2</sub>区,RNA多聚酶位于P<sub>3</sub>区。 根据HAV基因组的序例不同。 展开更多
关键词 肝炎病毒 病毒病原学 基因组 HBSAG 多聚蛋白 研究进展 结构蛋白2 结构蛋白3 型肝炎 沉降系数
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