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样本量对中苎1号群体遗传多样性参数的影响 被引量：6
1
作者 谭龙涛 喻春明 +4 位作者 陈平 王延周 陈继康 温岚 熊和平 《中国麻业科学》 2012年第4期179-183,共5页
为了确定群体的最适抽样量,本试验从中苎1号开放授粉群体中随机选取100蔸,并从中随机抽取10、20、30、40、50、60、70、80,90个个体组成抽样群体,计算其遗传多样性参数,得出SSR标记在样本量50以上时参数值变化不大,而SRAP标记在样本量6... 为了确定群体的最适抽样量,本试验从中苎1号开放授粉群体中随机选取100蔸,并从中随机抽取10、20、30、40、50、60、70、80,90个个体组成抽样群体,计算其遗传多样性参数,得出SSR标记在样本量50以上时参数值变化不大,而SRAP标记在样本量60以上时结果较为稳定。为苎麻群体遗传多样性的研究中样本量的选择提供了依据。 展开更多
关键词 苎麻(Boehmeria nivea L) 遗传多样性参数 样本量
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刺槐叶瘿蚊群体微卫星分析中样本量对遗传多样性指标的影响 被引量：3
2
作者 尚兴朴 赵文霞 +1 位作者 淮稳霞 姚艳霞 《植物检疫》 北大核心 2016年第1期32-35,共4页
采用微卫星标记进行刺槐叶瘿蚊群体遗传研究时,群体的样本量对遗传多样性指标准确性有一定影响。鉴于此,本实验设置了12个样本量梯度,统计分析在刺槐叶瘿蚊微卫星分子标记研究中,不同样本量对遗传多样性参数的影响,探讨刺槐叶瘿蚊群体... 采用微卫星标记进行刺槐叶瘿蚊群体遗传研究时,群体的样本量对遗传多样性指标准确性有一定影响。鉴于此,本实验设置了12个样本量梯度,统计分析在刺槐叶瘿蚊微卫星分子标记研究中,不同样本量对遗传多样性参数的影响,探讨刺槐叶瘿蚊群体遗传结构研究中所需的最适样本量。结果表明,样本量与平均等位基因数、平均有效基因数呈正相关,与平均观测杂合度、平均期望杂合度及内氏遗传多样性指数呈中度相关;在进行刺槐叶瘿蚊群体遗传结构的研究时,最适参数为期望杂合度和内氏遗传多样性指数,最小样本量为20。 展开更多
关键词 刺槐叶瘿蚊 微卫星标记 样本量 遗传多样性参数
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样本量与东方蜜蜂微卫星DNA遗传多样性参数稳定性的关系 被引量：2
3
作者 周姝婧 朱翔杰 +3 位作者 徐新建 苏显冰 蔡宗兵 周冰峰 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2022年第5期682-689,共8页
准确地评估遗传多样性是研究遗传多样性和保育遗传学的重要前提.遗传多样性研究可靠性的影响因素之一就是采样策略中的最适样本量.本研究采用微卫星标记研究样本量对遗传多样性参数检测稳定性的影响.以5个东方蜜蜂种群为试验材料,设置1... 准确地评估遗传多样性是研究遗传多样性和保育遗传学的重要前提.遗传多样性研究可靠性的影响因素之一就是采样策略中的最适样本量.本研究采用微卫星标记研究样本量对遗传多样性参数检测稳定性的影响.以5个东方蜜蜂种群为试验材料,设置10群为样本梯度,10~150群共15个梯度样本量,分析微卫星标记常用的7个遗传多样性参数与样本量之间的关系.结果表明:(1)每个参数反映的遗传多样性信息不同,能反映总体遗传多样性所需要的样本量也不同.(2)反映种群遗传变异丰富度的等位基因数和等位基因丰富度极易受样本量的影响,样本量为150群时能检测到总体91%以上的丰富度;反映种群遗传变异均匀度的期望杂合度、观察杂合度、有效等位基因数和多态信息含量的最小样本量分别为40、70、40和60~80群;同时反映遗传丰富度和均匀度的香农指数最小样本量为60~70群.综合考虑所有参数,建议在充分保证样本代表性的前提下,研究蜜蜂遗传多样性的样本量最少60群,最好在80群以上;重点关注等位基因数和等位基因丰富度等参数的研究,样本量应在150群以上;重点关注期望杂合度和有效等位基因数的研究,样本量可在40群以上. 展开更多
关键词 东方蜜蜂 遗传多样性参数 微卫星标记 样本量
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基于分子标记的野生大豆居群遗传多样性估算与取样策略 被引量：25
4
作者 赵茹 程舟 +1 位作者 陆伟峰 卢宝荣 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1042-1048,共7页
遗传多样性是生物多样性的基础和最重要组成部分,正确评价物种及其居群的遗传多样性是有效保护和利用生物种质资源的必要条件．以一个野生大豆自然居群(面积约为10000m^2)为研究材料,从中随机选取了100棵植株,分别用3种分子标记AFLP,ISS... 遗传多样性是生物多样性的基础和最重要组成部分,正确评价物种及其居群的遗传多样性是有效保护和利用生物种质资源的必要条件．以一个野生大豆自然居群(面积约为10000m^2)为研究材料,从中随机选取了100棵植株,分别用3种分子标记AFLP,ISSR和SSR对其遗传多样性进行分析,并采用计算机模拟方法,从这100棵植株中随机抽取不同大小(5～90个个体)的样本(抽样群体)各50次,对其主要遗传多样性参数进行了计算,旨在探讨利用不同分子标记检测该野生大豆居群的主要遗传多样性参数,即位点的预期杂合度(H_e)、Shannon多样性指数(l)和多态位点百分率(P)的差异和变化趋势以及随抽样群体样本量的不断增加这些参数的变化规律．结果表明,不同分子标记检测到同一野生大豆居群的各种遗传多样性参数值不同；同一居群中的不同样本量对遗传多样性参数的估算值有较大影响；用不同分子标记进行遗传多样性参数的估算时,多态位点百分率相对具有可比性；选用不同的遗传多样性参数来反映居群90%以上的总体遗传变异时需要不同的样本量,当选用多态位点百分率(P)时,30-45个植株才能代表总体90%以上的遗传变异．本研究为评价植物居群遗传多样性和采用合理的保护取样策略提供了科学依据． 展开更多
关键词 AFLP ISSR SSR遗传多样性参数 分子标记取样策略 野生大豆
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