转运RNA衍生的小RNA研究概述

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作者 骆雅鑫 胡雪峰 《生物学教学》 北大核心 2024年第1期2-5,共4页

转运RNA(tRNA)衍生的小RNA(tsRNAs)是由成熟tRNA或前体tRNA在应激条件下经特定核酸酶切割后所产生的一类小非编码RNA,具有高保守性、组织特异性和疾病相关性等特点,可作为生物标志物及治疗靶点。本文从tsRNAs的发现、分类、生物学功能... 转运RNA(tRNA)衍生的小RNA(tsRNAs)是由成熟tRNA或前体tRNA在应激条件下经特定核酸酶切割后所产生的一类小非编码RNA,具有高保守性、组织特异性和疾病相关性等特点,可作为生物标志物及治疗靶点。本文从tsRNAs的发现、分类、生物学功能及其在疾病中的作用等方面对其研究现状进行综述,以期为表观遗传学相关内容的教学提供参考信息。 展开更多

关键词 非编码RNA 转运RNA 衍生片段 转运RNA半分子

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甜瓜化感自毒作用响应基因的cDNA-AFLP分析 被引量：11

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作者 张志忠 孙志浩 +1 位作者 陈文辉 林文雄 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1514-1520,共7页

本研究以甜瓜种质＂新银辉＂为试验材料,利用浓度为0.03 g.mL 1的新鲜甜瓜植株水浸提液处理甜瓜幼苗,通过cDNA-AFLP技术分析甜瓜化感自毒作用相关基因及其表达情况。试验中利用82对引物进行扩增,共获得3 600多条差异表达转录衍生片段（T... 本研究以甜瓜种质＂新银辉＂为试验材料,利用浓度为0.03 g.mL 1的新鲜甜瓜植株水浸提液处理甜瓜幼苗,通过cDNA-AFLP技术分析甜瓜化感自毒作用相关基因及其表达情况。试验中利用82对引物进行扩增,共获得3 600多条差异表达转录衍生片段（TDFs）,平均每个引物组合可扩增出30~50条条带,片段大小集中在50~800 bp之间,根据条带强弱和有无的变化,其表达模式可以分为持续表达、瞬时表达、上调表达和下调表达4种情况。选取其中103条TDFs进行回收、测序,共获得75条有效序列,其中上调表达39条,下调表达21条,瞬时表达15条。BLAST结果分析显示其中55条与已知功能基因具有较高的同源性,选取其中10条TDFs,以甜瓜Actin基因为内参照,对其在不同胁迫处理时间的表达情况进行半定量RT-PCR验证,分析结果与cDNA-AFLP结果基本吻合,表明cDNA-AFLP技术是研究甜瓜化感自毒作用相关基因差异表达的有效方法。55条TDFs的BLAST结果显示,甜瓜自毒作用涉及到的基因表达情况较为复杂,与信号转导、能量代谢、蛋白合成、离子运输、逆境响应和转录调控等过程均有关系,这一结果为探讨甜瓜化感自毒作用的分子机理和相关基因的克隆提供了理论依据。 展开更多

关键词 甜瓜 化感自毒作用 CDNA-AFLP 差异表达转录衍生片段 半定量RT-PCR 化感基因

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tRNA衍生片段和tRNA半分子的生物学功能及其在疾病发生中的作用 被引量：6

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作者 朱林文 谢依 郭俊明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第7期565-572,共8页

tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragment,t RF)和tRNA半分子(tRNA halves,ti RNA)由成熟tRNA或其前体tRNA在不同位点特异性剪切产生,它们是一类广泛存在于原核生物和真核生物转录组中的非编码小RNA分子.t RF主要有tRF-5、tRF-3和tRF-1... tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragment,t RF)和tRNA半分子(tRNA halves,ti RNA)由成熟tRNA或其前体tRNA在不同位点特异性剪切产生,它们是一类广泛存在于原核生物和真核生物转录组中的非编码小RNA分子.t RF主要有tRF-5、tRF-3和tRF-1等3亚类,分别来自成熟tRNA的D环至反密码环茎区间切割至5′端、T环开始至3′端和前体tRNA的3′端尾部,其长度为14~30个核苷酸(nucleotide,nt).ti RNA主要有5′ti RNA和3′ti RNA等2亚类,是在成熟tRNA反密码子环处切割分别产生,其长度为29~50 nt.t RF和ti RNA具有多种生物学功能,既可以在应激反应中作为信号分子,又可以作为基因表达的调节者.它们与人类多种疾病(如肿瘤、神经退行性疾病、代谢性疾病和传染病等)的发生密切相关,有希望成为疾病诊断的新型标志物.本文就t RF和ti RNA的分类、生物学功能以及与人类疾病的关系作一综述. 展开更多

关键词 tRNA衍生片段 tRNA半分子 基因表达调控 疾病发生

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tRNA衍生的小RNA在肿瘤中作用机制的研究进展

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作者 王竞翊 成琳 许凌云 《现代医学与健康研究电子杂志》 2024年第17期126-129,共4页

随着高通量测序技术和生物信息学的快速发展,转运RNA(tRNAs)衍生的小RNA(tsRNAs)的生物学功能及其在肿瘤中的作用引起了广泛的关注。在氧化损伤、缺氧、葡萄糖饥饿等应激条件下,tRNAs前体或成熟tRNA可被特定的核酸内切酶剪切成tsRNAs,... 随着高通量测序技术和生物信息学的快速发展,转运RNA(tRNAs)衍生的小RNA(tsRNAs)的生物学功能及其在肿瘤中的作用引起了广泛的关注。在氧化损伤、缺氧、葡萄糖饥饿等应激条件下,tRNAs前体或成熟tRNA可被特定的核酸内切酶剪切成tsRNAs,根据其不同来源和剪切位点主要分为tRNA衍生片段(tRFs)和tRNA半分子(tiRNAs)。tsRNAs能够通过调节信使RNA(mRNA)的稳定性、调控翻译过程等多种方式调控基因表达,进而影响肿瘤的发生和发展,因此可成为肿瘤潜在的生物标志物和治疗靶点。现对tsRNAs的来源与分类,生物学功能,以及其在肿瘤中的作用机制等展开综述,以期为tsRNAs的研究提供参考依据。 展开更多

关键词 肿瘤 转运RNA衍生的小RNA 转运RNA衍生片段 转运RNA半分子 生物学功能

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tRF-013354介导阿霉素诱导的足细胞损伤的机制研究

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作者 王晓红 黄婵 +3 位作者 季嘉玲 张琳琳 张爱青 甘卫华 《皖南医学院学报》 CAS 2024年第1期14-18,共5页

目的:探究tRNA衍生片段013354(tRF-013354)在阿霉素(ADR)诱导的足细胞损伤中的作用及相关机制。方法:用ADR诱导足细胞损伤模型,tRF-013354 mimic和tRF-013354 NC-mimic分别转染足细胞,Real-time PCR(RT-PCR)验证转染效率,CCK-8检测足细... 目的:探究tRNA衍生片段013354(tRF-013354)在阿霉素(ADR)诱导的足细胞损伤中的作用及相关机制。方法:用ADR诱导足细胞损伤模型,tRF-013354 mimic和tRF-013354 NC-mimic分别转染足细胞,Real-time PCR(RT-PCR)验证转染效率,CCK-8检测足细胞存活率,免疫荧光检测足细胞损伤标志物Nephrin、Podocin的定位和表达水平,Western blot检测Nephrin、Podocin和Wnt/β-catenin信号通路相关蛋白非磷酸化β-catenin、Wnt1的蛋白表达水平,RT-PCR检测tRF-013354的表达;用Wnt信号拮抗剂Dickkopf-1(DKK1)阻断Wnt/β-catenin信号通路,Western blot检测非磷酸化β-catenin和Nephrin、Podocin的蛋白表达水平,RT-PCR检测tRF-013354的表达。结果:1μg/mL ADR干预足细胞24 h,可成功构建ADR诱导足细胞损伤模型,Wnt/β-catenin信号通路被激活,tRF-013354下调(P<0.05);足细胞过表达tRF-013354可减轻足细胞损伤;DDK1阻断Wnt/β-catenin信号通路,与ADR组比较,ADR+DKK1组足细胞损伤减轻,tRF-013354表达上调(P<0.05)。结论:tRF-013354可能作为Wnt/β-catenin信号通路的下游效应分子减轻ADR诱导的足细胞损伤。 展开更多

关键词 tRNA衍生片段 阿霉素 足细胞损伤 WNT/Β-CATENIN信号通路

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血5′tRF-LysCTT对急性脑梗死早期诊断及病情严重程度判定的价值

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作者 苏茜 孟德龙 +2 位作者 王孟可 苏志强 李国忠 《中国急救医学》 CAS CSCD 2024年第8期733-736,F0003,共5页

目的探究血5′tRF-LysCTT表达水平对急性脑梗死(ACI)患者早期诊断及病情严重程度判定的价值。方法收集2022年10月至2023年10月在哈尔滨医科大学附属第一医院神经内科住院急性脑梗死(ACI)患者为ACI组(n=114),选取同期健康体检者为对照组(... 目的探究血5′tRF-LysCTT表达水平对急性脑梗死(ACI)患者早期诊断及病情严重程度判定的价值。方法收集2022年10月至2023年10月在哈尔滨医科大学附属第一医院神经内科住院急性脑梗死(ACI)患者为ACI组(n=114),选取同期健康体检者为对照组(n=112)。根据NIHSS评分将ACI患者分为轻型组(NIHSS≤5分,n=66)和中重型组(NIHSS>5分,n=48)。通过实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测两组血5′tRF-LysCTT水平。应用多因素Logistic回归分析预测ACI患者神经功能缺损程度的危险因素。ROC曲线分析5′tRF-LysCTT对区分轻型、中重型ACI的诊断价值。结果ACI患者血5′tRF-LysCTT水平明显低于对照组(1.34±0.56 vs.3.28±1.01,P<0.001)。与轻型组比较,中重型组血5′tRF-LysCTT表达明显降低(1.65±0.45 vs.0.89±0.36,P<0.001)。与5′tRF-LysCTT相对表达量与ACI神经功能缺损程度呈负相关(P<0.001)。ROC曲线分析5′tRF-LysCTT对区分ACI组与对照组的曲线下面积(AUC值)为0.956(95%CI 0.9317~0.9805),敏感度为94.6%,特异度为84.7%,截断值为2.11;区分ACI轻、中重型的AUC值为0.908(95%CI 0.8543~0.9618),敏感度为93.3%,特异度为80.2%,截断值为1.41,具有较高诊断效率。Logistic回归分析显示,5′tRF-LysCTT是预测神经功能缺损程度的独立危险因素。结论血5′tRF-LysCTT可能成为ACI患者早期诊断及病情严重程度判定的新标志物。 展开更多

关键词 急性脑梗死 tRNA衍生片段 5′tRF-LysCTT 标志物 早期诊断

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tRNA衍生片段(tRFs)调节基因表达的机制及其在相关疾病中的研究进展

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作者 赵江华 蔡卫华 +1 位作者 陈琳 居林玲 《南通大学学报（医学版）》 2024年第1期63-67,共5页

转运RNA(transfer RNA,tRNA)衍生片段(tRNA-derived fragments,tRFs)是一类新的调节性非编码RNA,在应激诱导的疾病和癌症中具有独特的生物学功能。细胞必须合成新的蛋白质来维持其寿命,而tRNAs是蛋白质翻译过程的重要组成部分。成熟tRNA... 转运RNA(transfer RNA,tRNA)衍生片段(tRNA-derived fragments,tRFs)是一类新的调节性非编码RNA,在应激诱导的疾病和癌症中具有独特的生物学功能。细胞必须合成新的蛋白质来维持其寿命,而tRNAs是蛋白质翻译过程的重要组成部分。成熟tRNAs和前体tRNAs根据不同的酶切位点被裂解为两种类型:tRNA半体(tiRNAs,长度为28~36 nt)和tRFs(长度为14~30 nt)。前者包含2个亚类:5′-tiRNAs和3′-tiRNAs,后者分为5个亚类:tRF-1、tRF-2、tRF-3、tRF-5和i-tRF。tRFs通过与其他类型的RNA或蛋白质相互作用来调节基因的表达,并在多种疾病中异常表达,如在神经退行性病变、病毒感染等多种疾病中发挥重要作用,且在胃癌、肝癌等多种癌症中异常表达。本文就tRFs在人类疾病中的研究进展进行综述。 展开更多

关键词 tRNA衍生片段 转运RNA 疾病

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tRNA衍生片段与恶性肿瘤

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作者 龙正波 杨慧 +2 位作者 唐培仁 李英 王晚璞 《中国组织化学与细胞化学杂志》 CAS CSCD 2024年第1期85-93,共9页

转运RNA(tRNA)是蛋白质翻译的衔接分子,tRNA衍生片段(tRNA-derived fragments,tRFs)有5种类型:tRF-1、tRF-2、tRF-3、tRF-5及i-tRF(中间体tRF),tRFs在众多恶性肿瘤中呈异常表达,且与患者预后不良相关。此外,tRFs通过调节细胞周期和参与... 转运RNA(tRNA)是蛋白质翻译的衔接分子,tRNA衍生片段(tRNA-derived fragments,tRFs)有5种类型:tRF-1、tRF-2、tRF-3、tRF-5及i-tRF(中间体tRF),tRFs在众多恶性肿瘤中呈异常表达,且与患者预后不良相关。此外,tRFs通过调节细胞周期和参与癌症转移机制影响肿瘤细胞的生物学进程,展现出成为肿瘤预后标志物的潜力,深入研究tRFs在恶性肿瘤中的作用机制有助于肿瘤早期诊断和靶向治疗。本文综述了tRFs参与的生物过程、在不同肿瘤中作用机制及当前临床研究中的新进展,为后续tRFs研究提供新的见解。 展开更多

关键词 tRNA衍生片段 肿瘤诊断 肿瘤治疗 肿瘤机制

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tRNA修饰在胶质瘤中的研究进展

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作者 翟贝 魏灯 王萍 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期567-571,共5页

转运RNA(transfer RNA,tRNA)是哺乳动物细胞中修饰程度最高的RNA,其修饰不仅高度动态,并且易受环境条件的影响。肿瘤发生常伴有tRNA修饰异常。研究发现tRNA修饰酶在多种肿瘤组织中异常表达,与发病机制密切相关。胶质瘤是最常见的原发性... 转运RNA(transfer RNA,tRNA)是哺乳动物细胞中修饰程度最高的RNA,其修饰不仅高度动态,并且易受环境条件的影响。肿瘤发生常伴有tRNA修饰异常。研究发现tRNA修饰酶在多种肿瘤组织中异常表达,与发病机制密切相关。胶质瘤是最常见的原发性中枢神经系统肿瘤,恶性程度最高,预后极差。本文主要针对胶质瘤相关的几种t RNA修饰予以综述,描述其在胶质瘤发生发展中的功能和机制,为探索tRNA异常修饰生成的衍生片段作为胶质瘤诊断的生物标志物,以及设计靶向表观遗传调控因子的小分子抑制剂作为胶质瘤的治疗靶点提供新思路。 展开更多

关键词 胶质瘤 tRNA修饰 甲基化 tRNA衍生片段

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血清tRNA衍生片段tRF-17-79MP9PP的表达及与乳腺癌患者预后的相关性

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作者 莫冬萍 杨子龙 王承霞 《临床检验杂志》 CAS 2024年第7期488-491,共4页

目的检测乳腺癌患者血清tRNA衍生物tRF-17-79MP9PP(tRF-17)的表达水平,并分析其与患者预后的相关性。方法选取2016年6月至2019年12月本院收治并确诊的70例乳腺癌患者及25例健康人对照组的血清标本,记录患者的临床资料和数据。采用实时... 目的检测乳腺癌患者血清tRNA衍生物tRF-17-79MP9PP(tRF-17)的表达水平,并分析其与患者预后的相关性。方法选取2016年6月至2019年12月本院收治并确诊的70例乳腺癌患者及25例健康人对照组的血清标本,记录患者的临床资料和数据。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测两组血清tRF-17的表达水平;绘制ROC曲线并分析tRF-17对乳腺癌的临床筛查价值;采用Spearman相关分析tRF-17与血液炎症指标以及肿瘤标志物的相关性,随访截止日期为2023年4月,使用单因素和多因素COX回归分析乳腺癌预后不良的影响因素。结果与健康人对照组的14.09(5.14,21.34)相比,乳腺癌患者血清tRF-17的表达水平[3.99(0.70,10.46)]显著降低,差异有统计学意义(Z=-3.575,P<0.01);其筛查乳腺癌的ROC曲线下面积(AUCROC)为0.742(95%CI:0.635~0.849,P<0.01)。tRF-17高表达组乳腺癌患者的平均生存时间显著高于低表达组(75.97个月vs 56.06个月,log-rank P<0.01)。COX比例风险模型分析提示,淋巴结转移和血清tRF-17表达水平均是影响患者预后的独立危险因素(HR=1.723,95%CI:1.084~2.739,P<0.05;HR=0.189,95%CI:0.041~0.862,P<0.05)。结论乳腺癌患者血清tRF-17呈低表达,其表达水平是影响乳腺癌患者预后的独立危险因素,或可成为一种评估患者预后的生物学标志物。 展开更多

关键词 tRNA衍生片段 tRF-17-79MP9PP 乳腺癌 预后 生物学标志物

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转运RNA衍生片段15:31对TGF-β_(1)诱导的小鼠肾小球系膜细胞增殖和炎症反应的影响

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作者 夏梓桓 单智杰 +1 位作者 乔云阳 张爱青 《山东医药》 CAS 2024年第20期30-34,共5页

目的 观察转运RNA衍生片段15:31-Arg-CCT-3-1(tRF-15:31)对转化生长因子β_(1)(TGF-β_(1))诱导的小鼠肾小球系膜细胞增殖和炎症反应的影响。方法 体外培养小鼠肾小球系膜细胞,将细胞分为tRF组、NC组、模型组和对照组。对照组使用正常... 目的 观察转运RNA衍生片段15:31-Arg-CCT-3-1(tRF-15:31)对转化生长因子β_(1)(TGF-β_(1))诱导的小鼠肾小球系膜细胞增殖和炎症反应的影响。方法 体外培养小鼠肾小球系膜细胞,将细胞分为tRF组、NC组、模型组和对照组。对照组使用正常糖培养基培养细胞。tRF组、NC组、模型组以含10 ng/mL TGF-β_(1)的培养基培养24 h诱导CKD细胞模型;tRF组、NC组分别转染tRF-15:31 mimic和阴性对照。各组干预24 h后,采用CCK-8试剂盒检测细胞增殖能力,采用Western blotting法检测各组细胞中的纤维化指标[纤维连接蛋白(FN)、Ⅰ型胶原蛋白(ColⅠ)、α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)]和炎症指标[白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)]蛋白,采用逆转录定量PCR法检测FN、ColⅠ、α-SMA、IL-6、TNF-α mRNA,采用ELISA法检测各组细胞培养液上清中的IL-6、TNF-α。结果模型组增殖活力高于对照组,模型组FN、ColⅠ、α-SMA、IL-6、TNF-α蛋白及mRNA表达和培养液上清中IL-6、TNF-α水平高于对照组(P均<0.05);tRF组增殖活力低于NC组,tRF组FN、ColⅠ、α-SMA、IL-6、TNF-α蛋白及mRNA表达和培养液上清中IL-6、TNF-α水平低于NC组(P均<0.05)。结论 tRF-15:31可抑制TGF-β_(1)诱导的小鼠肾小球系膜细胞增殖,并减少炎症因子分泌。 展开更多

关键词 慢性肾脏病 肾小球系膜细胞 转运RNA衍生片段 细胞增殖 炎症反应

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tRNA衍生片段(tRF)在肿瘤侵袭转移中的机制及研究进展

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作者 刘颖军 陈文慧 赵建夫 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第2期199-202,211,共5页

转运RNA(tRNA)衍生片段(tRF)又被称为tRNA衍生的小RNA(tsRNAs),是一类新兴的调节性非编码RNA,是在特定条件下特异性切割前tRNA或成熟tRNA而形成的。目前已发现tRF在肿瘤等多种疾病发展进程中具有独特的生物学功能,包括具有miRNA样作用... 转运RNA(tRNA)衍生片段(tRF)又被称为tRNA衍生的小RNA(tsRNAs),是一类新兴的调节性非编码RNA,是在特定条件下特异性切割前tRNA或成熟tRNA而形成的。目前已发现tRF在肿瘤等多种疾病发展进程中具有独特的生物学功能,包括具有miRNA样作用及结合RNA结合蛋白(RBP)调节基因表达、蛋白质翻译、表观遗传学调控、调节细胞周期等。近年来多项研究表明tRF在乳腺癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、肺癌、前列腺癌、白血病等多种肿瘤中异常表达并参与其发展进程。本文总结了它们的分类、生物发生、作用机制以及在肿瘤侵袭和转移中的生物意义,为肿瘤的新型诊断标记和治疗靶点的发现提供新思路。 展开更多

关键词 转运RNA(tRNA) tRNA衍生片段(tRF) 肿瘤 侵袭转移

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转运RNA衍生片段在心血管疾病中的研究进展 被引量：2

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作者 崔楠 张俊哲 +2 位作者 马群 Muisha B MBIKYO 李昭 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第9期843-846,共4页

心血管疾病是影响人类健康、导致死亡的重要原因之一。转运RNA衍生片段(tRFs)在心血管疾病的发生、发展中起重要作用,包括参与心肌肥厚的代际遗传,调节血管平滑肌的增殖、迁移和表型转换等。但tRFs的很多作用机制仍不明确,需要大量的研... 心血管疾病是影响人类健康、导致死亡的重要原因之一。转运RNA衍生片段(tRFs)在心血管疾病的发生、发展中起重要作用,包括参与心肌肥厚的代际遗传,调节血管平滑肌的增殖、迁移和表型转换等。但tRFs的很多作用机制仍不明确,需要大量的研究验证。本文主要概述了tRFs的分类、生物学功能,并对tRFs在心肌肥厚、主动脉夹层、血管平滑肌细胞表型转换中的研究进展进行总结、分析。 展开更多

关键词 转运RNA衍生片段 生物学功能 心血管疾病

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基于cDNA-AFLP分析桂花开花进程中差异表达基因 被引量：2

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作者 曾祥玲 章晓琴 +1 位作者 邹晶晶 王彩云 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期940-950,共11页

桂花是我国重要的传统名花香花植物,花色与花香是桂花两个重要的观赏品质,受开花进程的影响。为了解其开花进程中色与香的合成过程及相关分子基础,该研究利用不同花期的桂花花瓣和幼叶建立了适用于多个样本的cDNA-AFLP体系,并分析开花... 桂花是我国重要的传统名花香花植物,花色与花香是桂花两个重要的观赏品质,受开花进程的影响。为了解其开花进程中色与香的合成过程及相关分子基础,该研究利用不同花期的桂花花瓣和幼叶建立了适用于多个样本的cDNA-AFLP体系,并分析开花进程中基因的表达差异。结果表明:共获得了283个在花瓣中特异且差异表达的转录衍生片段(transcript-derivedfragments,TDFs)。其中,120个TDFs在数据库中无同源序列;12个有同源序列,但功能未知;150个已知生物学功能的序列,其主要功能包括次级代谢、初级代谢和发育过程等。对其中已知功能的6个TDFs进行qRT-PCR验证,4个转录水平较高的TDFs表达模式与AFLP分析结果基本一致。这对了解开花进程中桂花色与香的合成过程相关基因的表达奠定了基础,也为进一步研究桂花色香形成的分子机制提供了参考。 展开更多

关键词 桂花 CDNA-AFLP 转录衍生片段 花色 花香

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转运RNA衍生的小RNA功能及其研究方法 被引量：2

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作者 马剑峰 甘麦邻 +1 位作者 朱砺 沈林園 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1107-1120,共14页

转运RNA衍生的小RNA(tRNA-derived small RNAs,tsRNA)是近年来发现的一类由成熟tRNA或tRNA前体通过特殊的作用机制加工产生的非编码RNA。根据其产生方式的不同,主要分为tRNA半分子(tRNA halves)和tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragmen... 转运RNA衍生的小RNA(tRNA-derived small RNAs,tsRNA)是近年来发现的一类由成熟tRNA或tRNA前体通过特殊的作用机制加工产生的非编码RNA。根据其产生方式的不同,主要分为tRNA半分子(tRNA halves)和tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragments,tRFs)两种类型。tsRNA广泛存在于各种生物体中,具有高度保守、结构稳定和组织表达特异性等特点。大量研究表明,多种细胞应激反应中tsRNA的表达显著上升,其参与应激反应的调控是一种保守的生物现象。tsRNA可通过调控转录本稳定性、调节翻译和作为表观遗传调控因子等方式在多种生物学过程中发挥重要作用,此外,tsRNA具有作为疾病生物标志物和治疗靶点的潜力,逐渐成为生物医学领域中的研究热点。本文从tsRNA的生物发生、功能和研究方法3个方面,对其研究现状进行了综述,以期为后续研究提供参考。 展开更多

关键词 非编码RNA 转运RNA衍生片段 tsRNA tRFs

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tRNA衍生片段的鉴定及对靶分子的调节机制 被引量：1

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作者 黄炯杰 陈乐意 廖奇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期438-451,共14页

随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定。tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和tRNA应激诱导RNA(tRNA-deriv... 随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定。tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和tRNA应激诱导RNA(tRNA-derived stress-induced RNA,tiRNA),其中tRF是一类具有调节功能的非编码RNA。为了加深对tRF的研究,近年来一些基于测序数据的tRF鉴定方法和相关数据库不断涌现,前者主要包括Telonis等人的算法和tDRmapper方法,后者主要有tRFdb、tRF2Cancer和MINTbase等。同时这两者为tRF的深入研究提供了更有效的工具。大量的研究表明,tRF主要以类似miRNA的方式对RNA、DNA及蛋白质进行调节,但也存在特异的作用方式。随着对这三者的深入研究,研究人员发现tRF在人类疾病的各种生物过程中也扮演着重要的角色,例如可以作为生物标志物。因此本文主要对tRF的鉴定方法、数据库、对靶分子的调节机制及其与人类疾病的关系作一综述。 展开更多

关键词 tRNA衍生小分子 tRNA衍生片段 数据库 生物信息学鉴定

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tRNA衍生的小RNA在呼吸系统疾病中的应用研究 被引量：1

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作者 刘露梅 夏世金 +1 位作者 邓思思 韦雅芹 《中华肺部疾病杂志（电子版）》 2022年第6期896-899,共4页

呼吸系统疾病不仅是影响公共健康的重大问题,也是老年人群主要死亡原因之一[1]。肺癌是最常见的呼吸系统疾病之一,不同类型肿瘤中病死率最高[2⁃3],其他如哮喘、慢性阻塞性肺疾病、肺结核、肺炎等呼吸系统疾病不仅患病率高,亦给家庭和社... 呼吸系统疾病不仅是影响公共健康的重大问题,也是老年人群主要死亡原因之一[1]。肺癌是最常见的呼吸系统疾病之一,不同类型肿瘤中病死率最高[2⁃3],其他如哮喘、慢性阻塞性肺疾病、肺结核、肺炎等呼吸系统疾病不仅患病率高,亦给家庭和社会带来巨大经济负担[4⁃6],因此,研究呼吸系统疾病的发病机制、寻找特异性诊断标志物及新的治疗靶点具有重要意义。 展开更多

关键词 tRNA衍生的小RNA(tsRNA) tRNA半分子(tiRNAs) tRNA衍生片段(tRFs) 呼吸系统疾病

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TRF及其在肿瘤中作用的研究进展 被引量：1

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作者 单世婷 朱春富 《医学综述》 2020年第8期1526-1530,共5页

转运RNA衍生片段属于非编码小RNA家族成员。TRF具有多种生物学功能,包括作为应激反应中的信号分子和基因表达的调节因子。此外,TRF还参与RNA加工、细胞增殖、翻译抑制、基因表型的遗传、细胞凋亡和免疫调节。TRF与癌症的发生、进展和化... 转运RNA衍生片段属于非编码小RNA家族成员。TRF具有多种生物学功能,包括作为应激反应中的信号分子和基因表达的调节因子。此外,TRF还参与RNA加工、细胞增殖、翻译抑制、基因表型的遗传、细胞凋亡和免疫调节。TRF与癌症的发生、进展和化疗耐药有密切关系,在乳腺癌及其耐药细胞、前列腺癌、结直肠癌组织中明显高表达。肿瘤细胞中特异性表达TRF,研究其在乳腺癌耐药中的作用机制,可能使其成为一种新的生物学标志物来指导临床诊断和治疗。 展开更多

关键词 转运RNA 转运RNA衍生的小RNA 转运RNA衍生片段 肿瘤 化疗耐药

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tsRNAs与肿瘤关系的研究进展 被引量：1

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作者 何小雪 樊希蕊 +1 位作者 黄芸 王辉 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期85-88,共4页

转运RNA(transfer RNA,tRNA)衍生的小RNAs(transfer RNA-derived small RNAs,tsRNAs)是来源于成熟tRNA或tRNA前体的一类新兴的非编码单链RNAs,主要包括tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragments,tRFs)和tRNA半分子(tRNA halves,tiRNAs)... 转运RNA(transfer RNA,tRNA)衍生的小RNAs(transfer RNA-derived small RNAs,tsRNAs)是来源于成熟tRNA或tRNA前体的一类新兴的非编码单链RNAs,主要包括tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragments,tRFs)和tRNA半分子(tRNA halves,tiRNAs)两类。tsRNAs在多种肿瘤中存在差异性表达,并且影响肿瘤的增殖、侵袭或转移过程,尽管其背后的机制尚未完全阐明,但有成为肿瘤新的生物标志物及治疗靶点的潜力。本文对tsRNAs与常见肿瘤的关系进行综述,以期为肿瘤的诊断、治疗及预防提供新思路。 展开更多

关键词 tsRNAs tRNA衍生片段 tRNA半分子 肿瘤

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rRNA衍生片段的研究进展

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作者 范云帆 李婷 +1 位作者 王鑫洋 付英梅 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2023年第3期353-356,共4页

rRNA衍生片段(rRNA-derived fragment,rRF)是近年来进入人们视野的一种新型小分子非编码RNA,它是成熟完整的rRNA在特定条件下裂解产生的一种小RNA片段。rRF的生物学功能不同于其亲本rRNA,是一种新型的小调控RNA,通过调控基因表达在细胞... rRNA衍生片段(rRNA-derived fragment,rRF)是近年来进入人们视野的一种新型小分子非编码RNA,它是成熟完整的rRNA在特定条件下裂解产生的一种小RNA片段。rRF的生物学功能不同于其亲本rRNA,是一种新型的小调控RNA,通过调控基因表达在细胞增殖、应激诱导、炎症反应和代谢调节等方面发挥重要作用。本文综述了rRF在生物学领域的最新研究进展,包括其主要产生机制和功能,以期为rRF的进一步研究提供参考。 展开更多

关键词 rRNA衍生片段 细菌 功能

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