目的:筛选胰腺癌(PC)侵袭相关微小RNA(miRNA,miR),验证其生物学功能和调控的信号通路,为胰腺癌的诊治提供新的分子标志物和靶点。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)的miRNA表达谱数据集GSE71533和GSE85589,分析miR-26b-5p的差异表达;利...目的:筛选胰腺癌(PC)侵袭相关微小RNA(miRNA,miR),验证其生物学功能和调控的信号通路,为胰腺癌的诊治提供新的分子标志物和靶点。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)的miRNA表达谱数据集GSE71533和GSE85589,分析miR-26b-5p的差异表达;利用癌症基因组图谱数据库(TCGA),分析miR-26b-5p对PC患者总生存率的影响。采用TargetScan数据库识别miR-26b-5p的靶基因集。通过细胞功能实验,验证miR-26b-5p对PANC-1细胞增殖、迁移和侵袭的影响。利用基因本体(GO)和KEGG通路富集分析,揭示miR-26b-5p靶基因的功能,并通过蛋白印迹(Western blotting)实验验证miR-26b-5p靶向的信号通路。结果:在GSE71533和GSE85589数据集,相对于正常组织和对照组血浆,miR-26b-5p在PC组织和PC患者血浆明显低表达(9.65±0.10 vs 10.18±0.07,P<0.001;0.67±0.18 vs 0.79±0.24,P=0.017)。TCGA-胰腺癌生存分析结果显示,miR-26b-5p高表达组的总体生存率明显优于低表达组(P=0.023)。KEGG分析显示,预测的251个miR-26b-5p的靶基因与MAPK信号通路有关。CCK-8实验、Transwell迁移、侵袭实验和划痕实验结果显示:miR-26b-5p抑制PANC-1细胞的增殖、迁移和侵袭。KEGG通路富集分析结果提示miR-26b-5p的靶基因参与丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路。Western blotting实验证实miR-26b-5p下调MKNK2/eIF4E信号通路。结论:miR-26b-5p下调MKNK2/eIF4E信号通路,抑制PANC-1细胞增殖、侵袭,有可能作为胰腺癌诊断和治疗的新靶点。展开更多
目的探讨受体相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶2(RIPK2)参与免疫调控通路及临床预后的作用。方法通过TIMER、cBioPortal、Human Protein Atlas(HPA)和UALCAN和STRING等数据库对RIPK2在组织中的定位和表达,及其在肿瘤免疫浸润、免疫调控和...目的探讨受体相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶2(RIPK2)参与免疫调控通路及临床预后的作用。方法通过TIMER、cBioPortal、Human Protein Atlas(HPA)和UALCAN和STRING等数据库对RIPK2在组织中的定位和表达,及其在肿瘤免疫浸润、免疫调控和生存预后中的作用进行分析。结果(1)RIPK2主要由激酶和CARD结构域构成,第18~298位氨基酸是其激酶结构,第435~526位氨基酸是CARD结构域;与正常组织细胞比较,RIPK2在大部分恶性肿瘤中高表达,其中在子宫内膜上皮癌和人黑色素瘤细胞系(hTERT-HME1)中表达最高。相比胶质瘤(GBM)和透明细胞癌(KIRC),在结肠癌(COAD)组织突变率和表达水平较高。(2)免疫组化和荧光染色结果显示,RIPK2定位在胞质,在不同肿瘤组织中RIPK2的表达和AIM2、CASP1、GSDMD、NLRP3、NOD1和NOD2蛋白表达呈正相关。(3)PPI网络图显示,RIPK2参与免疫调控,包括NOD样、NLRP3炎性小体、AIM2炎性小体和细胞焦亡相关通路。(4)RIPK2的表达与免疫渗漏和临床预后有关,在COAD和KIRC中,RIPK2的表达与CD_(8)^(+)、CD_(4)^(+)T细胞、Neutrophil细胞存在相关性。(5)生存分析曲线显示,RIPK2高表达与KIRC患者的预后生存相关,且高表达RIPK2的KIRC患者生存期缩短。结论RIPK2在COAD、GBM和KIRC等恶性肿瘤中高表达,参与调控免疫渗漏、预测肿瘤预后和生存分析,推测RIPK2可作为一个关键的候选基因,在免疫调控、指导临床预后和治疗恶性肿瘤中发挥重要作用。展开更多
文摘目的:筛选胰腺癌(PC)侵袭相关微小RNA(miRNA,miR),验证其生物学功能和调控的信号通路,为胰腺癌的诊治提供新的分子标志物和靶点。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)的miRNA表达谱数据集GSE71533和GSE85589,分析miR-26b-5p的差异表达;利用癌症基因组图谱数据库(TCGA),分析miR-26b-5p对PC患者总生存率的影响。采用TargetScan数据库识别miR-26b-5p的靶基因集。通过细胞功能实验,验证miR-26b-5p对PANC-1细胞增殖、迁移和侵袭的影响。利用基因本体(GO)和KEGG通路富集分析,揭示miR-26b-5p靶基因的功能,并通过蛋白印迹(Western blotting)实验验证miR-26b-5p靶向的信号通路。结果:在GSE71533和GSE85589数据集,相对于正常组织和对照组血浆,miR-26b-5p在PC组织和PC患者血浆明显低表达(9.65±0.10 vs 10.18±0.07,P<0.001;0.67±0.18 vs 0.79±0.24,P=0.017)。TCGA-胰腺癌生存分析结果显示,miR-26b-5p高表达组的总体生存率明显优于低表达组(P=0.023)。KEGG分析显示,预测的251个miR-26b-5p的靶基因与MAPK信号通路有关。CCK-8实验、Transwell迁移、侵袭实验和划痕实验结果显示:miR-26b-5p抑制PANC-1细胞的增殖、迁移和侵袭。KEGG通路富集分析结果提示miR-26b-5p的靶基因参与丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路。Western blotting实验证实miR-26b-5p下调MKNK2/eIF4E信号通路。结论:miR-26b-5p下调MKNK2/eIF4E信号通路,抑制PANC-1细胞增殖、侵袭,有可能作为胰腺癌诊断和治疗的新靶点。
文摘目的探讨受体相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶2(RIPK2)参与免疫调控通路及临床预后的作用。方法通过TIMER、cBioPortal、Human Protein Atlas(HPA)和UALCAN和STRING等数据库对RIPK2在组织中的定位和表达,及其在肿瘤免疫浸润、免疫调控和生存预后中的作用进行分析。结果(1)RIPK2主要由激酶和CARD结构域构成,第18~298位氨基酸是其激酶结构,第435~526位氨基酸是CARD结构域;与正常组织细胞比较,RIPK2在大部分恶性肿瘤中高表达,其中在子宫内膜上皮癌和人黑色素瘤细胞系(hTERT-HME1)中表达最高。相比胶质瘤(GBM)和透明细胞癌(KIRC),在结肠癌(COAD)组织突变率和表达水平较高。(2)免疫组化和荧光染色结果显示,RIPK2定位在胞质,在不同肿瘤组织中RIPK2的表达和AIM2、CASP1、GSDMD、NLRP3、NOD1和NOD2蛋白表达呈正相关。(3)PPI网络图显示,RIPK2参与免疫调控,包括NOD样、NLRP3炎性小体、AIM2炎性小体和细胞焦亡相关通路。(4)RIPK2的表达与免疫渗漏和临床预后有关,在COAD和KIRC中,RIPK2的表达与CD_(8)^(+)、CD_(4)^(+)T细胞、Neutrophil细胞存在相关性。(5)生存分析曲线显示,RIPK2高表达与KIRC患者的预后生存相关,且高表达RIPK2的KIRC患者生存期缩短。结论RIPK2在COAD、GBM和KIRC等恶性肿瘤中高表达,参与调控免疫渗漏、预测肿瘤预后和生存分析,推测RIPK2可作为一个关键的候选基因,在免疫调控、指导临床预后和治疗恶性肿瘤中发挥重要作用。
