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基于生物化学网络探讨山豆根干预哮喘的作用机制及物质基础
1
作者
何雅风
李红美
+3 位作者
魏明星
唐文雅
张帅男
李煦照
《药物化学》
2022年第3期265-274,共10页
目的:研究山豆根(Sophora tonkinensis Gagnep)治疗哮喘的物质基础和作用机制。方法:首先对山豆根进行液相色谱–质谱联用分析,获得山豆根的化学成分,随后通过数据库TCMIP,获得山豆根成分所能预测的靶点。在CTD数据库中,查找出与哮喘相...
目的:研究山豆根(Sophora tonkinensis Gagnep)治疗哮喘的物质基础和作用机制。方法:首先对山豆根进行液相色谱–质谱联用分析,获得山豆根的化学成分,随后通过数据库TCMIP,获得山豆根成分所能预测的靶点。在CTD数据库中,查找出与哮喘相关靶点,通过韦恩图对山豆根化学成分的靶点与其哮喘相关靶点进行结合,得出二者相互交叉的部分,即为交集靶点。采用Cytoscape v3.8.0软件构建“成分–靶点–疾病”的网络关系,采用DAVID数据库对交集靶点进行KEGG通路分析。最后对交集靶点进一步分析,获得山豆根治疗哮喘的核心靶点。结果:获得127个交集靶点与12个山豆根治疗哮喘的活性成分,筛选出31条KEGG信号通路,进一步挑选出核心靶点7个。结论:本文对山豆根具有多成分、多靶点、多通路等特点的哮喘治疗方法进行了研究和分析,为今后哮喘的治疗提供了理论依据。
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关键词
生物化学
网络
山豆根
哮喘
物质基础
作用机制
靶点
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职称材料
浅谈《生物化学》教学方法改革方案
被引量:
2
2
作者
隋昌海
王琳
《科技资讯》
2015年第10期193-193,195,共2页
《生物化学》是生物技术及应用、生物制药技术等专业的一门专业基础课程和专业主干课程,课程的教学内容丰富的但课堂教学时间有限,为了充分利用学生课余时间,提高课程教学质量,该研究者积极开展基于网上资源利用的《生物化学》教改实践...
《生物化学》是生物技术及应用、生物制药技术等专业的一门专业基础课程和专业主干课程,课程的教学内容丰富的但课堂教学时间有限,为了充分利用学生课余时间,提高课程教学质量,该研究者积极开展基于网上资源利用的《生物化学》教改实践与探索,探讨了基于网络资源利用的生物化学网络辅助教学、自主学习教学模式的可行性;提出并完善基于网络辅助教学、自主学习的教学模式,借助于网络平台补充、优化课堂教学,提高了课程教学质量。
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关键词
《
生物化学
》
教学方法
网络
版课件
生物化学
网络
评测系统
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职称材料
代谢网络可视化系统的力导向布局算法设计
被引量:
3
3
作者
李均豪
张赞波
+1 位作者
纪庆革
徐峻
《计算机仿真》
CSCD
北大核心
2012年第11期47-50,94,共5页
针对生物化学代谢反应网络可视化系统的优化设计,提出了一个基于力导向模型的解决方案。新方案根据具体的可视化目标,综合拓扑信息进行参数调整。实验表明,这些调整给可视化的布局质量带来很大的改善。另外,代谢网络具有鲜明的无尺度网...
针对生物化学代谢反应网络可视化系统的优化设计,提出了一个基于力导向模型的解决方案。新方案根据具体的可视化目标,综合拓扑信息进行参数调整。实验表明,这些调整给可视化的布局质量带来很大的改善。另外,代谢网络具有鲜明的无尺度网络特性。据此,进一步提出了针对枢纽结点的优化方案,在视觉效果上突出了代谢反应网络的无尺度特性。为了融合力导向方案和基于无尺度网络特性的局部调整方案,最后总结了一个三阶段的布局算法框架。
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关键词
网络
可视化
力导向算法
生物化学
代谢反应
网络
无尺度
网络
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职称材料
题名
基于生物化学网络探讨山豆根干预哮喘的作用机制及物质基础
1
作者
何雅风
李红美
魏明星
唐文雅
张帅男
李煦照
机构
贵州中医药大学
出处
《药物化学》
2022年第3期265-274,共10页
文摘
目的:研究山豆根(Sophora tonkinensis Gagnep)治疗哮喘的物质基础和作用机制。方法:首先对山豆根进行液相色谱–质谱联用分析,获得山豆根的化学成分,随后通过数据库TCMIP,获得山豆根成分所能预测的靶点。在CTD数据库中,查找出与哮喘相关靶点,通过韦恩图对山豆根化学成分的靶点与其哮喘相关靶点进行结合,得出二者相互交叉的部分,即为交集靶点。采用Cytoscape v3.8.0软件构建“成分–靶点–疾病”的网络关系,采用DAVID数据库对交集靶点进行KEGG通路分析。最后对交集靶点进一步分析,获得山豆根治疗哮喘的核心靶点。结果:获得127个交集靶点与12个山豆根治疗哮喘的活性成分,筛选出31条KEGG信号通路,进一步挑选出核心靶点7个。结论:本文对山豆根具有多成分、多靶点、多通路等特点的哮喘治疗方法进行了研究和分析,为今后哮喘的治疗提供了理论依据。
关键词
生物化学
网络
山豆根
哮喘
物质基础
作用机制
靶点
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
浅谈《生物化学》教学方法改革方案
被引量:
2
2
作者
隋昌海
王琳
机构
吉林工程职业学院生物工程分院
出处
《科技资讯》
2015年第10期193-193,195,共2页
文摘
《生物化学》是生物技术及应用、生物制药技术等专业的一门专业基础课程和专业主干课程,课程的教学内容丰富的但课堂教学时间有限,为了充分利用学生课余时间,提高课程教学质量,该研究者积极开展基于网上资源利用的《生物化学》教改实践与探索,探讨了基于网络资源利用的生物化学网络辅助教学、自主学习教学模式的可行性;提出并完善基于网络辅助教学、自主学习的教学模式,借助于网络平台补充、优化课堂教学,提高了课程教学质量。
关键词
《
生物化学
》
教学方法
网络
版课件
生物化学
网络
评测系统
分类号
G64 [文化科学—高等教育学]
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职称材料
题名
代谢网络可视化系统的力导向布局算法设计
被引量:
3
3
作者
李均豪
张赞波
纪庆革
徐峻
机构
中山大学信息科学与技术学院
广东轻工职业技术学院计算机工程系
中山大学药学院
出处
《计算机仿真》
CSCD
北大核心
2012年第11期47-50,94,共5页
基金
NSFC-广东联合基金(U0735001)
文摘
针对生物化学代谢反应网络可视化系统的优化设计,提出了一个基于力导向模型的解决方案。新方案根据具体的可视化目标,综合拓扑信息进行参数调整。实验表明,这些调整给可视化的布局质量带来很大的改善。另外,代谢网络具有鲜明的无尺度网络特性。据此,进一步提出了针对枢纽结点的优化方案,在视觉效果上突出了代谢反应网络的无尺度特性。为了融合力导向方案和基于无尺度网络特性的局部调整方案,最后总结了一个三阶段的布局算法框架。
关键词
网络
可视化
力导向算法
生物化学
代谢反应
网络
无尺度
网络
Keywords
Network visualization
Force-Directed algorithm
Metabolic network
Scale-free network
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物化学网络探讨山豆根干预哮喘的作用机制及物质基础
何雅风
李红美
魏明星
唐文雅
张帅男
李煦照
《药物化学》
2022
0
下载PDF
职称材料
2
浅谈《生物化学》教学方法改革方案
隋昌海
王琳
《科技资讯》
2015
2
下载PDF
职称材料
3
代谢网络可视化系统的力导向布局算法设计
李均豪
张赞波
纪庆革
徐峻
《计算机仿真》
CSCD
北大核心
2012
3
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职称材料
已选择
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