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转几丁质酶和核糖体失活蛋白双价基因大豆的获得与抗病性鉴定 被引量:9
1
作者 郭玉双 张艳菊 +5 位作者 朱延明 李杰 柏锡 张淑珍 吴书音 李海燕 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1841-1847,共7页
以东北地区4个主栽大豆品种为试材,通过农杆菌介导法,将2个抗真菌病基因,即几丁质酶基因和核糖体失活蛋白基因构建在同一植物表达载体上,对受体材料进行遗传转化,获得了经Southern检测同时整合双价基因的T0代转基因大豆植株,转化频率为0... 以东北地区4个主栽大豆品种为试材,通过农杆菌介导法,将2个抗真菌病基因,即几丁质酶基因和核糖体失活蛋白基因构建在同一植物表达载体上,对受体材料进行遗传转化,获得了经Southern检测同时整合双价基因的T0代转基因大豆植株,转化频率为0.5%。将T0代转基因大豆植株扩繁至T2代,并进行了大豆疫霉根腐病和大豆灰斑病的抗性检测,4个株系的抗性均比对照有明显提高。分子生物学验证及RT-PCR检测表明,2个外源基因在4个株系中均进行了转录表达。 展开更多
关键词 基因大豆 几丁质酶基因 核糖体蛋白基因 大豆疫霉根腐病 大豆灰斑病
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Cloning and Expression of Curcin, a Ribosome-Inactivating Protein from the Seeds of Jatropha curcas 被引量:7
2
作者 林娟 陈钰 +3 位作者 徐莺 颜钫 唐琳 陈放 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2003年第7期858-863,共6页
Curcin, a ribosome-inactivating protein with a molecular weight of about 28.2 kD, which strongly inhibits the protein synthesis in rabbit reticulocyte lysate system with an IC50 value of about (0.19 +/- 0.01) nmol/L, ... Curcin, a ribosome-inactivating protein with a molecular weight of about 28.2 kD, which strongly inhibits the protein synthesis in rabbit reticulocyte lysate system with an IC50 value of about (0.19 +/- 0.01) nmol/L, was purified from the seeds of Jatropha curcas L. The protein has the activity of rRNA N-glycosidase. Degenerate primers were designed based on the N-terminal partial sequence from purified curcin. The full-length curcin cDNA by RT-PCR and 5'-RACE was cloned. The deduced amino acids sequence indicates that a preprotein with 20 amino acid residues is first translated and then processed to a mature protein with 251 amino acids. The deduced amino acids sequence shares homology of 33% and 57% to those of type I ribosome-inactivating proteins (RIPs) and A chain of type II RIPs, respectively. The sequence encoding mature curcin was integrated into the pQE-30 vector for expression in Escherichia coli strain M15 (pREP4). The purified recombinant curcin was able to inhibit protein synthesis in rabbit reticulocyte lysate system. 展开更多
关键词 Jatropha curcas CURCIN RNA N-glycosidase CLONING in Escherichia coli expression
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应用玉米核糖体失活蛋白基因改善马铃薯对立枯丝核菌抗性 被引量:2
3
作者 郝文胜 赵永秀 +2 位作者 张永丰 东保柱 张少英 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期2200-2206,共7页
为探索在马铃薯中表达玉米源核糖体失活蛋白基因(RIP)是否可以改善受体对真菌病原立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)的抗性,本研究以根癌农杆菌菌株LBA4404(p2301-RIP)转化马铃薯易感品种"Favorita"并进行了目的基因表达的分子... 为探索在马铃薯中表达玉米源核糖体失活蛋白基因(RIP)是否可以改善受体对真菌病原立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)的抗性,本研究以根癌农杆菌菌株LBA4404(p2301-RIP)转化马铃薯易感品种"Favorita"并进行了目的基因表达的分子生物学鉴定和对R.Solani的抗病性鉴定。结果表明:卡那霉素抗性再生株系的基因组中扩增到了目的基因,经Southern印记分析证实各独立转化株系基因组中均整合了2个拷贝RIP基因;RT-PCR分析表明RIP基因在转录水平正常表达;酶促活性测定表明部分转基因植株蛋白提取物具有RIP基因产物应有的脱嘌呤活性;温室盆栽试验证实有1个转基因株系显著提高了对由R.Solani引起的马铃薯黑痣病的抗性。 展开更多
关键词 马铃薯 核糖体蛋白基因 遗传转化 立枯丝核菌 真菌抗性
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黑木耳核糖体失活蛋白cDNA 3′-端的克隆与分析
4
作者 邓中枢 赵恒田 +1 位作者 裴雪 黄福生 《中国野生植物资源》 2010年第4期37-41,共5页
为了克隆黑木耳核糖体失活蛋白cDNA 3′-端,根据随机测得的中间一段蛋白质序列设计简并引物,应用RT-PCR和3′-RACE反应方法,将得到的基因片段与质粒连接,并转化至大肠杆菌中,进行蓝白筛选,再通过琼脂糖凝胶电泳法和PCR法验证白斑,从而... 为了克隆黑木耳核糖体失活蛋白cDNA 3′-端,根据随机测得的中间一段蛋白质序列设计简并引物,应用RT-PCR和3′-RACE反应方法,将得到的基因片段与质粒连接,并转化至大肠杆菌中,进行蓝白筛选,再通过琼脂糖凝胶电泳法和PCR法验证白斑,从而得到阳性重组质粒,最后克隆出该目的蛋白基因片段。结果表明,克隆出的cDNA 3′-端为330bp的开放阅读框(ORF),编码107个氨基酸和2个终止密码子。经试验证明和文献检索,克隆得到的cDNA 3′-端为一种新基因。 展开更多
关键词 黑木耳 核糖体蛋白基因 3′-快速扩增cDNA末端
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遗传 育种
5
《麦类文摘》 1996年第6期21-22,共2页
Z961215 大麦核糖体失活蛋白基因的克隆及序列分析/吴志浩,朱祯…(中科院遗传所)//农业生物技术学报.-1995,3(4).-64~70以大麦基因组 DNA 为模板,通过合成5′-端及3′-端的一对特异引物,利用多聚酶链式反应(PCR)扩增出了大麦核糖体失... Z961215 大麦核糖体失活蛋白基因的克隆及序列分析/吴志浩,朱祯…(中科院遗传所)//农业生物技术学报.-1995,3(4).-64~70以大麦基因组 DNA 为模板,通过合成5′-端及3′-端的一对特异引物,利用多聚酶链式反应(PCR)扩增出了大麦核糖体失活蛋白编码序列,随后将其克隆到 E.coli 质粒上。序列分析表明,大麦核糖体失活蛋白基因由846个核苷酸组成,编码由281个氨基酸残基组成的多肽。与发表序列相比较,核苷酸序列及推导的氨基酸序列的同源性分别为93.1%和92%。(图5参9)Z961216 西藏裸大麦主要性状的遗传参数研究/王建林,胡书银…(西藏农牧学院农学系)//遗传.-1996,18(2). 展开更多
关键词 核糖体蛋白基因 啤酒大麦 序列分析 遗传相关系数 多聚酶链式反应 农业生物技术 西藏裸大麦 特异引物 育种 主要性状
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抗真菌转基因大豆对大豆疫霉根腐病抗病性鉴定 被引量:5
6
作者 郭玉双 张艳菊 +4 位作者 朱延明 刘佳 李杰 柏锡 张淑珍 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第6期733-738,共6页
采用下胚轴伤口接种法,对Southern杂交阳性的转菜豆几丁质酶基因和大麦核糖体失活蛋白基因的双价转基因大豆T2代的5个株系,进行了大豆疫霉根腐病抗病性检测,并通过比较接种后转基因大豆与对照组的死亡率来探讨两者的抗病性差异。结果表... 采用下胚轴伤口接种法,对Southern杂交阳性的转菜豆几丁质酶基因和大麦核糖体失活蛋白基因的双价转基因大豆T2代的5个株系,进行了大豆疫霉根腐病抗病性检测,并通过比较接种后转基因大豆与对照组的死亡率来探讨两者的抗病性差异。结果表明,有4个转基因株系对大豆疫霉根腐病的抗性与非转基因对照组相比有明显提高,另外1个株系与对照组相比没有明显差异。 展开更多
关键词 基因大豆 菜豆几丁质酶基因 大麦核糖体蛋白基因 大豆疫霉根腐病 抗痛性鉴定
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农杆菌介导TCS及RIP基因转化草莓的研究 被引量:3
7
作者 高庆玉 黄士杰 张丙秀 《中国果树》 北大核心 2008年第2期14-18,79,共6页
采用农杆菌介导法,将TCS基因和RIP基因导入草莓中,探讨影响草莓遗传转化的主要因素,建立了高效的草莓遗传转化体系。并经Km抗性筛选,获得了若干转基因植株,对这些植株进行了TCS基因和RIP基因的PCR检测和PCR-Southern杂交检测,结果显示,... 采用农杆菌介导法,将TCS基因和RIP基因导入草莓中,探讨影响草莓遗传转化的主要因素,建立了高效的草莓遗传转化体系。并经Km抗性筛选,获得了若干转基因植株,对这些植株进行了TCS基因和RIP基因的PCR检测和PCR-Southern杂交检测,结果显示,TCS基因及RIP基因已转入草莓植株的基因组中。 展开更多
关键词 草莓 基因转化 根癌农杆菌 天花粉蛋白基因TCS 核糖体蛋白基因RIP
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刘静 被引量:1
8
作者 黄艳艳 罗磊 +4 位作者 牛庆霖 刘峰 翁曼丽 刘静 冯殿齐 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2014年第4期481-488,494,共9页
本研究应用农杆菌介导的方法,采用L9(34)正交试验设计,对影响宁阳大枣基因转化的各项因子进行了分析比较,并着重探索了Ca2+浓度对侵染转化的影响.结果表明:侵染效率最高的组合为1/2 侵染液浓度,20 min 侵染时间和0 mg/L Ca2+浓度.... 本研究应用农杆菌介导的方法,采用L9(34)正交试验设计,对影响宁阳大枣基因转化的各项因子进行了分析比较,并着重探索了Ca2+浓度对侵染转化的影响.结果表明:侵染效率最高的组合为1/2 侵染液浓度,20 min 侵染时间和0 mg/L Ca2+浓度.Ca2+浓度在提高宁阳大枣基因转化效率方面没有明显促进效果.Ca2+浓度仅对平均分化芽数影响较大,浓度为0 mg/L 时,平均分化芽数最多.本试验共获得27 株转化苗,试验转化效率为33.33%. 展开更多
关键词 农杆菌介导法 香樟核糖体蛋白基因 枣疯病 Ca2+浓度
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S7核糖体蛋白基因序列变异及其在低等鲤科鱼类中的系统发育意义 被引量:13
9
作者 王绪桢 何舜平 陈宜瑜 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第14期1089-1094,共6页
鲤科是世界鱼类中最大的科,有210余属2010种.为研究其系统发育关系需要筛选合适的DNA标记.将S7核糖体蛋白基因用作遗传标记进行鲤科鱼类的系统发育分析.通过PCR方法,扩增了长度为602bp的胭脂鱼以及长度为655~859bp的16种鲤科鱼类的S7... 鲤科是世界鱼类中最大的科,有210余属2010种.为研究其系统发育关系需要筛选合适的DNA标记.将S7核糖体蛋白基因用作遗传标记进行鲤科鱼类的系统发育分析.通过PCR方法,扩增了长度为602bp的胭脂鱼以及长度为655~859bp的16种鲤科鱼类的S7基因内含子1序列.序列排列得到925个排列位点,其中信息位点499个,占全部位点的54%.结果表明,鲤科鱼类S7基因内含子1序列具有丰富的信息位点,并且在亲缘关系不同的物种间存在显著的序列差异.基于S7基因内含子1序列的NJ(neighbor-joining)和MP(most-parsimony)分支树经1000次重复抽样检验后,节点的自展支持率普遍高于以细胞色素b及线粒体控制区(d-loop)基因为遗传标记时所得到的分支树.因此,S7基因内含子1作为遗传标记在鲤科系统发育研究中的分辨率是比较高的,它是一个适合鲤科内亚科水平系统发育研究的有用的分子遗传标记.但S7基因内含子1是否适用于鲤形目科间或科以上水平的分子系统学分析,有待进一步研究. 展开更多
关键词 S7核糖体蛋白基因 系统发育 鲤科 序列变异 内含子 遗传标记 分子系统学
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长春花黄化植原体(PY)株系的检测与鉴定 被引量:15
10
作者 蔡红 孔宝华 陈海如 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期116-119,共4页
A 1.2kb and 1.3kb DNA fragments were amplified in DNA samples extracted from periwinkle exhibiting yellows naturally. The amplified fragments were cloned, sequenced and compared with other phytoplasma strains. The res... A 1.2kb and 1.3kb DNA fragments were amplified in DNA samples extracted from periwinkle exhibiting yellows naturally. The amplified fragments were cloned, sequenced and compared with other phytoplasma strains. The results showed that the 16S rDNA and ribosomal protein gene of periwinkle yellows phytoplasma consist of 1239bp and 1244bp, respectively. They all shared high homology (higher than 97.5%) with phytoplasma strains of 16S rI group. Thus, the result made it clear that the phytoplasma strain of periwinkle yellows (PY) is one of the members of phytoplasma 16SrI group. 展开更多
关键词 长春花 黄化植原 检测 鉴定 核糖体蛋白基因
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S3核糖体蛋白基因的过表达与K562/DOX细胞耐药性的关系 被引量:6
11
作者 朱宁希 郑树 +1 位作者 徐荣臻 虞荣喜 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期141-143,共3页
目的 观察S3核糖体蛋白 (S3rp)基因表达的改变对白血病耐药性的影响。方法 通过RT PCR方法获得含S3rp基因完整开放阅读框架 (ORF)的cDNA ,并将其克隆到pGEM TEasy载体里 ,然后通过亚克隆方法将pGEM TEasy重组质粒里的S3rpcDNA片段克... 目的 观察S3核糖体蛋白 (S3rp)基因表达的改变对白血病耐药性的影响。方法 通过RT PCR方法获得含S3rp基因完整开放阅读框架 (ORF)的cDNA ,并将其克隆到pGEM TEasy载体里 ,然后通过亚克隆方法将pGEM TEasy重组质粒里的S3rpcDNA片段克隆到真核表达载体pcDNA3.1(+)中 ,分别构建正向插入和反向插入的S3rpcDNA重组质粒 ,进行基因转染。将正义S3rpcDNA真核表达质粒转染K5 6 2细胞 ,使其S3rp基因表达增加 ,观察其对化疗药物敏感性的改变 ;将反义S3rpcDNA真核表达质粒转染具有多药耐药 (MDR)表型的K5 6 2 DOX细胞 ,阻碍其S3rp基因的表达 ,观察其对化疗药物耐药性的改变。结果 转染正义S3rpcDNA真核表达质粒后 ,K5 6 2细胞对阿霉素的耐药性比未转染的K5 6 2细胞增强 5 .8倍 ;转染反义S3rpcDNA真核表达质粒后 ,K5 6 2 DOX细胞对阿霉素的耐药性比未转染的K5 6 2 DOX细胞降低 6 9%。结论 S3rp基因过表达在K5 6 2 DOX细胞耐药性的形成中起重要作用。 展开更多
关键词 S3核糖体蛋白基因 K562/DOX细胞 耐药性 基因过表达 白血病
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S7核糖体蛋白基因序列变异与亚科鱼类的单系性研究 被引量:5
12
作者 王绪桢 何舜平 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期122-126,共5页
使用分子生物学的方法对亚科鱼类的单系性进行了探讨。通过PCR方法 ,获得了 13种鲤科鱼类S7核糖体蛋白基因第 1内含子序列 ,其中包括 6种亚科鱼类。使用MEGA软件中的Neighbor Joining法和Most Parsimony法分别构建分支系统图。研究... 使用分子生物学的方法对亚科鱼类的单系性进行了探讨。通过PCR方法 ,获得了 13种鲤科鱼类S7核糖体蛋白基因第 1内含子序列 ,其中包括 6种亚科鱼类。使用MEGA软件中的Neighbor Joining法和Most Parsimony法分别构建分支系统图。研究结果显示目前所确认的亚科鱼类实际上没有形成单系类群。其中属、波鱼属和低线属位于系统树基部 ,显示出原始性。而由细鲫属、马口鱼属和属构成的类群相对于亚科中的原始种类起源较晚 ,可能和较晚起源的东亚鲤科类群之间有更为密切的关系。 展开更多
关键词 Dan亚科 S7核糖体蛋白基因 系统发育 鲤科
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21例先天性纯红细胞再生障碍性贫血核糖体蛋白基因突变分析 被引量:8
13
作者 陈玉梅 阮敏 +6 位作者 邹尧 郭晔 王书春 陈晓娟 张丽 刘天峰 竺晓凡 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期1414-1418,共5页
本研究旨在探讨先天性纯红细胞再生障碍性贫血(Diamond-Blackfan anemia,DBA)患者的核糖体蛋白基因突变。对我院2008年12月至2012年4月期间诊治的21例DBA患者进行9个与本病相关的核糖体蛋白基因(RPS19、RPS24、RPS17、RPL5、RPL11、RPS7... 本研究旨在探讨先天性纯红细胞再生障碍性贫血(Diamond-Blackfan anemia,DBA)患者的核糖体蛋白基因突变。对我院2008年12月至2012年4月期间诊治的21例DBA患者进行9个与本病相关的核糖体蛋白基因(RPS19、RPS24、RPS17、RPL5、RPL11、RPS7、RPL35a、RPS10和RPS26)检测。结果表明,在21例患者中,有8例发生了核糖体蛋白基因突变,突变率为38.1%,其中RPS19基因突变3例,RPS24、RPS7、RPL5、RPL11、RPL35a突变各1例。在本组患者中未检测到RPS17、RPS10和RPS26基因突变。RPL11及RPL5突变患者分别伴有六指畸形、足趾畸形,1例RPS19突变患者伴有尿道下裂。结论:本研究中DBA患者核糖体蛋白基因突变发生率低于西方国家,部分RPS19突变患者可发生尿道下裂,RPL11及RPL5突变与指趾畸形相关。 展开更多
关键词 先天性纯红细胞再生障碍性贫血 核糖体蛋白基因 基因突变
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先天性纯红细胞再生障碍性贫血基因型与表型及疗效的相关性 被引量:7
14
作者 郑杰 吴润晖 +2 位作者 苏雁 马洁 张利强 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2018年第8期576-579,共4页
目的 分析具有明确致病基因突变的先天性纯红细胞再生障碍性贫血(Diamond-Blackfan anemia,DBA)患儿基因突变与临床表型及治疗反应的相关性.方法 回顾分析DBA中国及首都医科大学附属北京儿童医院2009年12月至2017年10月诊治及随访的4... 目的 分析具有明确致病基因突变的先天性纯红细胞再生障碍性贫血(Diamond-Blackfan anemia,DBA)患儿基因突变与临床表型及治疗反应的相关性.方法 回顾分析DBA中国及首都医科大学附属北京儿童医院2009年12月至2017年10月诊治及随访的42例具有明确致病基因突变的DBA患儿的临床资料及基因检测结果,统计分析其相关性.结果 42例患儿中位随访40个月(1~ 136个月),尚无成功停药患儿.检测到RPL5、RPL11、RPL35a、RPS17、RPS19、RPS24和RPS26共7种突变,最常见的基因突变是RPS19(42.9%),其次是RPL11(19.0%)、RPS17(11.9%)、RPS26(11.9%)、RPLS(7.1%)和RPL35a(4.8%).发病时血红蛋白中位水平为42.5 g/L,12例患儿存在身体畸形,以心脏畸形及手指畸形最为常见.37例患儿接受激素治疗,初期总反应率为89.2%(33/37例),激素无效患儿中1例使用环孢素(CSA)治疗有效,其余3例予输血治疗.结论 DBA患儿基因突变以RPS19最为常见,RPS17突变以拷贝数变异为主,在进行DBA基因检测时需注意大片段缺失可能.RPL5突变患儿畸形发生率高,各组患儿在发病年龄、发病时血红蛋白水平、畸形发生率及激素治疗有效率方面差异无统计学意义. 展开更多
关键词 先天性纯红细胞再生障碍性贫血 核糖体蛋白基因 基因 表型 治疗
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云南花生丛枝植原体16S rRNA和核糖体蛋白基因序列分析 被引量:7
15
作者 万琼莲 杨子祥 +2 位作者 王连春 蔡红 陈海如 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期370-378,共9页
利用植原体16S rRNA基因及核糖体蛋白基因(ribosomal protein,rp)通用引物对发生在云南元谋的花生丛枝病病株DNA进行PCR扩增,并对扩增片段进行序列测定。扩增获得的云南元谋花生丛枝植原体(PnWB-YNym)16S rDNA、16S-23S rDNA和23S DNA... 利用植原体16S rRNA基因及核糖体蛋白基因(ribosomal protein,rp)通用引物对发生在云南元谋的花生丛枝病病株DNA进行PCR扩增,并对扩增片段进行序列测定。扩增获得的云南元谋花生丛枝植原体(PnWB-YNym)16S rDNA、16S-23S rDNA和23S DNA片段总长1 806 bp,rp基因扩增片段长1 171 bp。云南株系与来源于台湾和海南的花生丛枝植原体均有较高同源性。比较16S rDNA片段,发现云南株系在5个位点上与来自台湾或海南的株系存在碱基差异,其中有1个位点的差异是云南元谋株系特异的;再分别比较核糖体蛋白rplV-rpsC 2个基因所编码的氨基酸序列,发现云南株系rpsC编码的第194位氨基酸与台湾和海南的株系存在差异。经16S rDNA片段系统进化及iPhyClassifier在线分析,表明PnWBYNym在分类上属于16SrII-A亚组成员,与候选种‘Cand/datus Phytoplasma australasiae'相关;基于rp基因构建的系统进化树表明,PnWB-YNym与16SrII-A亚组各成员聚为同一亚进化支(iii)。 展开更多
关键词 云南元谋花生丛枝 植原 16S RDNA 核糖体蛋白基因 序列分析
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山东蚕区桑黄化型萎缩病病原物的分子鉴定 被引量:6
16
作者 刘永光 田国忠 +3 位作者 王洁 李向东 竺晓平 束怀瑞 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期463-471,共9页
以采自山东省宁阳市桑园的桑黄化型萎缩病发病植株叶脉组织为材料,通过PCR扩增植原体16S rRNA基因及延伸因子基因(tuf)和核糖体蛋白基因(rp),分别得到大小约为1.4、0.8和1.2 kb的目的片段并测定序列。以该病原物的16S rRNA基因与GanBan... 以采自山东省宁阳市桑园的桑黄化型萎缩病发病植株叶脉组织为材料,通过PCR扩增植原体16S rRNA基因及延伸因子基因(tuf)和核糖体蛋白基因(rp),分别得到大小约为1.4、0.8和1.2 kb的目的片段并测定序列。以该病原物的16S rRNA基因与GanBank中相关的植原体16S rRNA基因序列构建系统发育树并进行RFLP分析,结果显示该病原物属于翠菊黄化组的16SⅠr-B亚组,与翠菊黄化组16SⅠr-B亚组典型成员的同源性为99.9%。进一步对延伸因子基因和核糖体蛋白基因构建系统发育树并做RFLP分析,结果显示该病原物与翠菊黄化组的tuⅠf-B亚组典型成员和rpⅠ-B亚组典型成员的同源性分别达到99.6%、99.9%。由此在3个基因水平确定该植原体的分类地位属于16SrⅠ-B、tuⅠf-B和rpⅠ-B亚组。 展开更多
关键词 桑萎缩植原 16S RRNA基因 延伸因子基因 核糖体蛋白基因 同源性分析
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西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析 被引量:6
17
作者 吴宽 颜永杰 +1 位作者 王海妮 张珏 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2010年第3期265-268,共4页
枣疯病是枣树上的一种具有毁灭性的植原体病害,几乎分布于国内所有的枣树栽培区,造成了巨大的经济损失。对我国陕西、宁夏、甘肃3省枣疯病样品植原体核糖体蛋白基因进行克隆和测序,获得枣疯病植原体的核糖体基因片段为1 196bp,包含部分r... 枣疯病是枣树上的一种具有毁灭性的植原体病害,几乎分布于国内所有的枣树栽培区,造成了巨大的经济损失。对我国陕西、宁夏、甘肃3省枣疯病样品植原体核糖体蛋白基因进行克隆和测序,获得枣疯病植原体的核糖体基因片段为1 196bp,包含部分rps19,rpl22和rps3三个基因,其中rpl22和rps3大小分别354bp和753bp,分别编码118和251个氨基酸,且这两个基因为非重叠基因。序列同源性比较结果表明:我国陕西、宁夏、甘肃的枣疯病植原体的核糖体蛋白rp基因大小一致,归属于植原体16SrⅤ-B组;该植原体核糖体蛋白基因特性与樱桃致死黄化(CLY5)和桃树黄化印度分离株系(PY-In)植原体相似。首次报道了我国枣疯病核糖体蛋白基因rp基因的序列,把枣疯病植原体归到16SrⅤ-B组,为枣疯病植原体提供了新的分类依据。 展开更多
关键词 枣疯病 植原 核糖体蛋白基因 序列分析 生物信息学
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长春花黄化植原体核糖体蛋白基因片段序列分析 被引量:4
18
作者 蔡红 陈惠 +1 位作者 李凡 陈海如 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期34-37,共4页
对自然表现典型黄化症的长春花植株总DNA进行植原体核糖体蛋白基因 (ribosomalproteingene ,rpgene)PCR扩增 ,得到约 1 3kb的特异片段。将此特异片段与pGEM TEasy载体连接并转化到大肠杆菌JM 1 0 9感受态细胞中 ,通过PCR鉴定、限制性... 对自然表现典型黄化症的长春花植株总DNA进行植原体核糖体蛋白基因 (ribosomalproteingene ,rpgene)PCR扩增 ,得到约 1 3kb的特异片段。将此特异片段与pGEM TEasy载体连接并转化到大肠杆菌JM 1 0 9感受态细胞中 ,通过PCR鉴定、限制性内切酶 (EcoRI)酶切分析、核苷酸序列测定及分析 ,结果表明该株系核糖体蛋白基因片段长 1 ,2 4 4bp ,包含rpl2 2、rps3基因 ,分别编码 1 2 9和 2 5 2个氨基酸 ,且这两个基因为重叠基因。 展开更多
关键词 长春花 黄化 植原 核糖体蛋白基因 序列分析
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柑橘黄龙病菌核糖体蛋白基因的多态性及系统发育分析 被引量:5
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作者 鹿连明 范国成 +2 位作者 姚锦爱 胡秀荣 陈国庆 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期125-132,共8页
通过PCR扩增6个不同地区柑橘黄龙病(citrus huanglongbing,HLB)病原茵的核糖体蛋白基因,采用4种不同的限制性内切酶对PCR产物进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析;并对核糖体蛋白基因克隆和测序后,使用DNAman和NCBI Blast等软... 通过PCR扩增6个不同地区柑橘黄龙病(citrus huanglongbing,HLB)病原茵的核糖体蛋白基因,采用4种不同的限制性内切酶对PCR产物进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析;并对核糖体蛋白基因克隆和测序后,使用DNAman和NCBI Blast等软件对基因序列进行比对分析,并通过软件Mega4.1构建其系统发育树.结果表明:6个分离物核糖体蛋白基因的RFLP指纹图谱有所差异,表现出一定的多态性;不同分离物核糖体蛋白基因的核酸序列和氨基酸序列均存在差异,但相互之间同源性很高,其中核酸序列与数据库中亚洲种(CandidatusLiberibacterasiaticus)的同源性高达99%~100%,与非洲种(Ca.L.africanus)的同源性为85%,与美洲种(Ca.L.americanus)的同源性为77%~80%;系统发育分析显示所有的Ca.L.asiaticus亲缘关系极近,归为一个类群,而后与Ca.L.africanus和Ca.L.americanus组成韧皮部杆菌属(CandidatusLiberibacter)一个大的类群. 展开更多
关键词 亚洲种黄龙病菌 核糖体蛋白基因 多态性 系统发育分析
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云南泡桐丛枝病植原体核糖体蛋白基因片段序列分析 被引量:5
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作者 和志娇 蔡红 +3 位作者 陈海如 和根强 吴华英 唐丽明 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第S1期18-21,共4页
应用植原体核糖体蛋白基因通用引物对rpF1/rpR1,对采自云南省曲靖市的泡桐丛枝病植原体DNA(PaWB-QJ)进行PCR扩增,得到1.3 kb的特异片段,证明此病株中存在植原体。将此片段与pGEM-T Easy载体连接并转化大肠杆菌 JM109感受态细胞,进行PC... 应用植原体核糖体蛋白基因通用引物对rpF1/rpR1,对采自云南省曲靖市的泡桐丛枝病植原体DNA(PaWB-QJ)进行PCR扩增,得到1.3 kb的特异片段,证明此病株中存在植原体。将此片段与pGEM-T Easy载体连接并转化大肠杆菌 JM109感受态细胞,进行PCR鉴定、核糖体蛋白基因部分核苷酸序列测定及分析。结果表明,该株系(PaWB-QJ)核糖体蛋白基因片段长1 244 bp,包含rps19、rp122和rps3基因。对PaWB-QJ株系的核糖体蛋白基因序列的同源性比较结果显示与 16S rI-B亚组的翠菊黄化(Aster yellows,AY)、长春花黄化(Periwinkle yellows,PY)和泡桐丛枝德国株系(Paulownia witches’-broom,PaWB-German)的亲缘关系最近,达到99.0%以上,而与其它组中的株系明显低于97.0%,所以认为该植原体株系属于翠菊黄化组B亚组(16SrI-B)。 展开更多
关键词 泡桐 丛枝 核糖体蛋白基因序列 植原 翠菊黄化
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