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甘蓝型油菜产量及相关性状的QTL分析 被引量:46
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作者 易斌 陈伟 +2 位作者 马朝芝 傅廷栋 涂金星 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期676-682,共7页
通过QTL作图分析了产量及其相关性状的数量性状位点,以甘蓝型油菜中油821和保604 F1代小孢子培养获得的DH系为作图群体,构建了由20个连锁群组成的,包括251个分子标记(2个RFLP标记,72个RAPD标记,91个SSR标记,86个SRAP标记)的遗传连锁图... 通过QTL作图分析了产量及其相关性状的数量性状位点,以甘蓝型油菜中油821和保604 F1代小孢子培养获得的DH系为作图群体,构建了由20个连锁群组成的,包括251个分子标记(2个RFLP标记,72个RAPD标记,91个SSR标记,86个SRAP标记)的遗传连锁图(10个标记没有分配到连锁群中).图谱的平均图距为6.96 cM,共覆盖油菜基因组1 746.5 cM.在此图谱基础上采取复合区间作图法,检测到与油菜产量及其相关性状有关的QTL共17个.其中控制株高的3个分别位于第4、第9和第10连锁群上,对性状的解释率为9.42%~17.58%;与分枝部位有关的4个分别位于第4、第6和第7连锁群上,其中Bp1和Bp2均位于第4连锁群,对性状的解释率为8.13%~15.20%;与主花序有效长有关的3个分别位于第4、第10和第16连锁群上,对性状的解释率为7.49%~23.36%;与一次有效分枝有关的2个分别位于第1、第4连锁群上,对性状的解释率为15.29%~19.58%;与角果总数和千粒重有关的分别位于第4连锁群和第9连锁群上,贡献率分别为17.42%和7.64%;与单株产量有关的3个分别位于第3、第4和第15连锁群,共解释26.60%的表型变异.部分性状的QTL在连锁群上成簇分布,对性状贡献率很大,表现主效QTLs的特点,相应的性状之间也呈显著相关,这表明一因多效或者相关的QTLs之间紧密连锁是性状相关的遗传基础.本研究中与主效QTLs连锁的标记可用于油菜产量性状的分子标记辅助选择. 展开更多
关键词 油菜 双单倍体群体 分子标记遗传图谱 产量 数量性状位点(qtl)
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基于SNP标记的玉米株高及穗位高QTL定位 被引量:51
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作者 郑德波 杨小红 +4 位作者 李建生 严建兵 张士龙 贺正华 黄益勤 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期549-556,共8页
为进一步明确玉米株高和穗位高的遗传机制,为育种生产提供服务,本研究以K22×CI7、K22×Dan340的F2群体为作图群体,利用覆盖玉米10条染色体的SNP标记构建了2个连锁图谱。并将这2个F2群体衍生的分别含237和218个家系的F2:3群体... 为进一步明确玉米株高和穗位高的遗传机制,为育种生产提供服务,本研究以K22×CI7、K22×Dan340的F2群体为作图群体,利用覆盖玉米10条染色体的SNP标记构建了2个连锁图谱。并将这2个F2群体衍生的分别含237和218个家系的F2:3群体用于田间性状的鉴定。用复合区间作图模型对2个群体的株高、穗位高表型进行QTL定位分析。结果显示,在广西南宁和湖北武汉两种环境条件下共定位到21个株高QTL和27个穗位高QTL;单个QTL表型变异贡献率的变幅为4.9%~17.9%;株高和穗位高QTL的作用方式以加性和部分显性为主;第7染色体上可能存在控制株高和穗位高的主效QTL。 展开更多
关键词 SNP 数量性状位点(qtl) 连锁图谱 株高 穗位高 玉米
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玉米SSR连锁图谱构建与株高及穗位高QTL定位 被引量:33
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作者 张志明 赵茂俊 +1 位作者 荣廷昭 潘光堂 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期341-344,共4页
用玉米自交系组合R15×掖478的F2群体构建连锁图谱,并通过1年2点随机区组试验设计,考察玉米229个F2:4家系成株期的株高和穗位高。所建连锁图谱上共拟合146个SSR标记位点,覆盖基因组1666cM,标记间平均距离为11.4cM。用复合区... 用玉米自交系组合R15×掖478的F2群体构建连锁图谱,并通过1年2点随机区组试验设计,考察玉米229个F2:4家系成株期的株高和穗位高。所建连锁图谱上共拟合146个SSR标记位点,覆盖基因组1666cM,标记间平均距离为11.4cM。用复合区间作图法进行QTL分析,共检测到8个控制株高的QTL,分别位于第2、3、4.5和8染色体;3个控制穗位高的QTL位点,位于第4染色体。单个株高QTL的贡献率变幅为6.67%-11.59%,单个穗位高QTL贡献率变幅为10.46%-12.15%。 展开更多
关键词 SSR 分子连锁图谱 数量性状位点(qtl) 株高 穗位高 玉米
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控制水稻剑叶形态相关性状的数量基因位点(QTL)的定位 被引量:20
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作者 肖珂 左海龙 +3 位作者 巩迎军 张俊芝 张永娟 董彦君 《上海师范大学学报(自然科学版)》 2007年第2期66-70,共5页
水稻籽粒中一半以上的碳水化合物来自剑叶的光合作用,剑叶形态改良一直是水稻株型育种的一个重要目标.利用一个日本主要种植的粳稻品种越光(轮回亲本)和一个印度的籼稻品种Kasalath杂交产生的回交重组自交系群体(backcross recombi... 水稻籽粒中一半以上的碳水化合物来自剑叶的光合作用,剑叶形态改良一直是水稻株型育种的一个重要目标.利用一个日本主要种植的粳稻品种越光(轮回亲本)和一个印度的籼稻品种Kasalath杂交产生的回交重组自交系群体(backcross recombinant inbred lines,BILs)对剑叶形态中的3个主要性状(剑叶长、叶宽以及其叶面积)进行了相关分析及其数量基因位点(quantitative trait loci,QTL)的定位.研究表明,控制剑叶形态的3个主要性状间存在极显著的正相关,并检测到影响3个性状的8个QTL,分布在第1,3,4,6条染色体上,贡献率介于4.94%~22.07%,其中第4染色体上C1016标记和第6染色体上C556标记附近的共有6个QTL,其两侧的紧密分子标记在水稻株型分子育种上具有一定应用价值. 展开更多
关键词 水稻 相关 剑叶形态 数量性状位点(qtl)
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水稻灌浆期不同阶段叶绿素含量的QTL分析 被引量:20
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作者 阿加拉铁 曾龙军 +6 位作者 薛大伟 胡江 曾大力 高振宇 郭龙彪 李仕贵 钱前 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期61-66,共6页
本研究以典型籼粳交(春江06/台中本地1号)的F1代花培加倍的DH群体为材料,系统考察了DH群体及其双亲在4个灌浆期不同阶段顶三叶的叶绿素含量,通过QTL作图分析,共检测到7个与叶绿素含量相关的QTL,分别分布在第4、6和8染色体上。其中,倒3叶... 本研究以典型籼粳交(春江06/台中本地1号)的F1代花培加倍的DH群体为材料,系统考察了DH群体及其双亲在4个灌浆期不同阶段顶三叶的叶绿素含量,通过QTL作图分析,共检测到7个与叶绿素含量相关的QTL,分别分布在第4、6和8染色体上。其中,倒3叶的QTL主要在灌浆早期表达,到灌浆后期则逐渐被倒2叶和剑叶所代替。在灌浆的前2个阶段检测到的4个QTL的总贡献率较大,表明在灌浆前期叶绿素含量较高;而在第3个阶段检测到了3个QTL,在第4个阶段则只检测2个QTL,贡献率均小于初期的总贡献率,表明随着灌浆的进程,叶绿素含量逐渐减少。其中qCHL2、qCHL4-1、qCHL4-2、qCHL8-1和qCHL8-2主要是在灌浆中前期对叶绿素含量起作用。而qCHL6-1和qCHL6-2两个QTL分别在后期的剑叶检测到,表明与剑叶"持绿"特性或抗衰老关系密切。 展开更多
关键词 水稻 加倍单倍体(DH) 数量性状位点(qtl) 叶绿素含量
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马铃薯SSR遗传连锁图谱构建及3个重要农艺性状QTLs定位 被引量:19
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作者 单友蛟 刘杰 +4 位作者 卞春松 段绍光 徐建飞 庞万福 金黎平 《中国蔬菜》 北大核心 2010年第18期10-14,共5页
利用二倍体马铃薯杂交群体P1的167个基因型为作图群体,应用SSR标记构建了一张总长度为645cM的遗传连锁图谱,该图谱包含86个SSR标记,标记间平均距离为7.5cM。应用该图谱,利用复合区间作图法,对与马铃薯块茎相关的3个重要农艺性状进行QTL... 利用二倍体马铃薯杂交群体P1的167个基因型为作图群体,应用SSR标记构建了一张总长度为645cM的遗传连锁图谱,该图谱包含86个SSR标记,标记间平均距离为7.5cM。应用该图谱,利用复合区间作图法,对与马铃薯块茎相关的3个重要农艺性状进行QTL定位和遗传效应分析,结果在第5条染色体上检测到控制3个性状的QTL各1个,其中控制单株产量的QTL遗传贡献率为12.3%,控制单薯质量的QTL遗传贡献率为16.1%,控制块茎比重的QTL遗传贡献率为11.2%。 展开更多
关键词 马铃薯 SSR标记 遗传图谱 块茎性状 数量性状位点(qtl)
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大白菜部分形态性状的QTL定位与分析 被引量:11
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作者 于拴仓 王永健 郑晓鹰 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第12期1153-1160,共8页
应用 35 2个标记位点的大白菜AFLP和RAPD图谱和一套栽培品种间杂交获得的重组自交系群体 ,采用复合区间作图的方法对大白菜 9个形态性状进行QTL定位及遗传效应研究。在 14个连锁群上检测到 5 0个QTL :其中控制株型的QTL有 5个 ;控制株高... 应用 35 2个标记位点的大白菜AFLP和RAPD图谱和一套栽培品种间杂交获得的重组自交系群体 ,采用复合区间作图的方法对大白菜 9个形态性状进行QTL定位及遗传效应研究。在 14个连锁群上检测到 5 0个QTL :其中控制株型的QTL有 5个 ;控制株高的QTL有 6个 ;控制开展度的QTL有 5个 ;控制最大叶长的QTL有 7个 ;控制最大叶宽的QTL有 4个 ;控制叶形指数的QTL有 6个 ;控制中肋长的QTL有 7个 ;控制中肋宽的QTL有 4个 ;控制抽苔的QTL有 6个。另外 ,估算了单个QTL的遗传贡献率和加性效应。这将为大白菜品种改良中形态性状的分子标记辅助选择提供理论依据。 展开更多
关键词 大白菜 重组自交系 形态性状 数量性状位点(qtl)
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甘蓝型油菜遗传图谱的构建及单株产量构成因素的QTL分析 被引量:16
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作者 王峰 官春云 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期271-277,共7页
采用常规品系04-1139与高产多角果品系05-1054构建的F2代群体为作图群体,运用SSR(Simple sequence repeat)和SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)构建分子标记遗传图谱并对甘蓝型油菜单株产量构成因素进行QTL分析。遗传图谱... 采用常规品系04-1139与高产多角果品系05-1054构建的F2代群体为作图群体,运用SSR(Simple sequence repeat)和SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)构建分子标记遗传图谱并对甘蓝型油菜单株产量构成因素进行QTL分析。遗传图谱包含200个分子标记,分布于19个连锁群上,总长度1700.23cM,标记间的平均距离8.50cM。采用复合区间作图法(Composite interval mapping,CIM)对单株产量构成因素(单株有效角果数、每果粒数和千粒重)进行QTL分析,共检测到12个QTL:其中单株有效角果数4个QTL,分别解释表型变异为35.64%、12.96%、28.71%和34.02%;每果粒数获得5个QTL,分别解释表型变异为8.41%、7.87%、24.37%、8.57%和14.31%;千粒重获得3个QTL,分别解释表型变异为2.33%、1.81%和1.86%。结果表明:同一性状的等位基因增效作用可以同时来自高值亲本和低值亲本;文章中与主效QTL连锁的标记可用于油菜产量性状的分子标记辅助选择和聚合育种。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 F2家系 分子标记遗传图谱 产量构成因素 数量性状位点(qtl)
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分子标记辅助聚合两个棉纤维高强主效QTLs的选择效果(英文) 被引量:16
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作者 郭旺珍 张天真 +3 位作者 丁业掌 朱一超 沈新莲 朱协飞 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1275-1285,共11页
利用长江流域推广品种泗棉3号和优异纤维种质系7235为育种亲本,配置了系统育种和修饰回交聚合育种两套群体。基于来自7235的2个高强纤维主效QTL的分子标记,在上述育种群体中进行了分子标记辅助选择效率研究。高强纤维主效QTLfs1是利用(7... 利用长江流域推广品种泗棉3号和优异纤维种质系7235为育种亲本,配置了系统育种和修饰回交聚合育种两套群体。基于来自7235的2个高强纤维主效QTL的分子标记,在上述育种群体中进行了分子标记辅助选择效率研究。高强纤维主效QTLfs1是利用(7235×TM1)F2分离群体,通过集团混合分离法检测到的,它可解释纤维强度表型变异的30%以上。高强纤维主效QTLfs2最初是利用(HS42710×TM1)F2分离群体检测到的,它可解释纤维强度表型变异的12.5%以上。进一步的研究表明,该QTL也位于7235优质系中,但与QTLfs1非等位。2套育种分离群体的2个高强纤维主效QTL的分子标记辅助选择效果表明:QTLfs1在不同环境条件下均稳定表达,它对不同遗传背景的育种群体均有显著的选择效果。尽管QTLfs2的选择效果低于QTLfs1,它在高世代育种群体中也表现较高的选择效率。利用分子标记辅助选择具有一定遗传距离的QTLfs1区间,其纤维强度的选择效率将大大增强。通过分子标记对位于不同连锁群上的2个QTL聚合选择,其中选单株的纤维强度显著提高。研究结果为利用分子标记辅助聚合优质QTL提供了成功实例。 展开更多
关键词 棉花 纤维强度 数量性状位点(qtl) 分子标记辅助选择(MAS)
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玉米持绿相关QTL整合图谱构建及一致性QTL区域内候选基因发掘 被引量:17
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作者 方永丰 李永生 +5 位作者 白江平 慕平 孟亚雄 张金林 王汉宁 尚勋武 《草业学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期175-185,共11页
以玉米高密度遗传连锁图谱IBM2 2008Neighbors为参考图谱,收集来自不同实验中的173个玉米持绿相关数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)信息,利用BioMercator 2.1软件,构建出玉米持绿相关QTL整合图谱;采用元分析技术,在1,4,5,9... 以玉米高密度遗传连锁图谱IBM2 2008Neighbors为参考图谱,收集来自不同实验中的173个玉米持绿相关数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)信息,利用BioMercator 2.1软件,构建出玉米持绿相关QTL整合图谱;采用元分析技术,在1,4,5,9号染色体上发掘出5个持绿"一致性"QTL区间。根据"一致性"QTL区间两端标记在玉米物理图谱B73RefGen_v2上的位置,将"一致性"QTL区间进行物理图谱定位,利用Plant GDB(http://www.plantgdb.org/)在线区段批量下载工具(download region data)下载"一致性"区间的1 445个预测基因序列并进行生物信息学分析,发现预测基因主要参与具体的细胞过程,执行结合功能,催化、转移酶活性和氧化还原酶活性等分子功能。根据"一致性"QTL区间的基因位点名称,在NCBI中下载相关基因序列,与所在"一致性"QTL区间所有预测基因保守结构域进行比对,在5个"一致性"持绿QTL区间内初步确定8个持绿相关候选基因。利用GRAMENE网站(http://www.gramene.org/)的Cmap功能,将水稻持绿基因sgr(stay green)转定位于玉米物理图谱B73RefGen_v2上,找到与其同源的玉米候选基因GRMZM2G091837_T01,其序列与已发表的玉米衰老诱导叶绿体持绿蛋白基因sgr1序列一致。 展开更多
关键词 玉米 持绿性 数量性状位点(qtl) 整合图谱 元分析
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基于高密度遗传图谱的玉米籽粒性状QTL定位 被引量:17
11
作者 秦伟伟 李永祥 +8 位作者 李春辉 陈林 吴迅 白娜 石云素 宋燕春 张登峰 王天宇 黎裕 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1510-1518,共9页
籽粒大小及百粒重是决定玉米产量的重要因素。为解析籽粒性状遗传基础,本研究以玉米自交系黄早四(HZS)和Mo17为亲本,构建包含130个重组自交系(recombinationinbredline,RIL)的RIL群体。基于GBS(genotyping-by-sequencing)技术获... 籽粒大小及百粒重是决定玉米产量的重要因素。为解析籽粒性状遗传基础,本研究以玉米自交系黄早四(HZS)和Mo17为亲本,构建包含130个重组自交系(recombinationinbredline,RIL)的RIL群体。基于GBS(genotyping-by-sequencing)技术获得的高密度多态性SNP(singlenucleotidepolymorphism)位点,构建了包含1262个Bin标记的高密度遗传图谱。采用完备区间作图法,对5个环境条件下的粒长、粒宽、百粒重、粒长/粒宽4个性状分别进行QTL(quantitativetraitlocus)定位,共检测到30个QTL。利用5个环境性状均值,共检测到11个QTL。其中粒长主效QTLqklen1、粒长/粒宽主效QTLqklw1在3个单环境条件下均被检测到,且定位在第1染色体相邻区域,物理位置分别为210-212Mb、207-208Mb,表型贡献率分别为22.60%和26.79%,被认为是控制玉米籽粒形状的主效位点。针对第1染色体207-212Mb区间,采用成组法t检验,对黄早四(受体)和Mo17(供体)构建的BC3F1回交群体进行单标记分析。结果表明,在BC3F1群体中qklen1和qklw1同样具有显著的遗传效应。本研究结果不仅为分子标记辅助选择籽粒性状提供了实用标记,而且为主效基因的进一步精细定位和候选基因挖掘奠定了基础。 展开更多
关键词 玉米(Zea mays L.) 籽粒性状 数量性状位点(qtl) 高密度遗传图谱
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基于掖478导入系的玉米产量性状QTL鉴定 被引量:16
12
作者 赵璞 刘瑞响 +4 位作者 李成璞 邢向茹 曹晓良 陶勇生 张祖新 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第17期3508-3519,共12页
【目的】鉴定玉米产量相关性状基因位点及包含有利等位基因的导入系,为了解产量性状形成的遗传基础及针对玉米自交系产量性状的分子设计提供参考和依据。【方法】以QB80和Qi319为供体亲本,掖478为轮回亲本,采用回交结合定向选择,分别构... 【目的】鉴定玉米产量相关性状基因位点及包含有利等位基因的导入系,为了解产量性状形成的遗传基础及针对玉米自交系产量性状的分子设计提供参考和依据。【方法】以QB80和Qi319为供体亲本,掖478为轮回亲本,采用回交结合定向选择,分别构建含有61和72个家系的基础导入系群体。通过2年4点田间试验,利用完备复合区间作图进行产量及其相关性状的QTL(quantitative trait locus,QTL)分析。【结果】4个环境下,在QB80为供体的导入系群体中,共检测到9个性状的49个QTL;在Qi319为供体的导入系群体中,检测到9个性状的42个QTL。在2个及以上环境中均检测到的QTL有16个。同一性状在不同环境下所检测的QTL定位在相同的染色体区域,不同性状的QTL也定位在相同或临近的染色体区域,形成多个QTL富集区。2个群体所检测的QTL位点具有较少的一致性,说明2个供体材料中含有不同的有利基因位点。同时,导入片段中含有利基因的导入系,其相关性状明显得以改良,这些导入系可用于QTL聚合以改良掖478的产量相关性状。【结论】QB80较Qi319与掖478间的遗传差异更大,能检测更多的产量性状QTL;2个导入系群体中含有优良等位基因的导入系可用于QTL聚合改良掖478;QTL富集区是为产量性状基因的克隆提供可供参考的重要染色体区域。 展开更多
关键词 玉米(Zca mays L.) 导入系 产量 数量性状位点(qtl)
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大白菜叶色相关性状的QTL定位与分析 被引量:11
13
作者 徐东辉 孙日飞 +8 位作者 张延国 原玉香 康俊根 武剑 张慧 宋晓飞 李晓楠 宋一沫 王晓武 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期99-104,共6页
应用已构建了AFLP遗传图谱的大白菜DH群体,采用多模型QTL作图的方法,通过色差计法、叶色素测定法和人为目测法3种方法7个指标对叶色相关性状进行QTL定位和分析。结果表明,在7个连锁群上共检测到18个QTL,其中色差计法检测到9个QTL,... 应用已构建了AFLP遗传图谱的大白菜DH群体,采用多模型QTL作图的方法,通过色差计法、叶色素测定法和人为目测法3种方法7个指标对叶色相关性状进行QTL定位和分析。结果表明,在7个连锁群上共检测到18个QTL,其中色差计法检测到9个QTL,叶色素测定法检测到8个QTL,人为目测法仅检测到1个QTL。另外,估算了单个QTL的贡献率和加性效应,发现各QTL的加性效应各不相等,各位点的贡献率在5.5%~15.6%之间。 展开更多
关键词 大白菜 叶色 数量性状位点(qtl) 连锁群
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大白菜抗芜菁花叶病毒的QTL分析 被引量:13
14
作者 张俊华 屈淑平 崔崇士 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期178-184,共7页
以大白菜高抗TuMV-C3株系的高代自交系A52-2和感病自交系GCⅣ杂交的F2代255个单株作为构建遗传图谱的作图群体,通过EST-PCR-RFLP和AFLP分子标记的遗传分析,构建了包含12个连锁群,由124个遗传标记组成的大白菜分子遗传图谱。其中包括6个E... 以大白菜高抗TuMV-C3株系的高代自交系A52-2和感病自交系GCⅣ杂交的F2代255个单株作为构建遗传图谱的作图群体,通过EST-PCR-RFLP和AFLP分子标记的遗传分析,构建了包含12个连锁群,由124个遗传标记组成的大白菜分子遗传图谱。其中包括6个EST-PCR-RFLP多态性位点和118个AFLP多态性位点,该图谱覆盖长度为683.9 cM,平均图距5.52 cM。利用Windows QTL CartographerV 2.0软件和复合区间作图法进行分析,共检测到4个抗TuMV-C3株系的QTLs位点。 展开更多
关键词 大白菜 分子遗传图谱 数量性状位点(qtl) 芜菁花叶病毒C3株系
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黄瓜瓜长性状的QTL定位分析 被引量:15
15
作者 程周超 顾兴芳 +4 位作者 张圣平 苗晗 张若纬 刘苗苗 杨双娟 《中国蔬菜》 北大核心 2010年第12期20-25,共6页
以黄瓜野生变种PI183967(Cucumis sativus L.hardwickii)和新泰密刺选系931为亲本获得的包含179个单株的F2群体为作图群体,构建了一张包含234个SSR标记、7个连锁群(分别对应黄瓜的7条染色体)的黄瓜遗传图谱,该图谱覆盖基因组长度829.7cM... 以黄瓜野生变种PI183967(Cucumis sativus L.hardwickii)和新泰密刺选系931为亲本获得的包含179个单株的F2群体为作图群体,构建了一张包含234个SSR标记、7个连锁群(分别对应黄瓜的7条染色体)的黄瓜遗传图谱,该图谱覆盖基因组长度829.7cM,平均图距3.5cM。结合F2和F3的表型数据,共检测到5个瓜长QTL,分布在第1、4、6号染色体上,贡献率在7.1%~14.1%之间。 展开更多
关键词 黄瓜 SSR 遗传图谱 瓜长 数量性状位点(qtl)
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水稻QTL图位克隆的特征分析 被引量:14
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作者 姜树坤 徐正进 陈温福 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1121-1126,共6页
图位克隆作为基因克隆的最有效手段,在水稻QTL克隆方面取得了很大的进展。文章通过分析近年来关于水稻QTL图位克隆的15个成功案例,总结了水稻QTL图位克隆的几个重要特征:(1)亲本杂交类型为种间或亚种间杂交,双亲的目标性状差异显著;(2)... 图位克隆作为基因克隆的最有效手段,在水稻QTL克隆方面取得了很大的进展。文章通过分析近年来关于水稻QTL图位克隆的15个成功案例,总结了水稻QTL图位克隆的几个重要特征:(1)亲本杂交类型为种间或亚种间杂交,双亲的目标性状差异显著;(2)目标QTL为主效,一般能解释大部分的表型变异;(3)物理图距一般小于40kb;(4)初级定位结果准确,精细定位群体大于6000(隐性群体不小于1500)单株。文章还对QTL图位克隆的难点及解决方法进行了有益的探讨。 展开更多
关键词 水稻 数量性状位点(qtl) 图位克隆 特征
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基于CSSL的水稻抽穗期QTL定位及遗传分析 被引量:13
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作者 杨德卫 张亚东 +5 位作者 朱镇 赵凌 林静 陈涛 朱文银 王才林 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期189-197,共9页
抽穗期是水稻(Oryza sativa)品种的重要农艺性状之一,适宜的抽穗期是获得理想产量的前提。鉴定和定位水稻抽穗期基因/QTL,分析其遗传效应对改良水稻抽穗期至关重要。以籼稻品种9311(Oryzasativa ssp.indica‘Yangdao 6’)为受体,粳稻品... 抽穗期是水稻(Oryza sativa)品种的重要农艺性状之一,适宜的抽穗期是获得理想产量的前提。鉴定和定位水稻抽穗期基因/QTL,分析其遗传效应对改良水稻抽穗期至关重要。以籼稻品种9311(Oryzasativa ssp.indica‘Yangdao 6’)为受体,粳稻品种日本晴(Oryza sativa ssp.japonica‘Nipponbare’)为供体构建的94个染色体片段置换系群体为材料,以P≤0.01为阈值,对置换片段上的抽穗期QTL进行了鉴定。采用代换作图法共定位了4个控制水稻抽穗期的QTL,分别位于第3、第4、第5和第8染色体;QTL的加性效应值变化范围为–6.4––2.7,加性效应百分率变化范围为–6.4%––2.7%;qHD-3和qHD-8加性效应值较大,表现主效基因特征。为了进一步定位qHD-3和qHD-8,在目标区域加密16对SSR引物,qHD-3和qHD-8分别被界定在第3染色体RM3166–RM16206之间及第8染色体RM4085–RM8271之间,其遗传距离分别为13.9cM和6.4cM。研究结果为利用分子标记辅助选择改良水稻抽穗期奠定了基础。 展开更多
关键词 染色体片段置换系(CSSL) 抽穗期 数量性状位点(qtl) 水稻 代换作图
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小麦株高的QTL分析 被引量:11
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作者 王竹林 王辉 +3 位作者 孙道杰 何中虎 夏先春 刘曙东 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第12期59-63,共5页
【目的】研究控制小麦株高的数量性状位点(QTL)。【方法】利用SSR和AFLP分子标记构建连锁图谱,在3种不同试验环境(2003~2004年北京、2004~2005年北京和河南安阳)下分析百农64×京双16组合的218个F2:3株系群体的株高。【结... 【目的】研究控制小麦株高的数量性状位点(QTL)。【方法】利用SSR和AFLP分子标记构建连锁图谱,在3种不同试验环境(2003~2004年北京、2004~2005年北京和河南安阳)下分析百农64×京双16组合的218个F2:3株系群体的株高。【结果】构建了由158个分子标记(100个SSR标记和58个AFLP标记)位点组成的遗传连锁图谱,覆盖了除1D连锁群外小麦全基因组的3114cM;检测到3个控制株高的QTL,分别位于2B、4D和6A染色体上,贡献率分别为7.3%~11.5%,7.4%~12.9%和5.7%~11.3%。【结论】3个株高QTI。位点在不同环境下表现稳定,其紧密连锁的分子标记可用于矮秆、半矮秆小麦的标记辅助育种。 展开更多
关键词 普通小麦 株高 数量性状位点(qtl) SSR标记 AFLP标记
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玉米产量因子QTL整合图谱构建与“一致性”QTL确定 被引量:13
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作者 王晓丽 李新海 王振华 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期756-761,838,共7页
应用生物信息学手段,收集和整理了411个玉米产量及构成因子QTL相关信息,借助高密度玉米遗传图谱IBM2 2005 Neighbors,采用BioMercator2.1软件构建出含221个QTL的整合图谱。采用统合分析方法,在LOD值大于4.0时于玉米第6染色体上确定1个... 应用生物信息学手段,收集和整理了411个玉米产量及构成因子QTL相关信息,借助高密度玉米遗传图谱IBM2 2005 Neighbors,采用BioMercator2.1软件构建出含221个QTL的整合图谱。采用统合分析方法,在LOD值大于4.0时于玉米第6染色体上确定1个与穗数、粒重和单位籽粒产量相关的"一致性"QTL,由标记bnlg1732和bnl8.08c界定,间距14.51cM。从MaizeGDB网站下载"一致性"QTL区间内基因和标记的原始序列,通过NCBI网站在线软件BLASTx同源比对分析,初步获得3个产量位置候选基因。利用比较基因电子定位策略,将53个水稻和玉米产量相关基因定位到玉米IBM2 2005 Neighbors图谱上,在"一致性"QTL区间内发现1个控制水稻分蘖数基因,初步确定为产量位置候选基因。本文结果为确定有关玉米产量因子的QTL及其候选基因提供了信息。 展开更多
关键词 玉米 产量因子 数量性状位点(qtl) 整合图谱 统合分析
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水稻穗颈维管束及产量相关性状的QTL分析 被引量:8
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作者 荆彦辉 付永彩 +4 位作者 孙传清 张培江 徐正进 陈温福 王象坤 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期16-21,共6页
采用 2个偏粳品种“光三”/C4 18的重组自交系群体 ,构建SSR标记的连锁图谱 ,并以此对水稻穗颈维管束数和产量相关性状进行了QTL(QuantitativeTraitLoci)分析。在第 1,5 ,8和 11染色体上检测到 4个控制穗颈大维管束数的QTL ,在第 5 ,9和... 采用 2个偏粳品种“光三”/C4 18的重组自交系群体 ,构建SSR标记的连锁图谱 ,并以此对水稻穗颈维管束数和产量相关性状进行了QTL(QuantitativeTraitLoci)分析。在第 1,5 ,8和 11染色体上检测到 4个控制穗颈大维管束数的QTL ,在第 5 ,9和 10染色体上检测到 3个控制穗颈小维管束数的QTL ;共检测到产量及 8个与产量相关性状的 30个QTL。通过分析穗颈维管束数与穗一、二次枝梗数 ,穗一、二次枝梗粒数 ,穗粒数 ,结实率 ,单株产量QTL在染色体上的分布及连锁关系 ,表明穗颈维管束是影响产量的重要解剖结构 ;通过增加穗颈大、小维管束数可望增加水稻“库”的容量 ,保证“流”的畅通。 展开更多
关键词 水稻 穗颈维管束 产量性状 SSR标记 数量性状位点(qtl)
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