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DNA芯片技术及其在营养学中的应用 被引量:6
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作者 沈慧 王福俤 陈坚 《国外医学(卫生学分册)》 2001年第3期178-181,143,共5页
DNA芯片技术是近年来迅速发展起来的分子生物学技术 ,该技术在人类基因组计划、新基因克隆、疾病诊断等许多生命科学领域已得到广泛应用 ,并显示出快速准确、多功能、微型化和自动化等无可比拟的优点。营养学作为生命科学的重要分支之一... DNA芯片技术是近年来迅速发展起来的分子生物学技术 ,该技术在人类基因组计划、新基因克隆、疾病诊断等许多生命科学领域已得到广泛应用 ,并显示出快速准确、多功能、微型化和自动化等无可比拟的优点。营养学作为生命科学的重要分支之一 ,DNA芯片技术在营养学中也有着潜在的广泛应用前景。本文就DNA芯片技术的原理、主要流程、优点及在营养学中的应用前景作一综述。 展开更多
关键词 DNA芯片 基因芯片 列阵 营养学
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肺癌早期诊断12种肿瘤相关抗原微阵列检测分析 被引量:5
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作者 陈俊林 王鹏 +4 位作者 闫平平 柴玉荣 代丽萍 王凯娟 张建营 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期479-481,共3页
目的评价12种肿瘤相关抗原(TAA)微阵列在早期肺癌中的诊断价值。方法采用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测174例肺癌患者和92名正常人群血清中的12种TAAs的抗体水平,应用流行病学筛检试验的指标对TAAs微阵列的结果进行评价;用ROC曲线来确定... 目的评价12种肿瘤相关抗原(TAA)微阵列在早期肺癌中的诊断价值。方法采用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测174例肺癌患者和92名正常人群血清中的12种TAAs的抗体水平,应用流行病学筛检试验的指标对TAAs微阵列的结果进行评价;用ROC曲线来确定最佳的微阵列组合,并用受试者工作特征曲线(ROC)下面积来判断其诊断价值。结果每种TAA的抗体水平在肺癌患者血清中的阳性率均高于正常对照组(P<0.05);单个TAA检测的灵敏度在12.6%~27.0%;12种TAAs微阵列检测的灵敏度增加到72.4%,特异度达到91.3%,正确指数为0.637,阳性预测值为94.0%,阴性预测值为63.6%,ROC曲线下面积为0.819。结论联合12种TAAs微阵列对肺癌具有较高的诊断价值,可提高肺癌的检出率,有助于肺癌早期诊断。 展开更多
关键词 肺癌 肿瘤相关抗原 酶联免疫吸附实验 列阵 受试者工作特征曲线(ROC)
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改进型基因集测试在乳腺癌研究中的应用 被引量:1
3
作者 吴迪 王瓞 《生物信息学》 2012年第2期92-95,共4页
乳腺癌是一种异源性疾病,包括至少5到6种分子亚型.在正常乳腺细胞中寻找不同癌症亚型的细胞起源非常重要,但很难做到。基因集测试(Genesettest)是处理微列阵(microarray)数据的常用生物统计方法,包括传统型和通用型。通用型基因集测试... 乳腺癌是一种异源性疾病,包括至少5到6种分子亚型.在正常乳腺细胞中寻找不同癌症亚型的细胞起源非常重要,但很难做到。基因集测试(Genesettest)是处理微列阵(microarray)数据的常用生物统计方法,包括传统型和通用型。通用型基因集测试又分为竞争型和自含型。墨尔本大学的科学家用改进的基因集测试:修正竞争型测试(CAMERA)和旋转基因集测试(ROAST)的方法分析了乳腺癌亚型与乳腺细胞间的对应相似性,发现正常内腔鲁米那前体细胞很可能是基底型乳腺癌的细胞来源。此项研究成为澳大利亚年度生物医学的重大成果。 展开更多
关键词 基因集测试 乳腺癌 基底型 鲁米那前体细胞 列阵
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大鼠中枢和外周神经损伤后胞体分布区神经组织基因表达谱的分析 被引量:1
4
作者 吕艺 刘淑红 +3 位作者 葛学铭 刘红 吴燕 范明 《感染.炎症.修复》 2004年第1a2期25-29,共5页
目的:分析中枢和外周神经损伤后胞体分布区神经组织多基因表达谱的差异,探讨中枢和外周神经轴突损伤后再生差异的分子机制。方法:12只 Wistar 雄性大鼠随机分为右侧坐骨神经夹伤和胸段脊髓半横断两组。手术后7d,用 cDNA Microarray 技... 目的:分析中枢和外周神经损伤后胞体分布区神经组织多基因表达谱的差异,探讨中枢和外周神经轴突损伤后再生差异的分子机制。方法:12只 Wistar 雄性大鼠随机分为右侧坐骨神经夹伤和胸段脊髓半横断两组。手术后7d,用 cDNA Microarray 技术检测1176个已知基因在与受损神经相应胞体分布区神经组织表达的变化,并分析其在中枢和外周神经损伤后表达的差异。结果:cDNA Microarray 分析的数据显示,有74个基因在外周和中枢神经损伤后同时变化,其中29个基因变化趋势一致,12个基因表达上调,17个基因表达下调。呈反向变化的基因有45个。结论:中枢和外周神经轴突损伤后,多种结构、功能基因表达发生变化;外周和中枢神经损伤后多种结构、功能基因表达存在明显的差异。 展开更多
关键词 cDNA 列阵 基因表达 脊髓损伤 坐骨神经损伤
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NGAL基因在永生化食管上皮细胞恶性转化中过表达的研究 被引量:39
5
作者 许丽艳 李恩民 +2 位作者 熊华淇 蔡唯佳 沈忠英 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第6期839-843,共5页
为研究NGAL (neutrophilgelatinase associatedlipocalin)基因在永生化食管上皮细胞恶性转化中的表达情况 ,以永生化食管上皮细胞系SHEE和食管癌细胞系SHEEC互为对照 ,用cDNA微列阵进行筛选 ,用RNA印迹和RT PCR进行鉴定 ,cDNA克隆测序后... 为研究NGAL (neutrophilgelatinase associatedlipocalin)基因在永生化食管上皮细胞恶性转化中的表达情况 ,以永生化食管上皮细胞系SHEE和食管癌细胞系SHEEC互为对照 ,用cDNA微列阵进行筛选 ,用RNA印迹和RT PCR进行鉴定 ,cDNA克隆测序后与GenBank进行BLAST分析比较 .结果表明NGAL基因在SHEEC中出现显著差异过表达 ,其cDNA序列与小鼠 2 4p3、大鼠NRL (neu relatedlipocalin)、人中性粒细胞NGAL和卵巢癌NGAL具有较高的相似性 .这提示NGAL基因在永生化食管上皮细胞恶性转化中可能发挥着重要作用 。 展开更多
关键词 NGAL cDNA列阵 差异表达基因 食管癌 永生化食管上皮细胞 恶性转化 过表达
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微光学元件面形的数字刀口检测技术 被引量:6
6
作者 张艳 张蓉竹 +2 位作者 董军 张均 蔡邦维 《强激光与粒子束》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第2期137-140,共4页
 微列阵光学元件的质量评价是光学测量中的一项新课题。将传统的刀口检测技术进行数字化改进后,用于微光学元件的面形检测,具有实时、定量、精度高的特点,在光学元件质量评价中有着重要意义。介绍了应用数字刀口检测反射式微镜列阵面...  微列阵光学元件的质量评价是光学测量中的一项新课题。将传统的刀口检测技术进行数字化改进后,用于微光学元件的面形检测,具有实时、定量、精度高的特点,在光学元件质量评价中有着重要意义。介绍了应用数字刀口检测反射式微镜列阵面形质量的原理和实验装置,详细论述了对CCD采集的阴影图进行图像处理的关键步骤:(1)精确测定每个像素的暗场阈值所对应的刀口位置;(2)确定与像素相应的面形区域的倾角误差;(3)对面形进行重构。最后结合具体实验进行了分析和讨论,实验所测得的面形误差为nm量级。 展开更多
关键词 列阵 面形检测 刀口检测 数字化 光学测量 质量评价 列阵光学元件
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用cDNA微列阵技术探讨苯中毒相关的DNA复制及损伤修复基因表达谱的改变 被引量:8
7
作者 陈丽 毕勇毅 +2 位作者 陶宁 王红夏 颖马强 《中华劳动卫生职业病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期248-251,共4页
目的筛选与苯中毒有关的DNA复制及损伤修复基因。方法选取慢性苯中毒患者和无苯接触的健康人各7例配对,提取外周血白细胞总RNA。在反转录cDNA时,用Cy3,Cy5两种激发波长荧光分别标记两组样本cDNA探针。将各对探针混合后与含141条DNA复制... 目的筛选与苯中毒有关的DNA复制及损伤修复基因。方法选取慢性苯中毒患者和无苯接触的健康人各7例配对,提取外周血白细胞总RNA。在反转录cDNA时,用Cy3,Cy5两种激发波长荧光分别标记两组样本cDNA探针。将各对探针混合后与含141条DNA复制及损伤修复的人类基因表达谱芯片杂交、扫描,分析杂交结果。结果共筛选出差异表达的基因25条,其中16条基因表达上调,9条基因表达下调,主要包括有DNA复制基因如PRIM2A,ORC1L等;DNA合成、重组及修复基因如POLK;DNA损伤信号基因修复蛋白和DNA连接酶如RECQL,PRKDC,G22P1,ERCC3,ERCC1,CRY1,CHES1,BRCA2,APEX等;重组蛋白质如RECQL;其他DNA合成再重组和修复蛋白质如SKIV2L,RBMS1,SON,SET等。结论苯中毒患者外周血白细胞的DNA复制及损伤修复基因与正常人相比存在差异性表达,为进一步筛选苯中毒生物标志物提供了依据。 展开更多
关键词 cDNA列阵 苯中毒 DNA复制基因 DNA损伤修复基因 基因表达谱
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6A8α-甘露糖苷酶表达减弱和表达正常鼻咽癌细胞间的差异基因表达 被引量:8
8
作者 陈双玲 时岩 +3 位作者 靳玉兰 刘音 赵方萄 朱立平 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期305-310,共6页
目的发现因转导反义6A8cDNA致恶性生物学行为减弱的人鼻咽癌细胞CNE-2L2(AS)和野生型细胞(W)间的差异表达基因。方法用DNA微列阵方法比较AS细胞和W细胞基因表达的差异。用Northern印迹和RT-PCR验证所得结果的可靠性。结果与W细胞相比,A... 目的发现因转导反义6A8cDNA致恶性生物学行为减弱的人鼻咽癌细胞CNE-2L2(AS)和野生型细胞(W)间的差异表达基因。方法用DNA微列阵方法比较AS细胞和W细胞基因表达的差异。用Northern印迹和RT-PCR验证所得结果的可靠性。结果与W细胞相比,AS细胞有34个基因的表达上调,有42个基因的表达下调。其表达增强可能对肿瘤恶性行为有抑制作用的基因有P130mRNAfor130Kprotein、TGF-betaIIRalpha、GABBR1、TGFBR1、TNFAIP1、STANIN、E-CADHERIN、CTNNA1、CTNNA2、RFX2及TMPO等,其表达减弱可能对肿瘤恶性行为有抑制作用的基因有CD44、NDRG1、TGFB1、RPS5、LEGUMAI、CBS、CD59及SNRPA1等。Northern印迹和RT-PCR验证了DNA微列阵方法检测的结果。结论与W细胞相比,AS细胞有34个基因表达上调,有42个基因表达下调,某些基因表达的改变可能与AS细胞恶性生物学行为的减弱相关。 展开更多
关键词 DNA列阵 基因表达 肿瘤 6A8 α-甘露糖苷酶
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羊水细胞染色体核型分析和微列阵比较基因组杂交技术验证无创产前检测的临床意义 被引量:10
9
作者 周静 蒋涛 +6 位作者 李璃 刘安 季修庆 林颖 王艳 胡平 许争峰 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期292-295,共4页
目的:探讨羊水细胞染色体核型分析技术和微列阵比较基因组杂交技术(array-CGH)验证无创产前检测(NIPT)的临床意义。方法:对NIPT提示信号异常的95例孕妇行羊膜腔穿刺术,抽取羊水进行培养后行染色体核型分析验证其符合率;同时对提示除外21... 目的:探讨羊水细胞染色体核型分析技术和微列阵比较基因组杂交技术(array-CGH)验证无创产前检测(NIPT)的临床意义。方法:对NIPT提示信号异常的95例孕妇行羊膜腔穿刺术,抽取羊水进行培养后行染色体核型分析验证其符合率;同时对提示除外21-三体、18-三体、13-三体的常染色体异常(即其他常染色体异常)的患者行array-CGH分析,验证其符合率。结果:NIPT提示21-三体高风险的染色体核型分析符合率86.96%(40/46);18-三体的染色体核型分析符合率76.92%(10/13);13-三体染色体核型分析符合率0(0/2)。性染色体核型分析的符合率50.00%(9/18),其中1例性染色体异常的染色体核型分析为46,XX,del(Xq23-25),行array-CGH验证,提示为X染色体该区带11.9 M的片段缺失。其他常染色体异常的染色体核型分析符合率12.50%(2/16),其array-CGH验证的符合率25.00(4/16)。结论:NIPT的结果需要验证,经典的羊水细胞染色体核型分析技术可以验证胎儿染色体数目和结构异常,array-CGH可以验证微缺失或者微重复,分辨率更高。 展开更多
关键词 染色体核型分析 列阵比较基因组杂交 无创产前检测
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利用cDNA微列阵技术分析胰腺癌相关基因表达谱 被引量:9
10
作者 虞先浚 龙江 +2 位作者 傅德良 张群华 倪泉兴 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期302-303,共2页
目的 利用cDNA微列阵技术分析胰腺癌相关基因表达谱来寻找下一步研究的目标基因。方法 利用含有 180 0 0个cDNA克隆的微列阵 ,对 2例正常胰腺组织和 4例中分化胰腺癌标本行基因表达谱分析。结果  2份混合癌组织样品分别有 14 84和 13... 目的 利用cDNA微列阵技术分析胰腺癌相关基因表达谱来寻找下一步研究的目标基因。方法 利用含有 180 0 0个cDNA克隆的微列阵 ,对 2例正常胰腺组织和 4例中分化胰腺癌标本行基因表达谱分析。结果  2份混合癌组织样品分别有 14 84和 13 5 3条差异表达基因 ,表达趋势相同的有 45 5条 ,上调基因 10 2条 ,下调基因 3 5 3条 ,已知基因 2 74条 ,未知功能EST 181条 ,差异 2倍以上的基因各占 2 7.8%和 5 2 .0 % ,已知差异基因中包括抑癌基因、生长因子及其受体基因、信号传导相关基因、转录调节因子等。结论 cDNA微列阵技术为分析胰腺癌相关基因表达谱提供了有力的工具 ,MBD1、EDG1等基因和过甲基化表达调控可能在胰腺癌发病机制中起着关键作用。目的 利用cDNA微列阵技术分析胰腺癌相关基因表达谱来寻找下一步研究的目标基因。方法 利用含有 180 0 0个cDNA克隆的微列阵 ,对 2例正常胰腺组织和 4例中分化胰腺癌标本行基因表达谱分析。结果  2份混合癌组织样品分别有 14 84和 13 5 3条差异表达基因 ,表达趋势相同的有 45 5条 ,上调基因 10 2条 ,下调基因 3 5 3条 ,已知基因 2 74条 ,未知功能EST 181条 ,差异 2倍以上的基因各占 2 7.8%和 5 2 .0 % ,已知差异基因中包括抑癌基因、生长因子及其受体基因、信号? 展开更多
关键词 cDNA列阵技术 胰腺癌 基因表达谱
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应用微列阵技术快速鉴定常见致病性分枝杆菌 被引量:7
11
作者 刘晶波 乐军 +1 位作者 韩敏 赵雁林 《中华临床感染病杂志》 CAS 2010年第1期44-47,共4页
目的利用微列阵技术建立一种简便、快速、灵敏、特异的分枝杆菌菌种鉴定方法,为临床医师正确诊断提供依据。方法以DNA测序法为对照,通过微列阵技术分析20种分枝杆菌标准株及473株分枝杆菌临床分离株。结果微列阵技术分析20种分枝杆菌... 目的利用微列阵技术建立一种简便、快速、灵敏、特异的分枝杆菌菌种鉴定方法,为临床医师正确诊断提供依据。方法以DNA测序法为对照,通过微列阵技术分析20种分枝杆菌标准株及473株分枝杆菌临床分离株。结果微列阵技术分析20种分枝杆菌标准株,特异性为100%,在473株分枝杆菌临床分离株中,358株与分枝杆菌属探针和结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)复合群探针杂交阳性,鉴定为MTB复合群。115株为非结核分枝杆菌(nontuberculosis myvobacterial,NTM),其中47株为龟分枝杆菌龟亚种和脓肿亚种,32株为胞内分枝杆菌,15株为鸟分枝杆菌,11株为堪萨斯分枝杆菌,4株为偶然分枝杆菌,2株为戈登分枝杆菌,2株为土分枝杆菌,2株只与分枝杆菌属探针杂交,经测序显示1株为副瘰疬分枝杆菌,1株为莫娜分枝杆菌,芯片上无鉴定这2个菌种的探针。结论做列阵技术是一种能准确、高效鉴定分枝杆菌菌种的分子诊断技术,对临床快速、特异诊断结核病具有重要意义。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 菌种鉴定 列阵技术
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乙型肝炎病毒X蛋白羧基端缺失突变体转染细胞的基因表达谱和蛋白质组差异分析 被引量:4
12
作者 刘晓红 陈颖 +2 位作者 王力 赵海华 朱明华 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第48期3425-3429,共5页
目的探讨乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)羧基端40个氨基酸的缺失突变体(HBx3′-40)不同生物学效应的分子基础。方法采用Trizol法抽提HBx3′-40(实验组)和野生型HBx(wtHBx,对照组)转染的人肝癌Huh7细胞的总RNA,经标记后,与含21074个靶基因点的c... 目的探讨乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)羧基端40个氨基酸的缺失突变体(HBx3′-40)不同生物学效应的分子基础。方法采用Trizol法抽提HBx3′-40(实验组)和野生型HBx(wtHBx,对照组)转染的人肝癌Huh7细胞的总RNA,经标记后,与含21074个靶基因点的cDNA芯片进行杂交,通过扫描杂交信号强弱获得差异表达基因;用固相梯度双向凝胶电泳分离实验组和对照组的细胞总蛋白质,银染显色,PDQuest2-D软件分析两组细胞蛋白质组的表达差异,借助质谱技术鉴定其中的差异蛋白质点。结果cDNA芯片检测结果显示,对比wtHBx组,HBx3′-40组存在165个基因(0.82%)的显著性改变,144和21个基因分别显示上调和下调。双向凝胶电泳结果显示,对比wtHBx组,HBx3′-40组存在(135±13)个蛋白差异点。基因表达谱和质谱分析结果显示,HBx3′-40组差异表达的基因和蛋白质主要涉及宿主细胞的基因转录、癌基因和抑癌基因、细胞连接、信号转导和代谢、免疫应答等过程。结论HBx缺失突变体对细胞基因和蛋白质的影响是广泛的,调节涉及肝组织特异性的代谢基因的变化。这些差异表达的基因和蛋白质在HBx突变致癌过程中是否发挥了重要的作用,需要进一步的研究证实。 展开更多
关键词 肝细胞 乙型肝炎病毒 cDNA列阵 双向凝胶电泳 基因表达谱
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后基因组时代的酿酒酵母研究策略 被引量:4
13
作者 宋洋波 马捷 +2 位作者 李丽 张留燕 刘延琳 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第23期4873-4882,共10页
近年,随着基因工程技术的日益发展,酿酒酵母在分子生物学研究方面的应用越来越广泛。本文介绍了后基因组学用于酿酒酵母的方法,并概述了利用该手段对试验菌株与商业酿酒酵母进行生理功能分析、研究和改造的最新进展,展示了后基因组时代... 近年,随着基因工程技术的日益发展,酿酒酵母在分子生物学研究方面的应用越来越广泛。本文介绍了后基因组学用于酿酒酵母的方法,并概述了利用该手段对试验菌株与商业酿酒酵母进行生理功能分析、研究和改造的最新进展,展示了后基因组时代对酿酒酵母的影响及综合基因组信息、生物信息学和分子生物学技术的研究策略。最后,展望了现代生物技术手段在葡萄酒工业中的应用前景。 展开更多
关键词 后基因组学 SAGE DNA列阵 代谢工程
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获得性血友病A患者血清miRNAs差异表达谱及功能miRNAs的初筛
14
作者 符丽梅 廖欣 熊暮珺 《山西医科大学学报》 CAS 2023年第5期677-682,共6页
目的 建立获得性血友病A(AHA)患者血清miRNAs差异表达谱,并探究潜在功能miRNAs分子。方法 收集13例AHA患者和13例健康对照的血清样本、人口统计学特征、APTT、FⅧ:C、FⅧ:Ab以及基础疾病情况,利用微列阵芯片技术分析其中3例AHA患者和3... 目的 建立获得性血友病A(AHA)患者血清miRNAs差异表达谱,并探究潜在功能miRNAs分子。方法 收集13例AHA患者和13例健康对照的血清样本、人口统计学特征、APTT、FⅧ:C、FⅧ:Ab以及基础疾病情况,利用微列阵芯片技术分析其中3例AHA患者和3例健康对照血清样本,筛选差异表达miRNAs,并建立差异表达谱。在另外20例参试者(AHA和健康对照各10例)中,利用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析验证差异表达miRNAs,筛选出潜在功能miRNAs。结果 微列阵芯片分析结果表明,有23个miRNAs在AHA患者和健康对照血清中表达水平存在显著差异(P<0.05)。实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)分析结果表明,与健康对照相比,AHA患者血清中4个miRNAs(miR-206、miR-144-5p、miR-374b-5p、miR-432-3p)显著上调(P<0.05),1个miRNA(miR-92a-3p)显著下调(P<0.05),其余18个miRNAs表达水平的差异不明显(P>0.05)。筛选出的5个miRNAs中,miR-206和miR-374b-5p与患者FⅧ:Ab显著正相关(P<0.05),而miR-92a-3p则与FⅧ:Ab显著负相关(P<0.05)。此外,miR-206和miR-92a-3p与患者罹患风湿性疾病、产后并发症、恶性肿瘤类基础疾病也存在显著相关性(P<0.05)。结论 本研究基于AHA患者血清建立了miRNAs差异表达谱,并筛选得到5个显著差异表达的miRNAs,为未来预防、诊断和治疗AHA提供了候选分子。 展开更多
关键词 获得性血友病A 小RNAS 列阵芯片 荧光定量PCR 差异表达谱
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缺氧中和缺氧后亚低温时炎症基因表达谱的变化 被引量:4
15
作者 崔红 张万东 +1 位作者 Jamie Hutchison Danica Stanimirovic 《首都医科大学学报》 CAS 2006年第1期70-73,共4页
目的了解缺氧中和缺氧后亚低温时炎症相关基因的变化。方法将体外培养的人脑血管内皮细胞(HCEC)分为对照组和实验组。对照组细胞常规培养,实验组细胞去掉细胞培养液,更换为无血清、低糖M199,置于缺氧箱房中,再分为2组:Ⅰ组为常温缺氧后... 目的了解缺氧中和缺氧后亚低温时炎症相关基因的变化。方法将体外培养的人脑血管内皮细胞(HCEC)分为对照组和实验组。对照组细胞常规培养,实验组细胞去掉细胞培养液,更换为无血清、低糖M199,置于缺氧箱房中,再分为2组:Ⅰ组为常温缺氧后低温恢复;Ⅱ组为低温缺氧后常温恢复。取细胞并分离总RNA后,用DNA微列阵技术观察缺氧以及缺氧中和缺氧后亚低温时HCEC炎症相关基因表达谱的变化。结果1)白介素-1受体1型(IL-1R1)、类1型白介素-1受体(IL-1RL1)、白介素-1β(IL-1β)、白介素-11(IL-11)、γ-干扰素调节因子2(IRF2)和集落刺激因子1(CSF1)分别在某些时间点上调;白介素-1受体拮抗剂(IL-1RN)、白介素-6(IL-6)、γ-干扰素受体2(IFNGR2)、集落刺激因子3受体(CSF3R)、淋巴细胞黏附因子1(SELL)、细胞间黏附因子3(ICAM3)、血小板/内皮细胞黏附因子(PECAM1)和内皮细胞黏附因子1(SELE)则在不同的时间点下调;γ-干扰素诱导蛋白30(IFI30)在某一些时间点上调,但在低温缺氧后常温恢复时下调;肿瘤坏死因子家庭成员7(TNFRSF7)则仅在低温时下调。2)缺氧4 h、32℃低温使下调基因增多。结论缺氧可以使IL-1βI、L-1RL1I、L-1R1等部分损伤性炎症基因表达上调,IL-11的上调可能为保护性反应;TNF基因表达的上调可能起双重作用。 展开更多
关键词 cDNA列阵技术 缺氧 亚低温 血管内皮细胞
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百草枯诱导PC12细胞MicroRNA的变化及bcl-2调控机制 被引量:3
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作者 黄敏 娄丹 +1 位作者 常秀丽 周志俊 《中华劳动卫生职业病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期32-37,共6页
目的探讨百草枯(paraquat,PQ)诱导大鼠肾上腺嗜铬细胞瘤细胞(PCI2)细胞毒性中MicroRNA(miRNA)的表达及bcl-2的调控机制。方法以PCI2细胞为多巴胺能神经元的细胞模型,用终浓度为0、62.5μmol/LPQ分别诱导PCI2细胞24h,用微列阵... 目的探讨百草枯(paraquat,PQ)诱导大鼠肾上腺嗜铬细胞瘤细胞(PCI2)细胞毒性中MicroRNA(miRNA)的表达及bcl-2的调控机制。方法以PCI2细胞为多巴胺能神经元的细胞模型,用终浓度为0、62.5μmol/LPQ分别诱导PCI2细胞24h,用微列阵芯片技术筛选变化显著的miRNA,实时荧光定量反转录一聚合酶链反应(realtimePCR)进行验证;根据microRNA数据库(TargetScan5.1)提供的靶标预测分析结果,搜寻其相关的靶标;用终浓度为0、62.5、125.0、250.0、500.0、1000.0μmol/LPQ染毒细胞24h,Annexin V-FITC/PI法流式细胞仪测定细胞凋亡,RT-PCR测定miR.34a、miR-Let-7e的相对表达水平,免疫印迹法(Western blot)测定bcl-2蛋白表达水平。结果与对照组比较,125.0、250.0、500.0、1000.0μmol/LPQ染毒PCI2细胞24h后,细胞存活率明显降低,细胞凋亡率明显上升,差异均有统计学意义(P〈0.05或P〈0.01),且呈现剂量依赖性。基因芯片技术显示,62.5μmol/LPQ作用于PCI2细胞24h引起8个miRNA表达下调,11个miRNA表达上调;其中miR-34a上调、miR-Let-7e下调最为明显。RT-PCR显示,随着PQ浓度的增加,miR-Let-7e表达水平持续下降,miR-34a表达水平持续上升,与芯片结果一致;随着PQ染毒剂量增加,bcl-2蛋白表达水平明显降低,且与miR-34a的表达量呈剂量一反应关系。结论miRNAs的异常表达参与了PQ致PCI2细胞损伤过程。PQ可能通过上调miR-34a表达增加bcl-2蛋白表达,进而诱导PCI2细胞凋亡。 展开更多
关键词 百草枯 PC12细胞 列阵芯片 原二癌基因蛋白质c-bcl-2
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应用组织芯片技术检测CD147、MMP-9和TIMP-1在宫颈病变中的表达及意义 被引量:3
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作者 范懿隽 卫兵 《安徽医药》 CAS 2013年第2期214-216,共3页
目的检测不同程度宫颈病变中CD147、MMP-9及TIMP-1的含量,了解上述指标与宫颈病变之间是否相关,以及CD147与MMP-9、TIMP-1之间的相互作用。方法采用免疫组织化学方法,选择高效低耗的组织微阵列(tissue microarray,简称TMA)作为试验平台... 目的检测不同程度宫颈病变中CD147、MMP-9及TIMP-1的含量,了解上述指标与宫颈病变之间是否相关,以及CD147与MMP-9、TIMP-1之间的相互作用。方法采用免疫组织化学方法,选择高效低耗的组织微阵列(tissue microarray,简称TMA)作为试验平台,检测CD147、MMP-9及TIMP-1在不同宫颈病变中的表达,其中宫颈炎29例,CINIⅠ13例,CINⅡ17例,CINⅢ32例,宫颈浸润癌24例,了解上述指标与宫颈病变之间的关系。结果四组之间CD147的蛋白表达的MOD值组间比较均差异有显著(P值均<0.05);宫颈癌组织MMP-9、TIMP-1蛋白表达的MOD值和MMP-9/TIMP-1比值均较低级别CIN及宫颈炎组显著性提高(P值均<0.05);CINIII中MMP-9/TIMP-1比值与宫颈癌相比有显著差异,但CIN组间及与宫颈炎相比没有差异。结论 CD147变化于轻度宫颈上皮内瘤样病变即较明显,可能对于预测CIN的发展,判断转归以及选择适当的处理方案,有一定意义。一旦CIN进展为浸润癌后,则MMP-9的作用更加重要。 展开更多
关键词 组织列阵 CD147 基质金属酶9 免疫组化 宫颈病变
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基因芯片技术应用研究进展 被引量:2
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作者 左绍远 《大理医学院学报》 2001年第2期72-74,共3页
目的:综述基因芯片技术在医药领域的应用研究进展。方法:检索相关文献进行分析、归纳总结。结果:基因芯片技术是近年出现的高新生物技术,因具有高通量、并行性、微型化与自动化等特点而在生命科学中日益显示出其重要的理论与实际应... 目的:综述基因芯片技术在医药领域的应用研究进展。方法:检索相关文献进行分析、归纳总结。结果:基因芯片技术是近年出现的高新生物技术,因具有高通量、并行性、微型化与自动化等特点而在生命科学中日益显示出其重要的理论与实际应用价值。结论:基因芯片技术已成为一种高新生物技术平台,其发展与应用前景十分广阔。 展开更多
关键词 基因芯片 DNA集列阵 高新生物技术 应用 进展
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基因芯片技术及其在血液学和肿瘤学应用的前景 被引量:2
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作者 张新 朱平 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2000年第3期222-226,共5页
介绍基因芯片的基本原理、制备的技术流程和不同的类型 ,在实际应用中基因芯片上的探针选择 ,受检标本的处理与杂交 ,在血液、肿瘤和细胞分化研究中应用基因芯片的情况 ,包括如何检测癌基因、抑癌基因以及细胞分化和凋亡基因的表达 ,分... 介绍基因芯片的基本原理、制备的技术流程和不同的类型 ,在实际应用中基因芯片上的探针选择 ,受检标本的处理与杂交 ,在血液、肿瘤和细胞分化研究中应用基因芯片的情况 ,包括如何检测癌基因、抑癌基因以及细胞分化和凋亡基因的表达 ,分析人类基因的多态性与疾病易感性的关系。最后 。 展开更多
关键词 基因芯片 DNA列阵 探针 血液学 肿瘤学
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上调CDX2基因表达对人胃癌SGC-7901细胞miRNA表达谱及生物学功能的影响 被引量:2
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作者 张健锋 董丽娟 +4 位作者 蒋伟 张弘 丁伟峰 周国雄 毛振彪 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2013年第23期2241-2249,共9页
目的:筛选上调尾型同源盒基因2(caudal type homeobox gene 2,CDX2)基因表达时人的胃癌细胞SGC-7901中差异表达的miRNA并预测其靶基因,并观察其对胃癌细胞生物学行为的影响.方法:提取瞬时转染48 h后空载体组(转染P E G F P-N1组)和转染... 目的:筛选上调尾型同源盒基因2(caudal type homeobox gene 2,CDX2)基因表达时人的胃癌细胞SGC-7901中差异表达的miRNA并预测其靶基因,并观察其对胃癌细胞生物学行为的影响.方法:提取瞬时转染48 h后空载体组(转染P E G F P-N1组)和转染组(转染P E G F P-N1-C D X2组)细胞的总R N A,应用m i R N A芯片检测差异表达的miRNA,并通过Miranda、TargetScan、Mirtarget2软件预测其靶基因,通过Gene Ontology(GO)和KEGG pathway分析了解靶基因功能.CCK8法检测细胞增殖能力,划痕试验、Transwell小室、细胞黏附实验检测各组细胞体外迁移黏附能力.结果:PEGFP-N1-CDX2组较空载体组有59种差异表达的miRNA,其中25种miRNA发生2倍以上表达上调,34种miRNA发生2倍以上表达下调.通过Gene Ontology(GO)和KEGG pathway分析得到部分miRNA靶基因功能,这些靶基因参与了肿瘤的发生、发展、转移及预后.与对照组相比,PEGFP-N1-CDX2组的胃癌细胞生长、迁移和黏附能力均明显受到抑制(P<0.05).结论:上调CDX2基因表达可明显抑制人胃癌细胞SGC-7901的生长,抑制其迁移黏附能力,CDX2基因的抗肿瘤作用可能与miRNA有关. 展开更多
关键词 尾型同源盒基因2 胃肿瘤 细胞增殖 细胞运动 miRNA列阵
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