序列谱带选支CO_2激光器

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作者 吴铁强 徐根传 +1 位作者 王世尧 朱国英 《中国激光》 EI CAS 1983年第4期212-214,241,共4页

本文介绍一种能产生CO2(0002—[1001,0201]Ⅰ,Ⅱ带激光跃迁,从而使普通封闭选支CO2激光器输出谱线数目加倍的腔内热吸收池技术及其实验结果。

关键词 激光器 谱线 序列谱 腔内 光激射器 电子器件 CO2 二氧化碳 增益分布

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基于残基序列信息的蛋白质相互作用位点预测(英文) 被引量：1

2

作者 彭新俊 王翼飞 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期649-653,共5页

蛋白质相互作用位点在细胞进程中有着非常重要的作用.尽管利用高通量方法发现蛋白质相互作用位点取得很大的成功,仍需要计算方法辅助预测实验中的相互作用位点.本文提出了基于残基序列谱、进化率和疏水性的预测异源蛋白质复合物作用位... 蛋白质相互作用位点在细胞进程中有着非常重要的作用.尽管利用高通量方法发现蛋白质相互作用位点取得很大的成功,仍需要计算方法辅助预测实验中的相互作用位点.本文提出了基于残基序列谱、进化率和疏水性的预测异源蛋白质复合物作用位点的两种向量表示方法并以支持向量机实现预测.其中,提出新的向量表示法取得更好的预测性能.文中的数据集由66个异源复合物蛋白质链组成. 展开更多

关键词 支持向量机 蛋白质相互作用位点 序列谱 进化率 疏水性 向量表示

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基于最大熵模型的蛋白质作用位点识别方法 被引量：2

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作者 杜秀全 程家兴 宋杰 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2010年第18期203-204,207,共3页

蛋白质相互作用位点的预测是当前生物信息学的一个研究热点.针对蛋白质序列中对界面残基有影响的各种因素,提出将蛋白质的进化信息和保守性作为特征函数,此类信息体现了蛋白质序列中氨基酸之间短程和长程相互作用的影响.采用最大熵模型... 蛋白质相互作用位点的预测是当前生物信息学的一个研究热点.针对蛋白质序列中对界面残基有影响的各种因素,提出将蛋白质的进化信息和保守性作为特征函数,此类信息体现了蛋白质序列中氨基酸之间短程和长程相互作用的影响.采用最大熵模型作为蛋白质作用位点识别的分类器,将多源信息融合成一个概率模型.实验结果表明该方法与其他传统机器学习方法相比,在特异度和精度上分别提高了2%～8%、3%～11%,且获得了较高的相关系数. 展开更多

关键词 蛋白质作用位点 最大熵 序列谱 残基保守性 机器学习

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基于贝叶斯方法的蛋白质界面残基预测 被引量：2

4

作者 王池社 程家兴 汪世义 《计算机应用与软件》 CSCD 2009年第9期75-77,共3页

蛋白质界面残基预测是蛋白质相互作用研究中的一项基本工作,在生物制药及蛋白质功能研究方面有着重要的应用。以蛋白质中的氨基酸残基为研究对象,使用残基的溶剂可及表面积及残基的序列谱为特征集,构建了基于贝叶斯方法的蛋白质界面残... 蛋白质界面残基预测是蛋白质相互作用研究中的一项基本工作,在生物制药及蛋白质功能研究方面有着重要的应用。以蛋白质中的氨基酸残基为研究对象,使用残基的溶剂可及表面积及残基的序列谱为特征集,构建了基于贝叶斯方法的蛋白质界面残基预测器。方法有效地结合了蛋白质残基特征集的条件独立性假设及贝叶斯方法在处理不确定性数据方面的优点,通过对含77个蛋白质的数据集进行实验,结果比其它方法获得了6%的准确率的提高,三维可视化的结果也表明分类器预测的有效性。 展开更多

关键词 蛋白质 朴素贝叶斯分类器 氨基酸残基 序列谱

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应用集成神经网络预测蛋白质相互作用位点 被引量：1

5

作者 沈孝利 陈月辉 《山东大学学报（工学版）》 CAS 北大核心 2010年第6期144-149,共6页

蛋白质相互作用位点在现代药物设计与构建蛋白质相互作用网络方面有着重要的意义。基于一个含有35个蛋白质分子的数据集,首先提取蛋白质的序列谱、熵值、可及表面积3种特征,然后运用误差反向传播神经网络以及其集成对蛋白质的相互作用... 蛋白质相互作用位点在现代药物设计与构建蛋白质相互作用网络方面有着重要的意义。基于一个含有35个蛋白质分子的数据集,首先提取蛋白质的序列谱、熵值、可及表面积3种特征,然后运用误差反向传播神经网络以及其集成对蛋白质的相互作用位点进行了预测。采用35次留一法(一倍交叉验证)进行训练与测试,结果显示每当加入一种新特征时,预测结果都有相应的提高,并且把神经网络集成时,结果又有了一定程度的提高。 展开更多

关键词 蛋白质相互作用位点 序列谱 熵 可及表面积 集成神经网络

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基于进化保守性的蛋白质相互作用位点预测 被引量：1

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作者 程节华 程家兴 杜秀全 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2011年第5期1833-1836,共4页

为了从蛋白质结构数据库中提取经验知识,进行蛋白质作用位点预测,提出了以蛋白质序列谱作为特征向量,采用支持向量机算法进行训练和预测蛋白质相互作用位点的方法。从蛋白质一级序列出发,以序列上邻近残基的序列谱为输入特征向量,采用... 为了从蛋白质结构数据库中提取经验知识,进行蛋白质作用位点预测,提出了以蛋白质序列谱作为特征向量,采用支持向量机算法进行训练和预测蛋白质相互作用位点的方法。从蛋白质一级序列出发,以序列上邻近残基的序列谱为输入特征向量,采用支持向量机方法构建预测器,来预测蛋白质相互作用位点,预测精度达到70.47%,相关系数CC=0.1919。实验结果表明,利用蛋白质序列谱,结合支持向量机算法进行蛋白质相互作用位点预测的方法是有效的。 展开更多

关键词 蛋白质相互作用位点 进化保守性 序列谱 支持向量机 蛋白质结构数据库

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基于朴素贝叶斯分类器的蛋白质界面残基识别(英文) 被引量：1

7

作者 王池社 程家兴 +1 位作者 苏守宝 徐栋哲 《计算机科学与探索》 CSCD 2009年第3期293-302,共10页

蛋白质相互作用中界面残基的识别在药物设计与生物体的新陈代谢等方面有着广泛应用。基于朴素贝叶斯分类器对属性条件独立性的要求,构建了由蛋白质序列谱和溶剂可及表面积组成的蛋白质相互作用特征模型。在一个具有代表性的蛋白质异源... 蛋白质相互作用中界面残基的识别在药物设计与生物体的新陈代谢等方面有着广泛应用。基于朴素贝叶斯分类器对属性条件独立性的要求,构建了由蛋白质序列谱和溶剂可及表面积组成的蛋白质相互作用特征模型。在一个具有代表性的蛋白质异源复合物组成的数据集中取得了68.1%的准确率、0.201 的相关系数、40.2%的特异度和 49.9%的灵敏度,取得了比其他方法更优的结果,且远优于随机的实验结果。通过一个三维可视化的结果更好地验证了方法的有效性。 展开更多

关键词 朴素贝叶斯分类器 蛋白质相互作用界面 序列谱 残基溶剂可及表面积

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基于自相关函数的蛋白质-蛋白质作用位点预测研究

8

作者 陈伟 程咏梅 +1 位作者 杨会芳 张绍武 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期743-746,共4页

蛋白质-蛋白质相互在细胞生命过程扮演重要角色,广泛参与免疫反应,信号传导,基因表达,蛋白质合成等,研究蛋白质-蛋白质作用位点,将有助于揭示生命过程的许多本质,对预防、诊断疾病,以及突变设计、蛋白质相互作用网络构建等方面均具有重... 蛋白质-蛋白质相互在细胞生命过程扮演重要角色,广泛参与免疫反应,信号传导,基因表达,蛋白质合成等,研究蛋白质-蛋白质作用位点,将有助于揭示生命过程的许多本质,对预防、诊断疾病,以及突变设计、蛋白质相互作用网络构建等方面均具有重要的参考价值。根据蛋白质-蛋白质作用位点残基倾向性及作用位点与其周围临近残基密切相关的特性,本文提出基于序列谱(或空间谱)构建自相关函数,度量邻近残基之间的相关程度,采用AdaBoost分类器预测蛋白质-蛋白质相互作用位点,精度达到67.6%,表明本文的方法预测蛋白质-蛋白质相互作用位点是有效的,为研究蛋白质-蛋白质相互作用位点研究提供了一种新方法。 展开更多

关键词 自相关函数 ADABOOST 序列谱 空间谱 蛋白质-蛋白质作用位点

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基于多窗口不同特征的蛋白质相互作用位点预测

9

作者 王菲露 宋杨 《安徽大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2010年第5期64-68,共5页

识别蛋白质相互作用位点在蛋白质功能研究中发挥着重要作用.文章从蛋白质序列出发,提取相关特征——序列谱、序列谱+信息熵,分别形成多个滑动窗口,以此构造输入特征向量.采用"留一法"生成训练数据集和测试数据集,使用支持向... 识别蛋白质相互作用位点在蛋白质功能研究中发挥着重要作用.文章从蛋白质序列出发,提取相关特征——序列谱、序列谱+信息熵,分别形成多个滑动窗口,以此构造输入特征向量.采用"留一法"生成训练数据集和测试数据集,使用支持向量机构建6种分类器,预测测试集中的表面残基是否是蛋白质相互作用位点,得到了较好的结果,说明了实验方法的有效性和可行性. 展开更多

关键词 蛋白质相互作用位点 序列谱 信息熵 滑动窗口 支持向量机

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基于支持向量机的蛋白质相互作用位点预测

10

作者 王菲露 宋杰 +1 位作者 王池社 杜秀全 《计算机技术与发展》 2008年第10期127-129,132,共4页

蛋白质的功能常体现在生物大分子的相互作用中,识别蛋白质相互作用位点对于研究蛋白质功能发挥着重要作用。蛋白质间主要通过表面残基发生相互作用,蛋白质相互作用形成复合体时,只有部分表面残基参与了该过程。基于序列谱信息,提取序列... 蛋白质的功能常体现在生物大分子的相互作用中,识别蛋白质相互作用位点对于研究蛋白质功能发挥着重要作用。蛋白质间主要通过表面残基发生相互作用,蛋白质相互作用形成复合体时,只有部分表面残基参与了该过程。基于序列谱信息,提取序列上相邻残基的序列谱作为输入特征向量,对大小为3和7的残基信息窗(win3,win7),分别采用支持向量机(SVM)分类器对蛋白质相互作用位点进行预测、比较和分析。最终实验结果为:win3的平均正确率为69.31%,win7的平均正确率为69.68%。 展开更多

关键词 蛋白质相互作用 序列谱 残基信息窗 支持向量机

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多特征融合的蛋白质相互作用位点预测

11

作者 程家兴 杜秀全 王池社 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2009年第16期50-52,59,共4页

蛋白质相互作用位点预测为蛋白质功能和药物设计的理解提供重要线索。而蛋白质的各种特征为蛋白质相互作用位点预测提供了大量有用信息,特别是进化信息、残基序列邻近和空间邻近性。不同的蛋白质特征对蛋白质间的相互作用的贡献也不一... 蛋白质相互作用位点预测为蛋白质功能和药物设计的理解提供重要线索。而蛋白质的各种特征为蛋白质相互作用位点预测提供了大量有用信息,特别是进化信息、残基序列邻近和空间邻近性。不同的蛋白质特征对蛋白质间的相互作用的贡献也不一样。通过提取蛋白质序列谱、保守性和残基熵,提出了特征融合技术对蛋白质相互作用位点进行研究,采用SVM构建三种预测器,分别对各种不同的特征加以验证,实验结果表明了基于特征融合方法的有效性和正确性。 展开更多

关键词 蛋白质相互作用位点 蛋白质特征 序列谱 残基保守性 残基熵 支持向量机

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运用二元阈值法识别日本血吸虫DNA序列的编码区

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作者 隋传宇 冯新港 《上海师范大学学报（自然科学版）》 2006年第2期85-90,共6页

分析了日本血吸虫DNA序列的编码区特征,发现其能够很好地满足1/3规则．研究表明,无论采用FTG还是序列谱(FFT)的方法,对于长度较短的序列都不适用．该研究首次使用二元阈值(p,R)方法判别编码区,其判别能力优于一元(p)阈值．统计试验结果... 分析了日本血吸虫DNA序列的编码区特征,发现其能够很好地满足1/3规则．研究表明,无论采用FTG还是序列谱(FFT)的方法,对于长度较短的序列都不适用．该研究首次使用二元阈值(p,R)方法判别编码区,其判别能力优于一元(p)阈值．统计试验结果为：单独使用z曲线方法,总的准确率为55．3%．联合使用Z曲线和FTG方法,对大于951bp的序列编码区预测准确率可达到78．2%． 展开更多

关键词 日本血吸虫 序列谱 FFT FTG Z曲线 编码区识别

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可持续发展公理破缺与修正的理论探讨 被引量：13

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作者 杨多贵 牛文元 《生态经济》 CSSCI 北大核心 2001年第1期7-9,共3页

论文简要概述了可持续发展理论产生的历史背景和国际上几种具有代表性的可持续发展定义。从哲学意义上指出可持续发展公理由于侧重于“时间序列谱的研究而忽视了“空间局域谱”的研究 ,导致理论上出现“破缺” ,并对产生“破缺”的原因... 论文简要概述了可持续发展理论产生的历史背景和国际上几种具有代表性的可持续发展定义。从哲学意义上指出可持续发展公理由于侧重于“时间序列谱的研究而忽视了“空间局域谱”的研究 ,导致理论上出现“破缺” ,并对产生“破缺”的原因作了探讨。论文应用“各态历经假说”理论对可持续发展“时空耦合”的基本特征和基本规律进行了论述 ,并从理论上指出唯有“时间序列谱”与“空间局域谱”二者达到“共振耦合” ,博大精深的可持续发展理论的真谛才能获得完美的表达。 展开更多

关键词 可持续发展 理论破缺 时间序列谱 空间局域谱

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基于MODIS NDVI时间序列谱匹配的耕地信息提取研究——以浙中地区为例 被引量：13

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作者 王红说 黄敬峰 +1 位作者 徐俊锋 彭代亮 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期334-340,共7页

基于MODIS NDVI数据和时间序列谱匹配提取季相相似的耕地面积.选取耕地样点像元的时间序列作为标准时间序列谱,其他像元的时间序列作为测试时间序列谱,对匹配系数进行t测验以确定耕地像元.当匹配位置m=0时,在t测验10%显著水平时耕地的... 基于MODIS NDVI数据和时间序列谱匹配提取季相相似的耕地面积.选取耕地样点像元的时间序列作为标准时间序列谱,其他像元的时间序列作为测试时间序列谱,对匹配系数进行t测验以确定耕地像元.当匹配位置m=0时,在t测验10%显著水平时耕地的匹配精度最高,相关系数r为0.60;而对均方根误差(RMSE)评价图执行非监督分类,获得的耕地匹配精度显著提高,相关系数为0.79,优于t测验方法.该研究证实了基于时间序列谱匹配的耕地信息提取的可行性,同时匹配精度可反映研究区作物季相的一致性信息. 展开更多

关键词 NDVI 时间序列谱匹配 交叉相关 匹配精度

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基于Ts-EVI时间序列谱的冬小麦面积提取 被引量：11

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作者 闫峰 王艳姣 +1 位作者 武建军 李春强 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第4期135-140,共6页

冬小麦是中国重要的粮食作物,利用遥感技术准确获取冬小麦分布面积对于从宏观上实现冬小麦生长状况和病虫害监测预警等田间精细管理以及产量预测具有十分重要的意义。采用NASA提供的2005年2～6月MYD09A1和MYD11A2数据产品,结合冬小麦生... 冬小麦是中国重要的粮食作物,利用遥感技术准确获取冬小麦分布面积对于从宏观上实现冬小麦生长状况和病虫害监测预警等田间精细管理以及产量预测具有十分重要的意义。采用NASA提供的2005年2～6月MYD09A1和MYD11A2数据产品,结合冬小麦生育期形态变化特征,以Ts和EVI构建的时间序列谱对河北省冬小麦种植面积的提取方法进行了研究。结果表明:冬小麦在Ts-EVI特征空间中具有独特的序列谱相特征,返青期后冬小麦的Ts在整体上表现为逐渐升高,EVI在开花期后下降,灌浆后期快速降低;对Ts-EVI空间信息的一维化处理后,采用主成分分析方法对时间信息降维,以ISODATA非监督分类方法实现冬小麦分离提取结果的样点验证精度为91.20%;Ts-EVI时间序列谱反映的作物生长过程的生理意义明确,采用Ts-EVI时间序列谱的遥感分类方法可以较好地实现冬小麦的遥感分类提取,具有较好的可行性。 展开更多

关键词 Ts-EVI 时间序列谱 冬小麦 河北

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基于广义回归神经网络的蛋白质二级结构预测 被引量：9

16

作者 王菲露 宋杨 《计算机仿真》 CSCD 北大核心 2012年第2期184-187,共4页

在生化实验中,关于优化蛋白质预测问题,由于采集的信息、参数、选取和设置等优化处理存在随机性,限制了蛋白质二级结构预测精确度。为解决上述问题,针对广义回归神经网络学习速率快、网络稳健的特点,提出基于广义回归神经网络预测蛋白... 在生化实验中,关于优化蛋白质预测问题,由于采集的信息、参数、选取和设置等优化处理存在随机性,限制了蛋白质二级结构预测精确度。为解决上述问题,针对广义回归神经网络学习速率快、网络稳健的特点,提出基于广义回归神经网络预测蛋白质二级结构的方法。鉴于编码方式对预测精度有重要影响,首先基于5位编码和不同的滑动窗口构建多个广义回归神经网络预测器对蛋白质二级结构进行预测,取得了较好的结果。并采用富含生物进化信息的序列谱(Profile)编码构建输入向量、并针对不同大小的滑动窗口设置多个spread值重新创建广义回归神经网络预测器,大大提高了预测精确度,仿真结果证明了预测模型的有效性和可行性,为预测提供了有效方法。 展开更多

关键词 蛋白质二级结构 广义回归神经网络 5位编码 序列谱编码

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多通道时间序列谱获取系统 被引量：1

17

作者 杜一飞 郭恬瑞 +1 位作者 袁双贵 张学谦 《核电子学与探测技术》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期43-47,共5页

本文介绍了一个基于 IBM PC 机与 CAMAC 的多通道时间序列谱获取系统的原理和实际实现,并进行了详细的性能分析和比较.

关键词 时间序列谱 获取系统 谱仪 辐射探测

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一个用于时间序列谱测量的插件-TSC

18

作者 敬岚 乔卫民 赵之正 《核电子学与探测技术》 CAS CSCD 北大核心 1992年第6期352-355,共4页

TSC是为配合ORTEC 918 MCB多道缓冲器进行时间序列谱测量而设计研制的NIM控制插件。它可以在0.1,0.5,1,5,10,50,100,1000s等八种可选时间段内,连续进行2×4096或4×2048的间序列谱测量。TSC的启动、停止信号由外电路提供。

关键词 时间序列谱 多道缓冲器 Γ谱 测量

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富里叶本征变换的数值方法研究及其在地震序列谱分析中的应用

19

作者 陈兵 郑治真 江在森 《地震学报》 CSCD 北大核心 1997年第6期608-614,共7页

对富里叶本征变换（ＦＥＴ）的数值方法进行了初步探讨，详细分析了本征基厄米函数的数值特性．采用非等间隔采样的高斯－厄米积分法计算本征系数ａｎ，取得良好结果．通过对基本信号函数幅频特性的讨论，证明本文所采用的数值方法具有... 对富里叶本征变换（ＦＥＴ）的数值方法进行了初步探讨，详细分析了本征基厄米函数的数值特性．采用非等间隔采样的高斯－厄米积分法计算本征系数ａｎ，取得良好结果．通过对基本信号函数幅频特性的讨论，证明本文所采用的数值方法具有精度高，计算量小的特点．最后，利用本方法对地震活动性资料进行拟实时ＦＥＴ分析，初步探讨了ＦＥＴ应用于地震预报工作的可行性。 展开更多

关键词 地震序列谱 富里叶本征变换 地震 拟实时谱分析

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基于多尺度序列谱核半定规划优化的签名认证方法

20

作者 邱德红 潘昕昕 陈传波 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第B12期44-49,共6页

变化尺度进行签名序列的相似性描述有利于获得更准确的相似性描述结果.本文定义了签名序列的变化尺度的谱核矩阵,在多个尺度的核变换空间上进行序列的相似性描述,并利用半定规划对多尺度谱核矩阵进行优化,结合支持向量机建立起一种能够... 变化尺度进行签名序列的相似性描述有利于获得更准确的相似性描述结果.本文定义了签名序列的变化尺度的谱核矩阵,在多个尺度的核变换空间上进行序列的相似性描述,并利用半定规划对多尺度谱核矩阵进行优化,结合支持向量机建立起一种能够自动优化签名序列多尺度相似性描述的认证方法.该方法能够适应不同个人的签名特点,克服统一尺度下相似性描述的缺陷,提高签名序列相似性描述的准确性,在相同签名数据集上的实验结果显示该方法可以获得更高的认证准确率. 展开更多

关键词 半定规划 序列谱核 签名认证

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