-
题名小桐子HXT基因家族的全基因组鉴定及表达分析
被引量：1
- 1
-
-
作者
王海波
高永
辛胡
-
机构
曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心生物资源与食品工程学院
曲靖师范学院云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室
-
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2017年第5期97-105,共9页
-
基金
国家自然科学基金项目(31460179)
-
文摘
为了进一步理解己糖转运蛋白基因家族的结构特征以及其在植物逆境信号转导过程中的作用,基于小桐子基因组数据,鉴定到15个小桐子己糖转运蛋白基因,并对其基因结构、进化关系、密码子偏性及低温表达特性进行了分析。结果表明,15个小桐子HXT基因聚类为5个亚组,包含2~5个外显子,且在基因上游调控区包含ABA、乙烯、干旱及低温等逆境响应元件。编码蛋白质都富含疏水性氨基酸,具有典型的12个α-螺旋跨膜区。另外,部分小桐子HXT基因存在交叉共线性关系及基因倍增现象,且密码子的第3位碱基偏好使用U或A。荧光定量分析显示,Jc HXT_13L与Jc HXT_C基因在小桐子的各器官中都有表达,其中,Jc HXT_13L在茎中表达量较高,而Jc HXT_C在根中表达量较高,Jc HXT_13L与Jc HXT_C在根与叶片中受低温诱导上调表达明显,与小桐子的抗冷性形成直接相关。为进一步探索小桐子HXT基因的生物学功能及参与小桐子抗冷分子机制奠定了理论基础。
-
关键词
小桐子
己糖转运蛋白
己糖信号
基因组
表达分析
-
Keywords
Jatropha curcas
Hexose transporter
Hexose signal
Genome
Expression analysis
-
分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
-
