孟德尔随机化研究及其在中医药领域的应用展望 被引量：6

1

作者 谢朝荣 陶庆锋 +3 位作者 胡缤予 周梦荻 郑晖 赵凌 《中医杂志》 CSCD 北大核心 2023年第5期438-442,447,共6页

孟德尔随机化研究以遗传变异作为工具变量建立模型,用于测试风险因素与各种表型间的因果关系,目前已被广泛用于流行病学中疾病复杂病因的探索。孟德尔随机化研究能有效克服混杂和反向因果导致的偏倚,且易于实施,使其在中医药领域进行因... 孟德尔随机化研究以遗传变异作为工具变量建立模型,用于测试风险因素与各种表型间的因果关系,目前已被广泛用于流行病学中疾病复杂病因的探索。孟德尔随机化研究能有效克服混杂和反向因果导致的偏倚,且易于实施,使其在中医药领域进行因果关系的推断变得可行。通过对孟德尔随机化研究的概念、核心假设、常见类型、在医学领域的研究现状及当前面临的弱工具变量、多效性、连锁不平衡等问题的阐述和分析认为,(1)孟德尔随机化研究在中医药领域具有较大的应用发展空间,其有助于中医证型的简化,理清不同病证间的关系,实现“异病同治”的目的;(2)该方法可有效补充观察性研究和干预性研究的不足,为中医药研究提供新方法;(3)同时存在可用数据相对局限的问题。 展开更多

关键词 孟德尔随机化研究 遗传变异 因果推断 中医药研究方法

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基于孟德尔随机化及生物信息学分析宫颈癌和类风湿性关节炎的关系及关键基因、通路和潜在药物 被引量：1

2

作者 韦乐川 庞文文 +1 位作者 杨航 张建军 《中国优生与遗传杂志》 2024年第1期33-40,共8页

目的利用孟德尔随机化法寻找宫颈癌和类风湿性关节炎间的因果关联性,利用生物信息学方法,寻找两疾病间的基因关联性,获取潜在的治疗靶点。通过此两种方法阐明类风湿性关节炎(RA)可能影响宫颈癌(CC),并发现两疾病之间相互影响的基因靶点... 目的利用孟德尔随机化法寻找宫颈癌和类风湿性关节炎间的因果关联性,利用生物信息学方法,寻找两疾病间的基因关联性,获取潜在的治疗靶点。通过此两种方法阐明类风湿性关节炎(RA)可能影响宫颈癌(CC),并发现两疾病之间相互影响的基因靶点,为疾病的治疗和新药物的研发提供思路。方法分别以类风湿性关节炎(ukb-b-11874)和宫颈癌(ukb-b-8777)为暴露因素和结局变量,选择与类风湿性关节炎具有显著相关性的单核苷酸多态性(SNPs)为工具变量,采用IVW法、WME法、Simple Mode法、Weighted Mode法和MR-Egger回归法进行孟德尔随机化(MR)分析,运用CochranQ检验进行异质性分析。从GEO数据库下载了宫颈癌和类风湿性关节炎各1个数据集并筛选差异表达基因(DEGs)。对两种疾病共有的DEGs进行了蛋白功能注释(GO)、富集通路(KEGG)分析。构建蛋白质互作分析(PPI)网络,识别两种疾病的中枢基因。使用药物特征数据库(DSigDB)来寻找潜在的治疗药物。结果共筛选出3个SNPs作为工具变量,IVW结果显示,类风湿性关节炎是宫颈癌发病风险的危险因素(OR=1.575>1,P<0.05);MR-Egger、WME、SimpleMode、WeightedMode效应估计值具有相似的统计结果。敏感性分析发现没有对因果估计结果产生影响较大的SNP。通过对宫颈癌和类风湿性关节炎2个数据集整合,获得53个DEGs,发现与双疾病相关的8个中枢基因,并根据潜在治疗靶点,找到治疗宫颈癌和类风湿性关节炎潜在治疗药物。结论本研究通过孟德尔随机化研究方法证明类风湿性关节炎与宫颈癌风险之间存在因果关系,生物信息学方法进一步证明两种疾病之间存在显著的基因关联。鉴定出的基因、通路和药物,给临床工作中两种疾病的诊断及治疗提供新思路。 展开更多

关键词 宫颈癌 类风湿性关节炎 孟德尔随机化研究 生物信息学 疾病相互关系

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身体质量指数与深静脉血栓形成因果关系的孟德尔随机化研究 被引量：7

3

作者 陈志波 陈钦昌 +2 位作者 李勇辉 姚陈 黄楷 《中华血管外科杂志》 2019年第4期247-251,共5页

目的利用全基因组关联(GWAS)分析相关数据,通过孟德尔随机化(MR)研究,探讨身体质量指数(BMI)与深静脉血栓形成(DVT)之间的因果关联.方法采用MR研究方法,以基因工具变量探讨BMI与DVT之间的因果关系.以GIANT数据库公开发表的基因数据为参... 目的利用全基因组关联(GWAS)分析相关数据,通过孟德尔随机化(MR)研究,探讨身体质量指数(BMI)与深静脉血栓形成(DVT)之间的因果关联.方法采用MR研究方法,以基因工具变量探讨BMI与DVT之间的因果关系.以GIANT数据库公开发表的基因数据为参考依据,借助MR-base平台,筛选出与BMI关联有统计学意义的单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量(参数为P<5×10^-8,连锁不平衡r^2<0.1),通过逆方差加权分析法(IVW)、加权中位数法和MR-Egger法分别判断BMI与DVT因果关联,绘制SNP相关的BMI与DVT风险的森林图及散点图.结果共筛选到79个与出生体重相关的SNP.IVW分析:OR=1.010,95%CI:1.006~1.013,P=1.54×10^-9;加权中位数法:OR=1.011,95%CI:1.005~1.016,P=1.34×10^-4);MR-Egger法:OR=1.014,95%CI:1.007~1.022,P=4.58×10^-4.森林图显示,IVW、加权中位数法和MR-Egger回归均显示BMI与DVT具有因果关联.MR-Egger结果表明遗传多效性不会对结果造成偏倚(截距=-0.00014,P=0.198).散点图显示,根据直线斜率判断,IVW法、MR-Egger法和加权中值法的因果关联估计相近.结论两样本孟德尔随机化分析结果表明,BMI与DVT的发病风险存在正向因果关系,即BMI每增加一个标准差,DVT发病风险会提高1%. 展开更多

关键词 身体质量指数 深静脉血栓形成 孟德尔随机化研究

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胃食管反流病与慢性阻塞性肺疾病:两样本孟德尔随机化研究 被引量：1

4

作者 张露 郭娜 +1 位作者 郭鸿 刘健 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期440-443,共4页

目的通过两样本孟德尔随机化方法,探讨胃食管反流病(GERD)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)之间的因果关系。方法从全基因组关联研究(GWAS)汇总数据中筛选出与GERD相关的单核苷酸多态性(SNP)作为基因工具变量,主要分析采用逆方差加权法(IVW)来... 目的通过两样本孟德尔随机化方法,探讨胃食管反流病(GERD)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)之间的因果关系。方法从全基因组关联研究(GWAS)汇总数据中筛选出与GERD相关的单核苷酸多态性(SNP)作为基因工具变量,主要分析采用逆方差加权法(IVW)来估计因果效应,用MR-Egger、加权中位数法、simple mode法和weighted mode法作为补充方法。为评估结果的稳健性,进行了敏感性分析,包括Cochran’s Q检验、MR-Egger截距和留一法。结果GERD可能与COPD风险增加有关[IVW:优势比(OR)=1.80,95%置信区间(confidence interval,CI)为1.55~2.08,P<0.01]。此外,MR-Egger截距、Cochran’s Q检验及留一法未观察到水平多效性和异质性。结论GERD可增加COPD风险,建议积极控制GERD以降低COPD的发生。 展开更多

关键词 胃反流性食管炎 慢性阻塞性肺疾病 孟德尔随机化研究

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白细胞介素-1受体拮抗剂与骨关节炎及亚型的孟德尔随机化研究 被引量：1

5

作者 陈继鑫 周沁心 +3 位作者 郭天赐 余伟杰 叶云天 刘爱峰 《医学研究杂志》 2024年第4期46-51,共6页

目的 采用双样本孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)的研究方法,评估白细胞介素-1受体拮抗剂(interleukin-1 receptor antagonist, IL-1RA)与骨关节炎及亚型骨关节炎的因果关系。方法 IL-1RA与骨关节炎、膝骨关节炎、髋骨关节... 目的 采用双样本孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)的研究方法,评估白细胞介素-1受体拮抗剂(interleukin-1 receptor antagonist, IL-1RA)与骨关节炎及亚型骨关节炎的因果关系。方法 IL-1RA与骨关节炎、膝骨关节炎、髋骨关节炎的单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism, SNP)来自公开的全基因组关联研究汇总数据集,选取密切相关的SNP作为工具变量(instrumental variable, IV)。筛选敏感度试验,MR多效性残差和采用离群值检验来验证所识别的IV的异质性和多效性。采用5种不同的模型,包括逆方差加权模型(inverse-variance weighted, IVW)、加权中值估计模型、基于加权模型的方法、MR-Egger回归和简单众数法进行MR分析。结果 研究不存在异质性。固定效应模型的IVW显示,IL-1RA与骨关节炎(OR=1.06,95%CI:1.01~1.11)、膝骨关节炎(OR=1.07,95%CI:1.01~1.13)之间有显著的因果关系,与髋骨关节炎之间具有相关性,因果关系不显著。敏感度分析显示,研究结果具有稳健性。结论 MR研究支持IL-1RA水平与骨关节炎、膝骨关节炎的发病风险具有因果关系。 展开更多

关键词 白细胞介素-1受体拮抗剂 骨关节炎 孟德尔随机化研究

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肠道菌群对男性生殖与性健康的因果关系 被引量：2

6

作者 马思成 张宸铭 +5 位作者 郝晓慧 马瑞敏 胡静 于雯霖 王祖龙 孙自学 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期587-595,共9页

目的:应用两样本MR方法挖掘211种肠道菌群对男性生殖与性健康的因果关系。方法:采用MiBioGen联盟发布的全基因组关联研究(GWAS)相关遗传变异数据作为肠道菌群的工具变量(IVs),芬兰生物样本库GWAS相关遗传变异数据分别作为男性不育症、... 目的:应用两样本MR方法挖掘211种肠道菌群对男性生殖与性健康的因果关系。方法:采用MiBioGen联盟发布的全基因组关联研究(GWAS)相关遗传变异数据作为肠道菌群的工具变量(IVs),芬兰生物样本库GWAS相关遗传变异数据分别作为男性不育症、畸形精子症、性功能障碍、勃起功能障碍、睾丸功能障碍的IVs。使用逆方差加权法作为MR分析方法,根据效应指标优势比和95%置信区间评估结果,并进行数据敏感性分析。结果:分别发现6种与男性不育症相关、12种与畸形精子症相关、5种与性功能障碍相关、4种与勃起功能障碍、4种与睾丸功能障碍有关的肠道菌群,且数据敏感性分析无异常,因果方向均正确。结论:肠道菌群与男性生殖与性健康密切相关。 展开更多

关键词 孟德尔随机化研究 肠道菌群 全基因组关联研究 男性不育 男性生殖健康

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基于两样本孟德尔随机化研究血脂水平和子宫内膜异位症之间的关系

7

作者 李永红 何家楠 +3 位作者 许俊晖 张圆青 郑群 何跃东 《成都医学院学报》 CAS 2024年第3期424-427,共4页

目的 采用两样本孟德尔随机化研究,探索血脂水平和子宫内膜异位症之间的因果关系。方法 利用大样本全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,选择与各类血脂水平密切相关的遗传位点为工具变量,采用逆方差加权法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR... 目的 采用两样本孟德尔随机化研究,探索血脂水平和子宫内膜异位症之间的因果关系。方法 利用大样本全基因组关联研究(GWAS)汇总数据,选择与各类血脂水平密切相关的遗传位点为工具变量,采用逆方差加权法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR值评价各类血脂水平与子宫内膜异位症间的因果关系。结果 除了极小极低密度脂蛋白(VLDL)胆固醇外,其余与VLDL有关的血脂水平升高会增加子宫内膜异位症的发病风险(OR>1)。高密度脂蛋白(HDL)中与胆固醇有关的血脂类型、小低密度脂蛋白(LDL)中总胆固醇水平升高可减少子宫内膜异位症的发病风险(OR<1)。所有与甘油三酯相关的血脂类型、小LDL中胆固醇酯与总脂质比率的升高均可增加子宫内膜异位症的发病风险(OR>1)。结论 多种类型的血脂水平会影响子宫内膜异位症的发生,HDL中与胆固醇或甘油三酯相关的血脂水平可作筛查子宫内膜异位症的生物指标。 展开更多

关键词 孟德尔随机化研究 子宫内膜异位症 血脂水平 因果关系

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偏头痛与乳腺癌:一项两样本孟德尔随机化研究

8

作者 谭雪 聂多锐 曹建雄 《右江民族医学院学报》 2024年第4期574-578,共5页

目的探究偏头痛与乳腺癌及其亚型之间的因果关系。方法采用两样本孟德尔随机化分析方法,将偏头痛相关遗传变异数据作为工具变量,乳腺癌及其亚型的全基因组关联研究数据作为结局事件。主要采用逆方差加权法,辅以MR-Egger、加权中位数方... 目的探究偏头痛与乳腺癌及其亚型之间的因果关系。方法采用两样本孟德尔随机化分析方法,将偏头痛相关遗传变异数据作为工具变量,乳腺癌及其亚型的全基因组关联研究数据作为结局事件。主要采用逆方差加权法,辅以MR-Egger、加权中位数方法分析偏头痛对乳腺癌、雌激素受体阳性乳腺癌和雌激素受体阴性乳腺癌发生风险的因果影响;使用异质性检验、水平基因多效性检验、留一法检验来验证结果的可靠性和稳定性。结果逆方差加权法结果显示偏头痛与乳腺癌和雌激素受体阳性乳腺癌之间存在正相关因果关系,其效应指标优势比和置信区间分别为(OR=1.067,95%CI:1.016~1.120,P=0.009)、(OR=1.060,95%CI:1.006~1.118,P=0.029),但与雌激素受体阴性乳腺癌不存在因果关联(OR=1.056,95%CI:0.974~1.146,P=0.189)。留一法分析显示结果稳定,无单独的SNP影响总体结果,无水平基因多效性。结论偏头痛与乳腺癌、雌激素受体阳性乳腺癌之间可能存在正向因果关系,与雌激素受体阴性乳腺癌不存在因果关系。 展开更多

关键词 孟德尔随机化研究 偏头痛 乳腺癌

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教育程度增加变应性鼻炎和(或)湿疹的患病风险:一项基于欧洲患者全基因组关联研究的孟德尔随机化研究

9

作者 郑瑞 刘子锋 +8 位作者 陈壮桂 黄雪琨 冯佩英 邱惠军 卢娅欣 陈静静 张雅娜 张剑嵘 杨钦泰 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期791-798,共8页

目的采用孟德尔随机化(MR)方法探索教育程度与变应性鼻炎和(或)湿疹患病风险之间的因果关系。方法对基于大样本全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据进行二次数据分析,包括来自社会科学基因组学会联盟的293723例参与者(教育程度)和来自英... 目的采用孟德尔随机化(MR)方法探索教育程度与变应性鼻炎和(或)湿疹患病风险之间的因果关系。方法对基于大样本全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据进行二次数据分析,包括来自社会科学基因组学会联盟的293723例参与者(教育程度)和来自英国生物样本库的462013例参与者[变应性鼻炎和(或)湿疹]。选择与教育程度密切相关的遗传位点作为工具变量,分别采用逆方差加权(IVW)、MR-Egger回归、加权中位数法和加权众数法进行两样本MR分析,以优势比(OR)评价教育程度与变应性鼻炎和(或)湿疹的患病风险之间的因果关联。结果共纳入70个单核苷酸多态性(SNPs)作为工具变量。MR-Egger回归结果显示,基因多效性不会对结果造成偏倚(P=0.107)。在单变量MR分析中,IVW结果显示,教育年限每增加1年或1个标准差(3.71年),患变应性鼻炎和(或)湿疹的风险分别为OR=1.044(95%CI:1.020~1.069,P<0.001)和OR=1.170(95%CI:1.074~1.256,P<0.001)。在反向MR分析中,IVW未观察到变应性鼻炎和(或)湿疹对教育年限的影响(OR=1.020,95%CI:0.927~1.023,P=0.683)。加权中位数法和加权众数法的结果与IVW的结果基本一致。结论教育程度与变应性鼻炎和(或)湿疹患病风险之间存在正向因果关系,即教育程度升高会增加变应性鼻炎和(或)湿疹的患病风险。 展开更多

关键词 鼻炎 变应性 季节性 鼻炎 变应性 常年性 湿疹 教育 孟德尔随机化研究

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两样本孟德尔随机化分析肠道菌群相对丰度与畸形精子症的因果关系

10

作者 郝晓慧 马瑞敏 +5 位作者 马思成 刘稳榜 张宸铭 于雯霖 胡静 王祖龙 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2024年第5期387-396,共10页

目的:探究肠道菌群与畸形精子症的潜在因果关系。方法:从全基因组关联研究(GWAS)数据库中选择肠道菌群与畸形精子症的GWAS数据。肠道菌群作为暴露因素,工具变量(IVs)从MiBioGen联盟发布的18340例参与者的GWAS中确定。结局变量来自欧洲... 目的:探究肠道菌群与畸形精子症的潜在因果关系。方法:从全基因组关联研究(GWAS)数据库中选择肠道菌群与畸形精子症的GWAS数据。肠道菌群作为暴露因素,工具变量(IVs)从MiBioGen联盟发布的18340例参与者的GWAS中确定。结局变量来自欧洲的畸形精子症GWAS数据,总样本量85716例,其中915例患者,209006例对照。采用逆方差加权法(IVW)、MR-Egger回归和加权中位数法(WME)进行两样本孟德尔随机化分析,以β值来评价肠道菌群与畸形精子症之间的因果关系。结果:丹毒丝菌纲、丹毒丝菌科、链球菌科、粪球菌属Coprococcus1、瘤胃菌外UCG009属、链球菌属、梭状芽胞杆菌目、丹毒丝菌目与畸形精子症的风险增高存在因果关系,紫单胞菌科与畸形精子症的风险降低存在因果关系。结论:丹毒丝菌纲、丹毒丝菌科、链球菌科、粪球菌属Coprococcus1、瘤胃菌外UCG009属、链球菌属、梭状芽胞杆菌目、丹毒丝菌目可能是引起畸形精子症的原因之一,紫单胞菌科可能对精子的形态具有保护作用,能够减少畸形精子症的发生风险。 展开更多

关键词 畸形精子症 肠道菌群 孟德尔随机化研究

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基于磁共振成像测量内脏脂肪组织体积与抑郁症的关系

11

作者 胡明芳 张玉琴 《现代实用医学》 2024年第5期620-623,共4页

抑郁症在精神障碍所致健康寿命损失疾病中居首位,2019年全球约有2.8亿人罹患该病,较1990年增长了62.2%^([1])。目前全球肥胖和肥胖相关疾病负担也显著增加^([2])。肥胖与许多疾病相关,包括焦虑、抑郁、情感障碍等精神疾病^([3])。其中... 抑郁症在精神障碍所致健康寿命损失疾病中居首位,2019年全球约有2.8亿人罹患该病,较1990年增长了62.2%^([1])。目前全球肥胖和肥胖相关疾病负担也显著增加^([2])。肥胖与许多疾病相关,包括焦虑、抑郁、情感障碍等精神疾病^([3])。其中肥胖与抑郁症间具有高度关联性,但缺乏直接联系证据,两者间可能通过负面生理反应,如影响皮质醇分泌等机制呈现螺旋上升的恶性循环。 展开更多

关键词 内脏脂肪组织 抑郁症 磁共振成像 孟德尔随机化研究

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高血压、心房颤动与阿尔兹海默症风险:一项孟德尔随机研究

12

作者 蒲珊珊 朱小敏 +2 位作者 卓桂锋 陈炜 吴林 《川北医学院学报》 CAS 2024年第8期1009-1013,共5页

目的:采用遗传变异的双样本孟德尔随机化(MR)评估高血压、心房颤动和阿尔兹海默症之间的因果关系,避免观察性研究的局限性。方法:对来自IEU数据库的高血压(HBP)、心房颤动(AF)和阿尔兹海默症(AD)数据集进行MR分析,采用逆方差加权(IVW)、... 目的:采用遗传变异的双样本孟德尔随机化(MR)评估高血压、心房颤动和阿尔兹海默症之间的因果关系,避免观察性研究的局限性。方法:对来自IEU数据库的高血压(HBP)、心房颤动(AF)和阿尔兹海默症(AD)数据集进行MR分析,采用逆方差加权(IVW)、MR Egger、加权中位数、简单模式、加权模式。采用Cochran's Q检验、MR Egger截距检验进行敏感性分析。结果:遗传预测的HBP与AD的风险的关联差异无统计学意义(OR=0.89,95%CI:0.53~1.49,P=0.58);MR Egger未发现遗传多效性的证据(截距=0.007,P=0.39)。AF与AD的风险不存在因果关联(OR=1.04,95%CI:0.97~1.10,P=0.75);MR Egger未发现遗传多效性的证据(截距=0.002,P=0.63)。结论:孟德尔随机化分析未发现HBP、AF与AD之间存在因果关系。 展开更多

关键词 HBP AF AD 孟德尔随机化研究 单核苷酸多态性

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睡眠性状与特发性正常压力脑积水的因果关联:一项两样本双向孟德尔随机化研究

13

作者 钟帷韬 李伟松 +2 位作者 李泽霖 王强 张旺明 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1612-1619,共8页

目的利用双向孟德尔随机化研究方法探索睡眠性状与特发性正常压力脑积水之间的因果关系。方法采用GWAS catalog、芬兰公共数据库和MRCIEU GWAS数据库中8种睡眠性状的全基因组关联分析数据作为暴露,芬兰公共数据库中特发性正常压力脑积水... 目的利用双向孟德尔随机化研究方法探索睡眠性状与特发性正常压力脑积水之间的因果关系。方法采用GWAS catalog、芬兰公共数据库和MRCIEU GWAS数据库中8种睡眠性状的全基因组关联分析数据作为暴露,芬兰公共数据库中特发性正常压力脑积水(iNPH)的全基因组关联分析数据作为结局,使用逆方差加权法(IVW)作为主分析方法来评估睡眠性状与特发性正常压力脑积水之间的因果关系。敏感性分析方法采用Cochrane Q检验进行异质性检验和采用MR Egger‑intercept检验来检测潜在的水平多效性。同时,进行反向孟德尔随机化分析特发性正常压力脑积水与睡眠性状的因果关联。结果主分析方法IVW法显示经常白天小睡会增加iNPH的发病风险(OR=3.3393,95 CI%:1.0646-10.4742,P=0.0270)。Cochrane Q检验显示结果无潜在的异质性、MR Egger‑intercept检验显示结果无水平多效性(P>0.05)。外部验证复现了这一结果(OR=2.5660,95 CI%:1.1680-5.6373,P=0.0189)、(OR=4.0424,95 CI%:1.5709-10.4024,P=0.0038)。反向MR分析提示罹患iNPH不会影响睡眠性状。结论白天小睡的频率和特发性正常压力脑积水存在因果关联,对于老年人群,减少每周白天小睡的频率有助于降低iNPH的发生风险。 展开更多

关键词 孟德尔随机化研究 睡眠性状 特发性正常压力脑积水 白天小睡

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慢性阻塞性肺疾病与房颤及房扑因果关系的孟德尔随机化研究

14

作者 于晓慧 程雪 +7 位作者 吕琳 王娜 李梦聪 纪文文 刘婷婷 崔晨 胡婷华 石志红 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2024年第8期979-984,共6页

目的:采用两样本孟德尔随机化研究方法评估慢性阻塞性肺疾病(慢阻肺)与房颤及房扑发生风险之间的潜在因果关系。方法:研究数据来自全基因组关联研究(GWAS)汇总数据集,其中慢阻肺数据包含3 871例样本,房颤及房扑数据包含5 669例样本,选... 目的:采用两样本孟德尔随机化研究方法评估慢性阻塞性肺疾病(慢阻肺)与房颤及房扑发生风险之间的潜在因果关系。方法:研究数据来自全基因组关联研究(GWAS)汇总数据集,其中慢阻肺数据包含3 871例样本,房颤及房扑数据包含5 669例样本,选取17个与慢阻肺密切相关的遗传位点作为工具变量。分别采用逆方差加权、加权中位数和MREgger法进行孟德尔随机化分析。同时采用MR-Egger检测水平多效性,“Leave-one-out”进行敏感性分析保证结果稳健性。结果:逆方差加权法分析结果显示慢阻肺与房颤及房扑发生之间呈显著正相关(OR=1.227,95%CI:1.024~1.470,P=0.027);加权中位数结果显示了相似的因果关系(OR=1.209,95%CI:1.008~1.450,P=0.041)。敏感性分析中MR-Egger检验P=0.65,表明没有水平多效性,Leave-one-out亦未检测到对结果影响大的SNP。结论:慢阻肺与房颤及房扑发生之间可能存在正向因果关系。 展开更多

关键词 慢性阻塞性肺疾病 心房颤动 因果关系 孟德尔随机化研究

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基于两样本孟德尔随机化方法探讨血清睾酮水平与动脉粥样硬化的因果关联

15

作者 胡嘉仪 刘泓岑 +2 位作者 龚胜兰 谢天 张天奉 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2024年第4期339-346,共8页

[目的]探讨基因预测的血清睾酮水平与全身多部位动脉粥样硬化是否存在因果关系。[方法]基于两项分别来自国外的关于睾酮与动脉粥样硬化的欧洲人群全基因组关联研究汇总数据库,采用两样本孟德尔随机化分析方法,将与睾酮相关的遗传变异数... [目的]探讨基因预测的血清睾酮水平与全身多部位动脉粥样硬化是否存在因果关系。[方法]基于两项分别来自国外的关于睾酮与动脉粥样硬化的欧洲人群全基因组关联研究汇总数据库,采用两样本孟德尔随机化分析方法,将与睾酮相关的遗传变异数据作为工具变量,利用逆方差加权法、MR-Egger回归和加权中位数估计等方法评估睾酮与动脉粥样硬化之间的因果效应。[结果]逆方差加权法分析结果显示,基因预测的血清睾酮水平与外周动脉粥样硬化的风险呈负相关(OR=0.93,95%CI:0.86~1.00,P=0.01),睾酮升高可能减少患外周动脉粥样硬化的风险,而与脑动脉粥样硬化、冠状动脉粥样硬化及其他部位动脉粥样硬化(除脑动脉、冠状动脉和外周动脉)之间均未发现潜在因果关联的证据(P>0.05)。[结论]孟德尔随机化分析结果显示睾酮与外周动脉粥样硬化发生的风险有一定的因果关系,睾酮治疗在动脉粥样硬化防治中的前景值得开拓及进一步研究。 展开更多

关键词 孟德尔随机化研究 动脉粥样硬化 睾酮 因果关联

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循环炎症因子与PCOS风险之间的关联评估:一项双样本孟德尔随机化研究

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作者 袁山政 张燕雨 +6 位作者 翟亚悦 张增 李泽琳 廖莎 高宁 郑伟 徐慧军 《生殖医学杂志》 CAS 2024年第9期1214-1220,共7页

目的采用孟德尔随机化(MR)方法来探究在遗传水平上循环炎症因子与多囊卵巢综合征(PCOS)的关联性。方法从SCALLOP联盟数据库(https://www.phpc.cam.ac.uk/ceu/proteins)中获取循环炎症因子的GWAS数据集,筛选符合条件的单核苷酸多态性(SNP... 目的采用孟德尔随机化(MR)方法来探究在遗传水平上循环炎症因子与多囊卵巢综合征(PCOS)的关联性。方法从SCALLOP联盟数据库(https://www.phpc.cam.ac.uk/ceu/proteins)中获取循环炎症因子的GWAS数据集,筛选符合条件的单核苷酸多态性(SNP)作为暴露变量,从Finngen数据库(r9.finngen.fi/pheno/E4_PCOS)中提取与PCOS相关的SNP用作结局变量,进行MR研究,采用逆方差加权法(IVW)作为该研究评估因果效应的主要分析方法,并以MR-Egger回归法、加权中位数法(WME)、基于众数的加权估计(WM)、基于众数的简单估计(SM)等作为补充方法,并通过Cochran’Q检验、MR-Egger回归的截距等进行敏感性分析。结果IVW结果表明,在遗传水平上,欧洲人群中白细胞介素-18(IL-18)、IL-6、基质金属蛋白酶-10(MMP-10)、γ-干扰素(IFN-γ)等循环炎症因子与PCOS患病风险之间存在关联性,其中IL-18[OR=1.255,95%CI(1.002,1.572),P=0.048],IL-6[OR=1.434,95%CI(1.025,2.008),P=0.036]以及MMP-10[OR=1.338,95%CI(1.058,1.693),P=0.015]会增加PCOS患病风险,而IFN-γ[OR=0.631,95%CI(0.441,0.902),P=0.012]则会降低PCOS患病风险;同时,敏感性分析未发现存在异质性以及多效性(P>0.05),表明研究结果没有产生偏倚,留一法结果也提示结果稳健。结论在欧洲人群基因水平上,IL-18、IL-6及MMP-10循环炎症因子与PCOS患病率的风险升高存在相关性,IFN-γ与PCOS患病率风险下降存在相关性。 展开更多

关键词 多囊卵巢综合征 循环炎症因子 孟德尔随机化研究

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两样本孟德尔随机化研究肥胖与男性不育症的因果关系

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作者 李智超 滕志海 +3 位作者 韩振伟 张艳平 金成根 王亚轩 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2024年第4期306-314,共9页

目的:通过孟德尔随机化(MR)研究阐明肥胖与男性不育症(MI)之间的因果关系。方法:进行双样本MR分析,以评估遗传预测的体质量指数(BMI)与MI风险的因果关联。暴露因子为BMI(n;病例组;=99998,n;对照组;=12746)。MI的遗传信息来自一项全基因... 目的:通过孟德尔随机化(MR)研究阐明肥胖与男性不育症(MI)之间的因果关系。方法:进行双样本MR分析,以评估遗传预测的体质量指数(BMI)与MI风险的因果关联。暴露因子为BMI(n;病例组;=99998,n;对照组;=12746)。MI的遗传信息来自一项全基因组关联研究(GWAS),该研究包含73479例欧洲人。在单变量孟德尔随机化研究(UVMR)分析中,将逆方差加权法(IVW)作为主要方法,MR-Egger回归模型和加权中值估计模型作为因果推断的补充方法。其次,运用多种敏感性分析方法来验证MR结果的稳健性,包括Cochran's Q检验、MR-Egger截距检验、MR-PRESSO、留一法检验和漏斗图。为了评估BMI对MI风险的直接因果效应,进行多变量孟德尔随机化研究(MVMR)。结果:UVMR发现遗传预测BMI与MI风险增加之间存在因果关系(OR:1.237,95%CI:1.090~1.404,P=0.001)。敏感性分析发现,目前的研究几乎不存在偏倚(P>0.05)。在调整2型糖尿病、饮酒和吸烟等危险因素后,MVMR进一步证实遗传预测的BMI对MI风险增加有直接影响(P均<0.05)。结论:两样本MR研究表明,遗传预测的BMI可能与MI风险增加之间存在因果关系。未来的研究可基于这一发现,进一步探讨肥胖与MI两者之间因果关系的具体机制,为预防和治疗提供新途径。 展开更多

关键词 肥胖 体质量指数 因果关系 男性不育症 孟德尔随机化研究

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循环亚油酸水平与动脉粥样硬化风险的因果关联:一项两样本孟德尔随机化研究 被引量：2

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作者 左波 钟国廷 +2 位作者 任杰 步昊阳 朱莎 《现代生物医学进展》 CAS 2023年第11期2046-2052,共7页

目的:本文拟探讨遗传预测的循环亚油酸水平与不同部位动脉粥样硬化的因果关联。方法:采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究方法,选择与亚油酸相关联的单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNPs)作为... 目的:本文拟探讨遗传预测的循环亚油酸水平与不同部位动脉粥样硬化的因果关联。方法:采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究方法,选择与亚油酸相关联的单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNPs)作为工具变量(Instrument Variables,IVs),评估遗传预测的循环亚油酸水平与不同部位动脉粥样硬化的因果关联。结果:逆方差加权法(Inverse Variance Weighted,IVW)分析结果显示,遗传预测的循环亚油酸水平与冠状动脉粥样硬化风险存在显著正相关(OR=1.32,95%CI:1.09-1.61,P=0.005);循环亚油酸水平与脑动脉粥样硬化风险之间无因果关联(OR=1.18,95%CI:0.63-2.23,P=0.602)。循环亚油酸水平与外周动脉粥样硬化风险存在显著负相关(OR=0.55,95%CI:0.39-0.77,P=0.001)。循环亚油酸水平与其他动脉粥样硬化(不包括脑、冠状动脉和外周动脉)之间无显著的因果关联(OR=0.99,95%CI:0.81-1.21,P=0.916)。结论:遗传预测的循环亚油酸水平与冠状动脉粥样硬化及外周动脉硬化存在因果关联,亚油酸在动脉粥样硬化防治中的作用值得重视及进一步研究。 展开更多

关键词 亚油酸 动脉粥样硬化 孟德尔随机化研究 因果关联

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基于两样本孟德尔随机化分析哮喘与胃食管反流病因果关系的研究

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作者 刘松 马建岭 +2 位作者 史利卿 罗景舒 郭兆迪 《华西医学》 CAS 2024年第4期546-552,共7页

目的采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究方法评估哮喘与胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)发生风险之间的潜在因果关系。方法利用大样本全基因关联研究汇总数据,选择与哮喘密切相关的遗传位点[... 目的采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究方法评估哮喘与胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)发生风险之间的潜在因果关系。方法利用大样本全基因关联研究汇总数据,选择与哮喘密切相关的遗传位点[单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)]作为工具变量,分别采用逆方差加权法、加权中位数法和MR-Egger法进行MR分析。同时采用MR-Egger检测水平多效性,留一法进行敏感性分析保证结果稳健性。结果共纳入77个SNP作为评估哮喘与GERD因果关联的工具变量。逆方差加权法分析结果显示哮喘与GERD呈正相关[比值比(odds ratio,OR)=1.044,95%置信区间(confidence interval,CI)(1.006,1.083),P=0.024],加权中位数结果显示了相似的因果关系[OR=1.075,95%CI(1.021,1.133),P=0.006]。MR-Egger回归结果显示,哮喘与GERD呈正相关,但无统计学意义[OR=1.080,95%CI(0.983,1.187),P=0.115]。异质性检验结果显示,哮喘与GERD的因果关系不存在异质性(P>0.05)。水平多效性检验结果显示SNP不存在水平多效性(P>0.05)。留一法检验结果显示,未检测到对结果影响大的SNP。结论哮喘与GERD存在正向因果关系。 展开更多

关键词 哮喘 胃食管反流病 孟德尔随机化研究 因果关系

原文传递

双向孟德尔随机化研究分析哮喘与肌少症的因果效应

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作者 蔡虹 裴晶祺 +1 位作者 唐琳妮 朱迎钢 《老年医学与保健》 CAS 2024年第1期18-22,共5页

目的采用孟德尔随机化研究(MR)探索哮喘与肌少症的因果效应。方法两样本MR评估哮喘数据集对肌少症关联的3个数据集(低手握力、四肢肌肉重量和行走速度)的因果关系。逆方差加权法结果作为主要指标,MR-Egger回归、加权中位值、基于众数的... 目的采用孟德尔随机化研究(MR)探索哮喘与肌少症的因果效应。方法两样本MR评估哮喘数据集对肌少症关联的3个数据集(低手握力、四肢肌肉重量和行走速度)的因果关系。逆方差加权法结果作为主要指标,MR-Egger回归、加权中位值、基于众数的简单估计和基于众数的加权估计作为参考。逐步剔除法检验敏感性,Q检验检验异质性,MR-pleiotropy函数检验多效性。反向MR研究肌少症对哮喘的影响。结果哮喘与低手握力概率增加有关(OR=1.703,95%CI:1.206~2.405,P=0.003);与四肢肌肉重量减少有关(OR=0.733,95%CI:0.598~0.899,P=0.003);与行走速度降低有关(OR=0.930,95%CI:0.873~0.990,P=0.022)。逐步剔除法证实哮喘对肌少症3个数据集因果效应结果稳定。反向研究未发现肌少症对哮喘存在促进作用。结论哮喘促进肌少症的发生和发展,是肌少症的潜在不利因素。 展开更多

关键词 哮喘 肌少症 孟德尔随机化研究 握力

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