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抗菌肽基因misgurin同向串连表达载体构建新策略 被引量:8
1
作者 龚杰万 刘飞鹏 《生物技术》 CAS CSCD 2002年第1期1-2,共2页
目的是将抗菌肽基因misgurin以同向串连方式连接成多拷贝基因 ,并克隆到甲醇酵母表达载体上。在设计和连接中采用新策略 ,运用常规分子克隆操作进行表达载体构建 ,结果表明 ,该策略能方便高效地进行基因多拷贝同向串连表达载体的构建。
关键词 抗菌肽 misgurin 同向串连 拷贝基因 表达载体
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武汉汉族群体3个多拷贝Y-STR基因座的遗传多态性 被引量:7
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作者 黄代新 朱传红 +3 位作者 方慧 刘翠兰 杨罕 杨庆恩 《中国法医学杂志》 CSCD 2007年第2期76-80,共5页
目的提供DYS385、DYS459和DYS464基因座的群体遗传学资料。方法用荧光标记引物及ABI 3100型基因分析仪对武汉地区176名汉族男性无关个体的DYS385、DYS459和DYS464 3个多拷贝Y-STR基因座进行分型。结果在DYS385和DYS459基因座的个体,可... 目的提供DYS385、DYS459和DYS464基因座的群体遗传学资料。方法用荧光标记引物及ABI 3100型基因分析仪对武汉地区176名汉族男性无关个体的DYS385、DYS459和DYS464 3个多拷贝Y-STR基因座进行分型。结果在DYS385和DYS459基因座的个体,可观察到1~2个不同长度的扩增产物;DYS464基因座个体,可观察到1~4个不同长度的扩增产物。DYS385基因座检出14个等位基因及47种单倍型,DYS459检出4个等位基因及7种单倍型,DYS464检出9个等位基因及51种单倍型,其单倍型多样性分别为0.9591、0.6047和0.9560。3个基因座构成的联合单倍型共有133种,其多样性值达0.9909。结论3个多拷贝Y-STR基因座均为高多态性的遗传标记,联合应用具有较高的个体分辨能力。 展开更多
关键词 法医物证学 拷贝基因 Y-STR基因 遗传态性
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数字PCR在EB病毒核酸检测中的临床价值
3
作者 黄金印 陈芊如 +5 位作者 何晓静 欧子豪 蔡贞 司徒博 郭永 郑磊 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期649-657,共9页
目的评估EB病毒(EBV)多拷贝和单拷贝基因的数字PCR(dPCR)核酸检测方法在EBV核酸定量检测中的性能,并探讨其在临床应用中的适用性。方法对多拷贝BamHI-W基因及单拷贝EBNA1基因dPCR体系的灵敏度、特异性、精密度、检测下限(LoD)和线性进... 目的评估EB病毒(EBV)多拷贝和单拷贝基因的数字PCR(dPCR)核酸检测方法在EBV核酸定量检测中的性能,并探讨其在临床应用中的适用性。方法对多拷贝BamHI-W基因及单拷贝EBNA1基因dPCR体系的灵敏度、特异性、精密度、检测下限(LoD)和线性进行性能验证比对,采用最小二乘线性回归分析评估其线性。同时,收集2022年1—7月就诊于南方医科大学南方医院疑似EBV感染相关疾病患者的血浆样本182例,使用dPCR和实时荧光定量PCR(qPCR)同步检测EBV DNA载量,采用最小二乘线性回归分析评估其定量相关性。结果多拷贝和单拷贝基因的dPCR体系均有良好的线性相关(R2分别为0.992、0.997,P均<0.001),BamHI-W基因dPCR体系LoD为188 IU/ml,EBNA1基因dPCR体系LoD为358 IU/ml;BamHI-W基因dPCR体系和EBNA1基因dPCR体系中高浓度样本(1000000 IU/ml)对数变异系数(CV)值分别为0.34%和0.21%,中低浓度样本(5000 IU/ml)对数CV值分别为0.98%和0.64%;7种常见临床感染病原体和EB病毒阳性样本对照检测中,dPCR检测体系中只有EBV阳性样本产生阳性信号,与其他病原体无交叉反应。在182份样本检测中,BamHI-W基因dPCR阳性率为47.80%(87/182),EBNA1基因dPCR阳性率为35.16%(64/182),qPCR阳性率为43.41%(79/182)。定量相关性分析中,BamHI-W基因dPCR体系和EBNA1基因dPCR体系与qPCR检测浓度值线性拟合R2值分别为0.837和0.763(P均<0.001)。临床样本中的BamHI-W基因的拷贝数为3~18拷贝,不同患者感染的EBV的BamHI-W基因拷贝数不同。对于每例患者,多拷贝BamHI-W基因dPCR体系和单拷贝EBNA1基因dPCR体系检测的载量监测变化曲线趋势具有较高的一致性。结论基于dPCR技术的检测多拷贝BamHI-W基因和单拷贝EBNA1基因的EBV检测方法均具有较高的灵敏度和特异性,精密度和定量准确性均适用于临床样本检测。多拷贝BamHI-W基因dPCR方法在提高检测灵敏度方面具有较大的优势,可作为目前EBV DNA载量检测方法 展开更多
关键词 爱泼斯坦巴尔病毒感染 数字聚合酶链反应 拷贝基因 拷贝基因 核酸检测
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河南汉族群体DYF403S1和DYF404S1序列分析及多态性 被引量:6
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作者 马亚磊 尚万兵 +4 位作者 黄艳梅 黄书琴 张晶 芦亮 张翠 《中国法医学杂志》 CSCD 2015年第2期148-151,155,共5页
目的调查2个新的多拷贝基因座DYF403S1和DYF404S1在240例河南汉族群体无关男性个体中的遗传多态性,评价其法医学应用价值。方法用6-FAM荧光染料标记引物,PCR扩增产物采用ABI 3500遗传分析仪检测,根据分型检测结果,分别对2个基因座的不... 目的调查2个新的多拷贝基因座DYF403S1和DYF404S1在240例河南汉族群体无关男性个体中的遗传多态性,评价其法医学应用价值。方法用6-FAM荧光染料标记引物,PCR扩增产物采用ABI 3500遗传分析仪检测,根据分型检测结果,分别对2个基因座的不同等位基因进行序列分析。结果 DYF403S1基因座为4拷贝,该基因座包含2种核心序列并表现出2种不同的基序,等位基因分别为23~33、38~53。DYF404S1基因座为双拷贝,等位基因为11~18。本研究中2个多拷贝基因座组成的联合单体型共229种,出现最多的单体型为26-28-29-48/14-15,频率是0.016 7,仅出现1次的单体型共220种,占91.67%。单体型多样性(HD)和个体识别力(DP)分别为0.999 6和0.995 4,单体型辨别能力(DC)为0.954 2。结论 2个多拷贝基因座DYF403S1和DYF404S1在河南汉族群体中具有较高的遗传多态性。 展开更多
关键词 法医物证学 拷贝基因 短串联重复序列 Y-STR基因 遗传态性
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鲤多拷贝基因MRC1的全基因组鉴定及表达分析
5
作者 常松欢 王嘉利 +3 位作者 许建 张瀚元 张天杨 江炎亮 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2024年第1期85-94,共10页
甘露糖受体C1型基因(mannose receptor C-type 1,MRC1)是C型凝集素超家族的成员之一,其编码的甘露糖受体是一种模式识别受体,在先天免疫反应中发挥关键作用。MRC1基因在哺乳动物免疫反应中的作用被广泛研究,但在鱼类中的研究较少。近年... 甘露糖受体C1型基因(mannose receptor C-type 1,MRC1)是C型凝集素超家族的成员之一,其编码的甘露糖受体是一种模式识别受体,在先天免疫反应中发挥关键作用。MRC1基因在哺乳动物免疫反应中的作用被广泛研究,但在鱼类中的研究较少。近年来,随着高密度集约化养殖模式的发展,由病原微生物引发的疾病频繁暴发,其中,嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)是常见的致病菌之一。本研究首次在鲤(Cyprinus carpio)全基因组范围鉴定MRC1基因,共发现11个基因拷贝,并进行了功能域预测、共线性分析、多序列比对和系统进化分析,结果表明,MRC1基因在物种进化过程中保守程度较高。拷贝数比较分析发现,MRC1基因在不同物种中表现出不同程度的多拷贝现象,在多数鱼类中发现2个拷贝,而在鲤中发现多达11个拷贝。同时,比较了各拷贝在健康鲤脑、肌肉、肝脏和脾脏组织中的表达情况,发现在免疫相关组织脾脏中的表达量相对高于其他组织。进一步对感染嗜水气单胞菌4、12、24 h后在鲤脾脏中的表达进行差异比较分析,发现不同拷贝的表达特征各有差异,其中,HHLG13g0734在感染嗜水气单胞菌4 h后表达显著上调,HHLG13g0734在感染24h后表现出极显著上调,HHLG3g0497在整个感染过程中表达显著下调,表明鲤MRC1基因只有部分拷贝保留了免疫相关功能及参与机体的免疫反应。本研究结果有助于进一步了解鲤MRC1基因在抵抗嗜水气单胞菌感染过程中发挥的免疫功能,并为分子选育抗病新品系提供一定的数据基础。 展开更多
关键词 甘露糖受体C1型 拷贝基因 系统进化树 嗜水气单胞菌
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含人脑钠素多拷贝基因原核系列表达载体的构建 被引量:5
6
作者 任运生 马康涛 张乃蘅 《药物生物技术》 CAS CSCD 1996年第3期129-132,共4页
根据人脑钠素(HumanBrainNatriureticPeptide,hBNP)的cDNA序列,化学合成四条DNA片段,经PCR延伸扩增,获得全长BNP之cDNA。依EcoRⅠ和PstⅠ位点插入PBV221表达质粒... 根据人脑钠素(HumanBrainNatriureticPeptide,hBNP)的cDNA序列,化学合成四条DNA片段,经PCR延伸扩增,获得全长BNP之cDNA。依EcoRⅠ和PstⅠ位点插入PBV221表达质粒,构建成PBV221/BNP重组体。依据cDNA片段中BglⅡ和BamHⅠ切点的共同粘性末端,依次构建成PBV221/2BNP,PBV221/3BNP………PBV221/8BNP等系列克隆,分别含有不同拷贝首尾串联的BNPcDNA,经DNA测序,证实了所构建串联基因的顺序准确性。 展开更多
关键词 脑钠素 拷贝基因 聚合酶链反应
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利用CRISPR/Cas9对基因组中高度同源DNA片段编辑多样性的遗传学研究 被引量:4
7
作者 汪乐洋 黄海燕 吴强 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期313-325,共13页
在基因组中,编码区存在许多高度相似的基因簇或基因群(多拷贝基因),非编码区也存在大量的重复序列。这些重复序列能通过改变染色体的三维结构调控基因的转录,对于生物体的遗传与进化起到了重要的作用。其高度同源的特征使得利用CRISPR/C... 在基因组中,编码区存在许多高度相似的基因簇或基因群(多拷贝基因),非编码区也存在大量的重复序列。这些重复序列能通过改变染色体的三维结构调控基因的转录,对于生物体的遗传与进化起到了重要的作用。其高度同源的特征使得利用CRISPR/Cas9技术进行基因组编辑时面临更加复杂的状况。如果编辑的片段是二倍体或多倍体,还会产生各条染色单体上的编辑情况不相同的现象。为此本文选择了2个位于同一染色体相距11 kb的高度同源300 bp片段(L1和L2)进行CRISPR介导的DNA片段编辑。采用一对sgRNA(分别共同靶向两片段的上、下游位点)引导Cas9对HepG2细胞两个高度相似的DNA片段进行切割。片段编辑的细胞进一步单克隆化后,对获得的22个L1/L2编辑的CRISPR单克隆细胞株进行详细的基因型鉴定。结果发现除了这两个DNA片段本身被删除外,它们之间的大片段也存在被删除的现象,三个片段的各种反转组合也很频繁。该研究结果对于采用CRISPR/Cas9系统编辑多拷贝基因或重复序列,尤其是对二倍体或多倍体生物进行基因组编辑时具有重要的借鉴和参考价值。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 DNA片段编辑 单克隆 拷贝基因 重复调控序列
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豆类活性肽PA1b在大肠杆菌中的多拷贝串联表达
8
作者 黄欣媛 邹礼平 范红波 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第15期57-62,共6页
为构建能表达串联豆类活性肽PA1b(peaalbumin 1 subunitb)基因的重组大肠杆菌,并进行诱导表达和产物纯化。通过合成PA1b基因,采用同尾酶技术构建1~4拷贝数的串联PA1b基因,分别克隆至pET32a(+)原核表达载体上,转化入大肠杆菌BL21(DE3)中... 为构建能表达串联豆类活性肽PA1b(peaalbumin 1 subunitb)基因的重组大肠杆菌,并进行诱导表达和产物纯化。通过合成PA1b基因,采用同尾酶技术构建1~4拷贝数的串联PA1b基因,分别克隆至pET32a(+)原核表达载体上,转化入大肠杆菌BL21(DE3)中进行诱导表达,亲和层析纯化融合蛋白,肠激酶切除融合标签和切开串联体,获得单体PA1b肽。结果显示,大肠杆菌转化子中的重组质粒pET32a(+)-nPA1b(n=1~4)经PCR及测序验证正确,经1mmol/LIPTG25℃诱导8h,均能以包涵体形式表达出重组融合蛋白。SDS-PAGE分析结果表明,串联拷贝数越多,融合蛋白中PA1b含量越高。Ni-NTA亲和纯化得到高纯度的4拷贝串联PA1b融合蛋白,经肠激酶充分酶切、超滤浓缩后获得重组PA1b多肽。获得了表达1~4拷贝串联PA1b基因的重组大肠杆菌,并通过酶解4拷贝PA1b融合蛋白制备了重组PA1b,为多拷贝法制备PA1b肽奠定基础。 展开更多
关键词 PA1b 重组基因表达 拷贝基因 原核表达
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多拷贝人C肽基因的构建及其原核表达研究 被引量:1
9
作者 贾秀娟 杨金奎 +3 位作者 柴三葆 于湄 刘小超 魏永祥 《首都医科大学学报》 CAS 2007年第3期288-291,共4页
目的构建多拷贝的人C肽基因,选用合适的表达载体,以多拷贝基因的形式在大肠杆菌中高效表达人C肽。方法采用PCR、克隆、DNA序列分析、IPTG诱导表达和亲和层析等方法构建多拷贝的人C肽基因。结果构建成含5拷贝C肽基因的重组pET-30 a表达载... 目的构建多拷贝的人C肽基因,选用合适的表达载体,以多拷贝基因的形式在大肠杆菌中高效表达人C肽。方法采用PCR、克隆、DNA序列分析、IPTG诱导表达和亲和层析等方法构建多拷贝的人C肽基因。结果构建成含5拷贝C肽基因的重组pET-30 a表达载体,经转化及诱导,可在大肠杆菌中高效稳定表达可溶性的带6个组氨酸标签的C肽融合蛋白。结论在大肠杆菌中获得了人C肽的高表达,为下一步C肽的功能研究创造了重要条件。 展开更多
关键词 C肽 拷贝基因 大肠杆菌 表达
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基于16S rDNA与多拷贝基因hyvⅠ/hyvⅡ的柑橘黄龙病菌PCR检测体系比较
10
作者 陈岳文 李娜 +3 位作者 李芳 肖翠 姚润贤 邓子牛 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期251-252,共2页
柑橘黄龙病是由α变形菌纲细菌黄龙病菌耐热性亚洲种(Candidatus Liberibacter asiaticus,CLas)引起的柑橘毁灭性病害,世界柑橘产量居前三的中国、巴西、美国近年受灾严重。目前对CLas的分子检测主要靶点基因序列有16S rDNA、β-操纵子... 柑橘黄龙病是由α变形菌纲细菌黄龙病菌耐热性亚洲种(Candidatus Liberibacter asiaticus,CLas)引起的柑橘毁灭性病害,世界柑橘产量居前三的中国、巴西、美国近年受灾严重。目前对CLas的分子检测主要靶点基因序列有16S rDNA、β-操纵子和外膜蛋白基因(Bove,2015),但检出率及灵敏度相对较低,而利用多拷贝基因序列检测黄龙病的研究较少。 展开更多
关键词 16SrDNA 柑橘黄龙病 拷贝基因 分子检测 病菌 PCR 基因序列检测 外膜蛋白基因
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融合有酸性片段的抗菌肽串连重复基因的构建
11
作者 王晓波 刘飞鹏 《生物技术》 CAS CSCD 2003年第2期2-4,共3页
为提高抗菌肽的表达 ,设计在抗菌肽基因的N端融合一段编码酸性肽的片段以减轻表达产物对宿主的毒性 ,通过含有酶切位点的接头将该融合肽基因以同向串连的方式连接成多拷贝基因 ,克隆至pUC19载体。为此 ,分段设计合成了编码天蚕素A -蜂... 为提高抗菌肽的表达 ,设计在抗菌肽基因的N端融合一段编码酸性肽的片段以减轻表达产物对宿主的毒性 ,通过含有酶切位点的接头将该融合肽基因以同向串连的方式连接成多拷贝基因 ,克隆至pUC19载体。为此 ,分段设计合成了编码天蚕素A -蜂毒素杂合肽和酸性肽的DNA片段。首先将其连接成融合肽全基因 ,然后分别与含相同粘性末端的前后接头连接。通过控制基因和接头加入的量及次序 ,可得到两侧有EcoRⅠ和SalⅠ酶切位点的同向串连的多拷贝基因。选取合适拷贝数的基因 ,将其克隆至pUC19载体 ,PCR扩增和DNA测序证明多拷贝基因构建成功且基因方向相同。结果表明 ,该方法能简捷高效地获得所需的多拷贝基因 。 展开更多
关键词 抗菌肽 抗菌药物 酸性肽 同向串连 拷贝基因 融合肽 天蚕素A 蜂毒素 基因表达
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人胰岛素原C肽基因高效表达载体的构建
12
作者 于祥 秦文浩 《南通大学学报(医学版)》 2005年第1期47-49,共3页
目的 :构建一种快速、高效的人胰岛素原 C肽基因的表达载体 ,为有效地提高重组 C肽的产量奠定了基础。方法 :以人胰岛素原 C肽的基因序列为基础 ,运用 DNA重组技术构建出含 5个拷贝的头到尾连接的 C肽基因片段的高效表达载体。结果 :通... 目的 :构建一种快速、高效的人胰岛素原 C肽基因的表达载体 ,为有效地提高重组 C肽的产量奠定了基础。方法 :以人胰岛素原 C肽的基因序列为基础 ,运用 DNA重组技术构建出含 5个拷贝的头到尾连接的 C肽基因片段的高效表达载体。结果 :通过酶切鉴定和 DNA测序分析证实 ,实验成功地构建了人胰岛素原 C肽基因的表达载体 p MAL - c2 E- C5。结论 :人胰岛素原 C肽基因表达载体 p MAL - c2 E- C5的成功构建 ,为进一步研究在大肠杆菌中表达人 C肽融合蛋白 ,继而获得高产的单体 展开更多
关键词 拷贝基因 人胰岛素原C肽基因 高效表达载体 糖尿病
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类人胰岛素原多拷贝重复基因原核表达载体的构建与表达
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作者 罗联忠 陈仲巍 叶子坚 《南昌大学学报(理科版)》 CAS 北大核心 2014年第3期234-242,共9页
根据大肠杆菌密码子偏好性,优化人胰岛素原基因序列,同时用2个赖氨酸取代C链。重叠PCR扩增法克隆优化的类人胰岛素原基因,PCR扩增引物中引入胰蛋白酶酶切位点和核酸限制性内切酶识别位点。经酶切、拼接获得类人胰岛素原多拷贝基因,并构... 根据大肠杆菌密码子偏好性,优化人胰岛素原基因序列,同时用2个赖氨酸取代C链。重叠PCR扩增法克隆优化的类人胰岛素原基因,PCR扩增引物中引入胰蛋白酶酶切位点和核酸限制性内切酶识别位点。经酶切、拼接获得类人胰岛素原多拷贝基因,并构建人胰岛素原基因多拷贝原核表达载体,转化感受态大肠杆菌诱导表达融合蛋白。表达产物经SDS-PAGE电泳,考马斯亮兰染色和融合蛋白染色条带光密度分析表明,含有4拷贝的类人胰岛素原重复基因序列原核表达载体的诱导表达类人胰岛素原效率最高,是单拷贝类人胰岛素基因原核表达载体表达效率的3倍左右。表达产物经质谱鉴定,确定为优化设计的类人胰岛素原,表明构建的多拷贝类人胰岛素原基因表达载体可应用于后续人胰岛素原的高效表达生产研究。 展开更多
关键词 类人胰岛素原 重组基因表达 拷贝基因 原核表达 糖尿病
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人α心钠素多拷贝基因在大肠杆菌中的高效表达
14
作者 赵明 马康涛 张迺蘅 《北京医科大学学报》 CSCD 1999年第1期20-22,共3页
目的:选用合适的质粒表达载体,以多拷贝基因的形式在大肠杆菌中高效表达人α心钠素,为人α心钠素的下游纯化工作及基因工程菌的中试打下基础。方法:采用PCR,克隆及连续亚克隆,序列分析,原核温度诱导表达等方法。结果:PCR... 目的:选用合适的质粒表达载体,以多拷贝基因的形式在大肠杆菌中高效表达人α心钠素,为人α心钠素的下游纯化工作及基因工程菌的中试打下基础。方法:采用PCR,克隆及连续亚克隆,序列分析,原核温度诱导表达等方法。结果:PCR方法扩增αhANP基因,克隆至原核表达载体pMS31b,热诱导表达融合蛋白。结论:在大肠杆菌中获得了人α心钠素的高表达。 展开更多
关键词 心钠素 拷贝基因 大肠杆菌 基因扩增
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心钠素多拷贝基因的原核表达及其产物的纯化与测定
15
作者 任运生 张乃蘅 《药物生物技术》 CAS CSCD 1996年第1期1-4,共4页
将含八拷贝心钠素(Cardionatrin,CN)cDNA的质粒转化大肠杆菌,在lac启动子控制下经化学诱导表达。表达的多串蛋白之间由不存在于心钠素序列的赖氮酸相互分开。经分离纯化后,得到8CN蛋白,电泳表现为单一条... 将含八拷贝心钠素(Cardionatrin,CN)cDNA的质粒转化大肠杆菌,在lac启动子控制下经化学诱导表达。表达的多串蛋白之间由不存在于心钠素序列的赖氮酸相互分开。经分离纯化后,得到8CN蛋白,电泳表现为单一条带。经赖氨酸酶C和羧肽酶B酶切及复性处理后,检测到较强的心钠素放免和生物学活性。 展开更多
关键词 心钠素 大肠杆菌 CDNA 拷贝基因 纯化
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多拷贝Y-STR基因座在法庭科学领域的研究 被引量:10
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作者 尚蕾 莫晓婷 +5 位作者 杨帆 张建 余政梁 马新 赵兴春 李万水 《刑事技术》 2018年第2期97-103,共7页
Y-STR技术现已成为法庭科学领域重要的检验鉴定方法。目前单拷贝Y-STR基因座广受瞩目,然而,多拷贝Y-STR基因座在Y染色体上有2~4个拷贝,多态性更高,可望作为Y-STR鉴定的重要补充。迄今为止,已报道的多拷贝基因座达几十种,其中包含多个快... Y-STR技术现已成为法庭科学领域重要的检验鉴定方法。目前单拷贝Y-STR基因座广受瞩目,然而,多拷贝Y-STR基因座在Y染色体上有2~4个拷贝,多态性更高,可望作为Y-STR鉴定的重要补充。迄今为止,已报道的多拷贝基因座达几十种,其中包含多个快速突变的基因座。利用各地的人群样本,国内外陆续开展了针对少数多拷贝基因座的遗传多态性研究,其中,国内的此类研究多集中于河南汉族人群,全面的研究工作仍待推进。现有的Y-STR复合扩增体系多数只包含2~3个多拷贝基因座,将大量多拷贝Y-STR基因座纳入复合扩增体系将可能提升系统的检验效能。本文从多拷贝Y-STR基因座的结构特点、突变特点、遗传多态性及复合扩增研究等多方面进行了综合评述,并提出了未来多拷贝Y-STR基因座的研究方向,为Y-STR技术更好地应用于法庭科学领域进行了初步探索。 展开更多
关键词 法庭科学 Y-STR 拷贝基因
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利用PCR构建多拷贝HIV-1 TAR序列的串联体 被引量:6
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作者 阴彬 白龙川 袁建刚 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2001年第1期85-87,共3页
建立“自身引物—模板”PCR方法 ,并应用此方法成功地扩增了多拷贝HIV 1TAR片段的同向串联体。此方法简便 ,省力 ,可用于多拷贝基因探针、多拷贝反义基因片段、多拷贝抗原表位的扩增和克隆。
关键词 自身引物-模板 串联板 聚合梅链反应 HIV-1TAR 拷贝基因探针
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小肽多拷贝基因表达载体的构建及其高效表达(英文) 被引量:8
18
作者 胡学军 张志超 +2 位作者 包永明 杨青 安利佳 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期287-292,共6页
介绍一种快速、高效构建小肽多拷贝基因表达载体的策略 ,并构建了相应的表达载体pETE coT .用人工合成的编码 2 8个氨基酸残基的胸腺素α1基因为模型 ,采用限制酶EcoT14I识别序列CCAAGG为小肽基因两末端序列 ,利用其酶切后可产生非镜相... 介绍一种快速、高效构建小肽多拷贝基因表达载体的策略 ,并构建了相应的表达载体pETE coT .用人工合成的编码 2 8个氨基酸残基的胸腺素α1基因为模型 ,采用限制酶EcoT14I识别序列CCAAGG为小肽基因两末端序列 ,利用其酶切后可产生非镜相对称粘性末端 ,一次连接反应就构建出一系列不同基因拷贝数的表达载体 ;在小肽基因两端分别引进编码FactorXa和羟胺蛋白切割位点的序列 ,表达出的融合蛋白可被FactorXa和羟胺剪切出不残留任何外源氨基酸的小肽 .不同拷贝数的小肽融合蛋白在大肠杆菌BL2 1(DE3)中均获得高效表达 . 展开更多
关键词 小肽拷贝基因 表达载体 高效表达 定向插入 EcoT14Ⅰ
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基于密码子偏好特征的原核基因组多拷贝基因序列分析
19
作者 陈清利 毕胜男 于家峰 《德州学院学报》 2014年第6期21-25,51,共6页
基因重复是普遍存在的现象,与基因组进化密切相关,是基因组和遗传系统分化的重要推动力.目前针对原核基因组中蛋白质编码基因序列中的重复基因的系统研究还很少.本文以四种具有不同GC%含量的原核生物基因组为研究对象,用CodonW软件... 基因重复是普遍存在的现象,与基因组进化密切相关,是基因组和遗传系统分化的重要推动力.目前针对原核基因组中蛋白质编码基因序列中的重复基因的系统研究还很少.本文以四种具有不同GC%含量的原核生物基因组为研究对象,用CodonW软件对各基因组中完全相同的功能基因的密码子使用偏好进行分析,用CD-hit软件对各基因组中以80%为阈值的重复蛋白编码基因进行分析.结果表明四个基因组的蛋白编码基因中普遍存在基因重复序列,其比例占到2.77%~7.03%.对序列完全相同的功能已知基因的分析表明其序列长度分布在50bp到1000bp左右的范围,多数长度在500bp以下;功能分析表明所研究基因组中大部分重复基因与转座酶有关,还有少量的编码转移酶、水解酶、跨膜蛋白、阻遏蛋白等.对各基因组中重复基因中序列完全相同的基因的密码子偏好性分析表明这些多拷贝基因坐落在基因组中某一特定区域并集中分布,展现出明显的共性特征.本文的尝试性工作将为今后原核基因组研究提供新思路. 展开更多
关键词 原核基因 重复基因 拷贝蛋白编码基因
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