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植物抗病基因研究进展 被引量：38
1
作者 董继新 董海涛 李德葆 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期1-9,共9页
植物抗病基因的研究是目前植物病理学科的热点及难点之一。 R基因的克隆与鉴定促进了寄主与病原物互作分子机制研究的深入。本文就近几年来对植物 R基因的克隆、结构与功能 ,R基因信号传导途径和 R基因的进化等方面的研究进展作一评述。
关键词 抗病基因 互作机制 信号传导 植物病害 寄主 病原 抗病反应 基因结构 基因功能 基因克隆 基因进化
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查尔酮合成酶基因 被引量：37
2
作者 蒋明 曹家树 《细胞生物学杂志》 CSCD 2007年第4期525-529,共5页
查尔酮合成酶基因是苯丙氨酸代谢途径中的关键基因,在类黄酮类物质合成中扮演着重要的角色,调控着色素合成、防御反应、植物育性等生理生化过程,对植物的生长发育起着至关重要的作用。现对查尔酮合成酶在苯丙氨酸代谢途径中的地位、基... 查尔酮合成酶基因是苯丙氨酸代谢途径中的关键基因,在类黄酮类物质合成中扮演着重要的角色,调控着色素合成、防御反应、植物育性等生理生化过程,对植物的生长发育起着至关重要的作用。现对查尔酮合成酶在苯丙氨酸代谢途径中的地位、基因表达特性、基因功能以及基因进化等方面的进展做一介绍。 展开更多
关键词 查尔酮合成酶基因 植物育性 植物花色 表达特性 基因进化
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抗生素耐药基因古老起源与现代进化及其警示 被引量：36
3
作者 李显志 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期81-89,共9页
细菌抗生素耐药性系全球关注的医学及社会问题。新近对古老细菌DNA与现代病原菌的研究揭示了抗生素耐药基因的古老起源、多样性及快速的现代进化,并促使了耐药基因组(resistome)的问世。耐药基因决定簇及其与进化有关的基因可移动元件... 细菌抗生素耐药性系全球关注的医学及社会问题。新近对古老细菌DNA与现代病原菌的研究揭示了抗生素耐药基因的古老起源、多样性及快速的现代进化,并促使了耐药基因组(resistome)的问世。耐药基因决定簇及其与进化有关的基因可移动元件如质粒、插入顺序、转座子和整合子等远存在于人类抗生素时代之前。在过去短短的70年抗生素时代期间,人类大量应用各类抗生素等行为明显地造成了对细菌的选择性压力,加之细菌基因本身的自突变性和水平基因转移能力等多种因素促使了耐药基因的进化及新型耐药特征的出现。人类重要病原菌如ESKAPE病原菌(肠球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肠道杆菌属)所呈现的高度多重耐药性或泛耐药性便充分展示了耐药基因起源、进化和传播的复杂性,并严重地威胁着感染性疾病的治疗。所有这些均警示人类需要同时采取多种有效措施控制各类抗生素尤其是人类极为重要抗生素的使用。任何环境下的抗生素滥用当止! 展开更多
关键词 抗生素耐药性 多重耐药性 ESKAPE病原菌 耐药基因组 基因进化 基因可移动元件 水平基因转移
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植物数量遗传学的建立、发展与展望 被引量：24
4
作者 章元明 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期19-24,共6页
论述了植物数量遗传学的建立、发展与展望。重点介绍了南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室在植物数量遗传方面的研究进展,包括学科建立、主基因+多基因混合遗传分析的拓展、纯系品种群体和遗传交配设计群体的基因挖掘及基因... 论述了植物数量遗传学的建立、发展与展望。重点介绍了南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室在植物数量遗传方面的研究进展,包括学科建立、主基因+多基因混合遗传分析的拓展、纯系品种群体和遗传交配设计群体的基因挖掘及基因的分子进化研究。展望了植物数量遗传的可能发展方向,包括遗传分析与作物育种和生物信息学相结合,以及海量信息分析与云计算相结合。目的在于引导植物遗传工作者的思考。 展开更多
关键词 数量遗传 多基因 主基因+多基因混合遗传 关联分析 遗传交配设计 基因进化
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河北省2013-2017年其他肠道病毒手足口病重症和死亡病例流行病学和病原特征分析 被引量：23
5
作者 于秋丽 刘莹莹 +5 位作者 赵文娜 苏通 谢赟 张文俊 齐顺祥 李琦 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1054-1057,共4页
目的掌握2013-2017年河北省其他肠道病毒感染所致手足口病重症和死亡病例的流行病学特征;分析柯萨奇病毒A组6型(CoxA6)的基因特征,进一步阐明其遗传进化特点及规律。方法利用描述性流行病学方法对2013-2017年河北省其他肠道病毒感染所... 目的掌握2013-2017年河北省其他肠道病毒感染所致手足口病重症和死亡病例的流行病学特征;分析柯萨奇病毒A组6型(CoxA6)的基因特征,进一步阐明其遗传进化特点及规律。方法利用描述性流行病学方法对2013-2017年河北省其他肠道病毒感染所致手足口病重症和死亡病例的三间分布特征进行分析。运用Mega 5.2软件对CoxA6的VP1区序列进行系统进化树分析。结果2013-2017年河北省累计报告其他肠道病毒手足口病重症和死亡病例86例(重症84例,死亡2例),占其他肠道病毒手足口病报告病例的1.12%(86/7698)。每年4月份发病人数逐渐上升,5-7月达到最高峰。人群分布上,1~岁年龄组儿童的5年累计占比65.12%(56/86)。男女性别比为1.39∶1(50/36)。职业分布上,散居儿童占总发病人数的93.02%(80/86)。标本经病毒分离获得阳性毒株39份,阳性分离率为45.35%(39/86)。亲缘进化树显示,CoxA6分离株与D3a和D3b这2种亚型代表株处于同一分支。结论2013-2017年河北省其他肠道病毒手足口病重症和死亡病例在发病时间上呈现季节性,与手足口病流行的整体趋势一致。CoxA6属于D3基因型,且未出现新的进化分支。 展开更多
关键词 手足口病 其他肠道病毒 流行病学特征 柯萨奇病毒A组6型 基因进化
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分子系统发育分析的生物信息学方法 被引量：17
6
作者 张树波 赖剑煌 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2010年第8期47-51,66,共6页
物种之间的系统发育分析研究物种的形成或进化历史,以及物种之间的进化关系,它是当代生命科学研究的一个重要分支。分子生物学和计算机科学的发展,为人类采用计算的方法从分子水平研究生物的进化历史以及探索生命的起源提供了新的思路... 物种之间的系统发育分析研究物种的形成或进化历史,以及物种之间的进化关系,它是当代生命科学研究的一个重要分支。分子生物学和计算机科学的发展,为人类采用计算的方法从分子水平研究生物的进化历史以及探索生命的起源提供了新的思路。在过去的几十年中,基于分子水平的系统发育学研究取得很大的进展,各种各样基于分子水平的系统发育树推断方法被提出来。现从物种进化距离刻画和系统发育树重构算法两个方面,总结和评述了在过去十几年里,人类利用生物信息学方法在分子水平上研究物种进化关系的进展和取得的成果,分析了物种进化研究存在的问题和面临的挑战,指出了物种进化研究今后的主要方向。 展开更多
关键词 生物信息学 系统发育分析 基因进化 最大简约法 最大似然法 邻接法
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入侵检测免疫模型中抗体基因库的生成和进化 被引量：6
7
作者 杨孔雨 王秀峰 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2003年第7期26-28,共3页
文中简要分析了当前入侵检测技术存在的问题和发展方向,结合人体免疫理论,提出一种基于检测代理的分布式网络入侵检测免疫模型。为了提高免疫系统识别异常的轻负荷和适应性,引入粗集理论的约简算法,用于待检数据的预处理和抗体基因库的... 文中简要分析了当前入侵检测技术存在的问题和发展方向,结合人体免疫理论,提出一种基于检测代理的分布式网络入侵检测免疫模型。为了提高免疫系统识别异常的轻负荷和适应性,引入粗集理论的约简算法,用于待检数据的预处理和抗体基因库的生成,并结合抗体进化原理不断对基因实施进化。该模型可降低待检数据的冗余,保持抗体基因的进化和适应性,提高入侵检测的效率和准确性。 展开更多
关键词 入侵检测 免疫系统 抗体基因库 粗集约简 基因进化
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B型流行性感冒病毒基因进化研究进展 被引量：16
8
作者 曾晓旭 王大燕 舒跃龙 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期656-658,共3页
流行性感冒病毒（简称流感病毒）属于正粘病毒家族，是单负链、分节段的RNA病毒，分为甲（A）、乙（B）、丙（C）三型，其中A型和B型流感病毒共有8个RNA节段，分别是聚合酶Ⅱ（ polymerase basic-2 protein, PB2 ） 基因、聚合酶Ⅰ（pol... 流行性感冒病毒（简称流感病毒）属于正粘病毒家族，是单负链、分节段的RNA病毒，分为甲（A）、乙（B）、丙（C）三型，其中A型和B型流感病毒共有8个RNA节段，分别是聚合酶Ⅱ（ polymerase basic-2 protein, PB2 ） 基因、聚合酶Ⅰ（polymerase basic-1 protein, PB1 ）基因、酸性聚合酶（ polymerase acidic ,PA）基因、 展开更多
关键词 流行性感冒病毒 B型流感病毒 基因进化 protein RNA病毒 聚合酶Ⅱ 正粘病毒 PB2
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高等植物中蔗糖转化酶的研究进展 被引量：14
9
作者 王连军 《安徽农业科学》 CAS 2014年第24期8108-8111,共4页
蔗糖是高等植物光合作用的主要产物之一,也是糖类在植物中运输的主要方式,在植物的生长发育过程中起重要的作用。蔗糖转化酶(Sucrose invertase,INV)可以不可逆地催化蔗糖水解成葡萄糖和果糖,对于蔗糖的利用和运输起重要的作用。很多研... 蔗糖是高等植物光合作用的主要产物之一,也是糖类在植物中运输的主要方式,在植物的生长发育过程中起重要的作用。蔗糖转化酶(Sucrose invertase,INV)可以不可逆地催化蔗糖水解成葡萄糖和果糖,对于蔗糖的利用和运输起重要的作用。很多研究表明,在植物组织中存在多种形式的蔗糖转化酶的同工酶。蔗糖转化酶基因在环境压力和进化过程中不断进化,最终形成人们现在看到的蔗糖转化酶基因家族。蔗糖转化酶的调控主要体现在mRNA水平的调控和抑制蛋白在翻译后的调控2个方面。抑制蛋白在翻译后的调控中有一类小20 kD的蔗糖转化酶抑制蛋白(Sucrose invertase inhibitor,INVINH),可以通过抑制蔗糖转化酶活性,起到调节植物生理活动的作用。 展开更多
关键词 蔗糖 转化酶 基因进化 mRNA调控 转化酶抑制蛋白
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植物蔗糖转运蛋白研究进展 被引量：12
10
作者 张清 胡伟长 张积森 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第1期193-202,共10页
蔗糖转运蛋白(SUT)在植物的生长代谢中调控蔗糖的运输和分配,并通过蔗糖信号影响其它代谢途径。植物蔗糖转运蛋白结构较为保守,属于12次跨膜的膜蛋白基因家族。对已完成基因组测序的10个单子叶和8个双子叶植物的蔗糖转运蛋白聚类分析表... 蔗糖转运蛋白(SUT)在植物的生长代谢中调控蔗糖的运输和分配,并通过蔗糖信号影响其它代谢途径。植物蔗糖转运蛋白结构较为保守,属于12次跨膜的膜蛋白基因家族。对已完成基因组测序的10个单子叶和8个双子叶植物的蔗糖转运蛋白聚类分析表明,该基因家族可以分为5个亚族,SUT1、SUT2、SUT3、SUT4、SUT5,其中SUT2和SUT4为单、双子叶所共有的基因,SUT1为双子叶特异,而SUT3、SUT5为单子叶特异。单、双子叶蔗糖转运蛋白是由2个祖先基因进化而来。SUT的组织分布和遗传转化研究表明,SUT参与植物蔗糖运输与贮存、非生物胁迫响应、胚乳发育等,且SUT家族成员之间存在功能差异。SUT2的表达受Sn RKs调控,而SUT4表达则调控部分生物钟相关基因,同时筛部移动信号等也调节SUT的表达。本文综述了植物蔗糖转运蛋白基因分类、生理功能及其在不同水平上的调控等方面的研究进展,为更好的理解蔗糖转运蛋白对植物生长发育的影响及其分子机制提供参考。 展开更多
关键词 蔗糖转运蛋白 单双子叶植物 基因进化 基因功能 基因家族
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植物抗病基因克隆的研究进展 被引量：3
11
作者 钟军 李栒 官春云 《生物技术通讯》 CAS 2002年第4期308-311,共4页
本文从抗病基因克隆技术、抗病基因的产物和结构、抗病基因介导的抗病信号传导以及抗病基因进化等方面入手,综述了近几年来植物抗病基因克隆的研究进展,并对转座子标签法和定位克隆法做了较为详细的阐述。
关键词 植物 抗病基因克隆 研究进展 信号传导 基因进化 转座子标签 图位克隆
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2017—2018年广州市H3N2流感病毒流行及血凝素基因分子特征分析 被引量：11
12
作者 曹蓝 鲁恩洁 +4 位作者 陈艺韵 马钰 李魁彪 陆剑云 狄飚 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期899-904,921,共7页
目的对广州市H3N2流感病毒进行基因变异和进化分析,为H3N2流感科学防控提供科学依据。方法对广州市2017年1月-2018年9月流感监测标本进行H3N2病毒检测和分离,并对HA基因进行测序,通过生物信息学软件分析病毒变异和进化特点。结果所监测... 目的对广州市H3N2流感病毒进行基因变异和进化分析,为H3N2流感科学防控提供科学依据。方法对广州市2017年1月-2018年9月流感监测标本进行H3N2病毒检测和分离,并对HA基因进行测序,通过生物信息学软件分析病毒变异和进化特点。结果所监测的8 535份标本中,检出H3N2流感阳性标本386份,阳性率为4.52%。对其中16株分离株HA基因测序结果显示,与同年度疫苗推荐株A/Hong Kong/4801/2014相比,2017年广州H3N2病毒A 区抗原位点变异频率较高,多发生于140位、144位和150位,其中有7株病毒发生新抗原漂移,变异毒株占比43.75%。受体结合位点变异主要发生在前壁,位于T131K位和T135K(N)位。糖基化位点变异同样多发生于A区抗原位点和受体结合位点前壁。2017年广州H3N2流感病毒均位于3C.2a分支,但分支内又进一步进化形成3个不同的小流行分支,包括3C.2a1分支,以及与2016年北京、2017年美国分离株亲缘相近的另外两个小分支。结论 2017年广州H3N2流感病毒HA蛋白重要氨基酸位点的变异表现遗传多态性,特别是在抗原性上可能发生了较大变异。在基因进化上表现为多样性和复杂性,呈现多分支进化特点。因此有必要密切监测流行毒株的进化趋势,以期及时对疫苗株的匹配性进行有效评估。 展开更多
关键词 H3N2流感病毒 血凝素 基因变异 基因进化
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2011-2014年河北省手足口病病原构成及其他肠道病毒基因进化分析 被引量：10
13
作者 刘莹莹 赵文娜 +3 位作者 刘宏灵 于秋丽 齐顺祥 李琦 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第11期973-976,981,共5页
目的了解河北省2011-2014年手足口病病原以及其他(非EV71及非CoxA16的肠道病毒)肠道病毒分子遗传进化特征。方法利用描述流行病学方法对河北省2011-2014年疾病监测信息报告系统上报的手足口病病例资料和实验室检测结果进行统计分析,利用... 目的了解河北省2011-2014年手足口病病原以及其他(非EV71及非CoxA16的肠道病毒)肠道病毒分子遗传进化特征。方法利用描述流行病学方法对河北省2011-2014年疾病监测信息报告系统上报的手足口病病例资料和实验室检测结果进行统计分析,利用DNAstar软件包和MEGA软件分析其他肠道病毒的基因进化特征。结果手足口病病原检测病原构成以EV71为主,阳性率为53.49%,且不同年份病原构成略有不同。在轻症病例中,2012年CoxA16构成比为44.56%,2013年其他肠道病毒构成比为48.54%,但仍有>75%的重症病例和85%的死亡病例由EV71感染引起。CVA6、CVA10、CVA4肠道病毒的分离株与其相应原型株的VP1区核苷酸序列差异均较大,但各型分离株具有较高的内部序列同源性,在进化树上与深圳、上海等相应分离株共进化共循环。结论 EV71是本地区手足口病的主要病原体,但EV71和CVA16感染所占比例总体上呈下降趋势,其他肠道病毒所占比例总体上呈缓慢上升的趋势,加强非EV71、非CoxA16肠道病毒的检测和鉴定分型将有助于手足口病预防和控制。 展开更多
关键词 手足口病 病原构成 其他肠道病毒 基因进化
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2017-2020年湖北省甲型H3N2亚型流感病毒流行特征和进化分析 被引量：8
14
作者 谢蒙生 方斌 +3 位作者 黄成静 于甜甜 韩诗 陈丹 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期50-57,共8页
目的了解2017—2020年湖北省甲型H3N2亚型流行性感冒(流感)流行分布及基因进化情况。方法根据湖北省流感病原学监测数据,分析2017—2020年甲型H3N2亚型流感病毒流行分布情况,按年度分布和地域分布的原则选取2017—2020年各市级流感监测... 目的了解2017—2020年湖北省甲型H3N2亚型流行性感冒(流感)流行分布及基因进化情况。方法根据湖北省流感病原学监测数据,分析2017—2020年甲型H3N2亚型流感病毒流行分布情况,按年度分布和地域分布的原则选取2017—2020年各市级流感监测网络实验室送检的该亚型流感病毒共38株进行测序,获得病毒HA和NA氨基酸序列,分析其抗原决定簇氨基酸位点变化情况,对其进行基因进化和三维建模分析。结果2017—2020年湖北省甲型H3N2亚型流感病毒存在3个流行高峰,第Ⅰ流行峰主要流行3C.2a1簇病毒,第Ⅱ流行峰主要为3C.2a1b+T131K簇病毒,第Ⅲ流行峰主要为3C.2a1b+T135K簇病毒。3C.2a1b+T131K簇病毒与3C.2a1b+T135K簇病毒在HA蛋白3处抗原决定簇上存在8处不同氨基酸突变位点。3C.2a1b+T131K簇病毒的50、131、135、140位点和3C.2a1b+T135K簇病毒在三维模拟结构图中差异明显。结论2017—2020年湖北省甲型H3N2亚型流感病毒不断进化,加强对近期3C.2a1b+T135K簇病毒的进化监测和抗原突变分析,有助于提高湖北省流感病毒流行病学和基因进化监测水平。 展开更多
关键词 H3N2 基因进化 三维建模 进化簇
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菠萝PEPC基因家族生物信息学分析 被引量：8
15
作者 马海洋 赵秋芳 +2 位作者 陈曙 石伟琦 冼皑敏 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2020年第1期97-103,共7页
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)在C4和景天酸代谢(CAM)光合途径吸收CO2过程中发挥重要作用,并参与各种非光合作用过程,包括果实成熟、气孔开放、碳氮相互作用、种子形成和萌发以及调节植物对逆境胁迫的... 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEPC)在C4和景天酸代谢(CAM)光合途径吸收CO2过程中发挥重要作用,并参与各种非光合作用过程,包括果实成熟、气孔开放、碳氮相互作用、种子形成和萌发以及调节植物对逆境胁迫的耐受性。菠萝为典型的景天酸代谢途径(CAM)植物,为了解磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)在菠萝景天酸代谢途径(CAM)中的作用,本研究鉴定到3个菠萝PEPC基因,按照基因描述命名为AcPEPC1、AcPEPC3和AcPEPC4,进化树分析结果AcPEPC1和AcPEPC3为植物型PEPC(PTPCs)蛋白,序列同源性较高且基因结构、保守结构域及保守基序均一致。AcPEPC4为细菌型PEPC(BTPCs)蛋白,与AcPEPC1/AcPEPC3间的序列同源性低。组织表达分析表明AcPEPC1菠萝叶片表达量较高,而AcPEPC3和AcPEPC4在菠萝花和果实表达量较高。 展开更多
关键词 菠萝 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC) 基因进化 基因表达谱
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逆转座子及其在真核生物基因组进化中的作用 被引量：2
16
作者 孔卫青 朱勇 杨金宏 《蚕学通讯》 2004年第4期27-31,共5页
基因组内的转座子 ,特别是逆转座子以不同的方式推动着基因组的进化。在植物和哺乳动物中 ,逆转座子不断积聚 ,已经占了基因组成的一大部分 ,不仅对基因而且对基因组都有较大的影响。虽然宿主常能够控制它们的数量 ,但在整个的进化中它... 基因组内的转座子 ,特别是逆转座子以不同的方式推动着基因组的进化。在植物和哺乳动物中 ,逆转座子不断积聚 ,已经占了基因组成的一大部分 ,不仅对基因而且对基因组都有较大的影响。虽然宿主常能够控制它们的数量 ,但在整个的进化中它们的大量的扩增还是被保留了下来。现在 ,它们已经成了研究基因进化和基因功能的非常有用的工具。 展开更多
关键词 转座子 真核生物 基因组进化 基因进化 基因功能 哺乳动物 植物 基因组成 数量 宿主
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上海市柯萨奇病毒A6型流行株基因进化与选择压力分析 被引量：8
17
作者 张晓玲 俞慧菊 +1 位作者 宋志刚 王蔚 《国际病毒学杂志》 2017年第6期365-370,共6页
目的 对上海市柯萨奇病毒A6型（CVA6）流行株的基因进化和选择压力进行分析,为今后手足口病的防治提供理论依据.方法 选取美国国立生物技术信息中心（NCBI）数据库中的CVA6参考序列,与2011-2015年上海地区CVA6流行株的VP1基因序列进行比... 目的 对上海市柯萨奇病毒A6型（CVA6）流行株的基因进化和选择压力进行分析,为今后手足口病的防治提供理论依据.方法 选取美国国立生物技术信息中心（NCBI）数据库中的CVA6参考序列,与2011-2015年上海地区CVA6流行株的VP1基因序列进行比对,采用MEGA软件构建进化树;扩增2014-2015年上海地区CVA6流行株的全长基因序列,采用Bioedit软件计算氨基酸置换熵值,用Datamonkey在线软件预测正向选择位点.结果 基于VP1基因序列的进化树显示2011-2015年上海地区的CVA6流行株为D3、D6和D7亚型,2014年后为D7亚型.氨基酸置换熵值计算共获得39个熵值＞0.6的位点.选取FEL和IFEL模型分析分别发现3个和4个正向选择位点,VP1的595位和3D区的1 999位为分析获得的共同氨基酸变异位点.结论 2014-2015年,上海地区流行的CVA6属于D7亚型,VP1区未出现显著的基因变异,应继续保持对上海地区CVA6的基因进化趋势研究并密切关注基因变异情况. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A6型 基因进化 选择压力
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H6N6亚型禽流感病毒进化演变及跨种属传播研究进展 被引量：7
18
作者 王熹婧 朱银川 +1 位作者 庞夏凤 张增峰 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期558-562,共5页
H6N6亚型禽流感病毒(AVI)在欧亚大陆野生鸟类和家禽中广泛流行,通过适应性突变和基因重配,其宿主范围逐渐扩大,遗传分析表明该病毒是高致病禽流感病毒H5N6的先祖之一.近年来研究证实,H6N6亚型AIV可以感染小鼠、雪雕、猪等哺乳动物,甚至... H6N6亚型禽流感病毒(AVI)在欧亚大陆野生鸟类和家禽中广泛流行,通过适应性突变和基因重配,其宿主范围逐渐扩大,遗传分析表明该病毒是高致病禽流感病毒H5N6的先祖之一.近年来研究证实,H6N6亚型AIV可以感染小鼠、雪雕、猪等哺乳动物,甚至在健康人群中检测到H6亚型AIV的血清特异性抗体,表明H6N6亚型禽流感病毒具有跨越物种屏障感染哺乳动物的能力,并对人类健康构成潜在威胁.本文从H6N6病毒起源、流行情况、进化演变及跨种属传播的研究进展进行综述,以期为H6N6亚型AIV的防控提供参考. 展开更多
关键词 H6N6亚型禽流感病毒 基因进化 跨种属传播 感染 哺乳动物 人
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大型集装箱起重机产品快速配置模型及算法 被引量：7
19
作者 许波桅 杨勇生 +1 位作者 李军军 任洪敏 《计算机集成制造系统》 EI CSCD 北大核心 2015年第5期1177-1186,共10页
为提高大型集装箱起重机产品设计的效率,提出面向快速设计的产品配置框架,构建了带约束的0-1规划基因进化模型,设计了一种基于改进蚁群的产品配置算法。模型中考虑了实例模板与客户需求的局部相似度、局部绿色特性满足度、配合亲和力等... 为提高大型集装箱起重机产品设计的效率,提出面向快速设计的产品配置框架,构建了带约束的0-1规划基因进化模型,设计了一种基于改进蚁群的产品配置算法。模型中考虑了实例模板与客户需求的局部相似度、局部绿色特性满足度、配合亲和力等。结合大型集装箱起重机产品配置设计特点,重新设计了蚁群算法的伪随机比例规则;针对备选基因实例数量往往较多的问题,提出一种备选基因实例数量减少机制;设计了一种x_Sigmoid函数,并按此函数调整转移概率,加快算法搜索速度;实施捕食策略,加强较优区域的开发,增强搜索能力。通过集装箱起重机大车机构配置设计实例,比较了不同算法的优化结果,验证了所提模型和算法的有效性。 展开更多
关键词 产品配置 快速设计 基因进化 蚁群算法
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北京地区2株人偏肺病毒的P和M蛋白基因序列分析 被引量：5
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作者 朱汝南 钱渊 +2 位作者 赵林清 邓洁 王芳 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期5-9,共5页
目的　进一步了解北京地区人偏肺病毒 (hMPV)编码基因的特征。方法　从分属于hMPV的两个不同基因进化簇 (即基因型 )的 2份临床标本BJ1816和BJ1887中扩增P和M全基因 ,克隆至pBS T载体中并进行测序 ,与GenBank中的hMPV的基因序列进行比... 目的　进一步了解北京地区人偏肺病毒 (hMPV)编码基因的特征。方法　从分属于hMPV的两个不同基因进化簇 (即基因型 )的 2份临床标本BJ1816和BJ1887中扩增P和M全基因 ,克隆至pBS T载体中并进行测序 ,与GenBank中的hMPV的基因序列进行比较分析和种系进化分析。结果　经扩增BJ1816和BJ1887的P基因全长为 885个核苷酸 ,编码 2 94个氨基酸 ;M基因全长 76 5个核苷酸 ,编码 2 5 4个氨基酸。BJ1816和BJ1887的P和M蛋白基因与同一基因簇内的hMPV有相当高的氨基酸同源性 (91.9%～ 10 0 % )。BJ1816和BJ1887间P基因的氨基酸同源性仅为 85 .8% ,而M基因的氨基酸同源性为 96 .9%。结论　BJ1816和BJ1887的P和M蛋白基因特征与其他国外文献中所报道的hMPV相似 ,不同型的hMPV的P基因之间比M基因显示了更强的基因多样性。 展开更多
关键词 M蛋白 人偏肺病毒 P基因 M基因 氨基酸同源性 扩增 基因序列分析 基因进化 T载体 基因簇
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