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中国少数民族传统聚落景观特征及其基因分析 被引量：87
1
作者 刘沛林 刘春腊 +3 位作者 李伯华 邓运员 申秀英 胡最 《地理科学》 CSCD 北大核心 2010年第6期810-817,共8页
对少数民族聚落景观进行研究具有理论探索和实践创新的双重意义。以景观基因的视角,将中国少数民族聚落景观的特征归纳为聚族而居、向心性强、自我防御、尊重环境等方面。并从景观要素基因、景观总体基因、原始图腾基因、标志性建筑基... 对少数民族聚落景观进行研究具有理论探索和实践创新的双重意义。以景观基因的视角,将中国少数民族聚落景观的特征归纳为聚族而居、向心性强、自我防御、尊重环境等方面。并从景观要素基因、景观总体基因、原始图腾基因、标志性建筑基因等方面对中国少数民族聚落景观基因进行了识别;同时,考虑到时空差异,从景观基因的地域差异性和变化性,对中国少数民族聚落景观基因进行了比较。 展开更多
关键词 传统聚落 少数民族 景观 基因分析 中国
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聚落“双修”视角下传统村落人居环境活化路径研究——以湖南省张谷英村为例 被引量：80
2
作者 李伯华 李珍 +1 位作者 刘沛林 窦银娣 《地理研究》 CSSCI CSCD 北大核心 2020年第8期1794-1806,共13页
传统村落是农耕文明的重要载体,维持传统村落人居环境的有效更新极为重要。以中国传统村落张谷英村为例,运用景观基因分析法分析了张谷英村显性物质文化景观基因与隐性非物质文化基因特征,从聚落"双修"视角提出了传统村落人... 传统村落是农耕文明的重要载体,维持传统村落人居环境的有效更新极为重要。以中国传统村落张谷英村为例,运用景观基因分析法分析了张谷英村显性物质文化景观基因与隐性非物质文化基因特征,从聚落"双修"视角提出了传统村落人居环境活化方案。研究结果显示:①显性景观基因特征为空间布局空心趋势明显,街巷系统衰退痕迹严重;民居建筑结构秩序紊乱,功能利用主体两极分化;主体建筑链条节点断裂,文明载体内涵挖掘尚浅;山川地势脉络根基平稳,水系网络线条渐趋单一;②隐性文化基因特征为家风信仰世代传承不息,图腾标志遥相呼应不止;民俗文化延续之途受阻,传统礼仪抗争之路临难;③显性基因修补路径为基因建库,恢复原始形态,完善基础系统;微创修补,保留原始功能,再现原真风貌;隐身挖掘,重接本土链条,夯实建筑内涵";低+高"干预,维持稳定脉络,调适单一线条;④隐性基因修复路径为内外熏陶,营造传承氛围,完善解说系统;置身其中,增强居民参与,再现特色场景。从聚落"双修"视角探索传统村落人居环境优化方案,其目的是在保留原有风貌的基础上实现有机更新,完成物质空间和非物质空间的转型发展,推动传统村落人居环境的可持续发展。 展开更多
关键词 聚落“双修” 传统村落 人居环境 活化路径 基因分析
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多重耐药阴沟肠杆菌流行状况及耐药机制的研究 被引量：62
3
作者 顾怡明 张杰 +2 位作者 俞云松 周志慧 杜小玲 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 2004年第12期1321-1324,共4页
目的了解多重耐药阴沟肠杆菌的流行状况及耐药机制。方法58株临床分离的对第三代头孢菌素耐药的阴沟肠杆菌进行琼脂稀释法药敏试验、表型筛选法和聚合酶链反应克隆测序。结果58株阴沟肠杆菌表型筛选结果显示,高产AmpC酶株、单产ESBLs株... 目的了解多重耐药阴沟肠杆菌的流行状况及耐药机制。方法58株临床分离的对第三代头孢菌素耐药的阴沟肠杆菌进行琼脂稀释法药敏试验、表型筛选法和聚合酶链反应克隆测序。结果58株阴沟肠杆菌表型筛选结果显示,高产AmpC酶株、单产ESBLs株和同时产AmpC酶和ESBLs株的检出率分别为65.52%、13.79%和20.69%;58株阴沟肠杆菌对多种抗菌药物耐药,高产AmpC酶菌株、单产ESBLs菌株和同时产AmpC酶和ESBLs菌株对头孢哌酮/舒巴坦的敏感率分别为55.3%、87.5%和16.7%;对哌拉西林/他唑巴坦的敏感率分别为28.9%、50%和8.3%;对头孢吡肟的敏感率分别为97.4%、37.5%和16.7%;对亚胺培南的敏感率均为100%;58株临床分离株ESBLs编码基因的测序结果显示,分别为SHV2、SHV2a、SHV12、CTXM14和CTXM3型ESBLs;58株临床分离株的ampD基因PCR扩增显示49株阳性,占84.48%,对其中8株进行克隆测序,均存在可疑的羧基端突变位点。结论产生AmpC酶和ESBLs是阴沟肠杆菌对头孢菌素耐药的主要机制。 展开更多
关键词 阴沟肠杆菌 AMPC酶 超广谱Β-内酰胺酶 耐药性 基因分析
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广州市某医院儿童秋冬季腹泻诺瓦克样病毒感染的分子流行病学研究 被引量：37
4
作者 刘翼 戴迎春 +5 位作者 姚英民 李建栋 詹惠春 陈清 俞守义 聂军 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期525-528,共4页
目的了解广州市某医院2003年秋冬季儿童腹泻中诺瓦克样病毒(NLVs)感染的流行病学特点及病毒的基因型.方法收集2003年10月至2004年1月临床诊断为病毒性腹泻而就诊的患儿粪便标本,采用引物JV12Y/JV13I进行逆转录-聚合酶链反应检测NLVs,阳... 目的了解广州市某医院2003年秋冬季儿童腹泻中诺瓦克样病毒(NLVs)感染的流行病学特点及病毒的基因型.方法收集2003年10月至2004年1月临床诊断为病毒性腹泻而就诊的患儿粪便标本,采用引物JV12Y/JV13I进行逆转录-聚合酶链反应检测NLVs,阳性标本的PCR产物经纯化、测序进行基因分析.结果收集的358份标本中检测出NLVs 42份,阳性率11.73%.3岁以下的婴幼儿阳性40例,占95.24%,其中6月龄～1岁组与1～2岁组阳性率最高,分别占38.10%、35.71%.年龄最小者只有25天龄.4个月中,11月阳性率最高为17.27%,其次是2004年1月、2003年10、12月,阳性率分别为15.79%、8.11%、11.36%.抽取11份阳性标本进行测序分析,结果5份为GⅡ-3群,5份为GⅡ-4群,1份为GⅡ型,但尚不确定所属群.随机抽取20份轮状病毒阳性标本检测NLVs,未发现合并感染.结论广州市某医院儿童腹泻的散发与NLVs感染有关,并且存在着不同的基因型,流行优势株为GⅡ-3群与GⅡ-4群的病毒株. 展开更多
关键词 分子流行病学研究 诺瓦克样病毒感染 广州市 秋冬季腹泻 医院 2004年1月 聚合酶链反应检测 2003年 流行病学特点 NLVs 儿童腹泻 阳性标本 病毒性腹泻 PCR产物 阳性率 粪便标本 临床诊断 基因分析 3岁以下 测序分析 标本检测
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数字PCR技术进展 被引量：40
5
作者 林彩琴 姚波 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2415-2423,共9页
数字PCR是近年来迅速发展起来的一种定量分析技术。与传统定量PCR技术不同的是数字PCR不依赖于扩增曲线的循环阈值(CT)进行定量,不受扩增效率的影响,也不必采用看家基因和标准曲线,具有很好的准确度和重现性,可以实现绝对定量分析。迄... 数字PCR是近年来迅速发展起来的一种定量分析技术。与传统定量PCR技术不同的是数字PCR不依赖于扩增曲线的循环阈值(CT)进行定量,不受扩增效率的影响,也不必采用看家基因和标准曲线,具有很好的准确度和重现性,可以实现绝对定量分析。迄今为止,已有Fluidigm、Bio-Rad等几家公司相继推出了数字PCR产品,这些产品已经在单细胞分析、癌症早期诊断和产前诊断等研究领域显示出巨大的技术优势和应用前景。本文在现有文献基础上,对数字PCR技术的基本原理和定量方法进行介绍,并对该技术的分类及其特点以及目前的主要应用领域进行评述。 展开更多
关键词 数字PCR 微流控芯片 基因分析
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1995年云南瑞丽HIV1毒株的基因变异和分析 被引量：36
6
作者 邵一鸣 管永军 +5 位作者 赵全壁 曾毅 张家鹏 张勇 段一娟 杨贵林 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第1期9-17,共9页
从１９９５年瑞丽静脉注射毒品者及其配偶２６人的血样中，经ＰＣＲ扩增细胞内ＨＩＶ基因并对其ｅｎｖＣ２－Ｖ３区进行测序，结果发现１８人为Ｂ亚型ＨＩＶ１，８人为Ｃ亚型ＨＩＶ１毒株。在瑞丽以Ｂ亚型毒株为主，与我们以往报告一致... 从１９９５年瑞丽静脉注射毒品者及其配偶２６人的血样中，经ＰＣＲ扩增细胞内ＨＩＶ基因并对其ｅｎｖＣ２－Ｖ３区进行测序，结果发现１８人为Ｂ亚型ＨＩＶ１，８人为Ｃ亚型ＨＩＶ１毒株。在瑞丽以Ｂ亚型毒株为主，与我们以往报告一致。Ｃ亚型毒株的出现曾有报导，我们进一步分析发现，Ｃ亚型毒株感染者多在１９９４和１９９５年被感染。根据其核苷酸序列测定的基因离散率（２．２５％），远小于Ｂ型毒株（６．７％），也说明它是近两年才在瑞丽流行的。Ｃ亚型毒株感染者明显聚集于城周，而Ｂ亚型毒株感染者均匀分布，提示其传染源的定向性。对它的可能来源文中进行了讨论。 展开更多
关键词 艾滋病毒 艾滋病毒1 毒株 基因变异 基因分析
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经输血传播病毒(TTV)在血液透析患者中感染状况及基因分析 被引量：39
7
作者 陈红松 丛旭 王宇 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 1998年第3期164-166,共3页
目的研究我国血液透析患者人群中经输血传播病毒(TTV)的感染及基因变异状况。方法设计特异性引物采用半巢式 PCR 方法对北京市2所综合性大医院50例血液透析患者血清标本进行 TTV DNA 的检测并将产物克隆及序列分析。结果经过半巢式 PCR... 目的研究我国血液透析患者人群中经输血传播病毒(TTV)的感染及基因变异状况。方法设计特异性引物采用半巢式 PCR 方法对北京市2所综合性大医院50例血液透析患者血清标本进行 TTV DNA 的检测并将产物克隆及序列分析。结果经过半巢式 PCR 检测,血透患者 TTV DNA 阳性率为14%。对其中4例标本中分离出的TTV 270个碱基核酸片段序列分析表明:基因同源性为99.1%～100%,推测的编码氨基酸序列同源性为100%。与国外报道的日本株比较,核苷酸同源性为88.3%～97.8%,推测的编码氨基酸同源性为96.1%～98.7%。TTV 阳性与阴性组转氨酶升高的患者比例差异无显著性。结论我国血透患者中存在较严重的 TTV 感染,其病毒部分基因及推测编码蛋白十分保守,但与日本所报道的 TTV 毒株有明显差别。未见 TTV 感染与转氨酶升高密切相关的证据。 展开更多
关键词 血液透析 基因分析 病毒 感染 输血传播病毒
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儿童地中海贫血的发生率及发病基因分析 被引量：35
8
作者 黄钰君 伍绍国 +2 位作者 区小冰 张力 余一平 《中国优生与遗传杂志》 2007年第6期28-31,共4页
目的调查广州地区儿童地中海贫血(地贫)的发生率及其中国人常见发病基因的分布特征。方法对4990例广州地区儿童进行以全自动凝胶电泳为主的地贫血液学检查,并利用以缺口PCR(gap-PCR)为原理的单管多重PCR方法、PCR结合反向斑点杂交(PCR-R... 目的调查广州地区儿童地中海贫血(地贫)的发生率及其中国人常见发病基因的分布特征。方法对4990例广州地区儿童进行以全自动凝胶电泳为主的地贫血液学检查,并利用以缺口PCR(gap-PCR)为原理的单管多重PCR方法、PCR结合反向斑点杂交(PCR-RDB)法分别对筛查出的287例患儿(其中α地贫103例、β地贫177例、α合并β7例)进行中国人常见发病基因的诊断分析。结果(1)在4990人中,检出α地贫427人,发生率为8.56%;检出β地贫562人,发生率为11.26%;α合并β7人,发生率为0.14%。(2)进行基因分析的110例α地贫(包括α合并β的7例)全部都是缺失型,其中东南亚缺失型(--SEA)占72.80%,右侧缺失型(-α3.7)占18.38%,左侧缺失型(-α4.2)占8.82%。进行基因分析的184例β地贫有181例得到确诊,共检出10种突变基因,22种基因型,最多见的前5种依次是:CD41-42(45.71%),IVS-Ⅱ-654(25.79%),CD17(14.03%),TATbox-28(8.15%),CD71-72(3.17%)。结论广州地区是国内α和β地贫发生率较高和β地贫基因背景最复杂的地区,在地贫高发区应加强对儿童人群进行地贫的血液学筛查和常见基因的诊断。 展开更多
关键词 地中海贫血 筛查 基因分析 儿童 广州
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肌肉生长抑制素基因的研究进展 被引量：23
9
作者 姜运良 连正兴 +1 位作者 李宁 吴常信 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期119-121,共3页
肌肉生长抑制素又称GDF 8,属TGF β 超家族,是骨骼肌生长的负调控因子。最早在小鼠中发现该基因的突变可导致骨骼肌肥大。随后的研究表明 ,肉牛的双肌现象也是该因子外显子311bp的碱基缺失或保守的单个碱基的突变所造成的。对人肌肉生... 肌肉生长抑制素又称GDF 8,属TGF β 超家族,是骨骼肌生长的负调控因子。最早在小鼠中发现该基因的突变可导致骨骼肌肥大。随后的研究表明 ,肉牛的双肌现象也是该因子外显子311bp的碱基缺失或保守的单个碱基的突变所造成的。对人肌肉生长抑制素基因的研究表明 ,它包括3个外显子和2个内含子 ,在人的骨骼肌中特异性地表达 ,产物为成熟糖蛋白。目前 ,该基因已分别在人、牛和猪的染色体上定位。猪的肌肉生长抑制素基因的表达在仔猪出生时显著下降 ,而且其表达在生后仔猪的乳腺中也可检测到。 展开更多
关键词 肌肉生长抑制素 TGF-Β超家族 基因分析
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广州地区儿童β地中海贫血的发生率及基因检测结果分析 被引量：32
10
作者 黄钰君 区小冰 +2 位作者 张力 余一平 伍绍国 《临床血液学杂志》 CAS 2006年第6期355-357,361,共4页
目的:调查广州地区儿童β地中海贫血(β地贫)的发生率及其中国人常见突变基因的分布特征。方法:对4990例广州地区儿童进行以全自动凝胶电泳为主的β地贫血液学检查,并利用PCR-RDB法对筛查出的其中177例患儿进行中国人常见18种突变基因... 目的:调查广州地区儿童β地中海贫血(β地贫)的发生率及其中国人常见突变基因的分布特征。方法:对4990例广州地区儿童进行以全自动凝胶电泳为主的β地贫血液学检查,并利用PCR-RDB法对筛查出的其中177例患儿进行中国人常见18种突变基因的诊断分析。结果:在4990人中检出β地贫562人,发生率为11.26%,其中β0地贫63人,发生率为1.26%,β+地贫499人,发生率为10.0%;进行基因分析的177例有174例得到确诊,共检出10种突变基因,22种基因型,最多见的前5种依次是:CD41-42(45.5%),IVS-Ⅱ-654(26.07%),CD17(13.74%),TATbox-28(8.06%),CD71-72(3.32%),表型中轻型占78.73%(137/174),中间型和重型占21.27%(37/174)。结论:广州地区是国内β地贫发生率较高和基因背景最复杂的地区,在β地贫高发区应加强对儿童人群进行β地贫的血液学筛查和常见基因的诊断。 展开更多
关键词 地中海贫血 筛查 基因分析 儿童 广州
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紫背天葵高通量转录组测序分析 被引量：30
11
作者 张少平 洪建基 +6 位作者 邱珊莲 郑云云 张帅 吴松海 何炎森 郑开斌 郑加协 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期935-946,共12页
为探讨紫背天葵(Gynura bicolor)花青素等物质合成的遗传基础,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq 2500)对其嫩叶进行转录组测序,共获得21 387 624个序列读取片段(reads),将测序数据进行序列组装后,获得33 314个单基因簇(Unigene),其中... 为探讨紫背天葵(Gynura bicolor)花青素等物质合成的遗传基础,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq 2500)对其嫩叶进行转录组测序,共获得21 387 624个序列读取片段(reads),将测序数据进行序列组装后,获得33 314个单基因簇(Unigene),其中超过1 kb的7 792个Unigene中共检测到2 387个SSR位点。对所得Unigene进行不同数据库注释,22 048和14 417个Unigene分别在Nr和Swiss Prot数据库有同源比对信息,并发现有29个Unigene与花青素合成相关;Pfam功能注释到13 909个Unigene分为5 198类相关蛋白功能区域,有12个Unigene涉及到花青素合成;GO注释到11 613个Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类51个功能组,有24个Unigene与花青素合成有关;COG注释到的6 589个Unigene功能系统分为24类,而KOG注释到的13 498个Unigene功能系统分为25类;以KEGG数据库为参考,将4 466个Unigene定位到108个代谢途径分支,其中有47个Unigene与类黄酮生物合成相关。 展开更多
关键词 紫背天葵 转录组 测序 基因分析 功能注释
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桂西南地区贫血儿童地中海贫血筛查及基因分析 被引量：28
12
作者 韦莹慧 韦建华 《中国妇幼保健》 CAS 北大核心 2010年第19期2740-2742,共3页
目的:了解桂西南地区地中海贫血(地贫)儿童的发生率及其地中海贫血常见发病基因的分布特征。方法:对756例贫血儿童采用血红蛋白电泳及肽链分析进行筛查,筛查阳性者用单管多重PCR技术及PCR扩增结合反向点杂交检测技术,分别进行α、β地... 目的:了解桂西南地区地中海贫血(地贫)儿童的发生率及其地中海贫血常见发病基因的分布特征。方法:对756例贫血儿童采用血红蛋白电泳及肽链分析进行筛查,筛查阳性者用单管多重PCR技术及PCR扩增结合反向点杂交检测技术,分别进行α、β地中海贫血基因诊断。结果:756例受检者中,筛查阳性243例(其中α地中海贫血152例,β地中海贫血91例);阳性者全部进行α、β地中海贫血基因诊断,检出α地中海贫血发生率为19.58%,96.62%为缺失型,以-SEA为主;3.38%为非缺失型,以HbCS多见。β地中海贫血检出率为11.24%,共检出10种突变类型18种组合,最多见的前5种依次是CD17M/N(42.35%),CD41-42M/N(24.71%),IVS-Ⅱ-654M/N(5.88%),βEM(4.71%),-28M/N(2.35%)。αβ复合型地中海贫血检出率为1.32%,以--SEA/β41-42为多见。结论:桂西南地区是国内α和β地中海贫血发生率较高和地中海贫血基因背景较复杂的地区,对被筛查出来的地中海贫血儿童对其生长、发育进行针对性监测,提供治疗、预后指导及长大成人后指导合理婚配,防止将其异常基因传给下一代具有重要的意义。 展开更多
关键词 地中海贫血 筛查 基因分析
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人脐带间充质干细胞生物学特性及其研究进展 被引量：23
13
作者 马锡慧 冯凯 石炳毅 《中国组织工程研究与临床康复》 CAS CSCD 北大核心 2011年第32期6064-6067,共4页
背景:人脐带间充质干细胞是一类具有自我更新和多向分化潜能的成体干细胞,具有来源丰富,对供者无影响,易于采集和运输,无异体排斥反应,避免伦理争议等诸多优点。目的:综述人脐带间充质干细胞的生物学特性及其应用进展。方法:以"人... 背景:人脐带间充质干细胞是一类具有自我更新和多向分化潜能的成体干细胞,具有来源丰富,对供者无影响,易于采集和运输,无异体排斥反应,避免伦理争议等诸多优点。目的:综述人脐带间充质干细胞的生物学特性及其应用进展。方法:以"人脐带间充质干细胞,生物学特征,基因分析,诱导分化,human umbilical cord mesenchymal stem cells(hUMSCs),biocharacteristics,gene analysis,induce differentiation"为关键词应用计算机检索CNKI数据库、万方数据库、PubMed数据库文章。结果与结论:人脐带间充质干细胞呈典型的成纤维状,其表达的表面标志抗原具有非单一性,高表达间质细胞标志、整合素受体,不表达造血系标志、协同刺激分子CD80、CD86和CD40、人白细胞抗原HLA-DR,HLA-G,HLA-DP,HLA-DQ、内皮标志CD31或CD33、CD14、CD56等。人脐带间充质干细胞与造血干细胞和胚胎干细胞类似,在体外可以分化为骨细胞、软骨细胞、肝细胞、心肌细胞等;在体内可以分化为多巴胺能神经元、骨骼肌细胞、内皮细胞、胰岛细胞等。但人脐带间充质干细胞的研究仍存在亟需解决的问题,如分离方法、培养条件的规范化,如何控制其生长和分化等。 展开更多
关键词 人脐带间充质干细胞 生物学特征 基因分析 诱导分化 干细胞
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甲基对硫磷水解酶基因的克隆与融合表达 被引量：13
14
作者 刘智 洪青 +6 位作者 徐剑宏 武俊 张晓舟 张小华 马爱芝 朱军 李顺鹏 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1020-1026,共7页
利用鸟枪法从甲基对硫磷降解菌DLL 1Peudomonasputida)中克隆了甲基对硫磷水解酶基因 (mpd)片段2 5kb ,并进行了测序。通过软件分析开放阅读框和启动子序列 ,表明该序列中最可能为甲基对硫磷水解酶结构基因的阅读框为 76 9～ 1 794区... 利用鸟枪法从甲基对硫磷降解菌DLL 1Peudomonasputida)中克隆了甲基对硫磷水解酶基因 (mpd)片段2 5kb ,并进行了测序。通过软件分析开放阅读框和启动子序列 ,表明该序列中最可能为甲基对硫磷水解酶结构基因的阅读框为 76 9～ 1 794区域。软件分析还表明该水解酶前端 4 5个氨基酸为典型的信号肽结构。通过PCR扩增了mpd结构基因 ,亚克隆到表达载体pET 32a中 ,构建了完整的融合表达载体pET MP。转化大肠杆菌BL2 1 (DE3) ,在IPTG的诱导下 2～ 4h甲基对硫磷水解酶表达可以达到最高水平 ;同时还研究了乳糖的诱导效果 ,2 %乳糖诱导 2h就可以起到很好的效果。通过PCR反应验证了mpd基因定位于DLL 展开更多
关键词 鸟枪法 甲基对硫磷水解酶基因 基因分析 融合表达 基因定位
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海洋产灵菌红素细菌的基因分析与鉴定 被引量：11
15
作者 陈月琴 周世宁 +2 位作者 戴欣 沈鹤琴 屈良鹄 《中山大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期115-117,共3页
报道了从大亚湾表面海水中分离到的１株海洋产灵菌红素细菌的分子鉴定结果．通过对该菌株１６ＳｒＲＮＡ基因的测定与分析，并与Ｇｅｎｂａｎｋ的数据进行比较，认为该菌属于假单胞菌属而不是色杆菌属．对于该菌株种的确定尚需进一步实... 报道了从大亚湾表面海水中分离到的１株海洋产灵菌红素细菌的分子鉴定结果．通过对该菌株１６ＳｒＲＮＡ基因的测定与分析，并与Ｇｅｎｂａｎｋ的数据进行比较，认为该菌属于假单胞菌属而不是色杆菌属．对于该菌株种的确定尚需进一步实验研究． 展开更多
关键词 灵菌红素细菌 分子鉴定 基因分析 海洋
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四川地区人群地中海贫血的筛查及基因分析 被引量：23
16
作者 王霞 江虹 +3 位作者 贾劲 周静 廖娟 左成华 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第1期135-137,共3页
对四川地区人群进行了地中海贫血的筛查和基因型分析。在本院体检的人群中应用血红蛋白电泳进行广泛地地贫表型分析,并对地贫表型阳性的病例进行基因检测。结果在3 185例受检者筛查出α地贫表型阳性者69例,β地贫表型阳性者115例。确诊... 对四川地区人群进行了地中海贫血的筛查和基因型分析。在本院体检的人群中应用血红蛋白电泳进行广泛地地贫表型分析,并对地贫表型阳性的病例进行基因检测。结果在3 185例受检者筛查出α地贫表型阳性者69例,β地贫表型阳性者115例。确诊为地贫者157例,其中α地贫53例,β地贫102例,α复合β地贫2例,阳性率分别为1.66%、3.20%、0.06%。可见,四川是地中海贫血高发省份之一。血红蛋白电泳是地贫筛查的重要方法,应用GAP-PCR和PCR-RDB技术可进行地贫基因型分析,二者结合可实现广泛的地贫筛查和诊断。 展开更多
关键词 地中海贫血 血红蛋白电泳 基因分析
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20株阴沟肠杆菌耐药性及氨基糖苷类修饰酶基因分析 被引量：21
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作者 黄支密 糜祖煌 +4 位作者 秦玲 陈榆 吴晶 仵蕾 单浩 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期428-431,共4页
目的　明确临床分离的2 0株阴沟肠杆菌耐药性及氨基糖苷类修饰酶基因存在状况。方法　采用ATB药敏试验板微量肉汤法测定临床分离的2 0株阴沟肠杆菌对2 0种抗菌药物的敏感性,采用聚合酶链反应及序列分析的方法分析氨基糖苷类修饰酶基因... 目的　明确临床分离的2 0株阴沟肠杆菌耐药性及氨基糖苷类修饰酶基因存在状况。方法　采用ATB药敏试验板微量肉汤法测定临床分离的2 0株阴沟肠杆菌对2 0种抗菌药物的敏感性,采用聚合酶链反应及序列分析的方法分析氨基糖苷类修饰酶基因型。结果　该2 0株菌呈现多重耐药,对亚胺培南和美罗培南均敏感,对阿莫西林、阿莫西林 克拉维酸、头孢噻吩和头孢西丁完全耐药,对头孢吡肟及4种氨基糖苷类抗生素阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素和奈替米星的耐药率分别为2 5 .0 %、6 0 .0 %、85 .0 %、90 .0 %和90 .0 % ,其余9种的耐药率在80 .0 %～95 .0 %之间。19株(95 .0 % )检出氨基糖苷类修饰酶基因;aac(6′) -Ⅰ、aac(3) - Ⅱ、ant(3″) -Ⅰ、ant(2″) -Ⅰ和aph(3′) Ⅵ基因的阳性率分别为80 .0 %、5 0 .0 %、4 0 .0 %、5 .0 %和5 .0 % ;而aac(3) -Ⅰ、aac(3) - Ⅲ、aac(3) -Ⅳ和aac(6′)- Ⅱ基因均阴性。结论　临床分离的阴沟肠杆菌多重耐药严重,氨基糖苷类修饰酶基因携带率很高。 展开更多
关键词 阴沟肠杆菌 耐药性 氨基糖苷类修饰酶 基因分析 聚合酶链反应
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国内养殖鱼类和进境鱼卵中传染性造血器官坏死病毒(IHNV)的检测及基因分析 被引量：20
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作者 刘荭 范万红 +5 位作者 史秀杰 陈超 吕建强 何俊强 高隆英 江育林 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期544-549,共6页
用传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)的反转录聚合酶链及该方法在来自国内养殖场的患病牙鲆和虹鳟及进口的匙吻鲟鱼卵中检测出IHNV,同时对扩增出的IHNV的DNA片段进行了序列分析。结果表明,从国内养殖的牙鲆和虹鳟中分离出的IHNV与IHNV的... 用传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)的反转录聚合酶链及该方法在来自国内养殖场的患病牙鲆和虹鳟及进口的匙吻鲟鱼卵中检测出IHNV,同时对扩增出的IHNV的DNA片段进行了序列分析。结果表明,从国内养殖的牙鲆和虹鳟中分离出的IHNV与IHNV的标准株RB-1株在序列上都具有98.1%的同源性,推导出在氨基酸序列上分别具有97%和99%的同源性。从进口匙吻鲟鱼卵中分离的IHNV与RB-1株在序列上都具有92.5%的同源性,推导出氨基酸序列有93%的同源性。系统发育树分析结果表明,从国内发病的养殖虹鳟中分离出的IHNV与进口匙吻鲟鱼卵中检测到的IHNV在进化上关系较为密切。 展开更多
关键词 传染性造血器官坏死病毒 检测 基因分析
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广州地区儿童α地中海贫血的发生率及缺失基因检测结果分析 被引量：21
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作者 黄钰君 区小冰 +1 位作者 余一平 张力 《中国小儿血液》 2005年第5期205-208,共4页
目的调查广州地区儿童α地中海贫血(α地贫)的发生率及其常见缺失型基因的分布特征。方法对4990例广州地区儿童进行以全自动凝胶电泳为主的α地贫血液学检查,并利用以缺口PCR(gap—PCR)为原理的单管多重PCR方法对筛查出的其中103例患儿... 目的调查广州地区儿童α地中海贫血(α地贫)的发生率及其常见缺失型基因的分布特征。方法对4990例广州地区儿童进行以全自动凝胶电泳为主的α地贫血液学检查,并利用以缺口PCR(gap—PCR)为原理的单管多重PCR方法对筛查出的其中103例患儿进行常见的三种缺失型基因诊断分析。结果在4990人中检出α地贫427人,发生率为8.56%,其中,H病68人,发生率为1.36%,占α地贫的17.53%,通过HbBarts诊断的α地贫128人,占α地贫的32.99%。进行基因分析的103例全部都是缺失型,其中东南亚缺失型(--SEA)占72.87%,右侧缺失型(-α3.7)占18.60%,左侧缺失型(-α4.2)占8.53%;具体基因型分布为:--SEA/αα70例,--SEA/-α3.719例,--SEA/-α4.2和α/-α3.7各5例,αα/-α4.2和-α4.2/-α4.2各2例。结论在α地贫高发区,应加强对儿童人群进行α地贫的血液学筛查和常见基因的诊断。 展开更多
关键词 地中海贫血 筛查 基因分析 儿童 广州
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山西某县农村外来嫁入女性及配偶中HIV感染者病毒序列特征分析 被引量：19
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作者 邢辉 卫军 +3 位作者 马鹏飞 乔晓春 全宇 邵一鸣 《中国艾滋病性病》 CAS 2007年第2期101-103,113,共4页
目的分析山西省某县农村外来嫁入女性及配偶中感染艾滋病病毒(HIV)的毒株分布和传染源,为制定有效的艾滋病防治措施提供科学依据。方法采集17名感染HIV的农村外来妇女及这些外来妇女的4例阳性配偶的外周血,提取前病毒DNA,应用套式PCR进... 目的分析山西省某县农村外来嫁入女性及配偶中感染艾滋病病毒(HIV)的毒株分布和传染源,为制定有效的艾滋病防治措施提供科学依据。方法采集17名感染HIV的农村外来妇女及这些外来妇女的4例阳性配偶的外周血,提取前病毒DNA,应用套式PCR进行艾滋病病毒gag基因检测,使用GCG软件包对扩增序列进行分析,并对这些HIV感染者进行相关流行病学调查。结果在送检的21份HIV确认阳性的样本中,共获得18份gag基因序列。基于gag基因区的序列分析结果表明:其中13份为CRF01 AE亚型(占72.2%),1份为B’亚型(占5.6%),2份为B’/C重组型(占11.1%),1份为C亚型(占5.6%),另有1例样本不确定。B’/C重组与新报告的云南瑞丽发现的B/C重组亚型相似性最大。18份样本中有3对为HIV双阳性的夫妻,系统树分析表明,每对夫妻感染毒株在系统树上聚在一起,处于一个分支,彼此间的基因距离均很小(0.007～0.009),推测为近期的家庭内传染。结论山西以往的HIV感染者的主要来源为采供血途径,近年外来高危人口的大量输入,已是山西HIV感染人群的重要毒株来源,使该地区的流行毒株从单一型向多样化发展,并已有家庭内传播的发生。这种形式使该省艾滋病的防控工作更加复杂,今后外来高危人口应纳入当地省艾滋病疫情的重点监测对象,降低传播情况的发生。 展开更多
关键词 艾滋病病毒 基因分析 外来女性
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