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地方土猪源副猪嗜血杆菌Omp P2基因的分子鉴定及遗传演化分析 被引量:1
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作者 常洪涛 王新卫 +5 位作者 刘慧敏 赵军 陈陆 杨霞 姚惠霞 王川庆 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期371-374,共4页
为研究地方土猪源副猪嗜血杆菌(Hps)的分子遗传演化特性,应用PCR方法扩增淮南猪源河南分离株XY0501的Omp P2基因,并进行序列比较和遗传演化分析。结果显示,XY0501的Omp P2基因序列全长为1080bp,编码359 aa;与参考菌株的核苷酸序列同... 为研究地方土猪源副猪嗜血杆菌(Hps)的分子遗传演化特性,应用PCR方法扩增淮南猪源河南分离株XY0501的Omp P2基因,并进行序列比较和遗传演化分析。结果显示,XY0501的Omp P2基因序列全长为1080bp,编码359 aa;与参考菌株的核苷酸序列同源性为96.7%~99.4%,与4型、5型和12型参考菌株的核苷酸序列同源性分别为96.9%~97.4%、96.7%~99.4%和97.1%~99.1%;基因进化树显示与血清5型参考菌株FJ685760亲缘关系最近,同源性高达99.4%。研究结果证明,该分离菌株属于血清5型;Hps可感染地方猪种并导致发病,但其来源则有待进一步研究;Omp P2基因在Hps国内优势流行血清型中高度保守,而且这种高保守性并无明显品种差异;不同地域的Hps分离菌株存在一定的遗传差异。 展开更多
关键词 地方 嗜血杆菌 OMP P2基因 PCR 分子鉴定 遗传演化分析
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地方土猪脑心肌炎病毒的分离、鉴定及全基因组序列分析
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作者 常洪涛 刘慧敏 +6 位作者 贺秀媛 赵军 陈陆 王新卫 杨霞 姚惠霞 王川庆 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期375-381,共7页
脑心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus,EMCV)是一种自然疫源性人兽共患病病原,但有关地方土猪EMCV的分离、鉴定及全基因组研究等尚未见报道。本研究应用"细胞接种与RT-PCR方法相结合"技术,成功分离到国内首株淮南猪源EMCV,命名... 脑心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus,EMCV)是一种自然疫源性人兽共患病病原,但有关地方土猪EMCV的分离、鉴定及全基因组研究等尚未见报道。本研究应用"细胞接种与RT-PCR方法相结合"技术,成功分离到国内首株淮南猪源EMCV,命名为HNXX13株,并对其进行了系统鉴定和全基因组序列测定分析。结果显示,该病毒粒子大小约为24~30nm,呈圆形,不耐酸和热,对胰蛋白酶敏感,对氯仿不敏感,二价阳离子没有保护作用,所感染BHK-21细胞的细胞浆内可见到特异的绿色荧光;基因组全长为7 725bp(GenBank登录号:KF771002),与不同动物源参考毒株的核苷酸同源性为81.0%~99.9%,与国内猪源参考毒株同源性为99.5%以上;基于全基因组序列和ORF的系统发育进化树显示,EMCV可分为G1、G2和G3 3个群,HNXX13株与国内其他参考毒株同属于G1群。研究结果表明,地方土猪可感染EMCV并引起发病,丰富了我国EMCV分子流行病学资料,并提醒在进行地方品种养殖中要充分考虑人兽共患疫病传播的生态学;EMCV存在较大的地域差异,其传播具有一定的区域限制性;EMCV在地方土猪和鼠之间可能存在着交叉感染与传播;EMCV在感染地方土猪时可能会发生个别氨基酸的突变,以适应不同的猪种。 展开更多
关键词 脑心肌炎病毒 地方 RT-PCR 全基因组 分子特征分析
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地方土猪源副猪嗜血杆菌16SrRNA基因的分子鉴定及遗传进化分析 被引量:4
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作者 常洪涛 刘慧敏 +7 位作者 杜季梅 陈陆 赵军 王新卫 姚惠霞 杨霞 李鸿雁 王川庆 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第11期157-160,共4页
为研究地方土猪源副猪嗜血杆菌(Haemophilusparasuis,Hps)的分子遗传进化特性,应用PCR方法扩增河南地方分离株XY0501的16SrRNA基因,并进行遗传进化分析。结果显示,地方土猪源Hps的16SrRNA基因全长为822bp,与国内外参考菌株的核... 为研究地方土猪源副猪嗜血杆菌(Haemophilusparasuis,Hps)的分子遗传进化特性,应用PCR方法扩增河南地方分离株XY0501的16SrRNA基因,并进行遗传进化分析。结果显示,地方土猪源Hps的16SrRNA基因全长为822bp,与国内外参考菌株的核苷酸序列同源性为97.1%~99.3%;与血清5型参考菌株的核苷酸序列同源性高达99.3%;基于16SrRNA基因序列绘制的系统进化树显示,地方土猪源Hps与血清5型Hps参考株属于同一分支。研究结果证明,Hps可感染地方土猪并导致发病,感染来源有待进一步查明;16SrRNA基因在Hps的不同血清型中高度保守,且无品种差异。 展开更多
关键词 嗜血杆菌 地方源菌株 PCR 16S RRNA 分子进化
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不同猪源副猪嗜血杆菌河南分离株16S rRNA基因的遗传进化分析 被引量:1
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作者 常洪涛 刘慧敏 +5 位作者 陈陆 杨霞 赵军 姚惠霞 王新卫 王川庆 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2015年第9期7-9,共3页
为研究来自河南省不同猪源的副猪嗜血杆菌(Hps)的遗传演化关系,应用PCR方法扩增所分离的良种猪源、家养野猪源和地方土猪源等3株Hps(KF0901、JZ0801和XY0501)的16S r RNA基因,并进行序列比较分析。结果 3株Hps的16S r RNA基因全长均... 为研究来自河南省不同猪源的副猪嗜血杆菌(Hps)的遗传演化关系,应用PCR方法扩增所分离的良种猪源、家养野猪源和地方土猪源等3株Hps(KF0901、JZ0801和XY0501)的16S r RNA基因,并进行序列比较分析。结果 3株Hps的16S r RNA基因全长均为822 bp,彼此间核苷酸序列同源性为99.3%~99.6%,与参考菌株的核苷酸序列同源性为97.1%~99.4%;基于16S r RNA基因序列绘制的系统进化树显示,本研究中家养野猪源Hps和地方土猪源Hps均属于血清5型,而良种猪源血清5型Hps却与血清12型和血清14型的亲缘关系更近。表明Hps在良种猪、家养野猪和地方土猪之间彼此交叉感染或具有共同来源;并非所有血清5型Hps分离株都属同一分支。 展开更多
关键词 嗜血杆菌 良种源、家养野源和地方源菌株 PCR 16S RRNA 分子演化
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