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禾本科植物β-淀粉酶基因家族分子进化及响应非生物胁迫的表达模式分析 被引量：5
1
作者 杨泽峰 徐暑晖 +2 位作者 王一凡 张恩盈 徐辰武 《科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第31期29-36,共8页
β-淀粉酶(beta-amylase,BAM)是一类关键的淀粉水解酶,在禾谷类作物生长发育过程中起着重要作用,与植物多种非生物胁迫响应相关。本研究通过系统发育分析,将水稻、玉米、高粱、谷子、二穗短柄草5种禾本科植物中共54个BAM基因分为10个同... β-淀粉酶(beta-amylase,BAM)是一类关键的淀粉水解酶,在禾谷类作物生长发育过程中起着重要作用,与植物多种非生物胁迫响应相关。本研究通过系统发育分析,将水稻、玉米、高粱、谷子、二穗短柄草5种禾本科植物中共54个BAM基因分为10个同源基因簇,每个同源基因簇都涵盖了这5个物种,因此推测在禾本科祖先物种中至少含有10个BAM基因,并且在禾本科植物分化后没有发生明显的基因丢失事件。基于对编码蛋白质序列的功能分化分析,表明同源基因簇间存在明显的进化速率的差异。对10个同源基因簇进行了适应性进化检测,发现有3个同源簇在禾本科植物的进化过程中经历了适应性进化。此外,对水稻β-淀粉酶的表达分析发现,一些β-淀粉酶具有组织特异性表达特征,并且至少有5个水稻的β-淀粉酶基因具有受到非生物逆境的胁迫而表现出不同的表达模式。本研究结果为进一步探讨禾本科BAM基因的生物学功能提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 Β-淀粉酶 同源基因簇 功能分化 正选择作用
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禾本科植物ITPK基因的进化分析
2
作者 陈志阳 刘嘉欣 《农村经济与科技》 2020年第6期34-36,共3页
1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶(ITPK)是植物磷酸肌醇代谢过程中一种重要的蛋白激酶,在植物感受细胞外刺激和信号转导中起着重要作用。同源性搜索表明在禾本科植物水稻、二穗短柄草、高粱、谷子和玉米基因组中分别具有6、5、6、7和6个ITPK基... 1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶(ITPK)是植物磷酸肌醇代谢过程中一种重要的蛋白激酶,在植物感受细胞外刺激和信号转导中起着重要作用。同源性搜索表明在禾本科植物水稻、二穗短柄草、高粱、谷子和玉米基因组中分别具有6、5、6、7和6个ITPK基因;系统发育分析发现5个禾本科物种的祖先中至少存在6个ITPK基因。对6个同源基因簇进行适应性进化分析后发现,有1个同源簇经历了适应性进化。研究结果为进一步研究ITPK基因在禾本科植物中的生物学功能提供了借鉴。 展开更多
关键词 1 3 4-三磷酸肌醇5/6-激酶 同源基因簇 系统发育 适应性进化
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同源盒基因A簇及其与白血病的关系研究进展
3
作者 郭巍伟 刘文君 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期219-221,共3页
同源盒基因(HOX)是一类控制胚胎发育和细胞分化的调节基因,参与造血干/祖细胞的增殖、分化、成熟等的调控。HOX基因A簇是造血干/祖细胞增殖分化的主控基因,可影响造血干细胞的数量,参与造血干细胞向红系、粒系、巨核系与淋巴系的分化,... 同源盒基因(HOX)是一类控制胚胎发育和细胞分化的调节基因,参与造血干/祖细胞的增殖、分化、成熟等的调控。HOX基因A簇是造血干/祖细胞增殖分化的主控基因,可影响造血干细胞的数量,参与造血干细胞向红系、粒系、巨核系与淋巴系的分化,并可能是导致白血病发病的靶基因。现就有关HOX基因A簇及其与白血病的关系研究进展综述如下。 展开更多
关键词 同源盒基因簇 造血干/祖细胞 白血病
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LncRNA HOTTIP调节miR-615/IGF2分子轴促进肺癌细胞增殖和侵袭的实验研究 被引量：5
4
作者 高雪峰 余旭辉 +1 位作者 张锐 余力 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2021年第6期493-498,共6页
目的探讨长链非编码RNA同源异型基因簇A远端转录本(lncRNA HOTTIP)对肺癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及可能机制。方法体外培养A549细胞,构建HOTTIP敲降载体、miR-615 inhibitor转染A549细胞,分为空白对照组、阴性对照组、HOTTIP shRNA... 目的探讨长链非编码RNA同源异型基因簇A远端转录本(lncRNA HOTTIP)对肺癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及可能机制。方法体外培养A549细胞,构建HOTTIP敲降载体、miR-615 inhibitor转染A549细胞,分为空白对照组、阴性对照组、HOTTIP shRNA组、HOTTIP shRNA+无序序列组、HOTTIP shRNA+miR-615 inhibit表达ors组。采用MTT、Transwell、免疫荧光法检测下调HOTTIP表达对A549细胞增殖、侵袭和迁移的影响。采用双荧光素酶报告实验检测lncRNA HOTTIP、miR-615及IGF2的靶向调控关系。采用实时荧光定量PCR(qPCR)和Western blotting检测HOTTIP、miR-615和IGF的表达量。结果A549细胞中HOTTIP相对表达量为1.74±0.08,高于BEAS-2B细胞的1.00±0.05(P<0.001)。HOTTIP shRNA组,HOTTIP相对表达量为0.43±0.04,低于空白对照组和阴性对照组(P<0.05)。下调HOTTIP表达后,A549细胞增殖、侵袭和迁移活性低于空白对照组(P<0.05),细胞凋亡率相应增加(P<0.05)。双荧光素酶报告实验证实HOTTIP靶向作用miR-615,而miR-615可负调控IGF2的表达。HOTTIP shRNA组细胞miR-615表达量高于空白对照组,IGF2 mRNA表达量低于阴性对照组,而HOTTIP shRNA+miR-615 inhibitors组IGF2 mRNA和蛋白表达量较HOTTIP shRNA组升高(P<0.05)。结论敲除A549细胞中lncRNA HOTTIP表达后可通过上调miR-615并下调IGF2进而抑制肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭活性。 展开更多
关键词 肺癌 长链非编码RNA(lncRNA) 同源异型基因簇A远端转录本(HOTTIP) miR-615/IGF-2分子轴 侵袭 迁移
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lncRNA HAGLR促卵巢癌细胞生长和上皮-间充质转化的机制研究
5
作者 李俊 王晓黎 +1 位作者 俞岩 周俏苗 《局解手术学杂志》 2024年第6期491-496,共6页
目的研究长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA(lncRNA HAGLR)通过调控核苷酸结合寡聚化结构域样受体家族pyrin结构域蛋白3(NLRP3)炎症小体对卵巢癌细胞生长和上皮-间充质转化(EMT)的调控作用。方法培养卵巢正常细胞IOS... 目的研究长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA(lncRNA HAGLR)通过调控核苷酸结合寡聚化结构域样受体家族pyrin结构域蛋白3(NLRP3)炎症小体对卵巢癌细胞生长和上皮-间充质转化(EMT)的调控作用。方法培养卵巢正常细胞IOSE-80(IOSE-80组)以及卵巢癌细胞A2780(A2780组)。然后将A2780随机分为lncRNA HAGLR沉默组(siHAGLR组)、沉默阴性对照组(siNC组)、siHAGLR联合NLRP3抑制剂MCC950处理组(siHAGLR+MCC950组)。qRT-PCR法检测lncRNA HAGLR的表达。Western blot检测NLRP3炎症小体相关蛋白NLRP3、caspase-1、ASC和EMT相关蛋白Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1的表达。CCK-8法检测A2780细胞的增殖活性。Transwell法检测A2780细胞的迁移和侵袭能力。细胞克隆形成实验检测A2780细胞的生长能力。TUNEL染色检测A2780细胞的凋亡。结果与IOSE-80组相比,A2780组lncRNA HAGLR、Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均上调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均下调(P<0.05)。与siNC组相比,siHAGLR组的lncRNA HAGLR、Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均下调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均上调(P<0.05),细胞增殖率、细胞克隆数以及迁移和侵袭数均明显减少(P<0.05),细胞凋亡数则增加(P<0.05)。与siHAGLR组相比,siHAGLR+MCC950组的lncRNA HAGLR表达无明显变化(P>0.05),而Vimentin、Snail1、α-SMA、Twist1表达均上调(P<0.05),但NLRP3、caspase-1、ASC的表达均下调(P<0.05),细胞增殖率、细胞克隆数以及迁移和侵袭数均显著增加(P<0.05),细胞凋亡数则减少(P<0.05)。结论lncRNA HAGLR通过抑制NLRP3炎症小体促进卵巢癌细胞的生长和EMT。 展开更多
关键词 长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA 核苷酸结合寡聚化结构域样受体家族pyrin结构域蛋白3 炎症小体 卵巢癌细胞 上皮-间充质转化
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过表达lncRNA HAGLR促胫骨骨折大鼠骨髓间充质干细胞成骨分化的机制研究
6
作者 王文 陈新宇 +2 位作者 黄兹艺 邓杨柳 崔红旺 《局解手术学杂志》 2024年第6期472-478,共7页
目的研究骨质疏松(OP)-胫骨骨折(TF)大鼠长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA(lncRNA HAGLR)与其下游靶基因的表达情况,并探讨lncRNA HAGLR对大鼠骨髓间充质干细胞(MSC)成骨分化的作用与机制。方法30只SD雌性大鼠随机... 目的研究骨质疏松(OP)-胫骨骨折(TF)大鼠长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA(lncRNA HAGLR)与其下游靶基因的表达情况,并探讨lncRNA HAGLR对大鼠骨髓间充质干细胞(MSC)成骨分化的作用与机制。方法30只SD雌性大鼠随机分为sham组、OP组、OP-TF组,每组10只。ELISA法检测大鼠血清碱性磷酸酶(ALP)和抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP)的水平。对大鼠MSC细胞系R7500使用成骨分化诱导培养基进行诱导,并分为MSC组和成骨诱导组(Osteogenic-MSC组)。分别转染pcDNA-HAGLR、pcDNA-NC、miR-19a-3p的模拟物(miR-19a-3p mimic)、mimic的阴性对照(NC mimic)、miR-19a-3p的抑制剂(miR-19a-3p inhibitor)、miR-19a-3p inhibitor的阴性对照(NC inhibitor)至R7500后进行相应分组。双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA HAGLR和miR-19a-3p以及骨形态发生蛋白2(BMP2)和miR-19a-3p的靶向关系。qRT-PCR检测各组lncRNA HAGLR和miR-19a-3p的表达。Western blot检测BMP2、ALP、胶原蛋白I(COL-I)、骨钙素(OCN)、骨桥蛋白(OPN)的表达。ALP染色和AR染色检测MSC的成骨分化能力。结果OP组和OP-TF组的血清ALP和TRAP水平均高于sham组,差异有统计学意义(P<0.05)。而OP组与sham组胫骨组织中lncRNA HAGLR、miR-19a-3p、BMP2的表达水平比较差异均无统计学意义(P>0.05),而OP-TF组胫骨组织中lncRNA HAGLR、BMP2的表达水平均明显低于sham组和OP组(P<0.05),OP-TF组胫骨组织中miR-19a-3p的表达水平高于sham组和OP组(P<0.05)。与MSC组相比,Osteogenic-MSC组的lncRNA HAGLR表达水平明显升高(P<0.05),而miR-19a-3p的表达降低(P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验表明lncRNA HAGLR与miR-19a-3p具有靶向关系,miR-19a-3p与BMP2具有靶向关系。pcDNA-HAGLR组的miR-19a-3p的表达水平低于pcDNA-NC组(P<0.05)。miR-19a-3p mimic组与NC mimic组的lncRNA HAGLR的表达水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。与NC mimic组相比,miR-19a-3p mimic组BMP2的表达水平降低(P<0.05),miR-19a-3p表 展开更多
关键词 骨质疏松 胫骨骨折 长链非编码RNA同源盒D基因簇反义生长相关长链非编码RNA miR-19a-3p 骨形态发生蛋白2 成骨分化
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LncRNA HAGLR激活RUNX2并抑制NLRP3炎症小体对胫骨骨折愈合的影响 被引量：2
7
作者 王文 陈新宇 +2 位作者 黄兹艺 邓杨柳 崔红旺 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第5期830-837,共8页
目的研究长链非编码RNA(LncRNA)HAGLR对胫骨骨折(TF)小鼠的NOD样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体表达和骨折愈合的影响并探讨机制。方法体外对成骨细胞MC3T3-E1沉默HAGLR,CCK-8法检测细胞活力,TUNEL法检测细胞凋亡,qPCR法检测骨碱性磷酸酶(BA... 目的研究长链非编码RNA(LncRNA)HAGLR对胫骨骨折(TF)小鼠的NOD样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体表达和骨折愈合的影响并探讨机制。方法体外对成骨细胞MC3T3-E1沉默HAGLR,CCK-8法检测细胞活力,TUNEL法检测细胞凋亡,qPCR法检测骨碱性磷酸酶(BALP)和骨钙素的表达。Western blot法检测RUNX2、磷酸化RUNX2(p-RUNX2)以及NLRP3、半胱天冬酶1(Caspase1)、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、白细胞介素-1β(IL-1β)的表达。通过小鼠TF手术建立TF小鼠模型,在模型小鼠体内过表达HAGLR,并在过表达HAGLR的基础上沉默RUNX2或加入炎症小体抑制剂MCC950。qPCR法检测HAGLR和RUNX2的表达,Western blot法检测胰岛素样生长因子-1(IGF-1)的表达。microCT测量小鼠骨痂体积(MBV),称量小鼠的全长胫骨湿重。结果沉默HAGLR导致MC3T3-E1细胞活力降低且凋亡率增加(P<0.05),且RUNX2、p-RUNX2、BALP和骨钙素表达量均降低(P<0.05),NLRP3、Caspase1、ASC、IL-1β的表达量都增加(P<0.05)。与健康组织比较,TF小鼠体内HAGLR和RUNX2表达量降低(P<0.05)。过表达HAGLR促进TF小鼠体内的HAGLR和RUNX2表达,并增加MBV和全长胫骨湿重以及IGF-1的表达量(P<0.05)。在过表达HAGLR的基础上沉默RUNX2导致TF小鼠的MBV、全长胫骨湿重和IGF-1表达量都降低(P<0.05)。而在过表达HAGLR的基础上加入NLRP3炎症小体抑制剂MCC950导致MBV、全长胫骨湿重和IGF-1表达又增加(P<0.05)。结论LncRNA HAGLR通过激活RUNX2并抑制NLRP3炎症小体促进TF的愈合。 展开更多
关键词 胫骨骨折 同源框D基因簇反义生长相关的长非编码RNA Runt相关转录因子2 NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3 炎症小体
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长链非编码RNA同源异型基因簇A远端转录本在肿瘤中的研究进展 被引量：1
8
作者 路井校 张杰 +1 位作者 苏阳 林方优 《医学综述》 2018年第3期465-470,501,共6页
长链非编码RNA(lncRNA)是一种转录本长度超过200个核苷酸,没有蛋白质编码功能的特殊RNA分子。长期以来,lncRNA被当作基因组的"垃圾序列",但随着研究的不断深入,人们发现lncRNA广泛参与细胞的生物学过程。lncRNA与多种恶性肿... 长链非编码RNA(lncRNA)是一种转录本长度超过200个核苷酸,没有蛋白质编码功能的特殊RNA分子。长期以来,lncRNA被当作基因组的"垃圾序列",但随着研究的不断深入,人们发现lncRNA广泛参与细胞的生物学过程。lncRNA与多种恶性肿瘤的发生、发展密切相关。而同源异型基因簇A远端转录本(HOTTIP)属于lncRNAs中的一种,其在多种恶性肿瘤中异常表达,所以了解HOTTIP在调节肿瘤细胞生命活动中的具体作用具有十分重要的意义。对其在肿瘤细胞发生、发展中的潜在分子机制进行分析,可为今后肿瘤的预防和治疗提供新思路。 展开更多
关键词 肿瘤 长链非编码RNA 同源异型基因簇A远端转录本 机制
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血清长链非编码RNA及HOTTIP在乳腺癌中的表达及新辅助化疗疗效的相关性研究
9
作者 缪志明 耿峰 +2 位作者 江飞 刘阳 沈祥 《临床和实验医学杂志》 2021年第15期1628-1632,共5页
目的探讨乳腺癌新辅助化疗患者血清长链非编码RNA(LncRNA HOTAIR)及同源异型基因簇A远端转录本(HOTTIP)的表达以及在化疗疗效预测中的价值。方法前瞻性选取在苏州大学附属张家港医院行新辅助化疗的46例乳腺癌患者作为研究组,另外收集40... 目的探讨乳腺癌新辅助化疗患者血清长链非编码RNA(LncRNA HOTAIR)及同源异型基因簇A远端转录本(HOTTIP)的表达以及在化疗疗效预测中的价值。方法前瞻性选取在苏州大学附属张家港医院行新辅助化疗的46例乳腺癌患者作为研究组,另外收集40例同院健康体检的正常人群作为对照组。采用反转录-实时定量聚合酶链式反应检测2组研究对象血清中LncRNA HOTAIR及HOTTIP的表达,并分析研究组中LncRNA HOTAIR及HOTTIP的表达与年龄、肿瘤大小、淋巴结情况、TMN分期,激素受体表达、HER-2表达的关系,并在3~4个化疗周期后评估其化疗疗效,采用受试者工作特征(ROC)曲线对LncRNA HOTAIR及HOTTIP的疗效预测效能进行评价。结果研究组血清LncRNA HOTAIR、HOTTIP的表达水平(2.58±1.32、3.52±1.50)较对照组表达水平(1.59±0.89、1.91±1.33)均显著增高,差异均有统计学意义(P<0.05)。高表达的外周血清乳腺癌的HOTAIR与肿瘤大小相关(P<0.05),与年龄、淋巴结是否转移、TNM分期、激素受体表达、HER-2表达无明显相关性(P>0.05);血清高表达HOTTIP与肿瘤分期有关(P<0.05),与年龄、肿瘤大小、淋巴结是否转移、激素受体表达、HER-2表达无明显相关性(P>0.05)。乳腺癌患者新辅助化疗后,化疗有效组22例,无效组24例,有效率47.8%。化疗有效组患者血清HOTAIR表达水平(2.18±1.32)明显低于化疗无效组(2.94±1.23),差异有统计学意义(P<0.05),而化疗有效组(3.10±1.46)与化疗无效组(3.90±1.47)患者的血清HOTTIP表达差异无统计学意义(P>0.05)。血清LncRNA HOTAIR单独预测化疗疗效的AUC、敏感度和特异度分别为0.688、59.1%、79.2%,血清LncRNA HOTTIP单独预测化疗疗效的AUC、敏感度和特异度分别为0.641、72.7%、70.8%,2者联合后的AUC、敏感度和特异度分别为0.708、60.5%、87.5%。结论血清LncRNA HOTAIR和HOTTIP在乳腺癌患者中高表达,2者联合可以作为乳腺癌新辅助化疗疗效的潜在 展开更多
关键词 乳腺癌 新辅助化疗 长链非编码RNA 同源异型基因簇A远端转录本 疗效
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