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担子菌类食用菌交配型位点结构的研究进展 被引量:26
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作者 鲍大鹏 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2061-2077,共17页
大多数可栽培的食用菌是属于担子菌的大型真菌,具有复杂的交配型系统,通常涉及到两类交配型基因,即编码同源域转录因子的A交配型基因以及编码脂肽信息素和信息素受体的B交配型基因。对担子菌交配型系统的研究已经有上百年的历史,近年来... 大多数可栽培的食用菌是属于担子菌的大型真菌,具有复杂的交配型系统,通常涉及到两类交配型基因,即编码同源域转录因子的A交配型基因以及编码脂肽信息素和信息素受体的B交配型基因。对担子菌交配型系统的研究已经有上百年的历史,近年来随着高通量测序技术的发展,很多常见食用菌的基因组获得测序,使得我们对不同类型交配型位点的分子遗传学结构能够进行更加细致的解析。本文在概述了担子菌有性生殖系统和交配型基因分子特点的基础上,对常见食用菌中的香菇、金针菇、灵芝、糙皮侧耳、刺芹侧耳、白灵侧耳、裂褶菌、双孢蘑菇、草菇和虎皮香菇以及模式生物灰盖鬼伞等物种的交配型位点的结构进行了总结和分析。从已有的研究结果来看,常见食用菌的交配型位点的分子遗传学结构存在多样性,不同物种的交配型位点具有不同的结构特点。从物种内不同菌株之间的交配型结构比较来看,交配型基因的位置和数量也具有丰富的多样性。在分子遗传学层面对常见食用菌交配型位点结构的认识将有助于深入阐明交配型基因对子实体发育的调控以及解决食用菌生产实际中的科学问题,但是目前对食用菌交配型位点和基因的研究仍旧存在很多空白,有待于进一步深入和拓展。 展开更多
关键词 同源转录因子 信息素受体 信息素前体 交配型
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PITX1基因在肺腺癌中的表达及临床预后意义 被引量:1
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作者 张卫东 《临床与病理杂志》 CAS 2021年第4期742-747,共6页
目的:探讨同源域转录因子1(paired like homeodomain 1,PITX1)基因在肺腺癌组织和正常组织中的表达水平及其与临床病理特征和预后之间的相关性。方法:综合利用肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和基因表达数据库(Gene... 目的:探讨同源域转录因子1(paired like homeodomain 1,PITX1)基因在肺腺癌组织和正常组织中的表达水平及其与临床病理特征和预后之间的相关性。方法:综合利用肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的GSE130779和GSE85841数据集,分析PITX1基因在肺腺癌患者癌组织及癌旁组织中的表达水平,并利用实时荧光定量PCR法在40例肺腺癌患者组织中验证PITX1基因的表达水平。同时利用COX回归分析PITX1基因与肺腺癌患者的总生存期(overall survival,OS)和无复发生存期(recurrence-free survival,RFS)之间的相关性,进而分析其表达水平与肺腺癌患者临床病理特征之间的相关性。结果:基于TCGA和GEO数据库分析结果显示PITX1基因在肺腺癌组织中显著高表达(P<0.01),实时荧光定量PCR结果显示PITX1基因在肺腺癌组织的表达量显著高于癌旁正常组织(P<0.001),其相对表达量分别为1.064±0.077和0.641±0.044。COX回归分析显示PITX1基因的表达水平与肺腺癌患者的TNM分期、淋巴结转移状态和肿瘤大小显著相关(均P<0.05)。同时,上调PITX1的表达水平与肺腺癌患者的OS和RFS呈负相关。结论:PITX1基因在肺腺癌组织中显著高表达,且与肺腺癌患者的预后显著相关。 展开更多
关键词 同源转录因子1 肺腺癌 预后 表达
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PITX1、miR-556-3p在乳腺癌肝转移中的表达研究
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作者 杨硕 郭满 张浩 《医学研究杂志》 2022年第11期72-76,81,共6页
目的探究垂体同源框配对同源域转录因子1(pituitary homeobox paired homeodomain transcription 1,PITX1)、miR-556-3p在乳腺癌肝转移中的表达。方法以2019年6月~2021年6月在笔者医院诊治的142例乳腺癌患者为研究对象,其中64例乳腺癌... 目的探究垂体同源框配对同源域转录因子1(pituitary homeobox paired homeodomain transcription 1,PITX1)、miR-556-3p在乳腺癌肝转移中的表达。方法以2019年6月~2021年6月在笔者医院诊治的142例乳腺癌患者为研究对象,其中64例乳腺癌肝转移患者为转移组,78例未发生肝转移患者为未转移组。采用免疫组化法检测PITX1表达。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测组织中PITX1mRNA、miR-556-3p的表达量。Pearson相关性分析PITX1与miR-556-3p的关系。多因素Logistic回归分析影响乳腺癌患者发生肝转移的危险因素。ROC曲线分析PITX1、miR-556-3p对乳腺癌患者发生肝转移的预测价值。结果乳腺癌肝转移组和未转移组患者TNM分期、淋巴结转移、组织学分级、病理类型比较,差异有统计学意义(P<0.05)。转移组患者PITX1阳性表达率32.81%显著低于未转移组65.38%(P<0.05)。与未转移组比较,转移组患者组织PITX1mRNA水平显著降低(P<0.05),miR-556-3p水平显著升高(P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,PITX1与miR-556-3p呈显著负相关(r=-0.436,P<0.001)。多因素Logistic回归分析显示,组织学分级3~4级、PITX1阴性是乳腺癌患者发生肝转移的危险因素(P<0.05)。受试者工作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线结果显示,PITX1、miR-556-3p联合预测乳腺癌患者发生肝转移的曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.926(敏感度为90.6%,特异性为82.1%)。结论PITX1、miR-556-3p在乳腺癌肝转移患者中表达异常,二者与肝转移的发生存在密切关系,且对乳腺癌患者发生肝转移具有一定的预测价值。 展开更多
关键词 垂体同源框配对同源转录因子1 miR-556-3p 乳腺癌肝转移
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心房颤动相关4q25基因座单核苷酸多态性的研究进展 被引量:1
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作者 王骏 张代富 《国际心血管病杂志》 2014年第3期143-145,共3页
随着全基因组关联研究的发展,近年陆续报道了与心房颤动(房颤)可能相关的基因座,其中以染色体4q25上单核苷酸多态序列rs2200733的关联性最强,而与之毗邻的成对同源构造域转录因子2(PITX2)基因也成为重要的房颤候选基因。该文主要对与房... 随着全基因组关联研究的发展,近年陆续报道了与心房颤动(房颤)可能相关的基因座,其中以染色体4q25上单核苷酸多态序列rs2200733的关联性最强,而与之毗邻的成对同源构造域转录因子2(PITX2)基因也成为重要的房颤候选基因。该文主要对与房颤相关的4q25基因座单核苷酸多态性及与之相毗邻的PITX2基因研究进展作一介绍,旨在为房颤分子生物学研究提供新的视野。 展开更多
关键词 心房颤动 成对同源构造转录因子2 基因 单核苷酸多态性
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