为探明双孢蘑菇培养料发酵过程中细菌群落多样性和组成的演变,获得相关优势菌落的信息,本研究利用变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)对不同季节不同发酵阶段样品的的细菌进行特异性扩增,并选取主要DNA条...为探明双孢蘑菇培养料发酵过程中细菌群落多样性和组成的演变,获得相关优势菌落的信息,本研究利用变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)对不同季节不同发酵阶段样品的的细菌进行特异性扩增,并选取主要DNA条带进行克隆、测序和生物信息学分析。结果显示,不同发酵时期带谱差异明显。发酵过程中,培养料中主要有芽孢杆菌属、黄杆菌属、杆菌属、假单胞菌属、Solibacillus、嗜热裂孢菌属、高温双歧菌属和未知分类地位的不可培养细菌。不同季节(春季、冬季)的培养料一次发酵过程中细菌多样性变化趋势相似,且发酵结束时细菌菌落结构相似。双孢蘑菇培养料在发酵过程中细菌群落结构至少经历了3个阶段的演替,即建堆初期、一次发酵阶段和二次发酵阶段。双孢蘑菇培养料发酵过程中细菌种群丰富,并随着发酵的不同阶段发生演替,种群多样性受环境温度的影响。双孢蘑菇培养料发酵过程中一直存在的细菌群落与具有木质纤维素降解特性细菌的序列相似度较高,有利于培养料转化为双孢蘑菇栽培基质。展开更多
为了解贵州省部分鸭场环境中细菌群落结构多样性概况,试验采用变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术对贵州省三穗县8个鸭场24份水样样本中细菌群落组成和优势菌群进行分析,并建立DGGE指纹图谱,细菌16S r DNA V3区特异性片段经DGGE凝胶分离...为了解贵州省部分鸭场环境中细菌群落结构多样性概况,试验采用变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术对贵州省三穗县8个鸭场24份水样样本中细菌群落组成和优势菌群进行分析,并建立DGGE指纹图谱,细菌16S r DNA V3区特异性片段经DGGE凝胶分离、切胶、测序及Quantity One软件分析。结果表明：共有30条特异性条带,测序可见17条条带归属于变形菌门（Proteobacteria）细菌种属,3条条带属于厚壁菌门（Firmicutes）细菌种属,2条条带属于酸杆菌门（Acidobacteria）细菌种属,另外有8条条带未确定细菌种属。DGGE图谱可见条带5,11,12出现在1~6号鸭场水样样本中,表明该细菌种属为1~6号鸭场的优势菌属;而条带1,2,3均出现在1~8号鸭场水样样本中,表明这三种细菌种属均为8个鸭场的优势细菌种属。说明应用PCR-DGGE技术能够客观反映出鸭场环境中真实的细菌群落结构信息,鸭场环境中微生物多样性十分丰富。展开更多
文摘为探明双孢蘑菇培养料发酵过程中细菌群落多样性和组成的演变,获得相关优势菌落的信息,本研究利用变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)对不同季节不同发酵阶段样品的的细菌进行特异性扩增,并选取主要DNA条带进行克隆、测序和生物信息学分析。结果显示,不同发酵时期带谱差异明显。发酵过程中,培养料中主要有芽孢杆菌属、黄杆菌属、杆菌属、假单胞菌属、Solibacillus、嗜热裂孢菌属、高温双歧菌属和未知分类地位的不可培养细菌。不同季节(春季、冬季)的培养料一次发酵过程中细菌多样性变化趋势相似,且发酵结束时细菌菌落结构相似。双孢蘑菇培养料在发酵过程中细菌群落结构至少经历了3个阶段的演替,即建堆初期、一次发酵阶段和二次发酵阶段。双孢蘑菇培养料发酵过程中细菌种群丰富,并随着发酵的不同阶段发生演替,种群多样性受环境温度的影响。双孢蘑菇培养料发酵过程中一直存在的细菌群落与具有木质纤维素降解特性细菌的序列相似度较高,有利于培养料转化为双孢蘑菇栽培基质。
文摘为了解贵州省部分鸭场环境中细菌群落结构多样性概况,试验采用变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术对贵州省三穗县8个鸭场24份水样样本中细菌群落组成和优势菌群进行分析,并建立DGGE指纹图谱,细菌16S r DNA V3区特异性片段经DGGE凝胶分离、切胶、测序及Quantity One软件分析。结果表明：共有30条特异性条带,测序可见17条条带归属于变形菌门（Proteobacteria）细菌种属,3条条带属于厚壁菌门（Firmicutes）细菌种属,2条条带属于酸杆菌门（Acidobacteria）细菌种属,另外有8条条带未确定细菌种属。DGGE图谱可见条带5,11,12出现在1~6号鸭场水样样本中,表明该细菌种属为1~6号鸭场的优势菌属;而条带1,2,3均出现在1~8号鸭场水样样本中,表明这三种细菌种属均为8个鸭场的优势细菌种属。说明应用PCR-DGGE技术能够客观反映出鸭场环境中真实的细菌群落结构信息,鸭场环境中微生物多样性十分丰富。
