期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到3篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
基于统计特征的酶蛋白质中特殊模体βαβ的预测 被引量：3
1
作者 宋航宇 胡秀珍 +2 位作者 冯振兴 姜卓 孙利霞 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期658-668,共11页
酶类是蛋白质中的重要组成部分,对其结构和功能的研究有重要的生物学意义。因此,作者对酶类蛋白质中的复杂超二级结构βαβ模体进行了统计分析和预测。建立了包含1141个酶蛋白质的βαβ模体数据库,通过统计分析,确定以loop-α-loop长1... 酶类是蛋白质中的重要组成部分,对其结构和功能的研究有重要的生物学意义。因此,作者对酶类蛋白质中的复杂超二级结构βαβ模体进行了统计分析和预测。建立了包含1141个酶蛋白质的βαβ模体数据库,通过统计分析,确定以loop-α-loop长10~26个氨基酸的βαβ模体为研究对象,以离散增量值、残基间的相互作用信息、预测的二级结构信息和矩阵打分值为特征参数,使用随机森林算法对βαβ模体进行预测,5交叉检验预测总精度为84.7%,相关系数达到0.686。将相同特征参数输入到支持向量机算法中,比较后发现随机森林算法得到的预测结果较好。 展开更多
关键词 βαβ模体 随机森林算法 氨基酸残基相互作用 离散增量值 矩阵打分值
原文传递
基于组合的序列特征识别蛋白质复杂超二级结构βαβ模体
2
作者 孙利霞 胡秀珍 +1 位作者 李少波 李昆 《内蒙古工业大学学报（自然科学版）》 2015年第3期177-183,共7页
从已知蛋白质结构的氨基酸序列出发,利用DSSP和PROMTIF构建了蛋白质复杂超二级结构strand-loop-helix-loop-strand模体数据集。数据集含1458条蛋白质链,其中βαβ模体数为3632个,非βαβ模体数为3148个。将亲疏水组分、优化的位点氨... 从已知蛋白质结构的氨基酸序列出发,利用DSSP和PROMTIF构建了蛋白质复杂超二级结构strand-loop-helix-loop-strand模体数据集。数据集含1458条蛋白质链,其中βαβ模体数为3632个,非βαβ模体数为3148个。将亲疏水组分、优化的位点氨基酸组分、预测的模体信息和二级结构信息共同作为序列特征输入支持向量机,5交叉检验的预测总精度和马氏相关系数达到了79.7%和0.59;独立检验的预测总精度和马氏相关系数达到了73.4%和0.47。 展开更多
关键词 βαβ模体 SVM算法 位点氨基酸 亲疏水组分 超二级结构
下载PDF
蛋白质βαβ模体序列的统计分析及其识别
3
作者 姜雪 《昆明理工大学学报（理工版）》 CAS 北大核心 2010年第5期83-88,93,共7页
通过对相似性小于33%的1 423个蛋白质的βαβ模体序列的统计分析,选取了适合的序列固定模式长.用矩阵打分的方法,以氨基酸出现的频数为参数,识别了βαβ模体.并用自恰和独立检验两种方法对算法进行了检验,均获得了较好的识别效果.
关键词 βαβ模体 统计分析 打分函数 蛋白质结构
下载PDF
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部