期刊文献+
共找到86篇文章
< 1 2 5 >
每页显示 20 50 100
黄海北部不同站位海洋细菌群落分布特征 被引量:47
1
作者 白洁 李海艳 赵阳国 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期343-350,共8页
【目的】为揭示北黄海不同海域中真细菌群落分布的差异,【方法】采用16SrRNA基因文库和变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,对远海和近海两个站位的沉积物和水体中细菌群落特征进行了解析和评价。【结果】文库分析揭示海水及沉积物中微生物种... 【目的】为揭示北黄海不同海域中真细菌群落分布的差异,【方法】采用16SrRNA基因文库和变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术,对远海和近海两个站位的沉积物和水体中细菌群落特征进行了解析和评价。【结果】文库分析揭示海水及沉积物中微生物种类丰富,存在大量未被认知的类群。各站位中主要为变形菌门(Proteobacteria),沉积物中γ-Proteobacteria和δ-Proteobacteria亚门占优势,水中则以α-Proteobacteria亚门占优势,但各亚门微生物在两个站位中存在明显系统发育学分歧。DGGE图谱聚类分析显示,近海沉积物和海水中细菌群落优势类群相似性很高,而远海沉积物和海水中则相似性很低。【结论】研究结果表明,微生物种类在不同地理位置和生存介质中存在明显差异,环境因素对微生物的分布起主导作用。 展开更多
关键词 北黄海 16S RRNA 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 变形菌门
原文传递
宝天曼落叶阔叶林土壤细菌多样性 被引量:31
2
作者 赵爱花 杜晓军 +2 位作者 臧婧 张守仁 焦志华 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期649-657,共9页
土壤微生物在森林生态系统中起着重要作用。高通量测序方法的出现为进一步认识土壤微生物提供了契机。本文利用Illumina Miseq高通量测序技术对宝天曼森林土壤的细菌多样性进行了初步研究。结果显示:在31个采样点内,随着采样点增加,检... 土壤微生物在森林生态系统中起着重要作用。高通量测序方法的出现为进一步认识土壤微生物提供了契机。本文利用Illumina Miseq高通量测序技术对宝天曼森林土壤的细菌多样性进行了初步研究。结果显示:在31个采样点内,随着采样点增加,检测出不同分类水平的土壤细菌类群也在增多,当采样点达到31个时,检测出的土壤细菌类群达到45门163纲319目495科785属和42,632个OTU;31个土壤样品中所检测出的细菌类群平均有34.2门114.7纲215.2目323.7科446.6属5,924.7个OTU,其中门、纲、目分类水平上的优势类群(所占比例)分别为变形菌门(Proteobacteria)(38.30%)、α-变形菌纲(α-Proteobacteria)(18.08%)、根瘤菌目(Rhizobiales)(10.62%)。这些初步研究结果表明在一定程度上宝天曼森林土壤有较高的细菌多样性水平,为进一步认识森林土壤细菌多样性与植物多样性关系等奠定了基础。 展开更多
关键词 森林 土壤微生物 细菌多样性 高通量测序 变形菌门 α-变形菌纲 根瘤菌目 宝天曼国家级自然保护区
原文传递
变形菌门与哺乳动物结肠肠道菌群失调相关研究进展 被引量:29
3
作者 郭仕辉 余永涛 +5 位作者 万佳宏 毛彦妮 张浩东 张津慎 田新岳 赵清梅 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2022年第4期479-484,共6页
随着微生物组测序技术的发展,哺乳动物肠道内复杂的微生物群落组成逐渐被人们所了解。越来越多的证据表明哺乳动物结肠肠道微生物组成变化是影响宿主健康的主要因素,而结肠肠道菌群失调通常伴随着变形菌门丰度的升高。变形菌门是胃肠道... 随着微生物组测序技术的发展,哺乳动物肠道内复杂的微生物群落组成逐渐被人们所了解。越来越多的证据表明哺乳动物结肠肠道微生物组成变化是影响宿主健康的主要因素,而结肠肠道菌群失调通常伴随着变形菌门丰度的升高。变形菌门是胃肠道中一类适应性强、具有潜在致病性的常见菌,其丰度变化可直接对宿主健康产生影响。本文就哺乳动物结肠肠道菌群失调过程中变形菌门丰度升高的微生物特征进行综述,旨在深入了解结肠肠道菌群失调过程中变形菌门丰度变化的驱动因素,以期为哺乳动物肠道菌群失调相关疾病的诊治提供新思路。 展开更多
关键词 变形菌门 肠道菌群 结肠上皮细胞 肠道失调
原文传递
云南4处酸性热泉中的变形菌门细菌多样性 被引量:27
4
作者 宋兆齐 王莉 +1 位作者 刘秀花 梁峰 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期376-382,共7页
选择云南腾冲和龙陵地区的4处酸性热泉(pH:2.3—6.0,温度:47~96℃),通过Barcoded pyrosequencing技术及统计学分析,详细阐述了这些样点中变形菌门的物种和遗传多样性。本研究共获得了2489条变形菌门16SrRNA基因序列,可划分为... 选择云南腾冲和龙陵地区的4处酸性热泉(pH:2.3—6.0,温度:47~96℃),通过Barcoded pyrosequencing技术及统计学分析,详细阐述了这些样点中变形菌门的物种和遗传多样性。本研究共获得了2489条变形菌门16SrRNA基因序列,可划分为234个可操作分类单元(OTUs)。分类结果显示,热泉内涵盖了大量已知的目、科和属。而41%的OTUs可能代表了变形菌门的未知物种。系统发育分析显示,样点中存在着若干全新遗传类群,这些样点和美国黄石地区的热泉各自呈现不同的变形菌门遗传多样性。此外,本次调查的热泉彼此间存在着变形菌门群落结构的显著差异。 展开更多
关键词 变形菌门 多样性 系统发育分析 酸性热泉 云南
下载PDF
黄海西北部沉积物中细菌群落16S rDNA多样性解析 被引量:23
5
作者 白洁 李海艳 +1 位作者 张健 赵阳国 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1277-1284,共8页
为揭示黄海西北部海域不同站位沉积物中细菌群落的多样性,采用16SrDNA文库技术,对黄海西北部辽东半岛和山东半岛近岸5个站位的沉积物中不同季节的细菌群落特征进行解析和评价.结果表明,沉积物中微生物种类丰富,主要分布于5~10个已知的... 为揭示黄海西北部海域不同站位沉积物中细菌群落的多样性,采用16SrDNA文库技术,对黄海西北部辽东半岛和山东半岛近岸5个站位的沉积物中不同季节的细菌群落特征进行解析和评价.结果表明,沉积物中微生物种类丰富,主要分布于5~10个已知的门,另外还存在大量未被认知的序列;各站位沉积物中优势菌均为变形细菌门,占文库序列的46%~60%,其中γ-和δ-变形细菌纲为门中优势类群,但在各个站位中存在明显系统发育学分歧.微生物种群在不同地理区域和季节都存在明显差异,不同功能类群与其特殊生境密切相关. 展开更多
关键词 沉积物 细菌群落 16S rDNA多样性 变形细菌门
下载PDF
应用DGGE分析三疣梭子蟹养殖塘底泥细菌的多样性 被引量:21
6
作者 钱丽君 张德民 徐小红 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期204-210,共7页
将传统的菌落菌体形态分类方法与分子生物学方法相结合研究了三疣梭子蟹养殖塘底泥中一个细菌类群的多样性。首先采用平板稀释法对三疣梭子蟹养殖塘底泥中的细菌进行分离与纯化,根据各菌株的菌落形态特征初步将118株分离物分为8个类群,... 将传统的菌落菌体形态分类方法与分子生物学方法相结合研究了三疣梭子蟹养殖塘底泥中一个细菌类群的多样性。首先采用平板稀释法对三疣梭子蟹养殖塘底泥中的细菌进行分离与纯化,根据各菌株的菌落形态特征初步将118株分离物分为8个类群,其中最大的一个类群的菌落基本特征为圆形、边缘整齐、表面凸起、菌落有光泽,对该类群的细菌多样性分析表明,通过芽孢染色可将产芽孢菌和不产芽孢菌区分开,不产芽孢菌根据其菌体形态又分为3个亚群,其中卵圆形细菌是最大的一个亚群,共有16株。应用PCR-DGGE方法对该类群进行菌株的遗传多样性分析。结果表明,卵圆形类群16株细菌中就有11株不同系统发育型的细菌。最后,将这11株细菌进行了16S rDNA部分序列(约750bp)的测定,并做系统发育学分析,结果显示,这些细菌的系统发育学地位相距很远,分属于γ-Proteobacteria、α-Proteobacteria和Firmicutes等类群。试验结果表明,以菌落特征的差异来挑选不同的菌株作为分析细菌多样性的第一个筛选步骤,会大大低估可培养异养细菌的多样性。 展开更多
关键词 三疣梭子蟹 异养细菌 16S RDNA 变性梯度胶电泳 变形菌门
下载PDF
不同干扰方式对喀斯特生态系统土壤细菌优势类群—变形菌群落的影响 被引量:21
7
作者 陈香碧 苏以荣 +4 位作者 何寻阳 覃文更 魏亚伟 梁月明 吴金水 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期354-363,共10页
以喀斯特原生林为对照,运用16S rRNA基因的PCR-RFLP和测序技术对该区不同人为干扰方式下土壤细菌的群落结构进行了分析。结果显示,4个样地中变形菌占总克隆子数的41.3%,是研究区土壤中的优势细菌类群。与原生林地相比较,受人为干扰的生... 以喀斯特原生林为对照,运用16S rRNA基因的PCR-RFLP和测序技术对该区不同人为干扰方式下土壤细菌的群落结构进行了分析。结果显示,4个样地中变形菌占总克隆子数的41.3%,是研究区土壤中的优势细菌类群。与原生林地相比较,受人为干扰的生态系统土壤中变形菌明显减少,自然恢复地、农耕地和放牧+冬季火烧草地减少了30.2%~47.4%。自然恢复地、放牧+冬季火烧草地与原生林地土壤中变形菌的4个亚群丰度分布关系一致,均为α->δ->β->γ-变形菌,而农耕地则为δ->α->β->γ-变形菌,说明自然恢复和放牧+冬季火烧草地对喀斯特土壤变形菌的恢复作用有限,而对变形菌4个亚群之间的分布关系有明显的正效应,尤其是自然恢复地中α-变形菌得到了很好的恢复,较农耕地增加了130%。四个样地中,占总克隆子数16.5%的克隆子被归类为根瘤菌目,且以原生林地最多,是3个干扰样地的1.6~3.7倍。基于以上研究结果,未来可考虑种植本土固氮植物结合接种相应的固氮微生物作为恢复喀斯特退化生态系统的措施之一。 展开更多
关键词 喀斯特 人为干扰 16S RRNA 变形菌
下载PDF
Impact of disinfection on drinking water biofilm bacterial community 被引量:17
8
作者 Zilong Mi Yu Dai +2 位作者 Shuguang Xie Chao Chen Xiaojian Zhang 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2015年第11期200-205,共6页
Disinfectants are commonly applied to control the growth of microorganisms in drinking water distribution systems. However, the effect of disinfection on drinking water microbial community remains poorly understood. T... Disinfectants are commonly applied to control the growth of microorganisms in drinking water distribution systems. However, the effect of disinfection on drinking water microbial community remains poorly understood. The present study investigated the impacts of different disinfectants(chlorine and chloramine) and dosages on biofilm bacterial community in bench-scale pipe section reactors. Illumina MiS eq sequencing illustrated that disinfection strategy could affect both bacterial diversity and community structure of drinking water biofilm. Proteobacteria tended to predominate in chloraminated drinking water biofilms, while Firmicutes in chlorinated and unchlorinated biofilms. The major proteobacterial groups were influenced by both disinfectant type and dosage. In addition, chloramination had a more profound impact on bacterial community than chlorination. 展开更多
关键词 Drinking water distribution systems Disinfection Microbial community High-throughput sequencing Firmicutes proteobacteria
原文传递
亚硝酸细菌研究进展 被引量:12
9
作者 周娟 李君文 郑金来 《环境科学与技术》 CAS CSCD 2001年第z2期8-10,共3页
从硝化细菌的生长特性 ,分类 ,检测 ,亚硝酸细菌氨单加氧酶等方面概要的叙述了国外在硝化细菌方面研究的进展 。
关键词 亚硝酸细菌 变形菌 多聚酶链式反应 氨单加氧酶
下载PDF
FISH技术解析不同氨氮浓度MBR中的微生物群落结构 被引量:17
10
作者 杨小丽 周娜 +3 位作者 陈明 张瑞 宋海亮 傅大放 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第2期380-385,共6页
为了探究膜生物反应器(MBR)中微生物群落结构与硝化作用的内在关系,采用荧光原位杂交技术(FISH)对不同氨氮浓度的MBR系统中微生物种群进行检测,考察变形菌(Proteobac-teria)、放线菌(Actinobacteria)、黄杆菌(Cytophaga-flexibacter-bac... 为了探究膜生物反应器(MBR)中微生物群落结构与硝化作用的内在关系,采用荧光原位杂交技术(FISH)对不同氨氮浓度的MBR系统中微生物种群进行检测,考察变形菌(Proteobac-teria)、放线菌(Actinobacteria)、黄杆菌(Cytophaga-flexibacter-bacteroides)、绿弯菌(Chloroflexi)、硝化细菌(Nitrobacter sp.)和氨氧化细菌(Ammonia-oxidizing bacteria)占总细菌的相对含量.结果表明:进水氨氮浓度分别为35,3.47和100 mg/L的MBR系统中,变形菌分别占总细菌的51%,44%和39%,氨氧化细菌与硝化细菌之和分别占总细菌的28%,4%和43%.在氨氮浓度较低的MBR中,检测到大量丝状β-变形菌,同时放线菌和绿弯菌也有所增加.高氨氮负荷有利于氨氧化细菌和硝化细菌的生长富集,并使其在系统中成为优势种群.相关性分析表明,氨氧化细菌、硝化细菌与氨氮去除呈显著正相关. 展开更多
关键词 膜生物反应器 荧光原位杂交 微生物群落结构 变形菌 氨氧化细菌 硝化细菌
下载PDF
青岛汇泉湾海洋趋磁细菌多样性研究 被引量:14
11
作者 邢素娥 潘红苗 +2 位作者 朱开玲 肖天 吴龙飞 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期312-317,共6页
在青岛汇泉湾沿岸沉积物中发现了大量海洋趋磁细菌,最大丰度可达10~5个/cm^3。透射电镜观察发现该菌菌体形态多样,有球形或卵球形、长短杆状、弧状和螺旋状,其中球形或卵球形趋磁细菌占绝对优势。电镜观察还发现该菌磁小体的排列方式多... 在青岛汇泉湾沿岸沉积物中发现了大量海洋趋磁细菌,最大丰度可达10~5个/cm^3。透射电镜观察发现该菌菌体形态多样,有球形或卵球形、长短杆状、弧状和螺旋状,其中球形或卵球形趋磁细菌占绝对优势。电镜观察还发现该菌磁小体的排列方式多样化,大多数呈链状排列,有单链、双链及多链,还有的呈环状或者成簇排列。磁小体的形态也多种多样,有正方体、棱柱体、立方八面体、子弹头状、片状和齿状。用 RFLP 方法分析了70个克隆测序,得到10条不同序列。经16S rRNA 系统发育分析,发现9个属于α-变形菌亚纲,1个属于γ-变形菌亚纲,共有8个不同的属,优势种属于未培养的海洋趋磁球菌。所有菌株与最接近的海洋趋磁球菌的相似性并不高(76.4%~89.4%),表明该海区的趋磁细菌为新发现的微生物资源。 展开更多
关键词 海洋趋磁球菌 多样性 磁小体 16S rRNA序列分析 变形菌纲 青岛汇泉湾
下载PDF
秋、冬季刺参养殖池塘菌群的多样性分析 被引量:12
12
作者 窦妍 丁君 +4 位作者 曲凌云 刘志敏 王轶南 穆晓虎 常亚青 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期143-148,共6页
以黄海和渤海代表性刺参养殖池塘秋、冬季海水和沉积物基因组DNA为模板,以细菌16S r DNA通用引物进行PCR扩增,构建16S r DNA文库并进行测序分析,研究了秋、冬季刺参养殖池塘菌群的多样性。结果表明:海水和沉积物中主要包括11个门类的细... 以黄海和渤海代表性刺参养殖池塘秋、冬季海水和沉积物基因组DNA为模板,以细菌16S r DNA通用引物进行PCR扩增,构建16S r DNA文库并进行测序分析,研究了秋、冬季刺参养殖池塘菌群的多样性。结果表明:海水和沉积物中主要包括11个门类的细菌,即变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、脱铁杆菌门(Deferribacteres)、绿弯菌门(Chloroflexi);黄海和渤海刺参养殖池塘海水和沉积物中优势类群均为变形菌(变形菌比例>48%);用Shannon指数及Simpson优势度指数分析细菌的多样性,黄、渤海刺参养殖池塘中,冬季沉积物细菌Simpson优势度指数均最低,分别为0.014 89和0.016 50,Shannon指数均最高,分别为6.312和5.695。研究表明,黄海和渤海刺参养殖池塘中,冬季沉积物细菌多样性均最高。 展开更多
关键词 刺参 养殖池塘 16S RDNA 变形菌门
下载PDF
春季青藏高原东北部湖泊细菌种类组成 被引量:11
13
作者 李明 郭嘉 +2 位作者 石正国 晏利斌 晏宏 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期750-758,共9页
青藏高原东北地区位于我国东部季风区、西北干旱区和青藏高原高寒区的交汇地带,人为影响较少,是研究生物种群组成的理想场所,然而目前尚缺乏大范围的分子生物学研究.2012年4-5月期间对青藏高原东北部10个湖区进行采样调查(表层、底层水... 青藏高原东北地区位于我国东部季风区、西北干旱区和青藏高原高寒区的交汇地带,人为影响较少,是研究生物种群组成的理想场所,然而目前尚缺乏大范围的分子生物学研究.2012年4-5月期间对青藏高原东北部10个湖区进行采样调查(表层、底层水各0.5 L混匀),应用16S rRNA和PCR-DGGE指纹分析研究细菌种类和组成.共鉴别出样本湖水中117个分类单元(Operational taxonomic unit,OTU)的细菌,分别隶属于12个纲,其中以α-变形菌纲(21种)和β-变形菌纲(27种)检出频次最多.细菌主要源于水生的微生物,外来扰动较少同时各湖区细菌分类单元数量(平均32.1±11.2)偏少,多样性指数(平均0.97±0.29)和均匀度指数(平均0.19±0.04)偏低,湖区之间相似性(平均0.31±0.11)较差,种群生态结构脆弱.各湖区物种分类单元数量受环境因素影响明显,温度与种群分类单元数(R=0.763,P<0.05)、多样性指数(R=0.708,P<0.05)及均匀度指数(R=0.641,P<0.05)正相关,湖水面积与种群分类单元数量(R=0.754,P<0.05)及多样性系数(R=0.668,P<0.05)呈正相关,并且细菌种类组成受到湖水水化学(如矿化度等)因素影响.本研究表明春季青藏高原东北部10个湖区细菌种类组成较为简单,生态结构脆弱,受自然环境因素限制明显,结果可为青藏高原东北部地区水生生物研究积累基础资料,亦可为群落结构的限制性气候因素分析、区域的可持续利用和保护提供科学依据. 展开更多
关键词 青藏高原 湖泊 细菌多样性 变形菌纲 分类单元
原文传递
城市富营养化湖泊沉积物微生物多样性季节变化 被引量:11
14
作者 彭磊 赵建伟 +3 位作者 张钰 华玉妹 朱端卫 刘广龙 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1012-1018,共7页
分别于2011年6月和11月,在武汉东湖和南湖采集沉积物,作为夏季和冬季样品的代表,采用PCR-DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)和克隆测序方法研究沉积物中微生物多样性及其季节变化.结果显示,城市湖泊沉积... 分别于2011年6月和11月,在武汉东湖和南湖采集沉积物,作为夏季和冬季样品的代表,采用PCR-DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)和克隆测序方法研究沉积物中微生物多样性及其季节变化.结果显示,城市湖泊沉积物中微生物多样性十分丰富,冬季两个湖泊沉积物的DGGE条带总数为287条,夏季为317条.冬季和夏季,东湖的平均丰度分别为27.4和31.0,Shannon-Wiener指数分别为2.32和2.78;南湖的平均丰度分别为30.0和32.2,Shannon-Winner指数分别为2.83和2.86.两个湖泊的夏季微生物丰度和多样性指数均高于冬季;同一湖泊各样点之间的相似性更强,说明湖泊内部形成了自身特有的微生物群落结构.克隆测序的结果表明东湖、南湖微生物主要归属于3个细菌类群,其中,变形菌门占有优势地位,其次为拟杆菌门和厚壁菌门,分别占序列总数的77%、17%和6%.变形菌门中,β-变形菌纲和γ-变形菌纲为优势菌种,占序列总数的35%和31%.综上,东湖和南湖沉积物夏季微生物丰度和多样性指数均高于冬季,季节性变化影响了沉积物微生物群落的丰度和结构;本研究结果丰富了对城市富营养化湖泊沉积物微生物多样性的认识. 展开更多
关键词 湖泊沉积物 季节性变化 微生物多样性 PCR-DGGE 变形菌门
原文传递
成年与未成年圈养林麝粪便菌群多样性的比较 被引量:10
15
作者 赵贵军 封孝兰 +5 位作者 朱吉彬 郑程莉 竭航 曾德军 张承露 戚文华 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期266-275,共10页
本研究旨在解析林麝未成年组(n=10)和成年组(n=10)之间的菌群差异。收集林麝新鲜粪便,提取总DNA,利用带标签的通用引物扩增16S rRNA V3-V4区,使用Illumina Miseq 300PE测序平台对扩增产物进行Miseq双端测序,通过计算ACE和Shannon等多样... 本研究旨在解析林麝未成年组(n=10)和成年组(n=10)之间的菌群差异。收集林麝新鲜粪便,提取总DNA,利用带标签的通用引物扩增16S rRNA V3-V4区,使用Illumina Miseq 300PE测序平台对扩增产物进行Miseq双端测序,通过计算ACE和Shannon等多样性指数,以及微生物组成成分和距离聚类分析,揭示组成结构与差异。α多样性分析表明成年组微生物的多样性丰富度略高于未成年组,但不存在显著差异性(P>0.05)。未成年组和成年组均是厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)所占的比例较高。成年组Proteobacteria比例明显高,而Firmicutes比例较低。LEfSe分析表明有12个显著差异的细菌分类。两组在Firmicutes门存在显著差异的细菌较少,而在Proteobacteria上存在显著差异的细菌较多。本研究证明在不同年龄阶段,微生物的丰富度和多样性不存在显著差异,细菌的组成成分也相同。但是在组成比例上存在差异性,间接反映了不同年龄阶段营养吸收的不同需求。 展开更多
关键词 林麝 不同年龄 肠道微生物 变形菌门
下载PDF
基于454焦磷酸测序分析虾夷扇贝外套膜菌群多样性 被引量:10
16
作者 丁君 窦妍 +2 位作者 徐高蓉 王轶南 常亚青 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期3344-3348,共5页
运用454焦磷酸测序技术分析了健康虾夷扇贝和缺刻症状虾夷扇贝外套膜细菌多样性,分别从健康和缺刻虾夷扇贝样品中获得20872和16333条有效序列.结果表明:缺刻虾夷扇贝样品菌群丰度和多样性分别高于健康虾夷扇贝样品;两个样品中细菌可以分... 运用454焦磷酸测序技术分析了健康虾夷扇贝和缺刻症状虾夷扇贝外套膜细菌多样性,分别从健康和缺刻虾夷扇贝样品中获得20872和16333条有效序列.结果表明:缺刻虾夷扇贝样品菌群丰度和多样性分别高于健康虾夷扇贝样品;两个样品中细菌可以分为8个门,即变形菌门、厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门、蓝细菌门、浮霉菌门、螺旋体门和柔膜菌门,其中前7个门类的细菌在健康和缺刻虾夷扇贝样品中均有分布;在健康虾夷扇贝样品中,变形菌门占绝对优势,占整个菌群的97.7%,次优势类群厚壁菌门占0.8%;缺刻虾夷扇贝样品中,优势类群为厚壁菌门,占整个菌群的52.2%,次优势类群变形菌门占47.7%. 展开更多
关键词 优势类群 变形菌门 厚壁菌门
原文传递
基于高通量测序技术分析患病与健康虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)闭壳肌菌群多样性 被引量:10
17
作者 窦妍 赵晓伟 +2 位作者 丁君 刘圣聪 张涛 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期1019-1025,共7页
本研究取自同一养殖海域不同浮筏养殖笼中健康和患脓包病虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)样品,健康虾夷扇贝样品标记为CK,患病样品分别标记为S1、S2和S3,使用Mi Seq高通量测序技术比较不同生存状态的虾夷扇贝的微生物组成与差异。结... 本研究取自同一养殖海域不同浮筏养殖笼中健康和患脓包病虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)样品,健康虾夷扇贝样品标记为CK,患病样品分别标记为S1、S2和S3,使用Mi Seq高通量测序技术比较不同生存状态的虾夷扇贝的微生物组成与差异。结果表明:4个样品中菌群多样性表现为S3>CK>S1>S2;4个样品中的细菌可归为24个门,主要门类有变形菌门、拟杆菌门、浮霉菌门、梭杆菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线菌门、硝化螺旋菌门、绿菌门和绿弯菌门;在健康虾夷扇贝样品中,变形菌门占绝对优势,占整个菌群的95.9%,患病虾夷扇贝样品中,S1和S3中优势类群均为变形菌门,分别占整个菌群的80.4%和86.8%,S2中优势菌群为拟杆菌门,占56.9%。 展开更多
关键词 虾夷扇贝 变形菌门 微生物多样性 高通量测序
原文传递
除磷工艺中含氧条件对聚磷菌种群结构影响研究 被引量:8
18
作者 傅以钢 戴睿 +2 位作者 刘洪波 赵建夫 夏四清 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第2期474-481,共8页
利用分子生物学技术直接从活性污泥样品中提取DNA,采用套式PCR技术对特征基因片断进行扩增,结合DGGE(变性浓度梯度凝胶电泳)分析活性污泥中微生物种群结构.研究了除磷工艺在正常运行情况下的微生态系统种群结构,并分析了微生物群落结构... 利用分子生物学技术直接从活性污泥样品中提取DNA,采用套式PCR技术对特征基因片断进行扩增,结合DGGE(变性浓度梯度凝胶电泳)分析活性污泥中微生物种群结构.研究了除磷工艺在正常运行情况下的微生态系统种群结构,并分析了微生物群落结构及行为特征.测定了活性污泥中变形杆菌(Proteobacteria)和产酸菌(Acidobacterium)部分菌种的16S rDNA V3区片段序列,通过NCBI(美国国立生物技术信息中心)基因库比对,初步确定了部分细菌的属.在厌氧/好氧和缺氧/好氧工艺中各类优势菌群变化规律研究表明,在除磷效果稳定的情况下,系统中除磷微生物种群结构大致能保持不变,少数数量或种类发生变化的种群与系统中含氧量变化有关,但是处于动态变化中的菌群结构总体能够适应工艺运行环境. 展开更多
关键词 变形杆菌 产酸菌 16SrDNA 微生态 厌氧
下载PDF
杭州市西湖景区春季空气细菌多样性特征 被引量:8
19
作者 楼秀芹 郭卫俊 +1 位作者 姚文冲 方治国 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期2946-2953,共8页
选取了杭州市西湖景区4个典型样点,利用高通量测序方法研究了其空气细菌多样性特征。结果表明,在细菌门水平上,各样点优势细菌为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),... 选取了杭州市西湖景区4个典型样点,利用高通量测序方法研究了其空气细菌多样性特征。结果表明,在细菌门水平上,各样点优势细菌为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其总相对含量在断桥残雪(MSBB)、柳浪闻莺(OSW)、宝石流霞(PSHFRC)和三潭印月(TPMM)分别为88.31%、86.03%、85.06%和89.28%,且不同样点优势菌群存在一定的差异,OSW和TPMM厚壁菌门分别占9.65%和11.6%,拟杆菌门分别占6.86%和5.55%,MSBB和PSHFRC拟杆菌门分别占7.31%和7.86%,厚壁菌门分别占7.09%和5.32%。在细菌属水平上,各样点优势菌属及含量差异显著,MSBB、TPMM、OSW和PSHFRC相对含量最高的菌属分别为马赛菌属(Massilia)、两面神菌属(Janibacter)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和甲基杆菌属(Methylobacterium),分别占6.22%、6.45%、6.05%和11.5%,各样点相对含量高于2%的细菌属有鞘氨醇单胞菌属、甲基杆菌属、薄层菌属(Hymenobacter)和异常球菌属(Deinococcus),这些菌属是西湖景区各样点共有的优势菌群;通过空气细菌OTU及多样性分析可知,MSBB空气细菌丰富度较高,均匀度较低,而PSHFRC丰富度较低,均匀度较高。杭州西湖景区不同样点空气细菌群落特征差异显著,且其丰富度和均匀度明显不同。 展开更多
关键词 生物气溶胶 西湖景区 变形菌门 细菌丰富度 多样性指数
下载PDF
黄、渤海春季刺参肠道及养殖池塘细菌菌群的多样性 被引量:7
20
作者 窦妍 丁君 +1 位作者 王轶南 穆晓虎 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期572-576,共5页
以黄海和渤海春季刺参养殖池塘的沉积物、海水和刺参Apostichopus japonicus肠道内容物中的细菌基因组DNA为模板,以细菌16S r DNA通用引物进行PCR扩增,构建16S r DNA文库并进行测序分析。结果表明:黄海和渤海养殖刺参肠道内容物、池塘... 以黄海和渤海春季刺参养殖池塘的沉积物、海水和刺参Apostichopus japonicus肠道内容物中的细菌基因组DNA为模板,以细菌16S r DNA通用引物进行PCR扩增,构建16S r DNA文库并进行测序分析。结果表明:黄海和渤海养殖刺参肠道内容物、池塘沉积物和海水中共存在变形菌Proteobacteria、蓝细菌门Cyanobacteria、放线菌门Actinobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes和厚壁菌门Firmicutes 5个门类的细菌类群,其优势类群均为变形菌(变形菌比例>41%),且在文库所含变形菌的4个亚门(Alphaproteobacteria、Betaproteobacteria、Gammaproteobacteria、Deltaproteobacteria)中,除黄海春季刺参养殖池塘海水文库(YSp3)中α-变形菌占优势外,其余5个文库均以γ-变形菌为优势亚门。 展开更多
关键词 刺参 16S rDNA文库 变形菌
下载PDF
上一页 1 2 5 下一页 到第
使用帮助 返回顶部