小麦幼苗叶片中硝酸盐转运蛋白NRT1和NRT2家族基因对氮饥饿响应的表达分析 被引量：19

1

作者 轩红梅 王永华 +4 位作者 魏利婷 杨莹莹 王利娜 康国章 郭天财 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1019-1028,共10页

硝酸盐转运蛋白NRT1(Nitrate transporter 1)和NRT2(Nitrate transporter 2)家族基因在高等植物氮转运过程中发挥着重要作用。为探讨NRT1和NRT2家族基因在小麦幼苗响应氮饥饿中的作用,本研究测定了氮饥饿处理过程中小麦幼苗的生长参数... 硝酸盐转运蛋白NRT1(Nitrate transporter 1)和NRT2(Nitrate transporter 2)家族基因在高等植物氮转运过程中发挥着重要作用。为探讨NRT1和NRT2家族基因在小麦幼苗响应氮饥饿中的作用,本研究测定了氮饥饿处理过程中小麦幼苗的生长参数和叶片中叶绿素、可溶性蛋白、硝酸盐和丙二醛(MDA)的含量,并利用荧光实时定量PCR(qPCR)技术分析了叶片中NRT1(7个)和NRT2(5个)家族基因的转录水平。结果表明,氮饥饿明显抑制小麦幼苗生长,其株高、干鲜重显著下降,叶片叶绿素含量、蛋白质含量和硝酸盐含量均显著降低,而MDA含量却显著升高。在氮饥饿处理后所有测定时间点(2d、4d、6d和8d),小麦幼苗叶片中TaNRT1.1、TaNRT1.2、TaNRT1.7、TaNRT2.3和TaNRT2.4的表达均受到显著抑制;然而,氮饥饿2d时,TaNRT1.4、TaNRT1.8和TaNRT2.1的表达量显著升高;氮饥饿4d时,TaNRT1.3、TaNRT1.5和TaNRT2.5的表达量也显著升高,推测TaNRT1.3、TaNRT1.4、TaNRT1.5、TaNRT1.8、TaNRT2.1和TaNRT2.5可能在小麦幼苗响应氮饥饿中发挥着重要作用。 展开更多

关键词 氮饥饿 硝酸盐转运蛋白 转录水平 小麦

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青海血蜱Haemalin基因的克隆、生物信息学及转录水平分析

2

作者 何永彩 李增魁 +11 位作者 陈炳华 张连生 李中余 何顺福 陈继勇 耿鹏程 胡晓宇 蒋硕 陈强 徐璐瑶 康明 李英 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期700-708,共9页

为构建青海血蜱Haemalin基因的cDNA全长序列,并分析该基因的生物信息学特征及其在青海血蜱不同发育阶段和雌蜱不同组织中的转录水平,本研究基于青海血蜱唾液腺转录组文库中检索到的一个功能注释为Haemalin的基因片段,采用cDNA末端快速... 为构建青海血蜱Haemalin基因的cDNA全长序列,并分析该基因的生物信息学特征及其在青海血蜱不同发育阶段和雌蜱不同组织中的转录水平,本研究基于青海血蜱唾液腺转录组文库中检索到的一个功能注释为Haemalin的基因片段,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)引物设计软件设计Haemalin基因3'RACE和5'RACE特异性引物,分别经RACE扩增青海血蜱Haemalin基因的3'端和5'端序列,测序后与其中间序列拼接获得该基因的cDNA全长序列。利用生物信息学软件分析该基因编码蛋白的信号肽、理化性质、跨膜结构域、结构域、蛋白质三级结构、B细胞抗原表位以及氨基酸序列比对,采用NCBI中的BLAST及MEGA 7.0软件分别分析Haemalin基因编码氨基酸序列的相似性及构建其系统进化树,采用qPCR检测Haemalin基因在不同发育阶段青海血蜱和雌蜱不同组织中的转录水平。结果显示,青海血蜱Haemalin基因cDNA全长583 bp,开放阅读框(ORF)423 bp,该基因编码蛋白的信号肽为N端的15个氨基酸,理论等电点4.71,属于亲水性蛋白,无跨膜结构域。该基因编码蛋白的三级结构分析结果显示,其存在两个典型的Kunitz/牛胰蛋白酶抑制剂(Kunitz/BPTI)结构域,两个结构域之间由单链连接,共包括3个α螺旋,2对反向平行的β折叠;在aa35~aa45、aa54~aa60、aa75~aa80、aa91~aa93、aa125~aa131等处可能存在潜在的B细胞抗原表位。相似性与进化树结果显示,青海血蜱Haemalin氨基酸序列与褐黄血蜱凝血酶抑制剂Haemalin氨基酸序列的相似最高达92%,并在进化树中二者处于同一进化分支。表明,青海血蜱Haemalin可能也为一种凝血酶抑制剂。qPCR结果显示,Haemalin基因在不同发育阶段青海血蜱中的转录水平为:卵>半饱血蜱>若蜱>饱血蜱>幼蜱>吸血96 h的雌成蜱>游离雌成蜱,且其在青海血蜱雌蜱中肠中的转录水平极显著高于其他组织(P<0.0001)。表明,Haemalin基因在青海血蜱成蜱� 展开更多

关键词 青海血蜱 Haemalin基因 克隆 生物信息学 转录水平

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环形泰勒虫感染对单核细胞中NOD样受体信号通路相关基因转录的影响 被引量：3

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作者 李四通 刘军龙 +8 位作者 刘爱红 李有全 赵洪喜 赵帅阳 何欣 陈银银 殷宏 罗建勋 关贵全 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期964-968,共5页

根据Gen Bank发表的相关序列,分别设计针对牛NOD样受体(NLRs)信号通路10个相关分子NOD1、NOD2、NLRP1、NLRP3、NLRC4、NAIP、RIP2、CASP1、IL-18和IL-1β基因设计Real-time PCR特异性引物,通过优化反应条件后对其特异性、敏感性和重复... 根据Gen Bank发表的相关序列,分别设计针对牛NOD样受体(NLRs)信号通路10个相关分子NOD1、NOD2、NLRP1、NLRP3、NLRC4、NAIP、RIP2、CASP1、IL-18和IL-1β基因设计Real-time PCR特异性引物,通过优化反应条件后对其特异性、敏感性和重复性进行评价,并分别检测环形泰勒虫感染细胞Ta NM中靶基因的转录水平及其与对照的差异。结果显示,所建立的分别检测10个靶基因的Real-time PCR方法特异均非常,其敏感性均在1~100 copies/L之间;而在F10代Ta NM细胞中,NOD1、NOD2、NLRP1、NLRP3、NLRC4、NAIP、RIP2、CASP1和IL-18基因的转录水平均显著低于对照组外周血单核细胞(P<0.01),而IL-1β在F10代Ta NM细胞中的转录水平却显著高于对照组(P<0.01)。本研究结果为开展环形泰勒虫对宿主细胞天然免疫机制的研究奠定了基础。 展开更多

关键词 NLRS REAL-TIME PCR 环形泰勒虫 转录水平

原文传递

水稻脱落酸响应基因分析 被引量：2

4

作者 樊凌志 季科研 +1 位作者 蒲首丞 孙梅好 《山西农业科学》 2017年第5期689-691,698,共4页

脱落酸(ABA)参与调节植物的生长和发育,在植物抗击外界环境压力方面起到了重要的作用。为了筛选出水稻体内的脱落酸响应基因,试验设计了OsRD22,OsLTP4,OsLEA7的定量PCR引物,同时利用以终浓度为50μmol/L的外源脱落酸处理的水稻叶片为材... 脱落酸(ABA)参与调节植物的生长和发育,在植物抗击外界环境压力方面起到了重要的作用。为了筛选出水稻体内的脱落酸响应基因,试验设计了OsRD22,OsLTP4,OsLEA7的定量PCR引物,同时利用以终浓度为50μmol/L的外源脱落酸处理的水稻叶片为材料,分析3种基因对外源脱落酸的响应情况。结果表明,随着外源脱落酸处理时间的延长,OsLTP4,OsLEA7等2种基因的相对转录水平并没有随之增长;OsRD22基因的相对转录水平随着时间的增加,呈现出表达量逐渐升高的趋势。因此,基因OsRD22的表达水平可以作为测定水稻叶片内脱落酸相对含量的指标。 展开更多

关键词 脱酸酸 水稻 相对转录水平 RT-PCR

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蓝光和蛋白酶体抑制剂MG132处理对蛹虫草Cmfrq、Cmwc-1和Cmwc-2转录水平的影响

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作者 丰磊 李晓然 +3 位作者 付鸣佳 黄紫妍 魏伟群 肖世平 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期587-600,共14页

生物钟的节律振荡器主要成分之间的关系构成了转录-翻译负反馈环,并以此调控生物体的生理生化反应和生长发育等。以不同时间的蓝光照射和蛋白酶体抑制剂MG132处理蛹虫草菌丝体,通过实时荧光PCR分析其中节律振荡器主要成分的3个基因Cmfrq... 生物钟的节律振荡器主要成分之间的关系构成了转录-翻译负反馈环,并以此调控生物体的生理生化反应和生长发育等。以不同时间的蓝光照射和蛋白酶体抑制剂MG132处理蛹虫草菌丝体,通过实时荧光PCR分析其中节律振荡器主要成分的3个基因Cmfrq、Cmwc-1和Cmwc-2转录水平变化,以期确定3个基因在蛹虫草中的相互关系和变化规律。研究表明,持续的黑暗情况下,MG132对Cmfrq转录水平的影响比较大,对Cmwc-1和Cmwc-2转录水平的影响有限。在黑暗培养过程中2 h的蓝光间断条件下,无MG132处理培养后期Cmfrq转录水平急剧下降,Cmwc-1转录水平却急剧上升,Cmfrq和Cmwc-1转录水平呈现生物振荡器负反馈调控特点;Cmfrq转录水平受营养条件的影响,加MG132处理后使得Cmfrq转录对营养的改变不敏感。持续的蓝光照射培养条件下,无MG132处理时Cmfrq转录水平在后期也出现急剧的下降,Cmfrq转录对MG132处理更为敏感;无论有或无MG132处理,这3个基因之间均没有反映出生物振荡器负反馈环的特点。在蓝光12h和黑暗12h的周期交替条件下,前后2个周期这3个基因的转录水平出现不一致的情况,由持续黑暗进入周期交替时,Cmfrq转录水平由高到低;在第2个周期时Cmwc-1和Cmwc-2转录水平均非常低,但MG132导致Cmwc-1和Cmwc-2转录水平升高。与黑暗条件相比,蓝光处理可以导致Cmfrq转录水平升高。Cmwc-1转录水平在多数情况下均非常低,表明该基因是生物振荡器中的关键基因。 展开更多

关键词 蛹虫草 蓝光 蛋白酶体抑制剂 基因转录水平

原文传递

水稻茉莉酸响应基因的分析

6

作者 季科研 樊凌志 +2 位作者 Bella akoa gilles marius 蒲首丞 孙梅好 《山西农业科学》 2016年第5期587-590,604,共5页

茉莉酸是植物体内天然的调节剂,在植物生长发育过程及响应外界环境胁迫方面具有重要的作用。为了分析水稻中茉莉酸的响应基因,设计了Os PDF1.2,Os VSP2,Os JAZ8的定量PCR引物,利用100μmol/L茉莉酸和100μmol/L菲尼酮(内源茉莉酸合成抑... 茉莉酸是植物体内天然的调节剂,在植物生长发育过程及响应外界环境胁迫方面具有重要的作用。为了分析水稻中茉莉酸的响应基因,设计了Os PDF1.2,Os VSP2,Os JAZ8的定量PCR引物,利用100μmol/L茉莉酸和100μmol/L菲尼酮(内源茉莉酸合成抑制剂)处理的叶片为材料,分析了Os JAZ8,Os PDF1.2,Os VSP2等3个基因对茉莉酸的响应情况。结果表明,Os JAZ8,Os PDF1.2随着茉莉酸处理时间的延长,表达量逐渐升高,随着菲尼酮处理时间的延长,表达量逐渐降低,而Os VSP2则与之相反;Os JAZ8对于茉莉酸的响应较Os PDF1.2,Os VSP2这2个基因更加敏感。据此结果认为,Os JAZ8的表达量可以作为水稻叶片中茉莉酸相对含量的指标。 展开更多

关键词 茉莉酸 水稻 RT-PCR 相对转录水平

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慢性囊型包虫病患者外周血单个核细胞中TLR2、4、7mRNA表达水平的研究 被引量：5

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作者 单骄宇 吐尔洪江·吐逊 +7 位作者 王俊华 张志 李亮 张雪 张传山 刘涛 林仁勇 温浩 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期273-278,共6页

目的 探讨慢性囊型包虫病（CE）患者外周血单个核细胞（PBMC）Toll样受体（TLRs）2、4、7基因表达变化及血清IL-10的表达情况.方法 采用实时荧光定量PCR（FQ-RT-PCR）法检测42例慢性CE患者与28例健康对照组（NC）外周血中TLR2、4、7 mRN... 目的 探讨慢性囊型包虫病（CE）患者外周血单个核细胞（PBMC）Toll样受体（TLRs）2、4、7基因表达变化及血清IL-10的表达情况.方法 采用实时荧光定量PCR（FQ-RT-PCR）法检测42例慢性CE患者与28例健康对照组（NC）外周血中TLR2、4、7 mRNA的表达,GAPDH作为内参基因;应用ELISA方法检测两组血清中IL-10的浓度.t检验比较两组间TLR2、4、7及IL-10的表达差异;TLR2、4、7的表达水平间及它们与血清IL-10水平间的相关性分析采用线性相关分析.结果 慢性CE组的TLR2、TLR4、TLR7的mRNA相对表达量均比NC组的表达增高,其中CE组的TLR2是NC组的7.3倍,TLR4是NC组的3.6倍,TLR7是NC组的3.6倍.CE组的TLR2、TLR4、TLR7 mRNA相对表达量分别是1.0729±0.4006、5.0976±1.6682、0.6481±0.2574;NC组的TLR2、TLR4、TLR7 mRNA的相对表达量分别是0.1468±0.0435、1.4067 ±0.3279、0.1804±0.0568.与NC组相比,CE组的TLR2、TLR4的差异均具有统计学意义（P值分别为0.0287、0.033）,而TLR7则无统计学意义（P=0.0862）.慢性CE组、NC组外周血清IL-10分别为（17.6770±1.6298）pg/ml、（9.4898±0.7049）pg/ml,且慢性CE组与NC组的IL-10比较,差异具有统计学意义（P=0.0002）;在慢性CE组中,外周血PBMC的TLR2与TLR4在mRNA相对表达水平上呈正相关（r=0.1135,P=0.036）,其他均无相关.结论 TLR2、TLR4参与了慢性囊型包虫病的发生发展过程,TLR2、TLR4可作为囊型包虫抗原的受体,与不同抗原成分相互作用,调节宿主的免疫应答,同时在血清IL-10分泌增高的作用下共同促使机体向Th2型免疫应答方向发展,从而对囊型包虫感染所产生的免疫逃避发挥着重要作用. 展开更多

关键词 慢性囊型包虫病 TOLL样受体 外周血单个核细胞 转录水平

原文传递

禽腺病毒血清4型感染鸡组织中NLRP3基因转录水平的实时荧光定量PCR分析 被引量：4

8

作者 郭慧芳 李宁 +5 位作者 王白玉 乔麒龙 黄庆 李永涛 王增 赵军 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期195-201,共7页

旨在分析禽腺病毒血清4型(FAdV-4)感染鸡组织中NLRP3基因的转录水平,本研究设计鸡NLRP3特异性引物,利用RT-PCR扩增NLRP3基因180 bp片段并克隆至pMD-18T载体,制备重组质粒pMD-18T-NLRP3。以pMD-18T-NLRP3质粒作为标准品进行荧光定量PCR... 旨在分析禽腺病毒血清4型(FAdV-4)感染鸡组织中NLRP3基因的转录水平,本研究设计鸡NLRP3特异性引物,利用RT-PCR扩增NLRP3基因180 bp片段并克隆至pMD-18T载体,制备重组质粒pMD-18T-NLRP3。以pMD-18T-NLRP3质粒作为标准品进行荧光定量PCR并建立标准曲线。通过反应条件优化,成功建立了检测NLRP3基因的实时荧光定量PCR方法,并利用该方法对致病性FAdV-4感染鸡组织中NLRP3基因的转录水平进行了分析。结果显示,所设计的NLRP3引物可特异性扩增鸡NLRP3基因,建立的实时荧光定量PCR对鸡NLRP3标准质粒的扩增曲线良好,标准品的拷贝数与Cq值呈现良好的线性关系。与对照组相比,NLRP3分子在FAdV-4感染鸡肝和脾中的转录水平极显著高于对照组(P<0.001),在盲肠扁桃体和法氏囊的表达显著高于对照组(P<0.01)。本研究所建立的鸡NLRP3基因SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR可以检测FAdV-4感染鸡不同组织中NLRP3的转录水平;致病性FAdV-4感染所造成的组织炎症损伤与NLRP3分子密切相关。 展开更多

关键词 禽腺病毒血清4型 鸡NLRP3基因 实时荧光定量PCR 组织炎症 转录水平

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番茄SlDOGL4转录因子基因的克隆和表达分析

9

作者 王祎祎 范冰丽 +4 位作者 李营 王改雪 薛东齐 李艳 高艳娜 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第8期24-33,共10页

为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG... 为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG1结构域,属于bzip转录因子中的DOG1家族成员;系统进化关系表明,SlDOGL4与马铃薯的StDOGL4蛋白亲缘关系较近。组织表达谱结果表明,SlDOGL4基因主要在根和破色期果实中表达。亚细胞定位结果表明,SlDOGL4蛋白定位于细胞核。SlDOGL4基因启动子上有多种与非生物胁迫和激素响应相关的顺式元件。构建ProSlDOGL4::GUS融合表达载体,遗传转化番茄检测启动子活性,GUS组织化学染色结果表明,SlDOGL4在根、茎、生长点、种子等组织中都有表达,表明该基因在番茄整个生长发育过程中发挥重要作用。通过公共数据库中转录组数据分析表明,SlDOGL4基因的表达受到盐、干旱、冷和热胁迫不同程度的诱导。为了进一步验证SlDOGL4基因的功能,在盐处理后,SlDOGL4基因的转录水平呈先升高后降低的趋势,且在盐处理2 h后达到最高转录水平。研究结果为探索SlDOGL4基因在番茄耐盐中的功能奠定了基础。 展开更多

关键词 番茄 SlDOGL4 非生物胁迫 亚细胞定位 转录水平

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过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅激活因子1α与肌纤维类型转化及其表达调控研究进展 被引量：3

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作者 周招洪 陈代文 +2 位作者 田刚 肖竺宏 余冰 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第10期2636-2643,共8页

过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPAR-γ)辅激活因子1α(PGC-1α)是一种多功能的转录调节因子,广泛参与线粒体生物合成、能量代谢和糖脂代谢等过程。PGC-1α可通过多条信号通路调控畜禽骨骼肌肌纤维类型的转化,从而影响肉品质。因此,在... 过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPAR-γ)辅激活因子1α(PGC-1α)是一种多功能的转录调节因子,广泛参与线粒体生物合成、能量代谢和糖脂代谢等过程。PGC-1α可通过多条信号通路调控畜禽骨骼肌肌纤维类型的转化,从而影响肉品质。因此,在转录和翻译水平上对PGC-1α的表达调控进行深入研究将为今后改善肉品质提供新的思路。日粮营养作为一种调控畜禽肉品质的重要方式,近年来,关于营养对PGC-1α活性的影响研究也逐渐开展起来,并取得了一些进展。作者概述了PGC-1α的结构、组织表达特点及PGC-1α调控肌纤维类型转化的机制,重点在转录和翻译水平介绍了PGC-1α的表达调控机制,并综述了日粮营养对PGC-1α活性的影响。 展开更多

关键词 PGC-1Α 肌纤维类型 转录水平 翻译水平 表达调控 营养

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蜕皮激素诱导下家蚕CYP3基因家族的表达变化 被引量：3

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作者 高瑞娜 卫正国 +4 位作者 张婷 王瑞娴 赵国栋 李兵 沈卫德 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期943-948,共6页

为了研究家蚕Bombyxmori CYP3家族基因经蜕皮激素诱导后的表达变化,用蜕皮激素溶液(2×10-3μg/μL)浸泡的桑叶喂食家蚕B.mori5龄幼虫,以不用蜕皮激素处理的桑叶喂食家蚕为对照,采用双跟踪标定定量PCR(dual-spike-in qPCR)方法,检... 为了研究家蚕Bombyxmori CYP3家族基因经蜕皮激素诱导后的表达变化,用蜕皮激素溶液(2×10-3μg/μL)浸泡的桑叶喂食家蚕B.mori5龄幼虫,以不用蜕皮激素处理的桑叶喂食家蚕为对照,采用双跟踪标定定量PCR(dual-spike-in qPCR)方法,检测在蜕皮激素诱导下家蚕中肠和脂肪体内CYP3基因家族的转录水平。结果表明:与对照相比,在蜕皮激素诱导下家蚕幼虫体内脂肪体中CYP302,CYP306和CYP339的转录水平分别上升了191.4,7.4和421倍,在中肠中变化不显著;其余基因转录水平变化不明显或检测不到转录活性。结果说明CYP339基因有可能参与家蚕蜕皮激素的代谢,这为进一步研究P450基因与内源物质的关系提供理论基础。 展开更多

关键词 家蚕 CYP3家族 蜕皮激素 双跟踪标定定量PCR 转录水平

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左心室射血功能障碍的心衰患者心房细胞中兰尼碱受体转录水平明显降低 被引量：3

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作者 王威 汪洋 +4 位作者 董国凯 殷文江 李周儒 蔡红星 孙晓明 《科学技术与工程》 北大核心 2019年第1期61-64,共4页

为检测心衰患者心肌细胞中钙离子调节基因的转录水平,探索心力衰竭及左室射血功能(left ventricular ejection fraction,LVEF)受损的分子机制,通过反转录PCR检测钙离子调节基因的转录水平并采用t检验的方法比较了左室射血功能受损组与... 为检测心衰患者心肌细胞中钙离子调节基因的转录水平,探索心力衰竭及左室射血功能(left ventricular ejection fraction,LVEF)受损的分子机制,通过反转录PCR检测钙离子调节基因的转录水平并采用t检验的方法比较了左室射血功能受损组与对照组的差异。结果表明:兰尼碱受体(ryanodine receptor,RyR)转录水平在左室射血功能受损组中的转录水平明显升高,差异具有统计学意义。可见左室射血功能受损的心衰患者,其心肌细胞中RyR转录水平高于左室功能正常的心衰患者,表明RyR参与了左室射血功能的调节。 展开更多

关键词 心衰 左室射血功能 钙离子调节 转录水平

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奶牛源金黄色葡萄球菌新疆流行株生物被膜形成及相关基因的分布与转录水平 被引量：3

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作者 伍晔晖 孟庆玲 +4 位作者 乔军 李静 蔡扩军 王登峰 才学鹏 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1829-1835,共7页

【目的】了解金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)临床分离株的生物被膜形成情况及黏附素和ica操纵子与生物被膜形成能力的相关性,为系统掌握新疆地区奶牛源SA流行株的分子特征及有效防治奶牛乳房炎提供科学依据。【方法】收集临... 【目的】了解金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)临床分离株的生物被膜形成情况及黏附素和ica操纵子与生物被膜形成能力的相关性,为系统掌握新疆地区奶牛源SA流行株的分子特征及有效防治奶牛乳房炎提供科学依据。【方法】收集临床分离鉴定的164株SA新疆流行株,采用结晶紫半定量黏附试验(MPA)测定各流行株的体外生物被膜形成能力,同时通过PCR和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对SA生物被膜形成相关基因转录水平进行检测分析。【结果】164株奶牛源SA新疆流行株的生物被膜阳性率为86.0%(141株),其中弱(+)生物被膜形成有69株(占42.1%)、中等(++)生物被膜形成有38株(占23.2%)、强(+++)生物被膜形成有34株(20.7%)。在141株MPA阳性SA分离株中,clfA、clfB、fnbA、fnbB、cna、fib、icaA、icaC和icaD基因检出率分别为83.7%(n=118)、58.9%(n=83)、75.2%(n=106)、78.7%(n=111)、75.9%(n=107)、58.9%(n=83)、90.1%(n=127)、79.4%(n=112)和100.0%(n=141);ica基因(icaA、icaC和icaD)检出率总体上高于其他生物被膜形成相关基因,且生物被膜形成能力强(+++和++)的菌株尤为明显;clfB、fnbA、cna和fib基因检出率则表现为MPA阴性菌株高于MPA阳性菌株。9个生物被膜形成相关基因中有7个基因(clfA、fnbA、fnbB、fib、cna、icaC和icaD)在强(+++)生物被膜形成能力SA分离株中的表达量显著上调(P<0.05)。【结论】奶牛源SA新疆流行株生物被膜形成率高,生物被膜形成相关基因携带率也较高,其中clfA、fnbA、fnbB、fib、cna、icaC和icaD基因的表达与SA生物被膜形成密切相关。 展开更多

关键词 金黄色葡萄球菌 生物被膜 黏附素 转录水平 新疆

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大豆对大豆胞囊线虫侵染的应答机制研究 被引量：2

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作者 焦梦瑶 董铮 +1 位作者 刘世名 李魏 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期475-479,共5页

大豆胞囊线虫病(Heterodera glycines,soybean cyst nematode,SCN)是大豆生产上的重要病害,其特点为危害重、分布广、难防治,每年对大豆生产造成极大的损失。种植大豆抗性新品种是防治SCN目前最为有效的措施,研究大豆对SCN侵染的应答机... 大豆胞囊线虫病(Heterodera glycines,soybean cyst nematode,SCN)是大豆生产上的重要病害,其特点为危害重、分布广、难防治,每年对大豆生产造成极大的损失。种植大豆抗性新品种是防治SCN目前最为有效的措施,研究大豆对SCN侵染的应答机制,是培育大豆持久抗病品种的前提,对加快抗线虫品种选育及SCN的防控具有重要的意义。本文综述了大豆对SCN侵染的组织细胞学应答机制;介绍了大豆在SCN侵染后酶系变化及酚类代谢的生理生化应答机制;从分子水平阐明了SCN侵染后大豆的基因转录变化,差异蛋白及DNA甲基化的应答机制,以期为大豆胞囊线虫病害的进一步研究与防治提供参考。 展开更多

关键词 大豆胞囊线虫(SCN) 组织细胞学 酶系 转录水平 DNA甲基化

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毛竹LTR反转录转座子PHRE8的鉴定与转录模式分析 被引量：2

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作者 季航 周明兵 +2 位作者 蒋政勤 郑浩 徐芷馨 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期705-713,共9页

LTR反转录转座子是植物基因组中重要的组成部分,可作为遗传工具在生物学研究上发挥重要作用。为探究毛竹中具有潜在活性的LTR反转录转座子,解析LTR反转录转座子转座激活机制,本研究从毛竹基因组中克隆1条典型的LTR反转录转座子序列,命名... LTR反转录转座子是植物基因组中重要的组成部分,可作为遗传工具在生物学研究上发挥重要作用。为探究毛竹中具有潜在活性的LTR反转录转座子,解析LTR反转录转座子转座激活机制,本研究从毛竹基因组中克隆1条典型的LTR反转录转座子序列,命名为PHRE8,系统地分析了PHRE8的结构特征、插入特性和进化关系,并利用荧光定量PCR检测PHRE8在DNA甲基化抑制剂(5-氮杂胞苷)、辐射、高温、低温、高盐逆境胁迫下的转录水平。结果表明,PHRE8属于Ty3-gypsy超家族,全长5296 bp,具有完整的GAG与POL结构域,插入时间约为123.07万年,是具有理论潜在活性的转座子;在不同胁迫处理下,与野生实生苗相比,PHRE8的相对表达量均有所增加,猜测PHRE8在不同胁迫条件下,会激发其转录活性,影响宿主基因组结构和基因表达模式的变化,以适应外界环境改变。本研究结果为进一步探究毛竹基因组中活性转座子的功能奠定了一定的理论基础。 展开更多

关键词 LTR反转录转座子 活性 荧光定量PCR 逆境胁迫 转录水平

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QRT-PCR检测目的基因mRNA转录水平的应用 被引量：2

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作者 韩天龙 王敏 李志明 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第30期18432-18434,共3页

[目的]详细介绍One Step SYBR Green I实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time Quantitative Reverse Transcription PolymeraseChain Reaction,简称QRT-PCR)在定量检测靶基因mRNA转录水平上的应用。[方法]从样品准备、引物设计、核酸提... [目的]详细介绍One Step SYBR Green I实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time Quantitative Reverse Transcription PolymeraseChain Reaction,简称QRT-PCR)在定量检测靶基因mRNA转录水平上的应用。[方法]从样品准备、引物设计、核酸提取、反应体系构建、反应条件确定、标准曲线建立和目的基因定量等方面进行了分析。[结果]决定QRT-PCR反应成功与否的几个关键因素有模板的质量、底物的质量与浓度、引物的质量、酶和Mg2+、反应条件的优化。[结论]为畜牧兽医工作者利用分子生物学技术揭示疫病的发生机制和发病机理提供了技术参考,为基因表达的相对定量研究提供了方法支持。 展开更多

关键词 QRT-PCR 荧光定量 基因表达 转录水平

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中国汉族人群中KIR3DL1及其配体对宫颈癌的保护性作用及机制探讨 被引量：2

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作者 甄建新 朱雷雷 +3 位作者 李卫红 胡海燕 邓志辉 熊礼宽 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2019年第10期1035-1038,共4页

目的探讨中国汉族人群抑制性KIR(inhibitory KIR,iKIR)受体及其HLA配体在宫颈癌发生发展中的作用及其机制.方法随机采集265例宫颈上皮内瘤样病变和宫颈癌患者及200名正常女性的外周血样本,应用特异性PCR扩增、反向序列特异性寡核苷酸探... 目的探讨中国汉族人群抑制性KIR(inhibitory KIR,iKIR)受体及其HLA配体在宫颈癌发生发展中的作用及其机制.方法随机采集265例宫颈上皮内瘤样病变和宫颈癌患者及200名正常女性的外周血样本,应用特异性PCR扩增、反向序列特异性寡核苷酸探针、序列分型方法以及TCGA数据库的宫颈癌数据,分别分析iKIR基因及其受配体基因组合、肿瘤组织iKIR转录水平、KIR3DL1等位基因与宫颈癌发生发展的相关性.结果在4种iKIR基因(KIR2DL1、2DL2/3、3DL1和3DL2)中,正常人群KIR3DL1基因和KIR3DL1+HLA-Bw4基因组合的检出频率均显著高于宫颈癌患者(96.5%vs.87.0%、81.5%vs.64.8%),差异有统计学意义(P=0.018,P=0.009);肿瘤组织KIR3DL1高转录水平的富颈癌患者生存率显著高于KIR3DL1低/中转录水平的宫颈癌患者,差异有统计学意义(P=0.028);正常人群强抑制性高表达型KIR3DL1*01502等位基因的检出频率显著高于宫颈癌患者(76.0%vs.59.3%),差异有统计学意义(P=0.015).结论汉族人群中KIR3DL1及其受-配体组合对拮抗宫颈癌发生发展具有保护性作用,其保护作用可能与强抑制性高表达型KIR3DL1*01502等位基因有关. 展开更多

关键词 宫颈癌 抑制性KIR KIR3DL1 测序分型 转录水平

原文传递

绵羊痒螨兔亚种MMP2基因的转录水平及其重组蛋白间接ELISA的建立 被引量：1

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作者 葛优 郑晶 +7 位作者 蒲善秋 周宇 黄翠锐 杨光友 谢跃 何冉 徐璟 古小彬 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期567-575,共9页

本研究旨在分析绵羊痒螨兔亚种MMP2基因(PocMMP2)的虫体转录水平,及建立针对重组PocMMP2(rPocMMP2)蛋白抗体的间接ELISA检测方法(iELISA)。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)测定PocMMP2在不同发育阶段虫体、饱食与饥饿虫体的转录水平,采用... 本研究旨在分析绵羊痒螨兔亚种MMP2基因(PocMMP2)的虫体转录水平,及建立针对重组PocMMP2(rPocMMP2)蛋白抗体的间接ELISA检测方法(iELISA)。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)测定PocMMP2在不同发育阶段虫体、饱食与饥饿虫体的转录水平,采用原核表达系统获得rPocMMP2,经方阵滴定法优化反应条件,建立rPocMMP2-iELISA,并用该方法检测成都地区有痒螨病流行病史兔场的86份兔血清。结果显示:PocMMP2在雌虫、雄虫、若虫和幼虫阶段均有表达,且在饥饿虫体的转录水平显著高于饱食虫体(P<0.05);rPocMMP2约72 ku,主要存在于包涵体中;rPocMMP2-iELISA临界值为0.223,敏感性和特异性分别为86.0%和83.3%,受试者工作曲线下面积(AUC)为0.876,批内与批间重复性变异系数均小于10.00%;该方法的临床检测呈现74.42%的血清阳性检出率(64/86),高于病原学检出率(10.47%,9/86)。PocMMP2可能参与了绵羊痒螨兔亚种发育和入侵宿主过程,且所建立的rPocMMP2-iELISA有良好的敏感性、特异性和较高的重复性,可用于兔痒螨病的血清抗体检测。 展开更多

关键词 绵羊痒螨兔亚种 MMP2 转录水平 原核表达 间接ELISA

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禽呼肠孤病毒σC蛋白对鸡胚成纤维传代细胞天然免疫相关因子的调控 被引量：1

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作者 万丽军 王盛 +10 位作者 谢芝勋 任红玉 谢丽基 范晴 罗思思 张艳芳 曾婷婷 黄娇玲 张民秀 谢志勤 邓显文 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期625-632,共8页

为初步探究禽呼肠孤病毒(ARV)σC蛋白对天然免疫信号通路的影响,本研究将构建好的真核质粒pEF1α-HA-σC(实验组)及pEF1α-HA(对照组)转染DF1细胞进行表达,通过RT-qPCR检测不同时间点DF1细胞中天然免疫相关因子在转录水平的变化。检测... 为初步探究禽呼肠孤病毒(ARV)σC蛋白对天然免疫信号通路的影响,本研究将构建好的真核质粒pEF1α-HA-σC(实验组)及pEF1α-HA(对照组)转染DF1细胞进行表达,通过RT-qPCR检测不同时间点DF1细胞中天然免疫相关因子在转录水平的变化。检测后统计发现,TLR3、TLR7、MDA5、TLR15、TRIF、NF-κB、IRF7、MyD88、MAVS、IFN-α、IFN-β、IL-1β及IL-6天然免疫相关因子在转录水平上都发生了不同程度的上调或下调,提示这13种天然免疫相关因子在ARVσC蛋白引起的天然免疫中发挥着重要作用。研究结果及分析为进一步揭示ARVσC蛋白在宿主抗病毒的天然免疫反应中发挥的作用及ARV的致病机理提供了研究基础,为研制新型高效靶向抗ARV疫苗及疫苗佐剂提供了理论依据。 展开更多

关键词 σC蛋白 天然免疫信号通路 天然免疫相关因子 转录水平

原文传递

白三叶类黄酮合成基因TrCHI的克隆及转录分析

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作者 张婷婷 刘洋 +1 位作者 张鹤山 许本波 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期2547-2555,共9页

为研究白三叶类黄酮合成途径的关键基因TrCHI在白三叶(Trifolium repens)花色形成中的作用,以白三叶野生型和红花突变体为材料,通过同源克隆得到TrCHI基因并进行转录分析和CHI酶活性测定。结果表明,白三叶野生型TrCHI基因开放阅读框长66... 为研究白三叶类黄酮合成途径的关键基因TrCHI在白三叶(Trifolium repens)花色形成中的作用,以白三叶野生型和红花突变体为材料,通过同源克隆得到TrCHI基因并进行转录分析和CHI酶活性测定。结果表明,白三叶野生型TrCHI基因开放阅读框长660 bp,编码219个氨基酸,其红花突变体TrCHI开放阅读框长度为669 bp,编码222个氨基酸。7处氨基酸突变包括:第13号位的谷氨酸突变成天冬氨酸,第75号位的谷氨酸突变成谷氨酰胺,第154号位的丝氨酸突变成苏氨酸,第218号位的赖氨酸突变成精氨酸,并在末尾增加了甘氨酸、蛋氨酸和赖氨酸。进化分析发现,CHI基因进化具有物种保守性,Tr CHI属于Ⅱ型CHI。花瓣、根和叶柄中,红花突变体TrCHI转录水平显著高于野生型;但在茎、叶和花梗中,红花突变体TrCHI基因转录水平低于野生型。突变体花瓣中CHI酶活性极显著高于野生型(P<0.001)。推测白三叶突变体的红花表型与TrCHI基因突变并对白三叶中的类黄酮化合物的合成调控有关。本研究为进一步研究TrCHI在白三叶上的潜在功能提供了一定的价值。 展开更多

关键词 基因克隆 同义突变 错义突变 开放阅读框 进化分析 转录水平 CHI酶活性分析

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