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DELTA系统——值得再次推介的国际分类学描述信息处理工具 被引量:7
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作者 张明理 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 2009年第1期87-90,共4页
DELTA(description language for taxonomy)系统是一个用于生物分类学描述的计算机信息处理系统,也是国际植物分类数据工作组(International Working Group on Taxonomic Databases for Plant Sciences)选定的国际数据交换通用标准。DE... DELTA(description language for taxonomy)系统是一个用于生物分类学描述的计算机信息处理系统,也是国际植物分类数据工作组(International Working Group on Taxonomic Databases for Plant Sciences)选定的国际数据交换通用标准。DELTA系统主要功能是对分类学的形态描述进行规范化处理,并在此基础上进行分类群的自动描述、交互式鉴定和分类信息管理等。随着DELTA系统近40年的研制和改进,以及因特网便捷的信息传输和交流,该系统被越来越多地应用于植物分类学研究。作者简要介绍了该系统的结构、功能、获取途径以及使用方法,对DELTA系统所包含的子程序的功能、用途及运行方式进行了简要分析,以期推动该系统在中国植物分类学研究中的普及和应用。 展开更多
关键词 DELTA系统 分类学描述 检索表 鉴定 信息查询
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海洋生物多样性信息资源 被引量:7
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作者 邵广昭 李瀚 +1 位作者 林永昌 赖昆祺 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期253-263,共11页
海洋生物多样性甚高,但却饱受人为的破坏及干扰。目前全球最大的含点位数据的在线开放性数据库是海洋生物地理信息系统(OBIS),共约12万种3,700万笔资料;另一个较大的数据库世界海洋生物物种登录(WoRMS)已收集全球22万种海洋生物之物种... 海洋生物多样性甚高,但却饱受人为的破坏及干扰。目前全球最大的含点位数据的在线开放性数据库是海洋生物地理信息系统(OBIS),共约12万种3,700万笔资料;另一个较大的数据库世界海洋生物物种登录(WoRMS)已收集全球22万种海洋生物之物种分类信息。除此之外,以海洋生物为主的单一类群的数据库只有鱼库(FishBase)、藻库(AlgaeBase)及世界六放珊瑚(Hexacorallians of the World)3个。跨类群及跨陆海域的全球性物种数据库则甚多,如网络生命大百科(EOL)、全球生物物种名录(CoL)、整合分类信息系统(ITIS)、维基物种(Wikispecies)、ETI生物信息(ETI Bioinformatics)、生命条形码(BOL)、基因库(GenBank)、生物多样性历史文献图书馆(BHL)、海洋生物库(SeaLifeBase);海洋物种鉴定入口网(Marine Species Identification Portal)、FAO渔业及水产养殖概要(FAO Fisheries and Aquaculture Fact Sheets)等可查询以分类或物种解说为主的数据库。全球生物多样性信息网络(GBIF)、发现生命(Discover Life)、水生物图库(AquaMaps)等则是以生态分布数据为主,且可作地理分布图并提供下载功能,甚至于可以改变水温、盐度等环境因子的参数值,利用既定的模式作参数改变后之物种分布预测。谷歌地球(Google Earth)及国家地理(National Geographic)网站中的海洋子网页,以及珊瑚礁库(ReefBase)等官方机构或非政府组织之网站,则大多以海洋保育的教育倡导为主,所提供的信息及素材可谓包罗万象,令人目不暇给。更令用户感到方便的是上述许多网站或数据库彼此间均已可交互链接及查询。另外,属于搜索引擎的谷歌图片(Google Images)与谷歌学术(Google Scholar)透过海洋生物数据库所提供的直接链接,在充实物种生态图片与学术论文上亦发挥极大帮助,让用户获得丰富多样的信息。为了保育之目的,生物多样性数据库除了整合与公开分享外,还应鼓励并推� 展开更多
关键词 海洋生物 生物多样性信息学 数据库整合 分类信息 生态分布
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Adansonia digitata L.(baobab):a review of traditional information and taxonomic description 被引量:4
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作者 Jitin Rahul Manish Kumar Jain +5 位作者 Shishu Pal Singh Rakesh Kant Kama Anuradha Aliya Naz Anup Kumar Gupta Sujeet Kumar Mrityunjay 《Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine》 SCIE CAS 2015年第1期79-84,共6页
Adansonia digitata L.(Malvaceae) is commonly known as baobab tree native to Africa.Baobab is a multi-purpose tree which offers protection and provides food,clothing and medicine as well as raw material for many useful... Adansonia digitata L.(Malvaceae) is commonly known as baobab tree native to Africa.Baobab is a multi-purpose tree which offers protection and provides food,clothing and medicine as well as raw material for many useful items.The fruit pulp,seeds,leaves,flowers.roots,and bark of baobab are edible and they have been studied by scientists for their useful properties.The fruit pulp have very high vitamin C.calcium,phosphorus,carbohydrates,fibers,potassium,proteins and lipids content,which can be used in seasoning as an appetizer and also make juices.Seeds contain appreciable quantities of phosphorus,magnesium,zinc,sodium,iron,manganese,whereas they have high levels of lysine,thiamine,calcium and iron.Baobab has numerous biological properties including antimicrobial,anti-malarial,diarrhoea,anaemia,asthma,antiviral,anti-oxidant and anti-inflammatory activities amongst others.Phytochemical investigation revealed the presence of flavonoids.phytosterols.amino acids,fatty acids,vitamins and minerals.The review summarizes the information on various aspects of traditional information,taxonomic description,medicinal properties and importantly nutritional value. 展开更多
关键词 Adansonia digitata Baobab TRADITIONAL information taxonomic DESCRIPTION
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鲽形目分类信息分析系统的建立与实现 被引量:1
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作者 杨俊杰 张全启 +1 位作者 刘保忠 刘坤 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期59-65,共7页
鲽形目鱼类经济价值较高,进化史悠久复杂,形态构造呈特殊的不对称性,分类系统备受关注但至今尚未统一。本文通过创建专项数据库、标准化数据索引和流程化分类学功能模块,将鲽形目分类阶元系统、分类检索表、序列比对搜索、DNA条码检索... 鲽形目鱼类经济价值较高,进化史悠久复杂,形态构造呈特殊的不对称性,分类系统备受关注但至今尚未统一。本文通过创建专项数据库、标准化数据索引和流程化分类学功能模块,将鲽形目分类阶元系统、分类检索表、序列比对搜索、DNA条码检索、分子系统树和分类参考资料等分类学信息研究的各要素有机地融为一体,实现了对传统分类特征与分子序列特征的信息集成、关联、分析和应用,阐明了将数据搜索、挖掘、分析和通用查询等综合应用于分类检索系统的方法,建立了一种特定阶元的分类系统软件开发模式,开发了鲽形目分类信息分析系统。 展开更多
关键词 鲽形目 数据库 分类学信息 分类检索系统
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被毛孢属两个昆虫病原真菌的重新描述 被引量:1
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作者 瞿娇娇 邹晓 +3 位作者 郁建平 周家喜 周叶鸣 梁宗琦 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2615-2623,共9页
【目的】调查研究被毛孢属真菌资源,丰富该属的物种多样性,完善已知种在公共数据库中的分类信息。【方法】从贵州省发现两个分别寄生于同翅目沫蝉、鳞翅目松梢螟成虫的真菌标本GZUIFR-dj14和GZUIFR-dy1,通过形态学观察和基于tef1、ITS和... 【目的】调查研究被毛孢属真菌资源,丰富该属的物种多样性,完善已知种在公共数据库中的分类信息。【方法】从贵州省发现两个分别寄生于同翅目沫蝉、鳞翅目松梢螟成虫的真菌标本GZUIFR-dj14和GZUIFR-dy1,通过形态学观察和基于tef1、ITS和28S r DNA 3个基因序列的分子生物学系统发育分析对其进行鉴定。【结果】两个病原真菌被鉴定为两个已知种,分别为长白山被毛孢(Hirsutella changbeisanensis)和雷州被毛孢(Hirsutella leizhouensis)。【结论】重新描述了这两种被毛孢的标本和无性型分离菌株,对其新寄主、新栖息地进行了报道,并补充了分子序列、系统发育分析等分类信息。 展开更多
关键词 昆虫病原真菌 被毛孢属 分类研究 信息增补
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基于Perl脚本在NCBI网站自动或批量获取物种信息
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作者 李元 丰磊 +1 位作者 吴玲惠 舒青龙 《生物信息学》 2018年第3期170-177,共8页
根据物种学名、分类号、任意一段核酸或蛋白质的序列,判定其属于什么物种及其详细分类的信息如何,是生物信息分析的最为基础且重要的环节,但该过程的分析及结果的获取均为手动,费时费力且容易出错。本研究旨在解决如何在NCBI网站上自动... 根据物种学名、分类号、任意一段核酸或蛋白质的序列,判定其属于什么物种及其详细分类的信息如何,是生物信息分析的最为基础且重要的环节,但该过程的分析及结果的获取均为手动,费时费力且容易出错。本研究旨在解决如何在NCBI网站上自动或批量获取物种信息。通过解析NCBI在线BLAST结果及其网页源程序特点,利用Perl语言编写自动化脚本,以达到批量获取查询或比对结果的物种分类信息。本研究编写的Perl语言脚本可解决序列在NCBI在线比对后自动或批量获取物种的分类信息问题,适用于细菌、真菌、动物、植物等物种学名、分类号、核酸或蛋白质的任意序列,可以为同行生物数据分析提供参考。 展开更多
关键词 Perl脚本 基因序列 物种分类信息 NCBI
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非分类关系学习的粒计算模型研究 被引量:4
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作者 邱桃荣 黄海泉 +2 位作者 段文影 周石林 李向军 《南昌大学学报(工科版)》 CAS 2012年第3期273-278,共6页
以领域信息系统为研究对象,探讨学习非分类关系的粒计算模型。通过信息函数的扩展,给出了领域信息系统的形式化描述;研究了领域信息系统的粒化方法和领域概念粒度空间生成;对不同领域概念粒度空间,通过分析粒间上下文,提出了基于不同领... 以领域信息系统为研究对象,探讨学习非分类关系的粒计算模型。通过信息函数的扩展,给出了领域信息系统的形式化描述;研究了领域信息系统的粒化方法和领域概念粒度空间生成;对不同领域概念粒度空间,通过分析粒间上下文,提出了基于不同领域概念粒度空间的概念粒间交叉关系学习模型。示例与测试表明所提出的模型有助于实现领域本体的非分类关系的获取。 展开更多
关键词 关系学习 非分类关系 粒计算 信息粒
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交互分类信息系统和电子植物志的设计与实现──Ⅱ.分类排列和"系统学处理"软件系统
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作者 洪亚平 钟扬 陈之端 《武汉植物学研究》 CSCD 1998年第4期379-382,共4页
关键词 分类信息系统 系统学处理 电子植物志 植物志
全文增补中
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