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子宫内膜腺癌组织中miRNA的差异表达 被引量:5
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作者 刘霞 夏伟 +2 位作者 代荫梅 邵宁生 张为远 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第19期1365-1367,共3页
目的探讨miRNA在子宫内膜腺癌及其癌旁组织中的表达差异。方法收集子宫内膜腺癌患者癌灶和癌旁内膜组织,分别采用Trizol一步法提取总RNA,利用含有miRNA探针的芯片检测系统进行miRNA表达谱差异分析。结果子宫内膜腺癌与癌旁组织中111个... 目的探讨miRNA在子宫内膜腺癌及其癌旁组织中的表达差异。方法收集子宫内膜腺癌患者癌灶和癌旁内膜组织,分别采用Trizol一步法提取总RNA,利用含有miRNA探针的芯片检测系统进行miRNA表达谱差异分析。结果子宫内膜腺癌与癌旁组织中111个miRNA表达存在显著差异,其中腺癌组织中68个miRNA表达上调,43个表达下调。结论miRNA可能参与子宫内膜腺癌的发生发展过程,这为进一步揭示子宫内膜腺癌发生的分子机制提供了依据。 展开更多
关键词 子宫内膜腺癌 MIRNA MIRNA芯片
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遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNAs的筛选 被引量:3
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作者 田晰晰 珠珠 +5 位作者 黄鉴 任俊宇 王跃 张楠 陈明清 董坚 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2013年第11期1040-1045,共6页
目的:应用microRNA(miRNA)芯片筛选及qRT-PCR技术检测可作为遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNAs.方法:选取4个遗传性非息肉性大肠癌患者及3个无家族史正常人的血清miRNAs进行miRNA芯片检测,再用q-PCR方法对于芯片结果进行验证... 目的:应用microRNA(miRNA)芯片筛选及qRT-PCR技术检测可作为遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNAs.方法:选取4个遗传性非息肉性大肠癌患者及3个无家族史正常人的血清miRNAs进行miRNA芯片检测,再用q-PCR方法对于芯片结果进行验证.结果:miRNA芯片筛查出57个上调及30个下调miRNAs,在这些差异性表达的miRNAs中选出8个较为理想的miRNAs作进一步研究,运用3个靶基因预测软件预测靶基因后取交集,得到294个靶基因,均是属于mir-20a-5p,mir-548b-5p和mir-548as-3p的靶基因.用qPCR的方法在标本中进行验证发现mir-548as-3p的表达情况符合芯片结果-在遗传性非息肉性大肠癌患者血清中表达上调.结论:血清miRNAs在遗传性非息肉性大肠癌患者中的差异性表达,mir-548as-3p可能为遗传性非息肉性大肠癌非侵入性的生物标志物. 展开更多
关键词 血清micrornas micrornas芯片 遗传性非息肉性大肠癌 生物标志物
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结直肠癌组织中miRNA的差异表达研究 被引量:3
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作者 严秀蕊 王立斌 +1 位作者 李玉奎 杨银学 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期295-298,共4页
目的:寻找并鉴定在结直肠癌及癌旁正常组织中差异表达的miRNA,为进一步阐明其在结直肠癌发生、发展机制中的作用奠定实验基础。方法:收集10例新鲜的结直肠癌及癌旁正常组织,抽提总RNA,利用miRNA芯片技术寻找结直肠癌及癌旁正常组织中差... 目的:寻找并鉴定在结直肠癌及癌旁正常组织中差异表达的miRNA,为进一步阐明其在结直肠癌发生、发展机制中的作用奠定实验基础。方法:收集10例新鲜的结直肠癌及癌旁正常组织,抽提总RNA,利用miRNA芯片技术寻找结直肠癌及癌旁正常组织中差异表达的miRNA,并通过real-time PCR技术进行验证。结果:与结直肠癌旁正常组织相比,结直肠癌组织中上调2.3倍以上的miRNA有32个,下调2倍以上的miRNA有10个;real-time PCR结果与miRNA芯片结果较吻合。结论:筛选得到结直肠癌miRNA差异表达谱,其可能与结直肠癌的发生、发展相关。 展开更多
关键词 MIRNA芯片 结直肠癌 micrornas
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Duplex micro RNAs assay based on target-triggered universal reporter hybridization 被引量:1
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作者 Yinan Wang Yue Sun +1 位作者 Choiwan Lau Jianzhong Lu 《Journal of Pharmaceutical Analysis》 SCIE CAS CSCD 2018年第4期265-270,共6页
In this paper, we designed and evaluated a duplex detection strategy for micro RNAs(mi RNAs) using universal probe-based target-triggered double hybridization and fluorescent microsphere-based assay system(x MAP ar... In this paper, we designed and evaluated a duplex detection strategy for micro RNAs(mi RNAs) using universal probe-based target-triggered double hybridization and fluorescent microsphere-based assay system(x MAP array). In the absence of target mi RNA, reporter DNA cannot hybridize stably with the immobilized capture DNA due to its low melting temperature. Only after adding target mi RNA, can reporter probe hybridize with capture probe to form a stable three-component complex. This targettriggered stable hybridization makes this method possible for highly selective and sensitive detection of multiple mi RNAs. We exemplified a quantitative detection of duplex mi RNAs with a limit of detection of40 p M. The x MAP array platform holds the potential of extending this approach to simultaneous detection of up to 100 mi RNA targets. Considering the simplicity, rapidity and multiplexing, this work promised a potential detection of multiple mi RNA biomarkers for early disease diagnosis and prognosis. 展开更多
关键词 xMAP array Multiple micrornas Target-triggered Universal reporter
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Modulation of a Specific Pattern of microRNAs, Including miR-29a, miR-30a and miR-34a, in Cultured Human Skin Fibroblasts, in Response to the Application of a Biofunctional Ingredient that Protects against Cellular Senescence <i>in Vitro</i> 被引量:1
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作者 Xianghong Yan Catherine Serre +4 位作者 Laurine Bergeron Ludivine Mur Valère Busuttil Jean-Marie Botto Nouha Domloge 《Journal of Cosmetics, Dermatological Sciences and Applications》 2015年第4期332-342,共11页
Skin aging is a process of structural and compositional remodeling that can be manifested by wrinkling and sagging. Remarkably, the dermis plays a dominant role in the aging process. Recent studies suggest that microR... Skin aging is a process of structural and compositional remodeling that can be manifested by wrinkling and sagging. Remarkably, the dermis plays a dominant role in the aging process. Recent studies suggest that microRNAs are implicated in the regulation of gene expression during aging. However, studies about age-related microRNAs and how they modulate skin aging remain limited. In the present work, a complex of hydrolyzed natural yeast proteins (Saccharomyces cerevisiae) and hydrolyzed natural soya bean was developed and showed the ability to modulate the expression of telomere-binding protein TRF2, which is a key factor for telomere protection and to prevent cellular senescence in vitro and DNA damage. The aim of the study was to identify microRNAs specifically modulated after application of the ingredient complex to cultured fibroblasts, and their possible involvement in remodeling of the human extracellular matrix and fibroblast senescence. Consequently, human skin fibroblasts were cultured and treated with 1% of the ingredient complex for 48 h before analyzing microRNA modulation by RT-qPCR. The use of bioinformatics allowed us to predict the target genes for modulated microRNAs. Results show that the ingredient complex modulated a pattern of microRNAs including the down-regulation of miR-29a-3p, miR-30a-5p and miR-34a-5p, which are associated with fibroblast senescence and remodeling of the human dermal extracellular matrix. In conclusion, our results indicate that miR-29a-3p, miR-30a-5p and miR-34a-5p possibly represent key microRNAs that impact human fibroblast senescence and remodeling of the dermal extracellular matrix. 展开更多
关键词 micrornas qPCR array SKIN Fibroblasts SKIN Senescence TELOMERE Extracellular Matrix SIRTUIN 1 Collagen
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HCV核心蛋白对HepG2细胞microRNA表达谱的影响 被引量:1
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作者 吴燕 曹炬 +2 位作者 黄世峰 文阳安 张莉萍 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2012年第6期618-622,共5页
目的分析HCV核心蛋白(HCV-Core)对HepG2细胞microRNA表达谱的影响。方法将构建好的重组真核表达质粒pCDNA3.1(+)/HCV-Core用脂质体转染HepG2细胞,经G418筛选得到稳定转染HCV-Core的HepG2细胞,命名为HepG2-HCV Core细胞系。然后用反转录... 目的分析HCV核心蛋白(HCV-Core)对HepG2细胞microRNA表达谱的影响。方法将构建好的重组真核表达质粒pCDNA3.1(+)/HCV-Core用脂质体转染HepG2细胞,经G418筛选得到稳定转染HCV-Core的HepG2细胞,命名为HepG2-HCV Core细胞系。然后用反转录聚合酶链反应(RT-PCR),细胞免疫荧光和Western blot对HCV核心蛋白在HepG2细胞里mRNA和蛋白水平的表达情况进行验证。利用博奥生物公司的miRNA Array基因芯片,分析稳定表达HCV核心蛋白的HepG2细胞和转染空质粒pCDNA3.1(+)的HepG2细胞二者microRNA表达谱的差异,最后用Taqman探针荧光定量PCR法进行验证。结果感染HCV-Core后,HepG2细胞表达有差异的microR-NA有8种,用Taqman探针荧光定量PCR法进行分析,发现HCV核心蛋白可以上调miR-29、miR-146a、miR-149、miR-192、miR-221、miR-222和miR-193b,下调miR-196a。结论 HCV核心蛋白可以诱导肝细胞microRNA表达谱发生改变,在肝癌发生发展过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 HCV核心蛋白 HEPG2细胞 micrornas 基因芯片
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大鼠成骨细胞微小RNAs的筛选研究 被引量:2
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作者 潘欣 曾思良 +6 位作者 梁兴伦 嵇承栋 周文博 周文锐 李琛 朱敏洁 沈琪 《转化医学杂志》 2017年第2期68-73,共6页
目的应用微小RNAs(microRNAs,miRNAs)芯片技术筛选补肾方含药血清干预大鼠成骨细胞后差异表达的miRNAs,与前期获得的软骨细胞差异miRNAs比较,筛选出共有差异miRNAs,以探讨补肾方通过共有miRNAs调控靶基因表达发挥治疗效应的机制。方法... 目的应用微小RNAs(microRNAs,miRNAs)芯片技术筛选补肾方含药血清干预大鼠成骨细胞后差异表达的miRNAs,与前期获得的软骨细胞差异miRNAs比较,筛选出共有差异miRNAs,以探讨补肾方通过共有miRNAs调控靶基因表达发挥治疗效应的机制。方法原代培养的大鼠成骨细胞经碱性磷酸酶染色、Ⅰ型胶原免疫荧光染色和矿化结节染色鉴定后,用补肾方含药血清干预成骨细胞,在给定时间点收获细胞,抽提纯化总RNAs行miRNAs芯片检测,并挑选差异表达4倍以上的miRNAs行实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应验证。结果所培养的原代细胞具有典型的成骨细胞形态和功能,碱性磷酸酶染色、Ⅰ型胶原免疫荧光染色和矿化结节染色均为阳性。与补肾方含药血清干预成骨细胞1 d相比,干预6 d的共有229个2倍以上表达差异的miRNAs,其中上调的52个、下调的177个。差异表达4倍以上的miRNAs实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应结果与芯片数据一致。与前期软骨细胞差异miRNAs芯片数据比较,miRNAs均上调2倍以上的有8个、下调4倍以上的2个。结论补肾方含药血清干预成骨细胞获得了一套较为特异的miRNAs,初步预测上调的miRNAs可能通过靶向Runx2、Wnt、Notch、Axin2等基因在骨发育、骨形态发生、骨吸收以及软骨内成骨形成等相关的信号通路中发挥作用。 展开更多
关键词 补肾方 成骨细胞 微小RNAs芯片 差异表达 大鼠
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原发性IgA肾病中微小RNA的差异表达研究
8
作者 眭维国 蓝慧娟 +6 位作者 晏强 邹贵勉 李飞 郑艺花 黄河 陈洁晶 戴勇 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期265-268,共4页
目的借助微小RNA(microRNA,miRNA)芯片研究IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)中miRNA的差异表达。方法收集11例IgAN患者肾穿标本作为IgAN组,3例镜下病理检查正常的肾皮质作为对照组。使用Trizol试剂提取每组总RNA,分离miRNA,采用miRNA芯片... 目的借助微小RNA(microRNA,miRNA)芯片研究IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)中miRNA的差异表达。方法收集11例IgAN患者肾穿标本作为IgAN组,3例镜下病理检查正常的肾皮质作为对照组。使用Trizol试剂提取每组总RNA,分离miRNA,采用miRNA芯片筛选出差异表达显著的miRNA,荧光实时定量PCR(Real-timePCR)技术验证芯片结果的可靠性。结果IgAN组中miRNA表达出现显著差异的有66个,其中表达显著上调35个,显著下调31个。挑选hsa-miR-637、hsa-miR-492进行Real-timePCR相对定量检测,结果显示2个miRNA的表达趋势与芯片结果相符,证明了芯片结果的可靠性。结论IgAN是一种经典的多因素、多基因病,本实验通过芯片技术表明miRNA在IgAN中出现显著差异表达。 展开更多
关键词 微小RNA表达 微小RNA芯片 IGA肾病
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Ⅳ和Ⅳ+Ⅴ型狼疮性肾炎患者血清microRNA标志物的芯片初筛 被引量:1
9
作者 张志恒 肖红波 +2 位作者 王琪 王艳 熊祖应 《重庆医学》 CAS 北大核心 2015年第27期3745-3747,3751,共4页
目的应用微小核糖核酸(microRNA)芯片技术初步筛选Ⅳ、Ⅳ+Ⅴ型狼疮性肾炎患者血清microRNA,探讨血清microRNA在狼疮性肾炎病理分型中的作用。方法从北京大学深圳医院肾内科生物标本库中选取Ⅳ、Ⅳ+Ⅴ型狼疮性肾炎血清各4例,作为试验组;... 目的应用微小核糖核酸(microRNA)芯片技术初步筛选Ⅳ、Ⅳ+Ⅴ型狼疮性肾炎患者血清microRNA,探讨血清microRNA在狼疮性肾炎病理分型中的作用。方法从北京大学深圳医院肾内科生物标本库中选取Ⅳ、Ⅳ+Ⅴ型狼疮性肾炎血清各4例,作为试验组;同时选取4例健康人血清作为对照组,使用microRNA芯片技术筛选差异表达的血清microRNA。结果Ⅳ型和Ⅳ+Ⅴ型共有部分microRNA,其中22个有显著差异,Ⅳ型特异性microRNA有29个,Ⅳ+Ⅴ型特异性microRNA有3个。结论血清microRNA具有作为鉴别Ⅳ、Ⅳ+Ⅴ型狼疮性肾炎生物标志物的潜能。 展开更多
关键词 狼疮肾炎 肾脏病理分型 微RNAS microrna芯片
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类风湿性关节炎患者循环microRNAs生物标志物的筛选及鉴定
10
作者 彭武建 王红蕾 +1 位作者 黄建溶 戴勇 《温州医科大学学报》 CAS 2016年第5期335-339,共5页
目的:分析类风湿性关节炎(RA)患者血浆中差异表达的microRNAs(miRNAs)。方法:采用mi RNA芯片检测、筛选RA患者与正常人血浆中表达有显著变化的miRNAs,并采用RT-q PCR技术对芯片数据进行验证。数据处理采用Gene Spring GX软件,t检验和方... 目的:分析类风湿性关节炎(RA)患者血浆中差异表达的microRNAs(miRNAs)。方法:采用mi RNA芯片检测、筛选RA患者与正常人血浆中表达有显著变化的miRNAs,并采用RT-q PCR技术对芯片数据进行验证。数据处理采用Gene Spring GX软件,t检验和方差分析用于统计学分析。结果:RA患者与正常人间存在差异的循环mi RNAs共有40个,其中18个上调,22个下调。根据循环miRNAs在芯片中表达差异的倍数和潜在的生物学价值,选取4个miRNAs进行RT-q PCR验证,候选的miRNAs与正常对照间差异有统计学意义(P<0.05),证实芯片结果可靠性。结论:RA患者体内具有差异表达的循环miRNAs,这些循环miRNAs可作为一种潜在的RA候选生物标志物。 展开更多
关键词 类风湿性关节炎 微小RNA 芯片 生物标志物
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瑞舒伐他汀对急性冠脉综合征患者CD4^+T淋巴细胞miRNA表达的影响 被引量:10
11
作者 谈红 陈瑞敏 +3 位作者 李晓燕 张红明 杨永耀 陈英剑 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期99-104,共6页
目的研究瑞舒伐他汀对急性冠脉综合征(ACS)患者外周血CD4+T淋巴细胞基因中微小RNA(miRNA)表达谱的影响,探讨瑞舒伐他汀钙治疗ACS的机制。方法选取2012年3-7月入住济南军区总医院的9例ACS患者,另以因疑似不典型冠心病症状而行320CT示冠... 目的研究瑞舒伐他汀对急性冠脉综合征(ACS)患者外周血CD4+T淋巴细胞基因中微小RNA(miRNA)表达谱的影响,探讨瑞舒伐他汀钙治疗ACS的机制。方法选取2012年3-7月入住济南军区总医院的9例ACS患者,另以因疑似不典型冠心病症状而行320CT示冠脉病变≤50%的住院患者9例作为正常对照组。利用密度梯度法离心分离ACS患者及对照者的外周血单核细胞,免疫磁珠法进一步分离出CD4+T淋巴细胞。采用miRNA基因芯片技术检测CD4+T淋巴细胞miRNA的表达谱,筛选ACS患者与正常对照组,以及ACS患者用药前后差异表达的miRNA。选取其中差异性最为显著的3个miRNA,采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)对差异表达的miRNA进行验证。结果通过基因芯片共检测基因1900余条,其中有差异的有300余条。与正常对照比较,ACS患者中显著上调的基因有126条,如miRNA-21、miRNA-142、miRNA-20a等,显著下调的基因有202条,如miRNA-4734、miRNA-1182、miRNA1273f等。ACS患者服用瑞舒伐他汀钙(20mg,1次/d)10d后,与用药前相比,显著上调的基因有157条,如miRNA-4734、miRNA-1182、miRNA-663b等,显著下调的基因有137条,如miRNA-4789、miRNA-5692c、miRNA-26a等。采用RT-PCR进一步验证,结果与miRNA芯片检测结果一致。结论瑞舒伐他汀钙可能通过调节miRNA-4734、miRNA-1182、miRNA-4789等miRNA的表达从而发挥其对ACS的治疗作用。 展开更多
关键词 微RNAS 急性冠脉综合征 瑞舒伐他汀 寡核苷酸序列分析
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蛇床子素通过上调微RNA-101a-3p抑制阿尔茨海默病细胞淀粉样前体蛋白表达 被引量:8
12
作者 蔺莹 姚璎珈 +6 位作者 梁喜才 时悦 孔亮 肖洪贺 吴雨桐 倪颖男 杨静娴 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期473-479,共7页
目的:研究阿尔茨海默病细胞模型中蛇床子素抑制淀粉样前体蛋白(APP)的作用及机制。方法:脂质体2000转染建立APP高表达的SH-SY5Y细胞模型。利用MTT和乳酸脱氢酶(LDH)法检测蛇床子素对APP高表达细胞的存活率和损伤程度的影响。利用基因芯... 目的:研究阿尔茨海默病细胞模型中蛇床子素抑制淀粉样前体蛋白(APP)的作用及机制。方法:脂质体2000转染建立APP高表达的SH-SY5Y细胞模型。利用MTT和乳酸脱氢酶(LDH)法检测蛇床子素对APP高表达细胞的存活率和损伤程度的影响。利用基因芯片技术筛选给予蛇床子素治疗后差异表达的微RNA(miRNA),然后通过生物信息学分析预测与差异表达miRNA靶向结合的基因。细胞内转入差异表达miRNA的抑制剂,然后采用免疫荧光细胞化学法观察细胞中APP、β淀粉样蛋白(Aβ)表达情况,RT-PCR法检测细胞中APP mRNA表达。结果:实验成功构建了APP高表达的阿尔茨海默病细胞模型。MTT和LDH法检测结果显示,蛇床子素对于APP高表达的细胞具有一定的保护作用,可以减轻细胞的损伤。miRNA-101a-3p是蛇床子素调控较明显的miRNA,其与APP的3'非翻译区靶向结合。与模型对照组比较,miR-101a-3p抑制剂组APP和Aβ蛋白荧光强度增加,APP mRNA表达量增加(均P<0.01);加入蛇床子素后细胞中APP和Aβ蛋白荧光强度降低,APP mRNA表达量减少(均P<0.01)。结论:在阿尔茨海默病细胞模型中,蛇床子素通过上调miR-101a-3p抑制APP表达。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 蛇床子素/药理学 微RNAs 淀粉样Β蛋白前体 蛋白质阵列分析 芯片分析技术
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肾母细胞瘤细胞株与正常胚肾细胞株微小RNA表达谱的差异分析 被引量:7
13
作者 王家祥 胡倩 +1 位作者 刘秋亮 韦源 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第26期1845-1848,共4页
目的 探讨肾母细胞瘤G401与正常胚肾CCC-HEK-1细胞株中微小RNA(miRNA)分子表达谱的差异,为进一步研究相关miRNA在肾母细胞瘤发病机制中的作用奠定基础.方法 选取G401和CCC-HEK-1的各3个样本分别作为实验组和对照组,采用miRNA芯片筛选... 目的 探讨肾母细胞瘤G401与正常胚肾CCC-HEK-1细胞株中微小RNA(miRNA)分子表达谱的差异,为进一步研究相关miRNA在肾母细胞瘤发病机制中的作用奠定基础.方法 选取G401和CCC-HEK-1的各3个样本分别作为实验组和对照组,采用miRNA芯片筛选两者之间差异表达的miRNA,样品间表达变化标准以上调2倍/下调50.0%作为阈值范围,并用实时定量PCR验证miRNA芯片结果的可靠性.结果 上调超过2倍差异表达miRNA分子71个,其中上调超过8倍差异表达miRNA分子11个;其中下调至50.0%以下差异表达miRNA分子59个,其中下调至12.5%以下差异表达miRNA分子11个.总体上,G401和CCC-HEK-1之间差异表达显著.结论 G401和CCC-HEK-1之间存在差异表达miRNA分子,它们可能与肾母细胞瘤的形成有关. 展开更多
关键词 WILMS瘤 微RNAS 寡核苷酸序列分析
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扶正化瘀方调节差异微小RNAs表达的抗肝纤维化的作用机制 被引量:7
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作者 王清兰 陶艳艳 +2 位作者 吕靖 刘平 刘成海 《临床肝胆病杂志》 CAS 2016年第3期503-508,共6页
目的筛选出扶正化瘀方(FZHY)调控的差异微小RNAs(miRNAs),并对这些差异miRNAs进行生物功能分析,部分揭示FZHY抗肝纤维化的作用机制。方法 CCl4皮下注射制备小鼠肝纤维化模型,分为正常组、模型组及FZHY组;自造模前3 d开始给药,1次/d,共8... 目的筛选出扶正化瘀方(FZHY)调控的差异微小RNAs(miRNAs),并对这些差异miRNAs进行生物功能分析,部分揭示FZHY抗肝纤维化的作用机制。方法 CCl4皮下注射制备小鼠肝纤维化模型,分为正常组、模型组及FZHY组;自造模前3 d开始给药,1次/d,共8周。天狼星红染色及羟脯氨酸(Hyp)含量测定观察肝组织胶原沉积。应用miRNAs芯片检测各组小鼠肝脏miRNAs表达谱。基于miRNAs表达谱筛选出正常组、FZHY组与模型组具有相同变化趋势的差异miRNAs,即FZHY调控的miRNAs,并以qRT-PCR进行验证。采用Target Scan及PITA数据库对miRNAs靶基因进行预测,并采用DAVID数据库对这些预测的靶基因进行功能分析及信号通路分析,发现其调控的显著性功能及信号通路。多组间比较采用方差分析,miRNA差异基因筛选采用随机方差模型的t检验。结果 FZHY可明显降低纤维化肝组织Hyp含量,减轻胶原沉积。miRNAs芯片分析共发现3个FZHY调控的miRNAs,分别为:mmu-miR-322、mmu-miR-342-3p和mmu-miR-296-5p。信号通路分析共得到32条这些miRNAs可能调控的信号通路,其中趋化因子信号通路、黏着斑、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肌动蛋白细胞骨架调节、间隙连接、细胞外基质蛋白相互作用、Wnt信号通路、Jak-STAT信号通路等与肝纤维化密切相关;功能富集分析共得到32项显著性功能,其中三磷酸尿苷(GTP)酶活性调节、细胞连接、凋亡调节、Ras蛋白信号转导调节及小GTP酶活性调节等与肝纤维化密切相关。结论下调miR-322,miR-342-3p及miR-296-5p表达,从而调节这些miRNAs对应的相关功能,如MAPK信号通路、Wnt信号通路、凋亡调节及Ras蛋白信号转导调节等可能是扶正化瘀方抗肝纤维化的作用机制,值得进一步研究。 展开更多
关键词 肝硬化 扶正化瘀方 微RNAS 寡核苷酸序列分析
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应用基因芯片检测喉鳞状细胞癌甲醛固定石蜡包埋组织microRNA表达谱 被引量:6
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作者 李琳 张宗敏 +8 位作者 刘宇 魏明辉 薛丽燕 邹霜梅 邸雪冰 韩迺珺 张开泰 徐震纲 高燕宁 《中华病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期391-395,共5页
目的 建立以甲醛固定石蜡包埋组织为材料、基于基因芯片技术的microRNA(miRNA)表达谱的分析方法 ;筛选与喉鳞状细胞癌(简称喉癌)生物学特征密切相关的差异表达miRNA.方法 从喉癌甲醛固定石蜡包埋组织中制备总RNA,经质量鉴定后进行... 目的 建立以甲醛固定石蜡包埋组织为材料、基于基因芯片技术的microRNA(miRNA)表达谱的分析方法 ;筛选与喉鳞状细胞癌(简称喉癌)生物学特征密切相关的差异表达miRNA.方法 从喉癌甲醛固定石蜡包埋组织中制备总RNA,经质量鉴定后进行荧光标记.采用Agilent公司的容纳723条人类miRNA探针的基因芯片完成杂交实验,以获得喉癌的miRNA表达谱.以GeneSpring GX和R-Project软件处理分析基因芯片实验数据,筛选与喉癌转移相关的差异表达miRNA.结果 从24例甲醛固定石蜡包埋组织标本中获得了符合基因芯片实验质量标准的RNA样品,并完成了基因芯片杂交及数据分析.从中共鉴定到319个miRNA,有96个miRNA在24例喉癌中均有表达,其中与淋巴结转移密切相关的(检错率〈0.05)差异表达miRNA有5个,分别为miR-23a* 、miR-28-5p、miR-15a、miR-16和miR-425.结论 甲醛固定石蜡包埋组织可以提供符合基因芯片分析质量要求的miRNA,是研究miRNA的重要样品资源.从喉癌的miRNA表达谱中筛选出的转移相关差异表达miRNA(miR-23a*、miR-28-5p、miR-15a、miR-16和miR-425)有可能成为评估喉癌转移风险的新型分子标志. 展开更多
关键词 喉肿瘤 鳞状细胞 肿瘤转移 微RNAS 寡核苷酸序列分析
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发热伴血小板减少综合征病毒感染者血清microRNA表达谱分析 被引量:3
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作者 潘玉宁 顾宏伟 +5 位作者 祁贤 李志锋 鲍倡俊 宋勇春 汤奋扬 周明浩 《国际病毒学杂志》 2013年第5期198-202,共5页
目的 了解发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)感染急性期患者血清microRNAs (miRNAs)的表达谱,鉴定与病毒感染或宿主免疫应答相关miRNAs.方法 采用TaqMan低密度芯片获得血清miRN... 目的 了解发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)感染急性期患者血清microRNAs (miRNAs)的表达谱,鉴定与病毒感染或宿主免疫应答相关miRNAs.方法 采用TaqMan低密度芯片获得血清miRNA的表达谱,分析患者与正常人miR-NA的表达差异,鉴定与病毒感染或免疫相关的miRNA,最后用实时定量RT-PCR对部分miRNA进行验证.结果 TLDA芯片结果显示,与正常人血清相比,SFTS血清表达上调超过2倍的miRNA有117个,表达下调超过2倍的miRNA有30个.在表达差异较为明显的miRNA中,病毒感染或免疫相关miRNA有23个.对6个miRNA的表达进行定量RT-PCR验证,其中miR-155,miR-126,miR-15b,miR-19b与芯片结果一致.结论 通过TaqMan低密度芯片获得了SFTS病毒感染者血清miRNA的表达谱,其中部分miRNA与病毒感染或免疫相关. 展开更多
关键词 发热伴血小板减少综合征病毒 血清 micrornas 低密度芯片
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微小RNA芯片检测高糖环境下人视网膜微血管内皮细胞微小RNA的差异表达 被引量:4
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作者 李青兰 吕红彬 苟文军 《中华眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期604-609,共6页
目的筛选高糖环境下人视网膜微血管内皮细胞(HRCEC)差异表达的微小RNA(miRNA),并预测部分差异表达的miRNA调控的靶基因。方法实验研究。常规培养HRCEC,取生长良好的第3~4代HRCEC,将细胞分为3组:(1)正常对照组:培养液为DMEM... 目的筛选高糖环境下人视网膜微血管内皮细胞(HRCEC)差异表达的微小RNA(miRNA),并预测部分差异表达的miRNA调控的靶基因。方法实验研究。常规培养HRCEC,取生长良好的第3~4代HRCEC,将细胞分为3组:(1)正常对照组:培养液为DMEM高糖培养液,含25mmoVL葡萄糖;(2)高糖组:培养液为条件培养液,含90mmol/L葡萄糖;(3)甘露醇高渗对照组:培养液为条件培养液,含65mmoVL甘露醇+25mmoVL葡萄糖。各组细胞在上述条件下培养5d后,用细胞凋亡检测试剂盒对细胞进行凋亡检测;提取细胞的总RNA并进行质量检测;miRNA芯片检测差异表达的miRNA,并用实时荧光定量PCR对部分差异表达的miRNA进行验证,运用生物信息学方法预测它们可能调控的靶基因。结果在荧光显微镜下观察细胞凋亡结果显示,正常对照组及甘露醇高渗对照组细胞的细胞核被4′,6-二脒基-2-苯基吲哚染色而呈蓝色荧光,但无凋亡荧光信号;高糖组细胞的细胞核也呈蓝色荧光,但有绿色的凋亡荧光信号。总RNA的质量检测结果显示,用分光光度计测量正常对照组细胞吸光度值(A)的比值,A260/A280=1.99、A260/A230=2.05;高糖组细胞A260/A280=1.98、A260/A230=2.26。甲醛变性琼脂糖凝胶电泳见电泳条带清晰完整,表明获得的总RNA质量较好且纯度高。miRNA芯片检测结果显示,与正常对照组相比,在高糖组一共筛选出49个差异表达的miRNAs(上调〉2倍或下调〈0.5倍),其中表达上调的miRNAs31个,表达下调的miRNAs18个。对miRNA芯片检测结果显示在正常对照组和高糖组间表达有差异的has—miR-320c和has—miR-9a^*进行实时荧光定量PCR验证,结果与芯片结果一致;对这两个miRNAs进行靶基因预测,结果显示这两个基因涉及很多生长因子和蛋白。结论部分miRNA在高糖刺激下的HRCEC中存在差异性表达。 展开更多
关键词 视网膜血管 内皮细胞 微RNAS 寡核苷酸序列分析
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胃癌外周血微小核糖核酸表达谱的初步分析 被引量:3
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作者 顾玮 胡梅洁 +3 位作者 孙颖 王吉 胡晓莹 马瑾 《中华消化杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期222-225,共4页
目的研究胃癌患者外周血微小核糖核酸(miRNA)的表达,初步建立胃癌特征性的循环miRNA表达谱,为深入研究miRNA与胃癌发生、发展并寻找新的分子标志物提供依据。方法选取6例胃癌患者和6例健康体检者,提取外周血总RNA,进行miRNA表达... 目的研究胃癌患者外周血微小核糖核酸(miRNA)的表达,初步建立胃癌特征性的循环miRNA表达谱,为深入研究miRNA与胃癌发生、发展并寻找新的分子标志物提供依据。方法选取6例胃癌患者和6例健康体检者,提取外周血总RNA,进行miRNA表达谱检测和生物信息学分析,采用实时定量PCR技术对芯片检测结果进行验证,对筛选出的显著差异表达miRNA的靶基因进行预测。结果胃癌组与对照组对比共有54个差异表达miRNA,其中表达上调的miRNA为35个(miRNA-504、miRNA-183、miRNA-938、miRNA-1285、miRNA-576—3p、miRNA-663等),表达下调的miRNA为19个(miRNA-433、miRNA-193b、miRNA-329、miRNA-409—3p、miRNA-154等)。实时定量PCR对其中2个上调miRNA(miRNA-504和miRNA-183)和2个下调miRNA(miRNA-433和miRNA-193b)的验证结果与芯片检测结果间具有较好的一致性。结论胃癌患者外周血中具有特异性的miRNA表达谱,这些差异表达的miRNA有可能成为新的胃癌诊断分子标志物。 展开更多
关键词 微小核糖核酸 胃肿瘤 寡核苷酸序列分析 基因表达 聚合酶链反应
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miR-224和miR-378e在大肠癌组织中的表达及其临床意义 被引量:3
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作者 高利飞 田延锋 +3 位作者 赵增仁 张丽静 贺新奇 裴永彬 《天津医药》 CAS 北大核心 2013年第8期737-739,共3页
目的探讨miR-224和miR-378e在原位大肠癌癌组织和癌旁正常黏膜组织中的表达差异,并分析其临床意义。方法 miRNA表达谱芯片技术检测大肠癌癌组织和癌旁组织标本中表达差异的miRNA,运用荧光实时定量聚合酶链反应(real-time PCR)验证其结果... 目的探讨miR-224和miR-378e在原位大肠癌癌组织和癌旁正常黏膜组织中的表达差异,并分析其临床意义。方法 miRNA表达谱芯片技术检测大肠癌癌组织和癌旁组织标本中表达差异的miRNA,运用荧光实时定量聚合酶链反应(real-time PCR)验证其结果,并分析其与临床病理资料之间的关系。结果 miRNA表达芯片分析发现,与正常黏膜组织比较,miR-224在大肠癌组织中表达显著上调,miR-378e在大肠癌组织中表达显著下调,并被real-time PCR所证实。miR-224在不同组织学类型癌组织中表达差异有统计学意义,miR-378e在不同浸润深度癌组织中表达差异有统计学意义,miR-224表达与组织学类型有关,miR-378e表达与大肠癌浸润深度有关。结论 miR-224具有潜在的癌基因作用,miR-378e具有潜在的抑癌基因作用,miR-224和miR-378e可作为潜在的大肠癌分子标志物。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 微RNAS 寡核苷酸序列分析 聚合酶链反应 miR-224 miR-378e
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肝细胞癌患者外周血单个核细胞诊断候选基因的筛选及其调控网络分析 被引量:2
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作者 伦永志 孙杰 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期148-157,共10页
目的:通过筛选肝细胞癌(HCC)患者外周血单个核细胞(PBMC)诊断候选基因并分析其上游互作微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状(circRNA)和参与的通路,探讨HCC发生、发展过程中的调控机制并寻找可用于临床诊疗的分子靶点。方法:利... 目的:通过筛选肝细胞癌(HCC)患者外周血单个核细胞(PBMC)诊断候选基因并分析其上游互作微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状(circRNA)和参与的通路,探讨HCC发生、发展过程中的调控机制并寻找可用于临床诊疗的分子靶点。方法:利用GEO数据库筛选HCC患者PBMC中的差异表达基因集,分别进行功能富集及互作分析,继而利用网络模块划分方法寻找差异表达基因中的诊断候选基因,再利用mirDIP、starBase在线工具对诊断候选基因的上游miRNA、lncRNA、circRNA进行预测。结果:获得高可信度的差异表达基因265个,差异表达基因主要富集于增殖调控、代谢调节、细胞通信、炎症疾病等功能,基因本体及KEGG通路富集结果相互关联。筛选获得4个诊断候选基因,包括RNA结合蛋白FUS、C-X-C基序趋化因子配体8、卡林蛋白和RNA聚合酶Ⅱ亚单位H。预测到10个miRNA、1个lncRNA和38个circRNA符合筛选标准,最后构建出一个lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA-通路调控网络。结论:本研究基于数据挖掘方法筛选获得HCC患者PBMC中的诊断候选基因及其调控网络,为HCC的早期诊断和合理治疗提供了理论依据,有助于寻找新的肿瘤标志物。 展开更多
关键词 肝细胞/病理学 白细胞 单核/代谢 微RNAs 基因 基因表达谱 寡核苷酸序列分析 基因表达调控 肿瘤 计算机通信网络 自动数据处理
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