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DNA甲基化作用与鼠肝细胞的老化 被引量:8
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作者 何忠效 王治平 +2 位作者 王秀奇 马晴 吴志奎 《生物化学杂志》 CSCD 1994年第1期16-20,共5页
本文比较了不同年龄的鼠肝DNA甲基化酶活力及DNA甲基化水平,发现它们均与鼠龄呈反相关。又以不同年龄的鼠肝DNA为模板,检验了其体外转录活力,发现其与鼠龄呈正相关。
关键词 DNA 甲基化 肝细胞 老化
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白菜DNA甲基化水平的反相离子对高效液相色谱法研究 被引量:4
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作者 吴筱丹 王华 楼健 《理化检验(化学分册)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期5-6,10,共3页
建立了反相离子对液相色谱测定白菜的DNA甲基化水平的方法。采用的色谱柱为HypersilBDSC18柱(200mm×4.0mm,5μm),以pH4.0的甲醇-5mmol·L-1庚烷磺酸钠-三乙胺(10:90:0.2,体积比)的混合液为流动相,UV检测器波长为273nm。通过测... 建立了反相离子对液相色谱测定白菜的DNA甲基化水平的方法。采用的色谱柱为HypersilBDSC18柱(200mm×4.0mm,5μm),以pH4.0的甲醇-5mmol·L-1庚烷磺酸钠-三乙胺(10:90:0.2,体积比)的混合液为流动相,UV检测器波长为273nm。通过测定DNA水样所产生的胞嘧啶和甲基胞嘧啶的含量,即可得知DNA甲基化程度。胞嘧啶和甲基胞嘧啶回收率分别为99.6%及103.3%,RSD为3.7%(日内)及5.2%(日间)。 展开更多
关键词 反相-离子对 HPLC DNA 甲基化水平 白菜 胞嘧啶 甲基胞嘧啶
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普通刺参(Apostichopus japonicus)和白刺参不同组织基因组DNA的MSAP研究 被引量:6
3
作者 左之良 谭杰 +5 位作者 吴彪 陈四清 高菲 燕敬平 王爽 孙慧玲 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第3期93-100,共8页
本研究分别以普通刺参(Apostichopus japonicus)和白刺参基因组DNA为实验材料,应用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术对刺参体壁、呼吸树和消化道3个组织的DNA甲基化水平和甲基化模式进行... 本研究分别以普通刺参(Apostichopus japonicus)和白刺参基因组DNA为实验材料,应用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术对刺参体壁、呼吸树和消化道3个组织的DNA甲基化水平和甲基化模式进行了研究,初步探讨了DNA甲基化对刺参组织间基因特异性表达的影响。结果显示,筛选得到的9对引物组合能够在普通刺参和白刺参两个群体中得到稳定扩增,在两群体刺参中分别检测到5932和5208个位点,均以未甲基化位点为主,普通刺参和白刺参未甲基化位点数分别为4317和3944,分别占总扩增条带数的72.78%和75.73%。普通刺参体壁的甲基化水平为31.07%,呼吸树为23.36%,消化道为26.34%;白刺参中体壁的甲基化水平为29.88%,呼吸树为23.25%,消化道为19.45%,由此可见,体壁的甲基化率在两群体中是最高的。普通刺参和白刺参同一组织间的甲基化水平和甲基化模式不同,同一群体体壁、呼吸树和消化道不同组织间的甲基化水平和模式也不同。甲基化在普通刺参和白刺参组织分化和发育过程中可能发挥着十分重要的作用。在检测的3个组织中,CCGG序列的全甲基化位点较半甲基化位点多。 展开更多
关键词 刺参 MSAP CCGG位点 甲基化水平
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陆川猪GPR1基因启动子甲基化及其mRNA表达分析 被引量:3
4
作者 谢婉 焦迪 +5 位作者 何剑雄 陈宝剑 关志惠 兰干球 郭亚芬 谢炳坤 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第17期1-4,229,共5页
为了探讨G-蛋白偶联受体1(GPR1)基因启动子甲基化对其在陆川猪和杜洛克猪背最长肌组织中差异表达的影响,试验采用实时荧光定量PCR方法检测GPR1基因mRNA在两个品种猪背最长肌中的表达水平,在线预测的方法预测GPR1基因启动子区CpG岛,亚... 为了探讨G-蛋白偶联受体1(GPR1)基因启动子甲基化对其在陆川猪和杜洛克猪背最长肌组织中差异表达的影响,试验采用实时荧光定量PCR方法检测GPR1基因mRNA在两个品种猪背最长肌中的表达水平,在线预测的方法预测GPR1基因启动子区CpG岛,亚硫酸氢盐测序(BSP)法分析猪GPR1基因启动子区CpG岛的甲基化水平。结果表明:GPR1基因在两品种猪背最长肌组织中的相对表达量差异显著,在陆川猪背最长肌中的相对表达量明显高于杜洛克猪;GPR1基因启动子区存在一个CpG岛,长度为103 bp,位于-1 031--929 bp处;GPR1基因启动子区CpG岛在两品种猪背最长肌中的整体甲基化水平差异不显著,但在-126,-116,-64,-10位点甲基化水平差异显著。说明GPR1基因启动子甲基化程度与肌内脂肪沉积存在一定关联。 展开更多
关键词 陆川猪 G蛋白偶联受体1基因 启动子 甲基化 表达量
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Interaction between early in ovo stimulation of the gut microbiota and chicken host-splenic changes in gene expression and methylation 被引量:3
5
作者 A.Dunislawska A.Slawinska +1 位作者 M.Gryzinska M.Siwek 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2022年第1期94-105,共12页
Background:Epigenetic regulation of the gene expression results from interaction between the external environment and transcription of the genetic information encoded in DNA.Methylated CpG regions within the gene prom... Background:Epigenetic regulation of the gene expression results from interaction between the external environment and transcription of the genetic information encoded in DNA.Methylated CpG regions within the gene promoters lead to silencing of the gene expression in most cases.Factors contributing to epigenetic regulation include intestinal microbiota,which in chicken can be potently modified by in ovo stimulation.The main aim of this study was to determine global and specific methylation patterns of the spleen under the influence of host-microbiome interaction.Results:Fertilized eggs of two genotypes:Ross 308 and Green-legged Partridgelike were in ovo stimulated on d 12 of incubation.The injected compounds were as follows:probiotic-Lactococcus lactis subsp.cremoris IBB477,prebiotic-galactooligosaccharides,and synbiotic-combination of both.Chickens were sacrificed on d 42 post-hatching.Spleen was collected,RNA and DNA were isolated and intended to gene expression,gene methylation and global methylation analysis.We have proved that negative regulation of gene expression after administration of bioactive substances in ovo might have epigenetic character.Epigenetic changes depend on the genotype and the substance administered in ovo.Conclusion:Epigenetic nature of microbial reprogramming in poultry and extension of issues related to hostmicrobiome interaction is a new direction of this research. 展开更多
关键词 Gene expression Host-microbiome immune tissue INTERACTION methylation level
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反相高效液相色谱法测定大鼠肝组织中DNA的碱基含量 被引量:3
6
作者 王超云 胡凤祖 师治贤 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期348-349,共2页
利用反相高效液相色谱法 ,采用SupelcosilLC 18色谱柱 (2 5 0mm× 4 6mmi d ,5 μm) ,以甲醇 0 0 5mol/LKH2 PO4缓冲液 (体积比为 2 0∶80 )为流动相 ,流速 0 8mL/min ,在 2 5 4nm波长处检测 ,对生活在高原 (海拔 2 3km)的习... 利用反相高效液相色谱法 ,采用SupelcosilLC 18色谱柱 (2 5 0mm× 4 6mmi d ,5 μm) ,以甲醇 0 0 5mol/LKH2 PO4缓冲液 (体积比为 2 0∶80 )为流动相 ,流速 0 8mL/min ,在 2 5 4nm波长处检测 ,对生活在高原 (海拔 2 3km)的习服大鼠肝组织中脱氧核糖核酸 (DNA)的碱基含量进行了检测 ,发现各碱基在DNA中所占的比例是相对稳定的 :腺嘌呤 (A) 2 8 8%、鸟嘌呤 (G) 2 3 3%、胞嘧啶 (C) 17 4 %、胸腺嘧啶 (T) 2 5 3% 。 展开更多
关键词 测定 碱基含量 反相高效液相色谱法 脱氧核糖核酸 甲基化水平 肝组织 内标法
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香猪卵巢RARRES1基因第1外显子CG位点的甲基化及其与基因差异表达的关联 被引量:3
7
作者 阮亦麒 李大鹏 +4 位作者 冉雪琴 毛宁 易凡利 张福平 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第6期1471-1478,共8页
为验证和探索香猪卵巢转录组RNA测序检测到的视黄酸受体应答1(retinoic acid receptor responder 1,RARRES1)基因在香猪高、低产仔组之间差异表达的原因,本试验针对RARRES1基因第1外显子ATG下游富含CpG位点区段设计特异性引物,采用亚硫... 为验证和探索香猪卵巢转录组RNA测序检测到的视黄酸受体应答1(retinoic acid receptor responder 1,RARRES1)基因在香猪高、低产仔组之间差异表达的原因,本试验针对RARRES1基因第1外显子ATG下游富含CpG位点区段设计特异性引物,采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)研究卵巢RARRES1基因中的甲基化修饰水平;利用实时荧光定量PCR方法检测高、低产仔组香猪卵巢RARRES1基因的表达量,并探究其与基因甲基化水平之间的相关性。结果表明,与低产仔组相比,香猪高产仔组的甲基化水平较高;4个CpG位点均未被甲基化(CpG_7、CpG_11、CpG_12和CpG_15),另外3个CpG位点(CpG_8、CpG_17和CpG_18)基本上全部发生了甲基化。此外,与低产仔组相比,香猪高产仔组中CpG_4(P>0.05)、CpG_9(P<0.05)和CpG_16(P<0.05)位点的甲基化占比较高,而CpG_6位点在香猪低产仔组中的甲基化比例较高,两组差异极显著(P<0.01)。实时荧光定量PCR结果显示,高产仔组香猪RARRES1基因的表达水平较高(P<0.05)。Spearman相关分析结果显示,CpG_9和CpG_16两个位点的甲基化比例与RARRES1基因的表达水平高度正相关(R2=0.896,P<0.01),提示这两个位点的甲基化可能是香猪高产仔组RARRES1基因表达量较高的原因。 展开更多
关键词 香猪 卵巢 RARRES1基因 甲基化 表达量
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反相高效液相色谱法测定人乳腺癌MCF7细胞中基因组DNA甲基化水平 被引量:2
8
作者 蔡鑫泽 乔莹 +4 位作者 都姝妍 刘楠 陈冬 车睿超 姜奕 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期898-900,903,共4页
目的利用反相高效液相色谱法检测MCF7细胞系中基因组DNA的甲基化水平。方法采用Nano LC(75μm×15 cm,5μm)和Micro LC(1.0 mm×15 cm,5μm)的C18反相色谱柱,以甲醇-醋酸铵缓冲液(pH 5.0)为流动相,使用线性梯度程序,将MCF7细胞... 目的利用反相高效液相色谱法检测MCF7细胞系中基因组DNA的甲基化水平。方法采用Nano LC(75μm×15 cm,5μm)和Micro LC(1.0 mm×15 cm,5μm)的C18反相色谱柱,以甲醇-醋酸铵缓冲液(pH 5.0)为流动相,使用线性梯度程序,将MCF7细胞中基因组DNA水解产物进行分离,两种体系流速分别是300 nl/min和40μl/min,在273 nm波长处检测,利用外标法分别检测DNA中脱氧胞嘧啶(dC)和甲基化脱氧胞嘧啶(5mdC)含量。结果 MCF7基因组DNA的水解产物,经反相色谱分离得到的峰图有较好的准确性与重复性;DNA水解后的产物为弱保留化合物,且Micro LC分离效果优于Nano LC;乳腺癌细胞MCF7甲基化水平为19.3%,高于正常细胞中基因组DNA甲基化水平。结论成功的将MCF7细胞中基因组DNA水解产物经反相色谱分离;使用Micro LC分离DNA水解后的弱保留产物较佳;MCF7细胞系基因组DNA甲基化水平高于正常细胞。 展开更多
关键词 反相高效液相色谱法 基因组 甲基化水平 乳腺癌
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5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响 被引量:1
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作者 李耀国 孙彤 +1 位作者 张雅剑 巩建豪 《海南热带海洋学院学报》 2016年第5期5-10,共6页
为了解5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响,该研究检测并分析了其对早期发育阶段甲基化水平和矿化基因表达的影响.结果显示5-氮杂胞苷处理可引发基因组甲基化水平显著降低.5-氮杂胞苷处理亦使DNMT3的表达量低于海水处理组,而矿化基因... 为了解5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响,该研究检测并分析了其对早期发育阶段甲基化水平和矿化基因表达的影响.结果显示5-氮杂胞苷处理可引发基因组甲基化水平显著降低.5-氮杂胞苷处理亦使DNMT3的表达量低于海水处理组,而矿化基因nacrein的表达量高于海水处理组.DNMT3和nacrein的表达呈显著正相关(R2=0.755,P=0.000).基因组甲基化水平的改变可能是调控生物矿化过程的重要因素. 展开更多
关键词 马氏珠母贝 去甲基化试剂 早期发育 甲基化水平 生物矿化
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基于分子水平的硫酸盐还原菌汞甲基化机制及其影响因素研究 被引量:1
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作者 张永栋 左旭 陈洋洋 《广东化工》 CAS 2021年第4期64-65,共2页
硫酸盐还原菌在自然界中普遍存在,在其代谢活动中,往往还会伴有甲基汞的生成。研究者从分子水平研究了硫酸盐还原菌汞甲基化的途径和机制。本文还综合论述了影响硫酸盐还原菌汞甲基化的影响因素,期待能够为控制和降低环境中甲基汞水平... 硫酸盐还原菌在自然界中普遍存在,在其代谢活动中,往往还会伴有甲基汞的生成。研究者从分子水平研究了硫酸盐还原菌汞甲基化的途径和机制。本文还综合论述了影响硫酸盐还原菌汞甲基化的影响因素,期待能够为控制和降低环境中甲基汞水平提供相关理论支撑。 展开更多
关键词 硫酸盐还原菌 汞甲基化 机制 影响因素 分子水平
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基于生物信息学方法分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系
11
作者 龙宪伟 刘洪 菅志远 《广西医学》 CAS 2023年第2期168-173,181,共7页
目的应用生物信息学方法分析程序性细胞死亡分子10(PDCD10)基因在胰腺导管腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系。方法搜索GEPIA数据库中关于PDCD10基因的数据,分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中的表达水平及其与患者生存情况的关系... 目的应用生物信息学方法分析程序性细胞死亡分子10(PDCD10)基因在胰腺导管腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系。方法搜索GEPIA数据库中关于PDCD10基因的数据,分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中的表达水平及其与患者生存情况的关系。应用UALCAN数据库分析PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中的甲基化水平。应用LinkedOmics数据库分析胰腺导管腺癌组织中与PDCD10基因共表达的基因,并对共表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。应用STRING网站绘制PDCD10基因的蛋白-蛋白相互作用网络图。应用TIMER数据库分析PDCD10基因表达水平与胰腺导管腺癌细胞纯度、各类型免疫细胞浸润水平的相关性。结果胰腺导管腺癌组织中的PDCD10基因表达水平高于正常胰腺组织(P<0.05),病灶组织中PDCD10基因低表达水平的胰腺导管腺癌患者的总体生存率及无病生存率均高于组织中PDCD10基因高表达水平的患者(均P<0.05)。胰腺导管腺癌组织中PDCD10基因甲基化水平高于正常胰腺组织(P<0.05)。GO功能富集分析结果显示,与PDCD10基因共表达的基因主要参与染色体分离、染色体定位、皮肤发育、多细胞生物信号转导、突触传递、GABA能神经肌肉过程等生物学过程;KEGG通路富集分析结果显示,与PDCD10基因共表达的基因主要涉及免疫调节反应信号通路、ERBB信号通路、谷氨酸受体信号通路。与PDCD10基因编码蛋白相互作用密切的蛋白主要为STRN4、SLMAP、STRIP1等。PDCD10基因表达水平与胰腺导管癌细胞纯度无相关性(P>0.05),而与CD4^(+)T淋巴细胞浸润水平呈负相关,与CD8^(+)T淋巴细胞、B淋巴细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润水平均呈正相关(均P<0.05)。结论PDCD10基因在胰腺导管腺癌组织中呈高表达,其表达水平与胰腺导管腺癌患者的预后密切相关。� 展开更多
关键词 胰腺导管腺癌 程序性细胞死亡分子10基因 表达水平 预后 甲基化水平 免疫细胞浸润 生物信息学
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脑膜瘤MLH1启动子甲基化水平及临床意义 被引量:1
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作者 袁国强 周旺宁 +5 位作者 魏乃礼 王晓清 马克君 苏愚 粱文涛 潘亚文 《中国临床神经外科杂志》 2015年第3期158-160,共3页
目的探讨脑膜瘤mut L同源基因1(MLH1)启动子甲基化水平与脑膜瘤侵袭性的相关性。方法从我院标本库随机选取64例脑膜瘤石蜡包埋组织标本,其中侵袭性脑膜瘤26例,非侵袭性脑膜瘤38例。应用逆转录-PCR检测MLH1 m RNA表达水平,应用特异高... 目的探讨脑膜瘤mut L同源基因1(MLH1)启动子甲基化水平与脑膜瘤侵袭性的相关性。方法从我院标本库随机选取64例脑膜瘤石蜡包埋组织标本,其中侵袭性脑膜瘤26例,非侵袭性脑膜瘤38例。应用逆转录-PCR检测MLH1 m RNA表达水平,应用特异高分辨率熔解(MS-HRM)曲线检测不同侵袭性脑膜瘤MLH1启动子甲基化水平。结果侵袭性脑膜瘤MLH1m RNA含量比非侵袭性脑膜瘤显著降低(P〈0.05)。MS-HRM曲线分析显示,侵袭性脑膜瘤MLH1启动子区高度甲基化水平为0-1%所占比例(7.7%,2/26)显著低于非侵袭性脑膜瘤(55.3%,21/38;P〈0.05)。结论 MLH1启动子区甲基化可能下调MLH1的表达,进而调控脑膜瘤侵袭性行为。 展开更多
关键词 脑膜瘤 侵袭性 mut L同源基因1 启动子 甲基化
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广西汉族儿童HepB免疫应答水平与ALKBH5基因甲基化关联分析
13
作者 李嘉铃 陆玉英 +5 位作者 董柏青 陈钦艳 胡莉萍 王超 苏永健 李海 《热带医学杂志》 CAS 2022年第11期1498-1501,共4页
目的从表观遗传学角度探讨ALKBH5基因甲基化与乙肝疫苗(HepB)应答水平的关联性。方法选择2016年1-12月间在广西壮族自治区妇幼保健院、南宁市妇幼保健院、南宁市第一人民医院已严格按照HepB免疫接种程序完成初次免疫的广西汉族263名8~9... 目的从表观遗传学角度探讨ALKBH5基因甲基化与乙肝疫苗(HepB)应答水平的关联性。方法选择2016年1-12月间在广西壮族自治区妇幼保健院、南宁市妇幼保健院、南宁市第一人民医院已严格按照HepB免疫接种程序完成初次免疫的广西汉族263名8~9月龄儿童作为研究对象,检测乙肝五项等指标,采用非匹配病例对照研究方法,将抗-HBs<100 mIU/mL者纳入病例组,抗-HBs≥100 mIU/mL者纳入对照组。采用Panel多重PCR技术、重亚硫酸盐转化测序技术和高通量测序等技术,检测ALKBH5基因CpG位点DNA甲基化情况。结果病例组ALKBH5_1基因92位点、ALKBH5_3基因97位点的DNA甲基化水平均高于对照组,差异均有统计学意义(P=0.024、0.013)。经非条件logistic回归分析显示ALKBH5_1基因92位点[OR(L95~U95):2.0(1.08~3.72)]与ALKBH5_3基因97位点[OR(L95~U95):0.6(0.38~0.93)]DNA甲基化与HepB应答水平差异有统计学意义(P<0.05)。结论ALKBH5_1基因92位点DNA甲基化可能增加广西汉族儿童发生HepB免疫低/无应答的风险,而ALKBH5_3基因的97位点的甲基化可能降低发生HepB免疫低/无应答的风险。 展开更多
关键词 ALKBH5基因 DNA甲基化 乙肝疫苗 应答水平
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SOX7基因启动子甲基化水平对乳腺癌MDA-MB-231细胞株体外迁移和侵袭的影响
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作者 王昂 王杰 +2 位作者 鄢文 关小倩 廖明 《现代生物医学进展》 CAS 2019年第22期4238-4242,共5页
目的:探讨乳腺癌MDA-MB-231细胞中,Y性别决定区基因7(SOX7)基因启动子甲基化水平对细胞的体外迁移和侵袭的影响。方法:脂质体转染pcDNA3.0-DNA甲基转移酶3a(DNMT3a)质粒至MDA-MB-231细胞中,并于24h、48h及72h后,采用蛋白质免疫印迹实验(... 目的:探讨乳腺癌MDA-MB-231细胞中,Y性别决定区基因7(SOX7)基因启动子甲基化水平对细胞的体外迁移和侵袭的影响。方法:脂质体转染pcDNA3.0-DNA甲基转移酶3a(DNMT3a)质粒至MDA-MB-231细胞中,并于24h、48h及72h后,采用蛋白质免疫印迹实验(WB)检测细胞内DNMT3a蛋白表达水平;甲基化特异性定量PCR(Q-MSP)检测DNMT3a处理组、5-aza-C处理组及对照(Control)组MDA-MB-231细胞中的SOX7基因启动子DNA甲基化水平;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)及WB实验检测各组MDA-MB-231细胞中的SOX7 m RNA和蛋白表达水平;细胞划痕实验及细胞侵袭实验检测各组MDA-MB-231细胞的迁移和侵袭能力。结果:pcDNA3.0-DNMT3a质粒转染MDA-MB-231细胞24h时,细胞内的DNMT3a蛋白表达水平最高。DNMT3a能够显著提高SOX7基因启动子DNA甲基化水平,而5-aza-C则抑制了SOX7基因启动子DNA甲基化水平(P<0.05)。与Control组相比,DNMT3a处理组的MDA-MB-231细胞中,SOX7的m RNA及蛋白表达水平均明显下降,而5-aza-C处理组SOX7的m RNA及蛋白表达水平均明显增加(P<0.05)。与Control组相比,DNMT3a处理组的MDA-MB-231细胞的迁移和侵袭能力均显著增强(P<0.05),而5-aza-C处理组的MDA-MB-231细胞的迁移和侵袭能力变化不大(P>0.05)。结论:在恶性肿瘤中,SOX7低表达表受其基因启动子高甲基化调节,且乳腺癌MDA-MB-231细胞中低表达的SOX7能够影响细胞的外迁移和侵袭能力。 展开更多
关键词 SOX7 甲基化水平 MDA-MB-231 迁移 侵袭
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DAC对玉米DNA甲基化影响及基因表达量变化的研究
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作者 张辰 杨丽萍 +1 位作者 李春雷 祁新 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期39-47,52,共10页
以5-氮杂-2脱氧胞苷(DAC)处理相应对照玉米幼苗叶片为材料构建转录组测序文库,采用Illumina测序平台进行测序,对差异表达基因进行GO功能分类和KEGG通路分析。最终筛选到差异基因1072个,其中,上调表达基因为646个,下调表达基因为426个。... 以5-氮杂-2脱氧胞苷(DAC)处理相应对照玉米幼苗叶片为材料构建转录组测序文库,采用Illumina测序平台进行测序,对差异表达基因进行GO功能分类和KEGG通路分析。最终筛选到差异基因1072个,其中,上调表达基因为646个,下调表达基因为426个。将差异基因富集的生物过程和信号通路进行GO分析,发现主要集中于细胞部分、细胞过程、代谢途径及催化活性等条目中。KEGG分析发现,差异基因主要集中在过氧化物酶体、半乳糖代谢、苯丙烷生物合成及植物激素信号转导等代谢通路中。结果表明,代谢途径的细胞过程、代谢过程、催化活性、苯丙烷生物合成、过氧化物酶体、半乳糖代谢以及植物激素信号转导可能在玉米生长发育中起主导作用。通过亚硫酸盐测序对筛选的3个差异表达基因进行DNA甲基化水平分析,发现处理组CG、CHG位点甲基化率下降显著,由此表明DNA甲基化影响基因的表达。 展开更多
关键词 玉米 DAC 差异表达基因 甲基化水平
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Simultaneous and Spatial Quantification of Telomerase Activity and DNA Methylation in Living Cells by a Deformable Satellite Nanocapsule
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作者 Shan Huang Cheng Ma +5 位作者 Jiahao Lin Wenjing Wang Yizhu Xu Xingxin Wu Jian-Rong Zhang Jun-Jie Zhu 《CCS Chemistry》 CAS 2021年第4期1231-1244,共14页
Telomerase plays an essential role in many biological processes.DNA methylation regulates the expression of many genes,including telomerase.Here,we propose a deformable satellite nanocapsule fluorescein isothiocyanate... Telomerase plays an essential role in many biological processes.DNA methylation regulates the expression of many genes,including telomerase.Here,we propose a deformable satellite nanocapsule fluorescein isothiocyanate(FITC)-hollowbowl mesoporous organicsilica@gold nanoparticles-methyl-CpG-binding protein 2(MECP 2)-silver nanoclusters(FHBMO@AMA),for simultaneous quantitative detection of both cytoplasmic telomerase activity and the degree of DNA methylation.This strategy enabled spatial-based detection in cells.The total cytoplasmic telomerase activity was detected by fluorescence energy resonance transfer(FRET)between FHBMO and gold nanoparticles(Au NPs),while the DNA methylation in the nucleus was detected by enhanced fluorescence of silver nanoclusters(Ag NCs).Furthermore,FHBMO@AMA could intuitively distinguish between the differences in telomerase expression in cells during the DNA synthesis period at the mitotic phase(S/M)of the cell cycle.Interestingly,the ratio of the two detections(telomerase activity/DNA methylation)significantly correlated with the efficacy of anticancer drugs.At the same time,there was no apparent linear relationship between any single detection target and the efficacy of the anticancer drugs.Therefore,based on the relationship between telomerase activity and DNA methylation,our newly developed approach serves as new and feasible method for evaluating the efficacy of anticancer drugs,thereby,extending the technology toolbox for precision in medical and pharmaceutical analysis of drug potency. 展开更多
关键词 TELOMERASE DNA methylation simultaneous detection single-cell level the efficacy of anticancer drugs
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苏博美利奴羊皮肤组织中WNT2基因的DNA甲基化与表达量分析
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作者 杨雪梅 徐新明 +5 位作者 付雪峰 杜建文 王丹 田月珍 田可川 黄锡霞 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第9期67-72,共6页
毛囊是皮肤的衍生物,WNT信号通路是已知与毛囊发育密切相关的通路之一,为研究WNT信号通路中关键基因WNT2的DNA甲基化和基因表达对羊毛性状的调控作用,本研究以周岁苏博美利奴羊为研究对象,采用亚硫酸氢盐测序法(BSP),并结合前期MeDIP-se... 毛囊是皮肤的衍生物,WNT信号通路是已知与毛囊发育密切相关的通路之一,为研究WNT信号通路中关键基因WNT2的DNA甲基化和基因表达对羊毛性状的调控作用,本研究以周岁苏博美利奴羊为研究对象,采用亚硫酸氢盐测序法(BSP),并结合前期MeDIP-seq结果检测了WNT2基因在第5外显子及前后100 bp处的DNA甲基化模式,通过实时荧光定量PCR法检测WNT2基因在苏博美利奴羊皮肤组织中的表达量。结果显示:WNT2基因在2组中的甲基化水平均较高,且2组的表达水平与DNA甲基化水平变化趋势一致,同时,CpG11位点的甲基化水平与表达量之间呈现显著正相关,该位点可能与羊毛纤维直径有关,表明WNT2基因的DNA甲基化水平对羊毛纤维直径有一定作用。本实验为后期深入研究DNA甲基化对毛囊的影响提供了重要参考,也为该基因的进一步研究提供理论基础。 展开更多
关键词 WNT2基因 DNA甲基化 表达量 苏博美利奴羊
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S-腺苷酰L-甲硫氨酸 (SAM)对 HL-60细胞 DNA甲基化酶活力和甲基化水平的影响(英文) 被引量:6
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作者 白坚石 马晴 +1 位作者 王萍 何忠效 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期155-159,共5页
以 S-腺苷酰 - L-甲硫氨酸 (SAM)为诱导物 ,在 1 0 μmol/L最佳浓度下造成 1 6%的 HL- 60细胞分化 .HPLC检测结果表明 ,细胞基因组 DNA甲基化水平升高 .通过3H甲基同位素参入法研究细胞 DNA甲基化酶活力 ,则发现在细胞分化过程中酶活力... 以 S-腺苷酰 - L-甲硫氨酸 (SAM)为诱导物 ,在 1 0 μmol/L最佳浓度下造成 1 6%的 HL- 60细胞分化 .HPLC检测结果表明 ,细胞基因组 DNA甲基化水平升高 .通过3H甲基同位素参入法研究细胞 DNA甲基化酶活力 ,则发现在细胞分化过程中酶活力未见升高 .说明细胞基因组甲基化水平升高并不是胞内 DNA甲基化酶催化能力改变的结果 ,而是由于 SAM进入细胞提供过量甲基造成的 . 展开更多
关键词 S-腺苷酰-L-甲硫氨酸 HL-60细胞 细胞分化 DNA甲基化酶 甲基化水平 酶活
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鼠肝细胞癌变中DNA甲基化作用的研究 被引量:8
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作者 何忠效 薛继艳 吴国利 《实验生物学报》 CSCD 1989年第4期417-421,共5页
本文用~3H标记的S-腺苷酰甲硫氨酸(~3H-SAM)为甲基供体,以同位素掺入法测定了正常小鼠肝细胞、H_(223)腹水癌细胞及荷癌肝细胞的DNA甲基化酶活力。并用HPLC法测定了上述细胞的DNA甲基化水平。发现:H_(223)腹水癌细胞及荷癌肝细胞的DNA... 本文用~3H标记的S-腺苷酰甲硫氨酸(~3H-SAM)为甲基供体,以同位素掺入法测定了正常小鼠肝细胞、H_(223)腹水癌细胞及荷癌肝细胞的DNA甲基化酶活力。并用HPLC法测定了上述细胞的DNA甲基化水平。发现:H_(223)腹水癌细胞及荷癌肝细胞的DNA甲基化酶活力和DNA甲基化水平明显低于正常肝细胞。当以抗肝癌药物去甲斑蝥素和斑蝥酸钠处理荷癌小鼠6天后,可使H_(223)腹水癌细胞及荷癌肝细胞的DNA甲基化酶活力回升,但并未检出DNA甲基化水平的回升。 展开更多
关键词 癌细胞 DNA甲基化 甲基化酶
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毛白杨MSAP体系优化及DNA甲基化的初步分析 被引量:6
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作者 马开峰 张志毅 +2 位作者 王斯琪 宋跃朋 张德强 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1-7,共7页
首次利用MSAP技术开展毛白杨DNA甲基化研究。在优化选择性扩增体系的基础上,对毛白杨亲子代的CCGG位点甲基化相对水平、CCGG位点胞嘧啶甲基化模式的遗传变异进行了初步分析。结果表明:①引物H/M+3、引物E+A+2、dNTP、Taq酶、预扩增产物... 首次利用MSAP技术开展毛白杨DNA甲基化研究。在优化选择性扩增体系的基础上,对毛白杨亲子代的CCGG位点甲基化相对水平、CCGG位点胞嘧啶甲基化模式的遗传变异进行了初步分析。结果表明:①引物H/M+3、引物E+A+2、dNTP、Taq酶、预扩增产物稀释倍数分别为0.03 nmol、0.03 nmol、0.20 mmol/L、1 U(或1.5U)、40倍时组成的20μL反应体系经PCR扩增后电泳,可得到品质最佳的银染谱带。②毛白杨CCGG位点甲基化相对水平约为26.75%~29.39%,CNG甲基化相对水平低于CG甲基化相对水平,子代的甲基化相对水平低于亲本的甲基化相对水平。③子代中发生遗传变异的CCGG位点数之比为1∶1。遗传自亲本的CG甲基化位点数高于遗传自亲本的CNG甲基化位点数,遗传自父本的甲基化位点数高于遗传自母本的甲基化位点数;子代甲基化位点的变异以去甲基化为主,发生CG甲基化变异的位点数与发生CNG甲基化变异的位点数之比为1∶1。 展开更多
关键词 毛白杨 甲基化敏感扩增多态性(MSAP) DNA甲基化 相对水平 遗传变异
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