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种群微卫星DNA分析中样本量对各种遗传多样性度量指标的影响 被引量:75
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作者 闫路娜 张德兴 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第2期279-290,共12页
我们以中国飞蝗种群的微卫星遗传分析数据为例 ,评估了取样对种群遗传多样性指标的影响 ,结果显示 :样本大小与所观测到的每位点等位基因数、平均等位基因数及基因丰富度指数均呈显著正相关 ,而与期望杂合度无显著相关 ;微卫星位点多态... 我们以中国飞蝗种群的微卫星遗传分析数据为例 ,评估了取样对种群遗传多样性指标的影响 ,结果显示 :样本大小与所观测到的每位点等位基因数、平均等位基因数及基因丰富度指数均呈显著正相关 ,而与期望杂合度无显著相关 ;微卫星位点多态性的高低直接影响所观测到的种群基因丰富度及其检测所需的样本量 ;对大多数种群遗传和分子生态学研究而言 ,30 - 5 0个个体是微卫星DNA分析所需要的最小样本量。基因丰富度经过稀疏法或多次随机抽样法校正后 ,可适用于瓶颈效应等种群历史数量变动的检测。另外 ,在研究中 。 展开更多
关键词 样本量 遗传多样性 基因丰富度 杂合度 微卫星DNA标记 飞蝗 分子生态学
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利用微卫星技术分析中国部分地方鸡种的遗传结构 被引量:51
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作者 吴信生 陈国宏 +6 位作者 王得前 张学余 王克华 成荣 刘博 徐琪 周群兰 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第1期43-50,共8页
利用 7个微卫星标记对鹿苑鸡、固始鸡、藏鸡、白耳鸡、仙居鸡、茶花鸡、大骨鸡、北京油鸡、狼山鸡、河南斗鸡、泰和乌骨鸡和萧山鸡等 12个中国地方鸡种的等位基因频率、基因杂合度、平均基因杂合度、多态信息含量以及群体间的亲缘关系... 利用 7个微卫星标记对鹿苑鸡、固始鸡、藏鸡、白耳鸡、仙居鸡、茶花鸡、大骨鸡、北京油鸡、狼山鸡、河南斗鸡、泰和乌骨鸡和萧山鸡等 12个中国地方鸡种的等位基因频率、基因杂合度、平均基因杂合度、多态信息含量以及群体间的亲缘关系进行分析。研究结果表明 ,12个地方鸡种在 7个微卫星座位上的基因频率存在一定的差异 ;鹿苑鸡的平均基因杂合度最高 ,为 0 5 92 9;茶花鸡的平均遗传杂合度最低 ,为 0 35 14。平均多态信息含量也出现了类似的结果 ,说明鹿苑鸡的遗传多样性最丰富。模糊聚类分析结果表明 ,12个地方鸡种间 ,泰和乌骨鸡与河南斗鸡的亲缘关系相对较近 ,而固始鸡与其他 11个地方鸡种的亲缘关系相对较远。 12个地方鸡种可以聚为 3类 :泰和乌骨鸡、河南斗鸡、狼山鸡、大骨鸡、萧山鸡、北京油鸡、鹿苑鸡聚为第 1个类群 ;茶花鸡、藏鸡、仙居鸡、白耳鸡聚为第 2类群 ;固始鸡为第 展开更多
关键词 地方鸡种 微卫星 杂合度 模糊聚类
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长江、珠江、黑龙江三水系的鲢、镛、草鱼原种种群的生化遗传结构与变异 被引量:51
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作者 李思发 王强 陈永乐 《水产学报》 CAS 1986年第4期351-372,共22页
用LKB平板电泳仪聚丙烯酰胺凝胶电泳测定了长江、珠江及黑龙江的鲢、鳙及草鱼的原种8个种群16个酶位点的遗传变异。同种鱼不同水系种群之间存在着明显的生化遗传差异。长江、珠江、黑龙江鲢鱼种群的多态位点的比例分别是13.3%、26.7%... 用LKB平板电泳仪聚丙烯酰胺凝胶电泳测定了长江、珠江及黑龙江的鲢、鳙及草鱼的原种8个种群16个酶位点的遗传变异。同种鱼不同水系种群之间存在着明显的生化遗传差异。长江、珠江、黑龙江鲢鱼种群的多态位点的比例分别是13.3%、26.7%、13.3%,平均杂合度分别是0.0493、0.0484、0.0511;长江、珠江鳙鱼种群的多态位点的比例都是31.3%,平均杂合度分别是0.1375,0.0977;长江、珠江、黑龙江草鱼种群的多态位点比例分别是30%,38%,23.1%,平均杂合度分别是0.1241,0.0961,0.0525。南方种群的多态位点比例有比北方的高的趋向。长江鲢—珠江鲢,长江鲢—黑龙江鲢,珠江鲢—黑龙江鲢的遗传相似度依次是0.9957,0.9955及0.9696;长江鳙—珠江鳙的遗传相似度是0.9955;长江草鱼—珠江草鱼,珠江草鱼—黑龙江草鱼,长江草鱼—黑龙江草鱼的遗传相似度依次是0.9679、0.9483及0.9324。长江种群与珠江种群这两个中央群体间的遗传差异较小,边缘群体黑龙江种群与中央群体长江、珠江种群间的遗传差异较大。黑龙江草鱼种群很小,其资源的保护工作应引起注意。 展开更多
关键词 长江 珠江 黑龙江 鲢鱼 鳙鱼 草鱼 原种 种群 遗传相似度 遗传距离 遗传变异
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应用微卫星技术对野鲤和两种鲤选育品系的遗传多样性分析 被引量:33
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作者 杜长斌 孙孝文 +1 位作者 楼允东 沈俊宝 《上海水产大学学报》 CSCD 2000年第4期285-289,共5页
用自行设计的 16对微卫星引物研究了野鲤、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系的群体内遗传变异及相互间的关系。微卫星分析结果表明 :野鲤、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系平均扩增条带分别为 4.91、2 .82和 2 .45 ,平均杂合度观测值分别为 0 .6 4、0... 用自行设计的 16对微卫星引物研究了野鲤、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系的群体内遗传变异及相互间的关系。微卫星分析结果表明 :野鲤、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系平均扩增条带分别为 4.91、2 .82和 2 .45 ,平均杂合度观测值分别为 0 .6 4、0 .40和 0 .38。表明野鲤的遗传多样性水平最高 ,高寒鲤次之 ,荷包红鲤抗寒品系最低。说明了人工繁育和养殖实践会造成物种遗传多样性的降低。本试验共发现了 1个群体特异性标记2 0 9bp ,为进一步研究此标记与性状的连锁关系和分子标记辅助育种奠定了基础。同时 ,还对三群体间的遗传距离作了估算 ,并进行了聚类分析 。 展开更多
关键词 遗传多样性 微卫星技术 分子标记辅助育种
全文增补中
中国野桑蚕遗传多样性的AFLP分析 被引量:42
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作者 鲁成 赵爱春 +1 位作者 向仲怀 万春玲 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期166-172,共7页
采用AFLP技术对我国具有代表性的 7个省市的 10个野桑蚕 (Bombyxmandarina)种群和 2个家蚕(Bombyxmori)品种的遗传多样性进行了研究。结果表明 :杭州、陕西和重庆 3个地区的野桑蚕种群间及种群内个体间的遗传距离都比家蚕品种大。野桑... 采用AFLP技术对我国具有代表性的 7个省市的 10个野桑蚕 (Bombyxmandarina)种群和 2个家蚕(Bombyxmori)品种的遗传多样性进行了研究。结果表明 :杭州、陕西和重庆 3个地区的野桑蚕种群间及种群内个体间的遗传距离都比家蚕品种大。野桑蚕存在广泛的变异 ,7个省市的 10个野桑蚕种群之间的遗传距离为0 16 4~ 0 44 4(平均值为 0 382 6 ) ,平均杂合度为 0 70 6 1,表明野桑蚕自然群体的遗传多样性十分丰富。 展开更多
关键词 中国 野桑蚕 遗传多样性 AFLP分析 家蚕 杂合度
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小豆种质资源同工酶遗传多样性分析与评价 被引量:28
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作者 王述民 谭富娟 胡家蓬 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第11期1311-1318,共8页
对 5 8份野生小豆和 2 4 9份栽培小豆种质资源进行了酯酶 (EST)、过氧化物酶 (PER)、苹果酸脱氢酶(MDH)和超氧歧化酶 (SOD)的检测分析 ,共检测到 6个基因位点 ,33个等位基因。小豆等位酶基因在野生种中的分布频率高于栽培种 ,在国内地... 对 5 8份野生小豆和 2 4 9份栽培小豆种质资源进行了酯酶 (EST)、过氧化物酶 (PER)、苹果酸脱氢酶(MDH)和超氧歧化酶 (SOD)的检测分析 ,共检测到 6个基因位点 ,33个等位基因。小豆等位酶基因在野生种中的分布频率高于栽培种 ,在国内地方种中的分布频率高于日本地方种。 4种同工酶的 6个基因位点的平均杂合度为0 .6 5 1,其中野生小豆的杂合度 (0 .6 36 )低于栽培小豆 (0 .6 6 4 ) ,说明小豆在长期的驯化和栽培过程中已经发生了遗传上的变异。依据同工酶谱带信息 ,把供试种质聚类并划分为 5个组群 ,野生种明显聚为 1类 ,栽培种聚为 4类 ,类群之间存在明显的遗传差异 ,但同工酶等位基因的多样性与地理区域的差异似乎看不出明显的相关性。 展开更多
关键词 小豆 种质资源 同工酶 遗传多样性 遗传杂合度 覆类分析
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Colorectal cancer tumour markers and biomarkers:Recenttherapeutic advances 被引量:42
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作者 Gustaw Lech Robert Słotwiński +1 位作者 Maciej Słodkowski Ireneusz Wojciech Krasnodębski 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2016年第5期1745-1755,共11页
Colorectal cancer(CRC) is the second most commonly diagnosed cancer among females and third among males worldwide. It also contributes significantly to cancer-related deaths, despite the continuous progress in diagnos... Colorectal cancer(CRC) is the second most commonly diagnosed cancer among females and third among males worldwide. It also contributes significantly to cancer-related deaths, despite the continuous progress in diagnostic and therapeutic methods. Biomarkers currently play an important role in the detection and treatment of patients with colorectal cancer. Risk stratification for screening might be augmented by finding new biomarkers which alone or as a complement of existing tests might recognize either the predisposition or early stage of the disease. Biomarkers have also the potential to change diagnostic and treatment algorithms by selecting the proper chemotherapeutic drugs across a broad spectrum of patients. There are attempts to personalise chemotherapy based on presence or absence of specific biomarkers. In this review, we update review published last year and describe our understanding of tumour markers and biomarkers role in CRC screening, diagnosis, treatment and follow-up. Goal of future research is to identify those biomarkers that could allow a non-invasive and cost-effective diagnosis, as well as to recognise the best prognostic panel and define the predictive biomarkers for available treatments. 展开更多
关键词 colorectal cancer biomarker microsatelliteinstability KRAS MUTATION BRAF MUTATION PIK3CAmutation CHROMOSOME 18q loss of heterozygosity antiepidermalgrowth factor receptor therapy COLORECTALCANCER biomarkers Carcinoembryonic ANTIGEN
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运用微卫星技术分析中国地方鸡品种的亲缘关系 被引量:31
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作者 王得前 陈国宏 +6 位作者 吴信生 张学余 王克华 成荣 刘博 徐琪 周群兰 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 2003年第2期1-6,共6页
利用7个微卫星标记对12个地方鸡品种的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量以及群体间的亲缘关系进行分析。结果表明:鹿苑鸡平均基因杂合度最高,为0.5929,遗传多样性最丰富;茶花鸡平均基因杂合度最低,为0.3514。各地方鸡品... 利用7个微卫星标记对12个地方鸡品种的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量以及群体间的亲缘关系进行分析。结果表明:鹿苑鸡平均基因杂合度最高,为0.5929,遗传多样性最丰富;茶花鸡平均基因杂合度最低,为0.3514。各地方鸡品种模糊聚类结果显示:乌骨鸡与斗鸡先聚在一起,然后依次与狼山鸡、大骨鸡、萧山鸡、油鸡、鹿苑鸡5个兼用型地方鸡品种聚为一类;茶花鸡与藏鸡先聚在一起,然后与仙居鸡、白耳鸡2个蛋用型鸡品种聚为另一类;固始鸡自成一类。 展开更多
关键词 地方鸡品种 微卫星 杂合度 模糊聚类分析
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我国地方鸡品种保种群微卫星多态性分析与分子标记档案的建立 被引量:30
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作者 高玉时 杨宁 +2 位作者 李慧芳 王克华 童海兵 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期859-864,共6页
利用 2 0个微卫星标记对国家家禽品种资源基因库中保存的 11个地方鸡品种保种群进行了遗传检测 ,计算各群体的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量及各群体间的遗传距离 ,并用类平均法进行聚类分析。研究结果表明 :2 0个微... 利用 2 0个微卫星标记对国家家禽品种资源基因库中保存的 11个地方鸡品种保种群进行了遗传检测 ,计算各群体的等位基因频率、平均基因杂合度、平均多态信息含量及各群体间的遗传距离 ,并用类平均法进行聚类分析。研究结果表明 :2 0个微卫星标记在 11个地方鸡品种保种群共检测到 176个等位基因 ,平均为 8 8个 ,基因频率分布在 0 0 13~ 0 838之间。检测到等位基因中 ,有 4 5个等位基因为 11个地方鸡品种所共有 ;11个地方鸡品种平均杂合度在 0 6 80 0~ 0 74 32之间。其中藏鸡最高 ,为 0 74 32 ;狼山鸡最低 ,为 0 6 80 0 ;平均多态信息含量在0 6 32 9~ 0 70 2 3之间 ,均大于 0 5 ,表现为高度多态性 ;11个鸡品种聚为 4类。丝羽乌骨鸡、茶花鸡、仙居鸡、藏鸡、萧山鸡聚为一类 ,鹿苑鸡、狼山鸡聚为一类 ,固始鸡、北京油鸡、大骨鸡聚为一类 ,河南斗鸡单独聚为一类 ;通过利用2 0个微卫星基因座检测不同世代群体中等位基因及其频率、群体基因平均杂合度和多态信息含量 ,建立地方鸡品种保种群微卫星标记档案 ,并分析世代间的差异 。 展开更多
关键词 地方鸡品种 微卫星 保种群 基因频率 杂合度 多态信息含量 分子标记档案
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Telomere erosion is independent of microsatellite instability but related to loss of heterozygosity in gastric cancer 被引量:35
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作者 Dian-Chun Fang Shi-Ming Yang Xiao-Dong Zhou Dong-Xu Wang Yuan-Hui Luo Department of Gastroenterology,Southwest Hospital,Third Military Medical University,Chongqing 400038,China 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2001年第4期522-526,共5页
AIM: To correlate the length of the telomere to microsatellite instability (MSI) and loss of heterozygosity (LOH) of APC, MCC and DCC genes in gastric carcinomas. METHODS: Telomeric restriction fragment (TRF) length o... AIM: To correlate the length of the telomere to microsatellite instability (MSI) and loss of heterozygosity (LOH) of APC, MCC and DCC genes in gastric carcinomas. METHODS: Telomeric restriction fragment (TRF) length of gastric cancer was measured with Southern blot. LOH of APC, MCC and DCC genes, microsatellite instability (MSI) and frameshift mutation of hMSH6, TGF-betaRII and BAX genes were analyzed by PCR-based methods. RESULTS: Sixty-eight cases of sporadic gastric carcinoma were studied for MSI using five microsatellite markers. MSI in at least one locus was detected in 17 (25%) of 68 tumors analyzed. Frameshift mutations of hMSH6, TGF-betaRII and BAX were detected in 2,6 and 3 of gastric carcinomas respectively showing high MSI (】 or = 2 loci, n = 8), but none was found in those showing low MSI (only one locus, n = 9) or MSS (tumor lacking MSI or stable, n = 51). Thirty-five cases, including all high MSI and low MSI, were studied for TRF. The mean TRF length was not correlated with clinicopathological parameters. No association was observed between TRF length and MSI or frameshift mutation. On the contrary, LOH at the DCC locus was related to telomere shortening (P【0.01). This tendency was also observed in APC and MCC genes, although there was no statistical significance. CONCLUSION: The development of gastric cancer can arise through two different genetic pathways. In high MSI gastric cancers, defective mismatch repair allows mutations to accumulate and generate the high MSI phenotype. In gastric cancers showing either low MSI or MSS, multiple deletions may represent the LOH pathway. Telomere erosion is independent of high MSI phenotype but related to the LOH pathway in gastric cancer. 展开更多
关键词 ADULT Aged DNA Neoplasm Female Frameshift Mutation Humans Loss of heterozygosity Male Microsatellite Repeats Middle Aged Research Support Non-U.S. Gov't Stomach Neoplasms TELOMERE
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相对Shannon信息量与基因变异的测量 被引量:29
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作者 袁志发 郭满才 +2 位作者 宋世德 边宽江 周静芋 《西北农业大学学报》 CSCD 北大核心 1998年第4期30-34,共5页
在shannon信息量的基础上,建立了相对纯合度信息量S′J(A2)、相对杂合度信息量S′H(A2)和相对信息量S′(A2)的概念,并赋予它们以遗传学意义。与纯合度J和杂合度H进行了理论比较,结果表明,二者在数量规律... 在shannon信息量的基础上,建立了相对纯合度信息量S′J(A2)、相对杂合度信息量S′H(A2)和相对信息量S′(A2)的概念,并赋予它们以遗传学意义。与纯合度J和杂合度H进行了理论比较,结果表明,二者在数量规律性上有很好的一致性,而各相对信息量有更好的性质。1-S′H主要反映基因的确定度,S′H(A2)主要反映基因的变异度;S′(A2)与K无关,它能反映群体的遗传变异程度,亦能比较不同位点间的遗传变异程度。 展开更多
关键词 Shannon信息量 遗传变异 群体遗传学 测量
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合浦珠母贝同工酶的电泳分析 被引量:29
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作者 李广丽 杜晓东 叶富良 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期17-22,共6页
采用聚丙烯酰胺梯度凝胶垂直板电泳技术和特异性染色方法 ,对合浦珠母贝外套膜、闭壳肌、肝脏和鳃组织中的 15种同工酶系统进行分析 ,结果表明 :a GPDH、ADH在 4种组织中均未见表达 ;AK、AMY、PGM、ALP、GDH和LDH只在肝脏中表达 ,而ME、... 采用聚丙烯酰胺梯度凝胶垂直板电泳技术和特异性染色方法 ,对合浦珠母贝外套膜、闭壳肌、肝脏和鳃组织中的 15种同工酶系统进行分析 ,结果表明 :a GPDH、ADH在 4种组织中均未见表达 ;AK、AMY、PGM、ALP、GDH和LDH只在肝脏中表达 ,而ME、SOD、EST、MDH、G6PD、6PGD和AAT则有较广泛的组织分布 ,其中 12个座位 (Aat 1、Aat 2、Sod 1、Sod 2、Sod 3、Sod 4、m Mdh c、G6pd 2、6Pgd 2、Ak 1、Gdh 1、Me 2 )具有多态性 ,多态位点比例为 4 6.1% ,平均杂合度 0 .112 2± 0 .0 576。 展开更多
关键词 合浦珠母贝 同工酶 多态位点 平均杂合度 电泳
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Loss of heterozygosity on 10q23.3 and mutation of tumor suppressor gene PTEN in gastric cancer and precancerous lesions 被引量:34
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作者 Yi-LingLi ZhongTian +2 位作者 Dong-YingWu Bao-YuFu YahXin 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第2期285-288,共4页
AIM: To investigate the loss of heterozygosity (LOH) and mutation of tumor suppressor gene PTEN in gastric cancer and precancerous lesions. METHODS: Thirty cases of normal gastric mucosa, advanced and early stage gast... AIM: To investigate the loss of heterozygosity (LOH) and mutation of tumor suppressor gene PTEN in gastric cancer and precancerous lesions. METHODS: Thirty cases of normal gastric mucosa, advanced and early stage gastric cancer, intestinal metaplasia, atrophic gastritis, and atypical hyperplasia were analyzed for PTEN LOH and mutations within the entire coding region of PTEN gene by PCR-SSCP denaturing PAGE gel electrophoresis, and PTEN mutation was detected by PCR-SSCP sequencing followed by silver staining. RESULTS: LOH rate found in respectively atrophic gastritis was 10% (3/30), intestinal metaplasia 10% (3/30), atypical hyperplasia 13.3% (4/30), early stage gastric cancer 20% (6/30), and advanced stage gastric cancer 33.3% (9/30), None of the precancerous lesions and early stage gastric cancer showed PTEN mutations, but 10% (3/30) of the advanced stage gastric cancers, which were all positive for LOH, showed PTEN mutation. CONCLUSION: LOH of PTEN gene appears in precancerous lesions, and PTEN mutations are restricted to advanced gastric cancer, LOH and mutation of PTEN gene are closely related to the infiltration and metastasis of gastric cancer. 展开更多
关键词 Gastric cancer Precancerous lesions PTEN gene Loss of heterozygosity MUTATION
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我国核桃组(Sect.Juglans)种质资源的SSR标记分析 被引量:29
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作者 郝艳宾 黄武刚 +2 位作者 王克建 齐建勋 续九如 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期620-625,共6页
为从基因水平对我国核桃组资源的遗传多样性进行分析,用9对SSR引物对核桃组中29份核桃(Juglansregia L.)样品、2份铁核桃(J.sigillata D.)样品、4份J.sigillataD.×J.regiaL.样品进行扩增,共检测出等位基因47个,每个位点扩增3~9个... 为从基因水平对我国核桃组资源的遗传多样性进行分析,用9对SSR引物对核桃组中29份核桃(Juglansregia L.)样品、2份铁核桃(J.sigillata D.)样品、4份J.sigillataD.×J.regiaL.样品进行扩增,共检测出等位基因47个,每个位点扩增3~9个等位基因,平均5.2个。9个SSR位点的PIC值在0.3188~0.7902,平均为0.6357。35个样品在9个SSR位点上有杂合位点1~6个,样品的杂合度在0.11~0.67,平均0.35。采用UPGMA方法进行聚类分析,35个样品可以分为4组。其中陕西晚实核桃与华北核桃聚为一类,陕西早实核桃聚为一类再与新疆核桃聚为一组,表明秦巴山地核桃可能属于华北和新疆2个地理生态型。铁核桃与西藏核桃聚为一组,说明铁核桃与西藏核桃的亲缘关系较近,认为铁核桃和西藏核桃作为核桃种下的一个生态类型可能更为合适。 展开更多
关键词 核桃 铁核桃 SSR 地理生态型 杂合度
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通辽杨花粉母细胞减数分裂及其染色体行为研究 被引量:31
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作者 王君 康向阳 +2 位作者 李代丽 景艳春 张正海 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期2231-2238,共8页
在温室水培条件下对通辽杨(Populus simonii Carr.×P.nigra L,‘Tongliao’)花粉母细胞减数分裂进程及其染色体行为进行了研究。结果表明:(1)通辽杨花粉母细胞减数分裂与其雄花芽/花序外部特征和花药颜色有着密切关系,前... 在温室水培条件下对通辽杨(Populus simonii Carr.×P.nigra L,‘Tongliao’)花粉母细胞减数分裂进程及其染色体行为进行了研究。结果表明:(1)通辽杨花粉母细胞减数分裂与其雄花芽/花序外部特征和花药颜色有着密切关系,前期Ⅰ作为减数分裂过程中最关键而复杂的一个阶段,大约占整个减数分裂进程90%的时间;中期Ⅰ存在单价体,后期Ⅰ有落后染色体出现,表现出较强的遗传杂合性,而且中期Ⅱ平行纺锤体的出现与天然花粉中大花粉的存在之间可能有着一定的联系;(2)在通辽杨减数分裂过程中核仁数目存在1~8个的动态变化,这种现象可能与杨属植物古多倍性起源有关,并推测通辽杨染色体组内至少存在8对带有次缢痕的染色体;(3)在同一个花芽,同一个小花,乃至同一个花药中,往往能同时观察到5~9个不同的分裂相,这种减数分裂不同步性是通辽杨适应环境的一种进化表现,对其种群繁殖具有重要意义。 展开更多
关键词 通辽杨 花粉母细胞 减数分裂进程 多核仁 杂合性 大花粉
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微卫星位点在基因组扫描中的信息表现 被引量:22
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作者 袁文涛 徐红岩 +9 位作者 赵进英 丁伟 江宏铨 顾鸣敏 薛京伦 陈家伦 方福德 陈竺 金力 黄薇 《中华医学遗传学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2000年第2期65-71,共7页
目的 研究汉族人群中 139个微卫星位点的杂合度和多态信息量 (polymorphisminformation content,PIC)。方法 应用多重 PCR方法对 139个位点进行扩增。聚丙烯酰胺凝胶电泳分离 ,Gene Scan TM、Genotyper TM软件进行基因分型。结果 这... 目的 研究汉族人群中 139个微卫星位点的杂合度和多态信息量 (polymorphisminformation content,PIC)。方法 应用多重 PCR方法对 139个位点进行扩增。聚丙烯酰胺凝胶电泳分离 ,Gene Scan TM、Genotyper TM软件进行基因分型。结果 这些微卫星位点的杂合度为 0 .35~ 0 .89,其中 88%的杂合度 >0 .6 0 ,PIC为 0 .32~ 0 .88,94%位点的 PIC>0 .5 0。结论 微卫星位点有较高的多态信息量 ,在不同群体间存在一定的差异 ,在遗传分析中有广泛的应用价值。 展开更多
关键词 微卫星位点 聚合酶链反应 杂合度 多态信息量
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中国主栽香菇品种SSR指纹图谱的构建 被引量:28
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作者 叶翔 黄晨阳 +2 位作者 陈强 王钰 张金霞 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期1067-1072,共6页
以商业栽培的25个香菇(Lentinula edodes)品种为材料,应用SSR分子标记技术进行区别性分析。本研究使用14对引物,引物的多态性为100%,每对引物产生的等位基因数为2~9个,平均5.0个,基因型数为2~12个,平均6.3个。预期杂合度为0.1151~0.8... 以商业栽培的25个香菇(Lentinula edodes)品种为材料,应用SSR分子标记技术进行区别性分析。本研究使用14对引物,引物的多态性为100%,每对引物产生的等位基因数为2~9个,平均5.0个,基因型数为2~12个,平均6.3个。预期杂合度为0.1151~0.8131,平均预期杂合度为0.6126;PIC值为0.1064~0.7736,平均PIC值为0.5541。25个品种中,除申香10号和申香12号不能区分外,对其他23个品种清晰鉴别,为构建香菇栽培品种的SSR分子指纹图谱提供了依据和方法。本方法获得的数据可以成为重复性良好、实验室间可比对的香菇栽培品种标准指纹图谱,在品种特异性鉴定中不再需要已有所有品种做参照,较RAPD、ISSR、SRAP等鉴定方法工作量大大减少。 展开更多
关键词 栽培品种鉴定 等位基因 基因型 杂合度
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长江中下游以及东南沿海的7个山羊群体的遗传多样性分析 被引量:19
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作者 汪志国 杨章平 +5 位作者 马月辉 王庆华 毛永江 常洪 周群兰 许明 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期1-6,共6页
利用23个微卫星标记对宜昌白山羊、马头山羊、湘东黑山羊、福清山羊、戴云山羊、黄淮山羊、长江三角洲白山羊等7个山羊群体进行了遗传多样性检测,结果显示:23个基因座中21个座位在所有群体中都具有多态性,基因座BM0203在各个群体中... 利用23个微卫星标记对宜昌白山羊、马头山羊、湘东黑山羊、福清山羊、戴云山羊、黄淮山羊、长江三角洲白山羊等7个山羊群体进行了遗传多样性检测,结果显示:23个基因座中21个座位在所有群体中都具有多态性,基因座BM0203在各个群体中分别为纯合基因座,但存在群体间变异,基因座BM6444在湘东黑山羊、宜昌白山羊群体中为单态,但在其他群体都存在多个等位基因。总群体基因杂合度为0.8190,7个群体PIC平均值在0.6305~0.6919之间。根据Nei氏遗传距离用UPGMA方法对7个群体进行亲缘关系聚类,马头山羊和湘东黑山羊首先聚为一类,福清山羊、戴云山羊、长江三角洲白山羊、黄淮山羊再和前者依次聚类,最后,宜昌白山羊和它们整个聚为一类。 展开更多
关键词 山羊 微卫星 杂合度 遗传距离
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7个绵羊微卫星DNA标记在绵(山)羊群体中的多态性检测 被引量:17
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作者 杨章平 常洪 +3 位作者 孙伟 耿荣庆 任战军 毛永江 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2004年第12期69-74,共6页
 选择分别位于绵羊2,4,6,9,17和19号染色体上的7个微卫星标记OarFCB11,OarFCB128,MAF70,OarAE101,MAF33,OarFCB48和OarFCB304,对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的典型群随机样本相应位点进行了PCR检测。结果表明,每个微卫星座位发现7个...  选择分别位于绵羊2,4,6,9,17和19号染色体上的7个微卫星标记OarFCB11,OarFCB128,MAF70,OarAE101,MAF33,OarFCB48和OarFCB304,对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的典型群随机样本相应位点进行了PCR检测。结果表明,每个微卫星座位发现7个以上等位基因,且均存在多态;湖羊、同羊、长江三角洲白山羊群体杂合度(H)分别为0.9092,0.9177和0.8867,相应的群体基因平均多态信息含量(PIC)分别为0.9024,0.9116和0.8774,有效等位基因数(Ne)分别为11.7723,12.4538和11.6104,均以同羊为最高;以产生有效条带为标志,随机样本的PCR扩增效率存在明显的群体间和座位间差异,以长江三角洲白山羊和OarFCB128座位为最高;以7个座位微卫星等位基因频率推算群体间标准遗传距离,山羊与绵羊群体间遗传距离远大于绵羊群体之间,湖羊、同羊间亲缘距离系数R为0.1998。研究结果提示:选择的7个微卫星DNA座位均为多态座位;以7个微卫星标记为测度,湖羊、同羊及长江三角洲白山羊具有丰富的遗传多态性;7个微卫星标记可进一步用于绵山羊近缘种间遗传分析研究。 展开更多
关键词 微卫星DNA标记 PCR扩增 杂合度 多态信息含量 有效等位基因 标准遗传距离
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运用微卫星标记分析11个鸭种(群)的亲缘关系 被引量:23
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作者 龚道清 张红 +5 位作者 张军 赵旭庭 段修军 杨廷桂 陈章言 高玉时 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1256-1260,共5页
利用9个微卫星标记对11个鸭种(群)的平均基因杂合度、多态信息含量以及群体间的亲缘关系进行分析。结果11个鸭种的平均基因杂合度为0.659 9;平均多态信息含量为0.596 6。其中,黑羽番鸭(白头)平均基因杂合度最高,为0.694 8,荆江麻鸭平均... 利用9个微卫星标记对11个鸭种(群)的平均基因杂合度、多态信息含量以及群体间的亲缘关系进行分析。结果11个鸭种的平均基因杂合度为0.659 9;平均多态信息含量为0.596 6。其中,黑羽番鸭(白头)平均基因杂合度最高,为0.694 8,荆江麻鸭平均遗传杂合度最低,为0.575 7。平均多态信息含量也出现了类似的结果,说明黑羽番鸭(白头)遗传多样性最丰富。根据遗传距离构建NJ系统发生树,系统发生树分析结果表明:黑羽番鸭(纯黑)、黑羽番鸭(白头)、白羽番鸭聚为第1类群;山麻鸭、金定鸭、高邮鸭聚为第2类群;苏牧白羽鸭、苏牧黑羽鸭、龙白鸭、苏牧麻鸭、荆江麻鸭聚为第3类群。 展开更多
关键词 微卫星 杂合度 系统发生树
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