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北京地区乙型肝炎病毒基因型与其感染临床表型的相关性 被引量：7
1
作者 李卓 李洪权 +10 位作者 李俊红 刘英 刘芳 勾春燕 高冀容 单晶 郭新会 殷继明 刘道洁 谢贤春 李辉 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2005年第24期2823-2827,共5页
目的:探讨HBV不同基因型感染患者转归的关系.方法:北京佑安医院住院及门诊1321例肝硬化患者、慢性乙型肝炎患者、慢性乙型肝炎病毒(HBV)携带者和乙型肝炎病毒自限性感染者四组人群进行HBV血清免疫学指标检测、HBVDNA检测、HBV基因型的分... 目的:探讨HBV不同基因型感染患者转归的关系.方法:北京佑安医院住院及门诊1321例肝硬化患者、慢性乙型肝炎患者、慢性乙型肝炎病毒(HBV)携带者和乙型肝炎病毒自限性感染者四组人群进行HBV血清免疫学指标检测、HBVDNA检测、HBV基因型的分析,用HBV特异性基因型引物进行聚合酶链反应(PCR),丙烯酰胺凝胶电泳分析HBVDNA基因型,应用酶联免疫吸附实验方法检测HBV血清免疫学指标.结果:1321例血清标本中804例(60.1%)HBVDNA阳性,HBV基因型分别为A型0.25%、B型20.77%、C型69.53%、B+C混和型9.44%.自限性感染者组14/245例(5.71%)HBVDNA阳性,其中9例C基因型、4例B基因型、1例BC混和基因型;慢性HBV携带者组128/300例(42.67%)HBVDNA阳性,其中88例C基因型、36例B基因型、4例BC混和基因;慢性肝炎患者组608/668例(91.11%)HBVDNA阳性,其中2例A基因型、121例B基因型、417例C基因型、68例B/C混和基因型;肝硬化患者组54/108例(50%)HBVDNA阳性,B型6例、C型45例、B+C混和型3例.肝硬化患者组C基因型为83.33%,分别高于自限性感染者组、慢性HBV携带者组和慢性肝炎患者组(64.29%、68.75%、68.58%,均为P<0.05).年龄,性别与感染HBV基因型无关,HBV感染后病情发展与HBV基因型有关.结论:北京地区乙型肝炎病毒基因型以C型为主,B型次之,其它基因型较少见;肝硬化患者组C基因型分别高于隐性感染者组、慢性乙型肝炎表面抗原携带者组和慢性肝炎患者组;提示乙型肝炎病毒基因型与肝炎病情发展有一定关系. 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基因型 感染
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广东部分地区猪戊型肝炎的分子流行病学调查 被引量：7
2
作者 纪方晓 王衡 +6 位作者 付新亮 王丽芳 白小磊 陈耀 郑运 何淑仪 张桂红 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1268-1273,共6页
为了解广东地区猪戊型肝炎的感染情况,本试验于2015年在广东不同猪场收集了2月龄内猪胆汁73份,RTnPCR检测、全基因组测序、同源性及进化分析结果显示:猪感染戊型肝炎的阳性率为6.8%(5/73),5个ORF2部分核苷酸序列同源性为87.2%~99.4%,属... 为了解广东地区猪戊型肝炎的感染情况,本试验于2015年在广东不同猪场收集了2月龄内猪胆汁73份,RTnPCR检测、全基因组测序、同源性及进化分析结果显示:猪感染戊型肝炎的阳性率为6.8%(5/73),5个ORF2部分核苷酸序列同源性为87.2%~99.4%,属于基因4型,4b、4h亚型。对4b亚型中的1个阳性样品(GZHD)株进行全基因测序,其核苷酸序列与swGX40(EU676172)同源性最高为96.5%,与广东株SS19(JX855794)同源性为93.9%,与人源戊型肝炎病毒(HEV)株CVS-Sie10(LC042232)同源性为94.8%。结果表明:广东地区猪群间HEV流行毒株仍以基因4型为主,且为揭示戊型肝炎的跨种传播提供了新的分子生物学依据。 展开更多
关键词 猪戊型肝炎病毒 人畜共患病 序列分析 基因型
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铜绿假单胞菌基因型与生物被膜形成能力的分析 被引量：2
3
作者 石磊 寇娅丽 《食品与机械》 CSCD 北大核心 2006年第6期5-7,共3页
通过改良的组织平板培养法及ERIC-PCR方法对48株PA生物被膜的形成进行定量分析并绘制其指纹图谱。结果发现48株PA菌株生物被膜形成能力不同,且在17%相似水平上分为A、B、C、D、E五个基因型,其中生物被膜形成能力较弱的菌株大多属于前三... 通过改良的组织平板培养法及ERIC-PCR方法对48株PA生物被膜的形成进行定量分析并绘制其指纹图谱。结果发现48株PA菌株生物被膜形成能力不同,且在17%相似水平上分为A、B、C、D、E五个基因型,其中生物被膜形成能力较弱的菌株大多属于前三个基因型,而D和E基因型则包含了大部分生物被膜形成能力较强的菌株,这表明不同生物被膜形成能力的PA在5个基因型中的分布并非随机的,菌株生物被膜形成能力和基因型之间具有一定的相关性。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 生物被膜 基因型
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DNA修复基因ERCC1单核苷酸多态性与非小细胞肺癌铂类药物化疗预后关系的研究 被引量：1
4
作者 成红艳 陈宝安 +3 位作者 孙新臣 邓雨霞 孙宁 曹远东 《徐州医学院学报》 CAS 2011年第9期620-624,共5页
目的探讨DNA修复基因ERCC1单核苷酸多态性（SNP）与非小细胞肺癌（NSCLC）铂类药物化疗后的预后关系。方法经病理学确诊的晚期NSCLC患者120例，采用铂类为主的两药联合化疗方案，化疗前采集患者外周血。采用基因芯片法检测ERCC1（118）... 目的探讨DNA修复基因ERCC1单核苷酸多态性（SNP）与非小细胞肺癌（NSCLC）铂类药物化疗后的预后关系。方法经病理学确诊的晚期NSCLC患者120例，采用铂类为主的两药联合化疗方案，化疗前采集患者外周血。采用基因芯片法检测ERCC1（118）、（504）的SNP，并随机抽取10％的样本进行基因测序来验证该方法的准确性，比较不同基因型与铂类药物化疗后生存期的关系。结果成功进行基因分型，野生型、杂合型和突变型的叠加荧光分别显示为绿色、黄色和红色，与基冈测序结果完全吻合。中位随访时间11个月。携带ERCCl（118）C／C、C／T＋rr／T基凶型患者铂类药物化疗后中位牛存期（MSq、），1年、2年及3年牛存率分别为10．9个月、35．9％、6．3％、1．6％和13．5个月、59．5％、19．0％、14．3％，2组间差异均有统计学意义（P〈0．05或P〈0．01）；携带ERCC1（504）C／C基因型、C／A＋，A／A基因型1年生仔率、2年牛存率分别为66．7％、16．8％和31．3％、7．8％，2组间差异均有统计学意义（P〈0．05或P〈0．01），而MST和3年生存率2组间差异尤统计学意义（P〉0．05）。结论 该芯片检测方法准确，高通量，价卡2}低廉，适用于大规模样本SNP检测，ERCC1（118）基因多态性与NSCLC患者铂类约物化疗后的生存期有关，有可能作为铂类约物化疗后生存期的预测指标。 展开更多
关键词 肺肿瘤 非小细胞肺癌 化学疗法 基因型 生存期 单核苷酸多态性 基因芯片
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载脂蛋白E基因型多态性与SAH后血管痉挛的相关研究 被引量：2
5
作者 阮健 谢延风 +3 位作者 孙晓川 苏海 江涌 唐文渊 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期79-83,共5页
目的:探讨载脂蛋白E基因(ApolipoproteinE,APOE)多态性与自发性蛛网膜下腔出血(Subarachnoid hemorrhage,SAH)后脑血管痉挛(Cerebral vasospasm,CVS)的相关性。方法:采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-re... 目的:探讨载脂蛋白E基因(ApolipoproteinE,APOE)多态性与自发性蛛网膜下腔出血(Subarachnoid hemorrhage,SAH)后脑血管痉挛(Cerebral vasospasm,CVS)的相关性。方法:采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)检测185例SAH患者,测定APOE基因型多态性,通过TCD评定SAH患者出血后的CVS情况。分型结果与CVS及相关临床资料等分别进行χ2检验和Logistic回归分析。结果:185例SAH患者中,32例APOEε4携带者中有21例(占65.7%)发生CVS,153例非ε4携带者中有56例(占36.7%)发生CVS,ε4携带者的CVS发生率明显高于非ε4携带者(P=0.022);单因素和多因素Logistic回归均提示ε4是CVS的危险因素。结论:APOEε4等位基因是SAH患者发生CVS的危险因素。 展开更多
关键词 载脂蛋白E 基因多态性 蛛网膜下腔出血 脑血管痉挛
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甜瓜耐低钾基因型的苗期筛选研究 被引量：3
6
作者 康利允 常高正 +7 位作者 马政华 李晓慧 高宁宁 梁慎 徐小利 李海伦 王慧颖 赵卫星 《河南农业科学》 北大核心 2020年第3期113-120,共8页
为了筛选耐低钾的厚皮甜瓜品种(系),挖掘甜瓜自身吸收利用钾素的潜力,以河南省主栽品种(系)为主,收集45个甜瓜基因型,在人工气候室穴盘基质栽培条件下(适钾和低钾浓度分别为2.50、0.01 mmol/L)对甜瓜苗期主要农艺性状的差异及相关性进... 为了筛选耐低钾的厚皮甜瓜品种(系),挖掘甜瓜自身吸收利用钾素的潜力,以河南省主栽品种(系)为主,收集45个甜瓜基因型,在人工气候室穴盘基质栽培条件下(适钾和低钾浓度分别为2.50、0.01 mmol/L)对甜瓜苗期主要农艺性状的差异及相关性进行分析,通过主成分分析和隶属函数法筛选耐低钾甜瓜品种(系).结果表明,45个供试品种(系)的11个农艺性状在适钾和低钾条件下变异系数均较大,除SPAD值、适钾水平下的茎粗外,变异系数均为10.0%以上;利用主成分分析方法将原11个农艺性状降维,提取出3个主成分,反映了原信息量的62.338%,钾累积量、株高、植株生物量、根系总吸收面积、根体积在第一主成分上有较高载荷值,SPAD值、叶面积在第二主成分上有较高载荷值,茎粗、根系活力、钾利用指数在第三主成分上有较高载荷值;利用聚类分析方法将45个甜瓜品种(系)划分为4类,Ⅰ类为耐低钾型品种(系),Ⅱ类为中耐低钾型品种(系),Ⅲ类为低钾弱敏感型品种(系),Ⅳ类为低钾敏感型品种(系).初步筛选出将军玉、锦绣、雪蜜、IVF168、丰蜜29、银蜜58等17个耐低钾品种(系),筛选出低钾敏感型品种(系)T120. 展开更多
关键词 甜瓜 耐低钾基因型 农艺性状 主成分分析法 隶属函数法
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胃癌高低发区差异基因型幽门螺杆菌菌株对人胃上皮细胞系 GES-1的损伤作用 被引量：1
7
作者 何红梅 宫月华 袁媛 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2005年第22期2681-2684,共4页
目的:研究胃癌高、低发区差异基因型幽门螺杆(H pylori) 菌株对永生化的非肿瘤胃上皮细胞GES-1的损伤作用;并阐明H pylori致细胞损伤的分子机制．方法:通过常规HE染色、Gimsa染色、W-S银染色鉴定H pylori菌株,采用蛋白酶K及酚-氯仿抽提... 目的:研究胃癌高、低发区差异基因型幽门螺杆(H pylori) 菌株对永生化的非肿瘤胃上皮细胞GES-1的损伤作用;并阐明H pylori致细胞损伤的分子机制．方法:通过常规HE染色、Gimsa染色、W-S银染色鉴定H pylori菌株,采用蛋白酶K及酚-氯仿抽提法提取DNA,PCR法扩增cagA、vacAsl、s2、mla、mlb、m2基因,对H pylori 因亚型进行检测．利用细胞和幽门螺杆菌共培养技术,观察胃癌高低发区差异基因亚型H pylori以及其他两种非差异基因型H pylori对胃上皮细胞系GES-1的损伤作用,并通过免疫细胞化学方法检测GES-1细胞8-OHdG的表达．结果:幽门螺杆菌对GES-1细胞具有损伤作用,随着作用时间的延长,GES-1细胞形态由贴壁的梭形变为圆形．细胞核染色质浓缩,呈新月形聚集于核缘,细胞质浓缩,可见空泡变性,死亡细胞逐渐增多．差异基因型H pylori对GES-1细胞的损伤程度比非差异基因型的损伤作用重．正常对照组 8-OHdG表达基本阴性(0．5%),而H pylori处理组GES-1细胞 8-OHdG表达阳性达98．5％,二者差异显著(P<0．01),有统计学意义．结论:胃癌高发区差异基因型H pylori即cagA+,vacAs1+／m1b+ 对胃上皮细胞GES-1具有更强损伤作用,其损伤具有时间依赖关系;H pylori可能通过增加胃上皮细胞8-OhdG表达而导致正常胃黏膜上皮细胞恶性转化． 展开更多
关键词 胃癌 幽门螺杆菌 差异基因型 胃黏膜上皮细胞 共培养 8-OHDG
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不同基因型棉花下胚轴离体培养胚状体发生的研究 被引量：17
8
作者 董合忠 《莱阳农学院学报》 1991年第2期97-101,共5页
在相同的培养条件下,4个棉花栽培种及其品种间的胚状体发生能力存在明显差异。陆地棉和亚洲棉供试品种的胚状体发生能力明显高于海岛棉与非洲棉。陆地棉栽培品种中,柯字棉系统的胚胎发生能力强,岱字棉系统次之,斯字棉系统最差。胚状体... 在相同的培养条件下,4个棉花栽培种及其品种间的胚状体发生能力存在明显差异。陆地棉和亚洲棉供试品种的胚状体发生能力明显高于海岛棉与非洲棉。陆地棉栽培品种中,柯字棉系统的胚胎发生能力强,岱字棉系统次之,斯字棉系统最差。胚状体发生能力是一种遗传特性,可以通过杂交转变或选择提高。文中提出了体细胞胚胎发生预决定阈值的概念,并以此解释了不同基因型胚状体发生能力存在差异的现象。 展开更多
关键词 棉花 基因型 胚状体发生 离体培养
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