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骨髓瘤细胞可诱导骨髓间充质干细胞的基因表达谱发生暂时和(或)长期性改变
被引量:
4
1
作者
李俊霞
李皎
+7 位作者
王欢
汤郁
杨姣
夏雷
朱彦
陆化
王丽霞
费小明
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期25-31,共7页
目的:正常骨髓间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC)在与骨髓瘤细胞相互作用过程中,MSC的全基因表达谱的改变目前尚未有报道,本研究就对此进行研究并进一步探索多发性骨髓瘤的发病机制。方法:正常人骨髓MSC与骨髓瘤细胞株在Transwel...
目的:正常骨髓间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC)在与骨髓瘤细胞相互作用过程中,MSC的全基因表达谱的改变目前尚未有报道,本研究就对此进行研究并进一步探索多发性骨髓瘤的发病机制。方法:正常人骨髓MSC与骨髓瘤细胞株在Transwell共培养体系培养前后,用全基因表达芯片检测MSC全基因mRNA的表达谱,比较正常MSC在与骨髓瘤细胞共培养(MC组)或共培养后去除骨髓瘤细胞后继续单独培养的MSC(MA组),和MSC单独培养的对照组(MK组)基因表达谱的变化。结果:MC组与MK组相比较,在所有分析的10 000个基因中共发现837个差异基因(837/10 000,8.37%),其中有472个基因表达上调(472/837,56.39%),365个基因表达下调(365/837,43.61%)。而MA组与MK组相比较,共发现367个差异基因,其中有218个基因表达上调(218/367,59.40%),149个基因表达下调(149/367,40.60%)。从芯片结果中筛选出MMP1、FGFR2、ANGPTL4、MFAP5、TGM2、STC1、CCL7和IL-32这8个基因,经定量PCR验证后的结果与基因芯片结果相一致。结论:骨髓瘤细胞可以诱导正常骨髓MSC多种基因表达改变,并且有些改变即使在骨髓MSC脱离骨髓瘤细胞后仍可存在;此外,初步筛选到8个差异表达基因,其中7个基因在多发性骨髓瘤发病机制中的作用既往未见报道,有待今后进一步研究。
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关键词
多发性骨髓瘤
骨髓间充质干细胞
共培养
基因表达谱
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职称材料
基于cDNA-SCoT差异显示的甘蔗应答水分胁迫基因表达谱分析(英文)
被引量:
1
2
作者
吴凯朝
黄诚梅
+7 位作者
邓智年
魏源文
曹辉庆
徐林
蒋胜理
吴建明
杨丽涛
李杨瑞
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期1999-2008,共10页
【目的】研究甘蔗应答水分胁迫差异基因表达,进一步探究甘蔗应答水分胁迫的分子机制,为开展甘蔗抗旱综合性遗传改良研究提供科学依据。【方法】选用GT11为材料,分别构建对照、干旱、复水3个处理总RNA混合池,使用cDNA-SCoT差异显示构建G...
【目的】研究甘蔗应答水分胁迫差异基因表达,进一步探究甘蔗应答水分胁迫的分子机制,为开展甘蔗抗旱综合性遗传改良研究提供科学依据。【方法】选用GT11为材料,分别构建对照、干旱、复水3个处理总RNA混合池,使用cDNA-SCoT差异显示构建GT11伸长期应答水分胁迫的基因表达谱,筛选、分离TDFs进行测序,在NCBI数据库进行BLAST同源性检索,根据同源基因推测基因功能。【结果】通过42条SCoT引物筛选得到180个TDFs,有100个TDFs与NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,根据同源基因功能可分为14类:新陈代谢相关基因(11个)、能量代谢相关基因(12个)、运输途径相关基因(5个)、通信及信号转导相关基因(6个)、细胞循环及DNA加工相关基因(3个)、转录调控因子相关基因(3个)、蛋白质合成相关基因(17个)、蛋白质加工相关基因(1个)、结合功能蛋白相关基因(7个)、环境互作相关基因(3个)、转座子、毒性及质粒蛋白相关基因(5个)、细胞成分生物合成相关基因(1个)、防御相关基因(4个)和未知功能蛋白基因(22个)。【结论】甘蔗应答水分胁迫调节途径具有多样性、复杂性、协调性和网络性;应用cDNA-SCoT差异显示筛选获得水分胁迫相关TDFs,可为进一步研究甘蔗应答水分调控途径的分子机理提供重要信息。
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关键词
甘蔗
cDNA-SCoT
水分胁迫
复水
基因表达谱
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职称材料
当归对自发性高血压大鼠脑组织Tnfaip8l2、Ahsg及Tlr3基因表达的影响
被引量:
10
3
作者
伊琳
赵昕
李屹
《中国动脉硬化杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第10期891-893,共3页
目的探讨当归对自发性高血压(SHR)大鼠脑组织肿瘤坏死因子α诱导蛋白8样蛋白(Tnfaip8l2)、α2-HS糖蛋白(Ahsg)及Toll样受体3(Tlr3)基因表达谱的影响。方法将SHR大鼠分为当归组、模型组,并将同周龄的Wistar大鼠作为对照组。测定用药前后...
目的探讨当归对自发性高血压(SHR)大鼠脑组织肿瘤坏死因子α诱导蛋白8样蛋白(Tnfaip8l2)、α2-HS糖蛋白(Ahsg)及Toll样受体3(Tlr3)基因表达谱的影响。方法将SHR大鼠分为当归组、模型组,并将同周龄的Wistar大鼠作为对照组。测定用药前后各组尾动脉收缩压;分组灌胃给药4周后,取大鼠脑组织,提取RNA进行表达谱的测定。结果当归可降低SHR大鼠的血压水平;同时基因表达谱分析显示当归可导致Tnfaip8l2、Ahsg及TLR3基因表达上调,且为差异表达上调基因,而这三个基因均为动脉粥样硬化抑制因子。结论当归具有一定的降压作用,并对SHR脑组织基因表达谱产生影响,通过抑制动脉粥样硬化的发生发挥作用。
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关键词
当归
基因表达谱
肿瘤坏死因子α诱导蛋白8样蛋白
α2-HS糖蛋白
TOLL样受体3
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职称材料
当归对原发性高血压大鼠脑组织基因表达谱的影响
被引量:
9
4
作者
伊琳
赵昕
李屹
《中国现代医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期24-27,共4页
目的探讨当归对原发性高血压大鼠(SHR)大鼠脑组织基因表达谱的影响。方法将SHR分为当归组、模型对照组,并将同周龄的Wistar大鼠作为正常对照组。测定用药前后不同模型组尾动脉收缩压,分组给药4周后,取大鼠脑组织,提取RNA送博淼生物科技...
目的探讨当归对原发性高血压大鼠(SHR)大鼠脑组织基因表达谱的影响。方法将SHR分为当归组、模型对照组,并将同周龄的Wistar大鼠作为正常对照组。测定用药前后不同模型组尾动脉收缩压,分组给药4周后,取大鼠脑组织,提取RNA送博淼生物科技(北京)有限公司进行表达谱的测定。结果当归可降低SHR的血压水平。当归组与模型组比较,当归组的变化基因有326个,其中184个基因表达上调,142个基因表达下调:信号值变化幅度2倍以上的差异表达基因85个,上调的基因53个,下调的基因32个,在85个差异表达基因中,已知生物学过程的基因有38个(上调23个,下调15个),主要与信号传导途径的基因相关,另外也与代谢、转录及蛋白质结合等基因相关。结论当归具有一定的降压作用,并对SHR脑组织基因表达谱产生影响,可能主要通过信号传导途径发挥作用。
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关键词
当归
原发性高血压大鼠
基因表达谱
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职称材料
题名
骨髓瘤细胞可诱导骨髓间充质干细胞的基因表达谱发生暂时和(或)长期性改变
被引量:
4
1
作者
李俊霞
李皎
王欢
汤郁
杨姣
夏雷
朱彦
陆化
王丽霞
费小明
机构
南京医科大学第一附属医院血液科
江苏大学附属医院血液科.江苏镇江
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期25-31,共7页
基金
国家自然科学基金(81202358)
江苏省自然科学基金(BK2008236)
镇江市社会发展项目(SH2010030,SH2011021)
文摘
目的:正常骨髓间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC)在与骨髓瘤细胞相互作用过程中,MSC的全基因表达谱的改变目前尚未有报道,本研究就对此进行研究并进一步探索多发性骨髓瘤的发病机制。方法:正常人骨髓MSC与骨髓瘤细胞株在Transwell共培养体系培养前后,用全基因表达芯片检测MSC全基因mRNA的表达谱,比较正常MSC在与骨髓瘤细胞共培养(MC组)或共培养后去除骨髓瘤细胞后继续单独培养的MSC(MA组),和MSC单独培养的对照组(MK组)基因表达谱的变化。结果:MC组与MK组相比较,在所有分析的10 000个基因中共发现837个差异基因(837/10 000,8.37%),其中有472个基因表达上调(472/837,56.39%),365个基因表达下调(365/837,43.61%)。而MA组与MK组相比较,共发现367个差异基因,其中有218个基因表达上调(218/367,59.40%),149个基因表达下调(149/367,40.60%)。从芯片结果中筛选出MMP1、FGFR2、ANGPTL4、MFAP5、TGM2、STC1、CCL7和IL-32这8个基因,经定量PCR验证后的结果与基因芯片结果相一致。结论:骨髓瘤细胞可以诱导正常骨髓MSC多种基因表达改变,并且有些改变即使在骨髓MSC脱离骨髓瘤细胞后仍可存在;此外,初步筛选到8个差异表达基因,其中7个基因在多发性骨髓瘤发病机制中的作用既往未见报道,有待今后进一步研究。
关键词
多发性骨髓瘤
骨髓间充质干细胞
共培养
基因表达谱
Keywords
multiple
myeloma
bone
marrow
mesenchymal
stem
cells
co-culture
gene
expressing
profile
分类号
R329.2 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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职称材料
题名
基于cDNA-SCoT差异显示的甘蔗应答水分胁迫基因表达谱分析(英文)
被引量:
1
2
作者
吴凯朝
黄诚梅
邓智年
魏源文
曹辉庆
徐林
蒋胜理
吴建明
杨丽涛
李杨瑞
机构
广西农业科学院甘蔗研究所/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室
广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室
广西大学/广西亚热带生物资源保护和利用重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第12期1999-2008,共10页
基金
National Natural Science Foundation of China(31400281)
Guangxi Natural Science Foundation(2014GXNSFAA118128)
Basic Special Fund of Guangxi Academy of Agricultural Sciences(2015JZ11,2015JM24)
文摘
【目的】研究甘蔗应答水分胁迫差异基因表达,进一步探究甘蔗应答水分胁迫的分子机制,为开展甘蔗抗旱综合性遗传改良研究提供科学依据。【方法】选用GT11为材料,分别构建对照、干旱、复水3个处理总RNA混合池,使用cDNA-SCoT差异显示构建GT11伸长期应答水分胁迫的基因表达谱,筛选、分离TDFs进行测序,在NCBI数据库进行BLAST同源性检索,根据同源基因推测基因功能。【结果】通过42条SCoT引物筛选得到180个TDFs,有100个TDFs与NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,根据同源基因功能可分为14类:新陈代谢相关基因(11个)、能量代谢相关基因(12个)、运输途径相关基因(5个)、通信及信号转导相关基因(6个)、细胞循环及DNA加工相关基因(3个)、转录调控因子相关基因(3个)、蛋白质合成相关基因(17个)、蛋白质加工相关基因(1个)、结合功能蛋白相关基因(7个)、环境互作相关基因(3个)、转座子、毒性及质粒蛋白相关基因(5个)、细胞成分生物合成相关基因(1个)、防御相关基因(4个)和未知功能蛋白基因(22个)。【结论】甘蔗应答水分胁迫调节途径具有多样性、复杂性、协调性和网络性;应用cDNA-SCoT差异显示筛选获得水分胁迫相关TDFs,可为进一步研究甘蔗应答水分调控途径的分子机理提供重要信息。
关键词
甘蔗
cDNA-SCoT
水分胁迫
复水
基因表达谱
Keywords
sugarcane
cDNA-SCoT
water
stress
rewatering
gene
expressing
profile
分类号
S566 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
当归对自发性高血压大鼠脑组织Tnfaip8l2、Ahsg及Tlr3基因表达的影响
被引量:
10
3
作者
伊琳
赵昕
李屹
机构
甘肃中医学院中西医结合系
兰州大学基础医学院遗传学研究所
出处
《中国动脉硬化杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第10期891-893,共3页
文摘
目的探讨当归对自发性高血压(SHR)大鼠脑组织肿瘤坏死因子α诱导蛋白8样蛋白(Tnfaip8l2)、α2-HS糖蛋白(Ahsg)及Toll样受体3(Tlr3)基因表达谱的影响。方法将SHR大鼠分为当归组、模型组,并将同周龄的Wistar大鼠作为对照组。测定用药前后各组尾动脉收缩压;分组灌胃给药4周后,取大鼠脑组织,提取RNA进行表达谱的测定。结果当归可降低SHR大鼠的血压水平;同时基因表达谱分析显示当归可导致Tnfaip8l2、Ahsg及TLR3基因表达上调,且为差异表达上调基因,而这三个基因均为动脉粥样硬化抑制因子。结论当归具有一定的降压作用,并对SHR脑组织基因表达谱产生影响,通过抑制动脉粥样硬化的发生发挥作用。
关键词
当归
基因表达谱
肿瘤坏死因子α诱导蛋白8样蛋白
α2-HS糖蛋白
TOLL样受体3
Keywords
Angelica
gene
express
ive
profile
Tnfaip812
Ahsg
Tlr3
分类号
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
当归对原发性高血压大鼠脑组织基因表达谱的影响
被引量:
9
4
作者
伊琳
赵昕
李屹
机构
甘肃中医学院中西医结合系
兰州大学基础医学院遗传学研究所
出处
《中国现代医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期24-27,共4页
基金
甘肃省高等学校基本科研项目(No:2010-3)
文摘
目的探讨当归对原发性高血压大鼠(SHR)大鼠脑组织基因表达谱的影响。方法将SHR分为当归组、模型对照组,并将同周龄的Wistar大鼠作为正常对照组。测定用药前后不同模型组尾动脉收缩压,分组给药4周后,取大鼠脑组织,提取RNA送博淼生物科技(北京)有限公司进行表达谱的测定。结果当归可降低SHR的血压水平。当归组与模型组比较,当归组的变化基因有326个,其中184个基因表达上调,142个基因表达下调:信号值变化幅度2倍以上的差异表达基因85个,上调的基因53个,下调的基因32个,在85个差异表达基因中,已知生物学过程的基因有38个(上调23个,下调15个),主要与信号传导途径的基因相关,另外也与代谢、转录及蛋白质结合等基因相关。结论当归具有一定的降压作用,并对SHR脑组织基因表达谱产生影响,可能主要通过信号传导途径发挥作用。
关键词
当归
原发性高血压大鼠
基因表达谱
Keywords
Angelica
SHR
gene
express
ive
profile
分类号
R544.1 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
骨髓瘤细胞可诱导骨髓间充质干细胞的基因表达谱发生暂时和(或)长期性改变
李俊霞
李皎
王欢
汤郁
杨姣
夏雷
朱彦
陆化
王丽霞
费小明
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
下载PDF
职称材料
2
基于cDNA-SCoT差异显示的甘蔗应答水分胁迫基因表达谱分析(英文)
吴凯朝
黄诚梅
邓智年
魏源文
曹辉庆
徐林
蒋胜理
吴建明
杨丽涛
李杨瑞
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
下载PDF
职称材料
3
当归对自发性高血压大鼠脑组织Tnfaip8l2、Ahsg及Tlr3基因表达的影响
伊琳
赵昕
李屹
《中国动脉硬化杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
10
下载PDF
职称材料
4
当归对原发性高血压大鼠脑组织基因表达谱的影响
伊琳
赵昕
李屹
《中国现代医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
9
下载PDF
职称材料
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