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水稻(Oryza sativa L·)捕光叶绿素a/b结合蛋白基因全长cDNA的克隆和特性分析 被引量：22
1
作者 向太和 王利琳 庞基良 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期1227-1232,共6页
根据捕光叶绿素a／b结合蛋白基因（cab）家族中的保守序列设计PCR引物，扩增出的约310bpcDNA小片段为分子杂交探针，对构建的水稻cDNA文库进行杂交筛选，并结合PCR分析确定阳性克隆中cDNA片段的大小。通过对插入的cDNA片段最长的阳性克... 根据捕光叶绿素a／b结合蛋白基因（cab）家族中的保守序列设计PCR引物，扩增出的约310bpcDNA小片段为分子杂交探针，对构建的水稻cDNA文库进行杂交筛选，并结合PCR分析确定阳性克隆中cDNA片段的大小。通过对插入的cDNA片段最长的阳性克隆进行测序分析验证，克隆了水稻中1个cab基因全长cDNA，命名为cab-n8（GenBank登记号：AY445626）。cab-n8长为1128bp，从第55bp开始至789bp含有1个开放阅读框和1个终止密码子，编码244个氨基酸（GenBank登记号为AAR19267．1）；在3’端含有330bp的非编码区和Poly（A）18；在5’端有45bp的非编码区，在转录起始位点附近有TCA序列。通过序列分析，cab-n8编码的蛋白质在第54—216位包括典型的捕光叶绿素a／b结合蛋白功能域（chlorophll a／b binding domain）；在第141—158位含有无名指结构功能域（ring finger structure domain），该位点可能与捕光叶绿素结合蛋白与叶绿素a／b的结合有关；在第194—231位含有甘油醛-3-磷酸脱氢酶C端功能域（C-terminal domain of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like）。cab-n8编码的蛋白质预测的等电点和分子量分别为6．52和26955．80 Da。通过比较分析，cab-n8DNA序列（AY445626）和编码的氨基酸序列（AAR19267．1）与cab27DNA序列（AF094775．1）和编码的氨基酸序列（AAC67557．1）相似性最高，均为97％，显示cab家族基因在进化过程中是相当保守的。Northern blot分析表明，该基因在水稻叶和茎中表达没有差异，但光对其表达有明显的诱导促进作用。 展开更多
关键词 水稻 叶绿素a/b结合蛋白基因 基因克隆 分析
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植物甜菜碱醛脱氢酶基因研究进展 被引量：23
2
作者 刘振林 戴思兰 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2004年第3期104-112,共9页
　对近年来植物甜菜碱醛脱氢酶(BADH)基因的研究现状进行了系统分析。对目前已分离到的10个不同种植物BADH基因的序列分析发现:该基因编码区序列趋于保守;在不同物种间存在拷贝数不同的差异;其表达也存在转录或转录后水平的差异,具有组... 　对近年来植物甜菜碱醛脱氢酶(BADH)基因的研究现状进行了系统分析。对目前已分离到的10个不同种植物BADH基因的序列分析发现:该基因编码区序列趋于保守;在不同物种间存在拷贝数不同的差异;其表达也存在转录或转录后水平的差异,具有组织特异性、组成型和诱导型的不同表达类型;氨基酸序列同源性反映的种间关系与这些种的系统分类位置一致,表明该基因的进化与植物的系统进化间具有密切关系。此外,还对信号肽区域、外显子剪切位点以及BADH定位的变化等进行了分析。 展开更多
关键词 植物 甜菜碱醛脱氢酶 基因结构 序列分析 表达特性 系统进化 渗透调节剂
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抗除草剂转基因黄瓜的获得及T_1植株抗性鉴定 被引量：21
3
作者 金红 杜胜利 +1 位作者 陈峥 魏爱民 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2003年第1期44-46,共3页
从影响黄瓜转基因体系的外植体类型、农杆菌共浸染时间、是否加入乙酰丁香酮等因素摸索,建立了黄瓜遗传转化体系;将抗除草剂基因bar以农杆菌共浸染法导入到黄瓜父本品种M1子叶中,经历愈伤组织分化、芽诱导和生根等过程获得落地转化株系... 从影响黄瓜转基因体系的外植体类型、农杆菌共浸染时间、是否加入乙酰丁香酮等因素摸索,建立了黄瓜遗传转化体系;将抗除草剂基因bar以农杆菌共浸染法导入到黄瓜父本品种M1子叶中,经历愈伤组织分化、芽诱导和生根等过程获得落地转化株系,通过特异性引物的PCR鉴定,13个株系扩增出bar基因片段。T0自交获得T1转基因植株,经1000倍除草剂巴士达喷施处理,其中84%表现为较高的抗性。 展开更多
关键词 抗除草剂 转基因 黄瓜 T1植株 抗性鉴定 遗传转化
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10株鸭源新城疫病毒的分离鉴定及F基因遗传进化分析 被引量：24
4
作者 孙杰 刁有祥 +4 位作者 李建侠 吴焕荣 颜贇 杨建朋 李瑶瑶 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期1054-1060,共7页
为调查山东省鸭群中新城疫病毒(NDV)的流行情况,对2007—2009年山东不同地区发病鸭群进行了NDV的分离鉴定,并对分离的10株鸭源NDV进行了生物学特性和遗传特性研究。结果显示:10株鸭源NDV的致病指数MDT和ICPI测定结果分别为50.4～60.0和1... 为调查山东省鸭群中新城疫病毒(NDV)的流行情况,对2007—2009年山东不同地区发病鸭群进行了NDV的分离鉴定,并对分离的10株鸭源NDV进行了生物学特性和遗传特性研究。结果显示:10株鸭源NDV的致病指数MDT和ICPI测定结果分别为50.4～60.0和1.66～1.78,表明10株分离株均属强毒株。致病性试验显示,3株代表毒株对不同日龄雏鸭均具有较强的致病性,发病率和死亡率分别达70%～100%和20%～70%。对F基因序列分析表明,相对于基因Ⅰ～Ⅵ型NDV,10株鸭源NDVF蛋白存在较大变异,这些变异主要集中在1—30、101—124、479—494和509—516 aa处,且在52、71、176、272、314、402和489位出现了与近几年流行毒株一致的氨基酸替代。核苷酸同源性分析结果表明,10株鸭源NDV之间同源性在95.8%～99.9%,与2000年以来国内外分离的基因Ⅶ型NDV同源性较高,在95.7%～99.8%,与传统LaSota、F48E9同源性较低,为83.8%～90.9%。遗传进化分析结果显示分离毒株均属于基因Ⅶd型。此外,10株鸭源NDV还具有大多数鹅源NDV所特有的973位和1 249位RsaⅠ位点。上述结果表明基因Ⅶd型NDV是造成我国鸭群近年来发生新城疫的主要病原,鸭源NDV很可能源于早期的鹅源NDV。 展开更多
关键词 鸭 新城疫 F基因 遗传特性
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农杆菌介导iaaM基因黄瓜遗传转化体系的建立 被引量：21
5
作者 苏绍坤 刘宏宇 秦智伟 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第3期289-293,共5页
以已经建立的高频黄瓜再生体系为基础,从影响黄瓜转基因体系的农杆菌侵染时间,共培养时是否加入乙酰丁香酮等因素优化了黄瓜遗传转化体系;将单性结实基因iaaM以农杆菌介导法导入到东农649品种黄瓜子叶节中,经过不定芽诱导和生根等过程... 以已经建立的高频黄瓜再生体系为基础,从影响黄瓜转基因体系的农杆菌侵染时间,共培养时是否加入乙酰丁香酮等因素优化了黄瓜遗传转化体系;将单性结实基因iaaM以农杆菌介导法导入到东农649品种黄瓜子叶节中,经过不定芽诱导和生根等过程获得了转基因株系,通过特异性引物的PCR鉴定,40个株系扩增出iaaM目的基因片段。PCR-Southern检测为阳性。转基因阳性植株移栽到温室中,其果实经检测80%为单性结实黄瓜。 展开更多
关键词 黄瓜 单性结实基因iaaM 遗传转化 抗性鉴定
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植物质膜钾离子转运体研究进展 被引量：12
6
作者 邱全胜 《植物学通报》 CSCD 2000年第1期34-38,共5页
近年 ,随着分子生物学技术的不断发展和广泛应用 ,有关植物质膜钾离子转运体的研究取得重要进展。目前已经克隆到多种质膜钾离子转运体基因并对钾离子转运体生化特性以及结构功能进行了广泛研究。研究认为 ,质膜钾离子转运体可分为钾离... 近年 ,随着分子生物学技术的不断发展和广泛应用 ,有关植物质膜钾离子转运体的研究取得重要进展。目前已经克隆到多种质膜钾离子转运体基因并对钾离子转运体生化特性以及结构功能进行了广泛研究。研究认为 ,质膜钾离子转运体可分为钾离子载体和钾离子通道。钾离子通道又可分为内向性K+通道α亚基、K+通道β亚基及外向性K+通道等三类。本文对上述质膜钾离子转运体的生化特性以及结构功能研究的进展进行了综述。 展开更多
关键词 质膜 钾离子转运体 基因克隆 特性 植物
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球毛壳菌60S核糖体蛋白L10a基因克隆与特性分析 被引量：17
7
作者 刘志华 杨谦 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期24-28,共5页
用粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)XP_322380和赤霉菌(G ibberella zeae)PH-1(EAA76971)的60S核糖体蛋白L10 a基因(60S ribosom al prote in L10 a,RPL10 a)蛋白序列对球毛壳菌(Chaetom ium globosum)ESTs序列数据库进行tB lastn检索,获... 用粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)XP_322380和赤霉菌(G ibberella zeae)PH-1(EAA76971)的60S核糖体蛋白L10 a基因(60S ribosom al prote in L10 a,RPL10 a)蛋白序列对球毛壳菌(Chaetom ium globosum)ESTs序列数据库进行tB lastn检索,获得了球毛壳菌RPL10 a cDNA序列。cDNA序列长765 bp,开放阅读框654 bp,编码217个氨基酸组成的多肽,蛋白分子量为23.9 kD。B lastP分析表明该基因氨基酸序列与粗糙脉胞菌相似最高为89%;与玉蜀黍黑粉菌(Ustilago maydis)相似性最低为78%。cDNA序列及推测的氨基酸序列在GenBank登录(登录号分别为AY669070,AAT74578)。 展开更多
关键词 球毛壳菌 60S核糖体蛋白L10a 基因克隆 特性分析 生物信息学
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竹子捕光叶绿素a/b结合蛋白基因全长的克隆和序列分析 被引量：14
8
作者 高志民 李雪平 +1 位作者 彭镇华 岳永德 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第3期34-38,共5页
采用RT-PCR技术与RACE技术，从绿竹中克隆到捕光叶绿素a／b结合蛋白基因全长eDNA，命名为cab-BO1（GenBank登记号：EF061137）。该基因长1102bp，从第64—861bp含有1个开放阅读框，编码265个氨基酸。cab-BO1编码的氨基酸中第64-232位包... 采用RT-PCR技术与RACE技术，从绿竹中克隆到捕光叶绿素a／b结合蛋白基因全长eDNA，命名为cab-BO1（GenBank登记号：EF061137）。该基因长1102bp，从第64—861bp含有1个开放阅读框，编码265个氨基酸。cab-BO1编码的氨基酸中第64-232位包括典型的捕光叶绿素a／b结合蛋白功能域，第9—11位为蛋白激酶c的磷酸化位点，第27～52位为泛素结构功能域信号，第55～58位为酪氨酸激酶（CK2）磷酸化位点O序列相似性分析结果表明：cab-BO1 DNA序列和编码的氨基酸序列与玉米、小果野蕉、小麦、水稻等的cab基因及其氨基酸序列的相似性分别在85％和89％以上，显示了cab家族基因在进化过程中的保守性。 展开更多
关键词 绿竹 叶绿素a/b结合蛋白基因(cab) 基因克隆 序列分析
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一个新的水稻液泡膜Na^+/H^+逆向转运蛋白基因的克隆及表达特征 被引量：11
9
作者 邱生平 周国安 +5 位作者 陆驹飞 黄骥 潘丽娟 王建飞 杨清 张红生 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期119-124,共6页
通过RT-PCR技术从水稻幼苗组织中克隆了一个新的Na+/H+逆向转运蛋白基因OsNHX2,它编码一条长544氨基酸的多肽。OsNHX2与水稻和拟南芥的液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白OsNHX1、AtNHX1氨基酸序列一致性分别为78%和77%。基因结构分析表明OsNHX2... 通过RT-PCR技术从水稻幼苗组织中克隆了一个新的Na+/H+逆向转运蛋白基因OsNHX2,它编码一条长544氨基酸的多肽。OsNHX2与水稻和拟南芥的液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白OsNHX1、AtNHX1氨基酸序列一致性分别为78%和77%。基因结构分析表明OsNHX2与OsNHX1具有类似的外显子和内含子构成,但不同于拟南芥AtNHX1,表明OsNHX2与OsNHX1可能起源于单双子叶植物分化后的水稻染色体复制。半定量RT-PCR方法检测了OsNHX2与OsNHX1在水稻耐盐品种韭菜青与盐敏感品种IR28的地上部与根部的表达。结果表明:耐盐品种韭菜青的OsNHX2与OsNHX1基因在盐胁迫下表达持续增强,而在盐敏感品种IR28的地上部,OsNHX2基因在盐胁迫处理后1h表达增强后立即减弱,根部的表达则基本不变,而IR28地上部与根部OsNHX1则在盐胁迫处理初期表达增强,随后即减弱。研究结果表明水稻两个液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白基因OsNHX2、OsNHX1在盐敏感程度不同的水稻品种中表达有所不同,液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白基因的转录调控可能是决定水稻耐盐能力的一个重要因素。 展开更多
关键词 水稻 盐胁迫 液泡膜Na^+/H^+逆向转运蛋白基因 基因克隆 表达特性
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2017～2018年河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染病例中人副流感病毒3型基因特征分析 被引量：14
10
作者 周杉杉 毛乃颖 +4 位作者 姬奕昕 张燕 崔爱利 许文波 扈瑞平 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期730-740,共11页
严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起... 严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起呼吸道感染的常见病原。为分析河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染(SARI)病例中人副流感病毒3型(HPIV-3)检出状况及血凝素-神经氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因特征,采用实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)方法对河南省漯河市中心医院于2017年10月10日至2018年12月27日送检的627份SARI病例咽拭子进行核酸检测,筛查HPIV-3阳性标本,对HPIV-3阳性标本用反转录聚合酶链反应(Reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增其HN基因,并对扩增产物进行序列测定,与GenBank数据库中的国内外HPIV-3 HN基因进行对比分析,绘制系统进化树,并分析基因特征。627份咽拭子标本中,HPIV-3阳性有27份,检出率为4.3%。59%的HPIV-3阳性病例分布于春夏季,发病人群中,6岁以下儿童占96.3%。通过RT-PCR方法共获得18株HPIV-3的HN基因,经过序列测定及对比分析可划分为两个基因亚型:C3a和C3b。C3a亚型有10株,C3b亚型有8株。18株HPIV-3的HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.1%~100.0%和98.8%~100%。与原型株Wash/47885/57相比,本次扩增18株HPIV-3 HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5%~95.0%和97.0%~97.7%。与GenBank中国内外的HPIV-3 HN基因的代表株比较,其核苷酸及氨基酸同源性分别为94.1%~98.5%和96.8%~97.0%。本研究提示HPIV-3是河南省漯河市儿童SARI病例中检出的病原之一,2017年10月至2018年12月期间,至少有C3a、C3b两个基因亚型的HPIV-3毒株在漯河市共流行。 展开更多
关键词 人副流感病毒(HPIVs) 血凝素-神经氨酸酶蛋白(HN)基因 基因特征 同源性分析
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水稻硝酸盐转运蛋白基因OsTNrt2.1的编码蛋白特征和表达 被引量：11
11
作者 徐海荣 谷俊涛 +3 位作者 路文静 邓若磊 曹云飞 肖凯 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期723-730,共8页
根据Nipponbare的OsNrt2.1cDNA序列,从氮效率较高的水稻品种TP309中克隆了与OsNrt2.1高度同源的硝酸盐转运蛋白(NRT)基因OsTNrt2.1。其开放阅读框为1 602 bp,编码533个氨基酸残基。OsTNrt2.1具有NRT共有的结构特征,与拟南芥、玉米、小... 根据Nipponbare的OsNrt2.1cDNA序列,从氮效率较高的水稻品种TP309中克隆了与OsNrt2.1高度同源的硝酸盐转运蛋白(NRT)基因OsTNrt2.1。其开放阅读框为1 602 bp,编码533个氨基酸残基。OsTNrt2.1具有NRT共有的结构特征,与拟南芥、玉米、小麦、大麦和烟草的NRT基因高度同源。OsTNrt2.1的表达表现器官特异性,在根中高于在叶中。此外,OsTNrt2.1的表达受NH+4的抑制和NO-3的诱导,并具典型的昼夜节律特征。在不同NO-3浓度下,OsTNrt2.1的表达水平相近,表明OsTNrt2.1可能是具有双亲和特征的NRT基因。在不同氮源及不同介质氮浓度条件下,OsTNrt2.1在根中的表达均高于在叶中,表明OsTNrt2.1对于根系吸收NO-3可能具有重要作用。 展开更多
关键词 水稻(Oryza sativa) NRT基因 OsTNrt2.1 基因特征 基因表达
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萝卜扩展蛋白基因RsEXPB1克隆与表达特征分析 被引量：14
12
作者 荆赞革 柳李旺 +3 位作者 龚义勤 姜立娜 孙新菊 周艳孔 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第4期801-805,共5页
本文根据GenBank中扩展蛋白序列设计特异引物,从萝卜高代自交系"NAU-LVYH06"中克隆到一个扩展蛋白基因RsEXPB1(GenBank accession No.GQ387363,GQ387364)。其编码区基因组序列长度为1430bp,包括4个外显子和3个内含子;RT-PCR... 本文根据GenBank中扩展蛋白序列设计特异引物,从萝卜高代自交系"NAU-LVYH06"中克隆到一个扩展蛋白基因RsEXPB1(GenBank accession No.GQ387363,GQ387364)。其编码区基因组序列长度为1430bp,包括4个外显子和3个内含子;RT-PCR获得长度为898bp的cDNA,开放读码框(ORF)为29～820bp,推导编码263个氨基酸,含有1个组氨酸(His-Phe-Asp,HFD)功能域,ORF和推导蛋白序列与拟南芥AtEXPB3(GenBank accession No.NM118965)同源性分别为87%、92%。半定量RT-PCR检测到该基因主要在萝卜生育前期的幼叶、肉质根木质部和韧皮部中表达,且表达丰度可能与该部位细胞生长分裂状态相关,差异较明显。 展开更多
关键词 萝卜(Raphanus SATIVUS L.) 扩展蛋白 基因克隆 表达特征
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阿拉伯糖苷酶基因的克隆、表达及表达产物的酶稳定性 被引量：13
13
作者 薛业敏 卢晨 +1 位作者 毛忠贵 邵蔚蓝 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期9-13,共5页
阿拉伯糖苷酶 /木糖苷酶是木聚糖类半纤维素生物降解和转化所必需的酶类。本文在国内首次报道对该酶的研究 :通过PCR从产乙醇热厌氧杆菌ThermoanaerobacterethanolicusJW2 0 0克隆出编码高度热稳定性阿拉伯糖苷酶 /木糖苷酶的基因 ,与... 阿拉伯糖苷酶 /木糖苷酶是木聚糖类半纤维素生物降解和转化所必需的酶类。本文在国内首次报道对该酶的研究 :通过PCR从产乙醇热厌氧杆菌ThermoanaerobacterethanolicusJW2 0 0克隆出编码高度热稳定性阿拉伯糖苷酶 /木糖苷酶的基因 ,与组氨酸标签融合 ,以高拷贝质粒pAlter Ex1在大肠杆菌中得到高效表达 ;基因表达产物通过热处理和亲和层析柱纯化后 ,酶纯度达电泳均一。纯化重组酶稳定性检测表明 ,得到的阿拉伯呋喃糖苷酶在pH4 .2～ 8.2之间酶活力稳定 ,75℃的半衰期为 1h ;β 木糖苷酶在pH 5 .0～ 8.2之间有较高的稳定性 ,酶 1h半衰期温度为 84℃。 展开更多
关键词 阿拉伯糖苷酶 基因克隆 基因表达 表达产物 酶稳定性 半纤维素 饲料 加工
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白及苯丙氨酸解氨酶基因的克隆、序列特征及激素响应表达分析 被引量：13
14
作者 罗才林 李林 +5 位作者 陈立 邓琴 张俊 马璇 徐德林 钱刚 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期694-701,共8页
目的苯丙氨酸解氨酶(PAL)是植物次生代谢与抗逆反应的关键酶类之一,研究PAL基因的序列信息与逆境胁迫响应模式,揭示其蛋白结构与功能及抗逆信号网络。方法采用RT-PCR、RACE技术获得白及PAL基因c DNA全长;Protparam、SOPMA、SWISS-MODEL... 目的苯丙氨酸解氨酶(PAL)是植物次生代谢与抗逆反应的关键酶类之一,研究PAL基因的序列信息与逆境胁迫响应模式,揭示其蛋白结构与功能及抗逆信号网络。方法采用RT-PCR、RACE技术获得白及PAL基因c DNA全长;Protparam、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学软件分析其编码蛋白的理化特性、结构域等特征;DNAMAN、MEGA软件分别进行氨基酸多序列比对与系统进化分析;实时荧光定量PCR(q RT-PCR)技术进行PAL基因时空表达特异性与外源激素胁迫下响应检测。结果克隆得到的Bs PAL基因c DNA全长为2 708 bp,编码1条797个氨基酸组成的多肽,预测蛋白质相对分子质量为86 216.94,等电点6.24,具有植物PAL酶的典型结构域和活性中心,不具有跨膜结构域,与铁皮石斛、蝴蝶兰的PAL基因亲缘关系最近。q RT-PCR结果表明白及根中PAL表达量显著高于叶与茎。在Me JA处理下,PAL表达量呈逐渐上升再下降的趋势;SA处理下,则是先下降再上升的趋势。结论白及PAL基因的克隆与序列特征分析、表达检测及响应Me JA和SA胁迫后的表达变化为阐明白及苯丙烷代谢途径与激素信号通路研究提供实验基础。 展开更多
关键词 白及 苯丙氨酸解氨酶 基因克隆 序列特征 表达分析 激素响应
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棉花生长素结合蛋白ABP1基因cDNA的克隆及序列分析 被引量：9
15
作者 孙建波 崔百明 +1 位作者 刘德兵 彭明 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2007年第4期243-247,共5页
生长素结合蛋白(ABP1)在植物细胞发育中起着重要作用。在ABP1蛋白的保守区设计引物,利用RT-PCR和RACE方法,首次克隆了棉花ABP1基因cDNA的3′和5′末端。测序及生物信息学分析表明,该基因cDNA全长824 bp编码190个氨基酸,它所编码的氨基... 生长素结合蛋白(ABP1)在植物细胞发育中起着重要作用。在ABP1蛋白的保守区设计引物,利用RT-PCR和RACE方法,首次克隆了棉花ABP1基因cDNA的3′和5′末端。测序及生物信息学分析表明,该基因cDNA全长824 bp编码190个氨基酸,它所编码的氨基酸序列包含植物ABP1蛋白家族的所有特征,被命名为GhABP1。棉花ABP1所包含的BoxA,Box B和Box C区在植物ABP1家族中是高度保守的。它的C末端氨基酸残基WDE在蛋白质的折叠及ABP1在质膜上的功能活性方面都具有重要的作用。棉花ABP1的C末端带有KDEL残基区,这个KDEL区表明它被定位在内质网上。用Clustal W软件进行多重比对分析表明,棉花ABP1与拟南芥、向日葵、油菜、辣椒、甘菊的氨基酸序列同源性分别为72%,72%,71%,70%和70%。系统进化分析表明,棉花在进化上与萝卜、拟南芥和油菜聚为一类。序列分析表明此基因为生长素结合蛋白基因家族的新成员。 展开更多
关键词 棉花 ABP1 基因克隆 基因分析
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植物抗病基因研究进展 被引量：10
16
作者 曹必好 宋洪元 雷建军 《天津农业科学》 CAS 2001年第4期13-18,共6页
对植物抗病基因的抗病反应的分子生物学机理,抗病基因的克隆方法,成功克隆的基因、抗病基因产物的结构特征及植物抗病基因类似序列研究现状进行了综述,并对植物抗病基因工程的研究取得的成绩、存在的问题及展望进行了简介。
关键词 抗病基因 克隆方法 结构特征 植物
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安徽省猪伪狂犬病毒的分离鉴定及其主要毒力基因分子特征 被引量：11
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作者 袁献宇 杨龙斌 +6 位作者 何赞赞 毛天骄 何长生 占松鹤 孙裴 魏建忠 李郁 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第1期43-56,共14页
猪伪狂犬病是由猪伪狂犬病毒(porcine pseudorabies virus,PRV)引起的一种急性、热性传染病。自2011年底以来,PRV发生了变异,传统的PRV弱毒疫苗已不能对PRV变异株提供完全保护,这给我国PR防控带来了巨大挑战。为了解安徽省PRV流行特征... 猪伪狂犬病是由猪伪狂犬病毒(porcine pseudorabies virus,PRV)引起的一种急性、热性传染病。自2011年底以来,PRV发生了变异,传统的PRV弱毒疫苗已不能对PRV变异株提供完全保护,这给我国PR防控带来了巨大挑战。为了解安徽省PRV流行特征及其主要毒力基因遗传变异情况。利用PCR技术、细胞接种试验、电子显微镜观察、间接免疫荧光试验及兔体接种试验等方法,对安徽省临诊病例中疑似PRV感染的病猪进行病原检测及PRV分离鉴定,并通过设计6对特异性引物对PRV分离株主要毒力基因(gE、gI、TK、gB、gC、gD)进行克隆及测序分析。2016—2018年安徽省临诊病例中共分离鉴定15株PRV;PRV分离株主要毒力基因序列均与2011年后国内PRV变异株同源性较高;与2011年前国内PRV经典株序列比对,PRV分离株gE、gB、gC及gD基因存在多个位点的一致性替换、插入或缺失,且gE、gC基因多位点突变位于其重要的抗原表位区。本研究分离的15株PRV均为变异株,变异株已成为安徽省主要的流行毒株。15株PRV分离株的gI、TK基因序列较为保守,而gE、gC蛋白抗原表位区域氨基酸的突变可能导致其毒力及抗原性发生改变。部分PRV分离株与邻近地区PRV序列同源性均为100%,可能与频繁跨省调运生猪、跨区引种等原因有关。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病毒 分离鉴定 毒力基因 序列分析
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栉孔扇贝Cf-dmrt4-like基因的克隆、序列特征及表达分析 被引量：11
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作者 冯政夫 邵明瑜 +1 位作者 孙大鹏 张志峰 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期930-940,共11页
DMRT家族是一类转录因子,在性别决定与分化、器官形成等早期胚胎发育中起重要的作用。本研究采用简并PCR扩增和cDNA末端快速扩增技术(RACE),从栉孔扇贝(Chlamys farreri)精巢中克隆得到1个全长为2312bp的dmrtcDNA序列,其开放阅读框(Open... DMRT家族是一类转录因子,在性别决定与分化、器官形成等早期胚胎发育中起重要的作用。本研究采用简并PCR扩增和cDNA末端快速扩增技术(RACE),从栉孔扇贝(Chlamys farreri)精巢中克隆得到1个全长为2312bp的dmrtcDNA序列,其开放阅读框(Open reading frame,ORF)1110bp,编码369个氨基酸,具有dmrt基因家族共有的DM保守结构域。同源比对和系统进化分析结果显示,其为Cf-dmrt4-like基因。半定量RT-PCR结果显示,该基因从受精卵至匍匐幼虫各发育时期均有表达,卵裂期表达量较高;在雄性成体的鳃和精巢以及雌性成体的外套膜、鳃、肾和闭壳肌中表达,但卵巢中未见表达。qRT-PCR检测不同发育时期的精卵巢,以成熟期精巢表达量最高。由此推测,栉孔扇贝Cf-dmrt4-like基因参与个体的早期发育,并在两性成体中发挥着不同的作用。 展开更多
关键词 栉孔扇贝 DMRT基因 全长CDNA 序列特征 组织表达
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2009-2011年甘肃省和陕西省流行的人副流感病毒3型基因特征分析 被引量：9
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作者 张鹏 姬奕昕 +7 位作者 许松涛 于德山 余鹏博 张慧 许晶 崔爱利 魏虎来 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期509-514,共6页
为了解我国甘肃省、陕西省流行的人副流感病毒3型(Human parainfluenza viruse-3,HPIV-3)的基因特征和流行规律,2009～2011年从上述两省急性呼吸道感染患者中共采集咽拭子标本719份,采用多重反转录聚合酶链反应(Multiplex reverse trans... 为了解我国甘肃省、陕西省流行的人副流感病毒3型(Human parainfluenza viruse-3,HPIV-3)的基因特征和流行规律,2009～2011年从上述两省急性呼吸道感染患者中共采集咽拭子标本719份,采用多重反转录聚合酶链反应(Multiplex reverse transcription polymerase chain reaction,多重RT-PCR)方法对常见呼吸道病毒性病原体进行筛查,HPIV-3阳性标本再用巢式PCR(nested polymerase chain reaction,nested PCR)扩增其血凝素-神经氨酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因,进行序列测定和基因分析。共获得13株HPIV-3HN基因序列,均属于C3亚群,核苷酸差异和氨基酸差异分别为0.2%～2.3%和0～1.1%。与美国、加拿大和澳大利亚的HPIV-3的HN基因序列之间的核苷酸差异和氨基酸差异较大,最大分别为6.0%和3.4%。shaanxi09-2与shaanxi10-H0091、shaanxi10-H0055与gansu11-62110372和shaanxi09-2与BJ/291/09之间存在核苷酸差异分别为0.9%、0.5%和0.6%,但均无氨基酸差异。提示甘肃和陕西两省在不同年份之间存在HPIV-3的持续循环传播。引起2009～2011年甘肃和陕西两省HPIV-3流行的毒株属C3亚群。 展开更多
关键词 人副流感病毒 HN基因 基因特征 序列分析
原文传递
潍坊萝卜中芜菁花叶病毒分离物的分子特性及CP基因的表达 被引量：9
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作者 刘金亮 于晓庆 +4 位作者 田延平 都杰 竺晓平 李向东 严敦余 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期84-88,共5页
从表现红心病的潍坊萝卜块根上得到一芜菁花叶病毒（Turnip mosaic virus, TuMV）分离物（TuMV-Ra），通过RT-PCR获得了该分离物的外壳蛋白（CP）基因，对其进行了序列测定，并将其核苷酸序列及推导出的氨基酸序列与GenBank中登录的其... 从表现红心病的潍坊萝卜块根上得到一芜菁花叶病毒（Turnip mosaic virus, TuMV）分离物（TuMV-Ra），通过RT-PCR获得了该分离物的外壳蛋白（CP）基因，对其进行了序列测定，并将其核苷酸序列及推导出的氨基酸序列与GenBank中登录的其它20个TuMV萝卜分离物的相应序列进行比较和分析。结果表明，TuMV-Ra与这20个分离物CP基因核苷酸序列的同源性为89．9％～99．O％，CP氨基酸序列同源性为94．8％～99．7％；其中与中国浙江杭州萝卜的两个分离物HZLB1、HZLB2同源性最高，核苷酸序列的同源性为98．7％和99．0％，氨基酸序列同源性为99．0％和99．7％。TuMV-Ra与1999年从表现相同症状的潍坊萝卜得到的分离物CHINA-WF CP基因核苷酸同源性为93．66％，氨基酸同源性为96．53％，说明病毒发生了比较大的变异，而且变异的位点主要在CP的N末端。将TuMV-Ra CP基因克隆到原核表达载体pET-22b（＋），在大肠杆菌BL21（DE3）中表达出分子量为38kD的融合蛋白。Western blotting分析证明TuMV-RaCP在大肠杆菌中得到了正确表达。 展开更多
关键词 芜菁花叶病毒 萝卜 CP基因 分子特性 基因表达
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